lncRNA HULC对肝癌细胞miRNA差异表达谱及ceRNA调控网络的影响

目的 探究长链非编码RNA(lncRNA)肝癌高表达转录本(HULC)对肝癌细胞微小RNA(miRNA差异表达谱及竞争内源性RNA(ceRNA)调控网络的影响。方法 选取人肝癌细胞系BEL-7402,瞬时转染HULC siRNA以降低lncRNA HULC的表达。通过高通量测序选取表达具有差异的miRNA,并通过实时荧光定量PCR进行验证。基于参考基因组,预测新miRNA。通过基因富集分析及ceRNA调控网络,研究这些基因的潜在功能。结果 经敲低lncRNA HULC表达后,通过高通量测序挑选出了9个表达差异显著的miRNA。5个miRNA表达下调,4个miRNA表达上调。通过miRDeep2打分,挑选出了15个分值较高的新miRNA。基因富集分析结果显示,表达下调的miRNA的靶基因的分子功能与丝氨酸tRNA连接酶活性、蛋白激酶活性、阳离子通道活性、钙转运ATP酶活性等有关;表达上调的miRNA的靶基因与硒代半胱氨酸裂解酶活性、过氧化物酶体机制靶向信号1结合、过氧化物酶体靶向序列结合、蛋白质N-末端结合、肿瘤坏死因子受体超家族结合等有关。miRNA-靶基因互作网络、显著富集功能-功能...     

长链非编码RNA在肝细胞癌发生中的作用及其应用

肝细胞癌(HCC)是一种常见的恶性肿瘤,其起病隐匿,早期诊断困难,目前缺乏有效的治疗方法,且患者的5年生存率较低,复发率较高。近年来研究发现,部分长链非编码RNA(lncRNA)在HCC中异常表达,且表达水平与患者的预后相关。这些lncRNA可通过调控表观遗传、作为竞争性内源RNA以及参与肿瘤细胞上皮间质转化等多种机制,促进或抑制HCC的发生发展,可能成为新型HCC诊断标志物及治疗靶点。该文就lncRNA在HCC的发病机制、诊断及治疗方面的研究进展作一综述。     

长链非编码RNA MALAT1在肝细胞癌发生发展中的作用

肝细胞癌(HCC)具有发病率高、生存率低、治疗效果不良、发病机制复杂等特点。近年来,多项研究证实lncRNA MALAT1在HCC中表达上调,具有促进HCC细胞增殖、侵袭和转移的作用,并且在HCC的诊断、预后及治疗方面具有临床指导意义。总结了lncRNA MALAT1在HCC中的研究现状,探讨其表达模式、作用机制以及在预测和监测HCC发展中的临床意义,以期深入了解lncRNA MALAT1在介导HCC发展中的作用。lncRNA MALAT1将有望成为HCC诊断和预后的潜在生物标志物,并在将来应用于临床靶点治疗。     

ST8SIA6-AS1与hnRNPA2B1相互作用通过激活AKT活性并下调P21促进肝癌进展

目的筛选肝癌中具有临床意义的潜在药物靶点并研究此靶点在肝癌发生、发展中的功能和分子机制。方法通过临床数据库GEPIA找到在肝癌中差异表达的lncRNA,进一步筛选到相比于肝正常组织表达差异性明显的lncRNA;通过细胞增殖实验筛选到影响肝癌细胞生长明显的lncRNA;通过GEPIA数据库探讨目的lncRNA在各肿瘤及肝癌中的表达情况及其与肝癌的临床预后相关性;最后通过与目的lncRNA相互作用的蛋白预测其参与的信号通路并进行Western blotting验证,从而说明目的lncRNA在肝癌中发挥功能的潜在分子机制。结果 ST8SIA6-AS1、MIR4435-2HG和HULC在肝癌相比于肝正常组织中显著高表达;通过敲低ST8SIA6-AS1、MIR4435-2HG和HULC的细胞增殖实验结果显示,ST8SIA6-AS1显著促进肝癌细胞的生长,从而确定ST8SIA6-AS1为研究目的lncRNA;ST8SIA6-AS1在肝癌中显著高表达且具有明显的临床预后相关性即高表达预后差的特征;ST8SIA6-AS1与hnRNPA2B1相互作用,敲低ST8SIA6-AS1和hnRNPA2B1表达均可降低cleaved caspase-3和P21的表达从而激活PI3K/AKT信号通路,促进肝癌细胞生长增殖。结论 ST8SIA6-AS1有望作为肝癌的潜在药物治疗靶点。     

H19基因对肝细胞癌的诊断价值

近年研究表明某些长链非编码RNA(lncRNA)在肝细胞癌(HCC)组织中表达异常,其中位于lncRNA上的H19基因在HCC组织中的表达明显高于正常组织,敲除H19后HCC的增殖和侵袭能力明显减弱。简要介绍lncRNA和H19基因,以及lncRNA的检测方法和H19在HCC中的诊断价值,认为H19可以作为诊断HCC的方法之一,进一步研究其在HCC中的表达规律以及快速、简便、经济的检测H19等lncRNA对HCC的诊断尤为重要。     

长链非编码小核仁RNA宿主基因（lncRNA SNHG）在肝细胞癌发生发展中的作用

肝细胞癌(HCC)是原发性肝癌中最常见的类型，也是癌症相关死亡的主要原因之一。尽管目前对HCC的研究逐渐深入，但其潜在的分子机制仍不清楚。近年来研究发现，长链非编码RNA (lncRNA)在HCC的发生和发展中起着重要作用，而长链非编码小核仁RNA宿主基因(lncRNA SNHG)在HCC中异常表达并在肿瘤细胞的增殖、侵袭、转移、血管生成、干细胞特性及耐药性等方面发挥调节作用。本文综述了lncRNA SNHG基因家族在HCC中的发生机制及预后价值，以期为该领域的基础和临床研究提供新思路。     

长链非编码RNA调控结直肠癌侵袭与转移机制的研究进展

长链非编码RNA(lncRNA)可通过DNA甲基化、组蛋白修饰、染色质重构等作用导致相关基因异常表达,发挥促癌或抑癌作用。在结直肠癌侵袭与转移过程中,lncRNA发挥着重要的调控作用,其中MALAT1、HOTAIR、HULC、H19、CCAT2的高表达起促进作用,而MEG3的高表达起抑制作用。研究提示,lncRNA为结直肠癌的侵袭与转移提供了潜在的预测指标和新的治疗靶点。     

长链非编码RNA XLOC-007123在乙型肝炎相关肝细胞癌中的表达及临床意义

目的检测长链非编码RNA(lncRNA)XLOC-007123在乙型肝炎相关肝细胞癌(HCC)患者组织(癌、癌旁)及肝癌细胞系中的表达,并分析其表达水平与临床病理特征的关系。方法选取2013年12月-2015年12月于解放军三〇二医院肝胆外科行HCC切除术的52例乙型肝炎相关HCC患者的肝癌组织;同时取同一患者的癌旁组织作为对照。应用荧光实时定量PCR检测lncRNA XLOC-007123在乙型肝炎相关HCC患者癌组织、配对癌旁组织以及肝癌细胞系中的表达水平。其中研究所用细胞系L02、HuH7、HepG2、SMMC-7721均由解放军三○二医院临床管理中心提供。非参数Wilcoxon秩和检验比较lncRNA XLOC-007123在癌组织和配对癌旁组织的表达水平;独立样本t检验比较不同HCC细胞系与正常肝细胞系间lncRNA XLOC-007123表达水平。临床指标差异分析采用χ~2检验。结果与癌旁组织相比,lncRNA XLOC-007123在乙型肝炎相关HCC患者的癌组织中表达显著下调(P<0.01);与正常肝细胞株相比,IncRNA XLOC-007123在3种肝癌细胞系中均呈低表达(P值均<0.05)。lncRNA XLOC-007123表达水平与患者的血清AFP水平和肿瘤分期相关,差异有统计意义(χ2值分别为7.738、7.589,P值均<0.05)。结论 lncRNA XLOC-007123在乙型肝炎相关HCC组织中表达降低,且与临床患者血清AFP水平和病理分期有关联,推测lncRNA XLOC-007123在乙型肝炎相关HCC发生发展过程中发挥着调控作用,有望成为乙型肝炎相关HCC临床诊断的潜在标志物。     

HBV上调的lnc-HUR1通过阻断p53活性促进肝细胞增殖和肿瘤发生

正【据《Hepatology》2018年5月报道】题:HBV上调的lnc-HUR1通过阻断p53活性促进肝细胞增殖和肿瘤发生(作者Liu N等)最近研究表明,一些lncRNA在肝细胞癌(HCC)中失调,其异常表达与肿瘤发生和预后不良有关。为了鉴定HBV相关的lncRNA,中科院微生物研究所Liu等使用RNA深度测序来量化HepG2细胞和HBV转基因HepG2-4D14细胞中lncRNA的丰度。证明了lnc-HUR1在HepG2-4D14细胞中显著上调,并发现HBV编码的HBx可以增强lnc-HUR1的转录。lnc-HUR1的过表达促进细胞增殖,而lnc-HUR1的敲低会抑制细胞生     

原发性肝细胞癌GOLM1基因异常表达和相关miRNA和lncRNA预测

目的通过GOLM1(GP73)在原发性肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中的表达,分析其作为HCC诊断标志物的可行性,并预测其相关RNA。方法分析在线数据库HCC中GOLM1 mRNA表达,用含90对HCC组织和癌旁正常组织的组织芯片和免疫组化方法检测GOLM1蛋白表达;用TCGA转录组数据预测GOLM1相关的miRNA和lncRNA。结果 HCC中GOLM1 mRNA的表达高于癌旁正常组织,与HCC患者临床分期、肿瘤分级和总生存时间相关。GOLM1蛋白在HCC与癌旁组织中的表达差异无统计学意义(P 0. 05)。生物信息学分析预测到与GOLM1存在可能调控关系的lncRNA 6个、miRNA 48个。结论 GOLM1 mRNA可作为HCC的诊断和预后标志物,成功预测到与GOLM1相互作用的lncRNA 6个、miRNA 48个。     

长链非编码RNA在原发性肝细胞癌脂质代谢重编程中的研究进展

肝细胞癌(HCC)是最常见的肝脏恶性肿瘤, 其发病机制复杂, 预后差。代谢重编程已被认为是癌症的重要标志之一, 而肝脏作为人体脂质代谢的重要器官, 脂质代谢重编程在HCC发生、发展过程中发挥重要作用。越来越多的证据表明, 长链非编码RNA(lncRNA)可以通过调控脂质代谢过程中关键的酶与转录因子影响HCC的脂质代谢, 参与HCC的发生、发展。阐明lncRNA在HCC脂质代谢重编程中的作用机制有利于为HCC的诊疗提供新靶点和新策略, 改善患者预后。现总结了lncRNA参与HCC脂质代谢重编程过程的最新研究进展。     

长链非编码RNA作为一种非侵入性标志物在肝细胞癌中应用的研究进展

肝细胞癌(HCC)早期症状不明显,异质性强且恶性程度极高,目前缺乏有效的诊断和治疗方法,患者预后差,临床病死率高。近年来发现长链非编码RNA (lncRNA)可作为一种新的肿瘤标志物用于HCC的诊断。存在于血浆、血清、外泌体、唾液等体液中的lncRNAs包括SNHG1、HEIH、 HULC、 Linc00152、 ZFAS1、 Uc001ncr、 Ax800134、 LRB1、 UCA1、 D16366、ENSG00000258332.1、LINC00635、LncRNA-ATB、LINC00161、LncRNA-PCDH9-13:1等。lncRNA与AFP联合应用、lncRNA相关风险评分系统和外泌体竞争性内源RNA (ceRNA)生物标志物面板可有效提高lncRNAs对HCC诊断和预测效能。     

肝细胞癌患者肝动脉化疗栓塞术后外周血长链非编码RNA TINCR水平与Th1/Th2平衡及预后的相关性分析

目的探讨分析外周血长链非编码RNA(lncRNA)TINCR表达水平与肝细胞癌(HCC)患者行肝动脉化疗栓塞术(TACE)术后辅助性T淋巴细胞1(Th1)/Th2平衡及预后的相关性。方法回顾性选取2015年3月—2017年3月在湖北省武汉市金银潭医院行TACE治疗的HCC患者85例,并随机抽取在本院体检的健康志愿者30例作为对照组。检测HCC患者TACE完成后7 d及对照组外周血lncRNA TINCR表达情况、Th1/Th2细胞因子表达情况。计量资料组间比较采用t检验,计数资料组间比较采用χ2检验,等级资料组间比较采用Kruskal-Wallis H检验。lncRNA TINCR相对表达量与Th1/Th2细胞因子的相关性采用Spearman相关性分析。lncRNA TINCR相对表达量对生存情况的影响采用Kaplan-Meier生存曲线分析,生存曲线比较采用log-rank检验。结果HCC组患者外周血lncRN TINCR相对表达量(1.784±0.429)高于对照组(0.926±0.263),差异有统计学意义(t=10.277,P<0.05)。lncRNA TINCR相对表达与HCC患者血管侵犯、肿瘤大小、肿瘤分期及血清AFP水平有关(t值分别为3.958、4.499、3.361、4.949,P值分别为<0.001、<0.001、0.001、<0.001)。HCC组患者血清IFNγ、IL-2水平明显低于对照组[(13.48±5.20)pg/ml vs(27.49±7.21)pg/ml、(21.89±6.45)pg/ml vs(32.05±7.89)pg/ml,t值分别为11.408、6.986,P值均<0.05],而IL-4、IL-10水平明显高于对照组[(13.73±3.35)pg/ml vs(9.36±2.73)pg/ml、(12.75±2.74)pg/ml vs(8.93±2.16)pg/ml,t值分别为6.426、6.909,P值均<0.05]。HCC患者外周血lncRNA TINCR相对表达量与血清IFNγ、IL-2水平呈负相关(r值分别为-3.164、-3.270,P值均<0.001),与患者血清IL-4、IL-10呈正相关(r值分别为2.963、3.044,P值分别为0.007、<0.001)。以lncRNA TINCR相对表达量≥1.700作为高表达,85例HCC患者中lncRNA TINCR高表达患者47例,低表达患者38例。log-rank检验结果显示,lncRNA TINCR低表达患者生存情况明显优于高表达患者(χ2=4.182,P<0.05)。结论HCC患者行TACE后外周血lncRNA TINCR表达明显高于健康人群,lncRNA TINCR表达与患者病理特征及Th1/Th2免疫平衡有密切联系,可作为患者生存预后的潜在预测指标之一。     

代谢诱导的肿瘤激活剂1具有促进肝细胞癌转移的作用

<正>【据《Hepatology》2019年3月报道】题:MITA1是一种新型能量应激诱导的lncRNA,具有促进肝细胞癌转移的作用(作者Ma M等)转移是癌症相关死亡的主要原因,但其潜在机制仍知之甚少。长非编码RNA(Long-non-codingRNAs,lncRNAs)已成为恶性肿瘤的重要调节因子,但其在肿瘤转移中的作用尚不清楚。Ma等研究发现了一种新的lncRNA,命名为代谢诱导的肿瘤激活剂1(? metabolism-induced tumor activator 1,MITA1),它在肝细胞癌(HCC)中表达上调,并参与了HCC的转移。MITA1是其在RNA测序时发现的一种富含染色质     

系统性红斑狼疮患者长链非编码RNA表达变化及其与调节性T细胞相关性的研究

目的通过检测SLE患者长链非编码RNA(lncRNA)的表达变化, 初步探索差异表达的lncRNA与调节性T细胞(Treg)数量间的联系, 分析Treg相关lncRNA与SLE患者临床特征间的相关性, 预测lncRNA调节Treg分化发育的机制, 为SLE的治疗提供新思路。方法收取9例活动期SLE患者外周血, 提取PBMCs, 用全转录组测序分析PBMCs的lncRNA表达谱, 以9名健康人作为对照组, 筛选差异表达的lncRNA, 采用Pearson检验分析lncRNA与Treg数的相关性, 以及Treg相关lncRNA与SLE患者SLEDAI评分、ESR、C3、C4之间的相关性, 用miRcode和Targetscan数据库及共表达网络预测Treg相关lncRNA的靶向基因。结果与健康对照组相比, SLE患者有240个差异表达lncRNA, 包括134个高表达的lncRNA(P<0.05), 106个低表达的lncRNA(P<0.05), 其中ANKRD44-AS1(r=0.74, P=0.022)、LINC00200(r=0.70, P=0.037)、AP001363...     

lncRNA GHET1表达水平对人胃癌细胞MGC-803增殖迁移和侵袭的影响及其机制研究

目的 探讨长链非编码RNA(lncRNA)胃癌高表达转录本1(GHET1)对人胃癌细胞MGC-803增殖、迁移和侵袭的影响及其机制。方法 以MGC-803细胞作为实验对象,通过慢病毒转染的方法构建lncRNA GHET1过表达和lncRNA GHET1沉默的MGC-803细胞模型,分别为过表达组和沉默组,并设置其对应的阴性对照组。通过荧光显微镜观察慢病毒转染效率。通过实时荧光定量PCR检测各组lncRNA GHET1、miR-105表达水平。通过CCK-8实验检测各组细胞增殖能力。通过Transwell实验检测细胞迁移、侵袭能力。结果 荧光显微镜下观察见各组细胞病毒转染率均高于90%。实时荧光定量PCR结果显示,过表达组lncRNA GHET1的相对表达量显著高于过表达对照组（P<0.05）,沉默组lncRNA GHET1相对表达量显著低于沉默对照组（P<0.05）,提示成功建立过表达和沉默lncRNA GHET1的MGC-803细胞模型。CCK-8实验结果显示,过表达组细胞增殖速度较过表达对照组快,而沉默组细胞增殖速度较沉默对照组慢。Transwell实验结果显示,过表达...     

长链非编码RNA在癌症中的研究进展

长链非编码RNA(lncRNA)在癌症中扮演重要的角色。基因组关联研究已经发现,大量的lncRNA与各种类型的癌症相关。lncRNA的表达和突变能够促进肿瘤的形成和转移。lncRNA可能具有肿瘤抑制和促进致癌作用。因为lncRNA的基因组表达具有多样性和特异性,所以,lncRNA被认定可以作为新的肿瘤分子标志物和治疗靶点。本文结合国内外最新报道,对lncRNA在癌症中的研究进展作一综述。     

肝细胞癌自噬相关标志物生物信息学分析

目的 基于生物信息学方法分析肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)自噬相关长链非编码RNA(long noncoding RNA,lncRNA)生物标志物,用于评估HCC的临床预后及指导治疗。方法 从TCGA数据库中下载HCC全转录组数据以及对应的临床数据,在人类自噬数据库(http://www.autophagy.lu/)下载自噬相关基因,通过共表达分析找到自噬相关lncRNA。然后,根据K-M分析及Cox分析构建临床预后模型预测HCC患者生存风险及临床相关性分析。最后,针对这些自噬相关lncRNA进行GSEA功能富集分析和临床样本验证。结果 共筛选出919条自噬相关lncRNA,其中AC009403.1、AC099850.3、AL365203.2、AL117336.3和AC015908.3具有临床预后价值且能预测HCC患者生存风险。根据构建的风险模型将高表达AC015908.3患者归为低风险患者,AC099850.3,AL117336.3和AL365203.2归为高风险患者,独立预后分析也验证了构建的预后模型能够预后肝癌患者的生存风险。GSEA功能富集...     

lncRNA介导的ceRNA网络在痛风性关节炎中的研究进展

长链非编码RNA(lncRNA)是长度大于200nt的非编码RNA,近年来研究发现其可作为微小RNA(miRNA)的海绵而调控竞争性内源性RNA(ceRNA)网络。研究表明lncRNA在痛风性关节炎中存在异常表达,与Toll样受体和核苷酸结合寡聚化结构域样受体信号通路、嘌呤能离子通道型受体7信号通路等关系密切。lncRNA可通过多条lncRNA-miRNA-信使RNA轴影响痛风的发生发展。本文探讨lncRNA介导的ceRNA调控网络在痛风中的研究进展,加深对痛风的发病机制认识,为靶向干预痛风炎症以及预防骨侵蚀提供新思路。     

刚地弓形虫慢性感染小鼠脑组织中lncRNA102796的差异表达及其作用机制

目的 了解长链非编码RNA102796 (lncRNA102796)在刚地弓形虫慢性感染小鼠脑组织中的差异表达及其作用机制。方法取SPF级雌性BALB/c小鼠构建弓形虫慢性感染小鼠模型。感染后2个月,取感染小鼠（10只）和健康对照小鼠（10只）脑组织,提取总RNA以及神经细胞的细胞质和细胞核RNA,采用实时定量PCR (qRT-PCR)检测小鼠脑组织中lncRNA102796的表达和在神经细胞中的定位。生物信息学分析预测lncRNA102796的靶基因为阿片受体1 (opioid receptor delta 1, oprd1)基因。取感染小鼠和健康对照小鼠脑组织,提取总RNA和细胞蛋白,qRT-PCR检测脑组织中oprd1 mRNA相对转录水平,蛋白质免疫印迹（Western blotting）检测脑组织中OPRD1的表达情况。构建lncRNA102796的干扰质粒（干扰lncRNA102796）和过表达质粒（过表达lncRNA102796）,分别以未干扰lncRNA102796的质粒pGPU6/GFP/Neo和未过表达lncRNA102796的质粒pcDNA3.1+为干扰对照和过表...