基于网络药理学的苏叶黄连汤治疗慢性肾衰竭机制研究

目的:采用网络药理学方法对苏叶黄连汤治疗慢性肾衰竭(CRF)的物质基础和作用机制进行探析。方法:运用网络数据库对苏叶黄连汤有效成分及其靶点和CRF疾病靶点进行筛选搜集。利用Cytoscape3.7.2软件,构建中药成分-靶点网络。利用网络数据库构建苏叶黄连汤治疗CRF的蛋白质相互作用(PPI)网络,并拓扑分析出核心靶点。最后对"药物-疾病"交集靶点进行富集分析。结果:苏叶黄连汤包含26个有效成分,对应靶点484个;核心靶点涉及表皮生长因子受体(EGFR)、白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、转录因子AP-1(JUN)、72 kDAIV型胶原酶(MMP2)、雄激素受体(AR);主要生物学过程及通路有:血管平滑肌细胞增殖的正调控、溶血磷脂通路、糖尿病并发症中的糖基化终末产物及受体(AGE-RAGE)信号通路等,共7条通路,其中聚集在血管平滑肌细胞增殖正调控通路的靶点最多。结论:苏叶黄连汤治疗CRF的机制复杂,可能主要通过对血管平滑肌细胞增殖的正调控来实现治疗目的,也提示该通路是未来研究苏叶黄连汤治疗CRF的重要方向。     

基于网络药理学和分子对接探讨真武汤治疗慢性肾衰竭的作用机制

目的:利用网络药理学和分子对接方法探讨真武汤治疗慢性肾衰竭( CRF)的作用机制.方法:采用TCMSP数据库筛选真武汤中有效成分及靶点,并将靶点导入Uniprot数据库匹配基因名.利用OMIM、Drugbank、Genecards、CTD数据库筛选CRF靶点并与真武汤靶点取交集.将交集靶点导入STRING数据库进行PP...     

大黄组方治疗慢性肾衰竭临床观察

慢性肾衰竭(CRF)是所有肾脏疾病的最终表现,如何进行有效治疗是我们研究的热点.我们采用大黄组方内服出和保留灌肠治疗38例患者,取得满意疗效.现报道如下.     

大黄联合爱西特治疗慢性肾衰竭

慢性肾衰竭(CRF)发展至终末期,主要靠腹透、血透、肾移植等方法治疗,费用昂贵.故探讨对CRF早、中期的药物治疗非常重要.我院近年来应用大黄联合爱西特治疗CRF,取得较好的疗效,现报告如下.     

基于网络药理学及分子对接探讨"藿香-佩兰-大黄"角药治疗慢性肾衰竭的作用机制

目的 通过网络药理学和分子对接探析角药"藿香-佩兰-大黄"治疗慢性肾衰竭(CRF)的核心成分、核心靶点、关键通路及其作用机制.方法 通过TCMSP数据库获取"藿香-佩兰-大黄"角药的药物活性成分和作用靶点,并进行筛选.疾病靶点通过Gencards、Drugbank和TTD数据库检索,Uniprot数据基因名称通过Uni...     

大黄治疗慢性肾衰竭临床应用及炮制研究

概述大黄治疗慢性肾衰竭的作用机制、含大黄中成药治疗慢性肾衰竭的临床应用、不同大黄炮制品治疗慢性肾衰竭的临床经验、大黄不同炮制品的药性特点及临床运用、大黄不同煎煮时间对有效成分的影响,研究大黄治疗慢性肾衰竭的作用机制,为合理使用大黄提供理论依据。     

基于网络药理学和分子对接预测大黄治疗胃癌的作用机制

目的 通过网络药理学和分子对接方法探讨大黄在胃癌中的抗肿瘤机制。方法 通过TCMSP网站收集大黄的活性成分及对应的靶点,利用肿瘤与癌症基因组图谱（TCGA）数据库、GeneCards网站得到胃癌相关基因,两者取交集,利用Cytoscape软件绘制胃癌-大黄-活性成分-靶点的网络图。通过Metascape网站对交集靶点进行功能、同路富集分析以及蛋白-蛋白相互作用网络分析,利用MCODE算法确定关键基因簇,最后利用分子对接方法找到可能的作用靶点。结果 通过筛选得到大黄的主要活性成分16个,共获得46个治疗胃癌的潜在靶点,京都基因和基因组数据库（KEGG）通路、基因本体论（GO）分类富集分析结果显示,大黄治疗胃癌的机制涉及多个生物学过程,包括凋亡、程序性细胞死亡、MAPK通路调节、细胞周期、PI3K-Akt等信号通路。蛋白-蛋白互作后发现关键基因簇包括BCL2、CASP8、AR、IL1B、CASP3、PRKCA、TP53、CDKN1A、PCNA,主要为凋亡相关基因,进一步分子对接验证了其与对应活性成分之间亲合度均较高,其中PKCNA与芦荟大黄素亲合度最高。结论 大黄治疗胃癌通过多成分、多靶点...     

基于网络药理学探讨真武汤治疗慢性心力衰竭作用机制

目的基于网络药理学探讨真武汤治疗慢性心力衰竭(Chronic Heart Failure,CHF)的作用机制。方法通过中药系统药理学数据库(TCMSP)筛选出真武汤的有效成分及作用靶点的相关信息;使用Genecard查找与CHF相关的疾病靶点;使用R及Venn Diagram得到药物与疾病相互作用的靶点;使用Cytoscape 3.6.1软件构建"药物-成分-靶点-疾病"网络图;用String构建PPI蛋白网络互作图;对预测靶点进行基因本体(GO)功能富集分析、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果真武汤的药物有效成分59种,作用于CHF的分子24个,靶标48个,富集到92个基因功能,代谢通路85条。结论真武汤中治疗慢性心力衰竭的主要成分包括甾醇类、芍药苷类、常春藤苷、山奈酚及儿茶酚胺等。主要作用于IL-6、MAPK8、CASP3、Re LA、ESR1等靶点,主要通过辅因子结合(cofactor binding)、核受体活性(nuclear receptor activity)、类固醇激素受体(steroid hormone receptor activity)、神经递质受体活性(neurotransmitter receptor activity)、类固醇结合(steroid binding)等功能作用于流体剪切力与动脉粥样硬化、肿瘤坏死因子信号通路、细胞凋亡、白介素-17、NF-κB、p53、卵巢类固醇生成等相关通路。真武汤通过多有效成分、多靶点、多生物途径及多通路方式协同抗心力衰竭。其结果需要通过实验进一步论证。     

基于网络药理学探讨黄芪治疗慢性心力衰竭作用机制

目的基于网络药理学探讨黄芪治疗慢性心力衰竭可能的作用机制。方法运用中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)与文献挖掘获取黄芪的有效化学成分及作用靶点。在GeneCards、OMIM数据库搜索慢性心力衰竭的靶点。采用Cytoscape 3.2.1软件构建黄芪活性成分-CHF-靶点网络模型。运用String数据库构建蛋白质间相互作用网络。借助DAVID在线工具进行疾病-药物交集靶基因的基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果通过筛选得到黄芪21个化学成分,黄芪治疗慢性心力衰竭的预测靶点有145个。网络分析结果表明,得出黄芪主要涉及RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、对炎症细胞因子的反应、过氧化氢的合成、调节平滑肌收缩等生物过程,通过调节肿瘤坏死因子、细胞凋亡、Toll样受体、分裂原激活的蛋白激酶(MAPK)等主要信号通路来发挥治疗慢性心力衰竭的作用。结论通过网络药理学方法初步揭示了黄芪治疗慢性心力衰竭的多成分、多靶点、多通路的作用机制,为黄芪的实验研究和临床应用提供了科学依据。     

基于网络药理学研究逍遥散治疗慢性乙型肝炎的作用机制

目的 利用网络药理学方法,从整体角度系统分析并预测逍遥散治疗慢性乙型肝炎(CHB)的分子机制,为临床研究及新药研发提供参考。方法 检索TCMSP数据库获取逍遥散的活性成分及其相关靶点,并根据口服利用度(OB)和类药性(DL)对活性成分进行筛选。在GeneCards、OMIM数据库中筛选CHB的相关靶点,并与活性成分的靶点取交集,获得逍遥散治疗CHB的潜在作用靶点。在STRING数据库中获得各靶点的相互作用关系,利用Cytoscape 3.8.0软件构建逍遥散-有效活性成分-潜在作用靶点网络及靶点的蛋白互作网络,并进行拓扑结构分析,筛选核心靶点。在R 3.6.2软件中进行潜在作用靶点的基因富集分析。运用BioGPS数据库对靶点进行器官定位。结果 通过网络构建及拓扑结构分析发现,逍遥散主要通过113个有效活性成分干预155个潜在靶点来治疗CHB,有效活性成分中以槲皮素、木犀草素等黄酮类成分为主,核心靶点为ESR1、CDK2、RXRA、RELA、AKT1、MAPK14、MAPK1等。基因富集分析显示逍遥散主要通过干预氧化应激相关生物学过程及调控PI3K-Akt、MAPK等信号通路,发挥治疗C...     

论大黄在慢性肾衰竭中应用

慢性肾衰竭是慢性肾脏病的终末期阶段,是以病程长、症状繁多、病情复杂为主的临床综合征。近年来,慢性肾衰竭患者发病率不断增加,肾脏疾病已经成为严重危害人类健康与生命的疾病之一。传统中药经验理论丰富、效果力专,且安全性高、不良反应少,现代医学对大黄的研究一直成为焦点。中药大黄作为通腑泄浊之要药,又有下瘀血、主寒热、破症瘕积聚、推陈致新、安和五脏之效。临证治疗慢性肾衰竭时,常以大黄为切入点,通过查阅相关文献,主要从药物功用、炮制之品、名医名家经验、改善肠道菌群、多途径治疗（中成药、保留灌肠、结肠透析、穴位贴敷、中药离子导入、药浴、足浴）等方面对大黄治疗慢性肾衰竭的研究概况进行简要归纳,并总结不足,展望其研究前景,以期明确获得药用角色和配伍使用。     

基于网络药理学探究肉桂治疗慢性肾脏病的作用机制

目的:采用网络药理学方法建立"药效成分-疾病靶标-生物学通路"之间的关系,筛选肉桂治疗慢性肾脏病的作用靶点,明确其作用机制。方法:采用中药系统药理学成分分析平台(BATMAN-TCM)数据库获得肉桂的活性化合物,利用PubChem数据库,获取化合物的SMILES结构,将SMILES结构导入SwissTargetPrediction平台,预测活性成分的潜在靶点,再通过GeneCards数据库获得相关化合物靶点,取两者交集得到肉桂作用靶点。通过TTD、DrugBank、OMIM、GAD、DisGeNET数据库获得CKD疾病相关靶点,并与肉桂作用靶点取交集。利用STRING数据库及Cytoscape3.2.1软件构建靶点相互作用网络图,并利用cytoHubba插件的MCC算法筛选关键靶点;基于DAVID数据库对靶点进行GO富集和KEGG富集分析。结果:共得到肉桂活性化合物18个,肉桂-CKD交集靶点29个。经过MCC算法筛选得到关键基因10个,包括雌激素受体alpha、人环加氧酶1、表皮生长因子受体、血管内皮生长因子受体、基质金属蛋白酶9、基质金属蛋白酶2、成纤维细胞生长因子受体1、丝氨酸蛋白酶抑制剂-1、DNA多聚酶B、多药耐药性蛋白1、B细胞淋巴瘤/白血病-2。GO富集共118个结果,主要包括细胞对缺氧的反应、丝裂原活化蛋白激酶活性的正调节、血管生成的正调节、炎症反应、磷脂酶C活性的正调节、蛋白自体磷酸化、对白细胞介素-1的细胞反应、血管内皮生长因子受体信号通路的正调节等。KEGG富集相关通路共51条,包括NF-кB信号通路、PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路、Ras信号通路、Rap1信号通路等。结论:通过网络药理学初步预测肉桂在慢性肾脏病治疗中改善糖脂代谢与胰岛素抵抗、抗氧化、抗炎与免疫调节、抗凝、促进成血管生成、改善组织局部血供等潜在作用机制,为下一步研究提供理论依据。     

大黄复方煎保留灌肠治疗慢性肾衰竭疗效观察

目的:探寻CRF非透析的中医替代治疗方法.方法:大黄复方煎保留灌肠治疗CRF 47例,结果:显效29例(氮质血症28例,尿毒症1例),有效15例(氮质血症11例,尿毒症4例),总有效率91%.结论:大黄复方煎灌肠方是理想的CRF非透析的替代治疗方,疗效肯定,无明显副作用.     

基于网络药理学探索真武汤治疗慢性心力衰竭作用机制研究

目的使用网络药理学的研究方法对真武汤治疗慢性心力衰竭的作用机制进行研究探讨。方法在中药系统药理学数据库及分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)筛选真武汤的活性化合物成分,运用Perl编程语言以及通用蛋白(Universal Protein,uniprot)数据库得到真武汤的基因靶点;在GeneCards数据库检索和筛选慢性心力衰竭相关疾病基因靶点进行检索,使用R语言筛选出共同的靶点并构建韦恩图;应用Cytoscape 3.7.1软件构建"活性成分-靶点"网络图;将共同靶点输入功能蛋白关联网络STRING数据库,获得蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络模型;使用R语言对"活性成分-靶点"相互作用网络图中的核心靶点基因进行基因本体论(gene ontology,GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。结果预测得到真武汤活性化合物成分中51种以及潜在靶点381个;得到慢性心力衰竭疾病相关靶点980个,得到真武汤-慢性心力衰竭共同靶点20个,度值较高的活性成分包括β-谷甾醇(β-sitosterol)、山柰酚(kaempferol)、石防风素(deltoin)等,度值较高的靶点蛋白包括前列腺素内过氧化合物合酶(PTGS1)、核受体亚家族3组C成员2(NR3C2)、毒蕈碱型乙酰胆碱受体亚型3(CHRM3)、乙酰胆碱酯酶(ACHE)等;PPI网络中的核心基因包括白细胞介素-6(IL-6)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白水解酶-3(CASP3)、丝裂原活化蛋白激酶-8(MAPK8)、细胞间黏附分子-1(ICAM1)、过氧化物酶体增生激活受体γ(PPARG)等;共同作用靶点主要富集于21种生物功能与61条信号通路上。结论通过运用网络药理学的研究方法我们发现真武汤治疗慢性心力衰竭具有多靶点、多通路的特点,从抑制炎症反应、调节免疫功能及调控细胞凋亡等多个机制治疗慢性心力衰竭。     

基于脑肠轴及网络药理学探究大黄治疗卒中后抑郁机制

<正>卒中后抑郁(post-stroke depression,PSD)是脑卒中后最常见的一种精神障碍,表现为一系列显著而持久的以情绪低落、消极悲观、兴趣缺失为主要特征的情感障碍综合征^[1]。PSD患者卒中复发时间较无抑郁患者可提前8年^[2],进一步加重了家庭和社会的负担。卒中之痰热腑实证治疗以清热化痰、通腑开窍为主,常用承气汤配合开窍药加减。《神农本草经》言大黄：“主下瘀血,血闭,寒热,破癥瘕积聚、留饮宿食,荡涤肠胃,推陈致新。”恰应痰热腑实的病机特点。现代研究表明,大黄素及大黄素甲醚可改善抑郁症模型大鼠行为学变化,     

基于网络药理学探究大黄-苦杏仁药对治疗克罗恩病的作用机制

目的:探讨大黄-苦杏仁药对治疗克罗恩病(crohn's disease,CD)的作用机制。方法:借助TCMSP数据库检索中药大黄、苦杏仁的化学成分和作用靶点,通过UniProt、Malacards和PubMed等数据库查询疾病靶点,进而运用Cytoscape 3.2.1软件构建成分-靶点网络,通过DAVID数据库进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,探究其作用机制。结果:共筛选出46个活性成分,其中OB值(Oral bioavailability)≥30%的活性成分14个(大黄4个,苦杏仁10个),其中12个活性成分参与作用靶点的一级交互网络构建。活性成分的直接作用靶点共4个,分别为白介素-10(IL-10)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、信号传导与转录激活因子3(STAT-3)、半胱氨酸蛋白酶CPP32(Caspase-3)。KEGG通路富集筛选涉及Th1、Th2、Th17及调节性T细胞(Treg cell),信号通路包括Toll样受体通路、JAK-STAT通路。结论:大黄-苦杏仁药对可通过多成分、多靶点、多通路治疗CD,其作用的物质基础及机制仍需深入发掘。     

牛膝防治慢性牙周炎机制的网络药理学研究

目的 用网络药理学方法 研究牛膝防治慢性牙周炎(chronic periodontitis,CP)的主要活性成分,以及分析其潜在分子机制和药理活性.方法 在TCMSP数据库获取牛膝的主要化学成分及作用靶点,从Genecards等数据库搜索CP疾病靶点,通过韦恩分析获得交集靶点.构建牛膝防治CP的"成分-靶点"网络,并利...     

基于网络药理学探究黄芩治疗慢性鼻窦炎的潜在作用机制

目的 运用网络药理学探究黄芩治疗慢性鼻窦炎的潜在作用机制。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systematic pharmacology database and analysis platform, TCMSP)、中医药整合药理学研究平台(integrative pharmacology-based research platform of traditional Chinese medicine, TCMIP)和中药分子机制生物信息学分析工具(bioinformatics analysis tool for molecular mechanism of traditional Chinese medicine, BATMAN-TCM)筛选出黄芩的活性成分;利用Swiss Target Prediction数据库收集黄芩活性成分的靶点;利用GeneCards、在线人类孟德尔遗传(online Mendelian inheritance in man, OMIM)、gharmGKB和DrugBank数据库筛选“慢性鼻窦...     

复方大黄栓剂治疗慢性肾衰竭45例临床疗效观察

目的:观察复方大黄栓剂治疗早、中期慢性肾衰竭的临床疗效。方法:80例早、中期慢性肾衰竭患者随机分为两组,对照组35例,治疗组45例。所有患者均采用优质低蛋白、低磷饮食,密切监测患者血压并控制在较理想水平,纠正水、电解质及酸碱平衡紊乱。对照组在上述基础上予以尿毒清冲剂治疗,治疗组予以复方大黄栓剂治疗,疗程为2个月。2个月后观察两组患者治疗前后症状、体征的变化并检测血肌酐(Scr)、尿素氮(BUN)。结果:对照组治疗后总有效率为77.1%,治疗组治疗后总有效率为92.5%,两组患者治疗后疗效经统计学分析有显著性差异(P<0.05)。治疗组治疗后Scr、BUN与治疗前和对照组治疗后比较有显著性差异(P<0.05)。结论:复方大黄栓剂通过降低血中的Scr、BUN,改善患者的肾功能,从而延缓慢性肾衰竭的进展,该药对于慢性肾衰竭早、中期患者疗效肯定。     

基于网络药理学探讨当归芍药散治疗慢性盆腔炎作用机制

目的基于网络药理学探讨当归芍药散治疗慢性盆腔炎的作用机制。方法利用TCMSP数据库筛选出当归芍药散活性成分及其相关靶标基因;使用Genecards数据库筛选慢性盆腔炎靶标基因;借助STRING在线数据库获取靶标基因相互作用关系;采用David数据库进行GO生物学过程分析和KEGG通路功能富集分析;利用cytoscape软件构建当归芍药散治疗慢性盆腔炎"活性成分-作用靶标-通路"网络。结果当归芍药散的核心活性成分有山示木酚、β-谷甾醇等,核心作用靶标有PTGS2、TNF、JUN等;GO生物学过程分析结果表明当归芍药散活性成分的基因功能主要表现在药物反应、RNA聚合酶II启动子转录的正调节、凋亡过程的负调节、信号转导等生物学过程; KEGG结果表明当归芍药散主要作用与TNF、Toll样受体等信号通路有关。结论当归芍药散活性成分山柰酚、β-谷甾醇等可能通过TNF、Toll样受体等信号通路作用于PTGS2、TNF-α、JUN、IL-6等关键靶标基因进而发挥其临床功效,达到治疗慢性盆腔炎等疾病的目的。