凉山彝族自治州HIV流行毒株基因亚型分析

目的对16例来自凉山彝族自治州的HIV感染者进行亚型分析,监测该地区感染人群HIV毒株的流行情况。方法从16例HIV-1抗体阳性样本中分离外周血单核细胞（PBMC）,从PBMC中提取基因组DNA,直接进行巢式PCR扩增HIVenv基因c2～v5区及gag基因p17～p24区,对PCR产物进行核苷酸序列测定和分析,确定基因亚型。结果 16例样本全部为BC重组亚型,env基因的基因距离较gag基因远,gag基因在进化上与CRF07-BC更为接近。结论凉山彝族自治州的HIV流行毒株主要为CRF07-BC。     

HIV/AIDS合并结核病患者196株结核分枝杆菌耐药分析

目的 探讨人类免疫缺陷病毒(HIV)/获得性免疫缺陷综合征(AIDS)合并结核病患者结核分枝杆菌菌株的耐药情况.方法 收集成都市公共卫生临床医疗中心2012年1月至2015年12月住院治疗的HIV/AIDS合并结核病初治患者196例,分析AIDS合并活动性结核病(包括肺结核及肺外结核)患者的痰液/组织液/纤冲液及病理组织送检分枝杆菌培养出的结核分枝杆菌菌株的耐药情况,采用BACTEC MGIT960鉴定系统进行菌型鉴定,960分枝杆菌培养系统进行药敏实验.结果 共培养出结核分枝杆菌菌株196株,发生结核分枝杆菌总体耐药率为26.02％;将196例AIDS合并结核病患者按CD4+T淋巴细胞计数不同分为大于100个/μL、≤100个/μL两组,比较两组患者结核分枝杆菌菌株对4种一线抗结核药物的耐药状况,发现两组患者结核分枝杆菌菌株对一线抗结核药物耐药率比较,差异无统计学意义(P＞0.05),一线抗结核药耐药发生率由高到低依次为:异烟肼、利福平、链霉素、乙胺丁醇.两组患者结核分枝杆菌菌株对5类耐药结核耐药率比较,差异无统计学意义(P＞0.05).结论 AIDS合并结核病初始患者耐药率与我国结核平均初始耐药水平一致,HIV/AIDS合并结核病患者的结核耐药性与CD4+T淋巴细胞计数水平高低无相关性.     

HIV耐药基因变异现况研究

人类免疫缺陷病毒(HIV)在药物的使用过程中面临着药物选择的压力,且同时HIV是反转录病毒,其反转录酶在HIV复制时具有DNA复制能力但没有校正能力,使HIV有高度的遗传变异性。目前已确定的HIV耐药相关的基因突变有200多种,HIV耐药基因的检测对临床合理设计用药策略产生不同程度的影响。该文就HIV的耐药基因突变位点、HIV耐药性产生的机制及检测方法进行综述。     

广西≥50岁男性新报告人类免疫缺陷病毒感染者的基因亚型及治疗前耐药分析

目的 分析广西≥50岁男性新报告人类免疫缺陷病毒(HIV)感染者的基因亚型及治疗前耐药情况。方法 采用分层随机抽样法,选取广西14个城市2020年1至6月新报告≥50岁男性HIV感染者,采用巢式逆转录聚合酶链反应扩增HIV-1 pol基因片段进行测序,分析耐药突变位点及耐药程度。结果 共615例HIV感染者纳入分析,CRF01＿AE、CRF07＿BC和CRF08＿BC 3种主要亚型的构成比分别为57.4%(353/615)、17.1%(105/615)和22.4%(138/615)。核苷逆转录酶抑制剂(NRTI)、非NRTI(NNRTI)和蛋白酶抑制剂发生耐药位点突变例数分别为8例(1.3%)、18例(2.9%)和0例。NRTI和NNRTI位点突变率最高的分别为M184V(0.7%)和K103N(1.8%)。22例(3.6%)至少对任意一类逆转录酶抑制剂产生耐药,其中,对NRTI耐药4例(0.7%)、NNRTI耐药14例(2.3%),同时产生耐药4例(0.7%);对蛋白酶抑制剂未产生耐药。NNRTI治疗前耐药率高于NRTI(2.9%比1.3%;χ²=3.929,P...     

TAM类突变对B'亚型HIV病毒耐药和复制能力的影响

目的 研究T215Y和L210W等TAM类突变在B'亚型pol区遗传背景下对HIV病毒的耐药程度和复制适应性的影响.方法 血浆样本来自我国中部地区1名已接受抗病毒治疗且耐药的患者,利用SGA方法获得其3个病毒准种的含TAM突变的pol基因片段,采用PCR引入点突变分别将T215Y和L210W回复突变为野生型密码子,将突变前后的pol区片段替换pNLA-3-BstⅡ感染性克隆的相应片段,构建重组感染性克隆,利用荧光素酶和P24抗原检测分别评价重组病毒的耐药程度和复制能力.结果 成功构建了3个重组感染性克隆pNL-PAT-1、pNL-PAT-2、pNL-PAT-3,TAM类突变分别为:T215Y、M41L/L210W/T215Y和M41L/L210W/T215Y,回复突变后的重组感染性克隆分别为pNL-PAT-1-T215Y(-)、pNL-PAT-2-L210W(-)和pNL-PAT-3-L210W(-);与原始重组病毒比较,T215Y和L210W回复突变后的重组病毒对AZT的IC50分别下降4.9、8.1和2.7倍,感染pNL-PAT-1-T215Y(-)的培养上清中P24含量较原始毒株pNL-PAT-1高,而两株含M41L/T215Y的病毒与含M41L/L210W/T215Y突变病毒的复制能力比较结果并不一致,其中pNL-PAT-2-L210W(-)感染上清的P24含量较原始毒株略有降低,而pNL-PAT1-3-L210W(-)的P24含量则较原始毒株明显升高.结论 在B'亚型pol区遗传背景下,T215Y和L210W均可引起HIV病毒对AZT的耐药程度升高,T215Y还可造成病毒复制能力的下降,但是L210W对复制能力的影响不一,基因多态性可能对病毒的耐药和复制能力具有一定的影响.     

深圳市龙岗区新确证HIV/AIDS病例的亚型分布及耐药分析

目的 了解深圳市龙岗区新增确证艾滋病病毒感染者（HIV）/艾滋病病人（AIDS）的流行病学特征、HIV-1亚型分布及耐药株流行状况,为当地的艾滋病防控提供参考依据。方法 对深圳市龙岗区2016—2019年新报告HIV/AIDS病例开展流行病学横断面研究,按年分层随机抽取432例HIV/AIDS患者血清并提取病毒RNA,一步法逆转录PCR和巢式PCR法扩增HIV-1 pol区基因并测序,以邻接法（Neighbor-Joining method, NJ）构建系统进化树鉴定亚型,通过美国斯坦福大学HIV耐药数据库进行耐药分析。结果 研究对象1 519例中男性占比最高（88.61%,1 346/1 519）,广东省以外户籍居多（66.16%,1 005/1 519）,同性传播比例多于异性传播,54.58%(829/1 519)新增病例的CD4+T淋巴细胞≥350个/μL。成功获得368份pol基因序列,共发现11种HIV-1基因亚型及17例独特重组型（URF）,优势亚型为CRF01＿AE和CRF07＿BC,其他包括CRF55＿01B、B亚型、CRF08＿BC、CRF 59＿01B,C亚型、G亚...     

高效抗逆转录病毒治疗的HIV/HBV重叠感染者耐药HBV毒株C区和P区基因序列分析

目的：进一步研究乙肝病毒(HBV)耐高效抗逆转录疗法(HAART)的耐药机制。方法：用HBV—DNA荧光定量试剂盒，定量检测36例HAART治疗的HIV／HBV重叠感染者中HBV—DNA，用HBV—DNAC区和P区引物常规扩增HBV—DNAC区和P区产物，PCR产物纯化后测序，用BLAST软件分析序列，与国际HBV基因库对比。结果：36例HAART治疗的HIV／HBV重叠感染者中，HBV—DNA阳性4例(11．1％)，血清中HBV—DNA拷贝数3例在10^4copies／ml级，1例在10^7copies／ml级。对1例HBV—DNA在10^7copies／ml级标本进行HBVDNAC区和P区序列测定，用BLAST软件与国际基因库对比，结果，C区nt2412位T→C，nt2413位T→C，P区nt741位A→G(YMDD→YVDD)。结论：HAART治疗的HIV／HBV重叠感染者，HBV耐药可能与HBV—DNAC区和P区联合变异有关。     

广西使用阿片类毒品的HIV感染者耐药情况及其影响因素分析

目的探讨广西使用阿片类毒品的HIV感染者基因型耐药情况及耐药的影响因素。方法采用方便抽样的方式,募集使用阿片类毒品的HIV感染者230例,均成功扩增HIV pol区基因片段。分析使用阿片类毒品的HIV感染者耐药发生率、抗病毒药物的耐药情况及耐药位点,采用Logistic回归模型分析耐药的影响因素。结果 230例使用阿片类毒品的HIV感染者中36例发生耐药,耐药发生率为15.7%,非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTIs)耐药发生率为14.3%,核苷类反转录酶抑制剂(NRTIs)耐药发生率为3.5%,蛋白酶抑制剂(PIs)耐药发生率为1.3%。其中,NNRTIs耐药的相关突变位点主要为E138A、K103N、V106A/I/M,NRTIs耐药的相关突变位点主要为M184V/I,PIs耐药的相关突变位点主要为G73S。多因素Logistic回归分析结果显示,最近一次CD4⁺T细胞计数≥200个/μL是耐药发生的保护因素,无固定性伴侣是耐药发生的危险因素(均P<0.05)。结论使用阿片类毒品的HIV感染者耐药率处于高度流行水平,以NNRTIs和NRTIs耐药为主。要密...     

辽宁省阜新市抗病毒治疗患者HIV-1 DNA耐药情况及亚型分析

目的 了解阜新市已接受HAART患者HIV耐药株的发生及基因亚型分布情况。方法 采集全血标本进行白细胞富集和前病毒DNA提取,巢式PCR扩增HIV-1 pol区基因并测序,使用MEGA以及斯坦福大学HIV耐药数据库等工具对序列信息进行分析。结果 在112份全血标本中获得101例有效基因序列,CRF01_AE亚型占84.16%(85/101),CRF07_BC 亚型占8.91%(9/101),B亚型占3.96%(4/101),CRF65_cpx亚型占1.98%(2/101),G亚型0.99%(1/101);耐药分析显示27例患者发生耐药位点突变,其中,19例对核苷类逆转录酶抑制剂耐药,主要耐药突变位点为M184I/V,14例对非核苷类逆转录酶抑制剂耐药,主要耐药突变位点为G190S,对两类逆转录酶抑制剂同时耐药的样本有6例,尚未出现蛋白酶抑制剂耐药突变患者;治疗时间以及基线CD4水平的差异对耐药突变具有统计学意义。结论 阜新市HIV-1存在5种亚型,CRF01_AE为主要流行亚型;耐药情况的研究为更科学有效地指导艾滋病防治工作提供参考依据,应继续加强耐药监测,掌握基线数据,严防耐药株的流行。     

上海市闵行区新发男男性行为(MSM)人群HIV感染者特征及分子流行病学研究

目的 了解上海市闵行区新发男男性行为(men who have sex with men,MSM)人群人类免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV-1)感染者相关特征及亚型和原发性耐药现状,为该人群的HIV防治及抗病毒治疗提供依据。方法 利用问卷对2014年新确诊的HIV-1男性感染者收集相关信息,对其中未进行抗病毒治疗的MSM感染者随机抽取55份冻存血浆,采用逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增和DNA测序,对序列进行亚型及原发性耐药分析。结果 2014年新发MSM感染者主要集中在25～34岁(55.7%),一般男性感染者≥35岁为主(65.4%),差异有统计学意义(χ2=15.84,P=0.001);MSM感染者文化程度以大专及以上为主(54.6%),一般男性感染者以初、高中为主(69.2%),差异有统计学意义(χ2=12.32,P=0.006);MSM感染者主要来源于检测咨询(60.8%),一般男性感染者主要来源于医疗机构(50.0%),差异有统计学意义(χ2=12.03,P=0.002)。扩增出48条序列,以CRF01_AE亚型为主,占58.3%,其次为CRF07_BC亚型,占20.8%。原发耐药率4.2%,耐药位点2个,为K70R和E138G,分别引起NRTI类AZT中度耐药,D4T低度耐药,以及NNRTI类EFV、ETR、NVP、RPV的低度耐药。结论 闵行区MSM感染者相比一般感染者,具有更年轻,文化程度更高,自我检测意识更强的特点,CRF01_AE及CRF07_BC为优势毒株,原发耐药为低度耐药,需加强针对该人群的防控措施及分子流行病学监测。     

652株肠球菌的分布及其耐药性分析

目的 了解临床标本分离的肠球菌菌群分布及其耐药性情况。方法 用Vitek-AMS-60全自动细菌鉴定仪对肠球菌进行鉴定，用K-B法进行药敏试验。结果 652株肠球菌中粪肠球菌占81．7％，屎肠球菌占15．5％，其它肠球菌占2．8％；肠球菌的检出率以胆道最高(22．6％)，呼吸系统次之(19．2％)，泌尿系统为15．8％。肠球菌对抗生素的敏感率以替考拉宁最高(99．2％)，其次为万古霉素(98．9％)，屎肠球菌的耐药性明显高于粪肠球菌。结论 肠球菌以引起胆道系统感染最常见，对常用抗生素的敏感性以替考拉宁最高，其次为万古霉素。庆大霉素高水平耐药菌株(HLAR)耐药率明显高于低耐株。     

746株鲍曼不动杆菌的临床分布及耐药性分析

【摘要】 目的 了解2011-2013年本院鲍曼不动杆菌的临床分布及耐药性分析,为临床合理使用抗菌药提供依据。方法 对2011～2013年本院临床送检的标本进行分离鉴定,共分离出鲍曼不动杆菌菌株746株。采用纸片扩散法对病原茵进行药敏试验,用WHONET5．6软件进行数据分析。结果 分离的746株鲍曼不动杆菌(77.8%为痰,9.3%为创面分泌物)主要集中在重症监护室、呼吸科等,该菌对多数抗茵药物呈现较高水平耐药并对多数抗茵药物的耐药率呈逐年上升趋势,美洛培南、亚胺培南的耐药率上升最为显著,但2012年鲍曼不动杆菌多数抗菌药物的耐药率与2011年相比略有下降。结论 临床分离鲍曼不动杆菌耐药性较高并呈上升趋势,开展耐药性分析,对指导临床合理用药具有重要意义。     

河南省部分地区HIV流行毒株的基因序列测定及亚型分析

目的:了解河南省内HIV-1流行株的亚型及序列变异特征.方法:在河南省尉氏县采集42例有偿献血HIV-1感染者静脉血,分离单个核细胞(PBMC),用套式聚合酶链反应(nest-PCR)对单个核细胞中前病毒脱氧核糖核酸(DNA)的膜蛋白(env)基因进行扩增,并对其C2-V3及邻区350～450个核苷酸序列进行测定和分析.结果:42份样品间的基因离散率为7.4%.与国际A-E亚型参考序列及部分地区B'亚型代表株序列相比较,河南省尉氏县的42个毒株及流行与我国云南德宏、四川等地的B'亚型毒株序列接近,均属于泰国B'亚型,基因离散率为6.72%系统树分析显示,42份样品仍和泰国B'亚型聚集,远离其他国际亚型.对V3环四肽序列的分析表明,具有泰国B'亚型基因型GPGQ的30例,具有欧美B'亚型的GPGR的7例.结论:根据以上数据及其它资料提示,目前河南省尉氏地区的既往献血人群中,泰国B'亚型依然占主导地位,该流行区毒株的传入与流行在云南德宏州的相同亚型HIV-1毒株密切相关.但是根据其离散率及系统树的结果提示,既往献血人群中泰国B'亚型有向其他亚型进一步变异的趋势,应引起有关部门的注意.     

358株肺炎克雷伯菌的临床分布及耐药性分析

目的分析肺炎克雷伯菌的临床分布及耐药情况,为临床合理使用抗生素提供依据。方法采用回顾性调查的方法对358株肺炎克雷伯菌的标本来源及耐药性进行分析。结果 358株肺炎克雷伯菌中,产ESBLs阳性142株,阳性率为39.7%;ESBLs阳性的肺炎克雷伯菌对所测抗菌药物耐药性显著高于产ESBLs阴性菌,并且出现2株对亚胺培南耐药的肺炎克雷伯菌。结论产ESBLs肺炎克雷伯菌在医院感染中十分流行,多重耐药明显。     

243株肠球菌感染菌种分布及其耐药性观察

目的了解肠球菌感染的菌种分布特征及其耐药性.方法所有菌株用常规方法分离,用API20Strep鉴定;药敏试验采用K-B法. 结果 243株肠球菌中主要有粪肠球菌161株（占66.2%）,屎肠球菌64株（占26.3%）;肠球菌庆大高耐株（HLRG）检出129例（高达53.3%）,耐万古霉素肠球菌（VRE）检出1例（0.4%）.结论应关注屎肠球菌感染的上升趋势;实验室应将肠球菌鉴定达到种水平;进行VRE的检测也非常重要.     

921株结核分枝杆菌耐药性分析

目的:调查结核分枝杆菌的耐药情况,为临床合理用药提供依据。方法:对921例肺结核患者进行结核分枝杆菌培养和药敏试验。结果:单耐药的耐药率由高到低依次是链霉素(18.3%)、异烟肼(14.6%)、利福平(13.1%)、乙胺丁醇(5.3%),耐多药的耐药率为3.3%。19～39岁年龄段无论是单耐药率还是耐多药率都较高,而<18岁年龄段的耐药率最低。结论:结核分枝杆菌的耐药形势比较严峻。     

687株不动杆菌属细菌临床分布及耐药分析

目的 了解不动杆菌在临床上的分布,预防和控制医院感染.方法 对2010年1月～2011年12月临床各科送检的各种标本中分离出的不动杆菌进行临床分布及耐药性分析.结果 鲍曼不动杆菌占不动杆菌属的77.3 %,不动杆菌标本来源以呼吸道为主,占88.1%,其他依次为分泌物占5.8 %、尿液占2 %;不动杆菌对头孢西丁、氨曲南耐药率最高,耐药率分别为94.1%、93.3%,头孢菌素类抗菌药物如头孢呋辛、头孢曲松,氨基糖苷类抗菌药物如庆大霉素、复方新诺明和阿米卡星,喹诺酮类如环丙沙星、左氧氟沙星耐药率分别为86.5%、85.9%、72.4%、71.8%、54.1%、71.6%、40%.多粘菌素活性最高,敏感率达92.8%,其次为头孢哌酮舒巴坦,敏感率为78.3%.结论 临床分离的不动杆菌中鲍曼杆菌分离率高,标本来源以呼吸道为主.应加强抗菌药物的合理应用督导,控制医院感染,保证医疗安全.     

362株铜绿假单胞菌的感染分布及耐药性分析

目的:了解铜绿假单胞菌的分布,对铜绿假单胞菌的耐药性进行分析研究,为临床用药提供参考。方法:回顾性分析2006年铜绿假单胞菌在我院各病区及标本中的分布,用琼脂扩散法(K-B法)检测14种临床常用抗生素的耐药性。结果:我院2006年分离的362株铜绿假单胞菌中,痰液的阳性率最高,为77.3%(280/362),其次为创面分泌物、脓液,阳性率分别为13.3%(48/362)和3.6%(13/362),病室中神经内科检出率最高,为27.9%(101/362)。铜绿假单胞菌对14种常用抗生素的耐药率由5.5%到77.2%不等。结论:铜绿假单胞菌已经成为医院感染的重要病原菌,其不仅耐药率高,而且呈多重耐药,应加强医院感染的管理,定期开展耐药性监测,指导临床合理使用抗生素。