基于新冠病毒Delta及Omicron变异株流行特征变化对疫情防控措施优化分析

目的 分析比较宁波市Delta和Omicron变异株引发本土聚集性疫情续发感染者的流行特征,为进一步优化调整新冠肺炎疫情的防控措施提供参考依据。方法 以2021年12月1日—2022年5月31日宁波市37起本土新冠肺炎疫情中判定为密切接触者（密接）中的171例续发感染者为研究对象,对两种变异株的感染者流行特征进行描述性分析,以与关联病例有明确暴露时间的续发感染者计算潜伏期。结果 确诊病例占80.70%(138/171),无症状感染者占19.30%(33/171)。Delta和Omicron变异株感染者分别占64.33%(110/171)和35.67%(61/171),Omicron变异株的无症状感染者比例高于Delta变异株（54.1%vs. 0,P <0.01）。与关联病例有明确暴露时间的22例确诊病例（Delta变异株15例,Omicron变异株7例）平均潜伏期为（3.45±0.44）d,Delta和Omicron变异株感染者的最长潜伏期分别为8和6 d,平均潜伏期分别为（3.60±0.58）和（3.14±0.63）d,差异无统计学意义（P> 0.05）。Omicron...     

淮安市1起由奥密克戎变异株BA.5.2引起的聚集性疫情的调查分析

目的 了解1起由奥密克戎变异株引起的新型冠状病毒肺炎(简称“新冠”)聚集性疫情流行病学特点。方法 对本起疫情进行流行病学调查、实验室检测和序列分析，并进行溯源分析。结果 本起疫情持续时间为2022年11月1—6日，报告新冠感染者13例，以男性为主(占61.5%),中位年龄为52岁；包括无症状感染者10例(占76.9%)、确诊病例轻型2例(占15.4%)和普通型1例(占7.7%)。病例病毒基因测序结果显示为奥密克戎变异株BA.5.2,与邻省“10.04”疫情1例本土病例感染毒株高度同源。结论 本起疫情高度怀疑为外省输入引发，病毒株为奥密克戎变异株BA.5.2。     

北京市3起新型冠状病毒Omicron变异株聚集性疫情的感染来源和传播链分析

目的对北京市3起可能通过跨境物流途径导致的新型冠状病毒(新冠病毒)Omicron变异株聚集性疫情进行调查, 分析其感染来源和传播链。方法应用流行病学调查和大数据技术核查病例的活动轨迹, 对活动轨迹涉及的风险点位进行密切接触者追踪、人员和环境采样, 应用实时荧光定量PCR进行核酸检测, 对核酸阳性标本进行基因测序分析。结果 2022年1-4月北京市3起Omicron变异株聚集性疫情病毒基因序列分别为Omicron变异株BA.1、BA.1.1、BA.2分支, 疫情分别持续8、12、8 d, 报告6、42、32例新冠病毒感染者。1起感染来源可能为国际邮件, 2起可能为进口衣物, 进口物品从境外启运至首发病例接触感染的时间间隔为3～4 d。潜伏期M(Q1, Q3)为3(2, 4)d, 代间距M(Q1, Q3)为3(2, 4)d。结论此次疫情提示常温进口货品通过物流途径输入Omicron变异株疫情的风险, 且Omicron变异株传播速度更快, 应加快流行病学调查处置。     

一起新型冠状病毒变异株XBB.1.5聚集性疫情流行病学调查

目的 针对中山市首起重点关注新型冠状病毒变异株XBB.1.5感染导致的本土聚集性疫情开展流行病学调查,梳理和分析其流行病学传播链和传播特征。方法 根据国家新型冠状病毒变异株流行病学调查方案要求,开展病例、同住和同班核心密接首轮广泛社区流行中的感染情况调查和多轮核酸检测,针对核酸检测阳性且CT值≤32病例开展基因测序,与指示病例基因序列进行比对。结果 该起聚集性疫情波及73人,其中53人（72.6%）在2022年12月有新冠病毒感染史,本次疫情无感染;20人既往无新冠病毒感染史,本次疫情7例感染,感染率为35%(95%CI:14.1%～55.9%),均在同一流行病学传播链,均为轻症,症状主要包括肌肉酸痛（3例）、咳嗽（3例）和发热（2例）。中山市疾控中心针对病例1～5完成基因测序,其基因组覆盖度分别为99.77%、99.83%、99.80%、99.82%、98.65%,均属于Omicron XBB.1.5进化分支。结论 本次新型冠状病毒变异株XBB.1.5聚集性疫情在班级和家庭小范围传播,涉及病例均为首次感染,无重症病例发生。     

北京市一起新型冠状病毒Omicron变异株聚集性疫情特征分析

目的 分析北京市海淀区一起新型冠状病毒肺炎聚集性疫情流行病学特征及传播链。方法 采用描述性流行病学方法分析疫情流行病学特征,应用现场调查和大数据技术分析传播链。结果 2022年4月27日至5月13日, 海淀区发生一起新型冠状病毒肺炎聚集性疫情,全基因组测序系Omicron变异株（BA.2.2进化分支）;涉及感染者38例,确诊病例34例,无症状感染者4例;临床分型以轻型（88.2%）为主,无重型、危重型和死亡病例;早期临床症状以咽部不适（50.0%）、咳嗽（29.4%）为主;17 d内传播7代,涉及3起社区聚集、2起单位聚集和8个家庭内传播;暴露方式以同住（47.6%）、同时空暴露（31.6%）为主;代间距M（Q₁,Q₃）为3（1,6）d;总续发率为1.5%（37/2 482）,其中家庭续发率为36.7%（18/49）。结论 本起Omicron变异株疫情临床症状轻,家庭、社区聚集性明显,疫情传播速度较快,同时空暴露感染风险较高,需利用信息化技术全面摸排密切接触者,以快制快,有效阻断疫情传播。     

一起可能由境外邮件引起的新冠肺炎聚集性疫情调查

目的 分析北京市海淀区一起可能由境外邮件引起的新冠病毒Omicron变异株聚集性疫情的流行特征和传播链,了解Omicron变异株可能的传播路径和传播特点。方法 采用现场流行病学调查方法核查该传播链上所有病例的活动轨迹,逐一排查涉及的风险点,同时对新冠病毒核酸阳性样本进行基因测序用于溯源分析。结果 此次聚集性疫情共涉及6例新冠肺炎确诊病例,病例感染的病毒基因序列和其接触的境外邮件以及同一来源发往另一地点尚未拆封的阳性邮件基因序列高度同源,与同期北美、新加坡等地流行的新冠病毒相似度较高,与同期我国其他地区疫情无关联。结论 携带新冠病毒的邮件物品存在传播的可能性,引起聚集性疫情。应加强快递邮件的消毒方法研究并实施,多渠道阻断传播风险。     

中山市一起奥密克戎变异株新冠感染聚集性疫情调查

目的 对中山市2022年一起奥密克戎(Omicron)变异株新冠感染聚集性疫情及关联个案开展调查，理清传播链、了解个案暴露与传染期，为疫情处置提供依据。方法 收集该起疫情报告个案及关联个案发病时间、初筛阳性时间、暴露史等信息，用Drawin软件绘制传播链图；针对单次暴露传播案例，描述个案暴露时间和二代传播发生时间的间隔。结果该起疫情首发个案发病前7 d均在中山市三角镇，基因测序提示为奥密克戎变异株BA.2.2进化分支，与采样时间2022年6月来自香港地区的序列最相近，推测本起疫情可能为香港地区输入；疫情累计报告65例，其中中山市29例、外省市36例，所有个案均在同一条传播链。疫情于7月9日发现，首例7月3日发病，疫情在中山市持续15 d,传播5～6代，6 d实现社会面清零；疫情集中在7个家庭，家庭以外的传播场所包括奶茶店、医疗机构、餐厅和网约车等。2例阳性个案通过医疗机构、网约车和餐厅同时空传播给12个人，两代个案暴露时间差中位数68 h(40～123 h)。结论 面对源头不清晰的本土聚集性疫情，中山市快速响应，75.9%的个案在管控人群中发现；病毒传播链被快速阻断，未发生大规模社区传...     

聊城市5起新型冠状病毒肺炎聚集性疫情流行病学分析

目的 分析新型冠状病毒肺炎(简称新冠肺炎)聚集性疫情的流行病学特征,为制定疫情防控策略和措施提供科学依据。 方法 于2020年1月24日—2月11日在聊城市应用现场流行病学方法调查5起新冠肺炎聚集性疫情所涉及的41例确诊病例及无症状感染者, 对相关标本采用实时荧光定量RT-PCR方法进行核酸检测。 结果 5起聚集性疫情的首发病例续发率为2.78%~50.00%,差异有统计学意义(χ²=21.57,P<0.01);家庭聚集性疫情涉及32例、10户家庭(族),公共场所聚集性疫情涉及16例、2个场所。一、二、三代病例分别有5、22、12例,传染率分别为100.00%、18.18%、0.00%。4例病例的潜伏期为5~10 d,中位数为7.5 d;聚集性疫情中存在潜伏期传播。有疫区旅行史或居住史者4例(9.76%),与潜伏期病例或确诊病例有密切接触、频繁交谈等有30例(73.17%),暴露于高浓度气溶胶4例(9.76%),未知感染来源3例(7.32%)。 结论 新冠病毒极易引起聚集性疫情,控制本地的聚集性疫情是防控工作的重点;新冠病毒可以通过高浓度气溶胶传播;病例在潜伏期具有感染性。     

连云港市11起新冠肺炎家庭聚集性疫情分析

目的 了解连云港市新冠肺炎家庭聚集性疫情特征.方法 采用描述流行病学方法,对连云港市2020年发生的11起新冠肺炎家庭聚集性疫情流行病学特征进行回顾性描述,计算代际间隔和家庭续发率.结果 截至2020年11月,连云港市共报告11起新冠肺炎家庭聚集性疫情,均发生在1-2月,共涉及18例确诊病例和11例无症状感染者.每起家...     

北京市新型冠状病毒Omicron BA.2和BF.7变异株感染者潜伏期特征分析

目的 对北京市由新型冠状病毒（新冠病毒）Omicron BA.2和BF.7变异株引起的疫情中的感染者进行流行病学调查，估算2种变异株分支的潜伏期及其影响因素，为新冠病毒传播动力学模型的建立提供基本参数。方法 选取北京市2022年4月（Omicron BA.2变异株）及10月（Omicron BF.7变异株）疫情中具有明确暴露时间和发病时间的感染者进行研究，采用秩和检验对不同变异株的潜伏期差异进行分析。使用Weibull、Gamma和lognormal分布对Omicron变异株的潜伏期分布进行拟合。采用多因素方差分析比较不同年龄、性别、变异株类型及疫苗接种状态下的潜伏期。结果 共纳入64例BA.2变异株感染者及58例BF.7变异株感染者。BA.2和BF.7变异株感染者潜伏期M（Q₁，Q₃）分别为3.00（3.00，4.00）d和3.00（2.00，3.25）d。lognormal分布的拟合效果最佳。多因素方差分析结果显示，不同类型的Omicron变异株潜伏期存在一定差异，与BA.2变异株感染者相比，BF.7变异株感染者的潜伏期更短。结论 Omicron BF.7变异株感染者潜伏期较BA.2变异株的潜伏期短。     

一起健身场所内新冠病毒感染聚集性疫情调查

目的 对一起健身场所内新冠病毒感染聚集性疫情进行流行病学调查分析，为大流行期间急性呼吸道传染病防控提供参考。方法 收集2022年3月浙江省嘉兴市嘉兴港区一起新冠病毒感染聚集性疫情现场处置期间报告的病例信息和流行病学调查报告，使用WPS Excel进行数据整理和描述性分析，用Microsoft Visio绘图，用SAS 9.4统计分析。结果 本次聚集性疫情共报告感染者25例，由新冠病毒奥密克戎变异株（Omicron BA.2.2进化分支）引起。末次核酸检测阴性前密接1 231人，无人感染；末次核酸检测阴性后密接416人，其中24人感染。共同打球密接的阳性率为77.8%(14/18)。在球场共同打球是暴露后感染的危险因素（OR=29.75,95%CI:15.41～44.07），而暴露时间（F=0.00,P=0.970）、疫苗接种剂次（F=0.00,P=1.000）、末次疫苗接种与本次暴露间隔时间（F=0.03,P=0.857）等因素与是否感染的差异无统计学意义。结论 在密闭空间内Omicron变异株具有较强传染性，但感染者末次核酸检测阴性前无传染性。建议在急性呼吸道传染病大流行期间，充分重...     

北京市朝阳区13起新型冠状病毒肺炎家庭聚集性疫情流行病学特征分析

目的对截至2020年3月22日北京市朝阳区报告的13起新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)家庭聚集性疫情(简称家庭聚集性疫情)的流行病学特征进行分析,为制定防控策略提供参考。方法采用描述性流行病学方法对北京市朝阳区13起家庭聚集性疫情的流行病学特征进行分析。采用病例对照研究方法,对病例感染来源、二代病例的发病影响因素进行单因素分析。结果 13起家庭聚集性疫情共波及家庭成员55人,累计发病38例,罹患率69.09%(38/55)。平均每起疫情发病例数2.6例,3人及以下家庭罹患率高于3人以上家庭(Z=-2.114,P=0.034)。一代病例20例,二代病例18例,续发率51.43%(18/35)。3人及以下家庭续发率高于3人以上家庭续发率(Z=-2.161,P=0.028)。一代病例的外省旅游史显著高于二代病例(χ2=20.607,P0.001)。与一代病例是否分房隔离的续发率有显著性差异,是保护性因素(χ2=12.887,P0.001; OR=0.157,95%CI:0.041～0.602)。结论小规模家庭罹患率和续发率较高,外省旅游是引起家庭内一代病例的首要因素,家庭成员及时开展自我隔离是防控家庭内传播的有效措施。     

辽宁省丹东市一起家庭聚集性新型冠状病毒肺炎疫情的溯源调查分析

分析辽宁省丹东市一起新型冠状病毒肺炎(新冠肺炎)家庭聚集性疫情,追踪疫情的传染源。应用现场流行病学方法调查辽宁省丹东市一起新冠肺炎家庭聚集性疫情中的病例及密切接触者,对调查资料及数据进行描述性分析,对病例及密切接触者的样本采用实时荧光定量RT-PCR法进行新型冠状病毒核酸检测,同时结合血清特异性抗体检测。报告疫情中涉及确诊病例3例,无症状感染者2例,家庭内密切接触者累计34人,其中8人为外省探亲人员,1人与确诊病例同航班,抗体IgG为阳性。本次家庭聚集性疫情是由外省途经武汉来到本地探访亲友的既往感染者引起的家庭聚集疫情。     

新冠病毒奥密克戎变异株感染的核酸转阴时间分析

目的 分析新冠病毒感染奥密克戎变异株上呼吸道标本核酸转阴时间,为了解新冠病毒感染奥密克戎变异株传染期提供参考。方法 以2022年11月1日—2023年1月10日湖北省荆州市某单位新冠病毒感染者为研究对象,收集感染者年龄、性别、新冠病毒疫苗接种史、2022年流感疫苗接种史以及发病日期、首次核酸检测阳性日期以及往后隔日核酸检测结果。发病日期或首次核酸阳性较早者定义为第0 d;连续2次（至少间隔24 h）核酸检测阴性定义为核酸转阴。采用生存分析计算转阴时间,Cox比例风险回归进行亚组比较。对定点收治医院感染者进行基因测序,监测荆州市流行毒株。结果 共102例新冠病毒感染者纳入研究,男女性别比0.96:1,年龄以40岁以上人群（65例,63.73%）居多,所有感染者既往均接种3剂次灭活疫苗,73例2022年7—8月接种4价流感疫苗。研究期间35名感染者进行基因测序结果显示均为Omicron BA.5.2变异株。感染者发病（或核酸检测首次阳性）5 d后核酸阳性率为97%。核酸转阴中位时间为12 d(95%CI:12～14 d),18 d后核酸均转阴。不同性别和年龄组感染者核酸转阴时间存在差异（P...     

安徽地区一起新型冠状病毒肺炎家庭聚集性疫情调查

目的分析新型冠状病毒肺炎(COVID-19)家庭聚集性疫情多代传播的特点,为制定防控措施提供科学依据。方法本起家庭聚集性疫情病例发病时间为2020年1月23日—2月3日,收集病例的流行病学调查资料和实验室检测资料,分析感染来源,判定传播代际和传播链。结果本起家庭聚集性疫情出现3代共10例确诊病例和1例无症状感染者,首发病例通过日常密切接触和聚餐传播给2代病例,2代病例中的无症状感染者通过聚餐传播给3代病例。首发病例与2代病例的代间距平均数为4.5 d,3代病例的潜伏期平均数为7.3 d。本起家庭聚集性疫情总续发率为34.5%,其中2代病例续发率为53.8%,3代病例续发率为18.8%。结论新型冠状病毒(SARS-CoV-2)传播能力强,在家庭内可以通过接触、聚餐等方式快速导致多代病例出现。     

2022年一起由新型冠状病毒Delta变异株引起365例感染者的暴发疫情特征

目的 分析2022年1月河南省禹州市新型冠状病毒肺炎(新冠肺炎)暴发疫情的流行病学特征,为完善新冠肺炎防控措施提供科学依据。方法 收集2022年1月禹州市新冠肺炎暴发疫情相关信息,进行描述性分析。结果 以病例报告日期统计,禹州市此次疫情持续18 d(1月2日至19日),共报告365例新型冠状病毒感染者,其中危重型3例(0.8%),重型12例(3.3%),无死亡病例。感染者年龄1月龄至98岁,平均为(43.6±23.1)岁,男女比例1∶1.3,农民占51.5%(188例)。潜伏期为1.0～9.0 d,M(P₂₅,P₇₅)为5.5(4.3,7.0)d。病例呈现明显的家庭聚集性,共发生70起家庭聚集性疫情,家庭续发率为29.9%。引起疫情的毒株为Delta变异株(B.1.617.2进化分支),基本再生系数(R₀)为5.5(95%CI为3.0～9.3),随着控制措施的实施,动态再生系数(R_t)呈下降趋势。结论 此次禹州市疫情具有明显的家庭聚集性,通过多种“疫情放大器”,导致大规模疫情的出现。应全面加快疫情防...     

成都市新冠病毒既往感染者重复感染Omicron变异株情况分析

目的 了解新冠病毒既往感染者重复感染Omicron变异株情况,为新冠病毒重复感染防控策略提供参考。方法 以2022年2—9月成都市5轮本土疫情涉及的2 567例感染者为调查对象,于2022年12月18—22日进行电话随访调查,内容主要包括感染者基本人口学特征、近1个月内核酸及抗原检测情况、临床表现等。通过四川省免疫规划信息管理系统查询感染者新冠病毒疫苗接种情况。采用SPSS 19.0统计软件进行不同特征人群重复感染率分析。结果 2 263例既往感染者完成调查,应答率为88.16%。男性占44.68%,女性占55.32%;年龄最小1月龄,最大90岁,平均年龄（34.88±19.22）岁;初次感染以轻型病例（61.82%）和无症状感染者（31.64%）居多。接种3剂次疫苗者占55.86%,接种2剂次疫苗者占29.56%,初次感染毒株主要为Omicron BA.2分支（98.89%）,2022年11—12月高峰感染疫情之前未报告新冠病毒重复感染者。在流行毒株为BA.5.2高峰感染疫情中重复感染197例,重复感染率为8.71%,时间间隔M(P25～P75)为98(93～104)d;其中193例...     

新型冠状病毒Delta变异株引起的宁波市镇海区本土疫情传播链分析

目的调查新型冠状病毒(新冠病毒)Delta变异株引起的宁波市镇海区本土聚集性疫情, 分析其传播链, 为新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情防控提供参考依据。方法资料来源于现场调查收集2021年12月6-18日宁波市镇海区新冠病毒感染者个案信息。采用现场流行病学调查方法, 描述COVID-19病例流行病学特征和传播链。结果首例病例为途经中风险地区, 直接或间接接触阳性感染者而感染新冠病毒, 后继出现家庭内聚集性疫情, 并通过工作、生活、艾灸养生活动等密切接触而传播。疫情共持续14 d, 共报告确诊病例74例, 潜伏期M(Q1, Q3)为4.0(3.0, 5.8)d。所有病例均在一条传播链上, 传播6代以上, 代间距M(Q1, Q3)为3.5(2.0, 5.3)d。基因测序结果为Delta变异株(AY.4进化分支), 流行病学调查和基因测序结果均显示宁波市镇海区本土疫情与上海市疫情为同一起关联疫情。结论本起疫情传播链清晰, Delta变异株(AY.4进化分支)具有明显的家庭、封闭场馆、集中居住地聚集性, 要加强重点区域、重点人群健康管理, 提高核酸检测频次。     

一起奥密克戎变异株引起的新型冠状病毒感染本土疫情流行特征与传播动力学分析

目的 分析云南省边境某县一起由奥密克戎变异株（BA. 2）引起的新型冠状病毒感染（新冠）本土疫情的流行特征及传播动力情况，为今后新冠疫情防控策略制定提供参考依据。方法 收集2022年4月8—25日云南省边境某县报告新冠阳性病例的个案信息和流行病学调查资料，采用描述流行病学方法及传染病传播动力学方法进行分析。结果 本次疫情共报告202例病例，经测序为奥密克戎变异株BA. 2；男女性别比1∶1.6，各年龄段、不同疫苗接种史的人群均有发病；出现51个家庭聚集性发病；潜伏期（2.38±2.20） d，代间距（2.85±2.11） d；实时再生数（Rt）最高时达到4.76 (95%CI:3.37～6.39)，但在实施防控措施约9 d后，Rt迅速下降至1以内，与防控效果相呼应。结论 奥密克戎变异株的潜伏期短、代际传播时间短、传播隐匿且速度快、容易造成聚集性发病，防控部门应进行早期疫情研判和采取有效的防控措施，对及时、快速地控制住疫情态势发展具有至关重要的作用。     

宁德市2022年一起新冠肺炎疫情的流行病学分析

目的 分析宁德市一起新冠肺炎疫情的流行特征,为防控工作提供参考。方法 采用描述性流行病学方法,分析宁德市2022年4月9日一起新冠肺炎疫情流行病学特征。结果 截至2022年4月24日,宁德市累计报告新冠肺炎201例,罹患率6.4/10万;涉及8个乡镇(街道);其中轻型40例(19.9%)、普通型6例(3.0%)、无症状感染者155例(77.1%);≥20岁人群症状出现率随年龄增长而升高(Z=-1.69,P=0.045);男女性别比为2.2∶1;年龄中位数31.0岁,病例集中在20～59岁(91.5%);以工人为主(54.7%);4月1日首例发病,4月22日末例发病,高峰为4月14日,报告56例(27.9%);无症状至确诊时间间隔1.5 d,确诊病例发病至确诊时间间隔1.0 d,诊断至报告时间间隔0.8 h,报告至审核时间间隔0.1 h; 16例病毒全基因组序列分析,均属Omicron变异株BA.2.2进化分支。结论 该起疫情由Omicron变异株BA.2.2引起,重点人群核酸筛查和早期及时开展应急处置对疫情防控具有重要意义。