蛋白质组学:药理学研究的新动力

仅仅完成基因组的测序对于阐明生物学特性是远远不够的 ,蛋白质组学由于可大规模的研究基因在蛋白水平的表达而成为了基因组学研究的重要补充。由于几乎所有的药物都是通过蛋白质发挥作用 ,蛋白质组学在药物研究中已取得了广泛的应用 ,包括药理学中的药物作用靶点、毒理学机制以及耐药性研究等。     

蛋白质组学在药物研究中的应用

随着后基因时代的到来,蛋白质组学得到了迅猛的发展,与蛋白质相关的药物研究在这一领域也取得了巨大的进展。本文主要介绍了蛋白质组学的主要技术,和蛋白质组学在药物研发中的应用进展。     

新的分析技术在现代临床药学研究中的应用

人类基因组计划 (ｈｕｍａｎｇｅｎｏｍｅｐｒｏｊｅｃｔ,ＨＧＰ)完成了人类基因组草图 ,随后公布了人类基因组“初步解析”。 2 0 0 1年 6月在意大利举行了国际蛋白组学会议 ,10月制订了人类蛋白质组计划 ,从而开始进入了人类后基因组时代。近年来 ,由于人类基因组计划实施的深入 ,促进了有关分析技术的发展。天然药物、合成新药和蛋白质多肽类基因工程药物的不断涌现 ,对临床药学提出了新的要求。随着临床药学领域的扩大和要求的提高 ,新的分析技术在现代临床药学研究中的应用有了更新的进展。1　体液中药物生物活性新测定法药物生物活性…     

疾病蛋白质组学研究中选材与样品制备的策略分析

1994年Wlliams和Wilkins两位学者首先提出与基因组相对应的＂蛋白质组＂（proteome）概念,广义上指某一细胞或组织的基因组表达的所有蛋白质。蛋白质组学是近年来应用各种技术手段对蛋白质组进行综合分析的一门新兴学科,目前广泛应用于生命科学各个研究领域。目前蛋白质组学研究发展十分迅速,无论是理论还是技术都得到不断完善和突破，成为我们探索疾病病因、发病机制、判断预后及药物开发等的有力工具。     

药物蛋白质组学研究概况

蛋白质组学（Proteome）一词是澳大利亚Macquie大学的Wilkins和Williams在1994年首次提出，最早的文献是在1995年7月《E1ectmph0Tesis》杂志上，定义是微生物基因组表达的整套蛋白质。随着人们深入研究，蛋白质组的概念也在不断发生变化。现在的蛋白质组的概念是在一种细胞内存在的全部蛋白质，人们利用图谱和图象分析技术，在整个蛋白质组水平提供了研究细胞通路、疾病、药物相互作用的可能性，有所提高，本文就蛋白质组学在药物研究中的作用做一综述。     

表达蛋白质组学在抗肿瘤药物研发中的应用

表达蛋白质组学主要对正常、疾病或药物处理细胞或亚细胞中的所有蛋白质进行定性或定量研究。近年来表达蛋白质组学对抗肿瘤药物的研发起到了一定的推动作用。本文通过检索相关数据库文献,对其进行梳理、总结和归纳,阐述了表达蛋白质组学在抗肿瘤药物研发中的应用,包括抗肿瘤药物靶点发现、药物作用机制阐明、临床诊断以及基于网络药理学的药物研发理念的实现等。尽管表达蛋白质组学本身还存在一些缺陷,但随着其技术的不断发展,必将进一步促进抗肿瘤创新药物的研发。     

中医证候学与蛋白组学探析

1蛋白质组学的概述 蛋白质组学和功能蛋白质组学随着蛋白质组的提出,蛋白质组学（Proteomics）也自然而然地孕育产生。但目前,蛋白质组学仍无明确的定义。一般认为它是研究蛋白质组或应用大规模蛋白质分离和识别技术研究蛋白质组的一门学科,是对基因组所表达的整套蛋白质的分析。现阶段,蛋白质组学研究的内容不仅包括对各种蛋白质的识别和定量化,还包括确定它们的细胞内外的定位、修饰、相互反应、活性,和最终确定它们的功能。     

蛋白质组学在中药现代化研究中的应用进展

随着后基因组时代的到来,蛋白质组学的地位被提升到了前所未有的高度,其研究成果已经广泛应用于医学、药学、农学等相关领域。本文通过查阅国内外文献,对蛋白质组学在中药现代化研究中的应用做一综述。     

代谢组学在药学中的应用

代谢组学是继基因组学和蛋白质组学之后发展起来的一种研究生物系统的组学方法。通过分析生物体液及组织中所有小分子物质以研究有机体内物质代谢规律和健康状况。代谢组学是新药研究开发的重要组成部分,本综述就代谢组学与药学研究的关系、代谢组学用于药学研究的特点和优势及其在药物研究中的应用等相关的问题进行阐述。     

蛋白质组学及其在消化道肿瘤中的研究进展

随着人类基因组计划的完成,后基因组时代即蛋白质组学的研究已拉开了序幕。其主要任务是分析和鉴定细胞内基因所表达的全部蛋白质的结构、功能、相互作用以及它们在疾病过程中的作用。1蛋白质组学的概念广义上讲,蛋白质组是指“一个细胞或一个组织基因组所表达的全部蛋白质”。     

磷酸化蛋白质组学在药物研究中的应用进展

目的:了解磷酸化蛋白质组学在药物研究中的应用现状,为促进其更好地服务于药物研究提供参考。方法:查阅近年来国内外相关文献,对磷酸化蛋白质组学在药物研究中的应用进展进行归纳和总结。结果与结论:磷酸化蛋白质组学虽然是蛋白质组学的一个新分支,但却明显有别于蛋白质组学,主要体现在其调节生命活动方面。药物研究过程中的几个重要方面包括目标识别、作用机制阐明、信号网络构建、药物重新定位和复合分层、药物毒性预测、药效学和目标接触生物标志物识别以及患者的分层等,而在计算机软件分析的帮助下,利用磷酸化蛋白质组学技术有助于以上各个方面研究的顺利开展。磷酸化蛋白质组学技术在药物研究过程中正在发挥越来越重要的作用。     

蛋白质组学在药物研究中的应用

蛋白质组是指基因组表达的所有相应的蛋白质，是指细胞或组织或机体全部蛋白质的存在及其活动方式。蛋白质组具有多样性和可变性，同一机体的不同细胞中，蛋白质的种类和数量是各不相同的，即使是同一种细胞。在不同时期、不同生理条件下，其蛋白质组都是在不断变化之中，在病理过程或药物作用下，细胞蛋白质的组成及其变化，与正常生理过程也是不同的。蛋白质组学是从整体的蛋白质水平上，从生命本质的层次上，研究和发现生命活动的规律和重要生理、病理现象的本质。蛋白质的研究技术主要应用于两个方面，一个是特殊细胞、组织或有机体的系统鉴定和所有蛋白的定量，这是系统生物学的核心，可以提供一个完全量化的含翻译后修饰变体的蛋白质组，更重要的是可以在相关样品中寻找差异，即在生理状态发生变化而产生的蛋白质图谱中的差异。另一个方面主要是蛋白质功能和蛋白质相互作用的研究，包括如蛋白质序列、结构、相互作用和生化活性的分析等多种试验方法。药物蛋白质组学的重要研究内容在临床前包括新药和靶的发现、药物作用模式、毒理学研究，在临床研究方面包括疾病特异性蛋白作为有效患者选择的依据和临床试验的标志。应用类似于药物遗传学的方法，按照蛋白质谱来分类患者，并预测药物作用疗效。     

蛋白质组学技术在药物肝毒性研究中的应用

蛋白质组学技术的发展促进了许多学科的发展,毒理蛋白质组学(toxicoproteomics)整合了经典毒理学、病理学和蛋白质差异表达分析技术,使毒理学研究上升到了一个新的高度。药物性肝损伤是肝脏疾病的一个重要原因,也是药物开发所面临的一项重大挑战。现就蛋白质组学的主要技术,包括双向凝胶电泳-质谱(2-DE-MS)、液相色谱-串联质谱(LC-MS-MS)、保留色谱-质谱(RC-MS)和蛋白质阵列,以及其在药物肝毒性研究中的应用,包括毒性蛋白标志物的筛选、毒性机制研究、毒性预测与毒性蛋白质数据库的建立方面进行综述。     

蛋白质组学及其在肝癌诊疗中的研究进展

蛋白质组学是一门在大规模水平上研究某一类型细胞、组织或体液中的所有蛋白质组成及其功能的新兴学科。其以细胞或器官表达的所有蛋白质为研究对象,通过凝胶电泳、生物质谱及生物信息学等技术,达到分离、鉴定、分析蛋白质的目的。肝癌是世界上病死率较高的恶性肿瘤之一,运用蛋白质组学技术,可以了解肝癌的发生、发展机制,在诊断和治疗方面产生价值。本文将解释蛋白质组学的概念及主要技术,介绍蛋白质组学在肝癌研究中的意义,阐述蛋白质组学在肝癌的早期诊断,标记物的筛选以及药物靶标的选择中体现出的重要应用。随着蛋白质组学的逐步完善和现代生物技术的迅速发展,这项技术将在肝癌等生命科学领域发挥更显著的作用。     

神经系统疾病线粒体蛋白质组学研究进展

蛋白质组学是对一个基因组或一种细胞、组织、器官所表达的全部蛋白质成分进行分析的新兴学科,其中亚细胞蛋白质组学的研究尤为重要,因为它不仅降低了蛋白质组的复杂程度,而且能够提示蛋白质的定位和功能信息,蛋白质组     

同位素标记相对和绝对定量技术在药物蛋白质组学研究中的应用

目的建立应用同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ)技术进行药物蛋白质组学研究的技术平台。方法分别测定12例高血压患者在给予降压药氨氯地平治疗前和治疗后8周的收缩压和舒张压,并同时收集患者在降压药治疗前和治疗后8周的血清,应用蛋白质组学iTRAQ技术对治疗前后的血清蛋白质组进行定量分析。结果高血压患者口服降压药苯磺酸氨氯地平片8周后平均收缩压和舒张压均明显降低(P<0.01)。经iTRAQ和ProteinPilot软件分析,共鉴定出232个差异蛋白质,其中降压药物治疗后表达上调和下调超过1.5倍的蛋白质分别有12种和13种。上调的蛋白质主要参与应激、防御和免疫反应,而下调的蛋白质主要参与应激、防御、炎症和凝血反应。本研究结果提示,降压药氨氯地平治疗可以双向调节机体的应激和防御反应,可以增强机体的免疫力,抑制炎症反应和改善高血凝状态,从而有利于血压的降低。结论应用iTRAQ技术进行药物蛋白质组学研究可筛选获得多种与药物疗效相关的差异蛋白质,为药物作用靶点和分子机制等方面的研究提供了一个良好的技术平台。     

化学蛋白质组学与药物靶点的发现

小分子药物靶点的发现对于生物和医学的研究者而言,是一项既重要又艰巨的任务,医学和药学界研究工作者急切需要发现和确认新的靶点。为了克服药物靶点确认的瓶颈,已经发展了许多新技术用以研究小分子化合物与蛋白质分子间的相互作用,其中包括化学蛋白质组学方法。化学蛋白质组是全蛋白质组学研究的一个亚类,化学蛋白质组学是利用能够与靶蛋白质发生特异性相互作用的化学小分子来干扰和探测蛋白质组,在分子水平上系统揭示特定蛋白质的功能以及蛋白质与化学小分子的相互作用,从而准确找到药物作用靶点的组学研究方法。化学蛋白质组学技术和方法不断成熟,在药物作用靶点的发现、确认和药物多靶点研究等方面都将起到重要的作用,并将大大提高药物发现的效率。     

蛋白质组和蛋白质组学

蛋白质组(proteome)一词由澳大利亚学者Wilkias于1994年首先提出，指基因组表达的全部蛋白质，或细胞、组织、机体在特定时间和空间所表达的所有蛋白质。蛋白质组学(proteomies)的定义为一门系统地研究蛋白质特性、数量和功能的科学。蛋白质组学方法的建立为在蛋白质水平研究生命活动和人类疾病提供了新的有效手段。     

蛋白质组学技术在网络药理学中的应用

蛋白质组学发展至今已日趋成熟,在生物医药相关领域研究中的应用显著增加,与之相关的样品制备技术、蛋白定量方法及先进的质谱仪器也得到了快速发展。网络药理学是近年来提出的新药发现新策略,是药理学的新兴分支学科,它从整体的角度探索药物与疾病的关联性,发现药物靶标,指导新药研发。将蛋白质组学技术应用于网络药理学研究用,加速药物靶点的确认,从而设计多靶点药物或药物组合。综述了蛋白质组学技术的新近研究进展,并简单概述了其在网络药理学中的应用。     

蛋白质组学在药物毒理中的应用

蛋白质是生命活动的主要承担者，一切生命活动无不与蛋白质有关。蛋白质组学是研究细胞内蛋白质组成及其活动规律，对不同时间和空间发挥功能的特定蛋白质群体的研究。本文重点介绍了蛋白质组学的理论基础和研究技术，在药物毒理研究中临床前、临床中发现毒性标志物以预测或早期发现药物毒性及毒性作用机制的研究，并简单阐述了蛋白质组学技术的发展。