2015年江苏省HIV耐药警戒线调查

目的:了解2015年江苏省的免疫缺陷病毒(HIV)耐药株传播水平和亚型分布?方法:采用WHO的截断序贯抽样法,在江苏省获得性免疫缺陷综合征(艾滋病)疫情主要发生地南京采集47例当年新报告25岁以下HIV感染者血样,提取病毒RNA,采用RT-PCR和巢式PCR扩增HIV-1 pol区片段,并进行传播型耐药基因型分析?结果:2015年调查对象的序列成功获得率为100%(47/47),亚型以CRF01_AE亚型为主(59.6%),其次依次为CRF07_BC(25.5%)?C亚型(6.4%例)和B亚型(2.1%),并在亚型分析中发现3例URFs?江苏省HIV耐药传播水平为低流行,47份样本中发现1份样本存在传播型耐药位点突变,为蛋白酶区耐药位点突变(M46I)?该例耐药个体感染途径为同性传播,亚型为CRF01_AE?此次抽样调查发现学生所占比例最大,为46.8%(22/47),已超过商业服务人员29.8%(14/47)的比例?传播途径除1例异性传播外,其余均为同性传播?结论:江苏省首次发现传播型耐药1例,说明耐药株已开始传播?虽仍为低流行,但应密切关注耐药株传播水平的趋势变化?学生逐渐成为25岁以下感染者的主要群体,扩大对该人群的检测咨询干预工作应成为艾滋病防控工作的重点?对男男性行为做好预防措施,是控制耐药株传播的关键?     

江苏省HIV耐药警戒线的调查

目的:了解江苏省开展艾滋病抗病毒治疗以来,耐药毒株的传播情况和亚型分布?方法:通过横断面调查,采集17~25岁HIV-1感染者的全血样品,测定HIV-1pol区编码蛋白酶和逆转录酶基因的序列,提交到斯坦福大学HIV在线耐药数据库中鉴定耐药位点?用MEGA4.0软件构建进化树,分析亚型?结果:47份样品中,没有发现HIV-1的耐药株?共有CRF01_AE?B?CRF07_BC和CRF08_BC 4种亚型流行,CRF01_AE是主要流行的亚型,占59.6%,其次为B亚型,占25.5%?结论:江苏省还未发现耐药株的传播,个体治疗前尚不需要进行耐药性检测?在江苏省流行的HIV-1亚型与2006年相比,已经发生了显著变化,为掌握目前江苏省HIV-1的亚型分布,应对近2年发现的HIV感染者进行分子流行病学研究?     

贵州省新发现HIV-1毒株亚型特征研究

目的 分析研究贵州省HIV-1亚型毒株分布及流行特征,为艾滋病防治及疫苗研制提供科学依据.方法 用套式基因扩增方法(PCR)扩增HIV-1毒株gag基因和env基因并测序分析.结果 128例样本扩增、测序成功119例,其中CRF01-AE亚型62例,CRF07-BC重组亚型49例,CRF08-BC重组亚型2例,B亚型6例.结论 本次研究贵州省HIV-1毒株以新发现的CRF01-AE重组亚型流行为主,CRF07-BC重组亚型次之,多亚型并存;分析结果提示贵州省HIV-1毒株亚型向性传播转变.     

钦州市钦南区HIV-1流行亚型及基因变异特征研究

目的 调查流行于钦南区的HIV-1亚型种类并分析其基因变异特征.方法 抽取100例未抗病毒治疗的HIV-1感染者,从血样中提取病毒RNA或前病毒DNA,采用聚合酶链反应(PCR)扩增HIV-1 gag基因和pol基因片段并测序,用系统进化树分析其亚型,并计算gag和pol区的基因离散率.结果 97份血样获得gag基因序列或pol基因序列,4份血样的gag与pol分型不一致,其他93份分型明确,其中CRF01_AE重组型、CRF07_BC重组型、CRF08 BC重组型及G亚型分别占76.34％(71/93)、9.68％(9/93)、12.90％(12/93)和1.07％(1/93).CRF08_BC的gag基因离散率为0.059±0.005,高于CRF07_BC的0.053±0.005(P＜0.01)和CRF01_AE的0.049±0.004(P＜0.01).CRF01_AE的pol基因离散率为0.044±0.003,高于CRF07_BC的0.035±0.004(P＜0.01)和CRF08 BC的0.033±0.003(P＜0.01).结论 钦南区HIV-1存在至少3种流行亚型,其中CRF01_AE是最主要的亚型,不同基因区的变异程度有所不同.     

江苏省艾滋病患者HIV-1耐药株的流行及影响因素研究

目的:了解江苏省艾滋病患者的耐药性,并探讨其影响因素?方法:以正在接受抗病毒治疗的艾滋病患者为研究对象,整群抽取了1 022人,对其进行问卷调查和血液采集,采用基因型耐药分析法对其进行耐药性检测?结果:共877名研究对象被纳入分析,人类免疫缺陷病毒(HIV-1)毒株总耐药率为6.50%?CD4水平低?独居?收入水平低?感染时间长?抗病毒治疗时间长和最近1个月出现HIV相关临床症状等因素是HIV-1耐药毒株产生的危险因素?结论:江苏省抗病毒治疗人群目前耐药率处于较低水平,但耐药个体核苷类逆转录酶抑制剂(NRTI)和非核苷类逆转录酶抑制剂(NNRTI)双重耐药突出;应多关注病程较长?抗病毒治疗时间较长?身体免疫状况较差?收入水平较低?居住状况不稳定的患者,增加CD4检测和耐药检测的频率,以尽早发现耐药情况,降低耐药毒株的发生和传播,提高抗病毒治疗的疗效,进而减少艾滋病患者的死亡?     

桂林市经性传播的HIV-1的流行特征和亚型分析

目的：了解桂林市2008年及以后确诊的经性传播的人类免疫缺陷病毒1型( HIV-1)感染者的流行病学及亚型的分布情况。方法选取样本100例,收集流行病学资料,采集抗凝全血,提取病毒RNA,RT-PCR法行gag基因扩增,对产物进行测序和分析。结果100例样本中男女比例为2．125∶1;青壮年年龄组(20~49岁)患者为54%,>50岁年龄组患者为45%;职业为农民的患者为40%,学生为6%;初中及以下文化水平患者占69%;经异性和同性性接触途径传播的分别为93%、7%。100例样本最终成功扩增得到61例样本的 gag 基因序列, CRF01-AE 重组亚型48例, CRF07-BC重组亚型8例,B亚型5例。结论应更加重视婚检、孕检的艾滋病抗体筛查;关注老年人群经性接触途径感染艾滋病的现象;采取针对低素质人群的有效防治措施;随着主要传播途径和主要亚型的变化,迫切需要对高危人群进行宣传教育和行为干预以阻断HIV/AIDS的流行和传播。     

TRUGENE HIV-1基因型检测系统在HIV-1亚型分析中的应用

目的利用TRUGENE HIV-1基因型检测系统对我国部分地区HIV感染者的血浆样本进行耐药性检测的同时进行HIV-1的亚型分析。方法采用TRUGENE HIV-1试剂盒扩增靶HIV-1序列即pol基因中长度分别为297bp的蛋白酶基因片段和621bp的逆转录酶基因片段，采用OpenGene DNA测序系统和数据分析软件进行测序和序列分析，利用HIV Database网站提供的HIV基因亚型分析软件对所得到的靶序列进行亚型分析。结果对165份标本的靶序列进行扩增和测序全部成功，采用蛋白酶基因片断和反转录酶基因片断进行亚型分析的结果非常吻合，165份标本亚型的分类与分布情况提示目前各类感染人群中的HIV-1毒株的亚型分布特点呈现出多样化和复杂性。另外，发现了一例国内尚未报道过的CRF09-cpx HIV-1的感染。结论TRUGENE HIV-l基因型检测系统可以成功的应用于HIV-1的亚型分析。     

我国口岸出入境人员HIV-1基因亚型分析

目的研究我国口岸检出的人类免疫缺陷病毒I型（HIV-1）感染者的HIV-1 gag区基因序列特征，了解亚型种类，为艾滋病的监控和防制提供科学依据。方法从HIV阳性的出入境人员血浆中提取病毒核酸，之后采用RT-PCR法扩增gag区基因，对该段序列进行测定分析。结果2004～2006年确认的39例HIV阳性标本，根据gag区基因序列系统树分析显示，共有8种亚型，其中12例C亚型，9例CRF01_AE重组，6例CRF07_BC重组，5例CRF08_BC重组，4例B亚型，1例B’亚型，1例CRF02_AG重组和1例A1亚型。结论北京口岸检出的HIV-1亚型种类较为复杂，研究口岸艾滋病病毒的变异特点和传播来源对于我国艾滋病的防治具有重要作用。     

HIV-1感染者不同人群的亚型分析

目的 研究河北省2008年新确认的HIV-1感染者不同人群的亚型分布情况.方法 选取2008年新确认的HIV-1感染者,利用分子生物学方法进行分型后,对不同人群的亚型分布情况进行分析, 探讨不同HIV-1感染者人群的亚型分布比例有无差异.结果 在58例已确定亚型的HIV-1感染者中,来源于性传播、吸毒、血液和不详4种不同的人群,包含了B、CRF01_AE、CRF07-BC、CRF08-BC和C 5种亚型.在这4种人群中,性传播途径的人群以B亚型(42.1%)和CRF01_AE(34 2%)为主,但是5种亚型的毒株均存在;血液传播途径中,均为B亚型;在吸毒人群中,均为CRF07_BC亚型;不详人群中亚型相对较复杂,包含了C亚型除外4种亚型.结论 河北省HIV感染者亚型的分布具有明显的人群特点.     

HIV-1整合酶抑制剂的发展和基因耐药研究

整合酶（Integrase, IN）是HIV-1病毒生命周期中最重要的4个酶之一。整合酶抑制剂（integrase inhibitors, INIs）是针对艾滋病患者的新一类抗HIV-1病毒药物,主要针对整合酶发挥作用,阻断病毒基因组整合至人体基因组的过程。相比传统抗病毒治疗药物,INIs上市时间短,耐药屏障高,且人体细胞结构中没有整合酶,毒副作用较小,更有利于患者治疗。但是随着使用人数的增多,不可避免地出现整合酶基因耐药突变。我国目前INIs耐药研究较少,已有研究均参考欧美国家相关数据,但是由于我国流行株以重组亚型为主,与欧美国家B亚型相差较大,因此不能直接借鉴欧美国家的研究结果。有必要深入研究我国流行亚型毒株的整合酶基因型耐药突变情况,同时关注接受INIs治疗患者的耐药情况,弥补我国获得性整合酶耐药研究的空白,为后续大规模临床推广INIs提供数据参考依据。     

深圳市HIV-1主要流行株外膜蛋白V3环氨基酸变异分析

目的 了解深圳市HIV-1主要流行株膜蛋白V3环氨基酸变异情况。方法 收集深圳市1996—2010年HIV确认阳性样本389份,应用巢式聚合酶链反应（Nested-PCR）技术,对样本膜蛋白(Env)基因V3-V4区进行扩增,并对核苷酸序列进行测定,判定亚型结果。对获得的CRF01_AE、CRF_BC、B’和B重组株/亚型的核酸序列进行比对和翻译,分析其V3环氨基酸变异情况。结果 227例CRF01_AE重组株V3环顶端四肽主要为GPGQ(184/227,81.1%),199例(87.7%)可预测使用CCR5辅助受体,12例(5.3%)使用CXCR4辅助受体;55例CRF_BC重组株V3环顶端四肽主要为GPGQ(54/55,98.2%),50例(90.9%)可预测使用CCR5辅助受体,5例(9.1%)不能预测;49例B’亚型毒株V3环顶端四肽主要为GPGR(39/49,79.6%),25例(51.0%)可预测使用CCR5辅助受体,3例(6.1%)使用CXCR4辅助受体,21例(42.9%)不能预测;10例B亚型毒株V3环顶端四肽主要为GPGR(5/10,50.0%),8例(80.0%)可预测使用CCR5辅助受体,2例(20.0%)使用CXCR4辅助受体。CRF01_AE、CRF_BC、B’和B亚型毒株V3环净电荷数分别为3.29±0.97(n=227)、3.11±0.42(n=55)、3.73±0.93(n=49)和3.50±0.97(n=10)。结论 深圳市HIV-1 V3 环顶端四肽主要为GPGQ和GPGR,病毒辅助受体使用以及表型预测结果表明深圳市HIV-1的流行仍以复制速度较慢的非合胞体诱导型病毒为主。     

1997～2002年山东省HIV-1流行株env基因序列测定和亚型分析

①目的对1997～2002年间山东地区HIV-1各亚型分离株进行基因分型，了解各亚型的分布及其与传播途径的相互关系。②方法采集1997～2002年间山东省38例HIV-1感染者的抗凝全血标本，用巢式PCR技术扩增外周血单个核细胞中HIV-1前病毒env基因C2～V3区，并对C2～V3区的核苷酸序列进行测定和分析。⑧结果山东省38例HIV-1分离株中存在亚型和重组毒株4种（A、B、C、A／E）。其中A亚型5株，B亚型22株（其中包括泰国B亚型11株），C亚型10株，A／E重组毒株1株。各亚型内的离散率有差异，A、B、c亚型内基因离散率分别为1．5％、8．6％和1．9％。在性乱人群和静脉吸毒人群中以A亚型和C亚型为主；在职业献血和不安全血制品使用者中以B亚型为主。④结论1997～2002年间山东省HIV-1流行特点为A、B、c亚型共存，伴有重组毒株；传播途径复杂，基因变异较大，B亚型仍然为主要流行株。     

湖北省未经抗病毒治疗的HIV-1感染者的耐药基因变异分析

目的了解湖北省部分地区未经抗病毒治疗的HIV感染者的耐药基因变异情况。方法采集HIV—1感染者抗凝全血，提取血浆病毒RNA，用巢式PCR方法（Nested polymerase chain reaction，nested—PCR）扩增HIV—1pol区基因片段的核酸序列，并进行序列测定及耐药基因型分析。结果135份样本中有115份扩增出pol区基因并进行序列测定。在蛋白酶基因上检测到的基因突变有：L63ASP（99．13％），A71TV（32．18％），V77IM（93．04％），193L（90．43％），L10I（1．74％），K20EMR（3．48％），L24V（0，87％），V32AE（1．74％），M36I（2．61％），147M（0．87％）；逆转录酶上针对核苷类逆转录酶抑制剂的突变有：E44K（0．87％），T215S（0.87％）；针对非核苷类逆转录酶抑制剂的突变有：K103INR（3．48％），V106I（1．74％），G190AR（1．74％）。显示115份样本中对NNRTIs的高度耐药突变出现2例，而针对PIs和NRTIs没有出现中度以上的耐药突变。结论湖北省未经抗病毒治疗的HIV感染者多数对现有的免费抗病毒药物敏感，但也发现有少数耐药基因的存在。应加强用药的科学性和抗病毒治疗用药的监管。     

2015年河南省新确证HIV-1感染者耐药传播状况研究

目的调查2015年河南省新确证人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)感染者中HIV耐药株的流行情况。方法对河南省4个地区2015年1—6月新确证HIV-1感染者确证时的信息资料进行整理,随后进行血样采集,基因型耐药检测和数据的分析。结果共收集到117例患者的样本和信息,得到63例患者的基因型耐药检测结果。63例患者中有11例被检测到携带耐药株,耐药传播率为17.46%。男性的耐药传播率高于女性(P<0.05),20~39岁病例的耐药传播率高于其他年龄段(P<0.05),B亚型的耐药传播率高于其他亚型(P<0.05),郑州地区病例的耐药传播率高于其他地区(P<0.05)。非核苷类逆转录酶抑制剂(NNRTI)和核苷类逆转录酶抑制剂(NRTI)耐药突变的发生率分别为15.87%(10/63)、4.76%(3/63)。NRTI耐药突变有M184V、K65R和F227FL,NNRTI耐药突变有V106I/V/M、V179D/V/E、G190E、V108I、Y181C和H221Y。2例病例同时携带NNRTI和NRTI耐药突变。CRF07-BC亚型占比最高,为36.51%(23/63),其次为B亚型[34.92%(22/63)]和CRF01-AE[26.98%(17/63)]。结论河南省新确证HIV-1感染者中已经出现了一定程度的耐药传播,CRF07-BC和CRF01-AE已经成为主流毒株亚型。     

云南省HIV-1 CRF01_AE毒株基因型耐药研究

目的 了解云南省HIV-1 CRF01_AE毒株的流行分布及基因型耐药情况。 方法 收集2018—2021年云南省抗病毒治疗失败的HIV/AIDS患者的人口学资料,采集患者血浆,逆转录聚合酶链反应扩增HIV-1 pol基因蛋白酶和逆转录酶区并进行序列测定,对基因型为CRF01_AE的序列进行耐药情况分析。结果 通过基因型耐药检测共获得967例亚型为CRF01_AE序列,其中男性682例（占70.5%）,耐药509例,耐药率为52.6%,异性性传播813例（占84.1%）,同性性传播95例（占9.8%）。同性性传播的耐药率最高,为65.3%;治疗时长<12个月的耐药率最低,为35.9%,36~<48个月耐药率最高,为58.1%。核苷类反转录酶抑制剂（NRTIs）耐药率为33.9%,非核苷类反转录酶抑制剂（NNRTIs）的耐药率为48.5%,蛋白酶抑制剂（PIs）的耐药率较低为1.3%。NRTIs类药物中阿巴卡韦（ABC）、恩曲他滨（FTC）和拉米夫定（3TC）耐药率较高,分别为为32.9%、32.4%和32.4%;NNRTIs类药物中奈韦拉平（NVP）和依非韦仑（EFV）耐药率较高,分别为47.6%和47.5%,均以高度耐药为主。一线治疗方案耐药率56.2%高于二线治疗方案耐药率29.5%,差异有统计学意义（P<0.001）。NRTIs耐药突变位点中,以M184V/I突变位点为主,突变率为30.0%;NNRTIs耐药突变位点中,以K103N/Q/S突变位点为主,突变率为28.1%;PIs耐药位点突变率相对较低,主要的耐药突变位点是L33F,突变率为3.7%。结论 云南省抗病毒治疗失败亚型CRF01_AE的患者耐药率有所降低,但部分地区及人群的耐药率仍较高,应加强对重点地区和人群的管理,加强耐药监测,对治疗失败的患者及时掌握耐药情况,合理调整治疗方案。     

两种HIV-1基因型耐药检测方法用于干血斑样本的比较

目的使用两种HIV-1基因型耐药检测方法分别检测干血斑(Dried Blood spot,DBS)样本并比较耐药结果,以期建立适合的检测方法。方法选择河南省和安徽省经高效抗逆转录病毒治疗(highly active anti-retroviral therapy,HAART)5年以上HIV感染者共35名,采集全血制作干血斑标本,进行CD4+细胞计数和病毒载量测定,分别使用两种文献报道的方法扩增干血斑标本中的HIV-1 pol区核苷酸片段,进行HIV-1基因型耐药检测,并比较34个主要耐药突变位点差异。结果低载量1×103copies/m L,方法2具有更高的扩增率(5/5),而方法1能扩增成功3份(3/5)。方法2共检出269个主要耐药突变位点,两种方法耐药位点的一致率为95.9%(258/269)。与方法1比较,有11个耐药位点存在差异,7个位点由混合碱基引起,另4个差异位点则集中为:E138Q和K101Q。结论两种方法都能够检测病毒载量大于1×103copies/m L的样本,但是对于低载量样本方法 2较方法 1有更好的表现,后续应选择更多的不同亚型标本进行研究。     

中国HIV-1的主要流行状况

自1981年美国报告首例艾滋病（AIDS）以来，艾滋病正以惊人的速度在全球传播和扩散。中国的艾滋病也进入了快速传播期。本文章综述了中国，尤其是云南省和中部地区HIV-1的主要流行情况。     

HAART治疗儿童的HIV-1基因型耐药变异情况

目的研究我国某地区HAART治疗的儿童HIV-1基因型耐药变异情况,为临床治疗HIV-1感染儿童提供参考实验室参考数据。方法利用RT-PCR和套式PCR从20例HAART治疗失败的HIV-1感染儿童的血浆中提取的病毒RNA扩增HIV-1逆转录酶基因（RT）第40-250位氨基酸,直接将PCR产物进行序列测定分析,利用斯坦福大学网站提供的HIVdb数据库分析该两个区域的耐药基因变异情况。结果（1）20例患儿根据RT区基因分型结果显示均为B亚型;（2）分别有20、15、13例患儿对NVP、DLV和EFV产生了高度耐药;分别有7例、5例患儿对AZT产生了高、中度耐药;有5例患儿对3TC产生了从潜在低度一中度耐药突变,而有11例患儿出现了高度耐药突变;针对d4T、ddI的中、高度耐药共占11／20;此外,19例患儿出现了针对从未服用的ABC的不同程度的耐药突变,12例患儿出现了针对TDF的不同程度的耐药突变。结论HIV-1耐药突变株的出现是儿童抗病毒治疗失败的主要原因之一。对于正在抗病毒治疗中的HIV-1患儿,应及时进行耐药变异监测,及早发现耐药变异。及时改变抗病毒治疗药物以达到真正的病毒抑制效果。     

深圳市2010年HIV-1分子流行病学调查

目的了解2010年艾滋病病毒-1型（HIV-1）毒株亚型在深圳市的流行情况,为预防和控制HIV在本市的流行提供有价值的资料。方法收集2010年深圳市HIV-1确认为阳性的样本150例,应用巢式聚合酶链反应（nested-PCR）技术,对该样本膜蛋白基因（env基因）和核心蛋白（gag基因）进行扩增,并对各基因区核苷酸序列进行测定和分析。结果共有128份样本获得分型结果,其中CRF01_AE重组株占63.3%（81/128）,B’亚型占14.1%（18/128）,CRF07_BC重组株占13.3%（17/128）,CRF08_BC重组株占7.0%（9/128）,C亚型占0.8%（1/128）,A1亚型占1.6%（2/128）;CRF01_AE重组株以吸毒传播、异性性传播和同性性传播为主,分别占其感染人群的23.5%、45.7%和30.9%,CRF07_BC、CRF08_BC重组株以异性性传播和同性性传播为主,分别占各感染人群的41.2%、58.8%和66.7%、33.3%%,B’亚型主要分布在性传播、献/输血和母婴传播人群。本文首次在吸毒人群中发现A1亚型。结论 2010年深圳市的HIV-1是以CRF01_AE重组株、B’亚型、CRF07_BC和CRF08_BC重组株为主要流行毒株,也存在A1和C亚型;CRF01_AE重组株是各传播途径人群中的主要流行株,并且CRF01_AE重组株在各人群中所占的比例高于国内其他地区。     

河南省部分地区HIV流行毒株的基因序列测定及亚型分析

目的:了解河南省内HIV-1流行株的亚型及序列变异特征.方法:在河南省尉氏县采集42例有偿献血HIV-1感染者静脉血,分离单个核细胞(PBMC),用套式聚合酶链反应(nest-PCR)对单个核细胞中前病毒脱氧核糖核酸(DNA)的膜蛋白(env)基因进行扩增,并对其C2-V3及邻区350～450个核苷酸序列进行测定和分析.结果:42份样品间的基因离散率为7.4%.与国际A-E亚型参考序列及部分地区B'亚型代表株序列相比较,河南省尉氏县的42个毒株及流行与我国云南德宏、四川等地的B'亚型毒株序列接近,均属于泰国B'亚型,基因离散率为6.72%系统树分析显示,42份样品仍和泰国B'亚型聚集,远离其他国际亚型.对V3环四肽序列的分析表明,具有泰国B'亚型基因型GPGQ的30例,具有欧美B'亚型的GPGR的7例.结论:根据以上数据及其它资料提示,目前河南省尉氏地区的既往献血人群中,泰国B'亚型依然占主导地位,该流行区毒株的传入与流行在云南德宏州的相同亚型HIV-1毒株密切相关.但是根据其离散率及系统树的结果提示,既往献血人群中泰国B'亚型有向其他亚型进一步变异的趋势,应引起有关部门的注意.