基于DNA条形码—产地—形态分析联用的巴西草药DENTEDE LEO(蒲公英)的混伪品鉴定及生药学研究

目的对巴西市场上销售的药用蒲公英的混伪品进行鉴定及生药学研究。方法通过提取样品DNA、PCR扩增及双向测序,获得样品的ITS序列。采用相似度分析法进行分子鉴定;根据植物产地分布特征和形态特征验证结果,三种方法联用获得鉴定结果;分析混伪品的性状和显微特征。结果 DNA条形码研究表明巴西药用蒲公英的混伪品来源于菊科植物假蒲公英猫儿菊Hypochaeris radicata的全草,产地分析和形态分析验证了DNA条形码鉴定结果。结论巴西药用蒲公英的混伪品来源于菊科蒲公英属植物假蒲公英猫儿菊Hypochaeris radicata的全草。混伪品的生药学特征能够为巴西草药DENTE DE LEO的真伪鉴别提供依据。     

基于DNA序列的石斛属药用植物鉴定研究进展

本文从核基因组、线粒体基因组和叶绿体基因组三方面,综述了目前常用DNA序列在石斛属药用植物的分子鉴定和物种分类研究中的进展。文献显示,目前用于石斛属物种分子鉴定研究的DNA序列主要有核ITS/ITS2、LEAFY,叶绿体rbcL、matK、trnH-psbA、rpoB、rpoC1、trnL-F、rbl16、trnl intron和线粒体基因组nad1 intron2,这些DNA序列均对石斛属药用植物鉴定具有借鉴意义。笔者对叶绿体全基因组序列作为“超级条形码”在石斛属植物中应用的可行性进行了展望,以期为石斛属药用植物的鉴定研究提供参考。     

重楼属植物遗传多样性的RSAP标记

目的:研究重楼属植物DNA指纹图谱,初步探讨RSAP分子标记技术在重楼属植物遗传多样性研究上的应用.方法:采用限制性位点扩增多态性(restriction site amplification polymorphism,RSAP)技术对重楼属8个种进行基因组DNA多态性分析.结果:用10条RSAP引物即选出18对引物组合构建了8个种的DNA指纹图谱.通过遗传距离构建系统进化树,重楼属8个种的进化关系得到了很好的分辨.结论:RSAP标记能够对重楼属植物进行准确的分子鉴定,为重楼属中药材的种类鉴定和种间的分类地位提供分子生物学依据.     

中药材DNA条形码分子鉴定指导原则

随着中药材DNA条形码分子鉴定方法研究的深入与普及,国家药典委员会讨论通过在《中国药典》增补本中列入中药材DNA条形码分子鉴定指导原则,该指导原则通过对大样本量中药材进行DNA条形码分子鉴定研究,建立以ITS2为核心,psbA-trnH为辅的植物类药材DNA条形码鉴定体系和以COI为主、ITS2为辅的动物类药材DNA条形码鉴定体系.该文介绍了中药材DNA条形码分子鉴定指导原则及其起草说明,并对该原则在中药材鉴定方面的应用前景进行展望.     

现代生物技术在人参属药用植物研究中的应用

该文对DNA条形码等分子鉴定技术、一代和二代测序技术、基因克降等现代牛物技术在人参属药用植物的物种鉴定、转录组分析、次生代谢产物合成途径及关键酶功能鉴定研究中的应用进行综述.现代牛物技术为人参属药用植物在分子水平的研究提供保证,揭示了人参属药用植物转录组及功能基因等遗传信息,加速了人参属药用植物基因组图谱绘制,为阐明人参属植物中重要次生代谢产物——人参皂苷合成的分子机制、实现体外合成重要天然产物以及对未来新药物的研发奠定基础.     

基于ITS2序列白头翁属原植物及药材的DNA条形码鉴定研究

目的:利用内转录间隔区2(internal transcribed spacer 2,ITS2)序列对白头翁属基原植物、药材进行DNA分子鉴定,为白头翁属植物的种类鉴定和遗传多样性研究提供理论依据。方法:提取白头翁属植物的DNA,对其ITS2序列进行逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)扩增与测序,且从Gen Bank下载上述所属植物的ITS2序列。所有序列经DNAMAN软件拼接,采用MEGA 6.0软件比对分析以及计算相关数据,基于K2P模型构建Neighbor-Joining(NJ)系统发育树。从ITS2数据库中下载序列的ITS2二级结构信息,比较各样本间ITS2序列二级结构的差异。结果:从NJ系统发育树分析看出,所有样本被聚为3大支。白头翁属植物自成1支,银莲花属植物为1支,獐耳细辛属植物为1支,白头翁属基原植物、药材的ITS2序列完全一致,并与其他混淆药材及植物明显区分。结论:ITS2序列可对白头翁药材、原植物进行鉴别,且在近缘物种鉴定方面具有较大应用价值,可用于白头翁属植物种类的分子鉴定。     

基于叶绿体全基因组的贝母属特异性DNA条形码的筛选

本研究通过对贝母属4个物种叶绿体基因组进行全局分析,分别查找基因区域和基因间区的高变异区域,筛选用于高效鉴别贝母属植物的新DNA条形码序列。相关研究发现贝母属植物的基因区域序列相似度极高,不适用于DNA条形码鉴定研究;共有7个基因间区可以作为潜在的贝母属植物鉴定的特异性DNA条形码。本研究所构建的DNA条形码筛选方法,为筛选用于难鉴定科属的新的DNA条形码提供了通用的方法体系。     

辽宁省白头翁属植物分类与基于ITS2的DNA条形码分子鉴定

目的:进一步总结辽宁省白头翁属植物种类,为合理开发保护白头翁属植物资源提供依据。方法:从植物形态、花粉粒、基于内转录间隔区(ITS2)序列的DNA条形码分子鉴定三方面对辽宁省白头翁属植物进行分类与鉴定研究。结果:在全国第四次中药资源普查中,笔者经实地调查白头翁属植物的形态特征、花粉粒微观形态、基于ITS2序列的DNA条形码分子鉴定等,确证了一新种白头翁-岩生白头翁(Pulsatilla saxatilis)的存在;确证了兴安白头翁(P.dahurica),白花白头翁(P.chinensis)两种辽宁省新记录;确证了在大连市大黑山、鞍山市千山有金县白头翁(P.chinensis var.kissii)的存在。结论:辽宁地区为白头翁的主产区之一,白头翁药材基本都为野生,价格逐年上涨,加之开荒种地等原因,辽宁地区白头翁属资源正在逐年锐减,更加造成了白头翁属植物资源的匮乏,急需加快栽培技术研究,保护白头翁属植物野生资源的多样性和保证白头翁药材的可持续利用。     

肉苁蓉属植物分子鉴定研究进展

肉苁蓉是我国常用珍稀药材之一,具有较高的药用价值和生态价值。随着分子生物学技术的快速发展,多种基于DNA水平的分子鉴定技术逐步完善与成熟,肉苁蓉相关的研究也取得了一定的成果。对近10年来有关肉苁蓉属植物DNA分子鉴定技术的研究进展进行综述,对其存在的问题进行探讨,对应用前景进行展望,以期为肉苁蓉真伪优劣的精准鉴别及其资源保护、合理利用、新品种的培育提供参考。     

石斛资源分子水平研究进展

石斛作为我国传统中药材,具有养阴生津、润肺明目、抗癌防老等显著功效,有着广泛的分布和悠久的应用历史。随着分子生物学技术的发展,石斛属药用资源的研究进展迅速,分子标记技术具有微量、快速、特异性强、准确可靠等特点,为石斛资源的研究提供了新的方法。通过选用RAPD,ISSR,AFLP,SRAP等不同分子标记的结合使用,对石斛不同种类之间的遗传多样性及亲缘关系进行分析,获得的遗传信息,可以为濒危的石斛资源的保护及开发利用提供理论依据。核基因、线粒体基因、叶绿体基因的结合应用,可以有效便捷地鉴定石斛正品,为进一步发展中药材特异性分子鉴定提供科学依据。同时不同基因片段序列的联合运用,可以作为石斛鉴别DNA条形码的分子标记,将为石斛类药材的鉴定提供新的思路和方法,有效提高石斛属植物的鉴定速度和效率。该文从分子鉴定,DNA序列,石斛功能基因等方面进行论述,为石斛属药用植物的进一步开发应用提供理论基础,同时也为石斛属植物的有效保护和可持续开发提供科学依据。     

基于DNA条形码的甘草属植物的分子鉴别

目的:评价不同DNA条形码序列对甘草属的鉴定能力。方法:应用5条常用DNA条形码序列ITS、ITS2、psbA-trnH、matK与rbcL对甘草属进行PCR扩增与序列测序,结合在GenBank数据库下载的序列数据,通过分析各序列种内与种间变异与遗传距离,构建系统发育树,并基于相似性搜索算法和最近距离法计算各序列鉴定成功率,以分析比较各序列对甘草属的鉴定效率。结果:matk序列因扩增与测序成功率均较低,没有加入后续的数据分析。各个序列的鉴定成功率由高到低的顺序为psbA-trnH、ITS、ITS2、rbcL。ITS和ITS2序列种间最小变异均大于种内最大变异,且种内变异最小。Barcoding gap检验结果显示,ITS、ITS2的重叠区较小。NJ树结果显示,只有psbA-trnH序列能把甘草属不同物种分开。结论:利用DNA条形码序列可准确鉴别甘草属植物,psbA-trnH和ITS组合序列可作为鉴定甘草属植物的较优序列组合。本研究为甘草属植物的分子鉴别提供科学依据。     

分子标记技术在獐牙菜属植物研究中的应用进展

獐牙菜属植物主产于中国,以其重要的药用价值而被研究者所青睐。分子标记技术近年来发展迅速,作为一种有效的现代手段被广泛用于药用植物的各个研究领域。首次系统综述了随机扩增多态性DNA(RAPD)、扩增片段长度多态性(AFLP)、简单重复序列区间(SSR)、ISSR和DNA条形码在獐牙菜属植物体细胞杂交、遗传多样性、种质资源鉴定和系统发育构建等方面研究的应用现状,以期为獐牙菜属植物及相关属植物的研究提供一定的参考。     

中药DNA分子鉴定技术的发展与应用

概述了近年来中药DNA分子鉴定技术在国内外的发展与应用。分析了RFLP、RAPD、DNA序列分析等常用技术的特点及在动、植物药材鉴定中的应用情况,展望了DNA分子鉴定技术在中药鉴定中的前景。     

基于DNA条形码技术的新疆民族药材天山堇菜基原研究

目的：明确市售药材天山堇菜的植物基原,为药材鉴定提供方法依据。方法：使用DNA条形码ITS2序列,建立了民族药材天山堇菜及同属126份基原植物的DNA条形码ITS2序列标准数据库,分析市售18份“天山堇菜”药材的基原。结果：成功建立了堇菜属126份植物的ITS2序列数据库,通过此数据库对18份市售药材的鉴定结果表明,8份为天山堇菜（44.4%）,3份为香堇菜（16.7%）,6份为堇菜属植物（33.3%）,1份为非堇菜属植物（5.6%）。结论：市售民族药材天山堇菜来源于多种植物,其中不足一半与标准中基原一致,多数为混伪品,其是否均能作为天山堇菜使用,还有必要结合用药历史考证。     

基于DNA水平的中国药用植物分子鉴定方法

通过对近年来国内外基于DNA水平分子鉴定方法研究的文献回顾,作者整理了几种经典的基于DNA水平的中药分子鉴定方法,包括RFLP,DNA microarray,RAPD,CAPS,ISSR,SSR等。随着分子生物学的迅速发展,DNA分子标记技术日趋成熟,该领域出现了诸多分子标记技术,并且已经能够很好的应用到中药基源鉴定中。最近兴起的DNA barcoding和DNA chip技术在DNA分子标记领域亦显示出了极大的优越性和潜力,结合即将出现的新的分子生物学分析方法笔者做了相应的阐述。任何一种药材的鉴定方法都存在局限性,重要的是要充分了解和应用其优势,从而合理和有效地对现有方法进行补充和改进,随着生物分子领域的迅速发展,有理由相信DNA分子鉴定方法值得进一步的研究和开发。     

景天属药用植物DNA条形码研究

目的：评价DNA条形码候选序列对景天属药用植物及其混伪品的鉴别能力,探索景天属药用植物鉴定的新方法。方法：使用ITS2、rbcL、matK和psbA-trnH序列的通用引物对景天属药用植物进行PCR扩增和测序,通过比较各序列的扩增效率、种内和种间变异的显著性,以及Barcoding gap,采取BLAST 1和Nearest Distance 方法评价不同序列的鉴定能力。结果: ITS2序列在采集的景天属几种药用植物中扩增成功率为100%,其种内种间变异差异、Barcoding Gap较psbA-trnH、rbcL序列具有更明显的优势,而且纳入网上48个样品33个种的数据后鉴定成功率仍达到100%。结论：ITS2序列能够准确鉴定景天属药用植物,并将其与常见混伪品区别开,ITS2可推荐为景天属首选的DNA条形码序列。     

中药DNA分子鉴定技术的发展与应用

概述了近年来中药DNA分子鉴定技术在国内外的发展与应用。分析了RFLP、RAPD、DNA序列分析等常用技术的特点及在动、植物药材鉴定中的应用情况，展望了DNA分子鉴定技术在中药鉴定中的前景。     

重楼属植物分子生物学研究进展

重楼属植物是重要的药用类群,其分子生物学领域的研究受到了广泛关注。开展重楼属植物研究,不仅具有重大科学意义,而且具有重要的经济和生态价值。从分子标记、分子鉴定、系统进化与谱系地理学、转录组学、蛋白质组学、基因克隆与功能研究等方面对重楼属植物的分子生物学研究进展进行综述,并就当前亟需解决的问题进行了探讨,以期为加快分子生物学技术在重楼属植物研究中的应用提供参考。     

ITS序列鉴定西红花与其易混中药材

目的：通过研究比较西红花与其易混中药材ITS序列的差异和规律,建立西红花与其易混药材之间的分子鉴别方法。方法：从正品西红花以及番紫花2个园艺品种中提取总DNA,用ITS序列通用引物扩增,扩增产物克隆测序；从GenBank中获得莲须、菊花、玉米、红花的ITS序列。结果：测得西红花以及番紫花2个园艺品种的ITS全长序列,总长度分别为658,634,633 bp,包括ITS1,5.8S和ITS2区,GenBank注册登记号为DQ094185,DQ224363,DQ224364。西红花和番紫花2个园艺品种的ITS序列相似性均高于91％；番紫花2个园艺品种之间ITS序列的相似性高达99.84％；比较ITS1区序列,正品西红花与其易混中药材的差异性均在46％以上；比较ITS2区序列,正品西红花与其易混中药材的差异性均在41％以上。结论：根据ITS序列特征,能有效区分西红花和其他易混中药材。ITS序列是正品西红花鉴定的有效的分子标记。