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1.
DNA修复酶基因MGMT启动子区异常甲基化与食管癌的关系 总被引:2,自引:0,他引:2
背景与目的: 分析食管癌组织中MGMT启动子区CpG岛甲基化状态和食管癌发病风险的关系,探讨MGMT基因启动子的异常甲基化在食管癌筛查及早期诊断中的意义。 材料与方法: 对江苏淮安的91例新发食管癌病例的癌组织、癌旁组织及外周血血浆样本提取DNA,应用甲基化特异性PCR(MSP)分析MGMT启动子区CpG岛的甲基化状态;对食管癌组织和癌旁组织提取总RNA,采用SYBR GREEN I 实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)测定MGMT的mRNA水平。 结果: MGMT启动子区CpG岛异常甲基化与食管癌发病风险增高有关联 (OR=7.750, 95%CI=2.736~21.955);MGMT启动子区CpG岛甲基化状态与MGMT mRNA水平无显著相关;血浆循环DNA中MGMT启动子区CpG岛甲基化与癌组织中MGMT启动子区CpG岛甲基化相关(P<0.01),血浆循环DNA中MGMT启动子区CpG岛甲基化检出率与癌组织中MGMT启动子区CpG岛甲基化检出率中度相关(Kappa=0.603, P<0.01)。 结论: MGMT基因的启动子区CpG岛的异常甲基化与食管癌发病风险增加有关;检测血浆循环DNA中MGMT基因启动子的异常甲基化,可为食管癌的筛查、早期诊断提供有价值的信息。 相似文献
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目的: 检测消化道肿瘤早期相关基因survivin mRNA在哈萨克族食管癌组织中的表达及其启动子区CpG岛甲基化状态,并进一步探究survivin启动子甲基化是否参与了食管癌的发生。方法:提取哈萨克族食管癌患者癌组织及远端无癌组织RNA,RT-PCR检测组织中survivin mRNA的表达水平,甲基化特异性PCR (methylation specific PCR,MSP)检测survivin启动子区CpG 岛的甲基化状态。结果:在20对食管癌组织标本中,癌组织中survivin mRNA阳性表达率 (95%)明显高于远端无癌组织 (65%) (P<0.05)。癌组织及远端无癌组织中survivin基因启动子区CpG岛多为杂合型甲基化,且两种组织间甲基化状态无明显差异 (P>0.05)。结论:survivin mRNA表达水平的增高在哈萨克族食管癌的发生、发展过程中起到了一定的作用,但其表达与启动子区CpG岛甲基化无关,提示甲基化并未直接调控该基因的表达并促进哈萨克族食管癌的发生发展。 相似文献
3.
目的:探讨人食管癌相关基因4(ECRG4)在食管癌中基因启动子甲基化状态及临床意义。方法:应用甲基化特异性PCR检测ECRG4基因启动子在55例食管癌原发组织及癌旁组织中的甲基化状态并结合临床病理资料进行分析。结果:在食管癌组织中ECRG4甲基化阳性率(67.3%,37/55)显著高于癌旁对照组织(5.5%,3/55)(P〈0.01)。ECRG4甲基化与肿瘤病变长度与患者饮酒史密切相关(P〈0.05)。结论:ECRG4甲基化可能是参与食管癌发展的重要分子事件。 相似文献
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5.
目的 DNA异常甲基化与食管癌的关系逐渐成为近年来食管癌防治领域的研究热点。总结近年来DNA甲基化与食管癌关系及其应用的研究进展,为该领域的研究提供参考。方法以"食管癌、抑癌基因过甲基化、诊断准确性"为主要关键词,检索2000-01-2018-12发表并收录于PubMed数据库的文献。主要纳入标准:(1)阐述DNA甲基化或抑癌基因过甲基化与食管癌关系及其在食管癌的早期诊断、指导临床治疗和预后判断方面应用的相关文献;(2)样本量较大(n≥30)且有对照组;(3)优先选取对DNA甲基化与食管癌关系的应用有具体评价指标的,如灵敏度、特异度等。排除标准:(1)重复文献;(2)样本为非人(动物标本或培养的细胞)的文献。根据纳入标准,符合分析的文献共28篇。结果食管癌患者普遍存在抑癌基因的高甲基化,且其比例明显高于正常对照(自身对照或异体对照)。p16、MGMT在食管鳞癌中的甲基化频率分别可达到88%和80.4%,结肠腺瘤息肉易感基因在食管鳞癌中的甲基化频率(50%)低于其在腺癌中的频率(92%);抑癌基因高甲基化用于食管癌的早期诊断时具有很好的准确性,且检测多个抑癌基因可以大幅提高其效能(灵敏度64.3%,特异度100.0%,曲线下面积0.821)。以食管脱落细胞为基础的甲基化检测方法,可以有效发现食管癌前病变,这为食管癌筛查提供了新的研究方向。在指导食管癌患者治疗和病情监测方面,CHFR、PAX5和ZNF695等基因分别可以判断晚期食管癌患者对紫杉醇、顺铂和放疗的敏感性;抑癌基因高甲基化的食管癌患者生存期明显长于未甲基化的患者,并且在预测肿瘤复发时,其灵敏度可达75%以上。结论 DNA异常甲基化与食管癌的发生发展密切相关,抑癌基因的高甲基化在食管癌的人群筛查、早期诊断方面有很好的应用前景,但在未来需要更大样本量、多中心的研究进行验证。在指导临床治疗和预后预测方面为晚期食管癌患者提供了更多的选择。 相似文献
6.
目的:探讨和比较新疆哈萨克族和汉族食管癌患者FHIT基因甲基化状态及其与食管癌发生及预后之间的关系。方法:采用甲基化特异性PCR法(methvlation-specific polymerase chain reaction,MSF)测定哈、汉两民族共71例食管癌及癌旁组织标本FHIT基因启动子区甲基化状况,建立Cox回归模型分析临床病理指标及FHIT基因甲基化水平等因素与预后的关系。结果:36例哈族食管癌患者癌组织和癌旁组织的FHIT基因启动子甲基化率分别为58.3%和19.4%,35例汉族食管癌患者癌组织和癌旁组织的FHIT基因启动子甲基化率分别为51.4%和14.3%,两民族癌组织FHIT基因的甲基化率均明显高于癌旁组织(P〈0.01);哈、汉民族食管癌患者癌组织之间、癌旁组织之间FHIT基因启动子甲基化率无显著性差异(P〉0.05)。预后因素分析表明肿瘤浸润程度、TNM分期、淋巴结转移区域数是影响哈、汉民族食管癌预后的独立危险因素,女性性别是保护因素。结论:FHIT基因启动子区甲基化状态与新疆哈族、汉族食管癌的发生有密切的关系,但可能与食管癌预后无关。 相似文献
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DNA甲基化与食管癌的关系 总被引:2,自引:0,他引:2
肿瘤细胞普遍存在DNA甲基化模式的改变,DNA甲基化异常包括原癌基因低甲基化和抑癌基因高甲基化。近年来研究结果表明,在食管癌发生过程中同样存在相关抑癌基因启动子区甲基化导致的基因表达的紊乱。其中由DNA甲基转移酶(DNA methyltransferase,DNMT)和去甲基化酶的活性改变导致的抑癌基因CpG岛超甲基化的研究,已成为食管癌发病机制研究中的热点之一。综述DNA甲基化的特点及其抑制基因转录和表达的分子生物学机制;DNA异常甲基化与食管癌发生发展的关系;食管癌相关肿瘤抑制基因的甲基化谱构成了食管癌独特的表遗传学标志;目前常用的甲基化检测手段及各方法的优缺点;DNA甲基化和去甲基化研究的展望及所需要解决的的问题等。 相似文献
8.
随着肿瘤表观遗传学的深入研究,DNA甲基化异常在血液肿瘤的发生和转化中起着重要作用。近来研究显示p15基因、降钙素基因、紧密连接蛋白-1基因等高度甲基化与骨髓增生异常综合征的发生发展具有重要关系。5-氮杂胞苷和5-2′-脱氧胞嘧啶等在骨髓增生异常综合征患者的治疗中已经取得一定效果。去甲基化治疗有望成为骨髓增生异常综合征治疗的有效方案之一。 相似文献
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摘 要: [目的] 基于转录组数据筛选食管癌铜死亡相关基因,构建预后模型,并探讨其临床价值。[方法] 从TCGA和GEO数据库下载食管癌转录组、基因表达和临床数据,对铜死亡相关基因进行鉴定。基于铜死亡相关基因表达量,对TCGA和GEO合并数据进行共识聚类,筛选差异基因,并进行Cox分析和LASSO回归分析,筛选预后基因并构建预后风险模型。基于风险评分及临床因素构建列线图,预测患者的生存率。[结果] 通过对49个铜死亡相关基因的鉴定,有26个基因在肿瘤组织及正常组织中差异表达。经多因素分析及LASSO回归分析,筛选出6个有预后价值的风险基因(PLEKHA7、GATM、F2RL2、TFF3、DKK1、CLIC3),并构建了6基因预后模型。基于预后模型的高风险组患者生存率明显低于低风险组,ROC曲线下面积(AUC)为0.916,验证了风险模型具有良好的预测性能。不同风险评分与患者的肿瘤微环境及药物敏感性密切相关。列线图预测了食管癌患者1年、3年和5年的生存概率分别为91.6%、62.4%和56.3%,校准曲线证实其预测的准确性。[结论] 基于铜死亡相关基因的6基因预后风险模型可以较好地预测食管癌的预后,可能是风险分层、免疫治疗评估和药物敏感性分析有用的生物标志物。 相似文献
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表观遗传改变例如DNA甲基化涉及多种癌症的发生和进展。DNA甲基化包括可逆的甲基基团添加至CpG二核苷酸中5′位胞嘧啶上。而DNA甲基化转移酶(DNA methyltransferases,DNMT)是负责甲基基团添加至CpG二核苷酸的酶,与组蛋白修饰一起,是发生于转录抑制所必须的起始事件。已经证明在多种人恶性肿瘤中DNMT的表达增高,并且通过DNMT介导的基因失活促进肿瘤进展。DNMT在衰老与凋亡过程中都起到一定作用。表观遗传改变是潜在可逆的,这刺激DNA甲基化抑制剂药理学的发展,为肿瘤的治疗提供了一个新的途径。 相似文献
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Chen X Hu H Guan X Xiong G Wang Y Wang K Li J Xu X Yang K Bai Y 《International journal of cancer. Journal international du cancer》2012,130(7):1607-1613
Previous studies on esophageal squamous cell carcinoma (ESCC) indicated that it contains much dysregulation of microRNAs (miRNAs). DNA hypermethylation in the miRNA 5' regulatory region is a mechanism that can account for the downregulation of miRNA in tumors (Esteller, N Engl J Med 2008;358:1148-59). Among those dysregulated miRNAs, miR-203, miR-34b/c, miR-424 and miR-129-2 are embedded in CpG islands, as is the promoter of miR-34a. We investigated their methylation status in ESCC by bisulfite sequencing PCR (BSP) and methylation specific PCR (MSP). The methylation frequency of miR-203 and miR-424 is the same in carcinoma and in the corresponding non-tumor tissues. The methylation ratio of miR-34a, miR-34b/c and miR-129-2 is 66.7% (36/54), 40.7% (22/54) and 96.3% (52/54), respectively in ESCC, which are significantly higher than that in the corresponding non-tumor tissues(p < 0.01). Quantitative RT-PCR analysis in clinical samples suggested that CpG island methylation is significantly correlated with their low expression in ESCC, 5-aza-2'-deoxycytidine (DAC) treatment partly recovered their expression in EC9706 cell line. We conclude that CpG island methylation of miR-34a, miR-34b/c and miR-129-2 are frequent events and important mechanism for their low expression in ESCC. DNA methylation changes have been reported to occur early in carcinogenesis and are potentially good early indicators of carcinoma (Laird, Nat Rev Cancer 2003;3:253-66). The high methylation ratio of miR-129-2 indicated its potential as a methylation biomarker in early diagnosis of ESCC. 相似文献
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Integrated analysis of DNA methylation and mutations in esophageal squamous cell carcinoma 下载免费PDF全文
Takayoshi Kishino Tohru Niwa Satoshi Yamashita Takamasa Takahashi Hidetsugu Nakazato Takeshi Nakajima Hiroyasu Igaki Yuji Tachimori Yasuyuki Suzuki Toshikazu Ushijima 《Molecular carcinogenesis》2016,55(12):2077-2088
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目的:检测人食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma, ESCC)组织及细胞中MicroRNA-203(miR-203)的表达及其基因的甲基化状态,探讨miR-203在ESCC发生及发展中的作用。方法:选取河北医科大学第四医院2008—2011年间手术切除的83例ESCC原发灶组织及癌旁组织标本,实时定量PCR与甲基化特异性PCR(methylation specific PCR,MSP)分别检测其miR-203的表达及其编码基因的甲基化状态。用DNA甲基化转移酶抑制剂5-氮杂-2’-脱氧胞苷(5-aza-2’-deoxycitydine, 5-Aza-dC)处理食管癌细胞系(TE1、TE13、YES-2、EC109、T.TN),实时定量PCR与MSP分别检测5-Aza-dC处理对食管癌细胞中miR-203的表达及其基因甲基化状态的影响。结果:五种食管癌细胞中miR-203的表达均相对较低,且呈高甲基化状态。5-Aza-dC处理后,miR-203的表达均显著升高( P <0.05或 P <0.01);YES-2细胞中miR-203编码基因的甲基化程度显著降低,其余4种细胞均转变为非甲基化状态。miR-203在ESCC组织中的表达显著低于癌旁组织(0.54±0.11 vs 1.00±001, P <0.01),启动子区甲基化率显著高于癌旁组织\[62.65%(52/83) vs 7.23% (6/83), P <0.01\],并且两者均与TNM分期和组织分化程度有关( P<0.05)。发生miR-203编码基因甲基化的ESCC组织中miR-203的表达显著低于未发生甲基化的ESCC组织( P <005)。结论: miR-203在ESCC组织与细胞中呈低表达,与食管鳞癌的发生、发展有关,且其启动子区甲基化可能是导致其表达沉默的机制之一。 相似文献
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食管鳞癌DNA甲基化的研究进展 总被引:1,自引:0,他引:1
近年来研究结果表明,相关抑癌基因启动子区超甲基化导致的基因表达紊乱已成为食管癌发病机制研究的热点之一.众多研究表明DNA甲基化在食管癌的发生、侵袭和转移过程中发挥了积极的作用,外周血DNA甲基化谱可作为食管癌早期诊断、预后判断及随访的检测指标,有望将抑癌基因去甲基化作为食管癌的治疗靶点. 相似文献
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目的:检测食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)细胞株TE13中(bridge integration factor1,Bin1)甲基化状态,分析去甲基化药物5-Aza-dC去甲基化前后Bin1表达水平、甲基化状态及细胞生物活性的变化,探讨ESCC发生的可能机制及治疗策略.方法:采用qRT-PCR方法检测去甲基化前后TE13细胞Bin1 mRNA的表达,MSP法检测ESCC细胞株TE13中Binl启动子区甲基化状态,划痕实验及Transwell实验分别检测去甲基化对TE13细胞迁移及侵袭能力的影响,Western blotting法检测Bin1与基质金属蛋白酶2(MMP-2)及基质金属蛋白酶9(MMP-9)蛋白的表达变化.结果:TE13细胞株中Bin1表现为完全甲基化状态,Bin1 mRNA呈低表达,经5-Aza-dC处理后Bin1 mRNA表达显著升高(P<0.01);划痕试验及Transwell试验显示去甲基化处理可明显降低TE13细胞迁移、侵袭能力(P<0.01);经5-Aza-dC处理后Bin1蛋白表达显著升高(P<0.01),MMP-2和MMP-9蛋白表达显著降低(均P<0.01).结论:DNA甲基化是Bin1低表达或缺失的重要机制之一,并可能通过调节MMP-2和MMP-9蛋白的表达,影响食管鳞状细胞癌细胞株TE13迁移、侵袭能力. 相似文献
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目的:检测食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell cancer, ESCC)中胰岛素样生长因子结合蛋白3(insulin-like growth factor binding protein 3, IGFBP3)基因的表达情况及甲基化状态,探讨其与ESCC发生发展的关系。方法:收集河北医科大学第四医院2008至2011年间的82例ESCC手术患者的ESCC原发灶组织及癌旁正常黏膜组织。RT-PCR及甲基化特异性-PCR(methylation specific-PCR, MSP)的方法分别检测DNA甲基转移酶抑制剂5-氮杂-2′-脱氧胞苷(5-aza-2′-deoxycitydine, 5-Aza-dC)处理前后的ESCC细胞系(TE1、TE13、YES-2、T.TN、Eca109)及82例ESCC及相应癌旁组织中 IGFBP3 基因mRNA表达水平及甲基化状态,应用免疫组织化学方法检测IGFBP3在ESCC组织中的蛋白表达情况,并分析 IGFBP3 基因甲基化状态与其表达水平之间的关系。 结果: 在ESCC细胞株TE1、TE13、YES-2、T.TN、Eca109中, IGFBP3 基因mRNA均呈阴性或弱阳性表达,用5-Aza-dC培养处理后,其mRNA表达水平均呈现不同程度的增高(P<0.05);MSP检测结果显示,在ESCC细胞株TE1、TE13、T.Tn、Yes-2中 IGFBP3基因均呈高甲基化状态。在ESCC组织中 IGFBP3 mRNA表达显著低于癌旁组织\[(0.15±0.07)vs(0.88±0.32),P<0.01\],且IGFBP3蛋白在癌组织中的表达阳性率显著低于癌旁组织\[29.3%(24/82)vs 84.1%(69/82),P<0.01\],并与TNM分期密切相关(P<0.05);IGFBP3基因在ESCC组织中的甲基率为68.3%(56/82),明显高于癌旁组织的15.9%(13/82)(P<0.01);IGFBP3基因在Ⅲ和Ⅳ期肿瘤组织中的甲基化率明显高于Ⅰ和Ⅱ期肿瘤组织(P<0.05),而该基因的甲基化率与肿瘤患者的组织学分级无相关性(P> 0.05)。IGFBP3基因甲基化状态与其表达之间有明显的相关性(P<0.05)。结论: ESCC组织及细胞株中IGFBP3基因呈高甲基化状态,该基因的甲基化可能导致其表达下调,并有可能是ESCC的发生机制之一。 相似文献
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[摘要] 目的:检测食管鳞状细胞癌(Esophageal squamous cell carcinoma, ESCC)中miR-203基因的表达及其甲基化状态,探讨miR-203基因在食管鳞癌发生及发展中的作用。方法:分别应用实时定量RT-PCR(Real-Time RT-PCR, qRT-PCR)以及甲基化特异性PCR(Methylation specific PCR, MSP)的方法检测DNA甲基化转移酶抑制剂5-氮杂-2’-脱氧胞苷(5-aza-2’-deoxycitydine, 5-aza-dC)处理前后的食管癌细胞系(TE1、TE13、YES-2、EC109、T.TN)以及食管鳞癌组织及相应癌旁正常组织中miR-203基因的表达和甲基化状态。结果:未经5-aza-dC处理的五种食管癌细胞系中miR-203基因的表达均相对较低,经5-aza-dC处理后,五种食管癌细胞系中miR-203基因的表达均增高。五种食管癌细胞系在5-aza-dC处理前表现为miR-203基因高甲基化状态,应用5-aza-dC处理后,YES-2细胞系中miR-203基因甲基化程度降低,非甲基化程度增加,其余四种细胞系中miR-203基因均表现为非甲基化状态。miR-203基因在食管鳞癌组织中的表达显著低于癌旁正常组织(P<0.05),并与TNM分期和组织学分化程度密切相关(P<0.05)。食管鳞癌组织中miR-203基因的启动子区甲基化率为62.7%(52/83),显著高于癌旁正常组织(7.22%, 6/83) (P<0.05),并与TNM分期和组织学分化程度密切相关(P<0.05)。发生miR-203基因甲基化的食管鳞癌组织中miR-203基因的表达显著低于未发生甲基化的食管鳞癌组织(P<0.05)。结论:miR-203基因在食管鳞癌中的异常低表达与食管鳞癌的发生、发展密切相关,且其启动子区甲基化可能是导致其表达沉默的机制之一。 相似文献
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目的:通过检测食管鳞状细胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)中长链非编码RNA XLOC_002319(long non-colding RNA XLOC_002319,lncRNA XLOC_002319)基因的表达及其甲基化状态,探讨XLOC_002319基因在ESCC发生及发展中的作用.方法:分别应用RT-PCR以及甲基化特异性PCR(methylation specific PCR,MSP)的方法检测DNA甲基化转移酶抑制剂5-氮杂-2'-脱氧胞苷(5-aza-2'-deoxycitydine,5-aza-dC)处理前后的食管癌细胞株(TE1、TE13、Yes-2、Eca109和T.TN)、ESCC组织以及癌旁正常组织、食管上皮内瘤变(esophageal intraepithelial neoplasia,EIN)组织中XLOC_002319基因的表达和甲基化状态.结果:未经5-aza-dC处理的5种食管癌细胞中XLOC_002319基因的表达均呈阴性或弱阳性,经5-azadC的5种食管癌细胞中XLOC_002319基因的表达均增高.5株食管癌细胞在5-aza-dC处理前表现为XLOC_002319高甲基化状态,处理后,Eca109和T.TN细胞系中XLOC_002319基因甲基化程度降低,其余3株细胞系中XLOC_002319基因均表现为非甲基化状态.XLOC_002319基因在ESCC组织中的表达显著低于食管上皮内瘤变组织和癌旁正常组织(P<0.01),并与组织学分化程度和TNM分期密切相关(P<0.05).ESCC组织中XLOC_002319基因启动子区甲基化率为63.75% (51/80),显著高于食管上皮内瘤变组织和癌旁正常组织(P<0.01),并与淋巴结转移、组织学分化程度和TNM分期密切相关(P<0.05).发生XLOC_002319基因甲基化的ESCC组织中XLOC_002319基因表达显著低于未发生甲基化的ESCC组织(P<0.01).结论:XLOC_002319基因在ESCC中的低表达可能与ESCC的发生密切相关,且其启动子区甲基化可能是导致其表达沉默的机制之一. 相似文献
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目的:探讨周期素依赖性激酶10(CDK10)在食管鳞癌中基因启动子甲基化状态及其与临床病理参数的关系。方法:应用甲基化特异性 PCR 检测 CDK10基因启动子在55例食管鳞癌组织及相应癌旁组织中的甲基化状态并结合临床病理资料进行分析。结果:在食管鳞癌组织中 CDK10甲基化阳性率(69.1%,38/55)显著高于癌旁对照组织(9.1%,5/55)(P <0.01)。CDK10甲基化与食管鳞癌淋巴结转移与临床分期显著相关(P <0.05)。结论:CDK10基因甲基化与食管癌淋巴结转移和临床分期密切相关。 相似文献
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Yiping Huang Xiaofei Chang Juna Lee Yong Gu Cho Xiaoli Zhong Il‐Seok Park Jun‐Wei Liu Joseph A. Califano Edward A. Ratovitski David Sidransky Myoung Sook Kim 《International journal of cancer. Journal international du cancer》2011,128(10):2261-2273
Esophageal squamous cell carcinoma (ESCC) is the sixth most frequent cause of cancer death in the world, and cigarette smoke is a key factor in esophageal carcinogenesis. To identify molecular changes during cigarette smoke‐induced ESCC, we examined the methylation status of 13 gene promoters in the human immortalized, nontumorigenic esophageal epithelial cell line (Het‐1A) that were exposed to mainstream (MSE) or sidestream cigarette smoke extract (SSE) for 6 months in culture. The promoter of sequence‐specific single‐stranded DNA‐binding protein 2 (SSBP2) was methylated in the Het‐1A cells exposed to MSE (MSE‐Het‐1A). Promoter methylation (86%, 56/70) and downregulation of SSBP2 expression were frequently detected in tumor tissues from ESCC patients. In addition, reintroduction of SSBP2 in an ESCC cell line (TE1) that does not express SSBP2 and in the MSE‐Het‐1A cells inhibited expression of LRP6 and Dvl3, which are mediators of the Wnt signaling pathway. SSBP2 expression markedly decreased the colony‐forming ability of ESCC cell lines and significantly inhibited cell growth of the MSE‐Het‐1A cells. Our results indicate that cigarette smoking is a cause of SSBP2 promoter methylation and that SSBP2 harbors a tumor suppressive role in ESCC through inhibition of the Wnt signaling pathway. 相似文献