SARS冠状病毒推定结构蛋白序列分析

2003年4月16日WHO正式宣布,蔓延全球的严重急性呼吸综合征 (Severe Acute Respiratory Syndrome ,SARS)的病原体是一类新的未知冠状病毒.并命名为SARS冠状病毒(SARS coronav irus, SARS CoV).     

SARS病情的动态变化

此前曾认为,导致此次SARS全球流行的元凶——SARS冠状病毒(SARS— CoV)是一种已知的人的冠状病毒的突变,从而获得了新的致病力;或是一种动物 冠状病毒的突变具有了感染人的能力;或是两种人类冠状病毒或人与动物冠状病 毒的重组。 然而,2003年5月15日新英格兰医学杂志(N ENGL J MED)于网上发表 了Katnryn V.Holmes撰写的题目为“SARS相关的冠状病”的研究文章,对SARS 患者血中病毒抗体进行了检测及研究。研究结果显示,这个抗体与已知的任何一种抗体均不同,提示SARS—CoV对人类是一个全新的病毒。 SARS—CoV的核苷酸序列已被科学家们测定出来,人们发现它的基因组成与已知的冠状病毒的序列完全不同。SARS—CoV的基因组序列不包括编码HE的基因,也没有从其他病毒或宿主细胞获得的大的基因片段。因此,人们推测SARS—CoV既不是已知病毒的突变,也不是已知病毒的基因重组。它是一个全新的冠状病毒,有可能寄生于其他动物,在某种条件下获得了感染人的能力。只有在SARS疫情最初暴发的区域检测野生及家养动物的血清才能鉴别它的最初宿主。比较来自SARS患者和自然宿主的病毒间的差异,有可能揭示病毒如何变迁转而感染人类。当病毒以人类为宿主后,是否还具有感染其初宿主的能力?若病毒丧失了这个能力,人类彻底清除这个病     

新型冠状病毒肺炎的研究进展

自2019年12月起,中国湖北省暴发了一系列原因不明的肺炎病例,科学家分离出一种新型冠状病毒（severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS CoV 2）,这种病毒感染已经在中国和全球多个国家流行,引起了全球关注。这是继严重急性呼吸综合征冠状病毒（SARS CoV）和中东呼吸综合征冠状病毒（MERS CoV）后发现的第三种冠状病毒,目前诸多学者对其进行大量的研究,本文对SARS CoV 2的病原学、流行病学特点、临床表现、影像学检查、实验室检查、诊断及治疗等进行综述。     

SARS冠状病毒可能编码蛋白质的三级结构预测

在本研究组稍早的工作中[1],我们已经基于基因组序列和蛋白质初步分析,完成了SARS冠状病毒(SARS Coronavirus, SARS CoV)所有推测蛋白质(putative protein)的二级结构分析 .     

SARS相关病毒基因组序列的研究

严重急性呼吸道综合征(severe acute respiratory syndrome，SARS)是由SARS相关病毒(SARS—CoV)引起的一种新的烈性呼吸道传染病。SARS—CoV是一种新的冠状病毒，基因组结构符合典型的冠状病毒特征，编码基因从5′端起分别为：RNA依赖的RNA聚合酶、突起蛋白、包膜蛋白、膜蛋白，3′端为核衣壳蛋白。对14株SARS—CoV的4个变异点分析，可将14株病毒分成两个基因型，即第9404、19084、22222、27827位的T：T：T：T／C：G：C：C两型。对SARS—CoV的基因组的全面了解不仅为疾病的发病机理研究提供主要线索，而且将为SARS的诊断、预防和治疗提供帮助。     

新型冠状病毒SARS-CoV-2亟待阐明的若干关键科学问题

2019年底爆发的新型冠状病毒(SARS-CoV-2)至今在全球已造成超过8万人感染、2700多人死亡(截至2020年2月25日)。虽然SARS CoV 2与2003年爆发的SARS CoV同属冠状病毒科、β冠状病毒属且相似性较高，全基因组同源性约79%，但是两者在病程、致死率等方面存在诸多差异。到目前为止，SARS CoV 2的宿主（包括自然宿主和中间宿主）、传播途径、毒力变异等方面还亟待阐明。本文将对上述存在的若干科学问题进行简要阐述。     

冠状病毒具有免疫原性的抗原

SARS(severeacuterespiratorysyndrome)冠状病毒(CoV,coronavirus)是冠状病毒的一种新变体。对11株SARS-CoV的核苷酸序列和翻译的氨基酸序列分析表明均有典型的CoV基因组结构。研究SARS-CoV具有免疫原性的抗原对于研制疫苗、新药和了解其致病机制十分重要。冠状病毒感染多种家畜、家禽和与其有关的动物,除猫传染性腹膜炎病毒(felineinfectiousperitonitisvirus,FIPV)和凝血性脑脊髓膜炎病毒(hemagglutinatingencephalomyelitisvirus,HEV)引起全身性感染外,冠状病毒多引起呼吸道和肠道的局部感染。肠致病性冠状病毒感染肠上皮绒毛…     

SARS的实验室诊断研究现状

研究表明SARS病毒是变异的冠状病毒(SARS CoV) ,其毒力远远强于其他已知的家族成员,病毒学诊断对SARS的确诊具有决定性意义[1] 。SARS CoV基因测序的完成为该病毒的扩增引物的设计提供了条件,也对SARS的诊断及药物研究具有重要意义。来源于患者的标本具有足够的基因信息,对它进行病毒纯培养,可获得大量SARS冠状病毒,用于PCR研究,产生丰富的病毒基因资料[2 ] 。SARS的实验室诊断主要有病毒的分离培养、抗体检测、PCR和基因芯片检测等方法[2 ,3] 。目前实验室诊断方法尚不完善,临床实用仍有距离,本文仅对SARS诊断比较成熟的…     

严重急性呼吸综合征相关冠状病毒的发现及其研究进程

严重急性呼吸综合征(SARS)暴发流行，引发了一场全球性通力合作、激烈竞争的攻关研究。2003年3月，中国香港及美国、加拿大和德国的科学家相继从SARS患者标本中发现并分离到一种SARS相关冠状病毒(SARS—CoV)，并得到世界卫生组织(WHO)的确认。之后，2003年4、5月间，美国、德国、中国香港、加拿大、荷兰的学者分别将他们对SARS病原体的研究成果发表于Sciece、NEJM、Luncet、Nature等国际权威学术期刊上，先后报告了SARS—CoV全基因组结构、基因组序列分析、SARS—CoV分子模型构建等，为进一步建立SARS诊断、治疗及疫苗研究等奠定了基础。分析这一迅速取得大量成果的研究进程，认真反思、深刻总结，将会使我们有很多收益。     

人冠状病毒SARS-CoV、229E和OC43核衣壳(N)蛋白单克隆抗体的制备及3株人冠状病毒N蛋白的抗原相关性观察

目的 通过制备和鉴定人冠状病毒SARS．CoV、229E和OC43核衣壳（N）蛋白单克隆抗体〈mAb）,观察3株人冠状病毒的N蛋白抗原相关性。方法 分别用基因重组SARS．CoV、229E和OC43N蛋白免疫BALB／c小鼠,制备mAb,并采用ELISA间接法、免疫印迹和免疫荧光进行筛选和鉴定．同时用mAb分析3株人冠状病毒N蛋白之间的免疫交叉反应。结果 获得多株抗SARS．CoV、229E和OC43N蛋白mAb杂交瘤细胞株。ELISA间接法、免疫印迹和免疫荧光结果均显示,所有的mAb仅与各自病毒的N蛋白特异性反应。而在3株人冠状病毒N蛋白抗原之间不产生免疫交叉反应。结论 获得的特异性抗人冠状病毒N蛋白mAb为进一步研究3株人冠状病毒的抗原决定簇相关性奠定了基础。     

传染性非典型肺炎(SARS)诊疗方案

传染性非典型肺炎是由SARS冠状病毒(SARS—CoV)引起的一种具有明显传染性、可累及多个脏器系统的特殊肺炎，世界卫生组织(WHO)将其命名为严重急性呼吸综合征(severe acute respiratory syndrome，SARS)。临床上以发热、乏力、头痛、肌肉关节酸痛等全身症状和干咳、胸闷、呼吸困难等呼吸道症状为主要表现，部分病例可     

新型冠状病毒感染相关心脏损伤

新型冠状病毒（severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, SARS CoV 2）感染者通常以呼吸系统症状为典型表现。随着感染人数增加,研究发现合并心血管疾病的感染者预后较普通患者严重,部分患者出现病毒感染相关心脏损伤,可能与血管紧张素转换酶2（ACE2）介导SARS CoV 2感染有关。适当应用心肌保护药物可能有助于改善SARS CoV 2感染预后。     

SARS冠状病毒RNA聚合酶编码区分析

SARS冠状病毒(SARS coronavirus ,SARS CoV)和同家族的其他冠状病毒一样,是一类单链的正义RNA病毒 ( single-stranded, (+)sense RNA virus).与其他种类的病毒(如负义RNA 病毒)相比,这类病毒有两个最重要的特征:(1)在其成熟的病毒颗粒中并没有RNA聚合酶(viral RNA polymerase)存在,即病毒复制、转录所需的病毒特有的RNA聚合酶,是在侵入宿主细胞之后才合成的. 而且,只是在病毒的扩增阶段,保留在宿主细胞内行使功能,并不参与病毒颗粒的组装.     

严重急性呼吸综合征相关冠状病毒基因组研究的新技术——RNA干扰

最近，严重急性呼吸综合征(SARS)在全世界约30个国家和地区散发或流行，众多实验室由此展开了针对SARS病原体的国际联合攻关。目前，已经确认其病原体是一种新型冠状病毒(命名为SARS—CoV)，而且该病毒的全基因组测序已经完成。采用现代分子病毒学实验技术对SARS病毒的功能基因组进行深入研究，有重要的理论和实际意义。作为一种崭新的基因沉默技术，RNA干扰无疑将在SARS病毒基因组研究中发挥重要的作用。     

SARS病毒S蛋白的原核表达与DNA疫苗的构建

目的探讨SARS冠状病毒的刺突(spike，S)蛋白的免疫学特性，以及S蛋白作为SARS—CoV病毒疫苗组分的可行性。方法将S蛋白基因分段克隆入原核表达载体pET—15b，并在大肠杆菌中表达，经过亲和层析得到纯化的重组蛋白rSa和rSb；将全长S基因克隆入真核分泌表达载体pSecTagB，得到重组DNA疫苗pSecS，免疫小鼠，得到SAS—CoV S蛋白抗血清。然后用纯化的重组蛋白rSa和rSb建立的SARS—CoV S抗体ELISA检测技术研究所构建的S-DNA疫苗的免疫效果。结果分段的重组蛋白rSa和rSb在大肠杆菌中均以可溶性形式得到高效表达，并能与SARS确诊病人血清以及pSecS免疫鼠血清发生特异性抗原抗体反应，原核表达的重组分段S蛋白具有SARS—CoV S蛋白相似的抗原性。结论原核表达的两段重组S蛋白有可能作为抗原组分用于临床SARS—CoV检测中；所构建的SARS—CoV的S基因核酸疫苗能在小鼠体内产生特异性抗体，这为进一步SARS DNA疫苗的研制提供一定的借鉴作用。     

SARS诊断研究进展

<正> 1 概况 传染性非典型性肺炎(简称“非典”),又称严重急性呼吸道综合征(Severe Acute Respiratory Syn-drome,SARS),是由一种新型冠状病毒(SARS—CoV)引起的,通过飞沫、粪便和尿液等多种途径传播,传染性很强的、高病死率的急性疾病。临床起病急,以发热(>380C)为首发症状,干咳、无上呼吸道     

SARS临床检测实验室消毒初探

现已证实 ,严重急性呼吸系统综合征 (severeacuteres piratorysyndrome,SARS)的病原体为变异的冠状病毒 (SARSCorovirus,SARS CoV) [1] ,其传染性强、生存时间长。保证实验室工作人员的安全 ,是目前SARS临床检测工作的当务之急。在至今尚无先例与规律可循的情况下 ,我科作为SARS定点医院 (三级甲等定点医院 )的专业临床检测实验室 ,根据国家的相关规定 ,结合SARS临床检测的特殊性和我科实验室现有条件 ,对SARS检测实验室的消毒措施进行了大量调研与实践 ,摸索、总结出一些经验 ,并取得了防止SARS在实验室交叉感染的初步成效。…     

SARS相关冠状病毒M基因片段的克隆及其DNA疫苗诱导的体液免疫

目的：构建含有SARS相关冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus，SARS—CoV)M基因片段的核酸疫苗，观察其免疫小鼠后病毒特异性抗体产生情况。方法：将合成的M基因片段克隆到核酸疫苗真核表达载体pVAX1中，免疫小鼠后，用SARS—CoV抗体ELISA检测试剂盒定期检测免疫小鼠血清中抗SARS—CoV的病毒特异性抗体水平。结果：构建了重组核酸疫苗质粒pVCo—M，免疫小鼠后可诱导产生出病毒特异性抗体。结论：以M为抗原基因的DNA疫苗能诱导SARS病毒特异性抗体，为进一步改进或探索同类DNA疫苗提供有益启示。     

现在自然界和人群中已不存在非典病毒

非典(SARS)流行至今已近10年,虽被进行了全面广泛深入的研究,但其起源和贮存宿主仍不明确。我们发现SARS的流行自然史和迄今世界上的传染病均不相符,其原因是非典病毒(SARS CoV)经"非寻常进化"方式,很可能是"非自然"方式进入人群。对几乎所有的SARS CoV基因变异、进化、跨种传播等既往研究,我们进行重新审视并综合分析,发现以往研究多从微观和一个侧面思考问题,而本文则从全新之视角,结合流行病学和生物进化理论,首次阐明:SARS CoV经历了逆向进化;自然界根本不存在SARS CoV的直接祖先和贮存宿主,故其流行后即从人群和动物界消失。因此建议卫生部正式向WHO等有关国际机构申请组织专家委员会,实证自然界和人群中已无SARS CoV,并予宣布。     

Anti-SARS virus antibody responses against human SARS-associated coronavirus and animal SARS-associated coronavirus-like virus

Severeacuterespiratorysyndrome (SARS )isaninfectiousdiseasefirstrecognizedinNovember 2 0 0 2inGuangdongprovince ,China Itwasspreadtomanycountriesallovertheworldwithinafewmonths 1,2 　ByApril 2 0 0 3,SARS associatedcoronavirus (SARS CoV)wasfoundtobetheetiologicalagent Afterthat ,ananimalSARS CoV likeviruswasisolatedfromHimalayanpalmcivetsandotheranimalsfoundinaliveanimalmarketinShenzhen ,China Thegenomesequenceofithas 99 8%homologytothehumanSARS CoV Geneticanalysisandepidemiologic…