江苏省一起胃肠炎暴发疫情中分离的诺如病毒基因特征分析

目的 分析江苏省一起胃肠炎暴发疫情中分离的诺如病毒基因特征。方法 对2016年12月16－27日江苏省一起急性胃肠炎暴发疫情中病例的肛拭子标本进行核酸提取,利用诺如病毒特异性引物对部分RNA依赖的RNA聚合酶序列及完整衣壳蛋白序列（VP1）进行RT-PCR扩增,扩增产物测序后进行基因特征分析。结果 序列比对结果显示,PCR产物在诺如病毒RNA依赖的RNA聚合酶区与GⅡ.g型别的西班牙株及芬兰株处于同一分支,同源性为98.7%,在VP1区与GⅡ.1型别的美国株同源性更高（99.4%）,初步推断为重组病毒。进一步通过重组分析软件Simplot分析,其可能重组位点在VP1的5 106位点,定位在ORF1/2交叠区。VP1氨基酸变异位点分析显示,其假定的抗原表位及受体结合表位均未出现变异,仅在132位氨基酸位点由N突变为S。结论 江苏省胃肠炎暴发疫情中分离的诺如病毒为GⅡ.g-GⅡ.1重组变异株。     

北京市一起来京游学团诺如病毒急性胃肠炎暴发疫情分析

目的对一起来京游学团急性胃肠炎事件进行调查,控制疫情蔓延。方法搜索2019年7月20-22日期间,某来京游学团中出现急性胃肠炎表现者,进行个案调查,采集病例标本进行实验室检测。结果此次疫情共搜索到28例疑似病例,罹患率为12. 9%(28/217),病例主要临床症状为呕吐(25/28)、腹泻(17/28)。1件呕吐物检出GⅠ型和GⅡ型诺如病毒核酸。9件便标本检出诺如病毒核酸(其中3件检出诺如病毒GⅡ型核酸,6件检出GⅠ型和GⅡ型核酸)。结论此次事件是GⅠ型和GⅡ型诺如病毒感染导致的急性胃肠炎暴发。     

一起诺如病毒所致急性胃肠炎的病原学调查

目的确定天津市一起水源性急性胃肠炎暴发的致病原。方法采集病例粪便标本,饮用深井水标本,采用荧光定量(Real-time PCR)检测病毒核酸,包括轮状病毒、杯状病毒、星状病毒和肠道腺病毒,阳性标本进行逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增及测序分析。对粪便标本进行常见肠道致病菌的检测。结果采集粪便标本33份,检出诺如病毒GⅠ型阳性5份(15.2%),诺如病毒GⅡ型阳性12份(36.4%),诺如病毒GⅠ型、GⅡ型均阳性3份(9.1%)。经测序分析1株GⅠ型为GⅠ/14基因型;4株GⅡ型中,2株为GⅡ/8型,1株为GⅡ/6型,1株为GⅡ/2基因型。轮状病毒(A,B,C组)、札如病毒、星状病毒、肠道腺病毒和肠道致病菌检测均为阴性。3份饮水标本中轮状病毒(A,B,C组)、诺如病毒(GⅠ型,GⅡ型)、札如病毒、星状病毒、肠道腺病毒检测均为阴性,常见肠道致病菌检测结果均为阴性。结论本次水源性急性胃肠炎暴发系由诺如病毒GⅠ型/Ⅱ型混合感染引起。     

一起幼儿园诺如病毒胃肠炎聚集性疫情的调查分析

目的对北京市石景山区一起幼儿园诺如病毒胃肠炎聚集性疫情的流行特征及传播因素进行分析,为疫情防控提供科学依据。方法收集病例基本情况、临床表现、流行病学特征等资料,并对病例和环境标本进行检测,采用描述性流行病学研究方法进行分析。结果此次疫情2016年12月6日开始至12月10日结束,累计发生病例9例,罹患率为26.47%。患者临床表现以呕吐为主。9名病例集中在同一个班级,其中幼托儿童8例、教师1例。4例病例粪便标本检测结果为GⅡ型诺如病毒核酸阳性。结论此次疫情是由人与人之间密切接触引起的幼儿园诺如病毒急性胃肠炎聚集性疫情。幼儿园发生疫情后,应及时报告,并采取病例监测、消毒隔离、健康宣教等综合防控措施。     

一起诺如病毒胃肠炎聚集性疫情的调查

目的:调查某学校发生的一起胃肠炎暴发疫情,分析传播途径和传染来源。方法:于2010年3月7日至25日,在该学校查看缺课登记表、医务室门诊日志,设立临时报告系统等方法收集胃肠炎病例,病例定义采用症状指数方法,症状指数大于3者为病例。开展病例对照研究,分析发病危险因素。并采集病例标本,食品留样,水样等标本进行诺如病毒和致病菌检测。结果:共收集到20个病例,其中5例病例2型诺如病毒检测阳性。食物和饮水中未发现致病菌和诺如病毒。病例对照研究发现,洗手次数大于5次为发病的保护因素。结论:在校外感染的首例病例为本次疫情传染源,首例病例未及时隔离为疫情蔓延的主要原因。     

一起诺如病毒胃肠炎聚集性疫情的调查报告

目的:调查一起幼儿园胃肠炎聚集性疫情的流行特征及因素。方法:制定病例定义,搜索病例并进行流行病学调查。采集病例的肛拭子、呕吐物标本,同时采集食物及桶装水,所有标本进行诺如病毒GI型、GII型、轮状病毒、腺病毒、星状病毒检测。结果:共发现病例28例,幼儿27例,罹患率为6.25%,教师1例,罹患率为1.72%,幼儿和教师的罹患率差异无统计学意义(χ2=1.94,P=0.16)。所有病例均有呕吐症状,部分伴有腹泻、发热和腹痛等症状,采集患儿肛拭子6份,呕吐物2份,经PCR检测,2份肛拭子和2份呕吐物诺如病毒GII型阳性。结论:本次疫情为一起诺如病毒引起的胃肠炎聚集性疫情。     

一起诺如病毒胃肠炎聚集性疫情调查分析

目的通过对一起幼儿园诺如病毒聚集性疫情的调查,了解其流行特征及因素,为今后制定控制措施提供参考依据。方法搜索病例并进行流行病学调查,对可疑食物和部分病例标本进行诺如病毒(GⅠ型和GⅡ型)、轮状病毒、腺病毒、星状病毒检测。结果共发现临床诊断病例14例,均为幼儿,罹患率为7.25%(14/193)。所有病例均有呕吐症状,部分伴有腹痛、低热等症状。采集患儿肛拭子11份,呕吐物2份,经PCR检测,其中5份肛拭子检出诺如病毒GⅡ型阳性。结论本次疫情为一起诺如病毒引起的聚集性疫情,应加强食品安全监测和风险评估,建立和完善食品污染物和食源性疾病监测体系。     

一起诺如病毒引起的急性胃肠炎RT-PCR检测

目的对急性胃肠炎疫情标本进行疑似诺如病毒核酸RT-PCR检测,以确诊其致病原。方法从34例病人粪便中提取RNA,用引物JV13i、JV12y进行诺如病毒核酸RT-PCR扩增,再对其扩增产物进行琼脂糖凝胶检测;同时采用ELISA法检测粪便中的诺如病毒抗原,并用基因序列分析进行检测结果验证。结果34份标本中有26份诺如病毒核酸RT-PCR检测阳性,阳性率为76.5%,经基因序列分析,也证实为诺如病毒;而ELISA只检测到9份标本为阳性,阳性率为26.5%。结论RT-PCR和ELISA的阳性结果均证实该起疫情为诺如病毒感染所致。RT-PCR法比ELISA法灵敏度高,特异性强,且成本较低,但是操作较为繁琐。     

杭州地区2014-2015年急性胃肠炎患者感染诺如病毒的流行病学特征分析

目的 了解2014-2015年杭州地区急性胃肠炎患者中诺如病毒的流行病学特征。方法 收集1 109份急性胃肠炎患者的临床流行病学资料和粪便样本,采用一步法双重荧光RT-PCR对样本中诺如病毒(GⅠ、GⅡ型)进行初筛,然后随机选择诺如病毒阳性的样本核酸进行多重RT-PCR扩增,对产物进行测序分析。结果 1 109份的粪便样本中,诺如病毒检出率为26.87%(298/1 109),以GⅡ亚型为主,占25.52%(283/1 109),GⅠ亚型占1.35%(15/1 109);不同性别人群诺如病毒检出率差异无统计学意义(P>0.05);不同年龄组人群中诺如病毒检出率分别为16.94%(<5岁)、19.45%(5~18岁)和32.26%(≥18岁);全年均可检出诺如病毒感染,高发季节为12月至次年3月,阳性率为29.67%~37.08%。序列分析显示,GⅡ基因亚型中以GⅡ-4/Sydney株为主(46.43%,13/28),其次为GⅡ-4/2006b株;GⅠ基因亚型中以GⅠ-1亚型为主(55.56%,5/9)。结论 诺如病毒是导致2014-2015年杭州地区急性胃肠炎的主要病原之一,GⅡ基因亚型特别是GⅡ-4/Sydney变异株和GⅡ-4/2006b变异株是该地区流行的优势毒株。     

苏州市14起诺如病毒胃肠炎暴发疫情流行特征分析

目的了解苏州市诺如病毒胃肠炎暴发疫情的流行病学特征。方法对2010-2014年发生的14起诺如病毒胃肠炎暴发疫情进行描述性流行病学分析,采用聚合酶链反应对病例肛拭子、粪便、呕吐物、水、环境涂抹标本进行核酸检测。结果 2011-2014年,苏州市共报告14起诺如病毒胃肠炎暴发疫情,罹患率波动范围为0.89%~21.18%。14起疫情中12起(85.71%)发生于托幼机构和中小学校,医院、农村各1起。全年均有发生,但以寒冷季节发生较多。仅1起查明与二次供水受到污染有关,13起未证实暴发原因。核酸检测结果12起由诺如病毒GII基因组引起,2起由GI基因组引起。结论诺如病毒已成为苏州市急性胃肠炎暴发疫情的重要病原,托幼机构和学校是高发场所,GII基因组是主要基因组。在暴发疫情处理中,应加强传染源和传播途径的调查。     

北京地区急性胃肠炎患者诺如病毒分子流行病学调查

目的 探讨北京地区急性胃肠炎患者诺如病毒分子流行病学特征.方法 采用RT-PCR扩增核酸和测序分型方法.结果 共收集腹泻标本685份,检测诺如病毒阻性66份,阳性率为9.6％.检出率在患者性别、年龄、住院和门诊间的差异均无统计学意义;诺如病毒胃肠炎患者时间分布也无明显季节性.66份阳性标本采用ORF2区测序分型,其中43份可分型.GⅠ组占22.7％,包括GⅠ.3型2份、G Ⅰ.4型1份、GⅠ.5型4份、GⅠ.7型3份;GⅡ组占77.3％,其中以GⅡ.4型为主(60.6％),其他包括GⅡ.2型1份、GⅡ.3型1份,GⅡ.5型1份、GⅡ.6型2份、GⅡ.7型1份、GⅡ.12型7份.6例出现GⅠ组和GⅡ组混合感染,其中可分型的有G Ⅰ.3/GⅡ.7、GⅠ.5/GⅡ.5、G Ⅰ.4/GⅡ.4.结论 北京地区急性胃肠炎患者诺如病毒呈现基因多样性,且以GⅡ组为主,其中GⅡ.4/2006a和2006b是主要的流行变种,存在GⅠ和GⅡ组混合感染现象.     

2007-2021年我国诺如病毒急性胃肠炎暴发疫情流行特征及影响因素分析

目的 分析我国诺如病毒急性胃肠炎暴发疫情流行病学特征,探讨暴发疫情规模的影响因素,为及早控制暴发疫情提供科学依据。方法 对突发公共卫生事件管理信息系统2007年1月1日至2021年12月31日全国诺如病毒急性胃肠炎暴发疫情进行描述性流行病学分析,应用非条件logistic回归模型分析暴发疫情规模的影响因素。结果 2007-2021年共报告暴发诺如病毒急性胃肠炎疫情1 725起,报告疫情起数呈上升趋势。南方省份每年10月至次年3月为疫情高峰,北方省份疫情高峰为每年10-12月和次年3-6月。疫情报告地区从东南沿海省份逐步向中部、东北和西部省份扩散。疫情主要发生在学校和托幼机构（1 539起,89.22%）,其次为企事业单位（67起,3.88%）和社区家庭（55起,3.19%）。人与人接触为主要传播途径1 262起（73.16%）,GⅡ基因型为引起暴发疫情的主要病原型别（899起,81.58%）。首例病例发病至疫情报告时间间隔M（Q₁,Q₃）为3（2,6）d,疫情规模M（Q₁,Q₃）为38（28,62）例。近年来,疫情报告及时性提升,疫情规模随年份呈下降趋势,二者在不同发生场所之间差异均有统计学意义（P<0.001）。发生场所、传播途径、报告及时性和居住地类型是暴发疫情规模的影响因素（P<0.05）。结论 2007-2021年我国诺如病毒急性胃肠炎暴发疫情整体呈上升趋势,疫情波及地区范围不断扩大,但疫情发生规模整体呈下降趋势,疫情报告及时性提升,提高监测灵敏度和及早报告可有效控制疫情发生规模。     

广东省诺如病毒急性胃肠炎疾病负担研究

目的 对广东省诺如病毒急性胃肠炎的流行病学负担进行评估,为制定或调整疫情防控策略提供科学依据。方法 结合广东省2013-2017年感染性腹泻病监测数据、与腹泻病相关的监测数据和调查结果,采用发病率、伤残调整寿命年（DALYs）和网络报告与实际发病数的比值等指标对广东省诺如病毒急性胃肠炎的流行病学负担进行评估。结果 2013-2017年广东省诺如病毒急性胃肠炎年均发病数为310.27万人次/年（253.59~403.76万人次/年）;估算年均就诊病例数为127.83万人次/年（104.48~166.35万人次/年）;估算年均住院病例数为383人次/年（313~499人次/年）。网络报告诺如病毒急性胃肠炎发病数与实际发病数之比为1∶1 203（1∶860~1∶1 771）。年均总负担为19 200.55 DALYs（16 919.20~25 001.83 DALYs）,平均负担为0.18 DALYs/千人年（0.15~0.23 DALYs/千人年）。结论 广东省诺如病毒急性胃肠炎疾病负担相对较高,需要有针对性的加强预防控制管理以及宣传教育。     

泰州市急性胃肠炎学校聚集性疫情病原学鉴定及分子溯源

目的 了解2018年10月至2019年1月间泰州地区急性胃肠炎疫情主要致病原,掌握其传播流行规律。方法 采集学校聚集性疫情中患者的咽拭子和肛拭子标本,进行病原学核酸检测,测定阳性疫情株VP1基因序列,构建系统发生树,分析疫情株所属流行亚群,推测该流行亚群做传染病人口学模型和传播路径,以及VP1基因变异性分析。结果 共采集疫情样100人份,检出诺如病毒GII型阳性45份,测定其中20份标本VP1基因序列,除1份为GII.3型外,其余均为GII.2亚型,该GII.2型疫情株间同源性平均达99.4%,其与2016-2017年中国、日本流行株属于同一流行亚群,该亚群起源于上海地区,且仍处于流行上升阶段。结论 本时间段泰州市急性胃肠炎学校聚集性疫情的主要致病原是GII.2型诺如病毒,其属于一个活跃的流行亚群。     

2015 - 2018年北京市西城区诺如病毒胃肠炎聚集性疫情流行特征分析

目的 分析北京市西城区诺如病毒胃肠炎聚集性疫情的流行特征。方法 对2015 - 2018年西城区诺如病毒胃肠炎聚集性疫情及个案资料进行流行病学特征分析,采用荧光RT - PCR对病例及相关人员的便标本进行肠道病毒检测。结果 共调查处置诺如病毒胃肠炎疫情106起,病例1 400例,平均每起疫情涉及病例13.21例,罹患率14.65%,疫情平均流行时间3 d。4年疫情报告整体呈上升趋势,疫情高发月份为3 - 6月和10 - 12月,占疫情总数的91.51%（97/106）,托幼儿童和小学生为主要发病人群。病例临床表现以呕吐（94.50%）为主,疫情相关人员便标本诺如病毒平均检出率50.42%（594/1 178）,以GⅡ型为主。疫情主要传播途径为人传人（94起,88.68%）,部分疫情（12起）涉及厨工感染的食源性传播。结论 引起北京市西城区诺如病毒急性胃肠炎疫情的主要病原体是 GⅡ型诺如病毒,幼儿园和小学作为高发场所,应加强对校医和老师相关知识和技能的培训,以便在疫情早期采取各项防控措施阻止疫情扩散。同时还应加强教师、保育员、厨工等重点人员的日常健康监测工作。     

一起老人护理院诺如病毒急性胃肠炎暴发的调查

目的调查分析1起某老人护理院诺如病毒急性胃肠炎暴发的原因,为今后老年人此类疾病的防控提供参考依据。方法采用个案调查收集病例资料,采集部分病例和工作人员肛拭子标本,运用实时荧光定量RT-PCR进行诺如病毒核酸检测。结果 21份肛拭子样本中,19份诺如病毒GⅡ犁核酸阳性,其中11份阳性为发病老人肛拭子样本,8份为工作人员肛拭子样本。结论该疫情是一起由GⅡ型诺如病毒引起感染性腹泻暴发疫情,密切生活接触及未能及时消毒是疫情暴发的主要原因。     

诺如病毒RdRp区和核心区部分基因克隆及序列分析

目的:明确引起急性胃肠炎暴发的诺如病毒RdRp区和衣壳区部分核酸序列,确定病毒基因亚型。方法:采集腹泻病人粪便标本,提取病毒核酸,通过RT-PCR扩增长度为387 bp的病毒RNA多聚酶区(RdRp)区和核心区部分核酸序列,并克隆至T载体,转化大肠杆菌,筛选阳性菌落,对插入片段测序,进行遗传进化分析。结果:确认此次流行株与韩国Seoul/0559/株和美国Shelby株核酸序列相似性最高。结论:国内首次发现诺如病毒GII/12亚型引起急性胃肠炎暴发。     

株州市学校一起因生活用水污染引起的诺如病毒胃肠炎暴发

目的了解株州市2013年某学校一起感染性腹泻暴发的特点和流行原因,探讨暴发疫情处理的经验并为制定防止对策提供依据。方法采用现场流行病学调查分析和实验室检测方法。结果2013年8月30日—9月15日,该校发生感染性腹泻病例97例,罹患率为9．8％,发病教师年龄35岁,发病学生年龄范围15～17岁,男女性别比为0．03：1。病例的临床表现基本相同,以腹泻、腹痛、乏力等症状为主,病程1—3d。回顾性队列研究显示,大食堂就餐为主要危险因素,从患者肛拭子标本中和管网末梢水中检测到诺如病毒抗原,采取改造供水管道、隔离治疗患者和健康教育等综合措施后,疫情得到控制。结论该次疫情为一起诺如病毒感染性腹泻暴发,暴发原因是该校供水管道被污染。供水系统安全存在诸多薄弱环节,建议尽快改用市政自来水供水。     

北京市2014－2018年诺如病毒急性胃肠炎暴发的影响因素分析

目的 分析2014－2018年北京市诺如病毒急性胃肠炎暴发的影响因素。方法 收集2014年4月至2018年3月北京市诺如病毒急性胃肠炎聚集性事件及暴发资料,应用非条件logistic回归模型分析诺如病毒急性胃肠炎暴发的影响因素。结果 北京市共报告由诺如病毒感染引起的急性胃肠炎事件765起,85.88%（657/765）为聚集性事件,14.12%（108/765）为暴发。在暴发中,70.37%（76/108）发生在2017年;84.26%（91/108）发生在冬、春季节;88.89%（96/108）发生在托幼机构及中小学;主要传播途径为人传人（81.48%,88/108）;93.52%（101/108）为GⅡ组诺如病毒感染引起。多因素logistic回归分析结果显示,在近郊区及远郊区发生的事件,出现暴发的风险分别是城区的1.84倍（95% CI：1.13～3.02）及3.78倍（95% CI：1.62～8.82）;在小学、中学及其他机构发生的事件,出现暴发的风险分别是幼儿园的6.26倍（95% CI：3.53～11.10）、14.98倍（95% CI：6.23～36.01）及8.71倍（95% CI：3.07～24.71）;就诊率低于全部事件就诊率中位数的,发生暴发的风险是就诊率高的2.29倍（95% CI：1.42～3.68）;传播途径为食源性的事件,发生暴发的风险为人传人传播的14.55倍（95% CI：3.15～67.07）。结论 加强郊区、中小学及其他机构诺如病毒暴发疫情的防控力度,急性胃肠炎患者积极就医,做好食源性疫情的防控及厨工的健康管理,有助于减少诺如病毒急性胃肠炎的暴发。