基于加权基因共表达网络分析并验证胰腺癌增殖相关关键基因

目的基于加权基因共表达网络分析(WGCNA)筛选与胰腺癌细胞增殖相关的关键基因并进行验证。方法利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库和基因型-组织表达(GTEx)数据库生成的胰腺癌以及正常组织数据集产生差异表达基因(DEGs)。采用R软件包的limma算法识别DEGs, 校正后P<0.01且表达变化大于2倍的基因被鉴定为DEGs。采用Metascape数据库对DEGs的功能进行富集分析。使用R软件包进行WGCNA分析。使用R软件包的Survival功能进行生存分析;取30例就诊于河北医科大学第四医院胰腺癌患者的新鲜胰腺癌临床样本及癌旁组织, 应用荧光实时定量反转录聚合酶链式反应(RT-qPCR)检测部分筛目标基因mRNA表达水平。数据分析使用R软件及SPSS 25.0统计分析软件进行处理。结果 DEGs分析结果显示, 在胰腺癌组织中有12 044个基因表达上调, 有694个基因表达下调(P<0.01)。生存分析结果显示, 其中855个与患者预后显著相关的基因(P<0.01)。对影响预后的DEGs进行富集分析, 发现与DNA损伤修复、细胞周期转化、蛋白激酶活性调控等多种功...     

肾透明细胞癌脂质代谢研究进展

肾透明细胞癌作为肾癌最常见的病理类型, 具有发病率较高, 预后较差的特点。其因特征性脂质异常堆积, 在苏木精-伊红(HE)染色下呈现透明样改变而得名, 这种脂质异常堆积的现象与肾透明细胞癌内独特的脂质代谢机制关系密切。这种脂质堆积有利于肿瘤细胞的发生与发展, 但是其背后基因表达、分子相互作用的机制并未得到充分的研究。这不仅阻碍了肾透明细胞癌的预防干预和早期诊断, 而且限制了治疗策略的发展。因此, 本文将结合近年来肾透明细胞癌脂质代谢研究进展, 为未来的机制和临床转化研究提供新思路。     

肾透明细胞癌甲基化驱动基因的筛选及其预后作用

目的筛选肾透明细胞癌甲基化驱动基因, 并基于肾透明细胞癌甲基化驱动基因构建预后分子标签, 探索其在肾透明细胞中的预后作用。方法下载TCGA数据库中肾透明细胞癌基因的表达数据、DNA甲基化数据及临床信息资料。使用R语言MethylMix包综合分析患者的基因表达数据和DNA甲基化数据, 筛选甲基化驱动基因, 然后随机抽取70%肾透明细胞癌患者的转录组数据, 应用LASSO-Cox回归分析构建预后分子标签, 取其余30%的数据验证构建分子标签。结果根据肾透明细胞癌表达谱数据和甲基化数据, 筛选得到188种肾透明细胞癌甲基化驱动基因(Cor<-0.3, 均P<0.05), 其中104种低甲基化驱动基因, 84种高甲基化驱动基因;基于ccRCC转录组数据和生存数据, 发现188种甲基化驱动基因中有91种与ccRCC预后相关的基因(均P<0.05)。联合临床预后数据采用LASSO-Cox回归分析从中筛选出8种与肾透明细胞癌预后相关甲基化驱动基因EPB41L4B、GOLGA6L2、HHLA2、HOXA2、LINC00944、SPINT2、ZNF382、ZNF888, 并联合8种甲基...     

基于免疫相关基因的肾透明细胞癌预后分子标签的建立与验证

目的通过挖掘TCGA数据库中肾透明细胞癌(ccRCC)的免疫相关基因数据, 构建ccRCC预后分子标签。方法从TCGA数据库中提取611例的RNA-Seq测序数据(正常样本72例, ccRCC样品539例)和530例ccRCC患者的临床数据, 筛选出免疫相关基因(IRGS)表达数据, 并计算正常肾组织与ccRCC组织表达差异的IRGS。在530例ccRCC肿瘤组织样品的IRGS表达数据中, 随机抽取70%的样品应用LASSO-Cox回归构建预后分子标签(训练组), 30%的样品验证构建的IRGS预后分子标签(测试组)。结果在ccRCC组织中筛选出差异表达的IRGS共775种。单因素Cox分析得到298种IRGS与ccRCC预后有相关性(P<0.05)。采用LASSO-Cox回归分析中筛选出12个与ccRCC预后相关的IRGS, 分子标签值在训练组、测试组、所有样本数据与ccRCC患者的生存期呈显著相关, 分子标签值越高患者的预后越差, 其中所有样本数据中的1、3、5年受试者工作特征曲线(ROC)的曲线下面积分别为0.797、0.763、0.780。结论 ccRCC的IRGS预后模...     

肾透明细胞癌病理分级相关基因的WGCNA筛选

目的 挖掘肾透明细胞癌(ccRCC)病理分级相关基因.方法 从美国国立生物技术信息中心(NCBI)的基因综合表达(GEO)数据库下载101例ccRCC及101例癌旁组织芯片数据(GSE40435)及临床数据作为训练集,265例芯片数据(GSE73731)和临床数据及GEPIA数据库中623例ccRCC相关数据作为测试集...     

肾透明细胞癌患者生存模型的构建及其临床应用价值

目的构建肾透明细胞癌(ccRCC)患者术后3年、5年总体生存率(OS)的个体化预测模型, 并将讨其应用价值。方法回顾性分析2012年1月至2016年12月西京医院手术治疗的672例ccRCC患者的临床资料。男467例, 女205例;中位年龄56(23～83)岁;左侧肿瘤327例, 右侧肿瘤345例;临床分期Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ期肿瘤分别为584、47、19、22例;就诊时504例无症状, 168例有症状。术前碱性磷酸酶中位值80(41～240)U/L, 血清白蛋白中位值44.8(30.5～59.8)g/L, 中性粒细胞与淋巴细胞比值(NLR)中位值2.25(0.81～9.89), 血小板计数中位值205(82～589)×109/L, 肌酐中位值97(55～230)μmol/L。420例行根治性肾切除术, 252例行肾部分切除术。采用Cox多因素分析确定术后OS的独立预测因素, 运用R软件整合所有独立预测因素, 使其根据多因素分析所得的系数值绘制列线图模型, 并通过计算一致性指数(C-index)、绘制校准图对模型的性能进行检验。结果 672例中位随访43(1～78)个月, 其中56例死亡, ...     

垂体瘤转化基因在肾透明细胞癌中的表达及意义

目的探讨垂体瘤转化基因(PTTG)在肾透明细胞癌中的表达及其临床意义。方法选取2019年1月至2020年12月在本院诊断为肾透明细胞癌的69例患者为研究对象。对患者手术标本的组织切片进行PTTG染色, 并收集患者的临床资料。根据PTTG在肿瘤组织中是否表达, 将患者分为PTTG阳性组(43例)和PTTG阴性组(26例)。通过GEPIA对癌症基因图谱(TCGA)数据库中肾透明细胞癌的基因表达数据进行分析, 包括PTTG在癌和癌旁组织、不同分期肿瘤中的表达水平, 并进行生存分析。结果 69例肿瘤组织中, 有43例组织的PTTG表达为阳性, 阳性率为62.32%, 26例PTTG表达阴性, 阴性率为37.68%。而69例癌旁组织中, 仅11例组织可见PTTG阳性表达, 阳性率为15.94%。肾透明细胞癌组织中的PTTG表达阳性率显著高于癌旁组织(χ2=29.294, P<0.001)。PTTG阳性组中的Fuhrman 3～4级(χ2=7.057, P=0.008)、TNM Ⅲ～Ⅳ期(χ2=8.918, P=0.003)和肿瘤长径>4 cm(χ2=3.907, P=0.048)的比...     

多向分化肾细胞癌1例报告

肾癌伴多向分化及多种成分临床罕见, 恶性程度高、早期可发生转移, 预后差。我们收治的1例多向分化肾细胞癌患者, CT检查示右肾下极6.5 cm×6.0 cm软组织肿物影, 增强扫描后肿物明显不均匀强化, 内部伴有液化坏死。胸CT检查示纵膈多发淋巴结肿大, 同时伴右锁骨上淋巴结肿大。全麻下行后腹腔镜右肾切除术+右锁骨上淋巴结活检术。术后病理示多向分化肾细胞癌, 局部肉瘤样变, 其中可见透明细胞癌、集合管样癌、髓样癌, 伴右锁骨上淋巴结转移。术后1个月开始行舒尼替尼靶向治疗, 术后6个月出现肝及肺转移, 术后12个月死于多器官功能衰竭。     

肾实质原发性鳞状细胞癌1例报告

肾实质原发性鳞状细胞癌(SCC)是一种极为罕见的肿瘤, 血液学和影像学检查较难诊断, 相比于其他原发性肾癌其诊断时临床分期已较晚。本文报道1例门诊诊断为肾囊肿患者, 肾增强MR检查考虑右肾囊性肾癌, 行机器人辅助右肾部分切除术, 术后病理检查提示右肾高分化SCC伴囊性变。术后随访5个月, 患者恢复良好, 未见肿瘤转移和复发。肾实质SCC虽然早期诊断困难, 但积极手术仍可获得较好的治疗效果。     

pT3a期肾非透明细胞癌的临床病理特征及预后分析

目的探讨pT3a期肾非透明细胞癌(nccRCC)的临床病理特征和预后。方法回顾性分析2013年3月至2023年3月北京大学第三医院行手术治疗的438例pT3a期肾细胞癌患者的临床资料。根据术后不同病理类型分组, nccRCC组58例, 肾透明细胞癌(ccRCC)组380例, 两组的年龄、美国麻醉医师协会(ASA)评分、合并症差异有统计学意义(均P <0.05), 故采用倾向性评分法匹配两组术前基线数据。匹配后nccRCC组58例, ccRCC组232例, 两组性别(男/女:34/24例与165/67例)、年龄[(53.3±16.8)岁与(56.6±11.6)岁]、ASA评分(1/2/3/4分:19/34/5/0例与60/163/8/1例)、合并症(有/无:16/42例与76/156例)、肿瘤最大径[6.7(5.3, 8.4)cm与5.8(4.6, 7.8)cm]、行保留肾单位手术(是/否:4/54例与15/217例)的差异均无统计学意义(P >0.05)。采用Kaplan-Meier法绘制生存曲线, 采用log-rank检验比较不同病理类型患者的总生存率(OS)和无进展生存...     

Runt相关转录因子2在人肾透明细胞癌组织的表达及其临床意义

目的探讨Runt相关转录因子2(RUNX2)在肾透明细胞癌(ccRCC)中的表达及其与患者预后和临床病理特征之间的关系。方法基于肾癌肿瘤基因组图谱(TCGA)数据, 分析RUNX2在癌和癌旁组织中的表达及其预后价值。采用多色免疫荧光标记(mIHC)技术分析RUNX2在癌和癌旁组织中的分布特征, 并结合临床资料进行χ2检验。单因素和拟合多因素Cox模型分析RUNX2及其他指标的预后价值。基于TCGA数据库, 探讨RUNX2与免疫细胞浸润的相关性。结果 TCGA数据分析结果显示, RUNX2在癌组织中的表达显著高于正常组织(P<0.001)。mIHC结果表明RUNX2在癌组织表达水平高于癌旁组织(Z=-2.123, P<0.05), 且其表达水平与患者总生存期呈负相关[P<0.01, 风险比(HR)=2.768, 95%可信区间(CI):1.120～6.838]。RUNX2表达水平与患者美国癌症联合委员会(AJCC)临床分期明显相关(χ2=4.505, P<0.05)。多因素Cox回归模型显示年龄(P<0.01, HR=1.068, 95%CI:1.024～1...     

延胡索酸水合酶缺陷型肾细胞癌诊治的现状和展望

延胡索酸水合酶缺陷型肾细胞癌(FH-RCC)是一种罕见且具有高侵袭性和转移性的肾细胞癌, 临床诊断相对困难, 对于晚期FH-RCC缺乏标准的系统治疗方案。因此, 在临床工作中, 需要更深入地了解该病, 充分结合家族史、影像学、病理学表现进行临床识别, 必要时进行分子病理检测。通过根治性手术或系统治疗方案, 可以改善患者的预后。     

前列腺癌伴肾细胞癌内转移1例报告

前列腺癌肾转移极罕见。本文报道1例前列腺癌伴肾癌内转移患者的临床特征和诊治经过。患者, 67岁。因腰背疼痛3个月, 加重伴发热2周于2018年6月就诊, 病理诊断为前列腺腺癌伴骨转移, Gleason评分4+4分, T2N0M1期。腹部CT检查示右肾下极肿物, 约3.0 cm×2.5 cm×2.5 cm, 动脉期明显强化, 考虑右肾癌。行右肾部分切除术。术后病理检查示肾透明细胞癌Ⅱ级, 肾癌组织内见多个小灶前列腺腺泡细胞癌浸润。术后诊断:转移性前列腺癌, 右肾透明细胞癌。术后影像学随访18个月未见右肾肿瘤复发。患者的前列腺癌予药物去势和醋酸阿比特龙治疗, 治疗6个月后出现PSA进展, 先后予多西他赛化疗、锶89治疗, 效果欠佳, 随访至第30个月患者因恶液质死亡。     

琥珀酸脱氢酶缺陷型肾细胞癌1例报告

琥珀酸脱氢酶(SDH)缺陷型肾细胞癌是2016版WHO肾肿瘤分类中新增的肾癌亚型, 目前国内外仅有少量样本报道。本文报道1例青年女性患者, 体检发现左肾小肿瘤, 行左肾部分切除术, 术后病理结果为SDH缺陷型肾细胞癌。术后3个月复查肿瘤无复发、转移。     

肾细胞癌骨转移病灶分布特征与生存预后的关系

目的探讨肾细胞癌骨转移病灶的分布特征与患者生存预后的关系。方法回顾性分析2009年1月至2019年12月北京大学人民医院收治的122例肾细胞癌骨转移患者的临床资料。男100例, 女22例;年龄(59.87±11.33)岁。根据纪念斯隆-凯特琳癌症中心(MSKCC)/Motzer评分体系, 首次诊断骨转移时20例(16.4%)为预后低风险组, 74例(60.6%)为中风险组, 28例(23.0%)为高风险组。首次诊断骨转移时, 26例(21.3%)处于局限骨转移组(转移灶仅累及胸椎和/或腰椎), 69例(56.6%)处于随机骨转移组(转移灶仅累及骨, 但存在除胸腰椎外的病灶), 27例(22.1%)处于广泛转移组(合并其他器官转移);48例(39.3%)病灶累及脊柱, 43例(35.2%)累及骨盆, 22例(18.0%)累及上肢, 20例(16.4%)累及下肢。同时性转移(初次诊断肾细胞癌时即发现骨转移)61例;异时性骨转移(诊断肾细胞癌手术后随访发现骨转移)61例。诊断肾细胞癌后, 99例(81.1%)接受根治性肾切除术, 6例(4.9%)接受肾部分切除术, 其余患者(17例, 13....     

延胡索酸水合酶缺陷型肾细胞癌临床诊治共识

延胡索酸水合酶缺失性肾细胞癌(FH-RCC)是一种驱动基因明确的高度恶性的独立肾细胞癌病理学亚型, 由FH胚系或体系突变导致。FH-RCC发病年龄早、影像学表现不典型、病理学形态多变, 临床诊断困难, 且传统药物治疗效果不佳, 对患者健康造成极大威胁。中国抗癌协会泌尿男生殖系肿瘤专业委员会少见肾癌协作组总结现有工作基础, 汇总国内外相关研究进展, 基于基础研究、临床队列和循证医学证据制定本共识, 包括疾病影像学表现、病理学诊断、基因检测、手术与系统治疗选择, 为该疾病的诊治提出建议和参考。     

2020版EAU肾细胞癌诊疗指南更新解读之一

基于近年来最新发表的临床研究结果,欧洲泌尿外科学会(EAU)对其发布的2019版肾细胞癌指南进行了更新,主要涉及肾脏肿瘤的外科治疗、晚期肾细胞癌的免疫治疗及分子靶向治疗等,在肾癌外科治疗方面的更新主要包括:肾血管平滑肌脂肪瘤的手术指征、肾髓质癌的手术指征以及早期肾细胞癌的主动监测与非手术治疗选择等方面。本文将对以上2020版EAU指南中涉及肾脏肿瘤外科治疗的更新内容及其临床意义进行介绍与解读。     

晚期肝细胞癌的免疫治疗进展

原发性肝癌中发病率最高的是肝细胞癌(HCC), HCC是我国常见的致死性恶性肿瘤, 给患者带来沉重的经济和心理负担。HCC特殊的肿瘤免疫微环境和复杂多变的病因使得治疗手段非常有限, 治疗效果不佳。研究结果显示以免疫检查点抑制剂为核心的免疫治疗, 针对HCC的免疫细胞, 抑制免疫抑制性细胞和信号, 增加免疫细胞的活化、成熟和募集, 增强已有免疫反应, 激发新的免疫应答, 对HCC表现出良好的疗效。近几年, 以综合治疗的理念, 免疫治疗联合其他治疗在晚期HCC治疗中取得了新的突破。本文回顾晚期HCC免疫治疗的最新研究进展, 并简述免疫治疗存在的缺点和问题, 以期为晚期HCC的临床治疗提供参考。     

转移性延胡索酸水合酶缺陷型肾细胞癌一线靶免联合疗效分析

目的探讨一线靶免联合治疗对转移性延胡索酸水合酶缺陷型肾细胞癌(FH-deficient RCC)的临床疗效。方法回顾性分析四川大学华西医院(44例)、上海交通大学医学院附属仁济医院(27例)和中山大学肿瘤防治中心(16例)2019年3月至2022年8月收治的接受一线靶免联合治疗的转移性FH-deficient RCC患者的临床病理和基因测序资料。共87例患者, 男57例, 女30例, 男女比例为1.9∶1, 中位年龄37(30, 47)岁。肿瘤中位直径为7.5(5.0, 10.0)cm。61例(70.1%)为FH胚系突变, 26例(29.9%)为FH体系突变。49例(56.3%)为初诊转移, 38例(43.7%)为异时转移。最常见的转移部位分别为淋巴结(41/87, 47.1%)、骨(33/87, 37.9%)、肝脏(22/87, 25.3%)和肺(14/87, 16.1%)。15例(17.2%)FH蛋白表达弱阳性, 59例(67.8%)PD-L1表达阳性。87例采用的治疗方案分别为信迪利单抗联合阿昔替尼方案52例(59.8%), 帕博利珠单抗联合卡博替尼方案6例(8.0%), 替雷利...     

结直肠癌免疫相关基因预后模型的构建与验证

目的通过构建结直肠癌免疫相关基因预后模型用于评估患者预后。方法从基因表达综合数据库(GEO)和癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载基因表达数据和临床信息, 筛选其中差异表达的免疫相关基因。基于单因素和多因素Cox回归分析建立风险模型, 进一步分析该模型对于临床预后评估的应用价值, 并通过外部数据集对模型进行验证。结果共鉴定出85个免疫相关差异表达基因。筛选C-X-C基序趋化因子配体3(CXCL3)、脂联素受体蛋白1(ADIPOQ)、鸟嘌呤核苷酸结合蛋白G(i)亚基α-1(GNAI1)、上皮细胞特异性分子1(ESM1)、锯齿状蛋白2(JAG2)、白血病抑制因子(LIF)、血管活性肠肽(VIP)、盐皮质激素受体(NR3C2)共8个基因建立风险模型。基于该模型获得患者风险评分, 高风险组预后差于低风险组(χ2=22.611, P<0.001), 且该风险评分为结直肠癌患者独立预后因素[风险比(HR)=1.154, 95%可信区间(CI):1.091～1.220, P<0.001)。该模型的受试者工作特征曲线下面积为0.763, 可以较好地区分高低风险的结直肠癌患者。结论本研究成功...