药物基因组学和药物基因组计划

药物基因组学 (Ｐｈａｒｍａｃｏｇｅｎｏｍｉｃｓ)和药物基因组计划 (Ｐｈａｒｍａｃｏｇｅｎｏｍｉｃｓｐｒｃｏｊｅｃｔ,ＰＧＰ)是在人类基因组(ＨＧＰ)基础上发展起来的功能基因组内容之一 .药物基因组学是研究影响药物吸收 ,转运、代谢和清除整个过程的个体差异的基因特性 .由于基因多态性所致个体对药物的不同反应—药物反应的遗传基础 ,即有关基因和基因变异与药物效应个体差异之间的关系 ,并由此开发新药物 .以达到根据个体化的合理用药 .所以 ,基因的多态性是药物基因组学的基础 .药物基因组学是一个新型的交叉学科 ,使药物治疗的…     

编者栏

人类基因组多样性 (ＨＧＤ)与人类基因组多样性计划 (ＨＧＤＰ) (1)人类基因组多样性 (ＨｕｍａｎＧｅｎｏｍｅＤｉｖｅｒｓｉｔｙ ,ＨＧＤ)是指人类基因组具有高度变异的特性 .在“人类基因组计划 (ＨＧＰ)”完成后 ,要真正了解人类的基因组 ,还要研究、比较不同人群的基因组 ,这就是人类基因组多样性计划 (ＨｕｍａｎＧｅｎｏｍｅＤｉｖｅｒｓｉｔｙＰｒｏｊｅｃｔ,ＨＧＤＰ) .对ＨＧＤ的研究是疾病基因组的主要内容之一 .生物信息学的内涵随着科研和现实的需要而变化 ,生物信息学主要是研究生物学系统和研究过程中的信息流相结合的学科 .…     

编者栏

基因组学和医学生物信息学 ( 3 )随着“人类基因组计划”的完成 ,结构基因测序的突破 ,进入“后基因组计划”即以功能基因鉴定为中心的“功能基因组学”时代 .本刊曾介绍了细胞蛋白质组学、神经信息学、环境基因组学、药物基因组学的基本概念和生物技术 .本期则介绍疾病微生物基因组学中的细菌基因组和病毒基因组的基本知识 .微生物基因组计划 (ＭＧＰ)是人类基因组计划的延伸 .1989年提出了Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ,ＢＩＭ(生物信息学 )这一词 ,后来这个概念逐渐被接受 .就在那一年 ,第一个细菌的全基因组序列———流血嗜血杆菌基因…     

基因组学和生物信息学

基因 (ｇｅｎｅ)的现代定义为 :遗传信息的结构与功能单位 ,可指一段ＤＮＡ分子 ,也指一段ＲＮＡ分子 一个物种的全部遗传信息总和称为基因组 (ｇｅｎｏｍｅ) ,可指一套染色体 ,也可指其中全部核酸 1986年美国著名人类遗传学家和内科教授Ｍｅｋｕｓｉｃｋ创立了基因组学 (Ｇｅｎｏｍｉｃｓ)这一名词 ,意指从基因组水平研究遗传的学科 这一词即被广泛接受 ,基因组学成为最活跃 ,最有影响的重大的前沿学科 人类基因组计划 (ＨｕｍａｎＧｅｏｍｅＰｒｏｊｅｃｔ,ＨＧＰ)自 1990年正式启动以来 ,迅速发展成为一个国际性大协作项目 其规模和…     

SNP与肿瘤易感相关性研究进展

单核苷酸多态性 (singlenucleotidepolymorphism ,SNP)是基因组变异最丰富的一种DNA序列变化形式 ,反映了个体表型、疾病易感性和对药物、环境因子反应的差异。肿瘤是一种多基因遗传病 ,除涉及外界环境因素的作用外 ,还涉及到多个遗传易感基因的作用。现就肿瘤易感相关基因SNP与肿瘤易感相关关系进行综述 ,并分析其在肿瘤的一级预防、早期诊断等方面的应用前景和目前存在的问题     

PTEN与信号转导及肿瘤

ＴＥＮ[1] (ｐｈｏｓｐｈａｔａｓｅａｎｄｔｅｎｓｉｎｈｏｍｏｌｏｇｙｄｅｌｅｔｅｄｏｎｃｈｒｏｍｏｓｏｍｅｔｅｎ)又名ＭＭＡＣ1 [2 ] (ｍｕｔａｔｅｄｉｎｍｕｔｉｐｌｙａｄａｎｃｅｄｃａｎｃｅｒ 1 )和ＴＥＰ1 [3 ] (ＴＧＦ -βｒｅｇｕｌａｔｅｄａｎｄｅｐｉｔｈｅｌｉａｌｃｅｌｌ -ｒｉｃｈｅｄｐｈｏｓｐｈａｔａｓｅ 1 ) (以下均称为ＰＴＥＮ) ,是 1 997年由 3个研究小组先后发现的一个具有双特异磷酸酶活性的抑癌基因。ＰＴＥＮ基因异常广泛存在于人类多种恶性肿瘤 ,如恶性神经胶质瘤、前列腺癌、子宫内膜癌、黑色素瘤等…     

基因组学和医学生物信息学(1)

基因是遗传信息的结构与功能单位 .可指一段ＤＮＡ分子 ,也可指一段ＲＮＡ分子 .基因组是指一个物种的全部遗传信息的总和 ,可指一套染色体 ,也可指其中全部核酸 .基因组学是指从基因水平研究遗传的学科 .人类基因组计划 (ＨＧＰ)的发展、完成 ,使基因组学成为一门高度综合的 ,跨学科的科学 ,同时也促进了生物信息学的出现和发展 ,所以最初被称为基因组信息学 .同样 ,ＨＧＰ的迅速发展、取得巨大的成果 ,有赖于生物信息学和生物信息网新学科的发展 .人类后基因组研究—功能基因组时代 :在ＨＧＰ草图和精细图完成后 ,后基因组计划启动并迅速…     

AAV载体介导的人β_2-AR、EGFP基因导入心肌细胞的研究

目的 :观察腺相关病毒 (ａｄｅｎｏ -ａｓｓｏｉａｔｅｄｖｉｒｕｓ,简称ＡＡＶ)载体介导的人β2 肾上腺素能受体 (简称β2 -ＡＲ)基因和增强型绿色荧光蛋白基因 (简称ＥＧＦＰ)对心肌细胞的转染及其表达。方法 :构建以串联方式携带 β2 -ＡＲ、ＥＧＦＰ基因的ＡＡＶ载体 ,转染大鼠的心肌细胞 ,检测心肌细胞 β2 -ＡＲ、ＥＧＦＰ的表达及ｃＡＭＰ的含量。结果 :Ｎｏｒｔｈｅｒｎ印迹杂交显示转染的心肌细胞表达人 β2 -ＡＲｍＲＮＡ ;Ｗｅｓｔｅｒｎ免疫印迹杂交分析表明转染的心肌细胞有人β2 -ＡＲ ;并在荧光显微镜下可观察到心肌细胞表达…     

P33^ING1基因生物学功能及研究进展

Ｇａｒｋａｖｔｓｅｖ等〔1〕采用ｃＤＮＡ消减杂交方法 (ｓｕｂｓｔｒａｃｔｉｖｅｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ)建立了一种从富含所需序列的ｃＤＮＡ文库中构建较简便ＧＳＥｓ(ｇｅｎｅｔｉｃｓｕｐｐｒｅｓｓｏｒｅｌｅｍｅｎｔｓ)文库的方法 ,并结合体内选择技术 (ｉｎｖｉｖｏｓｅｌｅｃｔｉｏｎａｓｓａｙ) ,成功地克隆了一个新的肿瘤抑制基因 ,命名为ＩＮＧ1(ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｏｆｇｒｏｗｔｈ)。研究发现 ,Ｐ33ＩＮＧ1的过表达可有效抑制细胞生长 ,促进无生长因子条件下的细胞凋亡 ,在抑制细胞生长过程中 ,Ｐ33ＩＮＧ1与ｐ5 3相互…     

SLE模型新西兰小鼠高IgG血症易感基因的定位

目的：定位自发性ＳＬＥ模型００（ＮＺＢｘＮＺＷ）Ｆ１小鼠高ＩｇＧ血症的遗传易感基因。方法：建立（ＮＺＢｘＮＺＷ）Ｆ１ｘＮＺＷ回交小鼠模型,采用覆盖小鼠１９条染色体的多态性微卫星遗传标记及数量性状位点（ＱＴＬ）分析进行基因定位。结果：高ＩｇＧ血症易感基因与小鼠第１条染色体末端９２．３ｃＭ处微卫星遗传标记ＤＩＭｉｔ３６肯定连锁（Ｌｏｄｓ值〉３）,该位点附近９２．０ｃｍ处存在Ｆｅｇｒ２ｂ基因,且回交小鼠     

什么是“人类基因组计划”?

1990年 10月由美国科学家提出“人类基因组计划 (ｈｕｍａｎｇｅｎｏｍｅｐｒｏｊｅｃｔ,ＨＧＰ)” ,目前世界许多国家都在进行此研究。该计划要在 2 0 0 5年完成对人体 10万个基因的全部分析。遗传学家估计人类基因组由 30亿个ＤＮＡ碱基对 (ｂｐ)组成 ,约含10万个基因 ,目前已有数千个人类基因被克隆分析。ＨＧＰ包括四个方面内容 :1 遗传图 ,又称连锁图 ,基因标志在染色体上的相对位置与遗传距离。 2 物理图 ,基因在ＤＮＡ序列上实际距离 ,3 ＤＮＡ的测序。 4 基因的确定和分析。现在有显微排阵、基因芯片等新技术 ,可大大提高基因分析…     

糖基化终产物增加人外周血单核细胞对单核 细胞趋化蛋白-1的表达

动脉粥样硬化 (Ａｔｈｅｒｏｓｃｌｅｒｏｓｉｓ ,ＡＳ)是严重危害人类健康的疾病 ,糖尿病患者并发ＡＳ的可能性是正常人的 3～ 4倍。高血糖状态下蛋白质发生的非酶糖基化可使其最终形成不可逆的糖基化终产物 (Ａｄｖａｎｃｅｄｇｌｙｃｏｓｙｌａｔｉｏｎｅｎｄｐｒｏｄｕｃｔｓ,ＡＧＥｓ)。ＡＧＥｓ可与单核细胞等多种细胞上受体结合 ,加速动脉粥样斑块的形成。单核细胞粘附于内皮并透入内皮下形成泡沫细胞是ＡＳ的早期事件。这一过程与单核细胞趋化蛋白- 1 (Ｍｏｎｏｃｙｔｅｃｈｅｍｏａｔｔｒａｃｔａｎｔｐｒｏｔｅｉｎ - 1 ,ＭＣＰ -…     

遗传学前沿领域的研究进展

(一 )于 1990年 10月正式启动的人类基因组计划 (ｈｕｍａｎｇｅｎｏｍｅｐｒｏｊｅｃｔ ,ＨＧＰ)已经取得了显著进展 ,约占整个基因组6 .3%的ＤＮＡ序列已被测定 ,已鉴定的基因 7484个 ,约 1万个人类基因的序列已经被克隆[1] 。据最新报道人类基因组全序列测定预计可以提前在 2 0 0 2年完成 ,比预计提前了一年。全球有关研究人员尝试将人类ＤＮＡ中的全部基因归类 ,这样使防治癌症、遗传性疾病成为可能。该计划的目标可概括为两点 :(1)人类 3× 10 10 ｂｐ的全序列分析 ;(2 )全部基因的识别及功能分析。人类基因组中约 5 10万个基因 ,它们…     

表皮生长因子与假单胞菌外毒素融合蛋白在大肠杆菌中的表达 …

目的和方法：应用基因工程技术，将ＥＧＦＣＤＮＡ克隆到ＰＬＹ５／ＩＬ２－ＰＥ４０载体的ＥｃｏＲⅠ、ＳｍａⅠ位点之间ＩＬ２基因位置上，再将重组融合基因亚克隆到表达载体ＰＢＶ２２０的ＥｃｏＲⅠ、ＰｓｔⅠ位点上，以探索ＥＧＦ－ＰＥ４０融合基因在大肠杆菌ＤＨ５ａ中的进行表达及其生理功能。结果：ＳＤＳ－聚丙烯胺凝胶电泳和Ｗｅｓｔｅｒｎｂｌｏｔ表明：ＥＧＦ－ＰＥ４０融合蛋白获得表达，并且具有ＥＧＦ和ＰＥ４０的免     

先天性巨结肠RET基因的突变

酪氨酸激酶受体基因（ｒｅｃｅｐｔｏｒｔｙｒｏｓｉｎｅｋｉｎａｓｅｇｅｎｅ，ＲＥＴ基因）被定位于染色体１０ｑ１１．２上，其突变可导致３种多发性内分泌瘤综合征和先天性巨结肠的发生。为了探讨ＲＥＴ基因突变在先天性巨结肠发病中的作用，采用多聚酶链反应（ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅｃｈａｉｎｒｅａｃｔｉｏｎ，ＰＣＲ）及单链ＤＮＡ构象多态性分析（ｓｉｎｇｌｅ－ｓｔｒａｎｄｅｄＤＮＡｃｏｎｆｏｒｍａｔｉｏｎａｌｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ，ＳＳＣＰ）的方法，对３４例散发先天性巨结肠基因组ＤＮＡ进行ＲＥＴ基因第６外显子突变筛查，并对电泳条带变异的ＰＣＲ产物进行了直接核苷酸序列分析。发现１例为ＧＡＣＴＣＡＧＡＣ→ＧＡＡＴＣＡＡＡＣ碱基突变，导致两个氨基酸发生改变。表明ＲＥＴ基因突变与先天性巨结肠发病有关。     

“医学生物信息学专题杂志”专栏

人类基因组测序图的完成与多种疾病相关的基因陆续发现 ,现代医学开辟了基因组医学的领域 .基因组医学从基因组研究开始又迅速地进入了蛋白质组学 ,染色体组和人类疾病基因的研究 .在基因组医学中 ,人类疾病基因和基因变异研究的两个重要方面包括 :单基因遗传性疾病的致病基因研究 ,复杂多基因疾病的相关基因研究和疾病易感性分析 .实际上要达到揭示基因与疾病的关系 ;遗传背景与环境因素综合作用对疾病发生发展的影响 ;为疾病的预后、诊断、风险预测、预防和治疗提供依据 .复杂性疾病通常是多个微效基因的累加作用 ,并在特定环境因素的诱发…     

基因组医学、染色体组和人类疾病基因(1)

人类基因组测序图的完成与多种疾病相关的基因陆续发现 ,现代医学开辟了基因组医学的领域 .基因组医学从基因组研究开始又迅速地进入了蛋白质组学 ,染色体组和人类疾病基因的研究 .在基因组医学中 ,人类疾病基因和基因变异研究的两个重要方面包括 :单基因遗传性疾病的致病基因研究 ,复杂多基因疾病的相关基因研究和疾病易感性分析 .实际上要达到揭示基因与疾病的关系 ;遗传背景与环境因素综合作用对疾病发生发展的影响 ;为疾病的预后、诊断、风险预测、预防和治疗提供依据 .复杂性疾病通常是多个微效基因的累加作用 ,并在特定环境因素的诱发…     

精神分裂症遗传易感性研究进展

精神分裂症是人类最常见的精神疾患之一,属于复杂的多基因遗传性疾病。随着分子生物学技术和遗传学数据分析方法的进步,精神分裂症易感基因方面的研究也取得了一定的进展。本文就近年来国际上关于精神分裂症遗传易感性研究的一些成果进行综述,主要内容包括：(1)精神分裂症分子遗传学研究的基本策略与方法;(2)精神分裂症易感基因的全基因组扫描研究结果;(3)依据精神分裂症发病的三大假说,进行的候选基因研究的部分结果;(4)采用新型多位点联合作用分析方法,寻找精神分裂症的易感基因。     

人类基因组表达图谱构建的进展

ｃＤＮＡ代表着基因的编码顺序，ｃＤＮＡ文库中一个ｃＤＮＡ克隆的已测序部分即为一个ＥＳＴ（ｅｘｐｒｅｓｓｅｄｓｅｑｕｅｎｃｅｔａｇ）。通过完成不同ｃＤＮＡ文库中ｃＤＮＡ克隆的部分测序及它们在染色体上的定位，我们就可得到一个由ＥＳＴ组成的人类基因组的表达图谱（ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎｍａｐ），这将大大推进人类基因组项目中基因识别和定位的研究，为遗传病致病基因的克隆创造有利条件。本文综述了表达图谱构建的进展、存在的问题及其前景。     

表皮生长因子与假单胞菌外毒素融合蛋白在大肠杆菌中的表达研究

目的和方法：应用基因工程技术，将ＥＧＦｃＤＮＡ克隆到ｐＬＹ５／ＩＬ２－ＰＥ４０载体的ＥｃｏＲⅠ、ＳｍａⅠ位点之间ＩＬ２基因位置上，再将重组融合基因亚克隆到表达载体ｐＢＶ２２０的ＥｃｏＲⅠ、ＰｓｔⅠ位点上，以探索ＥＧＦ－ＰＥ４０融合基因在大肠杆菌ＤＨ５ａ中的进行表达及其生理功能。结果：ＳＤＳ－聚丙烯酰胺凝胶电泳和Ｗｅｓｔｅｒｎｂｌｏｔ表明：ＥＧＦ－ＰＥ４０融合蛋白获得表达，并且具有ＥＧＦ和ＰＥ４０的免疫学活性。结论：这为进一步研究该融合的蛋白功能和肿瘤治疗打下基础