单核苷酸多态性的研究进展

单核苷酸多态性（ＳＮＰ）是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的一种ＤＮＡ序列多态性。ＳＮＰ现象在人类基因组中广泛存在,并具有很高的信息含量。目前已发现数万个ＳＮＰ标记,且有多个生物医学网站开辟了专页对其加以介绍。随着对ＳＮＰ检测和分析技术进一步发展,尤其是与ＤＮＡ芯片等技术的结合,它已成为第三代遗传标记,初步满足对疾病相关基因定位研究的需要,尤其是对多基因遗传病高精度基因定位的要求,并将最终     

人类基因组计划与人类疾病动物模型—跨世纪实验动物模型的展望

继英国科学家克隆羊“多利”诞生后 ,生命科学领域紧接着又一项以确定人类基因的结构和功能、表达和调控的“人类基因组计划”(ＨＧＰ)正在各大国相继地展开[1～ 4] 。今天人类 3× 1 0 9个核苷酸全序列中约有 5 0 0 0个基因已被测序 ,同时随着技术及测序仪器的更新 ,每年测序完成的速度正在加快。美国科学家宣布 ,今年底将完成约 90 %以上的人ＤＮＡ测序工作 ,预计 2 0 0 1年全部完成ＤＮＡ测序 ,由此而产生的一大堆匿名基因 (功能不知的基因 )及各基因的表达特性及表达蛋白生理活性研究称之为后基因组时代[5] 。研究基因 -蛋白、表达调控 …     

人类基因组微卫星DNA多态及其法医学应用

人类基因组是指人类细胞的DNA 分子中所包含的储藏有人体全部遗传信息的一整套基因它包括细胞核所构成的基因组和线粒体DNA 所构成的基因组两部分细胞核基因组规模庞大结构复杂包含了人类基因组的绝大部分基因其DNA 分子总长度可达3 10 6 Kb 基因总数约5 ~10 万个而线粒体基因组是一个结构简单的小基因组DNA 分子总长度约1 6 .6 Kb 基因数仅37 个人类基因组是一个十分稳定的体系不同民族不同群体的个体有相同数目的基因也有基本相同的核苷酸序列正是基因组结构的这种稳定性保证了人类作为一个物种的稳定性和同一物种向的共同性然而人…     

基因组研究和基因组工业的现状及思考

1人类基因组计划和后基因组时代1.1人类基因组测序将提前完成：人类基因组计划（HumanGenomeProject,HGP）旨在阐明人类基因组的全部序列,从整体上破译人类遗传信息,使人类第一次在分子水平上全面地认识自我。主要包括三项任务：人遗传图谱和物理图谱的建立;B．DNA测序;C．基因识别。自1990年实施以来,人类基因组测序已完成测序和正在测序的共计约330Mb,占人基因组的11％左右;已识别出与人类疾病相关的基因200个左右。此外,细菌、支原体等共17种模式生物全基因组序列已测定。随着技术更新和大公司的介入,人类基因组测序将提…     

编码兰氏贾第虫变异性表面蛋白家族的3个基因的克隆与序列

报道了编码兰氏贾第虫变异性表面蛋白家族的３个基因的克隆与序列分析。应用ＰＣＲ技术从基因组ＤＮＡ中扩增了基因的主要部分。通过对基因组基因库的筛选，位于基因组ＤＮＡ上两个不同部位的３个相关基因被克隆出来并且进行了序列分析。两个相同的基因（ＶＳＰｒＢ２－１和ＶＳＰｒＢ２－２）是以头对头方式排列，由１个３ｋｂ的中间区域分开。推导出的ＶＳＰｒＢ２－３和ＶＳＰｒＢ２－１／２序列比较显示，他们的氨基酸序列有７２     

河北汉族人群D16S310基因座的遗传多态性研究

短串联重复序列 (ｓｈｏｒｔｔａｎｄｅｍｒｅｐｅａｔ,ＳＴＲ)属微卫星ＤＮＡ序列 ,重复单位 2 7ｂｐ。ＳＴＲ位点在人类基因组中含量丰富 ,它不仅是绘制基因组物理图谱和遗传连锁分析的理想标记 ,也是法医遗传高信息基因座的丰富来源。Ｄ16Ｓ310短串联重复序列在人类自然群体的基因频率分布尚不清楚 ,为了解大陆人群Ｄ16Ｓ310基因座的遗传多态性 ,作者采用聚合酶链反应 (ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅｃｈａｉｎｒｅａｃｔｉｏｎ ,ＰＣＲ)技术和聚丙烯酰胺凝胶电泳技术 ,并结合银染的方法 ,对中国河北省 2 0 9名汉族无关个体进行了调查 ,首次获得…     

hMSH2基因在散发卵巢癌中突变研究

目的：研究卵巢癌患者ＤＮＡ错配修复基因ｈＭＳＨ２（ＨｕｍａｎｍｕｔＳｈｏｍｏｌｏｇ）基因突变，同时检测其基因组微卫星Ｄ２Ｓ１２３序列变化。方法：应用ＰＣＲ、ＰＣＲ－ＳＳＣＰ和ＤＮＡ序列分析方法检测了１５例卵巢癌患者正常细胞和肿瘤细胞中的ｈＭＳＨ２基因突变。结果：３例患者存在ｈＭＳＨ２基因生殖细胞或体细胞突变，序列分析表明有碱基置换的同义突变，有碱基丢失产生的无义突变。有３例患者基因组表现Ｄ２Ｓ１２３变化，其中１例检测到ｈＭＳＨ２突变。结论：ｈＭＳＨ２基因突变和卵巢癌发生有关。机理可能为其突变引起基因组不稳定，而引起一系列基因变化，导致细胞恶性转化     

小鼠PKD1基因的克隆及打靶载体的构建

目的：克隆小鼠的多囊肾病１（ＰＫＤ１）基因,构建ＰＫＤ１基因的Ｋｎｏｃｋｏｕｔ载体,为产生ＰＫＤ１基因缺陷小鼠品系准备条件。方法;以正常小鼠基因组ＤＮＡ为模板,扩增小鼠ＰＫＤ１基因部分序列为探针,应用噬斑原位杂交技术筛选１２９ＳｖＴｅｒ小鼠基因组ＤＮＡ库,并应用Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交,亚克隆及测序等方法鉴定所得克隆。对克隆到的ＰＫＤ１基因组ＤＮＡ片段进行结构分析,选择合适的亚克隆片段,以ｐＴＫ－Ｎ     

Cloning and Sequence of the Three Genes Encoding a Closely Related Family of Variant-Specific Surface Proteins of Giardia

报道了编码兰氏贾第虫变异性表面蛋白家族的３个基因的克隆与序列分析。应用ＰＣＲ技术从基因组ＤＮＡ中扩增了基因的主要部分。通过对基因组基因库的筛选，位于基因组ＤＮＡ上两个不同部位的３个相关基因被克隆出来并且进行了序列分析。两个相同的基因（ＶＳＰｒＢ２－１和ＶＳＰｒＢ２－２）是以头对头方式排列，由１个３ｋｂ的中间区域分开。推导出的ＶＳＰｒＢ２－３和ＶＳＰｒＢ２－１／２序列比较显示，他们的氨基酸序列有７２％的同源性。     

未知基因KS1的发现

生物多样性是由遗传物质决定的，这些遗传物质的总和称为基因组。人类基因组和后基因组计划是跨世纪生命科学发展的标志。此计划现已完成庞大基因组序列测定的大部分工作，但对于每个基因在基因组序列结构中的定位及表达调控与表达产物的生物学功能的研究才刚刚起步。目前分离克隆基因的方法较多。我们在对苦参碱诱导白血病Ｋ５６２细胞分化系统研究基础上，应用ＤＤ－ＰＣＲ技术分离并克隆了苦参碱作用Ｋ５６２细胞早期的４３个差异显示ｃＤＮＡ片段。经序列测定并利用网络技术和基因组数据库等相关生物信息分析，得到一个与已知基因无明显…     

骨髓移植配型中HLAⅡ类基因PCR-SSP分型技术的应用

ＨＬＡⅡ类基因是位于人类第 6号染色体短臂远端的一组高度多态的基因 ,主要包括ＨＬＡ ＤＲ、ＤＱ、ＤＰ3个亚区[1] 。ＨＬＡⅡ类基因配型对提高异基因骨髓移植存活率 ,减少ＧＶＨＤ ,具有重要意义[2 ] 。既往ＨＬＡⅡ类分型采用血清学微量淋巴细胞毒试验 ,近年国外实验室已转向基因分型 ,并已将其列为常规。我们采用序列特异性引物 (ＳＳＰ)ＰＣＲ技术对ＨＬＡ ＤＲＢ1,ＤＱＢ1进行基因分型 ,快速简便 ,报告如下。1　材料与方法1 1　样本　原山东医科大学附属医院提供 2 2名拟行骨髓移植的恶性血液病患者及相关供者样本。1.2　ＤＮＡ提取…     

人类基因组计划的研究进展

人类基因组计划(Human GenomeProject.HGP)是1986年由美国科学家Renato Dulbecco率先提出的，1990年，美、欧、日等国开始实施，其宗旨是用15年时间，阐明人类10万个基因的位置、结构、功能及作用方式。具体的研究任务有两个：一是‘读出’人类基因组全部ATCG语言，即人类染色体上30亿个碱基对的DNA序列；二是‘读懂’人类基因组全部ATCG语言，即人类全部基因的编码及功能的研究，揭开生命与疾病之谜、使遗传基因为人类健康服务。     

复合扩增D3S1358等9个STR位点在亲子鉴定中的应用

人类基因组中约有 5 0万个短串联重复序列位点 (ｓｈｏｒｔｔａｎｄｅｍｒｅｐｅａｔ,ＳＴＲ) ,其核心序列一般为 2～ 6ｂｐ ,片段长度为 10 0～ 5 0 0ｂｐ ,由于核心单位重复数目的变化 ,构成ＳＴＲ位点的高度多态性。目前 ,国内外普遍采用复合扩增ＳＴＲ位点进行基因分型来判定亲子关系 ,由于其具有一次检测的遗传信息量大以及准确、高效、简便等优越性 ,取代了过去传统的ＨＬＡ和酶型检测等方法。本实验室引进ＡＢＩ 310基因分析仪 ,应用复合扩增及四色荧光自动分析技术 ,获得了宁波地区汉族人群的Ｄ3Ｓ135 8等 9个ＳＴＲ位点的遗传多态…     

假性肥大型肌营养不良症第50和51号内含子的结构特点及51号外…

探讨假性肥大型肌营养不良症基因第５０和５１号内含子的结构特点与第５１号外显子缺失的关系。用分子克隆技术，按Ｓａｎｇｅｒ法双链测序，克隆了含ＤＭＤ基因第５０和５１号内含子的人基因组ＤＮＡ３．１ｋｂ－ＨｉｎｇⅢ片段，测出了该片段的全部顺序，并用计算机分析了序列特点。     

系统性红斑狼疮临床表现与HLAⅡ类单倍型关联的研究(摘要)

目的　探讨系统性红斑狼疮 (ＳＬＥ)易感基因致病的模式。方法　利用多聚酶链反应 /特异序列寡核苷酸探针杂交 (ＰＣＲ/ＳＳＯＰＨ)方法检测 113例确诊ＳＬＥ病人的ＨＬＡⅡ类基因型并进行单倍型分析。结果　ＳＬＥ病人的单倍型具有特定的结构特征 ;即以 2或 3个重型ＳＬＥ相关基因共同组成 1个单倍型 ;反之 ,2或 3个轻型ＳＬＥ相关基因组成另 1个单倍型 ;重型基因和轻型基因之间很少有强连锁不平衡。ＤＱＡ 0 30 1 ＤＱＢ1 0 30 2 ＤＲＢ1 15 0 1-ＤＱＡ1 0 10 2 -ＤＱＢ1 0 30 3和ＤＲＢ1 15 0 1-ＤＱＡ1 0 10 3-ＤＱＢ1 0 30 3与肾损害…     

DNA微小卫星序列分析在肺癌研究中的应用

ＤＮＡ微小卫星序列具有高度的长度多态性和很高的信息含量 ,其检测方法简便易行 ,是基因筛选、定位的有力工具。它在研究肿瘤发生机制、早期诊断以及判断预后方面具有重要意义 ,并有其应用前景。1　ＤＮＡ微小卫星序列的定义及特性80年代初 ,人们发现细胞内含有大量碱基重复序列 ,其中 1 4ｂｐ (碱基对 )串联重复称为ＤＮＡ微小卫星序列(ｍｉｃｒｏｓａｔｅｌｌｉｔｅｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ,ＭＳ) ,最常见的是双核苷酸重复 ,即 (ＡＣ)ｎ和 (ＴＧ)ｎ[1] 。ＭＳ散在分布于细胞整个基因组中 ,约占基因组的 5 % ,以 (ＡＣ/ＧＴ)ｎ重复序列最为多…     

人类基因组计划、后基因组研究与基因医学——基因诊断、基因制药与基因治疗的新世纪

NIH于 1991年拟定人类基因组计划 (HumanGenomeProject,HGP) ,1993年正式启动了第一个五年计划 (1994～ 1998) ,1998年秋HGP圆满完成计划。预计人类DNA测序将于 2 0 0 3年完成。人类 2 3条染色体共约 30亿bp ,功能基因约 10万个 ,疾病相关基因约 50 0 0～ 10 0 0 0个。人类基因组计划涉及的遗传图谱、物理图谱、主要的模式生物的工作 ,已基本在 1994～ 1998年的第一个五年计划中完成。今后的任务是集中DNA测序。工作草图 (Workdraft)亦计划于 2 0 0 1年完成。 2 0 0 3年测序工作全部完成。后基因组研究包括生物信息学、基因功能学和基因的开发研究 ,将遍及 2 1世纪生命科学的各个领域并充实基因医学的真实内涵。     

人类基因组──最新估计基因逾14万个美国、英国讨论自由享用权

最初估计,人类基因组含有约6万个基因,近几年通常的估计数目是10万个左右.究竟人类基因组含有多少个基因?据今年9月23日出版的Nature(1999,401:311)一则消息报道,最新估计人类基因组含有的基因逾14万个.消息说,在基因组研究所(Institute for Genomic Research)于9月20日在美国佛罗里达州迈阿密举办的年度序列学术会议上,生物技术公司──Incyte制药(Incyte Pharmaceuticals)董事长兼首席科学官Randall Scott公布的这一预测结果:人类基因组含有142 634个基因.他宣布的这一数据与美国政府首席科学顾问Neal Lane、英国政府首席科学顾问Robert May受政府委托,就公共频道播送尚未完成的(生)序列资料有关问题讨论联合公告时所透露的消息一致.     

人类DNA多态性及其应用

人类ＤＮＡ多态性及其应用郭俊明（生物化学教研室）脱氧核糖核酸（ＤＮＡ）是遗传信息的贮存者和携带者。人类基因组约有３×１０９碱基对（ｂｐ），根据重复序列的有无或多少，可以把它分为三类：（１）单拷贝或低重复序列：占６０％～６５％，组成了大约１０万个编码多...     

基因诊断与基因治疗

20 0 0年 6月 2 6日 ,参与人类基因组计划的六国 (美、英、日、德、法、中 )政府和有关科学家分别以不同的方法 ,宣布人类基因工程草图绘制成功。此计划始于 1990年 ,我国于 1999年参与该计划。国际社会对于这一重大科学进展给予高度评价。并一致呼吁共享这一人类共同财富。 2 0 0 1年 2月人类基因组图谱“正式版”公布 ,此表示测序任务终结 ,本次公布的主要有 3个内容 :1人类基因数只有 3万多 (3 .5万 ) ,比原先估计 10万个少很多 ;2发现致病基因 ,已找出 3 0个致病基因 ;3绝大多数遗传基因疾病来源为男人。广大的中西医工作者 ,期望对基因…