基于网络药理学探讨新加疏调汤治疗胃癌的分子生物学机制研究

胃癌属于恶性肿瘤的一种,在中国地区发病率较高,并且临床上预后多数较差,为了提高胃癌患者的生活质量,证明新加疏调汤在临床上对胃癌患者的有效性,故于此进行作用分析。新加疏调汤是国医大师张震根据人体气机的基本理论,加之临床实践得出的疏调气机汤加减而来,去山药,易枳实为枳壳,更加符合治疗胃癌的性质,经过实践证明了其有效性,故而通过药理学理论说明其作用机制。本研究使用中医药整合药理学研究平台（TCMIP）V2.0获取新加疏调汤的化学成分及其对应靶点,通过GeneCards数据库获得胃癌的靶点信息,创建药物与疾病的核心靶点网络。使用Hiplot网站进行基因本体论（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析,通过TCGA数据库获得部分核心靶点所对应基因在患者和正常人中的表达情况,对主要成分进行吸收、分布、代谢、排泄和毒性（Absorption,Distribution, Metabolism,Excretion,Toxicity,ADMET）水平分析、类药性定量评估（Quantitative Estimate of Drug-likeness,QED）,随后得到新加疏调汤287个化学成分,...     

新加良附方抑制人胃癌细胞增殖的分子机制

目的:探讨新加良附方及其主要成分薯蓣皂苷药物血清对人胃癌细胞BGC-823的增殖抑制作用及可能的作用机制。方法:制备新加良附方及薯蓣皂苷药物血清,并作用于胃癌细胞株BGC-823,使用MTS方法检测细胞增殖抑制率;采取实时PCR方法观察新加良附方及薯蓣皂苷药物血清对人胃癌细胞BGC-823中caspase-3及p53表达的影响;采取实时PCR方法检测胃癌细胞中miR-34a表达水平。结果:新加良附方药物血清及薯蓣皂苷药物血清对胃癌细胞BGC-823有明显的增殖抑制作用,并且其作用与时间正相关。新加良附方对胃癌细胞的增殖抑制作用在48 h、72 h高于其主要成分薯蓣皂苷;人胃癌BGC-823细胞中caspase-3的表达明显低于其在正常胃黏膜上皮细胞GES-1中的水平,p53基因表达水平高于正常GES-1细胞中的p53表达水平。新加良附方药物血清及薯蓣皂苷药物血清作用于BGC-823细胞后其caspase-3表达水平均明显上升,且随着时间增加其表达量升高;p53基因表达水平下降,并且与时间负相关。新加良附方与其主要成分薯蓣皂苷相比较,两者对caspase-3、p53的调控作用无明显差异;胃癌细胞中miR-34a表达水平高于正常胃黏膜上皮细胞GES-1。结论:新加良附方及其主要成分薯蓣皂苷可以显著抑制胃癌BGC-823细胞的生长,新加良附方对胃癌细胞的抑制作用高于其主要成分薯蓣皂苷。新加良附方及薯蓣皂苷抑制胃癌细胞增殖作用可能与增加凋亡相关蛋白caspase-3表达,抑制突变型p53表达相关。miR-34a可能发挥癌基因的作用,应明确其作用并进行下一步研究。     

新加良附方联合5-Fu对荷人胃癌裸鼠血清VEGF、bFGF水平的影响

目的:观察新加良附方联合5-Fu对荷人胃癌移植瘤裸鼠血清血管内皮生长因子(Vascular Endothelial Growth Factor,VEGF)、碱性成纤维生长因子(Basic Fibroblast Growth Factor,b FGF)水平的影响。方法:建立移植性人胃癌细胞(SGC-7901)裸鼠移植瘤模型,并将模型动物随机分为空白组、5-Fu组及新加良附方高、中、低剂量组、联合给药组(新加良附中剂量+5-Fu组)6组。新加良附方高、中、低剂量组给药剂量分别为10 g·d-1·kg-1、5 g·d-1·kg-1、2.5 g·d-1·kg-1;5-Fu组给药剂量为17mg·d-1·kg-1;空白组给予等量无菌生理盐水,新加良附方联合5-Fu组剂量为新加良附方中剂量(5 g·d-1·kg-1)联合应用5-Fu(17 mg·d-1·kg-1)。给药结束后,采用免疫学方法(ELISA)检测裸鼠血清中VEGF、b FGF的含量。结果:VEGF含量显示:联合给药组,5-Fu组,新加良附大、中、小剂量组裸鼠血清中含量较空白对照组均明显降低(P0.01),新加良附各剂量组对VEGF含量减低作用具有一定的剂量依赖性,联合用药组VEGF含量低于5-Fu组、新加良附中剂量组,但无统计学意义(P0.05)。b FGF含量显示:联合给药组,5-Fu组,新加良附大、中、小剂量组裸鼠血清中含量较空白对照组均明显降低(P0.01)。结论:新加良附方可以下调人胃癌裸鼠的血清中VEGF、b FGF表达水平,提示新加良附方具有一定抗胃癌新生血管生成作用。     

新加良附方影响人胃癌裸小鼠移植瘤新生血管形成的研究

目的：观察新加良附方对人胃癌裸小鼠移植瘤血管内皮生长因子（VEGF）表达和微血管密度（microvessel density,MVD）的影响,以探索其对人胃癌新生血管形成的作用。方法：建立移植型人胃癌MGC803实体瘤模型后,予模型对照及新加良附方大、中、小剂量4种处理并分组,分别取4组肿瘤组织,以免疫组化染色法检测肿瘤组织VEGF表达和以CD31为血管内皮标记的MVD。结果：与模型组比较,新加良附大、中剂量组有抑制MVD的作用,三者MVD值分别为68880．66±35846．10,37386．44±20175．69和40531．48±20817．34,后两者较前者有统计学意义（P〈0．05）。且与模型组相比。新加良附大、中剂量组能够下调VEGF表达,其值分别为16227．80±7620．67,4453．73±1717．25和5566．35±3686．67,其差异有统计学意义（P〈0．01）。结论：新加良附方能够抑制人胃癌新生血管形成。新加良附方抑制胃癌的作用可能与抑制胃癌新生血管形成有关。     

新加良附颗粒含药血清体外诱导人胃癌细胞凋亡研究

目的：观察新加良附颗粒对人胃癌细胞（BCC-823）诱导凋亡效应。方法采用MTT法测定新加良附颗粒含药血清体外对BGC-823生长抑制率，用流式细胞仪检测其对细胞凋亡影响的同时，以倒置显微镜和透射电镜观察细胞形态学变化。结果：新加良附颗粒对BGC-823有生长抑制效应和促进凋亡作用，并与用药剂量呈正相关；倒置显微镜下及透射电镜下对照组无明显变化，给药各组出现细胞形态学改变并可见凋亡特征出现。结论：新加良附颗粒体外具有抑制人胃癌细胞（BGC-823），诱导其凋亡作用。     

基于网络药理学探讨丹参通络方治疗冠心病血瘀证的机制＊

目的 基于网络药理学探讨丹参通络方治疗冠心病（Coronary heart disease，CHD）血瘀证的可能作用机制。方法 通过TCMSP数据库ChEMBL数据库筛选出丹参通络方3味药丹参、三七、银杏叶潜在活性成分及靶点，通过GeneCard数据库获得冠心病的作用靶点，结合课题组前期通过高通量测序方法获得的冠心病血瘀证的差异表达基因，最终得到药物与疾病的交集靶点，并运用Cytoscape 3.7.2软件绘制活性成分-靶点-疾病网络图，采用STRING数据库构建PPI网络，使用R软件和Bioconductor包对交集靶点进行基因GO功能和KEGG富集分析。结果 筛选得到丹参通络方治疗冠心病血瘀证的潜在活性成分8个，核心靶点7个，其作用的生物路径与IL-17信号通路等关系密切。结论 丹参通络方治疗冠心病血瘀证的作用具有多成分、多靶点、多通路的作用机制特点，网络药理学结果可为实验验证其机制提供方向。     

新加良附方影响小鼠肝癌组织VEGF与MVD表达的研究

目的观察新加良附方对小鼠肝癌组织血管内皮生长因子（VEGF）和微血管密度（MVD）表达影响。方法建立移植型小鼠肝癌H22实体瘤模型后,分别取模型对照、环磷酰胺（CTX）对照及新加良附方大、中、小剂量5组肿瘤组织,以免疫组化染色法观察肿瘤组织VEGF、MVD表达。结果新加良附大、中剂量可降低肿瘤组织中VEGF的表达,与模型对照组比较,有统计学意义（P〈0.01）;与CTX对照组比较,新加良附大、中、小剂量组均有统计学意义（P〈0.01）。新加良附中剂量组能降低MVD,与模型对照组比较有统计学意义（P〈0.05）。结论新加良附方抑制小鼠肝癌生长可能与下调VEGF、MVD,表达有关。初步表明新加良附方可能通过抑制肿瘤血管生成而发挥抗肿瘤效应。     

新加良附方影响小鼠肝癌组织VEGF与MVD表达的研究

目的 观察新加良附方对小鼠肝癌组织血管内皮生长因子(VEGF)和微血管密度(MVD)表达影响.方法 建立移植型小鼠肝癌H22实体瘤模型后,分别取模型对照、环磷酰胺(CTX)对照及新加良附方大、中、小剂量5组肿瘤组织.以免疫组化染色法观察肿瘤组织VEGF、MVD表达.结果 新加良附大、中剂量可降低肿瘤组织中VEGF的表达,与模型对照组比较,有统计学意义(P＜0.01);与CTX对照组比较,新加良附大、中、小剂量组均有统计学意义(P＜0.01).新加良附中剂量组能降低MVD,与模型对照组比较有统计学意义(P＜0.05).结论 新加良附方抑制小鼠肝癌生长可能与下调VEGF、MVD,表达有关.初步表明新加良附方可能通过抑制肿瘤血管生成而发挥抗肿瘤效应.     

基于网络药理学探讨四逆加人参汤调治胃癌相关性疲乏的潜在作用机制

目的:本研究采用网络药理学的方法探讨四逆加人参汤调治胃癌相关性疲乏(Gastric Cancer Related Fatigue,GCRF)的作用机制.方法:通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)收集并筛选四逆加人参汤中药成分及其相关作用靶点,运用Uniprot数据库对获得的靶点进行标化;利用OMIM、Gen...     

益母草治疗寒凝血瘀型痛经的网络药理学作用机制研究

目的构建益母草Leonurus japonicus化学成分-疾病靶点-代谢信号通路网络,探究益母草多成分-多靶点-多通路治疗寒凝血瘀型痛经的作用机制。方法利用TCMSP数据库与Swiss Target Prediction服务器获取益母草的化学成分与作用靶点,结合DrugBank、DisGeNET、TTD等数据库获取益母草治疗寒凝血瘀型痛经的作用靶点;通过DAVID网站对作用靶点进行GO功能富集分析和KEGG通路分析,采用Cytoscape 3.6.0构建益母草活性成分-痛经作用靶点-代谢信号通路网络图,探讨益母草治疗寒凝血瘀型痛经的作用机制;并进一步采用Westernblotting实验验证益母草对寒凝血瘀型痛经模型大鼠子宫组织中花生四烯酸代谢通路环氧化酶1(PTGS1)、PTGS2蛋白表达的影响。结果获得益母草潜在活性成分共8个,与痛经相关疾病靶点22个,关键靶点涉及PTGS1、PTGS2、ALOX5、PLAG2A、AKR1C3等。GO功能富集分析共得到GO条目71个(P<0.05),其中生物过程(BP)条目46个,细胞组成(CC)条目4个,分子功能(MF)条目21个。益母草...     

基于网络药理学探讨脑出血方治疗脑出血的作用机制

目的 应用网络药理学方法探讨脑出血方对脑出血的作用机制.方法 借助中药系统药理学技术平台(TCMSP)、中医药综合数据库(TCMID)和BATMAN-TCM数据库检索并收集水蛭、虻虫、大黄、蒲黄、三七、石菖蒲、瓜蒌和龟板的所有化学成分,并以口服生物利用度(OB)≥30％,类药性(DL)≥0.18为标准,筛选出活性化学成...     

基于网络药理学探讨健脾养正消癥方治疗胃癌的作用机制

目的 采用网络药理学方法研究全国名中医刘沈林创制的健脾养正消癥方治疗胃癌的作用机制。方法 应用TCMSP数据库获取健脾养正消癥方中所有中药的有效成分,筛选后获得相关靶点。采用GeneCards和OMIM数据库获得胃癌的相关靶点,并获得药物和疾病的共同靶点,使用Cytoscape软件构建有效成分-靶点调控网络,使用String数据库绘制蛋白互作网络,进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果 健脾养正消癥方12味中药有效成分152个、相关靶点276个,胃癌疾病靶点1 904个,两者共同靶点135个(AKT1、IL6、CASP3、VEGFA、MAPK3等),涉及有效成分118个,如槲皮素、山柰酚、β-谷固醇、木犀草素、豆甾醇等。GO功能富集在泛素样蛋白连接酶结合、激酶调节剂活性、磷酸酶结合等。KEGG通路富集在PI3K-Akt信号通路、细胞衰老、EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药、铂类药物耐药等。结论 健脾养正消癥方通过多成分、多靶点、多通路发挥抗胃癌作用,为进一步深入研究和开发奠定了基础。     

基于网络药理学探讨参附黄方调治脓毒症的作用机制

目的 基于网络药理学探讨参附黄方治疗脓毒症的作用机制.方法 通过TCMSP数据库获取红参、附子、大黄的主要化学成分及其靶点;检索GeneCards、OMIM、TTD、Drugbank数据库,得到脓毒症相关靶点;运用R语言得到药物和疾病的交集靶点并绘制韦恩图;应用STRING构建交集靶点相互作用网络图;利用Cyto?sc...     

基于网络药理学探讨抗感方抗病毒作用机制

目的 基于网络药理学方法 研究抗感方治疗冠状病毒、呼吸道合胞病毒(RSV)的作用机制.方法 借助TCMSP数据库筛选出抗感方活性成分及作用靶点,通过Gene Cards数据库筛选出冠状病毒 、RSV的疾病靶点.利用Cytoscape软件 、STRING数据库分别构建"药物-成分-靶点-疾病"的相互作用和潜在靶点PPI网...     

基于网络药理学探讨行气活血通络方治疗神经根型颈椎病的作用机制

目的基于网络药理学方法探讨行气活血通络方治疗神经根型颈椎病的作用机制。方法通过TCMSP(中药系统药理学数据库分析平台)、BATMAN-TCM(中药分子机制的生物信息学分析工具)数据库,对行气活血通络方所含活性成分进行筛选并预测作用靶点,利用GeneCards、OMIM(在线人类孟德尔遗传)和DisGeNET(疾病相关的基因与突变位点数据库)数据库检索神经根型颈椎病相关基因,利用韦恩图筛选行气活血通络方中活性成分治疗神经根型颈椎病的作用靶点。利用Cytoscape软件构建活性成分-作用靶点网络图,利用STRING数据库绘制蛋白互作网络。最后,利用Metascape数据库对靶点进行GO(基因本体)及KEGG(基因组百科全书)通路分析。结果行气活血通络方所含11味中药共筛选出93种活性成分,涉及250个靶点基因,其中有213个基因与神经根型颈椎病相关。网络分析结果表明,此方治疗神经根型颈椎病涉及的生物学过程主要包括毒性反应、无机物反应、细胞对氮化合物的反应等;涉及的分子功能主要包括神经递质受体的活性、激酶结合、G蛋白偶联胺受体活性等。其作用机制可能与AGE-RAGE signaling p...     

基于网络药理学方法探讨香附治疗肝癌的作用机制

目的:采用网络药理学的方法探讨香附治疗肝癌的作用机制.方法:运用中药系统药理学数据库与分析平台检索香附的活性成分及其作用靶点,通过GeneCards和OMIM数据库检索肝癌的相关靶点;应用Cytoscape 3.7.0软件构建香附-活性成分-肝癌-靶点相互作用网络,通过STRING数据库分析绘制靶点与蛋白相互作用的...     

基于网络药理学探讨参莲方治疗动脉粥样硬化性心血管病的作用及机制

目的:采用网络药理学方法分析抗动脉粥样硬化中药参莲方治疗动脉粥样硬化性心血管病(ASCVD)的活性成分、作用靶点和分子通路,探索参莲方治疗ASCVD的可能性及作用机制,并为其组方配伍的合理性阐释提供依据.方法:借助SymMap数据库与中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取参莲方主要化学成分,SymMap和ET...     

基于网络药理学探究参附注射液治疗慢性心力衰竭的作用机制

目的 探讨参附注射液功效物质基础及对慢性心力衰竭的作用机制.方法 借助中药系统药理学平台(TCMSP)筛选参附注射液中的活性成分和作用靶点,基于Genecards数据库遴选慢性心力衰竭相关的靶点,将中药与疾病靶点进行交集,构建成分-靶点网络;结合String数据库构建成分靶点-疾病靶点蛋白互作全局(PPI)网络,并通过...