胶质母细胞瘤8号、22号染色体等位基因杂合性丢失的研究

目的：寻找胶质母细胞瘤（GBM）8号，22号染色体上可能存在肿瘤抑制基因的杂合性丢失（LOH）区域。为发展和定位肿瘤抑制基因（TSG）提供线索和依据。方法：应用聚合酶链反应（PCR）方法，采用荧光标记的引物和377型DNA序列自动分析仪，分别分析了21例GBM8号，22号染色体上14个，7个微卫星多态性标记的LOH。结果：本组病例8号染色体LOH率为23．8％，在16．3％能提供信息位点检测到LOH，8P的LOH率明显高于8q，分别为23．8％，14．3％，8q上所有位点的LOH率都在15％以上，以8p22-23上D8S550和D8S549的LOH率较高，分别是27．8％，30．0％，染色体22q的LOH率为47．6％，在30．0％可提供信息位点存在LOH，以22q13.2-13.3上D22S274的LOH率最高（41．2％），结论：8号，22号染色体等位基因杂合性丢失可能在GBM的分子发病机制中发挥着重要作用。在8p22-23上D8S550和D8S549位点间区域以及22q13.2-13.3上D22S274位点所在区域可能存在多个与GBM相关的肿瘤抑制基因。     

胶质母细胞瘤1号染色体杂合性丢失的初步研究

目的 寻找胶质母细胞瘤（ＧＢＭ）１号染色体上可能存在肿瘤抑制基因的杂合性丢失（ＬＯＨ）区域,为发现和定位肿瘤抑制基因提供线索和依据。方法 应用聚合酶链反应（ＰＣＲ）方法,采用荧光标记的引物和３７７型ＤＮＡ自动序列分析仪,分析了２１例ＧＢＭ１号染色体上３１个微卫星多态性标记的ＬＯＨ。结果 在５２％（１１／２１例）ＧＢＭ的１号染色体上观察到了ＬＯＨ,在２０％（９４／４６３）可提供信息位点存在ＬＯＨ。其     

胶质母细胞瘤1号染色体杂合性丢失的初步研究

目的寻找胶质母细胞瘤(GBM)1号染色体上可能存在肿瘤抑制基因的杂合性丢失(LOH)区域,为发现和定位肿瘤抑制基因提供线索和依据。方法应用聚合酶链反应(PCR)方法,采用荧光标记的引物和377型DNA自动序列分析仪,分析了21例GBM1号染色体上31个微卫星多态性标记的LOH。结果在52%(11/21例)GBM的1号染色体上观察到了LOH,在20%(94/463)可提供信息位点存在LOH。其中1p的LOH率高于1q,1p和1q的LOH率分别为43%(9/21)、33%(7/21)。1p上各微卫星位点的LOH率均小于30%。在1q的下列位点上检测到了较高LOH率1q24-1q25上的D1s218(31.6%)、1q32.3-1q43上的D1s2785(31.6%)-D1s2842(37.5%)。结论染色体1p在GBM的分子发病机制中并不重要,而染色体1q上遗传物质的分子遗传学变化可能在GBM的发生发展中起着重要作用,染色体1q24-1q25上的D1s218和1q32.3-1q43上的D1s2785-D1s2842位点间区域可能存在与GBM有关的肿瘤抑制基因。     

食管鳞状细胞癌染色体13q11-12杂合性丢失

目的分析食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)在13号染色体长臂11-12区(13q11-12)上的等位基因杂合性丢失(LOH),以期寻找13q11-12区上可能存在的与食管鳞状细胞癌有关肿瘤抑制基因的缺失区域。方法用9个位于13q11-12区的微卫星标志物,对56例ESCC患者组织切片激光显微切割后,进行PCR-LOH分析;56例ESCC患者包括34例有上消化道癌家族史,22例无上消化道癌家族史。结果56例ESCC患者中,49例(87.5%)显示一个或更多位点LOH;并发现一个LOH高频率区,位于位点D13S787和D13S221之间,物理距离仅有1.83 Mb;在位点D13S1236有上消化道癌家族史组LOH为89%,明显高于无上消化道癌家族史组53%(P=0.031<0.05),差异有显著性意义。结论研究提示染色体13q11-12的LOH可能在食管癌发生、发展中起重要作用;在染色体13q11-12区上,可能存在一个或多个与ESCC发生发展有关的肿瘤抑制基因(TSG)。     

Chromosome 14q may harbor multiple tumor suppressor genes in primary glioblastom a multiformec

目的：评价染色体14q的（杂合性）丢失是否与原发性多形性胶质母细胞瘤的发生发展有关,并确定14q上可能存在的共同杂合性丢失区域。方法：应用聚合酶链反应（PCR）为基础的微卫星分析方法,采用14个荧光标记的多态性（微卫星）标记,检测了20例原发性多形性胶质母细胞瘤（GBM）染色体14q的杂合性丢失（LOH）状况。结果：50％（10/20例）GBM在染色体14q上至少有一个微卫星标记存在LOH,其中5个病例的所有被检测标记都表现为LOH或不能提供信息。在位于14q32.1的D14S65位点、14q23-31的D14S63-D14S74位点间区域检测到的LOH率最高,分别为57.1％、46.7％-47.1％。在本研究中的所有位点,均未检测到微卫星不稳定。结论：染色体14q上的等位基因丢失可能在GBM发病机制中起着重要作用,14q32.1上的D14S65位点、14q23-31上的D14S63-D14S74位点间区域可能存在与GBM相关的多个肿瘤抑制基因。     

胶质母细胞瘤染色体lp36杂合性缺失的初步研究

日的探讨1p36上可能存在的与胶质母细胞瘤(GBM)发生有关的肿瘤抑制基因的缺失区域,为发现和定位肿瘤抑制基因提供线索和依据.方法 运用聚合酶链反应(PCR)技术为基础的杂合性缺失分析(LOH)法对12例胶质母细胞瘤染色体1p36上12个微卫星多态标记序列作了较详细研究.结果 12例胶质母细胞瘤至少有一个位点出现杂合性缺失者11例,总缺失率为91.7%(11/12),其中以D1S214-D1S2666位点间区域LOH的频率最高.结论 胶质母细胞瘤染色体1p36发生高频率杂合性缺失,提示位点D1S214-D1S2666缺失区域间可能存在着与GBM发生有关的抑癌基因.     

胶质母细胞瘤染色体1p36杂合性缺失的初步研究

目的探讨1p36上可能存在的与胶质母细胞瘤（GBM）发生有关的肿瘤抑制基因的缺失区域，为发现和定位肿瘤抑制基因提供线索和依据。方法运用聚合酶链反应（PCR）技术为基础的杂合性缺失分析（LOH）法对12例胶质母细胞瘤染色体1p36上12个微卫星多态标记序列作了较详细研究。结果12例胶质母细胞瘤至少有一个位点出现杂合性缺失者11例，总缺失率为91．7％（11／12），其中以D1S214-D1S2666位点间区域LOH的频率最高。结论胶质母细胞瘤染色体1p36发生高频率杂合性缺失，提示位点D1S14-D1S2666缺失区域间可能存在着与GBM发生有关的抑癌基因。     

髓母细胞瘤11号染色体的杂合性丢失分析

目的研究髓母细胞瘤的遗传学异常,以探讨该肿瘤的发病机制.方法应用微卫星灶分析方法,研究髓母细胞瘤11号染色体的杂合性丢失(LOH).结果收集20例髓母细胞瘤,应用20个特异性标记物对11号染色体的杂合性丢失进行了分析.结果显示67%的可分析病例具有等位基因的丢失.染色体短臂(11p)和长臂(11q)上的杂合性丢失率分别为27%和13%.同时,在11 p13-15.1上发现了一个共同丢失位点.结论 11 p13-15.1上很可能存在重要的抑癌基因,该基因的丢失可能与髓母细胞瘤的发生有关.     

髓母细胞瘤11号染色体的杂合性丢失分析

目的研究髓母细胞瘤的遗传学异常,以探讨该肿瘤的发病机制.方法应用微卫星灶分析方法,研究髓母细胞瘤11号染色体的杂合性丢失(LOH).结果收集20例髓母细胞瘤,应用20个特异性标记物对11号染色体的杂合性丢失进行了分析.结果显示67%的可分析病例具有等位基因的丢失.染色体短臂(11p)和长臂(11q)上的杂合性丢失率分别为27%和13%.同时,在11 p13-15.1上发现了一个共同丢失位点.结论 11 p13-15.1上很可能存在重要的抑癌基因,该基因的丢失可能与髓母细胞瘤的发生有关.     

肿瘤抑制基因

1969年Heubner和Todaro提出了癌基因的假说.1970年mantin首先观察到癌基因的作用.癌基因是能转化正常细胞而诱发肿瘤的病毒或肿瘤细胞的DNA.在正常动物细胞中存在着癌基因的付本,即原癌基因.在适当的条件下原癌基因被激活、导致出现某些与肿瘤细胞有关的表型,引起肿瘤.八十年代另一类与肿瘤有关的基因已被发现,它们的产物有控制细胞增殖的功能.失去这类基因的功能可能和正常细胞     

A genome-wide allelotype study of primary and corresponding recurrent glioblastoma multiforme in one patient

Glioblastoma multiforme (GBM) is the most common type of primary malignant brain tumor. Although comprehensive therapeutic measures are available, recurrence is very frequent and the prognosis of GBM remains dismal. To date, little is known about the molecular pathogenesis associated with GBM recurrence. According to Knudson ' s two-hit hypothesis of tumor suppressor gene (TSG) inactivation,1 deletion of a chromosomal region, as revealed by loss of heterozygosity (LOH), is often indicative of the presence of a potential TSG. Allelotype studies involving a comprehensive LOH analysis of the whole genome can provide more detailed and thorough information for detecting genetic anomalies than traditional LOH analysis. The present study is designed to conduct a genome-wide allelotype analysis of one patient ' s primary and corresponding recurrent GBM tumors in an effort to reveal molecular genetic alterations associated with the recurrence of this malignancy.     

A genome-wide allelotype study of primary and corresponding recurrent glioblastoma multiforme in one patient

Glioblastoma multiforme (GBM) is the most common type of primary malignant brain tumor. Although comprehensive therapeutic measures are available, recurrence is very frequent and the prognosis of GBM remains dismal. To date, little is known about the molecular pathogenesis associated with GBM recurrence.     

Genome-wide allelotype study of primary glioblastoma multiforme

Objective To investigate the molecular genetic pathogenesis of primary glioblastoma multiforme (GBM) and identify which chromosomes or chromosomal regions of the entire genome may harbor tumor suppressor genes (TSGs) associated with GBM.Methods A high-resolution allelotype study of 21 cases of primary GBM was performed by PCR-based loss of heterozygosity （LOH）analysis. Three hundred and eighty-two fluorescent dye-labeled microsatellite markers covering all 22 autosomes were applied. The mean genetic distance between two flanking markers was about 10 cM.Results LOH was observed on all 39 nonacrocentric autosomal arms examined in this study. The LOH frequencies of 10q, 10p, 9p, 17p and 13q were the highest (&gt;50%). Furthermore, high LOH frequencies were detected in the regions containing known TSGs including PTEN, DMBT1, p16, p15, p53 and RB; the LOH frequencies on 14q, 3q, 22q, 11p, 9q, 19q were also high (&gt;40.5%). Our study observed the following commonly deleted regions: 9p22-23, 10p12.2-14, 10q21.3, 13q12.1-14.1, 13q14.3-31, 17p11.2-12, 17p13, 3q25.2-26.2, 11p12-13, 14q13-31, 14q32.1, 14q11.1-13, 22q13.3, 4q35, 4q31.1-31.2, 6q27 and 6q21-23.3. Conclusions The molecular pathogenesis of GBM is very complicated and associated with a variety of genetic abnormalities on many chromosomal arms. The most closely related chromosomal arms to the pathogenesis of GBM are 10q, 10p, 9p, 17p and 13q. Besides the well-known TSGs including PTEN, DMBT1, p16, p15, p53 and RB, multiple unknown TSGs associated with GBM may be present on the commonly deleted regions detected in the present study.     

老年人胃癌肿瘤抑制基因启动子区甲基化状态

目的 分析老年人胃癌组织及其癌旁小凹上皮和慢性胃炎小凹上皮中肿瘤抑制基因启动子区甲基化状态.方法 采用甲基化特异性聚合酶链反应(MSP)方法,检测51例老年人胃癌及其癌旁小凹上皮和15例慢性胃炎小凹上皮石蜡标本中E钙黏素(E-CD)、错配修复酶hMLH1、APC和6-氧-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)基因启动子区甲基化状态.结果 在胃癌组织及其癌旁小凹上皮和慢性胃炎小凹上皮中,基因总的甲基化率分别为70.6%(36/51例)、47.0%(24/51例)和6.6%(1/15例),三者之间差别有统计学意义(P＜0.01).Lauren弥漫型、Ming浸润型、低分化和未分化、Ⅲ期和Ⅳ期、T3和T4以及有淋巴结转移胃癌的甲基化率分别高于Lauren肠型、Ming膨胀型、高和中分化、Ⅰ期和Ⅱ期、T1和T2以及无淋巴结转移胃癌的甲基化率(均P＜0.05).结论 E-CD、hMLH1、APC和MGMT基因启动子区甲基化在慢性胃炎小凹上皮中少见,在癌旁小凹上皮中频繁出现,在胃癌组织中普遍存在,提示甲基化可能是胃癌发生的早期事件.     

中国人胃癌染色体11p15.5处杂合性缺失分析

目的　通过对中国人胃癌染色体 11p15 .5处杂合性缺失的研究 ,了解中国人群中胃癌病人在此区域杂合性缺失的情况。方法　从 66例胃癌病人的石蜡包埋的手术病理标本中 ,提取肿瘤及相应正常组织的DNA ,用荧光标记的方法选取 11p15 .5处的微卫星DNA标记进行PCR扩增 ,再将PCR产物进行变性聚丙烯酰胺凝胶电泳 ,电泳后行杂合性缺失分析。结果　 11/ 3 6( 3 0 .6% )的病人在D11S13 18处存在杂合性缺失 ;而D11S40 46位点处 ,13 / 60 ( 2 1.7% )的病例存在杂合性缺失 ;2 4/ 61( 3 9.3 % )的病例在 11p15 .5处至少有 1个位点存在杂合性缺失。杂合性缺失的频率与肿瘤病人的年龄、性别、肿瘤大小、肿瘤部位及淋巴结是否转移均无关。结论　高频杂合性缺失的区域可能有抑癌基因的存在。这将有助于阐明胃癌发生发展的分子机制 ,进而为对胃癌进行风险预测、基因诊断以及基因治疗提供可能     

口腔鳞癌组织中染色体3p14.2区杂合性丢失的研究

目的：检测口腔鳞癌组织中３ｐ１４．２区Ｄ３Ｓ１３００位点丢失情况,为新的抑癌基因定位提供依据。方法：应用聚合酶链反应（ＰＣＲ）技术以Ｄ３Ｓ１３００位点微卫星多态为遗传标记,检测口腔鳞癌组织中该位点的杂合性丢失（Ｌｏｓｏｆｈｅｔｅｒｏｚｙｇｏｓｉｔｙ,ＬＯＨ）状况。结果：２２例口腔鳞癌１７例提供信息,７例出现杂合性丢失,ＬＯＨ率为４１％（７／１７）,有２例出现微卫星的不稳定性。结论：３ｐ１４．２区Ｄ３Ｓ１３００位点杂合性丢失可能与口腔鳞癌的发生发展相关,提示该区域可能存在口腔鳞癌的抑癌基因,该区的错配修复基因突变可能是口腔鳞癌发生的一个新机理     

Screening of tumor suppressor genes on 1q31.1-32.1 in Chinese patients with sporadic colorectal cancer

Background As a model for both multistep and multipathway carcinogenesis, colorectal neoplastic progression provides paradigms for researching both oncogenes and tumor suppressor genes （TSGs）. However, the mechanism of colorectal cancer （CRC） is not completely understood, and many genes may be involved in the colorectal carcinogenesis. The purpose of this study was to screen for the potential TSGs on chromosome 1q31.1-32.1 in Chinese patients with sporadic colorectal cancer, to explore whether colorectal cancer in the Chinese population has unique genetic alterations and determine whether other putative TSGs exist and contribute to colon carcinogenesis. Methods Six polymorphic microsatellite markers, at a density of approximately one marker in every 1.6 cM, were chosen for refined loss of heterozygosity （LOH） mapping of 1q31.1-32.1. Eighty-three colorectal cancer patients＇ tumor and normal DNA were analyzed via polymerase chain reaction （PCR） for these microsatellite markers. PCR products were eletrophoresed on an ABI 377 DNA sequencer. Genescan 3.1 and Genotype 2.1 software were used for LOH scanning and analysis. On the basis of refined LOH mapping results, we undertook a microarray-based expression screening to identify tumor association genes in 19 of the CRC cases. Results The average LOH frequency of 1q31.1-32.1 was 24.41%, with the highest frequency of 36.73% （18/49） at D1S2622, and the lowest of 16.42% （11/67） at D1S412. A minimal region of frequent deletion was located within a 2 cM genomic segment at D1S413-D1S2622. There was no significant association between LOH of any marker in the studied regions and the clinicopathological data （patient sex, age, tumor size, growth pattern, or Dukes stage）. On the basis of refined mapping results, we chose 25 genes located in the D1S413-D1S2622 （1q31.3-32.1） region and presented a microarray-based high throughput screening approach in 19 sporadic CRC cases to identify candidate CRC related tumor suppressor genes. This study found 4