非人类免疫缺陷病毒患者感染肺孢子菌肺炎的诊断学特征并文献复习

目的探讨非人类免疫缺陷病毒(HIV)患者感染肺孢子菌肺炎(PCP)的诊断学特征。 方法选择2022年3月15日南京医科大学第一附属医院老年肾内科收治的1例PCP患者的临床资料,总结非HIV患者感染PCP的诊断学特征,并复习文献综述其诊治进展。 结果44岁女性患者,因IgA肾病接受糖皮质激素联合来氟米特治疗,以发热起病,咳嗽,无痰,HIV阴性,常规检查(包括胸部CT)无特殊异常,经广谱抗生素治疗无效。后经宏基因组二代测序技术证实病原体为肺孢子菌,遂接受复方磺胺甲噁唑、棘白菌素、丙种球蛋白等治疗。治疗过程中,患者先后发生I型呼吸衰竭、粒细胞缺少、肠道真菌感染、肝功能异常、药疹等,予相应处理后均治愈。 结论PCP进展迅速,病原体宏基因组二代测序可降低该病的漏诊率和误诊率。复方磺胺甲噁唑仍是治疗PCP的首选药物,但副作用明显,需及时发现、合理干预。     

宏基因组二代测序在异基因造血干细胞移植术后肺孢子菌肺炎和免疫相关肺炎诊断中的临床价值

目的 探索宏基因组二代测序（mNGS）在异基因造血干细胞移植术后肺孢子菌肺炎和免疫相关肺炎诊断中的临床价值。方法 纳入2019年8月—2021年8月于四川省人民医院医疗集团（成都东篱医院）行异基因造血干细胞移植术后出现肺部弥漫性、多发性病灶的患者。回顾性分析肺泡灌洗液的mNGS结果和传统病原学检测针对耶氏肺孢子菌的检出率、免疫相关肺炎的发生率，并总结临床特征与mNGS结果的相关性。结果 24例感染患者的mNGS结果中，有5例为单纯病毒，4例为病毒合并细菌、真菌，排除这9例患者。在可评估15例患者中8例（53.3%）检出肺孢子菌，均经标准剂量复方磺胺甲唑为基础的抗肺孢子菌肺炎治疗后康复；7例（46.7%）未检出明确病原菌的患者中，5例（33.3%）经过标准的糖皮质激素为基础的免疫抑制剂治疗后康复，2例（13.3%）经标准剂量复方磺胺甲唑为基础的抗肺孢子菌肺炎治疗后康复。结论 针对异基因造血干细胞移植后临床难以鉴别的肺部弥漫性、多发性病变，采用肺泡灌洗液mNGS的阳性结果可以精准、快速筛选出肺孢子菌肺炎患者，而其阴性结果可以在较大程度上提示免疫相关肺炎的可能性，具有很好的鉴别诊断意义。     

血mNGS确诊淋巴瘤化学治疗后免疫抑制并发嗜肺军团病一例并文献分析

目的 分析免疫抑制患者嗜肺军团病的临床特征，探讨免疫抑制患者血宏基因组二代测序（mNGS在军团菌感染中的早期诊治意义。方法 报道1例血管免疫母细胞淋巴瘤化学治疗后出现肺部感染的患者，通过血mNGS检测明确嗜肺军团菌感染。以“军团菌”“血”“宏基因组二代测序”为中文关键词分别检索中国知网数据库、中华医学期刊全文数据库，以“Legionella”“blood”“metagenomics next-generation sequencing”或“mNGS”为英文关键词检索PubMed数据库的相关英文文献，对血mNGS阳性军团病的病例资料进行分析。结果 该例为50岁女性患者，因“确诊血管免疫母细胞淋巴瘤10月余，需继续接受化学治疗”入院，入院后予2次静脉化学治疗，合并骨髓抑制，出现咳嗽、发热，考虑肺部感染，予常规抗生素治疗效果不佳，后经血mNGS明确嗜肺军团菌感染，调整抗生素（左氧氟沙星+替加环素）后患者好转出院。复习文献共收集具有较完整临床资料的患者2例，均为血液系统疾病干细胞移植后合并肺部感染的儿童患者，经血mNGS明确病原菌后经抗军团菌治疗好转。结论 免疫抑制患者嗜肺军团菌感染易合并血流...     

宏基因组二代测序技术在血液病合并肺孢子菌肺炎患者诊治中的应用价值

目的 探讨血液病患者宏基因组二代测序技术在耶氏肺孢子菌肺炎诊断和治疗中的应用价值，为该类感染诊治提供依据。方法 对25例病原宏基因组二代测序检出耶氏肺孢子菌并临床诊断为耶氏肺孢子菌肺炎的病例进行回顾性分析。结果 从2021年1月—2022年5月共25例患者检出耶氏肺孢子菌的同时临床诊断为耶氏肺孢子菌肺炎，其中男性18例（72.0%），女性7例（28.0%），中位年龄为50岁，主要基础疾病为急性淋巴细胞白血病、急性髓系白血病和骨髓增生异常综合征。其中15例（60.0%）患者肺感染发生在造血干细胞移植后，移植后中位时间为189 d。患者的常见临床症状包括发热（88.0%）、低氧血症（68.0%）和咳嗽（44.0%）,84.0%的患者在本次感染前有免疫抑制剂的使用史。肺部CT表现包括单纯磨玻璃影型（20.0%）、结节/斑片型（12.0%）、磨玻璃影为主的混合型（68.0%）。血浆是最常见的耶氏肺孢子菌检出的样本类型，其次为肺泡灌洗液和痰液。25例患者均进行了抗肺孢子菌治疗，19例（76.0%）抗感染治疗后治愈，6例（24.0%）死亡。结论 血液病患者耶氏肺孢子菌的临床感染诊断需结合临床症状、...     

人类疱疹病毒7型肺炎一例

人类疱疹病毒7型（HHV-7）肺炎罕见。该文报道1例HHV-7肺炎病例,患者以咳嗽、咳痰、发热为临床表现,胸部CT表现为双肺片絮状密度增高影、结节伴晕征、进展空洞。常规抗感染治疗效果欠佳,后经支气管肺泡灌洗液（BALF）行宏基因组二代测序确诊,加用更昔洛韦抗病毒后病情好转。该例诊治提示,HHV-7肺炎临床症状不典型,影...     

宏基因二代测序技术辅助诊断波氏假阿利什霉肺部感染一例

一位有哮喘病史的老年女性左上肺小细胞癌切除术后4年出现咳嗽咳痰伴胸闷,影像学表现为肺部空洞,反复抗感染治疗效果不佳,空洞逐渐扩大,患者痰宏基因二代测序技术（mNGS）检测出波氏假阿利什霉,与痰培养结果一致,经过伏立康唑单药抗真菌治疗后,肺内病灶呈现好转趋势。     

46例血液病患者肺孢子菌肺炎临床与影像特征

目的总结血液病患者肺孢子菌肺炎(PJP)的初始肺CT影像特征。方法回顾性分析2014年1月至2021年12月在中国医学科学院血液病医院诊断为PJP的46例血液病患者的临床及影像资料。所有患者均行多次胸部CT及相关实验室检查, 依据初始肺CT表现进行影像分型, 并分析不同临床特征分组下的不同影像分型分布。结果 46例患者中, 男33例, 女13例, 中位年龄37.5(2～65)岁。肺泡灌洗液(BALF)六胺银染色确诊11例、临床诊断35例, 临床诊断患者中16例经BALF宏基因组二代测序(BALF-mNGS)诊断、19例经外周血宏基因组二代测序(PB-mNGS)诊断。初始胸部CT表现分为4型, 包括磨玻璃型25例(56.5%)、结节型10例(21.7%)、纤维化型4例(8.7%)、混合型5例(13.0%)。确诊、BALF-mNGS诊断和PB-mNGS诊断患者的CT类型构成比差异无统计学意义(χ2=11.039, P=0.087)。确诊患者和PB-mNGS诊断患者CT表现以磨玻璃型为主(63.6%、73.7%), BALF-mNGS诊断的患者CT表现以结节型为主, 占37.5%。63.0%...     

基于宏基因组二代测序诊断的鹦鹉热衣原体肺炎的流行病学特征分析

目的 基于宏基因组二代测序(mNGS)诊断的鹦鹉热衣原体肺炎的相关数据,分析其流行病学特征.方法 由微远基因科技有限公司和迪飞医学科技有限公司提供宏基因组二代测序数据,分别为数据集Ⅰ(2019年11月至2021年1月)和数据集Ⅱ(2019年4月至2020年12月),包括:鹦鹉热衣原体检测阳性患者的性别、年龄、所在城市、...     

克林霉素联合复方磺胺甲噁唑片治疗艾滋病合并肺孢子菌肺炎的临床疗效观察

目的探讨艾滋病合并肺孢子菌肺炎应用克林霉素和复方磺胺甲噁唑片联合医治的临床疗效。方法选择本院2016年5月～2017年5月诊治的114例艾滋病合并肺孢子菌肺炎患者,按照医治方案不同分成2组,行单纯复方磺胺甲噁唑片医治的57例患者设为对照组,行复方磺胺甲噁唑片联合克林霉素医治的57例患者设为观察组,比较并分析2组患者的临床疗效、实验室指标和血气指标。结果观察组总有效率为94.74%,显著高于照组77.19%(P0.05);观察组乳酸脱氢酶、白蛋白、血氧饱和度、动脉氧分压、动脉二氧化碳分压,均优于照组(P0.05)。结论对艾滋病合并肺孢子菌肺炎患者应用克林霉素和复方磺胺甲噁唑片联合医治可有效减轻患者肺部炎症,改善临床症状,值得临床推广应用。     

小剂量复方磺胺甲噁唑预防肾移植后肺孢子菌肺炎

背景：2009年肾脏病预后组织指南推荐所有肾移植受者移植后均应预防性使用复方磺胺甲噁唑预防肺孢子菌肺炎,但疗效有待观察。目的：观察肾移植移植后预防性应用小剂量复方磺胺甲噁唑预防早期肺孢子菌肺炎的疗效。方法：回顾性分析珠江医院器官移植科2006/2009期间接受肾移植患者的临床资料,移植后1年内规律随访并有完整的数据资料者,患者均排除肝炎、二次移植、群体反应性抗体阳性以及移植后失访等因素后纳入统计。记录入选患者的年龄、性别、免疫抑制诱导治疗方案、免疫抑制维持方案、皮疹、肝肾损害、急性排斥反应和耶氏肺孢子菌肺炎发病情况。其中部分患者接受复方磺胺甲噁唑预防肺孢子菌肺炎,设为预防组,部分患者未进行预防,设为非预防组。肺孢子菌肺炎通过病程分析、临床表现、影像学检查和实验室检查等确诊。结果与结论：围手术期中预防组与非预防组在年龄、性别、免疫诱导方案（生物制剂选用）、免疫维持方案和移植后1个月时血肌酐值均差异无显著性意义（P〉0.05）。随访期间患者急性排斥反应、巨细胞病毒感染、移植后1年肾功能等指标以及骨髓抑制、肝功能、药物性皮疹等方面差异无显著性意义（P〉0.05）;而肺孢子菌肺炎的发病率预防组较非预防组明显降低（P〈0.05）。结果证实,肾移植后预防应用小剂量复方磺胺甲噁唑能明显降低早期肺孢子菌肺炎的发生率。     

小剂量复方磺胺甲噁唑预防肾移植后肺孢子菌肺炎☆

背景:2009年肾脏病预后组织指南推荐所有肾移植受者移植后均应预防性使用复方磺胺甲噁唑预防肺孢子菌肺炎,但疗效有待观察.目的:观察肾移植移植后预防性应用小剂量复方磺胺甲噁唑预防早期肺孢子菌肺炎的疗效.方法:回顾性分析珠江医院器官移植科2006/2009期间接受肾移植患者的临床资料,移植后1年内规律随访并有完整的数据资料者,患者均排除肝炎、二次移植、群体反应性抗体阳性以及移植后失访等因素后纳入统计.记录入选患者的年龄、性别、免疫抑制诱导治疗方案、免疫抑制维持方案、皮疹、肝肾损害、急性排斥反应和耶氏肺孢子菌肺炎发病情况.其中部分患者接受复方磺胺甲噁唑预防肺孢子菌肺炎,设为预防组,部分患者未进行预防,设为非预防组.肺孢子菌肺炎通过病程分析、临床表现、影像学检查和实验室检查等确诊.结果与结论:围手术期中预防组与非预防组在年龄、性别、免疫诱导方案(生物制剂选用)、免疫维持方案和移植后1个月时血肌酐值均差异无显著性意义(P>0.05).随访期间患者急性排斥反应、巨细胞病毒感染、移植后1年肾功能等指标以及骨髓抑制、肝功能、药物性皮疹等方面差异无显著性意义(P>0.05);而肺孢子菌肺炎的发病率预防组较非预防组明显降低(P<0.05).结果证实,肾移植后预防应用小剂量复方磺胺甲噁唑能明显降低早期肺孢子菌肺炎的发生率.     

宏基因二代测序技术辅助诊断波氏假阿利什霉肺部感染1例报告

假阿利什霉属肺部感染影像学表现与曲霉属感染无明显差异,但药物敏感性不同,因此菌种鉴定对指导临床治疗意义重大。本研究报告1例有哮喘病史的老年女性病例,出现咳嗽、咳痰伴胸闷,影像学表现为肺部空洞,经痰微生物培养和宏基因二代测序技术诊断为波氏假阿利什霉感染。国内外尚无宏基因二代测序技术诊断此疾病相关报道,该病例旨在为其在肺部感染的诊治提供参考。     

46例血液病患者肺孢子菌肺炎临床与影像特征北大核心CSCD

目的总结血液病患者肺孢子菌肺炎(PJP)的初始肺CT影像特征。方法回顾性分析2014年1月至2021年12月在中国医学科学院血液病医院诊断为PJP的46例血液病患者的临床及影像资料。所有患者均行多次胸部CT及相关实验室检查,依据初始肺CT表现进行影像分型,并分析不同临床特征分组下的不同影像分型分布。结果46例患者中,男33例,女13例,中位年龄37.5(2~65)岁。肺泡灌洗液(BALF)六胺银染色确诊11例、临床诊断35例,临床诊断患者中16例经BALF宏基因组二代测序(BALF-mNGS)诊断、19例经外周血宏基因组二代测序(PB-mNGS)诊断。初始胸部CT表现分为4型,包括磨玻璃型25例(56.5%)、结节型10例(21.7%)、纤维化型4例(8.7%)、混合型5例(13.0%)。确诊、BALF-mNGS诊断和PB-mNGS诊断患者的CT类型构成比差异无统计学意义(χ^(2)=11.039,P=0.087)。确诊患者和PB-mNGS诊断患者CT表现以磨玻璃型为主(63.6%、73.7%),BALF-mNGS诊断的患者CT表现以结节型为主,占37.5%。63.0%(29/46)的患者外周血淋巴细胞减少,25.6%(10/39)血清G试验阳性,77.1%(27/35)血清LDH水平升高。不同CT类型患者的外周血淋巴细胞减少率、G试验阳性率和LDH升高率的差异均无统计学意义(P值均>0.05)。结论血液病患者PJP初始肺CT表现多样,以两肺多发磨玻璃影多见,结节型与纤维化型也是PJP初始CT表现。     

宏基因组学第二代测序技术在慢性子宫内膜炎患者中的应用分析

目的 研讨宏基因组学第二代测序在慢性子宫内膜炎(CE)患者微生物检测中的应用及后续对治愈率的影响.方法 选取2017年1月至2020年12月在该院生殖中心诊断为CE的不孕不育患者共139例作为研究对象,随机分为两组进行子宫内膜标本微生物培养和宏基因组学第二代测序检测,分析两组的微生物阳性率和CE治愈率.结果 组1微生物...     

mNGS在鹦鹉热衣原体肺炎中的应用价值

摘要:目的检测并分 析鹦鹉热衣原体肺炎患者的临床病理参数及实验室检查结果。方法收集2021年7月至2022年8月经宏基因组二代测序技术( mNGS)诊断为鹦鹉热衣原体肺炎患者17例,对其临床病理参数及实验室检查结果进行回顾性分析及总结。结果17 例鹦鹉热衣原体肺炎患者临床主要表现为发热,白细胞计数正常或升高,中性粒细胞百分比、C反应蛋白、纤维蛋白原、D-二聚体、乳酸脱氢酶B型钠尿肽等升高，淋巴细胞百分比及清蛋白降低。结论mNGS检测为鹦鹉热衣原.体肺炎的诊断及防治缩短了诊疗时间,可使患者得到及时、精准治疗。     

宏基因组二代测序在免疫功能低下宿主肺炎诊断中的价值

目的 观察免疫功能低下宿主肺炎(ICHP)患者的临床特征,探讨肺泡灌洗液宏基因组二代测序(mNGS)对ICHP的诊断价值。方法 2021年6月—2023年6月河南省人民医院诊治ICHP患者55例,均行支气管镜检查及肺泡灌洗液mNGS、传统病原微生物检测(CMT),记录病原体检出情况,比较mNGS、CMT的病原体检出率。55例患者中双肺多发病变37例,根据双肺是否有弥漫性磨玻璃影分为弥漫组18例和非弥漫组19例,比较2组病原体检出情况。结果 55例患者中检出真菌37例,其中霉菌20例,耶氏肺孢子菌22例;检出细菌30例,其中肺炎克雷伯菌7例,铜绿假单胞菌7例,金黄色葡萄球菌4例,肺炎链球菌2例,分枝杆菌属6例,惠普尔养障体2例,诺卡菌2例;检出病毒38例,其中巨细胞病毒18例,EB病毒21例,新型冠状病毒7例,人类疱疹病毒1型4例,流感病毒2例;混合感染43例。55例患者中肺泡灌洗液mNGS检出病原体49例,CMT检出19例,2种方法同时检出13例;肺泡灌洗液mNGS对ICHP患者的病原体检出率(89.1%)高于CMT(34.5%)(χ²=9.720,P=0.002...     

宏基因组第二代测序技术诊断鹦鹉热衣原体肺炎1例

鹦鹉热衣原体肺炎是一类临床较为少见的人畜共患疾病。由于该病缺乏特异性的临床症状表现及有效、快捷的实验室诊断方法,且部分病例往往没有明确的流行病学资料,因此增加了临床确诊的难度。本文报道1例通过宏基因组第二代测序（metagenomic next-generation sequencing,mNGS）技术诊断的鹦鹉热衣原体肺炎病例,提示mNGS这项技术在不明病原体的社区获得性肺炎诊断具有较高的临床应用价值。     

宏基因组二代测序在异基因造血干细胞移植后耶氏肺孢子菌肺炎诊断中的意义

目的评估宏基因组二代测序(mNGS)对异基因造血干细胞移植(allo-HSCT)患者耶氏肺孢子菌肺炎(PJP)的诊断价值。方法纳入2019年6月至2023年8月南方医科大学南方医院血液科allo-HSCT后疑似肺感染并接受肺泡灌洗液病原学检测的98例患者, 比较mNGS与常规方法、实时定量PCR(RQ-PCR)对PJP的诊断效能。结果 12例患者最终诊断为PJP(确诊11例、临床诊断1例)。确诊患者中1例为常规方法和RQ-PCR检测均阳性, 10例仅RQ-PCR阳性。12例患者mNGS均检出耶氏肺孢子菌。mNGS诊断PJP的敏感性为100%, 高于常规方法(8.3%, P=0.001), 与RQ-PCR(91.6%)相当(P=1.000)。75%的PJP患者为肺混合感染, 合并EB病毒和巨细胞病毒最为常见。mNGS检出混合感染8例, RQ-PCR检出5例, 常规方法未检出(P=0.008)。结论 mNGS在allo-HSCT患者PJP诊断中具有良好的敏感性, 在混合感染病原检测方面具有优势, 可作为常规检测方法及RQ-PCR的有效补充。     

自身免疫性脑炎并发培养阴性抗原阳性肺隐球菌病的临床研究

目的 分析1例隐球菌培养阴性,宏基因组测序检出新型隐球菌序列,隐球菌抗原检测阳性的自身免疫性脑炎并发肺隐球菌感染病例的诊治过程,旨在为临床诊断和治疗肺隐球菌病提供帮助。方法 分析1例血清隐球菌荚膜多糖抗原阳性、自身免疫性脑炎患者的临床资料,分别采用常规检测、生化检测、微生物培养和气管镜肺泡灌洗液宏基因组二代测序(mNGS)等方法进行复查,明确肺炎感染类型,并结合文献对肺隐球菌病进行复习讨论。结果 该例患者HIV检测阴性,痰液Xpert MTB/RIF结核分枝杆菌检测阴性;痰液、肺泡灌洗液细菌培养结果为正常菌群生长,隐球菌培养阴性;血培养阴性。脑脊液常规检测、生化检测、微生物培养结果均正常,隐球菌抗原阴性,墨汁染色未检出隐球菌;气管镜肺泡灌洗液mNGS结果提示新型隐球菌,序列数6,相对丰度46.15%,覆盖度0.001 0%。口服氟康唑治疗3个月后患者肺部CT检查结果显示右肺下叶类圆形结节影伴空洞较之前缩小。结论 临床工作中遇到免疫功能低下、且肺部影像学检查出空洞的患者,血清隐球菌荚膜多糖抗原和呼吸道标本mNGS联合检测可以有效辅助临床对肺隐球菌病的诊疗。     

少见病原体肺部感染的诊疗思路

近年来，随着宏基因组二代测序的广泛应用，临床工作中越来越多地检测出少见病原体，包括非结核分枝杆菌、棒状杆菌、镰刀菌、肺隐球菌、人类疱疹病毒、细环病毒、细小病毒、惠普尔养障体、巴尔通体、鹦鹉热衣原体等。这些被检测出的少见病原体是否具有临床意义、是否需要给予治疗，却很难有确切结论。该文就部分少见病原体的肺部感染诊疗思路提出了一些建议和探讨。