长链非编码RNA在结肠癌中的表达研究

目的 探讨长链非编码RNA（lncRNA）在结肠癌中的表达情况。方法 从公共数据平台Gene Expression Omnibus（GEO）下载结肠癌外显子芯片数据集GSE31737,包含40对结肠癌及癌旁组织。对外显子芯片探针进行重排,筛选出在基因水平特异性匹配lncRNA的探针。用Affymetrix Power Tools分析获得lncRNA表达谱,用LIMMA分析在结肠癌和癌旁组织中差异表达的lncRNA。结果 共有136 053个探针特异性匹配9294个lncRNA,约包含了Ensembl数据库中76％的lncRNA。分析GSE31737发现,与癌旁组织相比,结肠癌组织中共有87个lncRNA差异表达,其中50个高表达,37个低表达。结肠癌与癌旁组织表达值倍数变化＞1.5倍的基因共37个。结论 lncRNA表达在结肠癌组织中发生明显变化,有可能成为结肠癌的分子诊断和基因治疗的新靶点。     

基于癌症基因组图谱数据分析筛选结肠癌预后相关长链非编码RNA

目的:通过分析癌症基因组图谱（TCGA）数据库中有关结肠癌的转录组测序数据,筛选结肠癌预后相关长链非编码RNA（lncRNA）,寻找新的lncRNA结肠癌分子标志物。方法:下载TCGA数据库中结肠癌转录组测序数据及结肠癌患者临床资料,利用R语言进行数据整理。采用edgeR包筛选差异表达lncRNA,采用单因素Cox回归模型对差异表达lncRNA进行生存分析。提取与这些lncRNA共表达的编码基因,行京都基因与基因组百科全书（KEGG）分析。结果:差异表达分析共筛选出227个在肿瘤各TNM分期中均异常表达的lncRNA,其中表达上调169个,表达下调58个。生存分析鉴定出15个差异表达lncRNA与预后显著相关（P<0.05）,其中2个为保护因素,13个为危险因素。KEGG分析发现,这些预后相关lncRNA 的共表达基因主要富集在核糖体生物合成、mRNA监视通路等。结论:通过挖掘TCGA结肠癌数据集,发现了一些具有预后意义的异常表达lncRNA,为后续深入研究其功能奠定了基础,这些lncRNA有望成为新的结肠癌诊断或治疗分子标志物。     

肾癌相关长链非编码RNA研究进展

长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类由RNA聚合酶Ⅱ转录及可变剪接而来、长度大于200个核苷酸、无蛋白编码功能的RNA分子。众多研究表明其在表观遗传学、转录等水平发挥重要的调控作用,且其异常表达与肾癌(renal cell carcinoma,RCC)的发生、发展、转移和预后等明显相关。旨在总结RCC相关lncRNA最新研究进展,浅析lncRNA在RCC发生、发展中的潜在分子机制,为RCC的预防、早期诊治及预后评估提供一种新的理论依据。     

长链非编码RNA与肺癌

长链非编码RNA（lncRNA）是一类转录本长度超过200个核苷酸的小分子RNA,不具有蛋白编码功能,起初被认为是基因组转录的“噪音”,近年来却被证实在生物体内对基因的表达具有调控作用,与肿瘤的发生发展密切相关。肺癌是一种严重危害人们健康的恶性肿瘤性疾病,研究发现lncRNA在肺肿瘤中表达失调,异常表达的lncRNA能作为关键的调控因子,参与多种生物学过程,影响肿瘤转移与侵袭、肺癌细胞的增殖和凋亡、肿瘤血管生成及调节肿瘤耐药,为肺癌临床治疗提供新思路。此外,lncRNA还可作为潜在的生物标志物用于肺癌早期诊断及评估肺癌预后。本文就lncRNA在肺癌研究中的进展进行综述。     

长链非编码RNA与肿瘤

长链非编码RNA （IncRNA）是重要的基因表达调控因子,它广泛参与多种生理及病理过程.近年来研究证实IncRNA与肿瘤密切相关,并显露出作为肿瘤诊断和治疗新靶点的潜能.     

长链非编码RNA与肿瘤研究进展

在基因组中大量转录的长链非编码RNA, 因其在致癌与肿瘤抑制途径中显露出的潜在作用而成为肿瘤研究的新热点。虽然这些新基因在各种人类肿瘤中普遍异常表达, 但其中大部分的生物学功能仍未可知。近年来, 许多研究显示长链非编码RNA, (Long non-coding RNAs, LncRNAs)与肿瘤的发生、发展密切相关。本文结合国内外最新报道, 对LncRNAs在各种肿瘤中的研究进展作一综述。      

特异长链非编码RNA在鼻咽癌中的表达及其意义

目的 分析长链非编码RNA（long non-coding RNA, lncRNA）在鼻咽癌与慢性鼻咽炎组织中表达水平的变化,寻找可能与鼻咽癌发生发展相关的特异lncRNA。方法 采用lncRNA芯片技术分析lncRNA和mRNA在鼻咽癌与慢性鼻咽炎组织的表达谱,筛选差异表达的lncRNA和mRNA,进一步研究使用了聚类分析、GO分析、pathway分析等生物信息学技术。结果 差异表达的lncRNA（2倍以上变化且P＜0.05）共856条,其中上调的共 425条,下调的共431条;差异表达的mRNA共767条,其中上调的共426条,下调的共341条。利用聚类分析方法将差异表达的lncRNA分成3类：增强子型lncRNA、HOX 基因簇、基因间lncRNA。GO分析将mRNA分成3类：生物学过程类、细胞组分类、分子功能类。Pathway分析显示mRNA共参与28条信号通路,其中参与细胞因子-细胞因子受体相互作用信号通路的上调差异表达的mRNA的富集度最高。结论 与慢性鼻咽炎相比,lncRNA在鼻咽癌组织的表达水平明显改变,提示差异表达的lncRNA可能与鼻咽癌的发生发展有关。     

头颈部肿瘤相关长链非编码RNA的研究进展

长链非编码RNA( lncRNA)是一类转录长度>200 nt的RNA分子,不编码蛋白. 近年来越来越多的研究证明lncRNA是多种肿瘤发生发展的关键调控因子,lncRNA靶向基因治疗有望成为肿瘤治疗的新途径. 目前关于头颈部肿瘤相关lncRNA的研究相对较少,本文将结合国内外最新研究文献,论述lncRNA在头颈部肿瘤中的研究进展.     

长链非编码RNA与宫颈癌的相关性

长链非编码RNA（lncRNA）是一类不编码蛋白,转录本长度超过200nt 的非编码RNA 分子。是以RNA的形式在多层面上调控基因的表达水平。多年的国内外研究显示,不同的lncRNA 种类在宫颈癌的发生发展、诊断、治疗及预后中起着不同的重要作用。还可为特异性靶点治疗提供新的研究方向。本文概述近几年的几种 lncRNA在宫颈癌中的作用。     

长链非编码RNA在胃癌中的研究进展

胃癌的发生涉及多步骤、多基因的相互作用等复杂过程。长链非编码RNA（long non-coding RNA,lncRNA）是一类长度超过200个核苷酸的无蛋白质编码功能却被证明具有广泛的基因表达调控作用的RNA分子。许多研究已经证实,lncRNA在多种类型肿瘤中存在异常表达,且在肿瘤发生、发展的过程中具有重要的作用。目前,研究证实lncRNA 在胃癌中异常表达,发挥潜在的促癌和抑癌的作用。本文就在胃癌中lncRNA表达的最新研究进展作一综述。     

长链非编码RNA与宫颈癌的相关性研究进展

宫颈癌的发病率和死亡率均位于女性肿瘤的第二位,早期诊断与治疗是降低其死亡率的有效途径。长链非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)是一类长度大于200 nt且缺乏编码蛋白能力的RNA,其通过多种途径参与基因的表达调控,在个体正常发育和疾病发生中起着重要作用。越来越多的研究表明lncRNA与肿瘤的发生、发展密切相关。本文将对lncRNAs在宫颈癌中的作用及其分子机制进行综述。     

长链非编码RNA在食管癌中的研究进展

随着分子生物学研究的技术革新和计算机生物信息学的蓬勃发展,长链非编码RNA（lncRNA）的作用和生物学功能得到了深入研究,其在细胞周期进程、细胞生长和凋亡等过程中具有重要的调控作用。lncRNA的异常表达与肿瘤的增殖、迁移及侵袭均密切相关。本文总结了近2年有关食管癌lncRNA的相关研究进展,介绍影响食管癌生物学特性的lncRNA调控机制,尤其是lncRNA作为竞争性内源RNA（ceRNA）的调控机制,以期为食管癌的诊断和治疗提供新思路。     

长链非编码RNA调控肝癌干细胞的作用

目前常规疗法对晚期、转移或复发肝癌患者疗效差。肝癌干细胞(LCSCs)参与肝癌的发展、侵袭、转移和耐药,与不良预后密切相关,被认为是肝癌治疗的重要靶点。长链非编码RNA(LncRNA)在肝癌中异常表达。最近的研究表明,lncRNAs可能在调控LCSCs的生物学功能中发挥重要作用。全文总结lncRNA调控LCSCs作用的研究现状。     

系统性鉴定长非编码RNA MALAT1调控的微小RNA

背景与目的长非编码RNA（long non-coding RNA, lncRNA）在肿瘤的发生、侵袭转移等过程中发挥着重要的调控作用。本研究通过实验和生物信息学手段系统性研究lncRNA MALAT1调控的微小RNA（microRNA, miRNA）。方法设计特异性敲减MALAT1的反义寡核苷酸（antisense oligonucleotides, ASO）,在A549细胞中敲减MALAT1,通过TqaMan Low Density Array（TLDA）芯片研究敲减MALAT1后miRNA表达变化;使用基因集富集分析（gene set enrichment analysis, GSEA）方法分析敲减MALAT1之后差异表达基因,寻找富集的miRNA。结果 ASO有效降低了MALAT1表达,敲减MALAT1之后153个miRNA表达显著变化,其中131个miRNA表达上调,22个miRNA表达下调。在A549细胞中敲减MALAT1后,458个基因发生显著差异表达,GSEA分析发现多个miRNA在差异表达基因中被显著富集。对TLDA和GSEA数据取交集并进一步分析确认28个被MALAT1调控的miRNA。结论本研究系统鉴定了MALAT1对miRNA的调控,为进一步研究提供了基础。     

长链非编码RNA在舌癌细胞上皮间质转化过程中的调节作用

舌癌恶性程度高,浸润性较强,易早期发生淋巴结转移。上皮间质转化(epithelial-mesenchymal transformation,EMT)是生物胚胎发育中的基础过程,在肿瘤细胞的迁移与侵袭过程中发挥关键作用。长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)是一类参与多种生物学进程的非编码RNA,部分lncRNA在恶性肿瘤的发生发展过程中异常表达,并通过多种方式参与调节肿瘤细胞的EMT。全文就近年来lncRNA在舌癌细胞EMT过程中的调节作用作一综述。     

长链非编码RNA CCAT1在肝细胞癌组织及细胞株中的表达及临床意义

目的 探讨长链非编RNA 结肠癌相关转录子1（LncRNA-CCAT1）在肝细胞癌（HCC）组织及细胞株中的表达及临床意义。方法 采用QPCR法检测CCAT1在4种肝癌细胞株（SMMC-7721、Hep3B、Hub7和HepG2）、正常肝细胞株LO2和42例HCC组织及其癌旁组织中的差异性表达,分析CCAT1表达与HCC临床病理特征的关系（性别、年龄、甲胎蛋白、肿瘤大小、肿瘤数量、淋巴结转移、分化程度和TNM分期）。结果 与正常肝细胞株LO2相比,CCAT1在SMMC-7721、Hep3B、Hub7和HepG2细胞株中均呈高表达（P＜0.05）,其中在HepG2细胞中表达水平最高。CCAT1在HCC组织中的表达水平高于其癌旁组织,差异有统计学意义（P=0.016）;CCAT1在肝癌组织中的表达水平与肿瘤大小、甲胎蛋白、分化程度、TNM分期和淋巴结转移有关（P＜0.05）,而与性别、年龄、肿瘤数量无关（P＞0.05）。结论 LncRNA-CCAT1与HCC发生、发展及预后有关,其作用机制值得进一步研究。     

长链非编码RNA在食管癌中的研究进展

随着分子生物学研究技术的革新和计算机生物信息学的出现和蓬勃发展,长链非编码RNA（lncRNA）的作用和生物学功能得到了深入研究,其在基因的转录翻译、细胞分化、个体发育、遗传及表观遗传等生命活动中具有重要的调控作用。目前,已有众多权威研究证实lncRNA可在表观遗传学、转录水平、转录后水平与DNA、RNA、蛋白质分子相互结合,在多个重要节点调控肿瘤的进展。lncRNA异常表达与肿瘤的发生、发展和转移均密切相关。本文着重强调lncRNA主要生物学功能,并总结其在食管癌中的异常表达及其调控作用,以期为食管癌的诊断和治疗提供新思路。