基于微生物-代谢组学研究尿毒清颗粒改善大鼠慢性肾病的作用及机制

采用微生物组学结合代谢组学的方法，研究尿毒清颗粒干预SD大鼠慢性肾脏疾病的作用，并初步探究其作用机制。采用腺嘌呤诱导的方法制备SD大鼠慢性肾脏疾病模型，模型构建成功后，将动物随机分为阴性对照组和尿毒清颗粒处理组，同时设立正常对照组，每组8只。给药4周后，分别收取动物粪便及血清，采用16S rDNA测序分析肠道微生物丰度、多样性以及功能预测；采用LC-MS进行高通量测序检测动物血清代谢物；利用MetPA数据库筛选出慢性肾脏疾病大鼠潜在的生物学标志物，并进行代谢通路的富集分析。Spearman法分析2个组学之间的相关性。结果显示，尿毒清颗粒可有效改善慢性肾脏疾病大鼠体质量减轻、肾脏功能相关生化及外观指标。16S rDNA测序结果表明，尿毒清颗粒可调节慢性肾脏疾病大鼠肠道菌群的多样性和组成；肠道微菌群的改变，影响了氨基酸生物合成和代谢、脂类代谢、碳水化合物代谢等功能代谢途径。LC-MS检测结果显示，相对于阴性对照组，尿毒清颗粒处理组动物有15种代谢物发生逆转，其中有11种潜在标志代谢物显著上调，有4种潜在标志代谢物显著下调；主要涉及5条氨基酸代谢通路，且与肠道菌群的改变具有显著相关性。尿毒清...     

16S rRNA高通量测序研究柴芪汤对代谢综合征大鼠肠道菌群的影响

目的:采用16S rRNA高通量测序技术分析柴芪汤对代谢综合征(MS)大鼠肠道菌群的影响。方法:通过Illumina Miseq PE300型高通量测序仪对大鼠粪便肠道菌群进行16S rRNA基因V3-V4可变区检测,运用Usearch、Mothur、LEfSe分析肠道菌群的组成结构及不同菌属相对丰度变化。结果:柴芪汤能够逆转MS大鼠肠道菌群物种多样性的下降,并纠正MS导致的菌群组成结构改变。研究发现MS大鼠的肠道菌群在菌属水平有57个菌属相对丰度发生显著变化,而柴芪汤能将其中的54个菌属恢复至正常水平。结论:从肠道微生态角度阐释了MS的可能病机,柴芪汤可以通过调节肠道菌群防治MS。     

中草药调控肠道微生态组成与代谢的研究进展

肠道菌群作为对宿主健康至关重要的微生态系统,由大量不同的细菌组成,一旦出现生态失调,将会诱发多种疾病。与此同时,肠道菌群所产生的代谢物在构建微生物群体响应与代谢信号网络中发挥着关键作用。许多中草药对于肠道菌群微生态平衡具有调节作用,集中表现在调控菌群的组成以及代谢产物。随着基因组学和代谢组学的快速发展,肠道菌群物种组成与代谢物的表征取得了巨大进展,已成为全球的研究热点。本文对近年来中药调控肠道菌群的研究成果与研究技术进行了归纳整理,以期为进一步研究中药调节肠道菌群的作用机制提供参考。     

快速老化小鼠SAMP8模型粪便代谢物和肠道菌群改变的研究

目的研究快速老化小鼠SAMP8模型老化过程中粪便代谢物和肠道菌群的变化。方法采用1H-NMR代谢组学和宏基因组学技术,探索衰老相关的代谢标志物和肠道菌群,并对代谢物与肠道菌群进行Pearson关联分析。结果 SAMP8小鼠粪便中指认出31种内源性代谢物,与SAMR1小鼠相比,13种代谢物发生显著改变。差异代谢物主要富集在4条代谢途径:苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸的生物合成,缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸的生物合成,苯丙氨酸代谢,组氨酸代谢。肠道菌群分析发现10月龄快速老化小鼠SAMP8肠道菌群多样性明显改变,10种菌群的相对丰度显著改变。相关性分析结果表明,Christensenellaceae菌科与苯丙氨酸、组氨酸、缬氨酸、异亮氨酸和尿苷酸均呈正相关;Dehalobacterium菌属与酪氨酸,Planococcaceae动球菌科与缬氨酸均呈负相关。结论通过研究快速老化小鼠SAMP8模型粪便代谢物和菌群的变化规律,为衰老机制及抗衰老药物研究提供实验依据。     

寒凝血瘀证大鼠的肠道菌群变化与粪便代谢特征分析

目的:探讨寒凝血瘀状态下大鼠肠道菌群多样性及粪便中内源性代谢物的变化,并考察与寒凝血瘀证密切相关的肠道菌群、代谢物、代谢通路。方法:采用冰水浴诱导的大鼠寒凝血瘀证模型,利用16S rRNA基因测序技术联合UPLC-TOFMS的粪便代谢组学技术,将扰动的肠道菌群与内源性生物标记物进行关联分析。结果:基于Illumina Mi Seq平台,发现与空白组大鼠相比,寒凝血瘀证模型组大鼠中Firmicutes显著上调(P0.05),Bacteroidetes显著下调(P0.01),显著差异的属有23个。确定了7个与寒凝血瘀证相关的粪便代谢物,涉及到的3个相关性最强的代谢通路,分别为缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸生物合成,泛酸和辅酶A生物合成,组氨酸代谢。另外,肠道菌群的属与粪便代谢物有强相关性。结论:16S rRNA的高通量基因测序技术与代谢组学技术的联用可用于评价寒凝血瘀证的病理机制。     

葛根芩连汤对腹泻型肠易激综合征大鼠肠道菌群的影响北大核心CSCD

探讨葛根芩连汤对腹泻型肠易激综合征(irritable bowel syndrome with diarrhea, IBS-D)大鼠肠道菌群的干预效果。将36只雄性SD大鼠按随机数字表法分为6组:正常组,模型组,利福昔明组(150 mg·kg^(-1)),葛根芩连汤高(8.125 g·kg^(-1))、中(4.062 5 g·kg^(-1))、低剂量组(2.031 3 g·kg^(-1)),每组6只。构建IBS-D大鼠模型,干预治疗8 d,观察大鼠一般状态和粪便性状评分、腹部收缩最小容量阈值;行HE染色观察结肠组织的病理学变化;利用16S rRNA测序观察肠道菌群变化。结果显示,与模型组比较,利福昔明组、葛根芩连汤高剂量组、葛根芩连汤中剂量组粪便性状评分均明显降低(P<0.01),腹部抬起最小容量阈值均显著升高(P<0.05)。HE染色显示葛根芩连汤干预后可以减轻肠道炎症。16S rRNA测序分析发现,IBS-D大鼠肠道菌群发生明显改变;葛根芩连汤干预后显著提高肠道菌群的丰富度指数与多样性指数,调节菌群物种数量,改善alpha多样性与beta多样性。肠道菌群物种组成及LEfSe分析显示,葛根芩连汤可以显著提高拟杆菌门Bacteroidota与厚壁菌门Firmicutes的比值,增加梭菌纲Clostridia、毛螺菌目Lachnospirales等益生菌丰度,减少拟杆菌目Bacteroidales、普雷沃菌科Prevotellaceae等条件致病菌丰度。PICRUSt2功能预测分析显示,葛根芩连汤主要与碳水化合物代谢、氨基酸代谢等多种代谢途径有关。综上所述,葛根芩连汤能够显著降低IBS-D大鼠内脏高敏性,减轻肠道炎症,改善腹泻等临床症状,其机制可能是通过调节肠道菌群组成结构并改善其代谢途径而发挥功效。     

基于16S rDNA和GC-MS技术研究胡黄连治疗便秘小鼠的作用机制

研究胡黄连对便秘模型小鼠肠道菌群和代谢产物的影响。将ICR小鼠分为空白组、模型组以及胡黄连高、中、低剂量组,应用盐酸洛哌丁胺对模型组和胡黄连各组造模,造模成功后,胡黄连高、中、低剂量组给予相应剂量药物灌胃给药7 d,测量各组小鼠首次黑便时间、3 h粪便总量、粪便含水率及肠道推进率;HE染色观察肠道黏膜情况;16S rDNA检测结肠内容物菌群变化;气相色谱-质谱(GC-MS)技术检测粪便代谢物变化。结果显示,模型组小鼠首次黑便时间显著延长,3 h粪便质量、粪便含水率及肠道推进率均显著减少,结肠组织可见明显炎性细胞浸润,肠道菌群及粪便代谢物呈现显著变化。胡黄连干预可显著改善便秘症状,修复肠道黏膜,部分恢复便秘小鼠肠道菌群及代谢物的组成。肠道菌群测序显示,胡黄连可以显著降低厚壁菌门/拟杆菌门比值,降低Lactobacillus相对丰度,增加肠道Muribaculaceae、Enterorhabdus、Eggerthellaceae相对丰度,线性判别分析(linear discriminant analysis effect size, LEfSe)软件测得胡黄连组优势菌种包括Muribacu...     

基于16S rDNA高通量测序研究针灸对克罗恩病大鼠肠道菌群的调节作用

目的：采用16S rDNA高通量测序技术分析针灸对克罗恩病（CD）大鼠肠道菌群物种相对丰度和多样性的影响,探讨针灸对克罗恩病的作用机制。方法：将40只SD大鼠随机分为正常组、模型组、隔药饼灸组、电针组和西药组,每组8只。采用2,4,6-三硝基苯磺酸溶液灌肠4周构建CD大鼠模型,隔药饼灸组和电针组选取天枢（双侧）、气海穴进行干预,西药组采用柳氮磺吡啶溶液灌胃干预。干预结束后取结肠组织进行HE染色,收取大鼠粪便进行16S rDNA高通量测序并对进行物种相对丰度、alpha多样性和基因功能代谢预测分析等。结果：隔药饼灸组和电针组大鼠结肠组织病理学评分显著低于模型组（P<0.01）。与正常组比较,模型组拟杆菌门、放线菌门、拟杆菌纲、拟杆菌目、紫单胞菌科、普雷沃菌科、拟杆菌科、普雷沃菌属等的相对丰度升高,厚壁菌门、变形菌门、梭菌纲、梭菌目、毛螺菌科、瘤胃菌科、乳酸杆菌属等的相对丰度降低;在经过隔药饼灸和电针治疗后,上述大多数微生物相对丰度均有不同程度改善。与正常组比较,模型组肠道菌群的Chao1、Observed species、Shannon、Simpson等alpha多样性指数均显著下降（P<0.05）;与模型组比较,隔药饼灸组和电针组上述指数均显著升高（P<0.05）。功能预测分析发现隔药饼灸和电针均能调节参与碳水化合物代谢、氨基酸代谢等的功能基因。结论：CD与肠道菌群结构变化有关,针灸能够调节CD大鼠肠道菌群物种相对丰度和菌群多样性。     

基于尿液代谢组学的二神丸中补骨脂、肉豆蔻炮制增效作用的机理研究

目的运用代谢组学方法研究二神丸中补骨脂、肉豆蔻炮制前后对脾肾阳虚泄泻大鼠尿液内源性代谢物的影响,探讨二神丸中补骨脂、肉豆蔻炮制增效机制。方法以脾肾阳虚泄泻模型大鼠为研究对象,运用气相色谱-质谱联用(GC-MS)采集大鼠尿液代谢图谱,利用主成分分析(PCA)和偏最小二乘判别式分析(PLS-DA)方法分析二神丸对脾肾阳虚泄泻大鼠尿液内源性代谢物的影响。结果二神丸对脾肾阳虚泄泻模型大鼠的丙氨酸、甘氨酸、琥珀酸、缬氨酸、脯氨酸、蛋氨酸、马尿酸、苯丙氨酸、棕榈酸、肉豆蔻酸和酪氨酸11种相关标志物具有不同程度的干预作用,尤以二神丸Ⅳ组(盐炙补骨脂+麸煨肉豆蔻)干预效果最佳。结论二神丸中补骨脂、肉豆蔻炮制增效作用可能与改善氨基酸、脂类以及能量代谢,调节肠道菌群等有关。     

基于16S rDNA测序技术的自发性高血压大鼠肠道菌群结构变化及中药干预作用

目的分析自发性高血压大鼠(SHR)肠道菌群结构特征,初步探讨中药黄连解毒汤(HLJDD)干预作用影响。方法 12周龄雄性SHR随机分模型组(M组)、HLJDD组(H组),同周龄雄性Wistar大鼠为正常对照组(W组),每组各4只。空白对照组及模型组常规饲养,HLJDD组按0.027 g/(kg·d)灌胃给药,每天给药1次,连续给药6周。干预结束后,取出盲肠内容物(新鲜粪便),采用16S rDNA高通量测序并进行生物信息学分析。结果 3组大鼠肠道微生物测序覆盖度在0.997以上,从属水平分析3组大鼠物种丰度聚类分布于4个优势的细菌门:27个属于厚壁菌门类(Firmicutes)、4个属于拟杆菌门类(Bacteroidetes)、3个属于变形菌门类(Proteobacteria)和1个属于疣微菌门类(Verrucomicrobia)门类细菌;Simpson指数表明,模型组大鼠肠道菌群多样性降低,HLJDD组大鼠肠道菌群多样性高于模型组;3组大鼠肠道菌群微生物群落结构在门水平上主要由厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)和变形菌门(Proteobacteria)组成,其中模型组厚壁菌门(Firmicutes)相对丰度增加,HLJDD组大鼠肠道菌群厚壁菌门(Firmicutes)的相对丰度低于模型组;3组大鼠肠道菌群微生物群落结构在属水平上主要由乳酸杆菌属(Lactobacillus)、肠球菌属(Enterococcus)、大肠志贺氏杆菌属(Escherichia Shigella)组成,其中益生菌乳酸杆菌属(Lactobacillus)相对丰度在模型组明显降低,HLJDD组大鼠肠道菌群乳酸杆菌属相对丰度高于模型组。结论 SHR肠道菌群结构失于平衡状态,菌群多样性有一定程度下降,HLJDD可能通过增加SHR菌群多样性、降低SHR致病菌厚壁菌门(Firmicutes)的相对丰度、升高SHR益生菌乳酸杆菌属相对丰度达到对抗高血压的作用,尚需扩大样本量进一步进行验证。     

基于血浆非靶向代谢组学和肠道菌群16S rRNA测序技术探讨养心通脉方干预冠心病血瘀证大鼠的作用机制（英文）

目的 探讨肠道菌群和血浆代谢物与冠心病血瘀证的关联性,及养心通脉方干预冠心病血瘀证的作用机制。方法 18只SPF级雄性SD大鼠建立冠心病血瘀证模型后,随机分为模型组、养心通脉方组和阿托伐他汀钙组,每组各6只,灌胃干预2周。另取6只一直正常饮食的大鼠作为正常对照组。苏木精-伊红染色法（HE）染色观察大鼠冠状动脉病理变化及检测心电图、血流变和血脂生化指标,液相色谱-串联质谱联用技术（LCMS/MS）技术分析大鼠血浆非靶向代谢组学,16S r RNA测序技术分析回肠黏膜菌群以及对两者代谢组学进行相关性分析。结果 与正常组相比,模型组大鼠全血黏度、总胆固醇酯和低密度脂蛋白胆固醇酯均显著升高（P <0.05）;模型组冠状动脉内皮细胞增生破坏,内皮下有大量空泡状改变,药物组冠状动脉内皮病变程度减轻。LCMS/MS结果共筛选鉴定出血清33种潜在内源性代谢物,其中1-甲基组氨酸、N-乙酰组胺、黄体酮和脱氧皮质酮可能成为冠心病血瘀证疾病模型的差异性代谢物,16S r RNA结果显示养心通脉方组肠道菌群的多样性和丰富度有所改善,通过相关性分析,与冠心病血瘀证高度相关的变形杆菌门Hydrogenoph...     

金复康对大鼠大肠癌癌前病变的改善作用及尿液代谢物研究

目的：考察二甲肼诱发大肠癌癌前病变大鼠的尿液中内源性小分子代谢物谱的变化过程，以及中药金复康干预下大鼠代谢谱的变化过程。方法：利用基于氯甲酸乙酯衍生、GC-MS技术的代谢组学方法。结果：经主成分分析表明，模型组大鼠的代谢谱具有随时间逐步偏离起始点的趋势，而金复康干预组大鼠的代谢谱则表现出先偏离再回归起始点的代谢谱变化轨迹，正常组大鼠的代谢谱在实验过程中没有出现明显的变化。对影响模型组大鼠与正常组大鼠代谢谱分离的权重变量进行鉴定和研究，发现三羧酸循环、色氨酸循环、多胺代谢等代谢通道的波动，以及肠道菌群代谢的紊乱与二甲肼诱导的大肠癌癌前病变相关。结论：代谢组学研究表明，金复康能有效逆转二甲肼诱导的大肠癌癌前病变大鼠的代谢谱的偏移，代谢组学的研究结果与病理实验结果相一致。     

中药调节肠道菌群防治慢性心力衰竭的研究概述

总结中药以肠道菌群为靶点治疗疾病的机制与优势,并着重阐述中药调节肠道群防治慢性心力衰竭的机制。中药以肠道菌群为靶点治疗疾病的机制包括改善肠道微环境、纠正肠道菌群失调状态、调节肠道菌群代谢等,优势为多渠道、多靶点和整体调节。中药调节肠道菌群防治慢性心力衰竭的机制包括：增加有益菌相对丰度,降低致病菌相对丰度,改善肠道菌群的组成,维持肠道屏障功能,以及调节短链脂肪酸、胆汁酸、氧化三甲胺等心血管相关活性物质的代谢等。中药通过调节肠道菌群可达到减轻心肌炎症反应,逆转心室重构,改善心功能,缓解临床症状,延缓慢性心力衰竭进展的作用。     

五加生化胶囊干预气虚血瘀证的GC-MS代谢组学研究

目的:采用代谢组学的方法,观察五加生化胶囊对气虚血瘀证的干预作用和相关作用机制。方法:运用GC-MS代谢组学方法,对大鼠血浆内源性代谢物进行测定。结果:基于GC-MS代谢组学方法定性鉴别出14种潜在生物标记物,五加生化胶囊对这些标记物均有回调作用。结论:五加生化胶囊能回调气虚血瘀证14个潜在生物标记物的含量。经初步生物学意义分析,推测五加生化胶囊通过调节能量代谢,三羧酸循环,氨基酸代谢来发挥治疗作用。     

葛根芩连汤干预胰岛素抵抗大鼠的粪便代谢组及相关菌群研究

目的从代谢组学及肠道菌群角度探讨葛根芩连汤干预胰岛素抵抗（IR）大鼠肠道代谢紊乱的作用机 制。方法将雄性SD 大鼠随机分成正常组、模型组及葛根芩连汤低、中、高剂量（1.65、4.96、14.86 g·kg-1）组。 采用高脂饲料喂养12 周建立IR 大鼠模型;模型复制成功后,连续灌胃给药16 周,每天1 次,同时继续以高 脂饲料喂养。给药结束后,采用超高效液相色谱-串联四级杆-飞行时间质谱（UHPLC/Q-TOF-MS）结合多元分 析的代谢组学技术对大鼠的粪便样品进行代谢轮廓分析,分析各组大鼠粪便内源性代谢物的变化,鉴定潜在 的生物标记物并进行生物学意义分析。对粪便样品进行16S rRNA V3~V4 区域测序,通过两部分模型（Twopart model）对生物标记物与肠道菌群进行关联性分析。结果筛选和鉴定出5 个潜在生物标记物：咪唑丙酸、 吲哚丙烯酸、二十碳四烯酸、二十四碳六烯酸及十二烷二酸;与模型组比较,葛根芩连汤低剂量组的十二烷 二酸含量明显增加（P＜0.05）,二十四碳六烯酸含量明显减少（P＜0.05）。肠道菌群关联分析结果显示,二十碳 四烯酸和十二烷二酸共关联到5 个肠道菌群操作分类单元（OTU）,涉及到的肠道菌群为厚壁菌门和拟杆菌门, 其中厚壁菌门消化链球菌科Romboutsia 属为二者所共有,其余OTU 为十二烷二酸特有;另外3 个生物标记物 未关联到相关肠道菌群。结论葛根芩连汤对高脂诱导的IR 大鼠的预防作用可能与其改善肠道中内源性代谢 物及相关肠道菌群的水平,恢复体内正常代谢活动有关。     

金复康对大鼠大肠癌癌前病变的改善作用及尿液代谢物研究

目的：考察二甲肼诱发大肠癌癌前病变大鼠的尿液中内源性小分子代谢物谱的变化过程，以及中药金复康干预下大鼠代谢谱的变化过程。方法：利用基于氯甲酸乙酯衍生、GCMS技术的代谢组学方法。结果：经主成分分析表明，模型组大鼠的代谢谱具有随时间逐步偏离起始点的趋势，而金复康干预组大鼠的代谢谱则表现出先偏离再回归起始点的代谢谱变化轨迹，正常组大鼠的代谢谱在实验过程中没有出现明显的变化。对影响模型组大鼠与正常组大鼠代谢谱分离的权重变量进行鉴定和研究，发现三羧酸循环、色氨酸循环、多胺代谢等代谢通道的波动，以及肠道菌群代谢的紊乱与二甲肼诱导的大肠癌癌前病变相关。结论：代谢组学研究表明，金复康能有效逆转二甲肼诱导的大肠癌癌前病变大鼠的代谢谱的偏移，代谢组学的研究结果与病理实验结果相一致。     

复方贞术调脂方对老龄小鼠肠道组织内源性代谢物的干预作用研究

目的:运用代谢组学方法探讨复方贞术调脂方对自然衰老C57BL/6小鼠肠道组织中内源性代谢物的影响。方法:C57BL/6雌性小鼠分为3组,包括青年组(2月龄)、老龄组(24月龄)和复方贞术调脂方给药组。采用超高效液相色谱-飞行时间质谱(UPLC-Q-TOF/MS)联用技术对3组小鼠肠道内源性代谢物进行检测。结果:3组小鼠的肠道组织中共鉴定出16个与衰老相关的差异代谢物。给药后,13个差异代谢物发现有显著性向青年组调节的趋势,经过对差异代谢物的分析,发现属于肠道组织化学成分的脂质和属于肠道分泌物的胆汁酸的代谢产物发生了变化。结论:老龄小鼠肠道组织的脂质和胆汁酸代谢明显异常,复方贞术调脂方可能通过调节脂质和胆汁酸代谢,从而发挥延缓肠道衰老的作用。     

基于肠道菌群和代谢组学探索糖尿病肾病中医湿证生物学特征

目的 探讨糖尿病肾脏病（DKD）中医湿证的差异肠道菌群、潜在生物标志物及代谢通路。方法 选择2017年1月—2019年12月储存在广东省中医院生物资源库的中医诊断为湿证的DKD患者的粪便标本和血清标本，应用16s RNA高通量测序和液相色谱-质谱法（LC-MS）检测DKD不同湿证亚型（湿热证、水湿证、湿浊证）患者之间的差异肠道菌群和血清代谢物，探索与湿证亚型相关的代谢通路，并将肠道微生物与代谢组学相结合，探讨肠道菌群和血清代谢物的关联性。结果 研究共纳入41例DKD患者的粪便和血清标本，其中湿热证21例，水湿证13例，湿浊证7例；肠道微生物结果显示：水湿证和湿浊证的差异肠道菌群有7种，湿浊证和湿热证有13种，水湿证和湿热证有4种。代谢组学结果提示：DKD湿浊证和湿热证的差异血清代谢物有8种，主要富集在苯丙氨酸代谢和泛醌和其他萜类醌生物合成通路（P<0.05）；水湿证和湿热证有27种，主要富集在嘌呤代谢通路和缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸生物合成通路；水湿证和湿浊证有16种，主要富集在α-亚麻酸代谢通路（P<0.05）。肠道菌群与代谢组学关联分析显示：共有46种差异血清代谢物与差异...     

柴芩宁神颗粒改善失眠大鼠睡眠作用的海马代谢组学研究北大核心CSCD

该研究采用超高效液相色谱-四极杆-静电场轨道阱高分辨质谱(UHPLC-Q Exactive Orbitrap-MS)代谢组学技术分析柴芩宁神颗粒对肝郁失眠大鼠内源性代谢物的影响,探讨柴芩宁神颗粒改善睡眠的作用机制。采用腹腔注射对氯苯丙氨酸(PCPA)加复合刺激复制肝郁失眠大鼠模型,观察柴芩宁神颗粒对肝郁失眠大鼠宏观体征、血液流变学和海马中神经递质的影响。给药结束取大鼠海马进行LC-MS代谢组学检测,以主成分分析(PCA)、偏最小二乘法判别分析(PLS-DA)及正交偏最小二乘法判别分析(OPLS-DA)等多元统计分析方法为手段,对各组大鼠海马代谢物进行分析,筛选出潜在生物标志物,并借助MetPA分析构建相关的代谢通路和代谢网络。研究结果表明,在给予药物治疗后,能显著改善大鼠的精神状态和肝郁血瘀现象,可以显著升高海马中除柴芩宁神颗粒低剂量组外其余各组中5-HT、GABA的含量和显著降低Glu的含量,其中艾司唑仑组和柴芩宁神颗粒高剂量组的效果优于其他给药组;代谢组学结果显示,通过代谢分析共筛选鉴定出27种与失眠相关的潜在生物标志物,并通过MetPA分析得到艾司唑仑干预失眠的代谢通路4条,柴芩宁神颗粒高剂量干预失眠的代谢通路3条,涉及嘌呤代谢、甘油磷脂代谢、组氨酸代谢、咖啡因代谢。柴芩宁神颗粒对改善失眠有一定的疗效,其可通过回调内源性差异代谢物来调控相关代谢通路,为进一步阐明柴芩宁神颗粒改善睡眠的作用机制提供依据。     

基于肠道菌群测序和粪便代谢组学的荆防颗粒保护急性肺损伤机制研究

为了阐明荆防颗粒治疗急性肺损伤的效果及作用机制,并考察荆防颗粒对急性肺损伤粪便内源性代谢物代谢紊乱和肠道菌群稳态的调控作用,将小鼠随机分为假手术组、模型组、荆防颗粒组,造模后持续给药6 d。利用超高效液相色谱-四极杆/静电场轨道阱高分辨质谱联用仪(UHPLC-HESI-QE-Orbitrap-MS/MS)代谢组学技术和16S rRNA高通量测序技术,测定小鼠肠道中内源性小分子物质和肠道菌群的变化,并寻找出潜在的生物标志物。结果显示,荆防颗粒可以对11个生物标志物L-谷氨酸、琥珀酸、花生四烯酸、亚油酸、亚麻酸、苯丙氨酸、鞘氨醇、丁酸、丙酮酸、色氨酸、棕榈酸进行调控。对这11个生物标志物通过在线软件MetaboAnalyst进行代谢通路分析,得到潜在的主要代谢通路,其中共有10条代谢通路与荆防颗粒治疗急性肺损伤密切相关,包括丙氨酸、天门冬氨酸和谷氨酸代谢,氨基酰基tRNA生物合成,三羧酸循环,乙醛酸及二羧酸代谢,精氨酸和脯氨酸代谢,亚油酸和亚麻酸代谢,氮代谢,谷氨酰胺和D-谷氨酸代谢,苯丙氨酸、酪氨酸和色氨酸的生物合成,苯丙氨酸代谢。肠道菌群结果显示显著性差异菌主要有Bacteroides...