结核病人免疫相关基因表达变化的基因芯片研究

目的 研究免疫相关基因在结核病人体内的差异表达。方法 应用基因芯片技术和生物信息学方法，对63例单纯结核性胸膜炎胸水及其外周血中淋巴细胞与36例正常健康志愿者外周血淋巴细胞以及10例心力衰竭患者胸水的mRNA表达水平进行分析比较。结果 在对基因表达谱原始数据进行标准化校正，聚类分析和统计学处理后，发现在626条免疫相关基因中差异表达基因86条，其中与细胞增殖相关的基因23个，与细胞免疫应答相关的基因34个，与信号传导有关的基因26个，其他相关基因3个，在结核病人胸水IL－2R，LT－β,IL-8,IOP-10,RANTES,MCP-1,IL-12,IL-12R,IFN-γ,TNF-α,TLR,IL-1,IL-10,HSP和TLR等53个基因表达显著性增高，IL－8，IL－15和IL－4等33条基因表达水平降低2倍以上；有14个基因之间存在线性相关。结论 机体抗结核免疫的发生，发展涉及多基因改变，免疫相关基因差异变化可以为结核临床生物治疗，辅助诊断和患者免疫水平的评价提供参考。     

肺癌前病变、肺癌中FHIT基因表达的临床研究

背景与目的FHIT基因为近年发现的新候选抑癌基因，位于3P14．2跨越FRA3B易脆点，在包括肺癌在内的人类多种肿瘤中均存在异常表达。本研究旨在观察FHIT基因在人肺癌前病变、肺癌中表达情况，探讨FHIT基因在人肺癌发生、发展过程中的可能作用。方法采用免疫组化方法检测298例甲醛固定、石蜡包埋的标本（包括161例肺癌、51例肺癌前病变、30例正常肺组织、23例肺良性病变和33例肺癌转移淋巴结）中FHIT蛋白表达情况。结果FHIT蛋白在正常肺组织及肺良性病变组织中均无失表达；癌前病变组织及肺癌组织中失表达率分别为54．9％（28／51）和59．0％（95／161）：肺癌转移淋巴结组织中FHIT蛋白失表达率78．8％（26／33），各组问比较有显著性差异（P〈0．05）。肺癌组织中FHIT基因表达水平与肺癌组织学类型、肿瘤细胞分化程度、患者P-TNM分期、淋巴结转移程度存在相关性（P〈0．05）。FHIT蛋白失表达组肺癌患者的术后五年生存率显著低于表达组（P〈0．01）。吸烟组患者FHIT基因失表达率69．1％（94／136）显著高于无吸烟组49．5％（49／99）（P〈0．01）。结论FHIT蛋白失表达可能是肺癌发生过程中的早期分子事件，与肺癌的发生、发展及预后有关；吸烟导致FHIT蛋白表达下降可能是诱发肺癌的原因之一。     

刺五加皂甙对肺癌细胞的生物效应

刺五加皂甙对肺癌细胞的生物效应作者简介：王淑范，女，４８岁，副主任医师，主要从事消化系基础理论与临床研究；朴云峰，男，４９岁，博士，教授，硕士生导师王淑范袁佐鸣（吉林省南湖医院，长春１３００１２）朴云峰（白求恩医科大学第一临床学院消化科）田爱廷（吉林...     

肺癌细胞三种多肽生长因子表达研究

目的探讨肺癌细胞生长因子受体的表达及其与淋巴结转移的关系。方法采用免疫组织化学法对肺癌组织切片中抗表皮生长因子受体（ＥＧＦＲ），血小板源性生长因子受体（ＰＤＧＦＲ）和胰岛素样生长因子１受体（ＩＧＦ１Ｒ）的表达进行检测。结果肺鳞癌ＥＧＦＲ、ＰＤＧＦＲ和ＩＧＦ１Ｒ的阳性率分别为８０％、８５％和７５％；腺癌为８８％、８８％和８１％；小细胞癌为８０％、７０％和８０％；而正常肺组织仅分别为２０％、１０％和２０％（Ｐ＜０．０５）；Ⅲ期肺癌ＥＧＦＲ、ＰＤＧＦＲ和ＩＧＦ１Ｒ的阳性率分别为８８％、８０％、９０％；Ⅱ期肺癌分别为５２％、４３％、５７％（Ｐ＜０．０５）；肺癌细胞三种生长因子受体表达均较正常组织为高。Ⅲ期患者生长因子受体表达明显高于Ⅱ期患者。结论ＥＧＦＲ、ＰＤＧＦＲ及ＩＧＦ１Ｒ的表达与肺癌生长分化、转移等恶性行为密切相关。     

信号转导及转录激活因子4在慢性阻塞性肺疾病发病机制中的作用

信号转导及转录激活因子4(STAT4)是STAT家族中的重要一员,近年来的研究表明,STAT4的异常活化与慢性阻塞性肺疾病的发生关系密切.本文拟就STAT4在慢性阻塞性肺疾病发病机制中的研究进展作一综述.     

肺黏膜相关淋巴组织淋巴瘤的免疫表型和诊断标准

肺黏膜相关淋巴组织(MALT)淋巴瘤是非常少见的一种肺的原发性低度恶性淋巴瘤，其病因不清，瘤细胞表达B细胞抗原，在病理学上符合其他部位MALT型淋巴瘤的一般特点，诊断需结合组织病理学、免疫学检测和临床特点。施行局部切除、化疗、低剂量的放疗或综合治疗，预后良好。     

加权基因共表达网络分析鉴别与老年肺腺癌免疫相关的关键基因筛选

目的:筛选与老年肺腺癌患者肿瘤浸润免疫细胞相关的关键基因。方法:回顾性分析,训练集的基因表达数据来源于癌症基因组图谱数据库,验证集来源于基因表达综合数据库的GSE72094数据集,筛选年龄≥75岁的肺腺癌患者91例,14例匹配的正常样本。肿瘤浸润免疫细胞水平由反卷积算法计算,训练集采用加权基因共表达网络分析筛选与肿瘤浸...     

激发CD40信号对胃癌细胞株生长增殖及基因表达谱的影响

目的探讨激发CD40信号对胃癌细胞生长、增殖的影响以及胃癌细胞株AGS基因表达谱的变化。方法四甲基偶氮唑盐（MTT）微量酶反应比色法检测不同浓度可溶性CD40配体（sCD40L）作用后胃癌细胞株AGS的存活率，以选择最佳干预浓度。流式细胞术检测sCD40L最佳干预浓度作用后胃癌细胞株AGS细胞周期和凋亡的变化。以sCD40L最佳干预浓度与胃癌细胞株AGS共育48h，基因表达谱芯片Affymetrix U133A 2．0检测胃癌细胞株AGS基因表达谱变化。结果sCD40L的最佳干预浓度为2μg／ml；与胃癌细胞株AGS共育48h后，sCD40L可使AGS细胞株生长抑制，细胞周期阻滞在G1期。激发CD40信号前、后，胃癌细胞株AGS差异表达基因414个，其中上调基因209个，下调基因205个。表达水平显著改变的基因共45个（P〈0．01），其中表达上调基因38个，下调基因7个。结论sCD40L对高表达CD40的胃癌细胞有明显的生长抑制作用。AGS细胞差异基因功能涉及代谢、凋亡及信号转导等，且可能主要活化p38丝裂原活化蛋白激酶和应激活化蛋白激酶／c-Jun氨基末端激酶信号通路，提示CD40信号对CD40阳性表达胃癌细胞的生物学行为可能具有重要的调节作用。     

survivin基因表达对肺鳞状细胞癌细胞侵袭的影响

目的探讨survivin基因对肺鳞状细胞癌细胞侵袭能力的影响及作用机制。方法应用survivin基因小干扰RNA（siRNA）转染处理人肺鳞状细胞癌细胞后,用荧光实时定量PCR和Western blot检测survivin mRNA和survivin蛋白表达,用软琼脂集落培养试验和Boyden小室模型试验检测癌细胞的锚着不依赖性增殖和侵袭能力,用琼脂糖凝胶电泳和细胞凋亡原位检测试剂盒检测癌细胞失巢凋亡情况。结果转染组癌细胞survivin mRNA和survivin蛋白表达明显受抑制,且与时间和浓度相关。与对照组比较,转染组细胞形成的软琼脂集落数和穿膜细胞数明显减少,细胞出现明显凋亡现象,并出现明显DNA条带。结论survivin基因siRNA转染可明显抑制肺鳞状细胞癌细胞的锚着不依赖性增殖和恶性侵袭,其机制可能与诱导失巢凋亡有关。     

IL-6对人胰腺癌细胞生长及STAT3信号转导通路的影响

目的 探讨IL-6对人胰腺癌细胞株Capan-2生长及STAT3信号转导途径的影响.方法 采用MTT法检测不同浓度IL-6刺激后Capan-2细胞的增殖率;免疫细胞化学染色确定磷酸化STAT3(P-STAT3)在Capan-2细胞内的定位及IL-6刺激前后表达量的变化;流式细胞仪检测细胞的凋亡;Western blot检测IL-6刺激前后Capan-2细胞中P-STAT3、bcl-xl、Cyclin D1蛋白表达量的变化.结果 100 ng/ml的IL-6作用Capan-2细胞后,细胞的增殖从1增加到4.965±0.18(P<0.05);细胞凋亡率从(3.21±0.23)%下降到(1.98±0.67)%(P<0.05);P-STAT3、bel-xl、Cyclin D1蛋白表达明显升高(P<0.05),且bcl-xl的表达与P-STAT3的表达呈正相关(r=0.985,P=0.015);Cyclin D1的表达与P-STAT3表达也呈正相关(r=0.914,P=0.036).结论 JAK/STAT信号转导途径的活化介导了IL-6对Capan-2细胞的增殖促进功能.     

基因芯片技术在食管鳞癌转移相关基因表达谱筛选中的应用

目的 研究人食管鳞癌转移相关基因表达谱,探讨食管鳞癌的转移机制。方法 选取392个与肿瘤转移相关的基因克隆,制备成肿瘤转移基因芯片。提取食管鳞癌组织以及正常食管组织RNA,反转录后标记为cDNA探针,与cDNA芯片杂交,经扫描及Quantarray 3．0软件分析后比较两种组织中的差异表达基因。结果 共筛查出差异表达基因58条,其中表达上调基因36条、下调基因22条,包括癌基因、抑癌基因、黏附分子、基质金属蛋白酶、信号转导因子、细胞代谢和免疫相关基因等。结论 基因芯片筛查食管鳞癌转移相关基因表达谱可为明确食管鳞癌转移机制提供重要参考。     

应用基因芯片研究肝细胞癌组织差异基因表达谱

目的：应用基因芯片技术研究原发性肝细胞癌组织中的差异基因表达谱改变，以寻找肝细胞癌相关基因。方法：抽提正常肝组织和肝癌组织中的mRNA来制备探针，经杂交、洗涤后，通过计算机扫描分析正常肝组织和肝癌组织基因表达谱的差异情况。结果：在10000个候选基因中，筛选出102条差异表达基因，表达上调的有42条，表达下调的有60条。未知基因12条。结论：基于DNA微阵矩技术的肿瘤基因表达谱分析能够高通量筛选与肝癌发生发展相关的基因。     

基因芯片技术筛选卵巢癌紫杉醇耐药差异表达基因的研究

目的应用基因芯片技术研究人卵巢癌紫杉醇耐药细胞株OC3/Tax300与其敏感细胞系OC3之间的基因表达谱差异,筛选耐药相关基因.方法分别提取OC3/Tax300与OC3细胞的总RNA并纯化mRNA;将等量的mRNA逆转录,以Cy5和Cy3标记的cDNA做探针,在BiostarH140S基因表达谱芯片上进行杂交.扫描芯片荧光信号图像,用基因图像分析软件对扫描图像进行数字化处理和分析.结果共筛选出显著表达差异基因234种,其中217种基因表达水平下调,17种基因表达上调;下调基因主要为EB病毒编码核蛋白（EBNA-3）、信号蛋白（COP9）,上调的基因主要是酪氨酸激酶（JAK2）、热休克蛋白（HSPs）、还原型辅酶烟胺腺嘌呤二核苷酸（NADH）等.结论本研究筛选出的基因可能为进一步探讨卵巢癌肿瘤细胞耐药机制提供新的途径.     

应用SELDI-TOF-MS技术筛选肺鳞癌和肺腺癌患者差异蛋白的研究

目的 应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术筛选出不同病理类型肺癌患者血清、支气管肺泡灌洗液(BALF)和肺癌组织中的差异蛋白,并探讨其临床意义.方法 选用WCX-2芯片、SELDI-TOF-MS技术检测20例肺鳞癌、20例肺腺癌和20例肺良性病变患者血清、BALF和肺组织匀浆的蛋白质谱,用Biomarker Pattern软件分析肺鳞癌和肺腺癌的差异蛋白并初步建立诊断模型.结果 ①肺鳞癌组与肺良性病变组:在血清、BALF、肺组织匀浆中发现存在2、9、8个差异蛋白峰(P＜0.05),分别选用其中质荷比为5 124.24、7 967.29联合10 843.45、7914.59联合8709.66的差异蛋白波峰建立分类树模型,其诊断肺鳞癌的灵敏度分别为85％、80％、75％,特异度分别为65％、80％、90％,正确率分别为75％、80％、83％,阳性预测值分别为71％、80％、88％,阴性预测值分别为81％、80％、78％,其相对应ROC曲线下面积分别为0.750、0.916、0.930.②肺腺癌组与肺良性病变组:在血清、BALF、肺组织匀浆中发现存在8、9、7个差异蛋白峰(P＜0.05),分别选用其中质荷比为9295.79、7923.01、2452.49的差异蛋白波峰建立分类树模型,其诊断肺腺癌的灵敏度分别为75％、80％、70％,特异度分别为65％、90％、85％,正确率分别为70％、85％、78％,阳性预测值分别为68％、89％,82％,阴性预测值分别为72％、82％、71％,其相对应ROC曲线下面积分别为0.844、0.933、0.825.结论 肺鳞癌和肺腺癌BALF及肺组织匀浆中的差异蛋白较血清多,诊断效率比血清高,肺鳞癌BALF中质荷比为7967.29和10843.45的差异蛋白峰联合、肺组织匀浆中质荷比为7914.59和8709.66的差异蛋白峰联合建模及肺腺癌BALF中质荷比为7923.01的差异蛋白峰建立分类树诊断模型,其诊断的灵敏度、特异度和正确率可达到75％～90％,有可能作为诊断肺鳞癌和肺腺癌的标志蛋白.     

Analysis of gene expression identifies candidate molecular markers in nasopharyngeal carcinoma using microdissection and cDNA microarray

Purpose Microarray analysis was used to bring a comprehensive insight into underlying molecular mechanisms and obtain a whole assessment of aberrant gene expression in nasopharyngeal carcinoma (NPC). Methods Combined with microdissection, gene expression profiles in 23 NPCs and 10 nontumor nasopharyngeal epithelial tissue samples were analyzed. Results Gene expression patterns suggested the dysregulation of the GTP/GDP-bound Ras cycle and an abnormal hyperactivity of cell cycle in NPC. Alterations in the WNT pathway suggest that this pathway may be activated in NPC. A 6-feature weighted-voting model was chosen because it represented the main characteristics of NPCs and predicted NPCs most accurately from the nontumor tissues (33 of 34 correct calls; 97.1% accuracy, Fisher’s exact test, P value = 8.389 × 10⁻⁸). Conclusions The data generated in this study represent a comprehensive list of genes aberrantly regulated in NPC. The 6-feature weighted-voting model may provide an extensive list of potential molecular markers for early diagnosis.Zhaoyang Zeng, Yanhong Zhou, Wei Xiong and Xiaomin Luo contributed equally to this work.     

凋亡相关基因在非小细胞肺癌组织中表达的研究

目的　探讨ｂｃｌ２ 、ｂａｘ、Ｆａｓ、ＦａｓＬ凋亡相关基因在非小细胞肺癌中表达及与肿瘤临床病理学的关系。方法　采用免疫组织化学方法检测４５ 例非小细胞肺癌中ｂｃｌ２、ｂａｘ、Ｆａｓ 和ＦａｓＬ的表达。结果　２３ 例（５１ ％）ｂｃｌ２ 阳性,３８ 例（８４％ ）ｂａｘ 阳性（ Ｐ＜ ０－０１） ,二者之间表达无明显关系,但Ｆａｓ 与ＦａｓＬ之间表达呈正相关（Ｐ＜０－０１） 。ｂｃｌ２ 蛋白表达率随肿瘤期别进展而降低（ Ｐ＜ ０－０５） ,ｂａｘ 蛋白在低分化癌中表达减少（Ｐ＜０－０５） ,ＦａｓＬ在肺腺癌细胞中表达较高（Ｐ＜ ０－０１） 。ｂｃｌ２ 和ｂａｘ 蛋白同时表达阳性与肺癌ＴＮＭ 分期显著相关（Ｐ＜０－０５） ,ｂｃｌ２ 蛋白单一表达与细胞分化有关（ Ｐ＝０－０３３）。结论ｂｃｌ２、ｂａｘ、Ｆａｓ 和ＦａｓＬ可能通过不同途径参与了非小细胞肺癌组织中细胞凋亡的调节,并在肿瘤的发生与发展中发挥重要作用。     

老年大鼠下丘脑-垂体-肾上腺轴炎性衰老相关基因表达特征

目的探讨炎性衰老的炎性细胞因子网络机制。方法清洁级健康雄性SD大鼠分为4月龄（4m）和24月龄（24m）二组,每组各10只。分别取各组大鼠下丘脑、垂体和肾上腺组织,应用炎症细胞因子与受体基因芯片进行基因表达检测,绘制基冈表达谱,筛选有表达差异的基因。结果与4m组相比,24m组下丘脑、垂体和肾上腺组织中表达上调的促炎性反应细胞因子与受体基因分别有6个、7个和9个,表达下调的抗炎细胞因子与受体基因分别有3个、4个和3个（P〈0．05）。三种组织中表达都上调的促炎性反应细胞因子与受体基因有白介素、肿瘤坏死因子和趋化因子。结论老年大鼠下丘脑－垂体－肾上腺轴组织存在促炎性细胞因子基因表达上调,导致促－抗炎性细胞因子网络和促－抗炎性反应体系平衡失调,这可能是炎性衰老中出现高促炎性反应状态的原因和炎性衰老发生的新机制。     

AnnexinⅡ基因在肺癌组织中的表达分析

目的分析AnnexinⅡ基因mRNA在肺癌组织及癌旁正常肺组织中的表达情况。方法分别提取10例人肺癌组织及5例癌旁正常肺组织总RNA,逆转录后分别对AnnexinⅡ和β-肌动蛋白行聚合酶链式反应(PCR)扩增。测定电泳图像中各条带光密度值,以同一泳道中AnnexinⅡ和β-肌动蛋白产物条带积分光密度值之比作数据分析,以此反映AnnexinⅡ基因mRNA的表达程度。结果肺癌组织中AnnexinⅡ基因mRNA表达量较癌旁正常肺组织明显增加(P0.05)。结论 AnnexinⅡ表达增加在肺癌的发生发展中可能具有重要作用。