基于网络药理学和分子对接探讨丹栀逍遥散治疗失眠障碍的作用机制

目的:基于网络药理学和分子对接分析丹栀逍遥散治疗失眠障碍的相关成分、靶点及通路,探讨其作用机制.方法:检索TCMSP数据库,获取丹栀逍遥散中各药物的活性成分及其靶点,在UniProt数据库中规范靶点名;在GeneCards、OMIM、TTD3个数据库中检索失眠障碍相关基因,筛选复方与疾病的交集靶点,将其导入String数据库,导出蛋白互作关系,并使用CytoscapeV3.8.0构建疾病-药物-成分-靶点网络和核心蛋白互作网络;利用Metascape平台分别对交集靶点进行GO富集分析和KEGG通路富集分析;将核心成分与核心靶点进行分子对接验证.结果:共获得丹栀逍遥散活性成分102种,对应靶点147个,与失眠障碍交集靶点52个,其中核心成分12种,核心靶点7个;GO富集分析共得762条结果,其中主要涉及神经递质水平调节、肾上腺素受体活性以及突触膜的组成部分等;KEGG通路富集分析共获得61条通路,主要涉及:神经活性配体-受体相互作用通路;分子对接结果显示核心靶点与核心成分均能形成稳定结合.结论:初步获得丹栀逍遥散治疗失眠障碍的关键成分、关键靶点和关键通路,为临床使用和进一步研究提供参考.     

基于网络药理学和分子对接探讨黑骨藤追风活络胶囊治疗类风湿关节炎的作用机制

目的 基于网络药理学和分子对接探讨黑骨藤追风活络胶囊（HZC）治疗类风湿关节炎（RA）的作用机制。方法 通过ETCM数据库和文献查阅获得复方活性成分,运用Swiss Target Prediction平台进行靶点预测。用GeneCards、DisGeNET、OMIM数据库筛选RA相关靶点,绘制韦恩图获取药物和疾病交集靶点。采用STRING平台构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,利用Cytoscape3.9.1软件中centiscape2.2插件筛选潜在关键靶点。用DAVID数据库对关键靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析,用Cytoscape3.9.1软件绘制药物-活性成分-靶点-通路网络图。最后选取核心成分与核心靶点进行分子对接。结果 共筛选出32个有效成分,药物与疾病交集靶点91个,主要活性成分为槲皮素、盐酸青藤碱和杠柳苷元,核心靶点为肿瘤坏死因子（TNF）、信号转导与转录激活因子3(STAT3)、表皮生长因子受体（EGFR）。作用机制可能与HIF-1信号通路、TNF信号通路、PI3K-Akt信号通路、JAK-STAT信号通路等有关。分子对接显示主要活性成分与关键靶点具有很...     

基于网络药理学-分子对接技术探讨泽泻 抗炎作用的分子机制

摘要：目的：应用网络药理学方法及分子对接技术，探讨泽泻发挥抗炎作用的活性成分及其对应靶点和相关通路。方法：通过TCMSP筛选出泽泻的活性成分，运用SwissTarget Prediction 数据库预测活性成分相关靶标，同时采用GeneCards数据库得到炎症相关靶点，再将获得的活性成分靶点和炎症靶点导入VENNY2.1得到药物治疗疾病的潜在靶点；再运用STRING数据库、Cytoscape3.7.1软件构建简化后的药物治疗疾病的靶蛋白互作图（PPI）并筛选关键靶点。利用DAVID数据库对关键靶点进行GO功能富集分析和KEGG信号通路分析，再用Cytoscape3.7.1软件构建“化合物-靶点-通路”图并筛选核心成分与核心靶点。最后运用AutoDock Vina和Pymol将核心成分与核心靶点进行分子对接。结果：获得10个药物活性成分，得到相关潜在靶点284个，疾病潜在靶点11414个，药物治疗疾病的相关靶点260个，有SRC、HSP90AA1、PIK3CA、MAPK1、AKT1、LCK、FYN、JAK1、PLCG1、JAK1等关键靶点58个；涉及PI3K-Akt信号通路、ErbB信号通路、FoxO信号通路等133条通路。结论：泽泻发挥抗炎的作用机制可能是一方面通过调控PIK3、AKT、m-TOR等相关蛋白，激活PI3K-Akt信号通路，从而抑制细胞凋亡；另一方面可能通过调控EGFR相关蛋白，介导ErbB信号通路，从而干预炎症细胞生长。本研究基于网络药理学方法和分子对接技术，阐释了泽泻通过多种成分、多靶点、多信号通路发挥抗炎作用与机制，为该药的进一步研究提供了有益参考和科学依据。     

基于网络药理学和分子对接探究新风胶囊“异病同治”类风湿关节炎和骨关节炎作用机制

目的：分析新风胶囊（XFC）“异病同治”类风湿关节炎（RA）和骨关节炎（OA）的分子机制。方法：TCMSP数据库筛选XFC的活性成分及靶点,疾病数据库中筛选RA和OA的靶点,构建药物-成分-靶点网络。构建交集靶点的蛋白互作网络,进行功能富集分析和分子对接。绘制XFC治疗RA和OA信号通路。结果：共鉴定103种化合物和217个靶点,槲皮素、蜈蚣素、山柰酚、谷甾醇α1、芒柄花黄素、雷公藤甲素、豆甾醇、山海棠二萜内酯A等11个化合物与≥30个靶基因相关联,其中9个靶基因（STAT3、MAPK14、NR3C1、JUN、FOS、MYC、TNF、RELA和MAPK1）是网络中的核心靶基因。富集分析表明IL-17、TNF、Th17、Toll和NF-κB信号通路可能是关键信号通路。分子对接表明山海棠二萜内酯A、槲皮素、雷公藤甲素、谷甾醇α1、蜈蚣素与NR3C1、FOS、STAT3、MAPK1和TNF靶点具有良好的结合活性。结论：XFC “异病同治”RA与OA的机制与抗炎、免疫调节、减少骨破坏等相关,具有多系统、多成分、多靶点的作用。     

基于系统药理学和分子对接探讨抗炎合剂治疗 脓毒症的分子调控机制

目的:基于系统药理学、分子对接以及GEO数据库差异基因表达分析的方法,解析抗炎合剂治疗脓毒症的分子调控机制。方法:通过TCMSP(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform)和Drug Bank数据库平台获得抗炎合剂的活性成分和对应靶标。基于GEO数据库分析获得脓毒症的差异表达基因(differentially expressed gene,DEG),并通过David在线分析平台对药物与疾病基因进行了GO(gene ontology)功能和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)富集分析。同时,利用Biso Genet和Cy to NCA插件对交集靶点进行网络拓扑分析,并将获得的Hub基因与关键活性成分进行分子对接,以证实抗炎合剂发挥治疗效用的分子机制。结果:从抗炎合剂474个化学成分中筛选出73个活性成分,其中45个活性成分被预测为针对54个与脓毒症相关的基因。GO功能、KEGG通路及蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络拓扑分析显示:交集靶点主要参与酶结合、蛋白质均聚活性调控、转录因子结合、细胞凋亡调控、细胞缺氧反应、转录调控、癌症相关途径、细胞周期、TNF信号通路、HTLV-I感染、细胞凋亡和NF-κB信号通路等,并筛选出4个Hub基因。最后,分子对接验证了分子靶标预测网络的可靠性。结论:研究预测了抗炎合剂治疗脓毒症的重要功能活性成分及其作用靶点,揭示了该中药复方的分子调控机制,为抗炎合剂的临床应用及实验研究提供了可靠的证据。     

洗腿又方治疗骨关节炎的网络药理学研究

目的 通过生物信息学、网络药理学和分子对接探讨洗腿又方治疗骨关节炎的药理学机制。方法 从基因表达综合数据库(GEO)中获取骨关节炎滑膜的差异表达基因,使用TCMSP、HERB、TCMID等数据库搜集洗腿又方的活性成分及其作用靶点,并与疾病靶点取交集。通过STRING数据库及Cytoscape3.8.2软件对交集靶点进行蛋白互作和富集分析,最终将关键活性成分与关键靶点进行分子对接。结果 获得骨关节炎滑膜的差异表达基因2072个,洗腿又方的活性成分20种,其治疗骨关节炎的靶点30个,进一步通过蛋白互作筛选获得HIF1A、CASP8、RAF1等关键靶点,富集分析发现洗腿又方主要通过干预细胞周期、炎症和内分泌等信号通路治疗骨关节炎,分子对接结果显示,关键有效成分芹黄素、槲皮素分别与关键靶点HIF1A、CASP8有良好的对接活性。结论 本研究探讨了洗腿又方治疗骨关节炎的可能活性成分、靶点及作用通路,为其应用于骨关节炎的治疗提供了理论依据。     

金鸡胶囊治疗盆腔炎的活性成分和作用机制预测

目的：运用网络药理学和分子对接技术预测金鸡胶囊治疗盆腔炎（pelvic inflammatory disease,PID）的潜在活性成分,并阐明其作用机制。方法：通过数据库和文献检索搜集金鸡胶囊中6味中药材的化学成分、作用靶点及疾病靶点;运用MCC算法对交集靶蛋白进行筛选得到核心靶蛋白;运用ClueGo和Metescape数据库对核心靶蛋白进行基因富集分析;通过构建“金鸡胶囊活性成分-核心靶点-关键通路图”反推测出关键活性成分和核心靶蛋白进行分子对接。结果：共收集到712种活性成分,化学成分作用靶点与盆腔炎疾病交集靶点有89个,其中化学成分14-去氧-12-甲氧基穿心莲内酯、穿心莲黄酮、甘草查尔酮A、远志酮I、千层纸素A和靶蛋白EGFR、PIK3CA、ESR1、AKT1、MTOR、MAPK1作为关键活性物质和核心靶点。分子对接表明,关键活性成分和核心作用靶点结合状况良好,结合自由能-9.65～-5.56Kcal/mol。结论：金鸡胶囊通过作用多靶点,多条通路治疗盆腔炎疾病。其中化合物14-去氧-12-甲氧基穿心莲内酯和甘草查尔酮A与靶蛋白ESR1、ATK1具有稳定的结合口袋,能够形成稳...     

基于网络药理学和分子对接探讨白花蛇舌草治疗骨肉瘤的作用机制

目的:从网络药理学和分子对接的角度探讨白花蛇舌草干预骨肉瘤的分子作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)预测白花蛇舌草的活性成分及相关靶基因;通过GEO-NCBI等数据库获得骨肉瘤相关的基因。将骨肉瘤相关基因和白花蛇舌草药物成分靶基因进行交集,得到白花蛇舌草干预骨肉瘤的共同靶基因。采用Cytoscape 3.8.1软件构建白花蛇舌草有效成分-骨肉瘤靶基因调控网络;将共同靶基因导入STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;运用DAVID在线数据库及R语言对共同靶点进行GO富集分析和KEGG富集分析;用Cytoscape 3.8.1软件筛选出白花蛇舌草干预骨肉瘤的核心靶点,然后将核心靶点与对应的白花蛇舌草活性成分进行分子对接以验证活性成分与核心靶点的结合能力。结果:共筛选出白花蛇舌草5个有效成分(MOL001659多孔甾醇、MOL001670 2-甲氧基-3-甲基-9,10蒽醌、MOL000449豆甾醇、MOL000358β-谷甾醇、MOL000098槲皮素)及其对应的靶基因共169个,3 178个骨肉瘤相关基因;靶基因和骨肉瘤相关基因交集得到白花蛇舌草干预骨肉瘤的预测靶点98个;经过PPI拓扑分析,提示相互作用紧密的8个核心基因分别是雌激素受体1(ESR1)、JUN、RAC-α丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶(AKT1)、G1/S特异性细胞周期蛋白-D1(CCND1)、FOS、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)和细胞肿瘤抗原p53(TP53)与MYC;GO富集分析得到P0.05的结果共计2 205条,其中生物进程(BP)结果 2 037条,细胞组分(CC)结果 39条,分子功能(MF)结果 129条;KEGG富集分析得到P0.05的结果共有155条,包括IL-17、细胞凋亡、肿瘤坏死因子、p53、细胞衰老等通路。分子对接结果显示AKT1、CCND1、FOS、MAPK1、TP53、MYC与槲皮素,ESR1与2-甲氧基-3-甲基-9,10蒽醌,JUN与β-谷甾醇之间亲和力均小于-7 kcal/mol,亲和力较高,显示出较好的结合能力。结论:白花蛇舌草可通过多个不同成分作用于骨肉瘤多个靶点,进而调控多条通路干预骨肉瘤发生发展过程,这可为白花蛇舌草临床应用和开发提供参考。     

基于网络药理学探讨合欢皮-远志药对的抗抑郁作用

目的:利用网络药理学方法分析贾跃进老中医常用药对合欢皮-远志的抗抑郁机制.方法:检索CNKI、TCMSP等数据库,获取各药物活性成分及相关靶点;利用GEO等数据库获得抑郁症的疾病靶点,筛选药物-疾病交集靶点;使用CytoscapeV3.8.0创建疾病-药物-成分-靶点网络及蛋白互作关系网络,并对交集靶点进行GO、KEGG通路富集分析;选择关键成分与关键靶点分子对接.结果:收集到合欢皮-远志药对活性成分54种,关联靶点708个.主要生物过程有:细胞过程、信号过程、对刺激的反应等;主要通路有:TNF信号通路、神经营养素信号通路、NF-κB信号通路等.结论:初步获得合欢皮-远志抗抑郁的作用机制,为临床应用和进一步研究提供一定理论参考.     

基于网络药理学探讨健脾益肾化浊方治疗多囊卵巢综合征的作用机制

目的：基于网络药理学方法探讨健脾益肾化浊方治疗多囊卵巢综合征（polycystic ovary syndrome, PCOS）的有效成分及可能作用机制。方法：通过TCMSP数据库检索健脾益肾化浊方组成药物的活性成分,筛选有明确作用靶点的活性成分和作用靶点;通过Uniport数据库检索靶点信息,将各中药活性成分作用靶点转化成相对应的基因名称,并通过Cytoscape3.9.0软件构建活性成分网络图、中药-活性成分-基因靶点网络图;检索Gene Cards疾病数据库中PCOS相关靶点;制作健脾益肾化浊方活性成分靶基因和PCOS相关靶点韦恩图,筛选交集基因,通过String数据库构建蛋白相互作用网络（PPI）;最后利用Meta scape数据库进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,用微生信作图。结果：筛选出健脾益肾化浊方活性成分94种,对应靶基因254个,PCOS疾病靶点1297个,两者交集靶点116个;其中MAPK1、MAPK3、AKT1、TP53、TNF、MAPK14、IL6、ESR1、EGRF、RB1可能是健脾益肾化浊方治疗PCOS的主要靶点。结论：健脾益肾化浊方的活性成分、关键...     

基于网络药理学预测青风藤治疗类风湿关节炎的分子机制

目的运用网络药理学的方法探讨青风藤治疗类风湿关节炎的分子机制。方法通过TCMSP平台筛选青风藤活性成分及作用靶点;在GeneCards和OMIM数据库中获取类风湿关节炎靶基因。通过R语言对基因进行匹配运算并绘制韦恩图;在String平台生成成分-蛋白互作网络图;Cytoscape 3.6.1软件构建成分-靶点网络;通过R3.5.1软件进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。结果共筛选出6个活性成分和23个潜在作用靶点;GO功能富集显示,青风藤可以影响炎症因子的细胞信号转导等生物学过程。KEGG通路富集分析显示,青风藤可以通过调控P53等凋亡相关通路发挥抗类风湿关节炎的作用。结论青风藤可能通过作用于CASP3、JUN、OPRD1等关键靶点调控P53等信号通路,从而调控炎症细胞凋亡进而发挥治疗类风湿关节炎的作用。     

基于网络药理学与分子对接探讨桃红四物汤对血小板活化的作用机制

目的 采用网络药理学和分子对接技术探讨桃红四物汤对血小板活化的作用机制,为后续实验研究及临床应用提供参考。方法 首先通过TCMSP数据库获得桃红四物汤中的主要活性成分及其对应作用靶点信息;通过Gene Card、OMIM、TTD等数据库获得与血小板活化相关的靶点;其次利用Venny图将桃红四物汤中有效成分对应靶点基因与血小板活化靶点基因相映射,筛选两者之间的共有靶点,借助STRING平台及Cytoscape3.7.1软件,绘制交集基因蛋白互作（PPI）网络图;然后利用基因注释、可视化和综合发现数据库（David）对核心靶点进行基因本体（GO）生物功能富集分析及京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,通过微生信云平台对富集结果可视化;最后借助AutoDockTools软件对核心成分及关键靶点基因进行分子对接,筛选出桃红四物汤中的重要成分及其作用于血小板活化过程中的重要靶点,为后续对核心成分抑制血小板活化作用进行实验验证提供重要依据。结果 按照一定条件共筛选出69个桃红四物汤有效成分及2 175个血小板活化的靶点,去除重复后获得44个桃红四物汤作用于血小板活化的有效成分和154个...     

基于网络药理学与分子对接探讨五苓散治疗脓毒症相关急性肾损伤的作用机制

目的 基于网络药理学及分子对接探究五苓散治疗脓毒症相关急性肾损伤的作用机制。方法 使用TCMSP、SwissTargetPrediction、GeneCards、OMIM、PharmGkb、TTD、DrugBank数据库筛选五苓散治疗脓毒症相关急性肾损伤的有效成分及关键靶点；使用Cytoscape 3.7.1软件构建“药物-成分-靶点”网络；使用STRING数据库构建关键靶点蛋白互作(PPI)网络；通过利用R语言对治疗靶点进行GO和KEGG富集分析，利用PubChem、蛋白质数据库(PDB)、AUTO Dock Vina等对主要活性成分及核心靶点进行分子对接。结果 通过网络药理学分析共获得40个五苓散的有效成分及其对应的432个基因，1 460个脓毒症相关急性肾损伤基因，166个药物和疾病的共同靶点。PI3K/Akt通路是一条关键的调节通路，选择小分子polyporusterone E和Akt1,以及Alisol B和PIK3CA进行分子对接。结论 五苓散是借助多个靶点和多个途径治疗脓毒症相关急性肾损伤的。     

半夏泻心汤治疗化疗性肠黏膜炎的作用机制探讨

目的：基于网络药理学,探讨半夏泻心汤治疗化疗性肠黏膜炎（CIM）的潜在分子作用机制,为其临床应用及研发提供参考。方法：采用TCMSP数据库检索获取半夏泻心汤的有效活性成分及其潜在的作用靶点,运用GeneCards、OMIM、TTD、Drugbank数据库检索CIM相关靶点,将两者取交集,获得半夏泻心汤治疗CIM的潜在靶点,通过CytoScape 3.6.1软件绘制“半夏泻心汤-活性成分-CIM靶点”网络图,利用STRING 11.0数据库构建交集靶点的蛋白互作网络图,筛选出网络中的关键蛋白。利用DAVID数据库对核心靶点进行GO和KEGG富集分析。最后,利用PDB平台将半夏泻心汤关键化学成分与核心靶点进行分子对接。结果：筛选共获得275种活性成分,99个半夏泻心汤治疗CIM靶点,富集分析后得到564个GO相关条目,115条相关信号通路。分子对接结果证明,半夏泻心汤主要活性成分与核心靶点EGFR、TNF、IL6具有较好的亲和力。结论：半夏泻心汤可能通过TNF、EGFR、IL6作用靶点发挥治疗CIM的作用,山奈酚、槲皮素、黄芩素可能是其发挥作用的主要活性成分。     

附子汤治疗颈椎病的作用机制

目的：采用网络药理学和分子对接技术探讨附子汤治疗颈椎病潜在分子机制。方法：通过检索TCMSP数据库获得每味中药的化学活性成分及作用靶点,通过检索GeneCard、OMIM、DisGeNet等数据库获得颈椎病的相关治疗靶点;通过Venny平台获得核心作用靶点,再利用Metascape对核心作用靶点进行GO功能富集分析,利用KEGG Mapper进行KEGG通路分析,其次借助STRING数据库并结合Cytoscape软件构建附子汤治疗颈椎病的“药物-活性成分-疾病作用靶点”及作用靶点网络与蛋白互作关系。最后检索PDB及PubChem数据库获得小分子和蛋白质结构,利用Autodock Vina软件及PyMOL进行分子对接验证。结果：筛选出药物潜在活性成分38个,药物潜在作用靶点109个,潜在疾病治病靶点976个。其中主要的核心作用靶点是16个。GO功能富集分析获得283个条目,KEGG分析主要涉及NF-κB信号通路、TNF信号通路等55个通路。分子对接提示Fumarine、Stigmasterol、Frutinone A、Beta-sitosterol等与PTGS1、PTGS2靶点具有较强亲...     

基于网络药理学探讨小柴胡汤治疗胃食管反流病合并失眠的作用机制

目的 基于网络药理学探讨小柴胡汤治疗胃食管反流病(GERD)合并失眠的潜在作用机制。方法 通过在线数据库筛选小柴胡汤的活性成分、药物靶点以及GERD和失眠的疾病靶点;取药物靶点和疾病靶点的交集,利用STRING数据库分析交集靶点的相互作用;通过Cytoscape软件构建和分析“活性成分-靶点”“药物-活性成分-共同靶点-疾病”、蛋白质相互作用(PPI)网络;通过DAVID数据库对交集靶点进行基因本体(GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;通过BioGPS对核心靶点进行基因定位,结合Cytoscape构建“成分-靶点-通路-器官/组织”网络;使用AutoDockVina进行主要活性成分与核心靶点的分子对接。结果 小柴胡汤治疗GERD合并失眠的主要活性成分包括槲皮素、山奈酚、黄芩素等多种化合物,关键靶点包括丝氨酸/苏氨酸激酶1(AKT1)、白细胞介素-1B(IL-1B)、白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、肿瘤蛋白53(TP53)等,与RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、炎症应答、信号转导等生物过程相关,涉及的通路包括癌症途径、AGE-RAGE信号...     

基于网络药理学和分子对接技术探讨沙棘活性成分对非酒精性脂肪肝作用机制

目的:通过网络药理学以及分子对接技术对沙棘活性成分干预非酒精性脂肪肝病（non-alcoholic fatty liver disease,NAFLD）的分子作用机制深入分析研究。方法:在GEO数据库检索非酒精性脂肪肝病的高通量测序数据，通过R语言edgeR包差异表达分析后，将差异基因与TCMSP数据库检索到的沙棘关键成分对应靶点取交集，得到沙棘干预非酒精性脂肪肝病的潜在靶点。利用基因集富集分析，研究潜在靶点相关细胞功能和信号通路，并使用Cytoscape构建成分-靶点-通路三者作用网络。随后进行蛋白质互作网络（PPI）和网络拓扑分析Degree确定核心干预靶点，并通过AutoDock Vina和PyMOL开源工具进行核心靶点与核心成分的虚拟对接工作，预测配体与受体之间的分子作用机制。结果:成分-靶点-通路网络由159个节点以及387对互作关系构建而成。分子对接结果显示，槲皮素、黄酮、山柰酚、亚麻酸、异鼠李素、杨梅黄酮、香豆素、熊果酸、芦丁和豆甾醇共10种活性物质与JUN、MMP9、FGF2、VCAM1、CDKN1A、ACE、SERPINE1、SPP1、NOS3和CCNA2 10个核心...     

丹参-莪术药对治疗癌性厌食的作用机制

目的：运用网络药理学和分子对接研究丹参-莪术治疗癌性厌食（cancer-related anorexia,CA）的作用机制。方法：通过TCMSP数据库、Uniprot数据库、PharmMapper数据库并结合相关文献筛选出靶点基因,并运用Genecards数据库、OMIM数据库对CA的对应靶点进行获取筛选。使用String数据库构建疾病与药物的交集靶点的蛋白互作网络,并将结果导入cytoscape3.8.2软件进行可视化分析。再将从String数据库得出的交集基因通过Metascape数据库进行GO富集分析和KEGG富集通路分析。采用Autodock软件进行分子对接,并利用pymol软件进行可视化处理。结果：共得到丹参靶点126个、莪术靶点54个,共同靶点25个,CA靶点1893个,疾病与药物交集靶点14个。蛋白互作结果显示MAPK1、ESR1为核心靶点。GO富集分析中生物学过程主要涉及细胞对有机环状化合物的反应、类固醇激素介导的信号通路、类固醇激素反应等;KEGG富集通路主要涉及Estrogen signaling pathway、TNF signaling pathway等。分子对...     

基于网络药理学方法研究大黄牡丹汤治疗阑尾炎的作用机制及物质基础

目的 运用网络药理学方法研究大黄牡丹汤治疗阑尾炎的作用机制及分子基础。方法 在TCMSP数据库中,检索大黄牡丹汤中五味中药的主要化学成分,通过TCMSP平台查找及预测中药化合物对应靶点,在genecards数据库中搜索阑尾炎疾病靶点,取二者靶点交集导入Swiss平台获得PPI网络,筛选核心作用靶点并构建大黄牡丹汤-潜在靶点-阑尾炎作用网络。对核心靶点进行基因本体（gene ontology,GO）分子功能及基因组百科全书（kyto encyclopedia of genes and genomes,KEGG）富集分析。采用DiscoverStiudio软件对活性成分与靶点进行分子对接。结果 筛选得大黄牡丹汤中主要活性成分有11个,该活性成分的有效靶点有166个,阑尾炎疾病709个,取交集得核心靶点66个;GO富集分析显示靶点基因主要涉及RNA聚合酶II启动子的转录正调控、一氧化氮生物合成过程的正调控、平滑肌细胞增殖正调控、蛋白磷酸化正调控等;KEGG富集结果显示大黄牡丹汤可能具有调控FoxO信号通路、鞘脂类信号通路、toll样受体信号通路等功效;结论 大黄牡丹汤可通过调控机体炎症反应、NF-kappa B信号通路、炎症介质对TRP通道,参与促炎症细胞因子的转录调节等治疗阑尾炎。     

基于网络药理学探讨参芪扶正注射液抗宫颈癌的机制

目的 基于网络药理学探讨参芪扶正注射液治疗宫颈癌的作用机制。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)及SwissTargetPrediction、STITCH数据库筛选黄芪、党参中药成分及作用靶点,以GeneCards数据库筛选宫颈癌相关基因靶点,利用Bioinformatics&Evolutionary预测活性成分-宫颈癌共同靶点,利用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络并筛选关键靶点。采用Metascape在线分析对关键靶点进行基因本体(GO)富集分析与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果 参芪扶正注射液筛选出山奈酚、木犀草素、美迪紫檀素等10个主要成分。经PPI拓扑分析共获得30个宫颈癌与成分关键靶点。GO富集分析结果主要涉及各种酶活性的传导、调节、调控以及各种酪氨酸激酶活性。KEGG通路富集得到8条主要通路,宫颈癌的治疗与癌症的中枢碳代谢、Th1和Th2细胞分化、trp通道的炎症介质调节等相关。结论 参芪扶正注射液通过多靶点调控多信号通路治疗宫颈癌,为后期研究抗宫颈癌的分子机制提供了依据。