长链非编码RNA XLOC-007123在乙型肝炎相关肝细胞癌中的表达及临床意义

目的检测长链非编码RNA(lncRNA)XLOC-007123在乙型肝炎相关肝细胞癌(HCC)患者组织(癌、癌旁)及肝癌细胞系中的表达,并分析其表达水平与临床病理特征的关系。方法选取2013年12月-2015年12月于解放军三〇二医院肝胆外科行HCC切除术的52例乙型肝炎相关HCC患者的肝癌组织;同时取同一患者的癌旁组织作为对照。应用荧光实时定量PCR检测lncRNA XLOC-007123在乙型肝炎相关HCC患者癌组织、配对癌旁组织以及肝癌细胞系中的表达水平。其中研究所用细胞系L02、HuH7、HepG2、SMMC-7721均由解放军三○二医院临床管理中心提供。非参数Wilcoxon秩和检验比较lncRNA XLOC-007123在癌组织和配对癌旁组织的表达水平;独立样本t检验比较不同HCC细胞系与正常肝细胞系间lncRNA XLOC-007123表达水平。临床指标差异分析采用χ~2检验。结果与癌旁组织相比,lncRNA XLOC-007123在乙型肝炎相关HCC患者的癌组织中表达显著下调(P<0.01);与正常肝细胞株相比,IncRNA XLOC-007123在3种肝癌细胞系中均呈低表达(P值均<0.05)。lncRNA XLOC-007123表达水平与患者的血清AFP水平和肿瘤分期相关,差异有统计意义(χ2值分别为7.738、7.589,P值均<0.05)。结论 lncRNA XLOC-007123在乙型肝炎相关HCC组织中表达降低,且与临床患者血清AFP水平和病理分期有关联,推测lncRNA XLOC-007123在乙型肝炎相关HCC发生发展过程中发挥着调控作用,有望成为乙型肝炎相关HCC临床诊断的潜在标志物。     

JAM3基因甲基化是食管鳞状细胞癌潜在的分子标志物

目的研究JAM3基因启动子区在食管癌中的甲基化情况及其表达调控机制,探讨JAM3基因启动子区异常甲基化作为食管鳞状细胞癌的潜在诊断标志物和治疗靶标。方法应用半定量RT-PCR、甲基化特异性PCR等技术对7个食管癌细胞系(KYSE140、KYSE150、KYSE410、KYSE450、COLO680N、KYSE520和TE13)、5例正常食管黏膜组织和83例原发性食管鳞状细胞癌组织进行分析。结果JAM3 mRNA在KYSE520、KYSE140、KYSE450细胞中高表达,这些细胞的JAM3基因启动子区呈非甲基化状态。JAM3 mRNA在KYSE410、COLO680N、TE13、KYSE150细胞中表达缺失,且其基因启动子区在这些细胞中呈完全甲基化。经过5-Aza-dc处理后,JAM3基因在KYSE410、COLO680N、TE13、KYSE150细胞中恢复表达。这些结果表明,JAM3在食管癌细胞中的表达受启动子区甲基化的调控。JAM3基因启动子区在5例正常食管黏膜组织中呈非甲基化状态(0/5),而在原发性食管鳞状细胞癌中其甲基化率为50.6%(42/83),且JAM3甲基化与肿瘤的位置相关(P<0.05)。结论JAM3在食管鳞状细胞癌中频繁发生甲基化,JAM3基因的表达受启动子区甲基化的调控,JAM3基因是潜在的食管癌诊断标志物和治疗靶标。     

CHD5基因在食管癌中的表观遗传学改变

目的:研究食管癌发病过程中染色质解旋酶DNA结合蛋白5(Chromodomain helicase DNA-binding protein5,CHD5)基因表观遗传学改变,探讨CHD5基因甲基化作为食管癌诊断标志物的可行性.方法:用甲基化特异性聚合酶链反应(methylation specific PCR,MSP)检测72例食管癌组织及成对癌旁组织,9例正常食管黏膜组织及4株食管癌细胞系中CHD5基因的甲基化状态,并用逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)检测CHD5基因在上述食管癌细胞系的表达.结果:69%(50/72)食管癌组织发生CHD5基因启动子区甲基化,32%(23/72)癌旁组织发生甲基化,差异具有统计学意义(χ2=20.254,P<0.05).9例食管正常组织未发生甲基化,2株食管癌细胞系中由于基因启动子区甲基化导致CHD5基因表达缺失,经5-aza-deoxycytidine处理96h后CHD5重新表达.结论:食管癌中CHD5基因频繁发生甲基化,表观遗传学改变是其基因表达的重要调节机制,CHD5基因甲基化有可能作为食管癌诊断的标志物.     

原发性肝细胞癌GOLM1基因异常表达和相关miRNA和lncRNA预测

目的通过GOLM1(GP73)在原发性肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中的表达,分析其作为HCC诊断标志物的可行性,并预测其相关RNA。方法分析在线数据库HCC中GOLM1 mRNA表达,用含90对HCC组织和癌旁正常组织的组织芯片和免疫组化方法检测GOLM1蛋白表达;用TCGA转录组数据预测GOLM1相关的miRNA和lncRNA。结果 HCC中GOLM1 mRNA的表达高于癌旁正常组织,与HCC患者临床分期、肿瘤分级和总生存时间相关。GOLM1蛋白在HCC与癌旁组织中的表达差异无统计学意义(P 0. 05)。生物信息学分析预测到与GOLM1存在可能调控关系的lncRNA 6个、miRNA 48个。结论 GOLM1 mRNA可作为HCC的诊断和预后标志物,成功预测到与GOLM1相互作用的lncRNA 6个、miRNA 48个。     

SLP-76基因在消化道肿瘤中的表达差异分析

目的 分析SLP-76基因在食管癌、贲门癌、胃癌、结肠癌及其癌旁组织中的差异表达。方法 依据微阵列技术筛选出SLP-76基因在食管癌组织中高表达的结果，应用逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)，对上述消化道肿瘤组织及其癌旁组织中的SLP-76基因表达进行检测。结果 SLP-76在73．3％(22／30)的食管癌组织中高表达(P=0．005)：在75％(9／12)的贲门癌组织中高表达(P=0．014)；在75％(12／16)胃癌组织中高表达(P=0．005)；在72．2％(13／18)结肠癌组织中高表达(P=0．008)。结论 在RNA水平，SLP-76基因在上述肿瘤之间的表达无显著性差异(P=0．9684)。但该基因在消化道肿瘤中高表达，SLP-76与上述消化道肿瘤生长关系密切；可能具有潜在的致癌性。     

胃脂肪酶在胃癌中的表达及临床意义

目的研究胃脂肪酶(lipase type F,LIPF)在胃癌中的表达,并分析其与临床病理特征及预后的相关性。方法收集胃癌手术切除后的石蜡包埋组织,包括胃癌组织122例和癌旁正常组织120例,整理临床资料及预后随访资料并进行相关性分析;用组织微阵列及免疫组织化学方法检测组织中LIPF的表达。选取5株胃癌细胞系及1株永生化正常胃黏膜细胞系GES1,利用qRTPCR方法检测LIPF mRNA的表达,用Western blotting方法检测各细胞系及8对新鲜配对胃癌组织中LIPF蛋白的表达。结果 LIPF在胃癌组织中的表达率显著低于癌旁正常组织(P0.001)。LIPF mRNA及蛋白在胃癌细胞系中微弱表达或不表达,在GES1细胞系中高表达(P0.01)。低表达LIPF胃癌患者5年内生存率显著低于高表达组(P0.001)。LIPF的表达与胃癌组织的浸润深度、Lauren分型密切相关(P0.05),与患者年龄、性别、TNM分期、淋巴结转移、远端转移无明显相关性(P0.05)。结论 LIPF在胃癌中表达下调,其低表达与肿瘤浸润深度、弥漫型胃癌呈正相关,低表达LIPF胃癌组预后较高表达组差,LIPF可以作为胃癌预后潜在的分子标志物。     

slp-76基因在肝癌及其他消化系统肿瘤中的差异表达分析

目的分析slp-76基因在肝癌、食管癌、贲门癌、胃癌、结肠癌及其癌旁组织中的表达情况。方法应用微阵列技术筛选出slp-76基因在肝癌组织中高表达,以逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术对上述消化系统肿瘤组织及其癌旁组织中的slp-76基因表达进行检测;应用Northern blot技术对肝癌组织及其癌旁组织中的slp-76基因表达进行检测。结果 RT-PCR证实slp-76在79.3%(24/29)的肝癌组织中高表达(P=0.005);在73.3%(22/30)的食管癌组织中高表达(P=0.005);在75%(21/28)的贲门癌组织中高表达(P=0.014);在75%(15/20)胃癌组织中高表达(P=0.005);在72.2%(13/18)结肠癌组织中高表达(P=0.008);Northern blot证实slp-76基因在肝癌组织中呈高水平表达。结论 slp-76基因在消化系统肿瘤中高表达,slp-76与上述消化系统肿瘤生长关系密切;在RNA水平,该基因在上述肿瘤间的表达无显著性差异(P=0.968)。     

干细胞Nanog蛋白在食管癌组织中的表达及意义

目的 探讨食管癌组织中干细胞Nanog蛋白表达,分析其与食管癌临床病理特征的关系.方法 收集87例食管癌患者的癌组织及癌旁正常组织标本,采用免疫组化法检测癌组织及癌旁正常组织中的Nanog蛋白表达,同时用免疫荧光技术检测食管癌细胞系TE-1、Eca-109中的Nanog蛋白表达.结果 Nanog蛋白在食管癌组织中的表达水平高于癌旁正常组织(P＜0.05),Nanog蛋白在食管癌组织中的表达与其病理分期、分化程度和淋巴结转移有关(P均＜0.05).食管癌细胞系TE-1、Eca-109中的Nanog阳性蛋白呈高表达,且表达存在异质性;多数细胞以细胞质表达为主,少数以细胞核表达为主,细胞核表达阳性率为10％.结论 Nanog蛋白在食管癌组织中的表达与食管癌的发生、发展及转移密切相关.     

食管癌组织中fez基因mRNA的表达改变

目的观察fez基因在食管鳞癌中的表达及意义。方法采用RT-PCR检测36例食管鳞状细胞癌癌组织、相应的癌旁组织和远癌组织中fez mRNA的表达情况。PCR产物经凝胶电泳,比较3种组织中fez与GAPDH条带的灰度值之比,半定量分析fezmRNA的表达水平。结果36例食管癌组织中有14例(38.9%)fez mRNA检测到阳性表达,22例(61.1%)fez mRNA表达缺失,其阳性表达率低于相应的癌旁组织和远癌组织(P<0.05);癌组织中fez mRNA表达水平(0.44±0.11)低于相应的癌旁组织(0.53±0.18)和远癌组织(0.69±0.21);随着肿瘤分化程度的升高,fez mRNA在癌组织中的阳性表达率也增加(P<0.05),但fez mRNA表达缺失与食管癌临床分期(TNM)、淋巴结有无转移和病理类型均无统计学差异(P>0.05)。结论fez mRNA在食管癌组织中存在表达缺失和低表达,说明fez基因在食管癌的发生发展中可能具有抑癌基因的作用。     

15-PGDH在食管癌中的表达

目的研究NAD+依赖性15-羟基前列腺素脱氢酶(15-PGDH)在食管癌组织及癌旁6 cm处非肿瘤对照组织中的表达,探讨15-PGDH在食管癌中的表达情况及其与食管癌的关系。方法本实验采用免疫组化SP法检测食管癌组织和癌旁6 cm处非肿瘤对照组织中15-PGDH的表达情况。结果免疫组化结果提示:40例食管癌组织中有5例(12.5%)15-PGDH呈强阳性染色,8例(20.0%)15-PGDH呈弱阳性染色,27例(67.5%)15-PGDH表达缺失;40例癌旁6 cm处对照组织中,13例(32.5%)15-PGDH呈强阳性染色,25例(62.5%)15-PGDH呈弱阳性染色,2例(5.0%)15-PGDH染色阴性(P0.05)。15-PGDH在食管癌组织(32.5%)的阳性表达率显著低于癌旁6 cm处非肿瘤对照组织(95.0%)的阳性表达率,15-PGDH的表达差异有统计学意义(P0.05)。15-PGDH蛋白表达与食管癌患者的性别、年龄、分化程度无关(P0.05)。15-PGDH蛋白表达与食管癌患者有无淋巴结转移有关(P0.05)。结论 15-PGDH在食管癌组织中表达缺失或减少,15-PGDH可能是食管癌发生发展中的重要抑制因子。     

cystatin B基因在人食管癌中的表达

目的：研究cystatinB基因在人食管癌中的表达状况。方法：采用逆转录聚合酶链反应（RT－PCR）方法检测41对食管癌组织及配对食管癌旁黏膜和食管癌细胞系EC9706和肺癌细胞系GLC82中cystatinB基因的表达。结果：cystatinB基因在82．95（34／41例）食管癌组织中的表达水平,低于配对的食管癌旁黏膜,且与食管癌淋巴结转移显著相关（P＜0．05）。在食中细胞系EC9706有微弱表达,在肺癌细胞系GLC82未检测到表达。结论：cystatinB基因在人食管癌中表达显著下调且与淋巴结转移相关。     

Expression of ECRG4, a novel esophageal cancer－related gene,downregulated by CpG island hypermethylation in human esophageal squamous cell carcinoma

AIM: To study the mechanisms responsible for inactivation of a novel esophageal cancer related gene 4 (ECRG4) in esophageal squamous cell carcinoma (ESCC). METHODS: A pair of primers was designed to amplify a 220 bp fragment, which contains 16 CpG sites in the core promoter region of the ECRG 4 gene. PCR products of bisulfite-modified CpG islands were analyzed by denaturing high-performance liquid chromatography (DHPLC), which were confirmed by DNA sequencing. The methylation status of ECRG 4 promoter in 20 cases of esophageal cancer and the adjacent normal tissues, 5 human tumor cell lines (esophageal cancer cell line-NEC, EC109, EC9706; gastric cancer cell line- GLC; human embryo kidney cell line-Hek293) and 2 normal esophagus tissues were detected. The expression level of the ECRG 4 gene in these samples was examined by RT-PCR. RESULTS: The expression level of ECRG 4 gene was varied. Of 20 esophageal cancer tissues, nine were unexpressed, six were lowly expressed and five were highly expressed compared with the adjacent tissues and the 2 normal esophageal epithelia. In addition, 4 out of the 5 human cell lines were also unexpressed. A high frequency of methylation was revealed in 12 (8 unexpressed and 4 lowly expressed) of the 15 (80 %) downregulated cancer tissues and 3 of the 4 unexpressed cell lines. No methylation peak was observed in the two highly expressed normal esophageal epithelia and the methylation frequency was low (3/20) among the 20 cases in the highly expressed adjacent tissues. The methylation status of the samples was consistent with the result of DNA sequencing. CONCLUSION: These results indicate that the inactivation of ECRG 4 gene by hypermethylation is a frequent molecular event in ESCC and may be involved in the carcinogenesis of this cancer.     

长链非编码RNA LOXL1-AS1在胃癌中的表达及其临床意义

目的探讨lncRNA LOXL1-AS1在胃癌中的表达及其临床意义。方法实时荧光PCR(qRT-PCR)检测89对胃癌组织及癌旁组织标本中lncRNA LOXL1-AS1的表达情况,并分析其与各临床病理因素的相关性;利用Kaplan Meier plotter数据库分析不同LOXL1-AS1表达状态下胃癌患者的总生存率差异,探讨LOXL1-AS1表达评估胃癌患者预后的价值。结果胃癌组织LOXL1-AS1表达量显著高于癌旁组织(P<0.05);胃癌组织中LOXL1-AS1表达量与患者肿瘤直径、局部淋巴结转移、远处转移和TNM分期密切相关(P<0.05),但与患者年龄、性别、腹膜转移、肿瘤分化程度等无相关性(P>0.05);Kaplan Meier plotter数据库纳入分析了631例病例样本,其中455例为高表达,176例为低表达。LOXL1-AS1高表达组胃癌患者生存率显著低于LOXL1-AS1低表达组患者,差异有统计学意义(HR=1.52,95%CI:1.17~1.97,P=0.0014)。结论LOXL1-AS1在胃癌中高表达,可能参与了胃癌发生、发展过程;LOXL1-AS1可能作为预测胃癌患者预后评估的指标。     

肝素酶基因表达与食管癌转移的关系

目的　探讨肝素酶基因表达与食管癌转移的关系。方法　采用逆转录聚合酶链反应技术 ( RT-PCR)检测 5 4例食管癌组织、癌旁组织及正常粘膜中肝素酶基因的表达。结果　有淋巴结转移的食管癌癌组织中肝素酶基因阳性表达率为 90 .5 % ( 19/ 2 1) ,癌旁组织为 6 1.9% ( 13/ 2 1) ,正常粘膜为 0 ( 0 / 2 1)。无淋巴结转移的食管癌癌组织中肝素酶基因阳性表达率为 15 .2 % ( 5 / 33) ,癌旁组织为 6 % ( 2 / 33) ,正常粘膜为 0 ( 0 / 33)。有淋巴结转移的食管癌组织及癌旁组织中肝素酶基因阳性表达率均高于无淋巴结转移者 ,二者相比差异均有显著性 (癌组织 P<0 .0 0 1,癌旁组织 P<0 .0 5 )。结论　肝素酶基因表达可能与食管癌发生转移有关 ,其可能成为预测食管癌转移的指标     

HspB1在新疆哈萨克族食管癌组织中的表达

目的:寻找与新疆哈萨克族食管癌发生、发展密切相关的基因,为早期诊断和治疗提供依据.方法:利用二维凝胶电泳(2-DE)和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)技术联用检测出新疆哈萨克族食管癌癌组织与远端正常组织的差异表达蛋白.对其中的HspB1基因进行RT-PCR验证.结果:2-DE结果显示新疆哈萨克族食管癌患者癌组织和远端正常组织在蛋白质水平有显著增高,而其mRNA表达在癌组织中为2.18±3.98,正常组织为3.06±4.69,并无显著升高(P>0.05),且与浸润深度、临床分期、分化程度无关(P>0.05),但HspB1的表达量在浸润深度组,T1-T2期T>N为7/11(63.6%),而T3-T4期T>N仅为14/37(37.8%);在分化程度组,低分化期T>N为5/9(55.6%),中高分化期T>N仅为16/39(41%).随着浸润深度和分化程度的逐步加深,由T>N向T相似文献   

Mechanism of aberrant long non-coding RNA expression in an adriamycin-resistant liver cancer cell strain

Background and aimsAberrant long non-coding RNA (lncRNA) expression in cancer can be used as a potential diagnostic biomarker and therapeutic target. In the present study we determined the potential pathogenic mechanism underlying significant aberrant expression of lncRNAs in HepG2-ADR.MethodsFirst, we identified different levels of lncRNA expression in liver cancer and adjacent non-tumor tissues obtained from public data (GSE70880) in NCBI. Then, the results were verified in a sensitive liver cancer cell line (HepG2) and a adriamycin-resistant liver cancer cell line (HepG2-ADR). Then, the effects of lncRNAs on the phenotype and some biological characteristics were also determined in HepG2 and HepG2-ADR through overexpression and using siRNA interference methods.ResultsWe showed that lncRNA ENST00000425005 is highly expressed in a liver cancer-resistant cell line when compared with adjacent non-tumor tissues based on bioinformatics analysis and qPCR verification. Compared with the control group, overexpression of lncRNA ENST00000425005 significantly promoted proliferation and adhesiveness, but inhibited apoptosis in HepG2-ADR cells. In contrast, interference of lncRNA in HepG2-ADR cells suppressed proliferation and adhesiveness, and induced apoptosis.ConclusionIn conclusion, lncRNA ENST00000425005 promotes cell proliferation and invasion in drug-resistant liver cancer cells by regulating epithelial–mesenchymal transition-related gene expression and participating in the regulation of EGF and FGF7.