基因片段的序列分析在中药质量研究中的应用

综述常用于中药质量研究的基因片段，介绍基因片段的序列分析在中药品种鉴定资源评价、亲缘关系及中药材道地性研究中应用的进展，为中药在基因水平的更深、更系统的研究及药用动植物的开发和可持续利用提供资料，常用于中药研究的DNA基因片段，主要包括叶绿体DNA、核DNA、线粒体DNA三大类。基因片段的序列分析在中药质量研究中初步显示了优越性，也向我们提出了许多新的课题。     

太空飞行对药用植物藿香叶绿体超微结构的影响

目的　通过对藿香叶绿体超微结构的研究,探讨空间环境对药用植物的影响。方法　以药用植物藿香的种子为材料,搭载返回式卫星,回到地面后用电镜观察其叶绿体的变化。结果　地面对照组细胞的叶绿体中常含有囊泡,而失重组和击中组细胞的叶绿体中则很少或缺失。失重组细胞的叶绿体有解体的表现。结论　空间环境对藿香叶绿体的超微结构有一定的影响。     

ISSR标记技术及其在药用植物遗传育种中的应用

简单重复序列间扩增(ISSR)是在简单重复序列(SSR)基础上发展起来的一种新技术。该技术以锚定的微卫星DNA为引物,对与锚定引物互补的间隔不太大的重复序列间DNA片断进行PCR扩增。ISSR标记具有较长的引物序列,退火温度高,表现出较好的稳定性,且结合位点丰富,可以检测到基因组中多个位点的差异,能够揭示出比限制性片段长度多态性(RFLP)、随机引物扩增多态DNA(RAPD)、SSR更多的多态性信息。对ISSR标记技术的原理、特点及其在药用植物种质鉴定、遗传多样性、居群遗传结构、进化与亲缘关系分析以及分子辅助育种等研究方面的应用进行了综述。     

DNA条形码序列对9种蒿属药用植物的鉴定

目的 采用DNA条形码序列对9种常见的蒿属药用植物进行鉴定,为常见蒿属药用植物的鉴定提供分子依据。方法 对9种常见蒿属药用植物的4条候选DNA条形码序列（ITS2、rbcL、matK、psbA-trnH）进行PCR扩增和测序,比较各序列的扩增和测序效率,应用BLAST1、Distance方法来评估各序列的鉴定效率。此外,基于MEGA5分析9种常见蒿属药用植物ITS2序列种间K2P遗传距离并构建NJ树。结果 除matK外,其余3条片段的PCR扩增和测序效率均为100%,ITS2序列对9种蒿属药用植物的物种水平鉴定成功率最高,为100%,而psbA-trnH、rbcL、matK、matK＋rbcL的鉴定成功率（BLAST1法）分别为83.3%、66.7%、54.5%、75%。通过ITS2序列的种间K2P遗传距离及NJ树均能将不同物种全部区分。结论 ITS2序列可以作为鉴定蒿属药用植物的潜在条形码。     

药用植物种质资源ITS序列研究进展

ITS(internal transcribed spacer)序列分析已成为近年来国际上植物多样性研究的热点，并在药用植物种质资源研究中得到广泛的应用。但由于相关研究成果众多，一定程度上也阻碍了该方面的科研工作。针对这种情况，对ITS序列分析的优缺点、技术流程、数据分析方法及其在药用植物品种鉴定、分类、亲缘关系确定、遗传多样性分析等方面的应用情况进行详细的综述，同时对其未来的发展前景进行了展望，以期能使国内药用植物学工作者对此有更多的了解和认识。     

铁线莲属蒙药材的rDNA-ITS序列分析

目的:比较研究铁线莲属入蒙药的6种药用植物(芹叶铁线莲、长瓣铁线莲、黄花铁线莲、棉团铁线莲、辣蓼铁线莲、短尾铁线莲)的rDNA - ITS序列差异性及其规律,寻找6种植物药之间的分子鉴别方法.方法:从铁线莲属蒙药材中提取总DNA,用PCR法扩增ITS,运用Clustal X、MEGA等软件比较和分析ITS的序列特征.结果:铁线莲属入蒙药的6种药用植物ITS序列长度为548～552bp,具变异位点57个,其中信息位点23个,特异性鉴别位点33个.序列已提交至NCBI数据库,登录号为JN809679 - JN809684.结论:ITS序列对铁线莲属入蒙药的6种药用植物具有较好的分辨性,为铁线莲属蒙药材分子鉴别提供了参考.     

PCR法扩增盐藻叶绿体atpA基因

目的：克隆杜氏盐藻叶绿体atpA基因片段。方法：把GenBank中近10种藻类的atpA全基因的氨基酸序列进行比较,设计简并引物,利用PCR方法从盐藻叶绿体DNA中扩增atpA基因片段,然后胶回收所扩片段并与T—vector相连,转化大肠杆菌JM109,挑阳性克隆鉴定,并测序,再将序列与所选藻类有关序列比较同源性。结果：从盐藻叶绿体基因组中扩增出约400bp的片段。测序结果显示此片段长405bp,推导的氨基酸序列与莱茵衣藻的同源性为920k,,普通小球藻为88％,,原始绿藻为87％,卵形肾藻为86％,Cyanidioschyzon merolae为85％。结论：本实验中所克隆的序列为杜氏盐藻的叶绿体atpA基因片段。     

巴戟天及其伪品的psbA-trnH序列鉴定

目的 利用叶绿体基因psbA-trnH间区序列探讨巴戟天及其常见伪品大果巴戟、樟叶巴戟、羊角藤、虎刺的分子鉴定方法.方法 分别提取巴戟天及其伪品植物的总DNA,经PCR扩增纯化后,测序,利用Clustal X和MEGA 3.1软件对序列进行分析.结果 各样品psbA-trnH序列长度为306 bp,巴戟天及其伪品之间存...     

表达序列标签在药用植物研究中的应用

功能基因研究是目前国际上研究热点之一,近几年来药用植物功能基因逐渐受到各国学者的广泛关注.序列表达标签(expressed sequence tag,ESTs)技术是认识生物体基因与基因组快速高效的研究手段之一,广泛应用于鉴定和发现新的基因、研究比较基因组学和生物信息学、建立分子标记、构建生物体遗传图谱和制作基因芯片等各个方面.首先对ESTs技术的原理、优势和研究现状进行简要介绍,重点对ESTs技术的主要研究方法及其在药用植物研究中的应用进行概述,并讨论了ESTs技术在药用植物研究中的应用前景及应注意的问题.     

6种成药中原料药材金银花的分子鉴别研究

目的：研究位点特异性PCR方法在中成药鉴定方面的应用。方法：本实验选用6种含有金银花原料药材的中成药为研究对象,采用改良CTAB法提取其总DNA,并使用DNA纯化试剂盒进行纯化;通过聚合酶链式反应（polymerase chain reaction,PCR）对trnL-trnF叶绿体序列进行扩增,将扩增产物进行不同浓度稀释;以稀释后样品作为模板,分别选择金银花特异性鉴别引物进行扩增,并将扩增后的产物进行测序。所得序列校正、比对后,进行Blast N比对分析。结果：连翘败毒丸、梔子金花丸、牛黄清宫丸、金噪散结丸、健脑补肾丸、金噪开音丸6种中成药中均含有原料药材金银花。结论：采用位点特异PCR方法鉴定中成药中原料药材具有一定的可行性。     

Relationship between DNA Barcoding and Chemical Classification of Salvia Medicinal Herbs

Objective To make the identification of medicinal herbs in Salvia L. quickly and accurately. Methods In this work, DNA barcoding and chemical fingerprint were compared for the identification of herbs in Salvia L. First, the nucleotide sequences of the internal transcribed spacer region two amplified from 48 medicinal plants in Salvia L., and three other groups of medicinal plants in Lamiaceae were sequenced. A molecular phylogeny was constructed using the minimum evolution and maximum parsimony methods according to their sequence diversity. Second, the water-solution bioactive components and lipid soluble components were tested by HPLC. Then a chemical phylogeny was built using HPLC fingerprint data. Comparing the molecular and chemical phylogenetic trees revealed many similarities. Results DNA barcoding was sequencing based and could therefore provide more accurate results within a shorter time especially in large-scale studies. Conclusion The results show that ITS2 region is a novel DNA barcode for the authentication of the species in Salvia L. This is the first work to show the relationship between DNA barcoding and chemical components.     

国产姜黄属药用植物RAPD分析与分类鉴定

运用ＲＡＰＤ技术刻划了国产姜黄属药用植物的遗传背景差异,并结合经典分类和异地栽培观察和聚类分析,初步澄清了姜黄属植物的一些分类学争议,从ＤＮＡ分子水平上为姜黄属植物分类与中药鉴定提供了参考依据。     

Key Techniques and Application Progress of Molecular Pharmacognosy

At the boundary between pharmacognosy and molecular biology, molecular pharmacognosy has developed as a new borderline discipline. This paper reviews the methods, application, and prospect of molecular pharmacognosy. DNA marker is one of genetic markers and some molecular marker methods which have been successfully used for genetic diversity identification and new medicinal resources development. Recombinant DNA technology provides a powerful tool that enables scientists to engineer DNA sequences. Gene chip technique could be used in determination of gene expression profiles, analyses of polymorphisms, construction of genomic library, analysis of mapping, and sequencing by hybridization. Using the methods and theory of molecular biology and pharmacognosy, molecular pharmacognosy represents an extremely prospective branch of pharmacognosy and focuses on the study of systemic growth of medicinal plants, identification and evaluation of germplasm resources, plant metabolomics and production of active compounds. Furthermore, the great breakthrough of molecular pharmacognosy could be anticipated on DNA fingerprint analysis, cultivar improvement, DNA identification, and a global DNA barcoding system in the future.     

基于简单重复序列标记的药用梅品种的身份证构建

目的 筛选一套适合中国药用梅品种鉴定标准的简单重复序列（simple sequence repeats, SSR）,用于构建药用梅品种DNA指纹身份证。方法 以30份药用梅农家种为材料,从180对SSR引物中,最终选取16对多态性较高、条带清晰且重复性好的SSR引物对30份药用梅农家种进行扩增。结果 30份药用梅共扩增出114个等位基因,平均等位基因数和多态信息含量分别为7.12和0.69,且在16个位点上识别两个具有相同基因型的随机个体的概率估计为5.24×10-17。最终筛选出4对扩增稳定、多态性强的核心引物,可将30个药用梅农家种进行有效区分,建立药用梅种质资源DNA指纹身份证。结论 SSR 标记技术可以作为药用梅分子身份证构建的有效技术手段。     

苏皖产大戟属药用植物rDNA的ITS序列分析

目的研究苏皖产大戟属内6种药用植物的ITS长度的变异,为探讨大戟属植物的系统演化关系和大戟属植物鉴定提供DNA分子证据。方法利用PCR技术对大戟属植物的rDNAITS区碱基序列进行测定。结果这6种大戟属植物的ITS1的长度范围为255~262bp,ITS2的长度范围为214~236bp。运用Mega2软件进行的系统分析得到大戟属内6种植物的系统进化树。这一分析结果与来自形态学的研究结果相吻合。结论此法可用于大戟属植物种间及真伪品鉴别。     

海南黎药资源调研现状分析

目的：通过野外调查,获得海南黎族药材及其品种鉴定、药材来源、炮制方法、功能主治及用法用量等第一手资料,筛选针对疑难病、多发病及黎医药优势病种的黎族常用药材,通过化学成分的粗分确定其临床作用的物质基础;方法：采用实地调研、文献查阅及初步化学成分分析相结合。结果：鉴定128种黎药材,同时获得有关其功能主治、化学成分、药理作用及民间或临床应用情况的文献资料;并初步进行了几种常用药材（胡椒、牛耳枫、三叉苦、胆木、水蓼粗分）临床作用物质基础的研究。结论：经过经2年的调研,已获得有关海南黎药资源的基本信息。     

A review of medicinal plant research at the University of the West Indies, Jamaica, 1948-2001

This review summarizes research carried out on Jamaican medicinal plants at the Faculty of Pure and Applied Science, The University of the West Indies (UWI), Mona, Jamaica, between 1948 and 2001. The plants identified as being medicinal are listed along with their folk use and a summary of the scientific research done at UWI leading to the identification of natural products (NPs) and determination of their bioactivity. Natural product research on Jamaican medicinal plants began with the inception of UWI in 1948, leading to many postgraduate degrees being awarded (22 MPhil and 31 PhD). At least 334 plant species growing in Jamaica have been identified as having medicinal qualities, 193 of these have been tested for their bioactivity. Crude extracts from 80 of these plants have reasonable bioactivity and natural products (NP) have been identified from 44 plants. At least 29 of these NPs were found to be bioactive. Only 31 of the plants tested at UWI are endemic to Jamaica. Of these 23% were bioactive, as compared to 11% of the non-endemics. Based on these results, patents have been obtained and drugs have been developed. This review represents the first attempt to gather this information together in one place.     

安徽省潜山县药用植物资源特点和合理利用

目的 探讨潜山县药用植物的资源特点和合理利用。方法 通过实地调查、标本采集和鉴定、整理分析,对重点调查的145种中药的资源特点进行分析。结果 该地区共有药用植物853种,野生药用植物资源丰富,部分品种栽培相对广泛。结论 潜山县药用植物资源丰富,应该可持续利用野生中药资源和合理发展中药种植,促进中药产业发展。     

安徽和县常用药用植物资源调查

目的调查和县药用植物的资源种类与分布特点。方法通过实地调查、标本采集与鉴定,整理与分析调查结果。结果和县分布的药用植物606种,隶属133科,400属,其中常用药用植物152种,主要分布在西北丘陵低山区。结论和县常用中药资源丰富,应可持续利用野生中药资源和合理发展中药种植,调整农业产业结构,促进中药产业的发展。