布鲁氏菌基因组学研究进展北大核心CSCD

布鲁氏菌是一类革兰氏阴性、胞内寄生菌,缺乏经典的毒力因子,致病性不仅依靠侵袭力和内毒素,还有赖于较强的环境适应能力。目前,布鲁氏菌入侵机体和在胞内持续存在的机制尚未明确。布鲁氏菌基因组学研究不仅可全面了解布鲁氏菌的基因组成、分子进化、毒力因子以及致病机制等特点,还可以对一些致病相关基因和重要的蛋白进行预测。该研究为开发研究疫苗和新型抗生素提供分子基础,从而为构建新的有效的布病治疗和防控策略提供理论依据。本文就布鲁氏菌的基因组组成、特征,全基因组测序分析、比较基因组研究进展予以概述。     

布鲁氏菌毒力基因的研究状况

随着马耳他布鲁氏菌、猪布鲁氏菌和流产布鲁氏菌的全基因组被破译,发现这三种布鲁氏菌的染色体序列、组成和结构非常相似。染色体的序列测定和阐明为布鲁氏菌蛋白质的研究和分析铺平了道路,与以前通过分析染色体来推测布鲁氏菌的毒力比较,这对后基因组时代完全弄清楚不同布鲁氏菌种生物学特征的研究提供了可能性。而对基因结构和功能的大量研究,很多与致病性和毒力有关的基因发现,将为弄清楚布鲁氏菌的致病机制打下坚实的基础,     

创伤弧菌基于基因组学的毒力因子及耐药基因的研究进展

创伤弧菌是一种致命的机会致病菌,在目前食源性疾病中致死率最高。创伤弧菌主要通过摄入未煮熟的海产品以及破损皮肤接触海水引起感染,病情恶化后导致危及生命的败血症。基因组学测序技术的发展迅速,在美国国家生物技术信息中心（NCBI）数据库中已公布的创伤弧菌基因组草图序列285株,完成图序列24株。创伤弧菌基因组学的研究,不仅有利于精确分型、进化关系和致病机制的研究,还利于对毒力因子、耐药基因进行预测,在创伤弧菌引起的食物中毒后进行快速检测、流行病学调查和预防发挥重要作用。目前针对创伤弧菌耐药性分析的研究较少,本文从创伤弧菌的基因组学角度出发,对重要毒力因子、抗生素耐药情况、耐药机制及耐药基因予以概述。     

布鲁氏菌减毒活疫苗株的比较基因组学研究

摘要：目的 探究布鲁氏菌减毒活疫苗株与亲本株的分子遗传差异。方法 通过布鲁氏菌全基因组DNA芯片对4株减毒活疫苗株进行比较基因组学研究。结果 通过比较基因组学研究,发现疫苗菌株中的存在大片段基因缺失,同时也发现一些基因以多拷贝形式存在。4株减毒活疫苗株分别缺失不同数目的功能基因,主要为胞内活动有关基因和功能未知基因（分别为31和45个）。较深入地认识了布鲁氏菌减毒活疫苗株基因构成上的差异、免疫原性和保护力的遗传基础。结论 与亲本株相比, 4株减毒活疫苗株缺失了大量基因,构成了不同疫苗株差异的遗传基础。     

不同来源金黄色葡萄球菌的全基因组序列分析北大核心CSCD

目的了解不同来源金黄色葡萄球菌(简称金葡菌)的全基因组序列基本特征,探究菌株的分子分型、耐药基因型、毒力及其遗传进化关系。方法应用solexa高通量测序技术对10株医源性和食源性代表株金葡菌进行全基因组测序,以此进行多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)、金葡菌a蛋白(Staphylococcus aureus protein A,spa)基因分型分析,并比较分析不同菌株基因组中携带耐药基因和毒力因子,筛选核心基因,构建系统进化树。结果10株金葡菌染色体基因组大小相似,均为2.7Mbp,包含有2486~2648个基因不等,平均长度约为887bp。耐药基因注释分析显示9株甲氧西林敏感金葡菌(MSSA)携带的耐药基因少于另一株耐甲氧西林金葡菌(MRSA)。尽管在不同菌株基因组之间的毒力因子数量无显著区别,但不同菌株存在的毒力因子却不同,食品来源金葡菌基因组携带1~4种数量不等的肠毒素基因。进化树分析显示不同来源金葡菌位于不同进化分支,2株为ST8型的MSSA和MRSA进化亲缘性较高,属于同一进化分支内。结论获得10株不同来源金葡菌的全基因组序列数据,并证实食源性或医院来源金葡菌为了适应不同生存环境,通过不同分子进化机制,获得不同耐药基因和毒力因子,形成菌株特定的分子遗传特征,可为金葡菌的分子流行病学和致病性机制研究提供参考依据。     

结核分枝杆菌相关毒力基因的研究进展

在结核病的发生过程中,毒力起着重要的作用,因为只有毒力菌株才可致病.结核菌的毒力可以理解为其引起结核病的能力,而致病性与毒力因子总是联系在一起的.结核菌是典型的胞内寄生菌,但只有有毒株才能在细胞内存活和繁殖.毒力因子在毒力株的巨噬细胞复制中起关键作用,目前对毒力相关基因及毒力因子作用机制知之甚少.本文将对几个研究较多的毒力相关基因作一综述.     

结核分枝杆菌相关毒力基因的研究进展

在结核病的发生过程中,毒力起着重要的作用,因为只有毒力菌株才可致病.结核菌的毒力可以理解为其引起结核病的能力,而致病性与毒力因子总是联系在一起的.结核菌是典型的胞内寄生菌,但只有有毒株才能在细胞内存活和繁殖.毒力因子在毒力株的巨噬细胞复制中起关键作用,目前对毒力相关基因及毒力因子作用机制知之甚少.本文将对几个研究较多的毒力相关基因作一综述.     

α疱疹病毒囊膜糖蛋白gI影响病毒毒力的分子机制

α疱疹病毒囊膜糖蛋白gI由非必需基因US7编码,在病毒的致病机制中扮演着重要角色。目前研究表明囊膜糖蛋白gI可分别通过参与二次囊膜包被、促进胞间传播在α疱疹病毒粒子组装和扩散过程中发挥重要作用;该蛋白还可以从促进病毒在神经元的轴突转运以及抵抗机体免疫应答等方面影响病毒的毒力。本文对囊膜糖蛋白gI影响α疱疹病毒毒力的分子机制进行总结,为深入研究此蛋白的功能、阐述疱疹病毒的致病机理及疾病防控提供参考。     

结核分枝杆菌相关毒力基因的研究进展

在结核病的发生过程中,毒力起着重要的作用,因为只有毒力菌株才可致病.结核菌的毒力可以理解为其引起结核病的能力,而致病性与毒力因子总是联系在一起的.结核菌是典型的胞内寄生菌,但只有有毒株才能在细胞内存活和繁殖.毒力因子在毒力株的巨噬细胞复制中起关键作用,目前对毒力相关基因及毒力因子作用机制知之甚少.本文将对几个研究较多的毒力相关基因作一综述.     

铜绿假单胞菌Ⅲ型分泌系统的研究进展

铜绿假单胞菌是临床常见的重要条件致病菌,具有多种毒力因子,能引起各种急慢性感染。其中最重要的毒力因子是Ⅲ型分泌系统,主动向宿主细胞靶向输送效应蛋白,引起宿主细胞的病理变化,并逃避免疫细胞的降解。研究Ⅲ型分泌系统不仅有助于明确铜绿假单胞菌的致病机制,更重要的是为临床治疗及新药研发提供新思路。     

布鲁氏菌重要膜蛋白研究进展

布病是由布鲁氏菌属细菌引起的一种重要的人兽共患病,在世界范围内广泛分布。布病不仅可导致巨大的经济损失,也是威胁人群健康的主要风险因素。布鲁氏菌外膜蛋白是主要的免疫和保护性抗原,不仅与布鲁氏菌的毒力和细胞内生存有密切的关联,而且对开发和建立新型的特异性血清学诊断方法具有重要的意义。本文对布鲁氏菌的重要外膜蛋白的研究进展予以综述,从而更好的理解布鲁氏菌表面蛋白的抗原特性,为建立布病实验室诊断方法和新型疫苗研发提供参考。     

布氏菌与巨噬细胞的相互作用机制

布氏菌病是由布氏菌感染引起的、严重的人兽共患传染病。病原是一种革兰氏阴性、兼性胞内寄生菌。巨噬细胞既是重要的固有免疫应答细胞同时又是布氏菌感染的重要靶细胞,布氏菌进入宿主后在一系列毒力因子的帮助下侵入宿主的巨噬细胞中,并通过多种机制抵抗巨噬细胞的杀菌作用,有利于其在巨噬细胞内生存和繁殖;同时巨噬细胞也可通过一系列机制抵抗布氏菌的感染。通过研究布氏菌与巨噬细胞的相互作用机制对于布氏菌病的防治具有重要的指导意义。     

蓝氏贾第鞭毛虫特异性细胞骨架蛋白——贾第素研究进展

蓝氏贾第鞭毛虫具有由微管、微丝和骨架蛋白构成的高度发达的细胞骨架系统.近年来,贾第虫的细胞骨架与其致病力的密切关系已经得到证实.在参与细胞骨架构成的众多蛋白质中,特异性细胞骨架蛋白——贾第素是其中重要的成分之一.对贾第素的研究不仅可为贾第虫细胞骨架的研究增添新的知识和研究资料,还可为贾第虫病的致病机制及抗贾第虫药物靶点的选择提供实验依据.     

布鲁氏菌A19疫苗株全基因组测序及比较基因组学分析

目的 探索布鲁氏杆菌A19疫苗株全基因组的结构、分子生物学的功能,并对其生物信息学进行研究。方法 采用Illumina Hiseq 4000和PacBio对A19进行全基因组测序,并与GenBank 上的8株菌进行比较基因组学解析。A19基因组3 286 167 bp, 预测3 371个基因,GC含量57.25%。通过注释COG库,对应基因有2 560个,将其归入22类COG中;根据比对KEGG库,得到2 544个基因,共参与33类代谢通路。结果 综合两个数据库结果发现,大多数A19预测基因中的基因功能主要与膜运输、氨基酸转运及碳水化合物代谢有关。结论 通过分析发现, A19和猪羊牛种布鲁氏菌之间存在一定差异,并找出牛种毒力基因。本实验通过测序A19全基因组,为布鲁菌疫苗的研究提供思路。     

The Brucella suis genome reveals fundamental similarities between animal and plant pathogens and symbionts

The 3.31-Mb genome sequence of the intracellular pathogen and potential bioterrorism agent, Brucella suis, was determined. Comparison of B. suis with Brucella melitensis has defined a finite set of differences that could be responsible for the differences in virulence and host preference between these organisms, and indicates that phage have played a significant role in their divergence. Analysis of the B. suis genome reveals transport and metabolic capabilities akin to soil/plant-associated bacteria. Extensive gene synteny between B. suis chromosome 1 and the genome of the plant symbiont Mesorhizobium loti emphasizes the similarity between this animal pathogen and plant pathogens and symbionts. A limited repertoire of genes homologous to known bacterial virulence factors were identified.     

布鲁氏菌噬菌体基因组学研究进展北大核心CSCD

布鲁氏菌噬菌体用于鉴定和鉴别布鲁氏菌种属,其种类、遗传特性以及基因组功能对布鲁氏菌鉴别分型具有重要作用,因此布鲁氏菌噬菌体的研究备受关注。基于当前的研究进展,本文对布鲁氏菌噬菌体的基本特征、基因组功能、基因组比对以及最新应用技术的相关研究进行综述,在了解布鲁氏菌噬菌体基因多样性和复杂性的基础上,进一步认识噬菌体与宿主的相互作用机制。     

基于全基因组测序的甲型副伤寒沙门菌暴发疫情分离株分子特征研究

目的 分析一起甲型副伤寒暴发疫情菌株的分子分型特征,为病原菌的确定和暴发疫情的防控提供科学依据。方法 利用生化试验、血清学试验对病原菌进行鉴定,并将分离到的病原菌进行微量肉汤稀释法药物敏感性试验、PFGE分子分型分析、全基因组测序,利用全基因组数据与沙门菌MLST标准数据库比对获得序列型别(ST)、cgMLST序列号以及rMLST序列号并进行聚类分析,通过细菌基因组分析平台fIDBA分析病原菌的耐药、毒力相关基因。结果 11株沙门菌血清型均为甲型副伤寒沙门菌,具有100%相似性的PFGE带型,MLST、cgMLST、rMLST的型别均分别为ST129型、cgST-2191型、rST3678型,表明此次暴发疫情菌株从分子特征角度可诊断为同一传染源导致。对萘啶酸100%耐药,对链霉素100%中介。发现本次疫情菌株基因组均携带29种耐药基因。通过毒力因子数据库比对,均携带21类250种已知毒力基因,其中以Ⅲ型分泌系统、粘附、鞭毛等最为常见。结论 本次暴发疫情是由共同来源的、具有相同分子分型特征的甲型副伤寒沙门菌引起。在病原溯源研究中,应用全基因组数据可更精细分析菌株遗传进化特征、亲缘关系及毒力基因、耐药基因携带情况,可以作为替代PFGE、MLST的技术用于更精准的传染病分子流行病学调查分析研究。     

布鲁氏菌TIR结构域蛋白TcpB的研究进展

布鲁氏菌病是由布鲁氏杆菌感染引起的一种人兽共患病,其感染的重要特征是机体的免疫功能受到抑制。布鲁氏菌TIR结构域蛋白TcpB具有多种免疫抑制功能,在逃避宿主免疫应答中具有重要作用。谨就布鲁氏菌TcpB的基本结构、免疫调节功能和分子机制的研究进展综述,以便理解TIR结构域蛋白TcpB在布鲁氏菌致病中介导的免疫抑制机制,有助于更好理解布鲁氏菌的致病机理,为诊治布鲁氏菌病提供新思路。     

布鲁氏菌疫苗株S2全基因组测序及牛羊布鲁氏菌比较基因组学研究

目的 为了了解布鲁氏菌S2疫苗株全基因组结构及分子生物学功能。方法 对布鲁氏菌疫苗株S2进行全基因组测序,并与GenBank公布的6株牛羊布鲁氏菌进行比较基因组学研究。结果与结论 通过全基因组测序发现S2基因组大小为3 331 982 bp,预测基因有3 243个,GC含量为57.23 %。S2预测基因中大多数基因功能主要与糖代谢﹑氨基酸代谢﹑氨基酸转运和膜转运有关。通过比较基因组学研究发现S2有20个特有基因。另外S2与GenBank公布的S2序列进行比对发现有19个差异基因。