膜联蛋白A5在胰腺癌中的预后意义及机制的生物信息学分析

背景与目的 胰腺癌是一种诊断较晚、预后差的侵袭性疾病，对于胰腺癌的分子机制研究对改善胰腺癌患者的预后具有重要意义。膜联蛋白A5（ANXA5）与人类肿瘤的发生与发展关系密切，但ANXA5与胰腺癌患者预后的关系及具体机制尚不十分清楚。本研究通过生物信息学分析结合实验验证探讨ANXA5的表达与胰腺癌预后的关系及其作用机制。方法 从TCGA和GEO数据库（GSE15471、GSE16515、GSE21501）下载胰腺癌转录组及临床数据，利用R包分析GEO数据库中ANXA5基因在胰腺癌组织与癌旁正常组织的表达情况，并利用GEPIA在线网站分析TCGA数据库中胰腺癌患者组织与GTEx数据库中正常组织ANXA5基因表达情况。采用Kaplan-Meier的方法分析ANXA5的表达水平对胰腺癌患者总生存时间的影响，然后单因素及多因素Cox分析判断胰腺癌相关危险因素，并利用GSEA分析ANXA5在胰腺癌中可能的信号通路并分析其相关性。最后采用免疫组织化学法检测49例胰腺癌组织和癌旁组织中ANXA5的表达，并分析其与预后及胰腺癌临床病理特征的关系。结果 数据库分析显示，在GSE15471与GSE16515数据集，以及TCGA数据库中ANXA5在胰腺癌组织中的均表达明显升高（均P<0.05）；在GSE21501数据集与TCGA数据库中ANXA5高表达的患者总体生存期明显短于低表达患者（均P<0.05）；TCGA中ANXA5表达是胰腺癌患者预后的独立危险因素（HR=1.819，95% CI=1.058~3.126，P=0.03）；ANXA5基因与胰腺癌TGF-β通路及肿瘤上皮-间质转化（EMT）高度相关。胰腺癌组织样本分析结果显示，ANXA5的表达明显高于癌旁组织（P<0.001），且此基因高表达预示着较差的预后（P=0.008 2）；ANXA5表达是胰腺癌患者预后的独立危险因素（HR=3.06，95% CI=1.046~8.952，P=0.041）；ANXA5的表达与肿瘤临床分期（P=0.000 94）及淋巴结转移（P<0.001）明显相关。结论 ANXA5在胰腺癌中表达升高，其高表达是胰腺癌患者预后的危险因素，其机制可能是通过TGF-β通路及EMT进程促进胰腺癌发展有关。     

富亮氨酸α2糖蛋白1在乳腺癌中的表达及其功能的生物信息学分析

背景与目的 富亮氨酸α2糖蛋白1（LRG1）是富亮氨酸重复序列（LRR）家族蛋白成员,近些年研究显示LRG1在恶性肿瘤的发生、上皮间质转化、侵袭转移、异常血管生成、预后预测中发挥重要作用。然而LRG1在乳腺癌中的表达、预后、功能和潜在机制方面尚待阐明。本研究旨在通过生物信息学方法系统分析LRG1在乳腺癌中的表达及意义。方法 使用TCGA、Breast Cancer Gene-Expression Miner、UALCAN、Kaplan-Meier Plotter、GeneMANIA、DAVID等多个数据库对LRG1在乳腺癌中的表达与临床病理特征关系、预后价值、相互蛋白作用网络及功能富集进行综合分析。结果 TCGA数据库分析显示,LRG1 mRNA在乳腺浸润癌中的表达量明显高于正常组织（23.461 vs. 8.357,P<0.001）。在不同分子亚型中,luminal型乳腺癌中LRG1 mRNA表达量为37.462（9.930~74.197）,高于HER-2阳性型乳腺癌和三阴性乳腺癌（TNBC）（均P<0.01）;I、II、III期乳腺癌中LRG1 mRNA的表达水平均高于正常乳腺组织（均P<0.05）。Breast Cancer Gene-Expression Miner数据库分析显示,雌激素受体（ER）和（或）孕激素受体（PR）阳性乳腺癌中LRG1 mRNA的表达水平高于ER和（或）PR阴性乳腺癌,HER-2阴性乳腺癌中LRG1 mRNA表达高于HER-2阳性型乳腺癌（均P<0.05）;淋巴结阳性乳腺癌LRG1 mRNA表达量高于淋巴结阴性乳腺癌（P<0.000 1）。用GEPIA在线平台对TCGA数据库中乳腺癌数据进行生存分析发现,LRG1高表达患者总生存率（OS）及无复发生存率（RFS）均低于低表达患者,但差异无统计学意义（HR=0.81,P=0.200;HR=0.70,P=0.064）;用Kaplan-Meier plotter对TCGA中乳腺癌数据进行生存分析发现,LRG1的表达与luminal A型、luminal B型、HER-2阳性型乳腺癌的OS无明显关系（均P>0.05）,但在basal-like亚型中,LRG1低表达患者OS明显优于LRG1高表达患者（HR=3.12,95% CI=1.54~6.29,P<0.001）。使用GeneMANIA数据库进行分析,共筛选出20个与LRG1相互作用蛋白质,GO富集分析显示,LRG1及与其共表达相关的20个蛋白富集于细胞胞外区,外泌体,血液微粒,受体复合物等结构中,参与细胞的血管生成调控、上皮间充质的转化、缺氧反应等相关生物学过程。结论 LRG1在乳腺癌组织中表达上调,并可预测部分不良乳腺癌亚型的预后,LRG1可能为乳腺癌治疗提供新的靶点。     

意外胆囊癌二次术后早期复发的危险因素及辅助化疗疗效分析

背景与目的 术后早期复发是胆囊癌预后不良的重要危险因素，越来越多的证据表明辅助化疗可以改善患者的预后。但目前有关意外胆囊癌（IGBC）二次术后早期复发及辅助化疗对患者预后的影响尚未见报道。因此，本文探讨IGBC二次术后早期复发的危险因素及分析辅助化疗对于早期复发和非早期复发患者的疗效，以为临床提供决策支持。方法 回顾性收集2011年1月—2021年12月于西安交通大学第一附属医院肝胆外科因IGBC行意向性根治术的170例患者的临床病理资料，分析患者术后早期复发的影响因素（早期复发定义为二次意向根治术后12个月内），以及患者术后无复发生存（RFS）与总体生存（OS）的影响因素。结果 170例行IGBC意向性根治术后患者，随访期间复发者73例（42.94%）、早期复发者41例（24.12%）。IGBC术后早期复发患者中位OS时间明显短于非早期复发患者（χ²=192.910，P<0.001）。病理分化程度（OR=20.758，95% CI=5.557~80.239）、CA19-9水平（OR=7.920，95% CI=1.557~39.771）及病灶残留（OR=8.050，95% CI=3.062~21.160）是IGBC术后早期复发的独立危险因素（均P<0.05）。病理分化程度（HR=6.160，95% CI=2.877~13.193）、CA19-9水平（HR=2.538，95% CI=1.297~4.965）、手术切除范围（HR=2.111，95% CI=1.154~3.860）、病灶残留（HR=2.571，95% CI=1.547~4.273）是IGBC术后RFS时间的独立危险因素（均P<0.05）。病理分化程度（HR=3.225，95% CI=1.461~7.121）、早期复发（HR=29.558，95% CI=14.250~61.311）、病灶残留（HR=2.416，95% CI=1.361~4.287）是IGBC术后OS时间的独立危险因素（均P<0.05），辅助化疗是术后OS时间的独立保护性因素（HR=0.260，95% CI=0.123~0.551，P<0.05）。按有无病灶残留及是否早期复发分层分析的结果显示，辅助化疗可延长病灶残留患者术后RFS时间及OS时间，亦可延长早期复发患者术后OS时间（均P<0.05）。结论 病灶残留是IGBC二次术后早期复发及预后的独立危险因素，术后辅助化疗可以有效改善病灶残留及早期复发患者的预后。     

胰腺癌肝转移核心基因的筛选与验证

背景与目的 胰腺癌是预后极差的恶性肿瘤,其5年生存率约为11.5%,有将近半数的患者在初诊时已出现远处转移,而肝转移则占到其中的37.0%~41.9%。探索新的胰腺癌肝转移的生物标志物可能有助于提高患者治疗的效果。因此,本研究通过生物信息学方法寻找在胰腺癌肝转移过程起关键作用的基因并验证。方法 下载GEO数据库中的胰腺导管腺癌（PDAC）高通量测序数据集GSE151580（该数据集中包含胰腺癌肝转移病灶组织样本和原发病灶组织样本）,使用R语言“limma”包筛选出肝转移病灶组织样本和原发病灶组织样本间的差异表达基因。对差异表达基因进行GO和KEGG功能富集。利用STRING数据库构建蛋白质间的相关作用关系,使用Cytoscape对蛋白质相互作用网络进行可视化展示并利用CytoHubba插件根据MCC拓扑分析方法,挑选MCC分数最高的前10位基因,确定为候选的核心基因。利用TCGA、GEPIA、UALCAN和HPA数据库的验证对候选的核心基因加以验证。结果 总共纳入分析基因数为46 512个,符合筛选条件的差异表达基因数为491个,其中上调162个,下调329个。挑选MCC分数最高的前10位基因后,通过候选基因经验证显示,APOB基因在肿瘤组织中高表达（P<0.05）,其表达产物主要定位于细胞质和细胞膜,免疫组化中等强度阳性。APOB基因的突变与患者的M分期有关,表现为该基因突变组中,M1患者构成比更大（P=0.022 1）;而该基因的表达与患者的总生存（OS）率和无病生存（DFS）率均无明显关系（均P>0.05）。此外,APOA4基因表达产物也主要定位于细胞质和细胞膜,免疫组化染色呈中等强度阳性。APOA4基因的突变与患者的TNM分期有关,表现为突变组中,TNM分期更早（P=0.018 3）。该基因低表达患者的DFS更高（HR=1.75,P=0.025）,但与患者的OS无关（P>0.05）。结论 APOB基因可能与胰腺癌的肝转移相关,有望作为胰腺癌肝转移早期筛查的分子标志物。APOA4基因与胰腺癌患者的DFS相关,有望成为新的分子标志物用于评价患者预后,监测肿瘤复发,或作为潜在的基因治疗靶点。     

磷脂酰肌醇转运蛋白细胞质1在肝细胞癌中表达及临床意义

背景和目的：肝细胞癌（HCC）侵袭性强,极易发生复发转移,临床预后差。目前HCC发生发展分子机制仍然不清楚。磷脂酰肌醇转运蛋白细胞质1（PITPNC1）是一种脂质代谢相关基因,表现出促癌作用。然而,PITPNC1是否在HCC发展中发挥作用仍然未知。因此,本研究探讨PITPNC1在HCC中的表达及其作用。方法 招募2015年1月—2018年12月间中南大学湘雅医院行肝切除手术的HCC患者116例进行前瞻性队列研究,收集患者的病历资料和组织标本,并进行规律随访。通过免疫组化方法检测患者组织标本PITPNC1蛋白的表达,分析PITPNC1表达和临床病理特征预后之间的关系。通过LCCLD数据库分析PITPNC1在人HCC细胞系中的表达,利用慢病毒包装小RNA干扰PITPNC1在高侵袭转移性HCC细胞系MHCC97H中表达,利用集落形成和皮下成瘤实验观察PITPNC1表达与HCC生长的关系,并对皮下移植瘤行油红O染色。利用生物信息学方法分析PITPNC1作用的分子机制。结果 PITPNC1蛋白阳性染色定位于细胞浆,在癌组织阳性表达率为76.7%（88/116）,在癌旁组织阳性表达率为21.5%（24/116）,差异有统计学意义（P<0.001）。PITPNC1高表达与卫星结节（P=0.041）、血管侵犯（P<0.001）、肿瘤分化（P=0.027）、BCLC分期（P=0.009）、TNM分期（P=0.028）明显有关。Kaplan-Meier生存分析表明,PITPNC1高表达HCC患者总体生存（OS）率与无复发生存（RFS）率均明显降低（均P<0.001）;PITPNC1表达是OS率与RFS率的独立影响因素（HR=11.775,95% CI=1.462~4.082,P=0.006;HR=1.928,95% CI=1.306~4.889,P=0.004）。PITPNC1沉默后,MHCC97H细胞体内和体外生长均明显抑制（均P<0.05）。油红O染色显示,PITPNC1表达下调后,皮下移植瘤的脂质积累明显减少（P<0.05）。数据库分析结果显示,PITPNC1过表达涉及脂质代谢相关的PPAR信号通路活性。结论 PITPNC1是HCC新的癌基因和不良预后标志物。PITPNC1可能通过调控脂质代谢途径而在促进HCC生长过程中可能起重要作用。     

lncRNA MIR31HG和miR-101在分化型甲状腺癌组织中的表达及临床意义

背景与目的 研究表明长链非编码RNA（lncRNA）与微小RNA（miRNA）的表达异常以及两者的相互作用在恶性肿瘤的发生与发展中起了重要作用。本研究探讨分化型甲状腺癌患者癌组织lncRNA MIR31HG与miR-101的表达特点,以及两者表达与患者临床病理特征及预后的关系。方法 用qRT-PCR检测92例分化型甲状腺癌患者的癌组织及癌旁组织手术标本中lncRNA MIR31HG和miR-101表达水平,收集患者的临床资料与随访资料,分析两者表达与患者临床病理因素的关系,用Kaplan-Meier法分析患者生存率,采用Cox比例风险回归模型分析患者预后不良的影响因素。结果 分化型甲状腺癌组织中lncRNA MIR31HG相对表达量明显高于癌旁组织,而miR-101相对表达量明显低于癌旁组织（均P<0.01）。lncRNA MIR31HG和miR-101相对表达量均与患者的临床分期、分化程度、淋巴结转移明显有关（均P<0.05）。lncRNA MIR31HG高表达患者的累积生存率低于lncRNA MIR31HG低表达患者（84.7% vs. 94.6%,χ²=7.032,P=0.016）,miR-101低表达患者累积生存率低于miR-101高表达患者（78.3% vs. 95.6%,χ²=8.482,P=0.004）。临床分期Ⅲ~Ⅳ、分化程度高、癌组织lncRNA MIR31HG相对表达量>1.5和miR-101相对表达量<0.5是分化型甲状腺癌预后不良的危险因素（均P<0.05）。结论 分化型甲状腺癌组织中lncRNA MIR31HG表达上调与miR-101表达下调,是分化型甲状腺癌预后不良危险因素,两者可能成为分化型甲状腺癌预后不良标志物。     

胚系BRCA突变年轻乳腺癌术式选择对预后影响的Meta分析

背景与目的 携带胚系BReast CAncer基因（gBRCA）突变的年轻乳腺癌患者同时具有年轻与基因突变带来的双重风险。目前对于gBRCA突变早期乳腺癌患者是否可行保乳治疗目前尚无一致结论。本研究通过Meta分析探讨不同手术方式对gBRCA突变的年轻乳腺癌患者预后的影响，以及该影响是否有人种差异。方法 检索多个国外数据库，收集比较gBRCA突变早期乳腺癌患者行保乳手术与全乳切除术预后差异的临床研究，对无复发生存（RFS）、无转移生存（MFS）、乳腺癌特异性生存（BCSS）、总生存（OS）等指标进行Meta分析。结果 最终纳入6篇研究（中国2篇，欧美4篇），共2 140例gBRCA突变患者，中位年龄38~47岁。Meta分析结果显示，总体人群中，gBRCA突变患者行保乳手术较全乳切除术复发风险增高（RFS：HR=1.91，95% CI=1.03~3.54，P<0.05），但两种术式的MFS、BCSS、OS差异均无统计学意义（均P>0.05）；中国人群中，gBRCA突变患者行保乳手术较全乳切除术复发风险增高（RFS：HR=1.63，95% CI=1.10~2.41，P<0.05），两种术式的其余指标差异均无统计学意义（均P>0.05），欧美人群中，两种术式的上述指标差异均无统计学意义（均P>0.05）。结论 对于欧美人群，保乳手术不是gBRCA突变早期年轻乳腺癌术后预后的风险因素；但在中国人群中，gBRCA突变早期年轻乳腺癌患者行保乳手术可能具有更高的复发风险，需在术式选择的医疗决策时充分告知。     

对比乙型与丙型肝炎背景下肝细胞癌患者经微波消融治疗后预后

目的 对比观察微波消融（MWA）治疗乙型（HB）与丙型肝炎（HC）背景下肝细胞癌（HCC）的预后。方法 回顾性分析HCC伴HB（HB-HCC）及HCC伴HC（HC-HCC）各159例患者资料,比较组间肿瘤学结局,分析患者死因,观察HCC患者MWA后总生存期（OS）的危险因素。结果 HC-HCC组OS率低于HB-HCC组（P=0.045）,组间无病生存率（P=0.095）及癌症特异性生存率（P=0.189）差异均无统计学意义。相比HB-HCC组,HC-HCC组患者死于肝硬化并发症的风险更高（HR=2.339,P=0.043）。Child-Pugh B级（HR=3.082,P＜0.001）、肝炎病毒载量＞500 IU/ml（HR=1.654,P=0.006）及病灶最大径≥3.0 cm（HR=1.541,P=0.017）均为HCC患者MWA后OS的独立危险因素。结论 相比HB-HCC患者,HC-HCC患者MWA后OS较短。     

ε和δ亚型微管蛋白复合物2在肝细胞癌中的表达及其与患者预后的关系

背景与目的 肝癌（肝细胞癌占75%~85%）每年的新发病例数及死亡例数在我国所有癌症类型中高居第五和第二位,肝癌生长、转移、免疫逃逸及治疗抵抗的分子机制复杂,是目前研究的热点及难点。研究发现ε和δ亚型微管蛋白复合物2（TEDC2）在多种恶性肿瘤中表达上调,且与预后相关,但目前肝癌中的临床意义尚未见报道,因此,本研究探讨TEDC2在肝癌中的表达及其与患者预后的关系。方法 从TCGA和ICGC数据库中下载肝癌患者的转录组数据及临床病理资料,通过GEPIA2网站对TEDC2行泛癌分析,用Kaplan-Meier法分析TEDC2表达与患者预后的关系,用单因素和多因素Cox回归模型分析患者的预后因素,用基因富集分析探索TEDC2表达相关的生物学功能。结果 泛癌分析发现TEDC2是肾上腺皮质癌（ACC）、肾透明细胞癌（KIRC）、肾乳头状细胞癌（KIRP）、急性髓细胞样白血病（LAML）、肝癌（LIHC）和肺腺癌（LUAD）这6种癌症的风险预后因子。TCGA和ICGC数据分析均表明肝癌组织中的TEDC2表达水平高于正常组织（均P<0.05）。TEDC2的表达水平与TNM分期、T分期、组织学分级有关（均P<0.05）,与性别、年龄无关（均P>0.05）。生存分析显示,TEDC2高表达的患者总生存期和无病生存期短于TEDC2低表达的患者（均P<0.05）。单因素和多因素Cox回归分析发现,TNM分期、T分期、TEDC2表达是肝癌预后的风险因素,而仅TEDC2表达在TCGA和ICGC患者中均是肝癌的独立预后因子（均P<0.05）。基因富集分析发现在TEDC2高表达样本中富集细胞增殖相关的通路。结论 TEDC2在肝癌组织中高表达,并且是肝癌的独立预后因子,其高表达与患者的不良预后密切相关,而且,机制可能与细胞增殖活性增加有关。     

胰腺神经内分泌肿瘤临床特征分析：附111例报告

背景与目的 胰腺神经内分泌肿瘤（pNETs）是一种具有恶变潜能的起源于胰岛内分泌细胞的上皮源性肿瘤，在临床上较为罕见。部分肿瘤分泌过量激素，从而引起特定的内分泌综合征。本研究旨在分析pNETs的临床特征、CT及超声内镜（EUS）基本特征，以及各临床特征与预后的相关性，为临床诊疗提供参考。方法 回顾2016年1月1日─2023年5月1日期间中南大学湘雅医院收治的111例pNETs患者的临床资料。所有患者均经手术切除或活检病理确诊。收集患者的一般资料、实验室指标及影像学资料，分析pNETs患者不同临床分期、病理分级的临床特征及影像学特征，以及与预后相关的危险因素。结果 在确诊的111例pNETs患者中，男性53例（47.7%），女性58例（52.3%）；平均年龄为（50.54±13.38）岁，其中非功能性pNETs（NF-pNETs）61例（55.0%），功能性pNETs（F-pNETs）50例（45.0%）。临床特征分析显示，中晚期组（Ⅲ/Ⅳ期）患者病理分级更高、肿瘤多无功能以压迫或转移等症状为主，神经元特异性烯醇化酶（NSE）阳性率更高，治疗方式因出现转移则以化疗、生物制剂治疗等非手术治疗为主。根据病理分级，CT特征分析显示，与低级别组（G1/G2）比较，高级别组（G3/NEC）肿瘤形态多不规则、边界欠清以及更易出现淋巴结转移和远处转移（均P<0.05）；EUS特征分析显示，高级别组期患者肿瘤长径大于低级别组（P<0.05）。中位随访时间为37个月，回访率为78.37%，共纳入87例行预后相关因素分析，结果显示，治疗方式（手术vs.非手术：HR=0.232，95% CI=0.056~0.969，P=0.045）、病灶形态（不规则vs.规则：HR=7.038，95% CI=2.028~24.427，P=0.002）、NSE（阳性vs.阴性：HR=3.584，95% CI=1.029~12.481，P=0.045）为患者预后的独立危险因素。结论 手术是pNETs的首选治疗方式，F-pNETs手术率高于NF-pNETs。CT及EUS引导下细针穿刺抽吸/活检术（EUS-FNA）为诊断pNETs较为敏感和准确的方法。病灶的形态、治疗方式、NSE有预测患者临床预后的潜能。因此，分析pNETs临床特征、影像学表现有助于综合评估病情，监测疾病进展情况，制定相应诊疗方案，改善预后。     

FBXO43在胃癌中的表达及其生物学功能与作用机制

背景与目的：F-BOX蛋白（FBP）家族成员F-box only protein 43 (FBXO43）在肝癌和结直肠癌等消化系统肿瘤中高表达,促进肿瘤恶性进展,且研究显示,FBXO43促进p53降解,发挥促瘤功能。为此本研究进一步探讨FBXO43在胃癌中的表达及其在胃癌恶性进展中的功能与相关机制。方法：基于TCGA、GTEx和Kaplan-Meier Plotter等在线数据库,分析FBXO43在胃癌组织中的表达及其与胃癌患者预后的相关性。用Western blot和qPCR检测FBXO43在胃癌细胞与正常胃黏膜上皮细胞中的表达水平;用免疫组化检测在胃癌组织与癌旁组织中FBXO43的蛋白水平。利用脂质体转染特异性靶向FBXO43和p53的小分子干扰RNA分子（siFBXO43和sip53）,分别或同时敲低HGC27和MGC803细胞中的FBXO43和p53的表达,利用CCK8、平板克隆形成、Transwell侵袭和迁移等实验,检测细胞生长、增殖、迁移和侵袭能力的影响;利用免疫共沉淀（Co-IP）检测FBXO43和p53的相互作用情况,以及敲低FBXO43后,p53的总泛素化水平。结果...     

术前中性粒细胞与淋巴细胞比值对胰腺癌手术患者预后价值的Meta分析

背景与目的：胰腺癌是恶性程度极高的实体恶性肿瘤之一,因早期缺乏症状导致多数患者确诊时已处于局部进展期或晚期。因此,探索术前判断预后的标志物对临床制定诊疗策略至关重要。目前,术前中性粒细胞与淋巴细胞比率（NLR）与胰腺癌患者预后的关系尚存在争议。本研究使用Meta分析方法,探讨术前NLR与胰腺癌患者术后生存获益之间的关系及其预后价值。方法：计算机检索PubMed、Cochrane Library、Web of Science、中国知网、维普及万方数据库收集术前NLR值与胰腺癌患者术后总体生存期（OS）和无病生存期（DFS）关系的研究,检索时限均从建库至2022年3月31日,由两名评价员独立筛选并纳入文献,提取资料并评价纳入研究的偏倚风险后,利用Revman 5.4和Stata 16.0软件对风险比（HR）和95%可信区间（CI）进行合并,并根据异质性选择对应的效应模型。对纳入研究的文献进行敏感度分析,用Egger回归检验判断纳入文献是否存在显著发表偏倚。结果：共纳入25项回顾性研究,4 796例研究对象。研究中有24篇文献报道了NLR与术后OS之间的关系,6篇报道了NLR与术后DFS之间...     

Increased BCAR1 Predicts Poor Outcomes of Non-small Cell Lung Cancer in Multiple-Center Patients

Objective

This study was designed to determine the prognostic value of BCAR1 expression and its associations with clinical-demographical characteristics in multiple centers of non-small cell lung cancer (NSCLC) patients.

Methods

Gene expression microarray (mRNA) of 77 adenocarcinomas from Mayo Clinic, RNA-sequencing of 508 NSCLC from The Cancer Genome Atlas (TCGA), and immunohistochemistry stain of BCAR1-protein expression in 150 cases from Daping Hospital were included in the study. The association of mRNA or protein expression with patient clinical characteristics and overall survival was assessed in each dataset. We also predicted microRNAs (miRNA) that target BCAR1 using bioinformatics prediction tools and evaluated miRNA expression patterns with BCAR1 expression in miRNA-sequencing data of 74 lung cancer cases from TCGA dataset.

Results

In the Mayo Clinic dataset, a higher BCAR1-mRNA level correlated significantly with more advanced tumor-stage and lymphatic metastasis. Similar changes were observed in the TCGA RNA-seq dataset. Additionally, higher BCAR1-mRNA levels predicted poorer survival in adenocarcinoma and squamous carcinoma from the TCGA dataset. The protein levels in the adenocarcinoma cases with lymphatic metastasis were significantly higher than of those without metastasis. Tumor tissues demonstrated remarkably higher levels of protein compared with matched normal tissues although there was no significant difference in BCAR1-mRNA expression between tumor and matched normal tissues was detected. In miRNAs that were downregulated in the tumors, Let-7f-2 and miR-22 differed the most (P < 0.001 and P = 0.007, respectively).

Conclusions

We confirmed that increased BCAR1 expression predicts poorer prognosis in NSCLC. We postulate that mRNA-protein decoupling of BCAR1 may be a result of reduced inhibition of specific miRNAs in tumor tissues, which warrants further study.

     

T1期乳腺癌的临床病理特征及预后危险因素分析

背景与目的：T1期乳腺癌患者总体生存预后良好,但仍有少部分患者具有高度侵袭性,早期容易出现复发转移与死亡等不良生存结局,预后较差。本研究探讨影响T1期乳腺癌的临床病理特征及预后的危险因素,旨在早期识别高风险的T1期乳腺癌患者,为临床决策提供参考。方法：回顾性分析中南大学湘雅医院2011年1月—2015年12月经手术治疗的1 250例T1～T3期原发性浸润性乳腺癌患者资料,分析T1期与非T1期患者的临床病理学特征差异,单因素及多因素Cox风险模型分析影响T1期乳腺癌患者复发转移及死亡的危险因素,Kaplan-Meier法分析不同危险因素下T1期乳腺癌患者总生存（OS）和无病生存（DFS）的差异,Log-rank检验比较组间生存曲线差异。结果：1 250例原发性浸润性乳腺癌患者中,T1期261例（20.88%）,非T1期（T2和T3期） 989例（79.12%）。与非T1期比较,T1期患者BMI值低、腋窝淋巴结转移数目少、不利生物学特性少、生存预后好（均P<0.05）。T1期患者随访期间共15例死亡,40例出现复发转移。中位OS时间为94 (5～132)个月,2、5、10年OS率分别...     

环状RNA KIF4A在结直肠癌中表达与功能及其作用机制

背景与目的：环状RNA KIF4A (circKIF4A)被发现在多种肿瘤的恶性进展中起到重要作用,然而,circKIF4A在结直肠癌中的生物学作用尚未见报道。因此,本研究探讨circKIF4A对结直肠癌生物学行为的影响及机制。方法：用qRT-PCR检测不同结直肠癌细胞系与结肠黏膜上皮细胞以及结直肠癌组织与癌旁正常组织中circKIF4A的表达;用siRNA敲低结直肠癌SW620细胞中circKIF4A的表达后,分别检测细胞生长、克隆形成及侵袭能力以及细胞内总谷胱甘肽（T-GSH）/氧化型谷胱甘肽（GSSG）比例与铁死亡抑制蛋白SLC7A11表达的变化;通过生物信息学软件和双荧光素酶报告基因实验预测和分析circKIF4A的目标microRNA (miRNA)以及下游的靶基因并验证。结果：与正常结直肠上皮细胞及癌旁组织比较,circKIF4A在不同直肠癌细胞系及癌组织中的表达均明显上调（均P<0.05）;敲低circKIF4A后,SW620细胞的生长、克隆形成、侵袭能力、细胞内T-GSH/GSSG比例及SLC7A11蛋白表达均明显降低（均P<0.05）;预测与分析结果显示,...     

长链非编码RNA 909靶向调控miR-194-5p/DACH1轴对胰腺癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响

背景与目的:长链非编码RNA 909(LINC00909)是一个新发现的长度约为2 kb的长链非编码RNA(lncRNA),在胶质瘤和白血病中被报道发挥癌基因的作用.然而LINC00909在胰腺癌中的作用鲜有报道.本研究旨探讨LINC00909在胰腺癌中的表达及其对患者预后的影响,以及LINC00909与其调控网络对胰...     

长链非编码 RNA SOX21-AS1调控 miR-31-5p/MMP-16轴对胰腺癌细胞活性与增殖的影响

背景与目的:胰腺癌是一种常见的消化系统恶性肿瘤,也是癌症死亡的常见病因.长链非编码RNA(lncRNA)已在多种恶性肿瘤中被鉴定为调节因子和特异度生物标志物.最新研究表明,lncRNA SOX21-AS1在多种恶性肿瘤的发生、发展中起重要作用.但其在胰腺癌中的作用尚未明确.因此,本研究探讨SOX21-AS1在胰腺癌中的...     

IFITM1在胰腺癌中的表达及对胰腺癌细胞生物学行为的影响

背景与目的:干扰素诱导的跨膜蛋白1(IFITM1)是一种在淋巴细胞中转导同型黏附信号的膜复合物,在胰腺癌组织中表达量异常,但是其在胰腺癌中的作用机制则仍不清楚,因此,本研究初步探讨IFITM1的表达对胰腺癌细胞生物学行为的影响.方法:用Western blot法检测78例胰腺癌患者(32例转移,46例未转移)的癌组织和...