乙型肝炎病毒X基因研究现状

乙肝病毒（HBV）X基因编码的X蛋白（HBX）在HBV的致病性中,起着重要的作用。HBX激活信号通路,直接与转录因子作用或促进转录因子与转录元件的特异结合,调控HBV的转录。HBX作为一种反式激活因子,通过反式激活作用影响信号转导,抑制细胞DNA修复,影响细胞凋亡等导致肝细胞癌（HCC）发生。     

微小RNA甲基化在肝细胞癌诊疗中的研究进展

微小RNA(microRNA,miRNA)是一类在转录后水平调节基因表达的非编码短链RNA,在细胞的生命活动中具有多种调节作用。甲基化是从基因组层面研究RNA转录调控的重要领域,通过调节基因的表达和沉默,与肿瘤、衰老等许多疾病密切相关。研究表明,miRNA甲基化异常可以调控miRNA的表达,并影响其靶基因的表达和功能,是肝细胞癌发生发展的关键信号,这为进一步研究肝细胞癌发病的分子机制和探索有价值的治疗靶点提供新的思路。     

长链非编码RNA在宫颈癌中的研究进展

宫颈癌的发生和发展是一个复杂的病理过程,除了人乳头瘤病毒（HPV）感染外,癌基因的激活和抑制基因的失活也在癌症过程中发挥了重要作用。长链非编码RNA（LncRNA）是长度大于200个核苷酸、不能编码蛋白质的长RNA转录物。一些lncRNA在肿瘤中表达异常,可作为癌基因或抑癌基因参与细胞通路调控,并与肿瘤发生、发展及转移密切相关。越来越多的证据表明,一些lncRNA在宫颈癌细胞中表达异常,可通过多种途经调控宫颈癌细胞的增殖、迁移与凋亡,并且与肿瘤的大小、血管生成、晚期FIGO分期、淋巴结转移和不良预后密切相关,是宫颈癌诊断与预后的重要指标和潜在治疗靶点。     

胰岛β细胞转录因子MafA的研究进展

肌腱膜纤维肉瘤癌基因同系物A(MafA)是特异表达于β细胞的一种转录因子,参与调节胰岛素合成、分泌和糖代谢等相关基因的表达。MafA特异结合于胰岛素基因C1元件,与结合于A1、E1元件的转录因子胰腺和十二指肠同源盒因子1、β细胞E盒反式作用因子共同调节胰岛素基因的转录。MafA在葡萄糖调节胰岛素基因表达过程中具重要作用,血糖变化可通过改变MafA的表达、稳定性及其与C1元件的结合活性调节胰岛素基因的转录。MafA的变异或缺失与糖尿病发生密切相关。     

Lnc RNA GAS 5在恶性肿瘤中的研究进展

长链非编码RNA GAS 5（Lnc RNA GAS 5）是一类非转录翻译蛋白的长片段RNA,片段大小一般>200bt,在许多恶性肿瘤细胞的增殖、凋亡、侵袭和浸润中发挥着重要的作用。目前研究者们认为长链非编码RNAs不仅只有转录功能,还能调控下游基因的表达或被上游基因调控表达,从而发挥着癌基因或抑癌基因的作用。目前对Lnc RNA GAS 5的作用机制仍不十分清楚,本文对Lnc RNA GAS 5在各种恶性肿瘤中的作用的最新研究进展进行综述,明确其作用并总结可能的机制。     

LncRNA ZFPM2-AS1对肝细胞癌的预后影响及机制研究

目的 分析LncRNA ZFPM2反义RNA1(ZFPM2 antisense RNA1,ZFPM2-AS1)对肝细胞癌预后的影响及其潜在的致病机制。方法 采用癌症基因组图谱（The cancer genome atlas,TCGA）数据库相关基因表达谱并结合临床病理学指标综合分析ZFPM2-AS1对肝细胞癌诊断及预后的效能及其与临床病理学指标的相关性;通过siRNA干扰ZFPM2-AS1的表达,采用5-乙炔基-2’脱氧尿嘧啶核苷染色（EdU）法检测HepG2细胞增殖活力、Transwell实验检测细胞迁移和侵袭能力、免疫印迹法检测下游蛋白质表达水平的变化;通过GO和KEGG分析,初步探究ZFPM2-AS1调控肝细胞癌进程的潜在机制。结果 ZFPM2-AS1在肝细胞癌组织中显著高表达（P<0.01）,影响患者的生存时间（P<0.001）,且与年龄（P=0.004）、T分期（P=0.011）、临床分期（P=0.033）及甲胎蛋白水平（P=0.050）密切相关。ZFPM2-AS1可促进HepG2细胞的增殖、迁移及侵袭能力,抑制B淋巴细胞瘤-2蛋白相关蛋白（BAX）、E-钙黏蛋白...     

N-ras癌基因负调控因子的研究(简报)

笔者曾通过分子杂交、Run-off转录活性的检测及原位杂交技术证明,肝癌细胞中N-ras癌基因的表达明显高于正常肝细胞,其分子机理可能是由于转录水平的异常.进而采用Southwestern Blot技术对反式作用因子(trans-acting factor)进行检测,结果发现在肝癌细胞中缺失了一组(分子量45 000、40 000和35 000)DNA结合蛋白.本实验对该组DNA结合蛋白进行分离、鉴定并利用体外转录系统证明其具有抑制转录的作用,提示存在N-ras癌基因的负调控因子.     

深度挖掘肝细胞癌中遗传变异对可选择性多聚腺苷酸化的影响

摘要:目的 通过整合组学和临床信息,深度挖掘肝细胞癌中重要的可选择性多聚腺苷酸化(alternativepolyadenylation,APA)数量性状基因位点(alternativepolyadenylationquantitativetraitlocus,apaQTL),并研究这些重要位点相关 的下游靶基因及上游 RNA 结合蛋白(RNA-bindingprotein,RBP)。方法 从 SNP2APA 数据库下载泛癌顺式和反式 apaQTL数据,用 R语言分析肝细胞癌apaQTL的分布特征。根据位置提取apaQTL上下游50bp范围内的序列,使用 STREME进行特征基序富集,进一步结合肝细胞癌临床信息,筛选改变基序和临床预后相关的apaQTL。利用 Tomtom 挖掘潜在调控 APA 的上游 RBP,并通过 ENCODE以及 TCGA 预后数据分别验证 RBP在 APA 调控和肝细胞癌发生发 展中的重要性。将apaQTL和表达数量性状位点(expressionquantitativetraitlocus,eQTL)进行共定位,并结合差异表 达和预后分析,筛选影响表达和预后的apaQTL和下游靶基因。结果 通过对肝细胞癌apaQTL进行特征分析,发现肝 细胞癌顺式apaQTL在其他癌症中广泛出现,而反式apaQTL在肝细胞癌中具有特异性。通过对apaQTL进行基序分 析,筛选出20个可以改变多聚腺苷酸化基序的apaQTL。其中rs16742可以生成新的多聚腺苷酸化基序,从而导致赖氨 酰-tRNA 合成酶(leucyl-tRNAsynthetase,LARS)基因的转录本增长。进一步分析表明,rs16742与肝细胞癌的预后相 关。通过预测新的apaQTL基序和上游靶基因,并结合外部数据验证,发现 RBP聚(RC)结合蛋白2[poly(RC)binding protein2,PCBP2]参与肝细胞癌 APA 事件的调控,并与预后相关。进一步分析表明,预后显著的apaQTLrs115865883 和rs150628203可能影响 PCBP2与转录本的结合。通过apaQTL和eQTL共定位分析,筛选出30个潜在的影响表达和 肝细胞癌发生发展的apaQTL和下游靶基因。结论 研究发现了一系列功能性肝细胞癌apaQTL及下游靶基因,基于 apaQTL相关分析,发现 RBPPCBP2可调控肝细胞癌的 APA 事件及预后。     

MicroRNA和血液系统肿瘤的基因调控

微小RNA(miRNA)是一类长度为20~25 nt的非编码RNA,广泛存在于真核生物中,通过与由靶基因转录而成的mRNA序列互补结合,在转录后水平调节基因的表达。miRNA参与生命过程中一系列重要进程,包括胚胎早期发育、细胞增殖、凋亡和分化等。miRNA表达水平的异常往往与人类肿瘤的发生密切相关,具有类似于癌基因或抑癌基因的作用。越来越多的研究表明,miRNA在血液系统肿瘤发生发展中起着重要的调控作用,该文将对这一领域的研究进展进行综述。     

miR-542-3p在恶性肿瘤中的表达及其作用的研究进展

微小RNA(miRNA)是一类内源性非编码RNA,通过结合靶标信使RNA(mRNA),在转录后水平调控基因表达。miRNA参与多种生理和病理过程,在恶性肿瘤的发生发展中发挥促癌或抑癌基因功能。近期研究发现,miR-542-3p在肝癌、肺癌等多种癌肿中表达异常,并参与调控增殖、凋亡、迁移和侵袭等生物学过程。     

核转录因子NF—κB在血管内皮细胞组织因子表达中的作用

目的：探讨核转录因子NF－κ在肿瘤坏死因子α（TNF－α）,血管紧张素Ⅱ（AngⅡ）诱导血管内皮细胞组织因子（TF）表达中的作用。方法：用发色底物法测定血管内皮细胞表面TF活性。分别采用凝胶电泳迁移率改变法（EMSA）和Western 鲩迹法检测血管内皮细胞核转录因子NF－κB的DNA结合活性和含量。结果：100U／ml TNF-α,^-6mol/l Ang II作用下,内皮细胞表面TF活性明显增高。分别较对照增高1＝65倍和1．61倍,TNF－α,AngⅡ处理后细胞核内NF－κB含量明显增加,分别为正常对照组的1．77倍和1．52倍。结论：TNF－α,AngⅡ可增强内皮细胞TF活性,这可能与其促进内皮细胞核转录因子NF－κB的核转位和DNA结合活性有关,进一步证实NF－B在内皮细胞TF诱导表达中的重要作用。     

吗啡对胶质瘤C6细胞RNA聚合酶Ⅱ通用转录因子F基因表达的影响

目的：检测吗啡对C6胶质瘤细胞RNA合成的影响。 方法：通过RT-PCR方法检测吗啡影响C6胶质瘤细胞RNA聚合酶Ⅱ通用转录因子F(TFⅡF)基因表达的变化。 结果：吗啡作用于C6胶质瘤细胞与相应对照组相比,TFⅡF转录产物均明显减少;纳络酮能阻断吗啡对TFⅡF基因表达抑制的作用。结论：吗啡通过μ受体途径介导C6胶质瘤TFⅡF基因表达抑制的作用。     

PTEN的ceRNA网络调控研究进展

抑癌基因PTEN的表达水平与多系统肿瘤的发生、发展密切相关。研究发现,多种microRNA可以在转录后水平调控PTEN的表达,竞争性内源性RNA（competitive endogenous RNA,ceRNA）则能够屏蔽microRNA对PTEN mRNA的抑制或降解作用,二者共同作用形成一个精细的ceRNA调控网络,参与PTEN基因表达的转录后调控。本文主要列举目前已经被鉴定的具有功能性的PTEN相关ceRNA,并探讨ceRNA调控网络对PTEN蛋白表达水平及抑癌功能的影响。     

幽门螺杆菌调控胃上皮细胞基因表达的机制

目的：在基因转录调节水平上研究幽门螺杆菌生物活性物质调控胃上皮细胞基因表达的机制。方法：人胃上皮癌细胞株SGC-7901采用常规方法培养,幽门螺杆菌菌株NCTC11637采用马血清琼脂培养基培养,收获后用超声粉碎法提取生物活性物质,基因转录采用报告基因方法分析。结果：幽门螺杆菌提取物使SRE反式激活的基因转录增加（P〈0．01）,而对CRE反式激活的基因转录没有明显影响（P〉0．01）。结论：幽门螺杆菌生物活性物质通过顺式转录调控元件SRE调控细胞基因表达。     

环状RNA在乙肝病毒相关性肝细胞癌中的研究进展

肝癌是常见的恶性肿瘤之一,肝细胞癌是最常见的病理类型,在我国80%以上的肝癌患者合并了乙肝病毒（hepatitis B virus, HBV）感染。近年来研究发现,环状RNA（circular RNA, circRNA）作为非编码型RNA（non-coding RNA,ncRNA）中的一员,其可由pre-mRNA反向剪接生成,具有充当miRNA海绵、调节转录、翻译多肽等多种功能,在恶性肿瘤包括肝癌的发生发展中扮演重要角色,已经成为目前研究的热点,引起了人们广泛关注。本文对CircRNAs的分类及主要功能、CircRNAs与乙肝相关性肝细胞癌的关系、CircRNA可作为乙肝相关的HCC分子标志物等方面的研究现状进行了综述,探讨了CircRNAs的临床应用价值。     

肺炎克雷伯菌CRP对kfuABC操纵子的转录调控机制研究

目的：利用分子生物学实验研究肺炎克雷伯菌环磷酸腺苷受体蛋白（cAMP receptor protein,CRP）对kfuABC操纵子的转录调控机制。方法：设计相关跨基因引物,用Real-time PCR方法验证kfuABC的转录结构。以肺炎克雷伯菌野生株NTUH-K2044（wild type,WT）的总RNA为模板,利用引物延伸的方法寻找kfuA的转录起始位点,确定其核心启动子区。构建含kfuA启动子区DNA序列的LacZ重组质粒,并将其转入突变株?驻crp（肺炎克雷伯菌野生株基因组中crp基因敲除）和WT中,通过测定比较两株菌中β-半乳糖苷酶活性差异来判定CRP调控子对kfuA的调控关系;分别提取?驻crp和WT的总RNA,进一步采用实时定量Real-time PCR的方法验证CRP对kfuA的调控关系。通过凝胶阻滞实验验证His-CRP是否对kfuA启动子区具有直接的结合作用,进一步采用 DNaseⅠ足迹实验确定具体的结合位点。结果：肺炎克雷伯菌kfuA、kfuB和kfuC位于同一个操纵子kfuABC;引物延伸实验结果显示kfuABC只有一个转录起始位点T;CRP能够结合到kfuABC启动子区-204到-171之间的碱基序列上（转录起始位点为+1）,抑制其转录表达。结论：CRP能直接结合到kfuABC启动子区抑制其转录表达。     

MicroRNA在前列腺癌发生发展中的研究进展

前列腺癌是男性泌尿系最常见的恶性肿瘤之一。MicroRNA（循环或游离RNA,miRNA）在转录后水平对基因表达进行调控,通过类似癌基因,抑癌基因或其他方式调控肿瘤过程的发生、发展和转归过程。最近研究表明一些MicroRNA在前列腺癌病人外周血中特异表达,为前列腺癌病人的早期诊断及预后判断提供了新的分子标志物。     

组织特异性表达基因PLUNC调控元件的生物信息学分析

目的 分析组织特异性表达基因PLUNC的调控元件.方法 采用进化足迹法,结合生物信息学工具,预测PLUNC基因的顺式作用元件和反式作用因子.结果 预测的PLUNC基因的转录起始位点位于-1～+10 bp区域间、-29 bp存在TATA盒子,启动子集中在-490 bp～+89 bp内,在人和小鼠PLUNC基因的启动子保守区内存在29个共同的转录因子结合部位及5个增强子.结论 PLUNC基因调控元件的分析可为探讨上呼吸道特异性表达基因的调控机制提供模型.生物信息学技术结合进化足迹法,在基因表达调控机制的研究中具有重要的应用价值.