模拟HIV-1 gp41 CHR表位短肽的筛选及研究

目的 利用针对HIV-1跨膜蛋白gp41CHR序列合成肽C34的单克隆抗体1G1筛选噬菌体12肽库，旨在找寻模拟C34肽表位的序列，同时探索该短肽成为HIV-1gp41NHR与CHR结合抑制物的可能性。方法 以1G1为钓饵蛋白对噬菌体12肽库进行亲和筛选，以双夹心ELISA鉴定阳性克隆。结果 经3轮筛选后，随机挑选17个噬菌体克隆，其中6个克隆与1G1显示出较强的结合活性，上述6个阳性克隆经DNA测序，氨基酸序列相同；HYEFWAWNWEAN，其明显的疏水性质类似于G34N末端，特异性鉴定显示这些克隆均能够与HIV-1gp41N多肽结合，结论 该噬菌体克隆展示肽可模拟HIV-1gp41CHR多肽表位，并可与N多肽结合。     

HIV-1 gp41 C-螺旋模拟位的筛选和鉴定

目的：筛选可作为小分子先导化合物的HIV-1 gp41 C螺旋模拟位，为开发抗HIV-1早期感染的小分子药物奠定基础。方法：以源于HIV-1 gp41端的肽N36为靶，对噬菌体环七肽库进行亲和筛选。利用ELISA鉴定噬菌体阳性克隆并对其进行DNA序列分析。结果：3轮筛选后随机挑取26个噬菌体克隆，ELISA鉴定表明有16个克隆可与N36结合，将其中10个克隆DNA测序并推导氨基酸序列，每一克隆至少含有2个疏水氨基酸，其中9个克隆均有WW，7个克隆有WWH保守序列。挑选阳性噬菌体克隆No.8进一步鉴定，游离N36肽阻断No.8克隆与固相化N36结合，C34肽竞争抑制N36肽与No.8克隆结合(IC50为12.5μg/ml)。结论：表达WW保守序列的肽模拟HIV-1 gp41C螺旋与N螺旋结合，该结果为设计针对HIV介导融膜的抑制剂提供技术支持。     

HIV-1 gp41 NHR结合性环肽的研究

目的 筛选可与HIV-1 gp41 NHR结合的环肽，为研制抗HIV-1早期感染的小分子药物奠定基础。方法 采用P＋LS方法，用源于gp41 NHR的合成肽N36肽筛选噬菌体环七肽库，ELISA鉴定噬菌体克隆，根据阳性克隆的DNA序列，合成环肽并鉴定其与N36肽结合。结果 经3轮筛选、鉴定，得到11个和N36肽结合的噬菌体克隆。DNA测序并推导氨基酸序列，表明这11个克隆展示同一序列CDRHQHKRC。根据此序列合成的环肽NA（Biotin—SACDRHQHKRCGG）经与载体蛋白BSA偶联后，EIJSA鉴定表明交联物可特异地与N36肽结合，这种结合可被游离N36肽、以及源于gp41 CHR的肽C34抑制。结论 sACDRHQHKRCGG环肽为HIV-1 gp41 NHR结合肽。     

我国HIV-1流行株gp41抗原表位筛选与串联表达

目的探讨HIV-1gp41抗原表位串联表达蛋白用于HIV抗体检测的可行性。方法用HIV-1gp41蛋白亲和层析柱制备HIV-1感染者血清中的多克隆抗体，用噬菌体展示随机十二肽库进行生物淘洗，反向吸附非特异性噬菌体。经ELISA鉴定阳性克隆，DNA测序，确定优势表位。将优势表位与文献报道的另一个优势表位串联，克隆人pQE30载体进行蛋白表达。结果成功筛选到位于HIV-1 gp41蛋白上的优势抗原表位(YGPKDAETTAIW)，串联表位(YGPKDAETTAIW-GGGS-SC-SAKFTCTTQI)在pQE30载体中实现可溶性表达。重组蛋白具有良好的抗原性，能与不同的HIV-1抗体阳性血清呈特异反应。结论HIV-1 gp41抗原表位串联表达设计足可行的，串联表位重组蛋白可用于HIV-1抗体检测，但检测灵敏性低于常规方法。     

麻痹性贝类毒素GTX2,3模拟表位的初步研究

目的:利用噬菌体展示随机肽库筛选可模拟麻痹性贝类毒素GTX2,3抗原表位的噬菌体,初步鉴定人工合成的GTX2,3抗原表位肽的特异性。方法:以抗麻痹性贝类毒素GTX2,3单克隆抗体(mAb)为靶分子,对噬菌体随机12肽库进行3轮免疫亲和筛选,以夹心ELISA方法鉴定噬菌体克隆,竞争ELISA鉴定阳性噬菌体克隆的特异性。对阳性克隆进行DNA测序并推导噬菌体所展示的氨基酸序列。竞争ELISA鉴定模拟GTX2,3表位的合成肽的特异性。结果:经过3轮筛选获得20株能与靶分子高亲和力结合的阳性噬菌体克隆。序列分析表明DXLXPP为保守序列(X为任意氨基酸)。竞争ELISA检测表明,麻痹性贝类毒素GTX2,3可抑制阳性噬菌体克隆phage2与抗GTX2,3mAb结合。根据阳性序列合成的短肽可以抑制phage2与抗GTX2,3mAb的结合(IC50=13μg/mL)。结论:通过噬菌体肽库筛选技术,成功地获得麻痹性贝类毒素GTX2,3的模拟表位,并初步证实以此为基础合成的短肽能够准确和特异的模拟GTX2,3的表位。     

利用噬菌体随机肽库筛选IL-5结合的相关多肽

目的：采用噬菌体随机肽库筛选人IL-5，以获得能高亲和力结合IL-5的相关多肽。方法：以重组人IL-5作为筛选分子，应用M13噬菌体PⅢ呈现随机7肽库进行筛选。经过三轮淘筛后，经夹心ELISA、竞争ELISA法进一步鉴定噬菌体克隆与IL-5的亲和力，对阳性克隆进行了扩增和DNA测序，据此推导结合随机多肽的氨基酸序列。结果：经鉴定得到9个阳性噬菌体克隆能与IL-5呈高亲和力结合。通过测序和序列比较分析，发现CX1-2AS为相对保守的结合表位。结论：研究表明通过噬菌体肽库能够筛选到IL-5结合的相关多肽，为进一步研究IL-5结合表位及抑制剂奠定了基础。     

从噬菌体环肽库中筛选TNF-α表位模拟肽的研究

目的：用具有中和活性的抗TNF—α单抗(mAb)J1D9筛选噬菌体环七肽库，从中获得可模拟TNF—α表位的短肽。方法：筛选TNF—α表位模拟肽，并用夹心ELISA法鉴定阳性克隆。结果：对环七肽库进行3轮筛选后，随机挑选20个噬菌体克隆，经ELISA鉴定出9个阳性克隆。DNA序列分析后，推导的氨基酸序列共3种：c—RRPAQSG—c、c—NKHNRKI—c和c—RGMSRKI—c。结论：筛选的环七肽克隆展示肽具有TNF—α的抗原性，为TNF—α表位模拟肽。     

以特异性噬菌体展示肽为靶筛选TNF-α结合肽的研究

目的：建立以特异性噬菌体展示肽为靶从噬菌体肽库中筛选结合表位的新方法。方法：以前期工作中筛选得到的模拟TNF－α表位的环七肽克隆LCS－7（c-RRPAQSG-c)为靶，筛选噬菌体线性十二肽库；用间接ELISA及竞争试验鉴定阳性克隆。结果：对噬菌体十二肽库进行3轮筛选后，挑取20个克隆中有10个为阳性克隆，测序结果氨基酸序列相同：EHMALTYPFRPP。结论：以TNF－α模拟肽克隆为靶筛选得到的噬菌体十二肽克隆，能够与TNF－α结合，为TNF－α结合肽；所测得序列完全一致。上述结果提示了该筛选方法的可行性。     

利用噬菌体肽库筛选IL-2Rα模拟表位肽的研究

目的 筛选IL-2Rα模拟表位肽,为研制高效、特异性强的小分子肽类免疫抑制剂奠定基础.方法 应用离子交换层析法从小鼠腹水中纯化抗人IL-2Rα单克隆抗体5G1,细胞ELISA方法检测其特异性.用5G1单抗筛选噬菌体环七肽库,并对噬菌体克隆进行抗原性鉴定.根据阳性克隆的DNA序列合成环肽并鉴定其生物活性.结果 经5轮筛选、鉴定,获得5个与5G1有较强结合特性的噬菌体阳性克隆.DNA测序并推导氨基酸序列,得到Lys-X-{X}-Lys-Gly保守序列.依此序列合成环七肽CP,小鼠淋巴细胞增殖试验证实其有免疫抑制活性.结论 环肽CP为IL-2Rα模拟表位肽,可作为IL-2Rα的拮抗剂发挥免疫抑制效应.     

广谱抗革兰氏阴性菌单克隆抗体3A8识别表位的初步研究

目的:利用噬菌体肽库技术筛选抗广谱革兰氏阴性菌与LPS单克隆抗体3A8的识别表位,以获得来源于不同LPS的保守表位.方法:用广谱抗G-菌、LPS的单克隆抗体3A8为靶,筛选噬菌体环七肽库,蚴鉴定阳性噬菌体克隆并测序.根据阳性保守序列合成短肽A2及A5,并与KLH载体交联,ELISA鉴定A2-KLH、A5-KLH与3A8单抗的结合.结果:随机挑选的33个噬菌体克隆中有15个可特异性与3A8结合,该结合可被LPS2630所抑制.根据阳性克隆DNA序列推导氨基酸序列,共有7种序列,均以疏水氨基酸为主,且包含保守序列Ser Pro Pro/Pro X Pro;选择所获阳性序列经设计与改造合成延长的两个环肽;经ELISA鉴定表明这些环肽可特异地与3A8结合.结论:得到可被3A8单抗特异性识别并含保守残基Ser Pro Pro/ProX Pro的阳性序列,据此合成的短肽可特异性结合3A8,提示该短肽可能模拟LPs共同表位的抗原性,有望成为疫苗候选表位.     

Utilisation of bacteriophage display libraries to identify peptide sequences recognised by equine herpesvirus type 1 specific equine sera

Three filamentous phage random peptide display libraries were used in biopanning experiments with purified IgG from the serum of a gnotobiotic foal infected with equine herpesvirus-1 (EHV-1) to enrich for epitopes binding to anti-EHV-1 antibodies. The sequences of the amino acids displayed were aligned with protein sequences of EHV-1, thereby identifying a number of potential antibody binding regions. Presumptive epitopes were identified within the proteins encoded by genes 7 (DNA helicase/primase complex protein), 11 (tegument protein), 16 (glycoprotein C), 41 (integral membrane protein), 70 (glycoprotein G), 71 (envelope glycoprotein gp300), and 74 (glycoprotein E). Two groups of sequences, which aligned with either glycoprotein C (gC) or glycoprotein E (gE), identified type-specific epitopes which could be used to distinguish between sera from horses infected with either EHV-1 or EHV-4 in an ELISA using either the phage displaying the peptide or synthetic peptides as antigen. The gC epitope had been previously identified as an immunogenic region by conventional monoclonal antibody screening whereas the gE antibody binding region had not been previously identified. This demonstrates that screening of phage display peptide libraries with post-infection polyclonal sera is a suitable method for identifying diagnostic antigens for viral infections such as EHV-1.     

从ＨＣＶ核心蛋白噬菌体随机展示肽库中筛选抗原表位

目的 探讨病毒抗原序列研究的新方法。方法 应用噬菌体展示技术,筛选ＨＣＶ核心蛋白的抗原序列,用抗－ＨＣＶ核心抗体单独阳性的血清,对已构建的ＨＣＶ核心蛋折扣长菌体随机展示肽库进行４轮筛选,检测筛选阳性的克隆数、插入阳性率和杂交阳笥率来评价筛选的效果。测定和分析了７个序列中,６个为ＨＣＶ核心蛋白序列,其中５个被正常地展示于噬菌体表面,１个可能被正确展示。这些序列均含有重要的ＨＣＶ核心抗原表位。另１个为大肠杆菌nrfa基因。结论 噬菌体展示技术完全可应用于病毒蛋白抗原序列的筛选,并具有简便、快速、准确的优点。     

Phage-displayed peptides mimicking the discontinuous neutralization sites of puumala Hantavirus envelope glycoproteins.

We selected peptide ligands mimicking the surface structure of discontinuous binding sites of Puumala hantavirus-neutralizing monoclonal antibodies from a random 18-amino acid peptide library containing a disulfide bridge in a fixed position and displayed on a filamentous phage. The varying of selection conditions, either by shortening of the association time or by competitive elution with antigen, was crucial for the selection of peptide inserts that could be aligned with the primary sequences of the envelope glycoproteins G1 and G2. Correspondingly, when the envelope glycoprotein sequences were synthesized as overlapping peptides as spots on membrane, the same site in primary structure was found as with phage display, which corroborates the use of the two methods in mapping of conformational epitopes. Also, epitopes reactive with early-phase sera from Puumala virus infection were defined with the pepspot assay in the amino-terminal region of G1. Similarities of the selected phage clones to a monoclonal antibody-escape mutant site and to a linear early-phase epitope were found.     

从噬菌体15肽库中筛选乙脑病毒糖蛋白模拟肽

目的 用抗JEVE蛋白的mAb2H4筛选噬菌体15肽库,以研究JEVE蛋白模拟肽。方法 用生物素标记的mAb2H4,对噬菌体随机15肽库进行3轮筛选,经ELISA鉴定后,随机挑战取10个阳性噬菌体克隆测序,并与JEVE蛋白进行同源性比较,结果 筛选到的噬菌体能与mAb2H4特异地结合,并且这种结合可被天然JEV抗原所抑制,10个阳性噬菌体克隆的氨基酸序列相同,均为RQD-PQWPYANSTIAR,同源分析表明,在JEVE蛋白不同区域有两个同源性较高的序列：STXAR和WXXAXST,阳性噬菌体展示肽了能与抗天然JEV抗原的鼠血清产生特异性反应。结论 筛选的该噬菌体克隆展示肽可模拟JEVE蛋白的部分抗原性。     

用噬菌体肽库筛选IBDV单克隆抗体的模拟表位

目的:筛选法氏囊病毒(IBDV)单克隆抗体所针对的模拟抗原表位。方法:以纯化的3株IBDV单克隆抗体为靶分子用噬菌体12肽库筛选相应抗原模拟表位;应用间接和竞争ELISA鉴定所筛选的阳性样品;最后对与抗体高亲和结合的噬菌体进行测序分析。结果:经过四轮淘洗,随机挑取30个克隆经间接ELISA鉴定,发现其中22个克隆结合活性较高。进一步应用竞争ELISA,获得14个噬菌体克隆,其抑制率高达50%以上。对这些噬菌体进行DNA测序,并分析比对了IBDV相应序列,确定了3个抗原模拟表位。结论:通过噬菌体随机肽库成功筛选出3个IBDV模拟表位,为进一步研究IBDV抗原性质奠定了基础。     

从噬菌体随机环七肽库筛选可模拟C1qR的C1q结合肽

为获得能结合C1q并模拟C1q受体 (C1qR )配体结合位点的短肽 ,以C1q为钓饵蛋白筛选噬菌体环七肽库 ,采用C1q结合ELISA、U937细胞配体结合抑制试验、多聚IgG (AIgG )竞争抑制试验鉴定阳性克隆 ,再进行单链DNA测序和分析。结果经 3轮筛选后 ,随机挑选 2 3个噬菌体克隆进行ELISA鉴定 ,10个克隆与C1q有较强的结合 ;利用U937细胞配体结合抑制试验 ,得到了 7个阳性克隆 ;从其展示肽DNA测序结果推导氨基酸序列 ,获得 7个短肽序列 :QTPFQLW、NPFNWTS、SPFXLTS、FLTWLDP、FSTFLYP、GPMWWSY和NPFXLIL。     

用噬菌体展示随机12肽库筛选HCV B细胞抗原表位

目的用患者血清中抗丙型肝炎病毒(HCV)抗体从噬菌体展示随机12肽库筛选HCV抗原表位。方法用硫酸铵粗提HCV患者血清中Ig后用DEAE—Sephadex A50层析纯化并作为筛选的配基;对噬菌体展示随机12肽库采用配基亲和富集、阴性血清吸收的方法进行生物淘洗;ELISA鉴定筛选克隆的结合特性;测定阳性克隆所携带DNA序列并进行计算机辅助分析。结果三轮生物淘洗后特异性克隆得到了富集。用第3轮淘洗出的26个克隆进行结合实验,其中有3个克隆与HCV患者血清结合力较高而与正常人血清结合能力较弱;序列分析发现2个序列与HCV蛋白第1082～1093和1954～1965位(1082YHGAGTRTIASP 1093和1954TQLLRRLHQWIS 1965)氨基酸有较高的同源性;计算机辅助分析提示这两个位点具有形成表位的性质。结论获得了两个HCV抗原表位,在HCV感染的检测中具有潜在的应用价值。     

噬菌体随机肽库分析HIV-1 p24抗原表位

目的：利用噬菌体随机肽库分析抗HIV－1核心区抗原p24单抗体在抗原上的识别位点。方法：用抗HIV－1 p24单抗2C7和3H10作为筛选分子，对噬菌体肽库进行生物洗（biopanning)，并通过DN测序、ELISA效价测定等对所获得的噬菌休克隆进行鉴定，最后对合成的7肽位点通过间接ELISA及免疫抑制试验进行血清学分析。结果：序列分析结果表明，单抗2C7和3H10在HIV－1 p24上的抗原识别表位的保守序列分别为DHPXPXX和XXXXKAF。分别合成这2个7肽氨基酸序列P－C1（DHPSPWG）和P－H3（SPWLKAFGGS），并分析其免疫学结合特性，结果表明与P－H3相比，单抗2C7的抗原识别表位P－C1的固相结合特性较好，固相P－C1检测血样，13份抗HIV阳性本中，12份为阳性（检出率为92．3％），19份抗HIV阴性样本中，仅1份为假阳性结果（特异性为94．7％），与P－C1相比，单抗3H10的抗原表位P－H3的固相结合能力极差，但液相结合活性较好，血样与P－H3的抑制试验表明，13份抗HIV阳性样本中12份样本对P－H3的抑制率大于60％（12／13），而9份抗HIV阴性样本中仅1份对P－H3的抑制率大于50％，结论：用抗HIV－1 p24单抗筛选噬菌体随机肽库，获得单抗在p24抗原上的识别表位的氨基酸序列，血清学结果表明这2个抗原表位存在于p24自然抗原上，在抗HIV－1的感染检测中具有潜在的应用价值。     

大肠杆菌脂多糖2630模拟位的研究

目的 :利用纯化的抗大肠杆菌L2 6 30多抗筛选噬菌体环七肽库 ,以获得可模拟脂多糖 (LPS)表位的短肽克隆。方法 :以亲和层析纯化的抗大肠杆菌L2 6 30多克隆抗体为靶分子 ,筛选噬菌体随机环七肽库 ,用双夹心ELISA和竞争抑制ELISA鉴定阳性噬菌体克隆的抗原性。结果 :对噬菌体环肽库进行 3轮筛选后 ,随机挑选 2 0个克隆 ,经鉴定其中 12个可与抗L2 6 30抗体结合 ,即为阳性克隆 ;其中有 5个阳性噬菌体克隆表现出与抗鼠伤寒沙门氏菌LPS多抗结合的活性 ,提示这 5个噬菌体展示的短肽具有模拟大肠杆菌LPS及鼠伤寒沙门氏菌LPS共同表位的性质。经DNA序列分析显示 ,其中 8个克隆的氨基酸序列具有X DGLL XX或X EDGLL X保守序列 ,其余 4个克隆的序列均不相同。结论 :筛选获得的噬菌体环七肽克隆具有模拟大肠杆菌LPS表位的活性 ,为大肠杆菌L2 6 30多表位模拟短肽。其中 5个阳性噬菌体克隆短肽具有模拟大肠杆菌LPS及鼠伤寒沙门氏菌LPS共同表位的活性