测序法研究XRCC1基因单核苷酸多态性与结直肠癌遗传易感性的相关性

目的探讨x线交叉互补基因1（XRCCl）单核苷酸多态性（SNP）与结直肠癌遗传易感性的相关性。方法采用SNaPshotSNP分型技术方法,对136例结直肠癌病例（病例组）和214例成组匹配的正常体检者（对照组）外周血中的XRCCl基因的rs25487、rs25489和rs1799782等3个SNP位点进行分型,针对每个位点分析共显性、显性、隐性、超显性和叠加作用5种不同的遗传模型。分析XRCCl不同基因型与结直肠癌发生风险的相关性。结果XRCCl基因3个SNP位点25487G／A、25489C／T及1799782C／T变异等位基因在病例组的频率分别为0．20、0．11和0．32。对照组分别为0．23、0．13和0．34。单倍型分析显示。GCT、GCC、ACC和GTC为最常见的4种单倍型,其OR值分别为1、1．35、0．90和0．84,病例组与对照组单倍型的分布差异无统计学意义（P〉0．05）。单位点分析结果显示,在5种不同的遗传模型中,3个SNP位点的基因型均与结直肠癌发生风险无相关性（P〉0．05）。结论XRCCl基因的3个SNP位点（rs25487、rs25489、rsl799782）均与结直肠癌的发生无明显相关性。     

ABCA2基因单核苷酸多态性与胆囊结石病的相关性

目的 检测中国人ABCA2(ATP binding cassette A2)基因编码区单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),并探讨其与中国汉族人群胆囊结石病的关系。方法 采用直接测序法检测ABCA2基因编码区及相邻的部分内含子的序列,以确定中国人ABCA2基因SNPs的位置及类型。对位于编码区的SNPs,采用病例对照方法,在胆囊结石病患者和正常对照者中进行关联研究。结果在16 911 bp测序长度中,共发现12个SNP,2个位于编码区,10个位于内含子,其中7个为新发现的SNP。各SNPs在胆石病组和对照组中分布差异无统计学意义。结论SNP在不同种族间存在差异。ABCA2基因编码区SNP在胆石病和对照组间分布差异无统计学意义。     

基因单核苷酸多态性与肝癌肝移植术后复发的研究进展

肝癌移植术后肿瘤复发是影响肝移植远期预后重要的因素。病理学与基因组学发现术后肿瘤的复发是多因素、多步骤、多种基因调控的复杂生物过程。肝移植术后肿瘤复发的病理学相关研究国内外已有较多的文献报道,但是基因组学的研究相对较少。近几年研究发现基因单核苷酸多态性(SNP)与多种肿瘤发展密切相关。本文对基因SNP与肝癌移植术后术后肿瘤复发的关系进行综述。     

人端粒保护蛋白1基因单核苷酸多态性与胃癌的关系

目的 探讨人端粒保护蛋白1基因(hPOT1)IVS13-98G/T位点单核苷酸多态性与胃癌的关系.方法 收集2005年12月至2006年7月甘肃省武威肿瘤医院、武威市人民医院、武威市凉州区医院168例胃癌患者(胃癌组)和156例健康受试者(对照组)的血液标本,采用聚合酶链反应和限制性片段长度多态性技术行基因型分析,比较各基因型分布频率与胃癌发病风险的关系.采用X~2检验比较胃癌组和对照组hPOT1IVS13-98G/T位点的基因型分布和等位基因频率,用Hardy-weinberg平衡检验基因型和等位基因频率分布是否具有群体代表性.相对危险度和95%CI以非条件Logistic回归模型计算.结果 胃癌组hPOT1IVS13-98G/T位点GG、GT、TT型的频率分别为21.4%、41.7%、36.9%,G、T等位基因的频率分别为42.3%、57.7%;对照组GG、GT、TT型的频率分别为24.4%、51.9%、23.7%,G、T等位基因频率分别为49.7%和50.3%.两组G、T等位基因型频率比较差异无统计学意义(X~2=3.58,P>0.05).以TT型作为参照基因型,GT和GG两种基因型相对危险度分别为0.439(95%CI:0.251～0.767,P<0.05)、0.514(95%CI:0.264～0.999,P=0.05).hPOT1IVS13-98G/T位点各基因型与性别、吸烟及肿瘤家族史对胃癌发病没有影响.结论 hPOT1IVS13-98G/T位点的CT和GG型可能与胃癌的易感性降低有关,hPOT1IVS13-98G/T位点单核苷酸多态性可能为胃癌的保护因素.     

FGFR2基因单核苷酸多态性与乳腺癌的相关性研究

目的：探讨成纤维细胞生长因子受体2（FGFR2）基因第二内含子单核苷酸多态性与女性乳腺癌发生的相关性。方法：运用等位基因扩增-聚合酶链反应（ASA-PCR）方法结合琼脂糖凝胶电泳技术,对200例女性乳腺癌患者（乳腺癌组）和200例正常女性（对照组）进行检测,分析两组人群FGFR2基因第二内含子的三个单核苷酸位点rs2912778r、s3135718和rs11200014的多态性分布,并进行统计学分析。结果：rs2912778（T/T、T/C、C/C）r、s3135718（A/A、A/G、G/G）r、s11200014（A/A、A/G、G/G）的基因型分布在对照组和乳腺癌组之间的差异有明显的统计学意义（P〈0.01）;根据病理分型进一步分析,三个位点野生型与变异型相比差异均无统计学意义（P〉0.05）。结论：FGFR2基因第二内含子的三个位点单核苷酸多态性可能与中国女性乳腺癌的发生有关。     

单核苷酸多态性与结直肠癌关系研究进展

结直肠癌是一种多因素共同作用的疾病,对结直肠癌的研究应该从多基因水平考虑,单核苷酸多态性作为一种新的研究肿瘤基因改变的方法,在结直肠癌的研究中有重要作用.寻找结直肠癌特异性单核苷酸多态性,对筛选高危人群,预估发病风险,具有重要意义.     

DNA修复基因多态性与膀胱肿瘤的关系

DNA修复基因多态性对维持基因组的稳定性有重要作用,基因突变与膀胱肿瘤的发生、发展关系密切。近年来,DNA修复基因多态性在肿瘤发生中的作用成为研究热点。     

血管内皮生长因子936 T/C基因多态性与结直肠癌及术后吻合口瘘的关系

目的通过研究血管内皮生长因子（VEGF）936T／C基因多态性了解该因子对结直肠癌生成及术后结肠吻合口瘘的影响。方法采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR—RFLP）方法检测结直肠癌及正常对照的VEGF936T／C基因型。结果结直肠癌患者VEGF936T／C基因型或等位基因与对照组相比无差异。伴有术后结肠吻合口瘘的结直肠癌患者其VEGF936C／C基因型及C等位基因比例低于无术后结肠吻合口瘘的患者,两者差异有统计学意义（P〈0．05）。结论VEGF936C／C基因型或936C等位基因与结直肠癌的发生无关,但提示术后结肠吻合口瘘的发生率降低。     

IL-28B单核苷酸基因多态性与CHB干扰素疗效的相关性

目的：探讨IL-28B单核苷酸基因多态性与慢性乙型肝炎（CHB）干扰素疗效的相关性。方法选取300例HBeAg阳性CHB患者,给予聚乙二醇化干扰素α（Peg-INF-α）规范治疗48周后以PCR法对IL-28B SNP rs12979860及IL-28B SNP rs8099917基因分型进行检测。结果治疗后HBV DNA定量、ALT、AST水平明显较治疗前下降（P＜0.05）,HBeAg转移率53.13%,随访1年后应答率49.44%;Peg-INF-α应答患者与非应答患者IL-28B SNP rs12979860基因型CC、CT、TT分布及等位基因C、T频率比较差异无统计学意义（P＞0.05）,IL-28B SNP rs8099917基因型TT、TG分布及等位基因T、G频率比较差异具有统计学意义（P＜0.05）。结论 IL-28B SNP rs8099917可能对干扰素治疗的应答反应性形成影响,其中等位基因G的频率升高可能提示着干扰素的成功应答,因而检测IL-28B SNP rs8099917对干扰素治疗的CHB患者治疗疗效有一定预测价值。     

L-plastin启动子单核苷酸多态性与前列腺癌遗传易感性的相关性研究

目的 研究L-plastin启动子单核苷酸多态性(SNP)与前列腺癌的关系.方法 采用Tm-shifting(等位基因特异性扩增结合融解温度曲线分析法)分析方法,对82例前列腺癌人群和94例对照人群的L-plastin启动子SNP位点的基因型进行检测.结果 L-plastin启动子TT、CT、CC基因型及等位基因T、C在汉族前列腺癌患者及对照者中的分布频率差异无显著性(P>0.05);在前列腺癌组内不同病理分级中,中、高分化组和低分化组中TT、CT、CC基因型分布频率差异无显著性(P>0.05);在前列腺癌组内不同临床分期中,与TT纯合子相比,CC纯合子前列腺癌Ⅳ期的风险增加至5.0倍(P<0.05).结论 L-plastin启动子单核苷酸多态性在中国汉族人群中与前列腺癌无相关,但该启动子多态性可能在预测前列腺癌进展中有一定作用.     

汉族女性乳腺癌患者has-mir-125a-5p基因的rs12975333位点的单核苷酸多态性及其在癌组织的表达研究

目的 探讨汉族女性乳腺癌患者has-mir-125a-5p基因rs12975333位点单核苷酸多态性(SNP)及has-mir-125a-5p基因在癌组织表达水平与乳腺癌发生发展的关系.方法 选取汉族女性乳腺癌患者289例、乳腺纤维腺瘤49例和相匹配的健康汉族妇女外周血338例,分离淋巴细胞,抽提基因组DNA,采用taqman-MGB探针检测338例乳腺肿瘤及338例健康对照组has-mir-125a-5p的rs12975333位点的单核苷酸多态性;采用茎环Real-time RT-PCR检测289例乳腺癌组织及其正常腺体组织中has-mir-125a-5p的表达水平.结果 乳腺癌组has-mir-125a-5p基因rs12975333位点基因型为GG型273例(94.5%)、GT型16例(5.5%);乳腺纤维腺瘤组及对照组has-mir-125a-5p基因m12975333位点基因型均为GG型;乳腺癌组织has-mir-125a-5p的表达水平(0.19 ±0.04)低于腺体组织(0.37±0.05),差异有统计学意义(P=0.04);携带T等位基因乳腺癌组织中has-mir-125a-5p下调水平较GG基因型表达者更为明显(P=0.022).has-mir-125a-5p的表达降低在发病年龄较晚(P=0.036),ERBB2(P=0.007)、ERBB3(P=0.04)受体表达阴性及存在腋窝淋巴结转移(P=0.001)的乳腺癌组织中更为明显.结论 汉族妇女has-mir-125a-5p基因rs12975333位点的G＞T变异可能与乳腺癌遗传易感性有关;has-mir-125a-5p表达与乳腺癌发生发展相关,是一个潜在的乳腺癌分子标志物.

Abstract：

Objective To investigate the relationship between the single nucleotide polymorphisms (SNPs) in has-mir-125a-5p rs12975333 and the expression of has-mir-125a-5p and clinicopathological cheracteristics of female breast cancer in Han Chinese women. Methods Genomic DNA was extracted from peripheral blood lymphocytes. taqman-MGB assay was used to type breast cancer of 338 cases and 338 controls. Expression levels of has-mir-125a-5p in 289 biopsies were examined using stem-loop real-time RTPCR and the clinicopathological cheracteristics of breast cancer were evaluated. Result The gene frequencies (GG,GT,TT) of rsl2975333 in the patients were GG 273 (94. 5% ), GT 16 (5.5%),TT 0(0%), while in breast fibroadenoma and controls there were GG 49 ( 100% ), 338 (100%). The expression level of has-mir-125a-5p in breast cancer(0. 19 ±0. 04) was lower than that in the matched nontumor adjacent tissue specimens (0. 37 ± 0. 05 ) ( P = 0. 04 ) .The expression level of minor T allele of mature miR-125a in breast cancer patients was lower than that in has-mir-125a-5p-GG carying(P =0.022). The expression of has-mir-125a-5p was down-regulated in primary breast cancer, especially in elder patients ( P = 0. 036) and lymph node metastasis groups (P = 0. 001) and with negative ERBB2 (P = 0. 007), ERBB3 (P =0. 04). Conclusions rs12975333 polymorphisms in has-mir-125a-5p gene may work as a risk factor of breast cancer in Han Chinese women. The altered expression of has-mir-125a-5p might play a role in the pathogenesis and progression of breast carcinoma.     

X线交错互补修复基因1和核苷酸剪切修复基因多态性与前列腺癌发病风险的相关性

目的 探讨DNA损伤修复基因X线交错互补修复基因1(XRCCI)、核苷酸剪切修复基因(XPD)基因多态性与前列腺癌发病风险的关系. 方法 以358例前列腺癌患者和312例健康对照者为研究对象,采用聚合酶链反应一限制性片段长度多态技术检测XRCC1 C26304T、G28152A和XPD A35931C位点基因型,以非条件logistic回归分析计算比值比(OR)及95%可信区间(CI),评估不同基因型与前列腺癌风险之间的相关性. 结果 前列腺癌组XRCC1 28152位点AA基因型者47例(13.1%),对照组24例(7.1%),携带此基因型者患前列腺癌风险显著增加(OR 1.924,95%CI=1.126～3.288,P=0.017).2组间XRCC1 C26304T和XPD A35931C位点基因型分布差异无统计学意义.3个基因位点联合分析结果 显示,个体携带XRCCI 28152AA型及XPD 35931AC+CC型者发生前列腺癌风险显著增加(OR=3.087,95%CI 1.081～8.813;OR=3.376,95%CI 1.067～10.683,OR 3.216,95%CI=1.439～7.188,P=0.004).以患者年龄、PSA值、Gleason评分以及临床分期分层分析结果 显示,携带XRCC1 28152AA及XPD 35931AC+CC基因型者发病年龄明显低于携带野生基因型者(P<0.05). 结论 中国汉族人群XRCCl和XPD基因多态与前列腺癌发病有关,尤其是较年轻者.     

雌激素代谢酶CYP17、CYP19单核苷多态性与乳腺癌易感性的相关性分析

目的 初步探讨雌激素代谢酶CYP17和CYP19单核苷多态性与乳腺癌易感性的相关性.方法 采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性及短串联重复多态性方法,检测213例乳腺癌患者和430例正常对照CYP17、CYP19单核苷多态性分布.结果 乳腺癌患者雌激素代谢酶CYP17 A2/A2基因型频率为6.7%,高于对照组的2.4%(P＜0.05),CYP17变异等位基因A2病例组的频率为16.2%,亦明显高于对照组的10.6%(P＜0.05);乳腺癌患者雌激素代谢酶CYP19(TTTA)10等位基因病例组的频率为12.4%,对照组为8.2%,差异有统计学意义(P＜0.05).结论 CYP17单核苷多态性与乳腺癌易感性相关,A2/A2基因型增加乳腺癌风险;CYP19单核苷多态性与乳腺癌易感性亦相关,CYP19(TTTA)10等位基因变异升高与乳腺癌易感性高度相关.     

ERCC2单核苷酸多态性对宁夏原发性男性不育的影响

目的:探讨DNA修复基因(ERCC2)单核苷酸多态性(SNPs)rs13181、rs1618536和SNPrs1799793对宁夏原发性男性不育的影响。方法:采用病例-对照研究方法,运用MassArray SNP技术,对宁夏地区351例原发性男性不育患者[年龄22~38(31.0±4.2)岁]和327例健康生育对照人群[年龄19~42(33.0±5.9)岁]的ERCC2 SNP rs13181、rs1618536和rs1799793进行分型检测。结果:ERCC2 SNP rs13181、rs1618536和rs1799793基因型频率和等位基因频率在病例组和对照组中的分布无统计学意义(P0.05),其中AnyG-anyA-anyA突变基因型频率在两组中分布具有统计学差异(OR=0.414,95%CI=0.176~0.970)。结论:ERCC2 SNP rs13181、rs1618536和rs1799793在宁夏地区男性原发性不育中存在交互作用,随着联合突变位点的增多,不育症的发病风险增加。     

hMLH1A655G／A多态性与结直肠癌发病的相关性

目的研究错配修复基因hMLH1A655多态性与结直肠癌发病的关系。方法提取135名健康人和115例结直肠癌患者的外周血DNA．聚合酶链反应-变性高效液相色谱（PCR．DHPLC）技术及DNA序列分析检测hMLH1A655多态性,采用病例对照研究统计分析hMLH1A655多态性与结直肠癌发病的关系。结果hMLH1A655G检出率在正常人群和结直肠癌患者中分别为3．0％和11．3％,两组比较差异有统计学意义（P〈0．01）。管状或乳头状腺癌中A655G检出率为8．2％．黏液腺癌中检出率为27．8％,两者比较差异有统计学意义（P〈0．05）。而hMLH1A655G／A多态性与年龄、性别及有无淋巴结转移无明显相关（P〉0．05）。结论hMLH1A655A—G突变可能在结直肠癌的发病过程中具有重要影响．并且hMLH1A655多态性有可能成为结直肠癌患者预后风险评估的一个指标。     

肌球蛋白重链9基因单核苷酸多态性与内蒙古自治区汉族IgA肾病临床、病理及预后的关系

目的 探讨肌球蛋白重链(MYH)9基因单核苷酸多态性与内蒙古自治区汉族IgA肾病患者临床特征、病理及预后的关系.方法 以经肾组织活检确诊的IgA肾病患者148例为研究对象,对其中56例患者进行了1～97月的随访.取外周血提取DNA,采用PCR限制性片段长度多态性分析(RFLP)法检测MYH9基因Rs3752462、Rs4821480位点单核苷酸多态性.研究各位点基因型与IgA肾病患者临床特征的相关性.分析不同基因型与疾病进展和预后的关系.结果 (1)Rs3752462位点符合Hardy-Weinberg平衡,Rs4821480位点不符合Hardy-Weinberg平衡.(2)IgA肾病患者MYH9基因Rs3752462位点TT基因型患者的收缩压低于CC+CT基因型(P＜0.05).Rs4821480位点GG基因型与TT+GT基因型两组患者收缩压、舒张压、年龄差异有统计学意义(P＜0.05).Scr、肌酐清除率、血白蛋白、血红蛋白、镜下血尿、蛋白尿程度等临床指标及病理HASS分级、肾病理改变在Rs4821480位点、Rs3752462位点3种基因型组间差异无统计学意义.(3) Kaplan-Meier生存分析提示Rs3752462位点CC基因型、Rs4821480位点TT基因型患者肾活检到肾功能减退时间显著较短(P＜0.05).结论 MYH9基因Rs3752462位点C等位基因是引起IgA肾病患者高血压损害的独立危险因素.MYH9基因Rs4821480位点3种基因型多态性与患者预后相关.携带Rs3752462位点C等位基因、Rs4821480位点T等位基因可能影响患者的预后.     

巨噬细胞清道夫受体单核苷酸多态性与前列腺癌易感及患者预后的相关性分析

目的 探讨分析巨噬细胞清道夫受体(MSR1)单核苷酸多态性与前列腺癌易感及患者治疗预后的相关性.方法 选择2017年3月至2019年5月在本院治疗的前列腺癌患者103例设为前列腺癌组,再选取同期在本院健康体检的男性受试者97例设为对照组.检测两组受试者MSR1基因rs918位点及rs1904577位点的基因多态性分布情...     

IgA肾病候选基因单核苷酸多态性的搜寻和确定

目的 通过搜寻IgA肾病(IgAN)候选的megsin和P选择素基因单核苷酸多态性(SNPs)并分析其特点，为进行IgAN病例-对照相关研究提供重要资料。 方法 采用PCR产物直接测序法，对中国汉族人24份标本(12例IgAN，12例正常对照者)两个候选基因中所有启动子区、编码区及其部分调控区和外显子-内含子连接区域13 591 bp进行检测，开展SNPs筛查。 结果 经过对测序结果统计分析，共发现SNPs 27个，其中SERPINB7基因11个，SELP基因16个；平均分布密度为503 bp/SNP。在我们发现的27个SNPs中，共有10个SNPs在GenBank中尚未报道过，占27个SNPs的37%。 结论 本检测为进一步行IgAN病例-对照相关研究及建立中国人群基因序列变异的自主知识产权提供了有用信息。     

24个单核苷酸多态性位点与皖北地区布加综合征相关性研究

目的探讨24个相关基因单核苷酸多态性(SNPs)位点与皖北地区布加综合征(BCS)的关系,为BCS的诊断和针对性治疗提供新依据。方法选取2017年2月至2019年6月蚌埠医学院第一附属医院收治的80例BCS患者(BCS组),另选取同期80例健康体检者(对照组),静脉血提取DNA,应用Agena MassARRAY SNP结合多重PCR技术、MassARRAY iPLEX单碱基延伸技术和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)技术通过检测延伸产物相对分子量对21个基因中24个SNPs进行分型检测,分析各基因型、等位基因的差异表达。结果其中6个SNPs位点统计结果不符合Hardy-Weinberg平衡;18个SNPs位点基因型频率分布在BCS组及对照组间差异无统计学意义。BCS组MTHFR C677T(rs1801133)基因位点A等位基因频率高于对照组(OR=2.769,95%CI:1.171~4.465,P=0.004)。结论MTHFR C677T(rs1801133)基因位点A等位基因可能是皖北地区BCS的危险因素。