北京地区汉族人群DNA修复基因XPD单核苷酸多态性与肺癌及食管癌风险的研究

目的：研究核苷酸切除修复基因XPD单核苷酸多态性与北京地区汉族人群肺癌及食管癌风险的关系。方法：采用以医院患者为基础的病例－对照研究方法，包括正常对照383人，肺癌患者351例，食管癌患者325例。以聚合酶链反应－限制性片段长度多态性方法分析了XPD基因Asp312 Asn和Lys751Gln多态性，比较不同基因型与肺癌及食管癌风险的关系，并探讨吸烟与基因多态交互作用对患癌风险的影响。结果：与携带312 Asp/Asp基因型者比较，携带至少1个312Asn等位基因者（即Asp/Asn和Asn/Asn基因型）罹患肺鳞癌的风险增加1．8倍（95％CI1．10－2．93），而与肺腺癌无关（校正的比值比为1．07，95％CI0．55－2．08）。分层分析显示，风险型等位基因312Asn和751Gln与吸烟有明显的交互作用。吸烟剂量≥29包／年且携带312Asn或751Gln者罹患肺鳞癌的风险最高，校正的比值比分别为12．44（95％CI4．97－31．17）和10．74（95％CI4．51－25．57）。XPD基因Asp312Asn和Lys751Gln多态与食管鳞癌风险无关。结论：XPD基因Asp312Asn和Lys751Gln多态是地区汉族人群肺鳞癌遗传易感因素，而与肺腺癌以及食管鳞癌风险无关，可能反映了不同组织学类型肺癌以及肺癌和食管癌之间的病因学差异。     

GSTT1基因型和吸烟状况与肺癌易感性关系

 目的：探讨GSTT1基因多态性与肺癌遗传易感性的关系及GSTT1基因多态性和性别、吸烟在肺癌易感性中的交互作用。方法：采用病例对照和PCR-RFLP)方法对100例肺癌患者和135例健康对照者外周血的GSTT1基因型进行检测,并评价其与吸烟和肺癌遗传易感性的关系。 结果：(1)GSTT1(-)基因型在肺癌组和对照组分别为57%和41.5%,二者间有显著性差异( P=0.019)。GSTT1(-)基因型的吸烟者较不吸烟者患肺癌的风险增加3.643倍(P=0.016)。吸烟者携带GSTT1(-)基因型较携带GSTT1(+)基因型患肺癌的风险增加3.286倍(P=0.006)。吸烟量≥20包年的人群中携带GSTT1(-)基因型者较携带 GSTT1(+)基因型者患肺癌的风险增加7.81倍(P=0.002)。结论：GSTT1(-)基因型增加肺癌遗传易感性,吸烟与GSTT1(-)基因型间存在互交作用,二者协同增加患肺癌的风险性。吸烟量越大且携带GSTT1(-)基因型者患肺癌的风险越高     

基质金属蛋白酶1基因多态性与肺癌易感性的关联研究

目的研究我国西北汉族人群基质金属蛋白酶（matrix metalloproteinase 1，MMP1）基因-1607（1G→2G）多态与肺癌发生风险的关系。方法应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析的方法，检测了150例肺癌患者和200名正常对照者删1G→2G多态的基因型，比较不同基因型与肺癌发生风险的关系。结果肺癌组2G／2G基因型频率要高于对照组（X^2=5．896，P〈0．05），2G／2G基因型者患肺癌的风险是1G／2G和1G／1G基因型的1．77倍（OR=1．77；95％CI：1．12—2．91）。吸烟者中2G／2G基因型发生肺癌的风险是1G／2G和1G／1G基因型的3．20倍（OR=3．20；95％CI：1．50～6．82）。结论我国西北汉族人群MMP1基因-1607（1G→2G）多态性与肺癌易感性有关，2G／2G基因型可以增加肺癌发生风险。     

福建汉族胰岛素样生长因子受体基因多态性与非小细胞肺癌易感性的关联研究

目的 探讨胰岛素样生长因子受体(insulin-like growth factor receptor,1GF-1R和IGF-2R)基因多态性与福建汉族人非小细胞肺癌(non-small-cell lung cancer,NSCLC)易感性的关系.方法 采用病例-对照研究,用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性和DNA测序法检测福建籍汉族健康人258名和NSCLC患者260例的IGF-IR +1013和IGF-2R+1619两个位点的等位基因分布,探讨不同基因型与NSCLC发病的相关性.结果 (1) IGF-1R +1013(G/A)位点基因型和各等位基因的频率在两组中分布差异有统计学意义(P＜0.05).对于IGF-1R+ 1013(G/A)位点,与GG基因型者相比,GA基因型者NSCLC患病风险增加0.80倍(95％ CI:1.24～2.59,P=0.002),AA基因型者的风险增加2.59倍(95％ CI:1.78～7.26,P=0.000),而等位基因A携带者(GA+AA基因型)患病风险增加0.98倍(95％ CI:1.39～2.83,P=0.000).未发现IGF-2R +1619(G/A)位点各基因型和等位基因的频率分布在两组中差异有统计学意义(P＞0.05).(2)根据病理类型分层分析发现IGF-1R +1013(G/A)变异等位基因A携带者(GA+AA)患肺鳞癌的风险增加2.20倍(95％ CI:1.75～5.84,P=0.000),患肺腺癌的风险增加0.55倍(95％Ch l.00～2.41,P=0.049),患其他类型肺癌的风险增加0.96倍(95％CI:1.10～3.49,P=0.023).未发现两基因多态性与临床分期、淋巴结转移、远处转移有关(P＞0.05).(3)联合分析发现,IGF-1R+1013(G/A)和IGF-2R +1619(G/A)基因联合多态性与NSCLC的患病风险存在相关性(P=0.003).结论 IGF-IR+ 1013(G/A)位点变异等位基因A是肺癌发生的风险因素,IGF-1R+1013(G/A)和IGF-2R+1619(G/A)基因多态性对肺癌的发生有协同作用.     

RET基因功能性单核苷酸多态与先天性巨结肠风险

目的先天性巨结肠是一种肠神经系统发育异常导致的先天性消化道畸形。RET基因是其主要致病基因，本研究探讨RET启动子区的两个功能性单核苷酸多态-5G／A和-1A／C与先天性巨结肠遗传易感性的关系。方法以聚合酶链反应（PCR）和直接测序（direct-squencing）分析方法，检测了52例先天性巨结肠病人和120例正常对照者RET-5G／A和-1A／C的基因型。比较不同基因型与先天性巨结肠风险的相关性。结果RET-5AA和-1CC基因型频率在先天性巨结肠患者和正常对照中的分布有显著性差异（P值分别为〈0．001和0．003），携带RET-5AA和-1CC基因型者罹患先天性巨结肠的风险分别是携带RET-5GG和-1AA基因型者的11．40倍（95％CI，2．89-53．09）和4．65倍（95％CI，0．98-32．30）。此外，单倍型分析发现，同时携带两种风险等位基因的A-C单倍型者的患病风险比携带G-A型者增高了4．38倍（95％CI，2．53-11．90）。结论RET基因功能性单核苷酸多态-5G／A和-1A／C多态可能是中国人先天性巨结肠的遗传易感因素。     

HER-2基因Ile655Val多态性与结直肠癌易感性分析

目的 探讨HER-2原癌基因Ile655Val多态性与结直肠癌易感性的相关性,及其在自然人群中的分布频率.方法 应用病例对照研究,对浙江省嘉善县292例结直肠癌患者和842名健康对照者采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法检测HER-2基因密码子655基因型.结果 结直肠癌组HER-2基因Ile/Val+Val/Val基因型频率(25.34%)和Val等位基因频率(13.36%)均显著高于对照组(18.41%和9.74%)(P<0.05).与Ile/lie基因型携带者相比,Ile/Val+Val/Val基因型携带者患结直肠癌的风险增加(OR=1.54,95%CI:1.11～2.14).HER-2基因多态性与吸烟、饮酒的交互作用OR值分别为1.43(95%CI:0.88～2.30)和1.29(95%CI:0.73～2.29).结论 HER-2基因Ile655Val多态性与结直肠癌易感性相关,但是这种多态性与吸烟、饮酒在结直肠癌发生中不存在交互作用.     

HER-2基因Ile655Val多态性与结直肠癌易感性分析

目的 探讨HER-2原癌基因Ile655Val多态性与结直肠癌易感性的相关性,及其在自然人群中的分布频率.方法 应用病例对照研究,对浙江省嘉善县292例结直肠癌患者和842名健康对照者采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法检测HER-2基因密码子655基因型.结果 结直肠癌组HER-2基因Ile/Val+Val/Val基因型频率(25.34%)和Val等位基因频率(13.36%)均显著高于对照组(18.41%和9.74%)(P<0.05).与Ile/lie基因型携带者相比,Ile/Val+Val/Val基因型携带者患结直肠癌的风险增加(OR=1.54,95%CI:1.11～2.14).HER-2基因多态性与吸烟、饮酒的交互作用OR值分别为1.43(95%CI:0.88～2.30)和1.29(95%CI:0.73～2.29).结论 HER-2基因Ile655Val多态性与结直肠癌易感性相关,但是这种多态性与吸烟、饮酒在结直肠癌发生中不存在交互作用.     

HER-2基因Ile655Val多态性与结直肠癌易感性分析

目的 探讨HER-2原癌基因Ile655Val多态性与结直肠癌易感性的相关性,及其在自然人群中的分布频率.方法 应用病例对照研究,对浙江省嘉善县292例结直肠癌患者和842名健康对照者采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法检测HER-2基因密码子655基因型.结果 结直肠癌组HER-2基因Ile/Val+Val/Val基因型频率(25.34%)和Val等位基因频率(13.36%)均显著高于对照组(18.41%和9.74%)(P<0.05).与Ile/lie基因型携带者相比,Ile/Val+Val/Val基因型携带者患结直肠癌的风险增加(OR=1.54,95%CI:1.11～2.14).HER-2基因多态性与吸烟、饮酒的交互作用OR值分别为1.43(95%CI:0.88～2.30)和1.29(95%CI:0.73～2.29).结论 HER-2基因Ile655Val多态性与结直肠癌易感性相关,但是这种多态性与吸烟、饮酒在结直肠癌发生中不存在交互作用.     

HER-2基因Ile655Val多态性与结直肠癌易感性分析

目的 探讨HER-2原癌基因Ile655Val多态性与结直肠癌易感性的相关性,及其在自然人群中的分布频率.方法 应用病例对照研究,对浙江省嘉善县292例结直肠癌患者和842名健康对照者采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法检测HER-2基因密码子655基因型.结果 结直肠癌组HER-2基因Ile/Val+Val/Val基因型频率(25.34%)和Val等位基因频率(13.36%)均显著高于对照组(18.41%和9.74%)(P<0.05).与Ile/lie基因型携带者相比,Ile/Val+Val/Val基因型携带者患结直肠癌的风险增加(OR=1.54,95%CI:1.11～2.14).HER-2基因多态性与吸烟、饮酒的交互作用OR值分别为1.43(95%CI:0.88～2.30)和1.29(95%CI:0.73～2.29).结论 HER-2基因Ile655Val多态性与结直肠癌易感性相关,但是这种多态性与吸烟、饮酒在结直肠癌发生中不存在交互作用.     

HER-2基因Ile655Val多态性与结直肠癌易感性分析

目的 探讨HER-2原癌基因Ile655Val多态性与结直肠癌易感性的相关性,及其在自然人群中的分布频率.方法 应用病例对照研究,对浙江省嘉善县292例结直肠癌患者和842名健康对照者采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法检测HER-2基因密码子655基因型.结果 结直肠癌组HER-2基因Ile/Val+Val/Val基因型频率(25.34%)和Val等位基因频率(13.36%)均显著高于对照组(18.41%和9.74%)(P<0.05).与Ile/lie基因型携带者相比,Ile/Val+Val/Val基因型携带者患结直肠癌的风险增加(OR=1.54,95%CI:1.11～2.14).HER-2基因多态性与吸烟、饮酒的交互作用OR值分别为1.43(95%CI:0.88～2.30)和1.29(95%CI:0.73～2.29).结论 HER-2基因Ile655Val多态性与结直肠癌易感性相关,但是这种多态性与吸烟、饮酒在结直肠癌发生中不存在交互作用.     

XPC polymorphisms play a role in tissue-specific carcinogenesis: a meta-analysis

XPC participates in the initial recognition of DNA damage during the DNA nucleotide excision repair process in global genomic repair. Polymorphisms in XPC gene have been analyzed in case-control studies to assess the cancer risk attributed to these variants, but results are conflicting. To clarify the impact of XPC polymorphisms in cancer risk, we performed a meta-analysis that included 33 published case-control studies. Polymorphisms analyzed were Lys939Gln and Ala499Val. The overall summary odds ratio (OR) for the associations of the 939Gln/Gln genotype with risk of cancer was 1.01 (95% confidence interval (95% CI): 0.94-1.09), but there were statistically significant associations for lung cancer, observed for the recessive genetic model (Lys/Lys+Lys/Gln vs Gln/Gln), (OR 1.30; 95% CI: 1.113-1.53), whereas for breast cancer a reduced but nonsignificant risk was observed for the same model (OR 0.87; 95% CI: 0.74-1.01). The results for Ala499Val showed a significant overall increase in cancer risk (OR 1.15; 95% CI: 1.02-1.31), and for bladder cancer in both the simple genetic model (Ala/Ala vs Val/Val) (OR 1.30; 95% CI: 1.04-1.61) and the recessive genetic model (Ala/Ala+Ala/Val vs Val/Val) (OR 1.32; 95% CI: 1.06-1.63). Our meta-analysis supports that polymorphisms in XPC may represent low-penetrance susceptibility gene variants for breast, bladder, head and neck, and lung cancer. XPC is a good candidate for large-scale epidemiological case-control studies that may lead to improvement in the management of highly prevalent cancers.     

No association between three xeroderma pigmentosum group C and one group G gene polymorphisms and risk of cutaneous melanoma

Xeroderma pigmentosum (XP) patients exhibit a 1000-fold increased risk for developing skin cancers including malignant melanoma. We investigated the role of three variant alleles of the DNA repair gene XPC and one variant allele of the XPG gene in a hospital-based case-control study of 294 Caucasian patients from Germany with malignant melanoma and 375 healthy control individuals from the same area matched by sex. The polymorphisms G1580A (XPC exon 8; Arg492His), T1601C (XPC exon 8; Val499Ala), G2166A (XPC exon 10; Arg687Arg), and C3507G (XPG exon 15; Asp1104His) were not in linkage disequilibrium. The allele frequencies (cases: controls) were for 1580A 6.29%: 5.63%, for 1601C 79.08%: 78.28%, for 2166A 26.19%: 28.13%, and for 3507G 79.86%: 78.61%. We found no association of the homozygous 1580A, 1601C, 2166A, and 3507G genotypes with increased risks of melanoma: OR 1.254 (95% CI: 0.486-3.217), OR 1.108 (95% CI: 0.629-1.960), OR 0.817 (95% CI: 0.490-1.358), and OR 1.168 (95% CI: 0.670-2.044), respectively. Exploratory analyses of subgroups of melanoma patients compared to all controls indicated no association of these genotypes with increased risks for development of multiple primary melanomas (n = 28), a negative family history for melanoma (n = 277), melanomas in individuals with a low number of nevi (n = 273), melanomas in individuals older than 55 years (n = 142), and melanomas thicker than 1 mm (n = 126).     

CASP3和 CASP9基因多态性与胃癌遗传易感性的关联研究

目的 探讨凋亡相关基因caspase 3 (CASP3)、caspase 9 (CASP9)单核苷酸多态性与胃癌遗传易感性的关系.方法 采用以自然人群为基础的病例对照研究设计,对278例胃癌患者和以同年龄(± 5岁)、同性别、同居住地匹配为原则获得的278名对照进行研究.CASP3 rs12108497和 CASP9 rs4646018多态位点的基因分型采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性的方法分析.非条件Logistic回归分析计算基因多态与胃癌风险的相关性.结果 携带 CASP3 rs12108497 TC、CC基因型者患胃癌的风险较TT基因型者分别增加45%(OR=1.45,95%CI:1.01～2.07)和117% (OR=2.17,95%CI:1.15～4.08).未发现 CASP9 rs4646018基因多态与胃癌发病风险间存在显著关联.多基因模型显示携带1个或2个风险基因型的个体胃癌易感性增高(OR=1.60,95%CI:1.12～2.30).分层分析表明,携带1个或2个风险基因型的个体罹患胃癌的危险度在男性个体(OR=1.62,95%CI:1.05～2.49)、吸烟者(OR=1.87,95%CI:1.12～3.12)、饮酒者(OR=1.92,95%CI:1.02～3.65)和无肿瘤家族史者(OR=1.78,95%CI:1.18～2.68)中尤为明显.结论 CASP3 rs12108497 多态性会增加胃癌的发病风险.CASP9 rs4646018多态性与胃癌发病风险无关.

Abstract：

Objective To investigate the association between the apoptosis genes CASP3 (rs12108497) and CASP9 (rs4646018) polymorphisms and the risk of developing stomach cancer. Methods In this population-based case-control study, 278 cases with stomach cancer and 278 age (±5 years), gender, and residential area matched controls were recruited. The genotypes were analyzed by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) method. The unconditional Logistic regression analysis was utilized to calculate the odds ratios (OR) and 95% confidence intervals (CI). Results The individuals with TC, CC genotypes of rs12108497 locus had significantly increased risk of stomach cancer in comparison to those carrying TT genotype (OR=1.45, 95% CI: 1.01-2.07 for TC; OR=2.17, 95%CI: 1.15-4.08 for CC). However, the rs4646018 locus of CASP9 gene polymorphism was not related to stomach cancer risk. Compared with the subjects carrying the both low-risk genotypes, those carrying 1 or 2 high-risk genotypes had a noteworthy increased risk of stomach cancer (OR=1.60, 95% CI: 1.12-2.30). The combined high-risk genotypes appeared to be more evident in subjects of male (OR=1.62, 95% CI: 1.05-2.49), ever-smokers (OR=1.87, 95%CI: 1.12-3.12), ever-drinkers (OR=1.92, 95%CI:1.02-3.65) and no family history of cancer (OR=1.78, 95%CI: 1.18-2.68). Conclusion The current findings suggest that the polymorphism of CASP3 rs12108497 might be associated with the risk of stomach cancer. However, the CASP9 rs4646018 polymorphism may not be related to the stomach cancer risk.     

HER-2基因Ile655Val多态性与结直肠癌易感性分析

目的 探讨HER-2原癌基因Ile655Val多态性与结直肠癌易感性的相关性,及其在自然人群中的分布频率.方法 应用病例对照研究,对浙江省嘉善县292例结直肠癌患者和842名健康对照者采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法检测HER-2基因密码子655基因型.结果 结直肠癌组HER-2基因Ile/Val+Val/Val基因型频率(25.34%)和Val等位基因频率(13.36%)均显著高于对照组(18.41%和9.74%)(P<0.05).与Ile/lie基因型携带者相比,Ile/Val+Val/Val基因型携带者患结直肠癌的风险增加(OR=1.54,95%CI:1.11～2.14).HER-2基因多态性与吸烟、饮酒的交互作用OR值分别为1.43(95%CI:0.88～2.30)和1.29(95%CI:0.73～2.29).结论 HER-2基因Ile655Val多态性与结直肠癌易感性相关,但是这种多态性与吸烟、饮酒在结直肠癌发生中不存在交互作用.     

HER-2基因Ile655Val多态性与结直肠癌易感性分析

目的 探讨HER-2原癌基因Ile655Val多态性与结直肠癌易感性的相关性,及其在自然人群中的分布频率.方法 应用病例对照研究,对浙江省嘉善县292例结直肠癌患者和842名健康对照者采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法检测HER-2基因密码子655基因型.结果 结直肠癌组HER-2基因Ile/Val+Val/Val基因型频率(25.34%)和Val等位基因频率(13.36%)均显著高于对照组(18.41%和9.74%)(P<0.05).与Ile/lie基因型携带者相比,Ile/Val+Val/Val基因型携带者患结直肠癌的风险增加(OR=1.54,95%CI:1.11～2.14).HER-2基因多态性与吸烟、饮酒的交互作用OR值分别为1.43(95%CI:0.88～2.30)和1.29(95%CI:0.73～2.29).结论 HER-2基因Ile655Val多态性与结直肠癌易感性相关,但是这种多态性与吸烟、饮酒在结直肠癌发生中不存在交互作用.