荧光MGB探针实时PCR检测经典型苯丙酮尿症的基因突变

[目的]探讨荧光MGB探针实时PCR技术检测经典型苯丙酮尿症的基因突变。[方法]运用荧光MGB探针实时PCR检测经典型苯丙酮尿症33例，一级亲属43例，正常对照30例。检出R243Q突变的PCR标本进行测序验证。[结果]发现11例PKU具有R243Q突变，突变频率为33％，其中突变纯合子4例，突变杂合子7例，一级亲属检出R243Q杂合子突变9例，正常人未发现R243Q突变。所有突变均经测序证实。[结论]PAH基因第7外显子的R243Q点突变在中国PKU患中有较高的突变率；荧光MGB探针实时PCR是PKU的基因诊断良好技术平台。     

苯丙酮尿症患儿苯丙氨酸羟化酶基因外显子7突变特点及临床研究

目的:探究苯丙酮尿症(PKU)患儿苯丙氨酸羟化酶(PAH)基因外显子7突变特点及其与临床的关系.方法:选取87例PKU患儿为研究对象.聚合酶链反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)分析PAH基因外显子7突变与基因测序,分析其与经典型、中间型及轻型PKU之间的关系.结果:87例患儿检出6种PAH基因外显子7位点突变,分别为R243Q、IVS7+2T-A、R241C、G247R、L255S、G247V,其基因频率分别为18.97％、4.02％、1.72％、1.15％、1.15％、0.57％;经典型PKU患儿检出6种突变,中间型PKU检出R243Q、IVS7+2T-A、R241C等3种突变,而轻型PKU仅检出R243Q突变;应用外显子7位点突变情况预测患儿PKU表型显示,经典型、中间型及轻型PKU预测与临床诊断一致性较高,Kappa值分别为0.818、0.781、0.935.结论:PKU患儿PAH外显子7突变主要以R243Q、IVS7+2T-A为主,其基因型与PKU表型存在相关性,有助于患儿PKU表型预测.     

苯丙氨酸羟化酶基因突变家系PCR-SSCP分析

目的探讨聚合酶链反应-单链构象多态性（PCR-SSCP）检测方法对确定苯丙酮尿症（PKU）患者基因突变来源的应用价值,以便更好地应用于PKU基因诊断和产前诊断。方法对15例确诊的经典型PKU患者及其双亲的PAH基因的第3、5、6、7和11外显子及部分内含子行PCR扩增和非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分析;无PKU家族史的正常人作为正常对照。PCR-SSCP检测出异常外显子行PCR正、反向测序确定突变类型并分析患者的基因突变来源。结果5例患者的30个等位基因共检出16个突变,共14个突变等位基因来源均得到确定,1例患者（基因型为G247V/R243X）的突变来源未能确定。结论（1）PCR-SSCP检测方法可以确定PKU患者的基因突变来源（包括纯合突变和杂合突变）,但对于2个基因突变位于同一外显子的杂合子患者,该方法不能很好地确定基因突变来源。（2）PCR-SSCP方法能够区分基因突变纯合子与基因突变杂合子。     

内蒙古经典型苯丙酮尿症PAH基因外显子7突变的检测及一种新突变的鉴定

目的：探讨内蒙古地区经典型苯丙酮尿症(PKU)基因突变特征，为基因诊断提供依据。方法：应用PCR-单链构象多态性分析技术和DNA直接测序的方法，对22例内蒙古地区PKU病人苯丙氨酸羟化酶(PAH)基因外显子7内突变进行了检测。结果：共检出4种错义突变；R243Q、R252Q、R261Q及G239D，1种剪接部位突变IVS7nt(2)，突变频率分别为：8／44、1／44、1／44、1／44、1／44。经与国际PAH基因突变数据库比较，确认G239D(G→A)为国际上首次发现的新突变。结论：内蒙古地区PKU病人PAH基因外显子7的突变位点、突变频率和中国东北人群相类似。但与中国南方人群PAH基因突变特点不同，这对提高内蒙古地区基因诊断率有其理论及实用价值。     

新疆维吾尔族苯丙氨酸羟化酶基因突变分析

目的 了解新疆维吾尔族苯丙氨酸羟化酶(PAH)基因的突变构成及特点.方法 采用PCR产物直接测序的方法,测定9例维吾尔族苯丙酮尿症(PKU)患者PAH基因全部外显子及其启动子区域序列.结果 在18个PAH等位基因中共检出15个不同的突变基因,检出率为83.3%(15/18),常见突变类型包括R243Q、EX6-96A＞G和R111X,其余突变类型均为散在发生.从维吾尔族中检出的PAH突变基因均系在本民族中首次报道,其中5'-Flanking-480DelACT和5'-Flanking-626 G＞C突变是世界新的PAH基因突变类型.L348V突变是国内未见报道的新突变.结论 研究结果显示维吾尔族PAH基因突变表现出多样性、复杂性和特殊性,具有显著的民族特色.     

吉林和辽宁地区80例苯丙酮尿症患儿苯丙氨酸羟化酶基因突变分析

背景 苯丙酮尿症(phenylketonuria,PKU)是一种常染色体隐性遗传的氨基酸代谢病,由苯丙氨酸羟化酶(phenylalanine hydroxylase,PAH)活性的部分或完全缺失引起,会使苯丙氨酸在体内蓄积,导致患儿出现神经系统等损害.PAH基因突变种类和频率存在明显的地域和种族差异.目的 分析吉林和辽宁地区苯丙酮尿症80例患儿苯丙氨酸羟化酶PAH基因的突变特征.方法 对2016 - 2018年吉林辽宁两省医院80例PKU患儿PAH基因的13个外显子及其侧翼序列,包含5'和3'端非编码区,进行一代测序点突变分析.结果 80例患儿共检出161个突变位点,占292个突变等位基因的55.14％.其中,R243Q占比最高(15.75％),IVS11-3 A>T、R413P、IVS4-1 G>A和EX6-96A>G次之,占比依次为4.11％、3.42％、3.08％和3.08％.另外5个低频突变位点Y356*、R111*、R241C、R53H a和IVS2 + 19 T>C突变频率为1％～3％.此次,我们发现PAH基因1个新的突变点F294S,位于8号外显子.结论 依据此次吉林辽宁地区80例PKU患儿PAH基因的突变特点,为该地区预防PKU出生缺陷提供理论依据.     

用PCR-SSCP-银染法检测苯丙酮尿症PAH基因外显子11的点突变

目的：研究内蒙古地区经典型苯丙酮尿症(PKU)苯丙氨酸羟化酶(PAH)基因突变的特点和频率，以提高该地区苯丙酮尿症(PKU)的基因诊断率。方法：应用PCR-SSCP-银染法和DNA直接测序的方法，对22例内蒙古地区PKU患者苯丙氨酸羟化酶(PAH)基因外显子11进行了检测。结果：检出一种已知突变Y356X(TAC-TAA)，突变频率为13．6％。结论：内蒙古地区PKU患者PAH基因外显子11的突变频率均高于我国的其它北方人群，也高于云南PKU患者的突变频率，这为内蒙古地区PKU患者PAH基因分析和产前诊断提供了科学依据。     

第2代测序技术在甲基丙二酸尿症以及苯丙酮尿症诊断中的应用

目的 探讨第2代测序技术在儿童常见遗传代谢病诊断中的价值, 提出遗传代谢病诊断的新策略。方法 采用目标区序列捕获及第2代高通量测序技术对临床诊断的3例甲基丙二酸尿症、2例苯丙酮尿症患儿进行检测, 同时采用Sanger测序技术对患者突变进行验证。结果 3例甲基丙二酸尿症患儿检测发现均为MMACHC基因突变, 其中1例为c.80A > G(P.Q27R)和c.609 G > A (P.W203X)复合杂合突变, 1例为c.394C > T(P.R132X)和c.567dupT(P.I190fs)复合杂合突变, 另1例为c.80A > G(P.Q27R)和c.271dupA(P.R91fs)复合杂合突变。2例苯丙酮尿症患儿检测发现PAH基因突变, 其中1例为c.158G > A(P.R53H)和c.838G > A(P.E280K)复合杂合突变, 另1例为c.158G > A(P.R53H)和c.1238 G > C (P.R413P)复合杂合突变, 上述突变均为已知致病突变位点杂合突变;Sanger测序结果与第2代测序结果相符合。结论 本研究提示第2代测序技术具有低成本、高通量、高敏感度以及可灵活设计的特点, 可作为儿科临床常见遗传代谢病基因诊断的首选工具。     

内蒙古经典型苯丙酮尿症PAH基因外显子11突变的检测

目的：研究内蒙古地区经典型苯丙酮尿症（PKU）苯丙氨酸羟化酶（PAH）基因突变的特点和频率，以提高该地区PKU的基因诊断率。方法：应用PCR—SSCP-银染法和DNA直接测序的方法，对22例内蒙古地区PKU病人PAH基因外显子11进行了检测。站果：检出一种已知突变Y356X（TAC→TAA），突变频率为13．6％。结论：内蒙古地区PKU病人PAH基因外显子11的突变频率均高于我国的其它北方人群，也高于云南PKU病人的突变频率，这为内蒙古地区PKU病人PAH基因分析和产前诊断提供了科学依据。     

目标序列捕获二代测序技术在苯丙酮尿症基因诊断中的应用

 目的  评估目标序列捕获二代测序技术在苯丙酮尿症(phenylketonuria,PKU)基因诊断中的应用价值。方法  采用目标区序列捕获及第二代测序技术对9例经典型PKU患者的苯丙氨酸羟化酶(phenylalanine hydroxylase,PAH)基因进行检测;采用Sanger测序技术对患者及其父母基因突变型进行验证。结果  9例患者检测到PAH基因的12种致病性突变,包括7种错义突变(p.I65T、p.F161S、p.Q204C、p.R241C、p.L242F、p.R243Q和p.Q375E),2种无义突变(p.R111X和p.Y356X),3种剪接突变［c.442 1G>A(IVS4 1G>A)、c.1315+6T>A(IVS12+6T>A)和c.1316 2A>C(IVS12 2A>C)］,以及3种非致病性的变异(p.Q232Q、p.V245V和p.L385L),致病性突变均来自患者父母。其中,2个致病性突变未见报道,分别为c.1316 2A>C和p.Q375E(CAA >GAA)。结论  目标序列捕获二代测序可以准确检测出PAH基因突变,对遗传病因明确的疾病具有一定的临床应用价值。     

苯丙氨酸羟化酶基因突变检测对苯丙酮尿症的诊断意义

目的探讨苯丙氨酸（PA）羟化酶（PAH）基因突变检测对苯丙酮尿症（PKU）的诊断意义及其对PKU患儿的影响。方法选取PKU患儿135例进行临床实验,所有受试者PAH基因突变情况均采用聚合酶链式反应技术进行扩增,采用Sanger测序方法检测其突变点,PAH基因是否存在大片缺失重复采用多重连接探针扩增技术（MLPA）检测,最后将各项检测数据纳入SPSS 21.0软件处理,分析PAH突变情况及比较其PAH突变对KPU患儿智商的影响。结果135例PKU患儿（270对PAH等位基因）中,共12例患儿有PAH基因突变,占比8.89%,突变位点共12个,其中R243Q、Y204C、R241C、IVS4-1、R413P、R111X、R261Q、W326X及Y356X等均有突变频率,各占总PAH等位基因的5.19%、5.19%、3.70%、2.96%、2.22%、1.48%和1.48%、0.74%、0.74%,而E56D、F161S、A345T等的突变频率则不明显。经SNaPShot、Sanger及MLPA检测12例PKU患儿的PAH基因突变情况发现,纯合突变占比16.67%,复合、杂合突变占比83.33%。12例PKU患儿干预后的PA低于干预前、全智商评分高于干预前,差异均具有统计学意义（P < 0.05）,而言语智商、操作智商干预前后差异均无统计学意义（P>0.05）。经Pearson分析发现12例PAH基因突变的PKU患儿治疗期的PHE平均控制浓度与1周岁时的IQ检测值呈负相关（r=-0.924,P < 0.01）。结论在PKU患儿的临床治疗过程中科学、合理地进行PAH基因突变检测并严格控制患儿的PHE血浓度有较好的临床应用与推广价值,也是改善患儿智商的关键因素之一。     

中国人苯丙氨酸羟化酶基因的10种新突变

目的 研究中国人苯丙氨酸羟化酶(PAH)基因突变的分子基础。方法 应用PCR／SSCP、序列分析等技术,分析中国北方地区120个经典型苯酮尿症(PKU)核心家系,对PAH基因外显子3、5、7、10、11、12进行突变基因的筛查和确定。结果 在确定的31种突变中(另文报道)有10种突变首次在中国PKU人群中发现：165T、S70del、G239D、R241fsdelG、L255S、P281L、G346R、L367fsinsC、R400S和Ivsllnt2t→c。其中4种突变G239D、R241fsdelG、R400S和Ivsllnt2t→c在国际PAH数据库末见公布(至投稿日期)。新突变显示中国人PAH基因虽以点突变为主,但存在小的碱基插入、缺失以及移码突变。新突变主要发生在外显子7中(4／10),每种突变的发生频率均很低(0．42％。1．3％)。结论 中国人PAH基因存在高度异质性和突变的多样性,外显子7是PAH基因的突变热点区域。     

Detection of point mutations of the phenylalanine hydroxylase gene and prenatal diagnosis of phenylketonuria.

The known mutant alleles of the human phenylalanine hydroxylase (PAN) gene were analyzed in 25 phenylketonuria (PKU) families from North China by using polymerase chain reaction and allele-specific oligonucleotide dot blot hybridization techniques. The results showed that the six mutations analyzed accounted for 62% of all PKU genes. The three most frequent mutations were R243Q, R413P and Y204C. Seven prenatal gene diagnoses were carried out in 6 PKU families and were confirmed after birth or by examination of aborted materials.     

锁核酸结合分子信标技术检测乙型肝炎病毒DNA G1896A点突变研究

目的研究和评估乙型肝炎病毒(HBV)DNA G1896A点突变的实时荧光PCR检测方法。方法收集经测序验证HBV DNA G1896A未突变的野生型样本150例和已发生突变的突变型样本58例,在突变区域设计分子信标探针,点突变处进行锁核酸处理,利用荧光PCR方法检测HBV前C区G1896A点突变;再从临床标本中随机抽取18例、8例和19例荧光PCR结果分别显示为G1896A突变的标本、杂合的标本以及野生型的标本的PCR产物进行序列测定。结果突变型质粒和野生型质粒的检测灵敏度均可以达到100copies/ml;突变型探针检测高浓度的野生型质粒时无检测信号,野生型探针检测高浓度突变型质粒时无检测信号;突变型模板在总杂合模板中的比例达到5%时则都可以将突变型检测出来;序列测定的8例G1896A突变标本、6例杂合标本和19例野生型标本的PCR产物结果和荧光PCR检测结果完全吻合。结论实时荧光PCR检测方法可以快速、简便、准确地检测HBVDNAG1896A点突变,是检测点突变的重要方法,具有重要的临床应用价值。     

Frequencies of 6 known mutations in phenylalanine hydroxylase gene and their application in prenatal gene diagnosis]

The known mutant alleles of human phenylalanine hydroxylase gene were analyzed in 25 phenylketonuria (PKU) families from North China by polymerase chain reaction combined with allele-specific oligonucleotide dot hybridization techniques. The results showed that the six mutation accounted for 62% of all PKU genes. The three most frequent mutations were Arg243-->Gln in exon 7, Arg413-->Pro in exon 12 and Tyr204-->Cys in exon 6. They accounted for 24%, 18% and 16% respectively of all PKU alleles. The frequencies of Arg111-->Ter mutation in exon 3, Tyr356-->Ter mutation in exon 11 and Trp326-->Ter mutation in exon 10 were somewhat lower in North China. They accounted for 4% of all PKU alleles. Among these 25 PKU families, prenatal gene diagnosis was possible in 10 families. In 11 families, 50% exclusive diagnosis was possible. Prenatal gene diagnosis was performed and confirmed in 2 families.     

MUTATIONS IDENTIFIED IN EXON 7 OF PHENYLALANINE HYDROXYLASE GENE IN CHINESE

Exon 7 of the phenylalanine hydroxylase (PAH) gene was analyzed in 45 children affected with classic phenylketonuria (PKU) from northern China by using PCR-single strand conformation polymorphism (PCR-SSCP)technique and DNA direct sequencing. Six missense mutatiorm(i.e. R243Q,R241H,G247V,L249H,F2541 and G257V)and one silent mutation (V245v) were identified. The latter three mlssense mutations were demonstrated as novel mutations in comparison with the PAH mutation database. One missense mutation (R241H) was first documented in Chinese. Our results showed population and region differences in the PAH mutation distribution,and suggest that there is more than one founding population for PKU in China. The finding of novel mutations will enhence the molecular diagnosis of PKU.     

河北地区55例苯丙酮尿症患者苯丙氨酸羟化酶基因突变的检测与分析

目的 了解河北地区苯丙酮尿症(PKU)患者苯丙氨酸羟化酶(PAH)基因突变情况,分析该地区PAH基因的突变谱及突变特点.方法 联合应用PAH基因全部外显子及外显子-内含子交界区扩增测序和多重连接依赖式探针扩增(MLPA)方法,对2007年9月至2009年7月就诊的55例来自河北地区的PKU患者进行PAH基因点突变和拷贝数改变的检测.对发现大片段缺失的个体,用跨越断裂位点(Gap) -PCR-测序方法确定断裂点精确位置.结果 110个PAH等位基因中检出突变等位基因108个,突变检出率为98.2％.共发现PAH基因突变41种,涉及11个外显子,包括错义突变24种、无义突变7种、剪接位点突变7种、小的缺失1种和大片段缺失2种,其中4种错义突变(p.Pro147ku,p.Gly289Arg,p.Phe392Ser,p.Ile421Thr)和2种大片段缺失突变(- 4163_ - 406del和- 1932_+ 3402del)为国际首次报道.55例患者中以下3种突变所占比例最高:p.Arg243Gln(12.7％)、c.611A ＞G(11.8％)和c.1197A ＞T(9.1％).结论 中国河北地区PKU患者中PAH基因的突变分布广泛;突变类型大部分为单碱基替换,但是大片段缺失也占一定比例.