宏基因组二代测序技术在2型糖尿病合并肺部感染患者中的临床应用

目的 比较宏基因组二代测序技术(metagenomic Next-Generation Sequencing, mNGS)与传统病原学诊断方法对2型糖尿病患者肺部感染病原学诊断的优劣，为临床诊治提供参考依据。方法 对阜阳市人民医院在2021年11月至2023年3月就诊的103例2型糖尿病合并肺部感染患者进行回顾性分析，均接受传统培养及mNGS检测，比较两种不同检测方法对病原体检测的阳性率、病原学分布及检测结果的一致性；比较两种不同检测方法的敏感度、诊断效能；比较不同分组患者mNGS阳性检出率。结果 mNGS检测对肺部感染病原检出阳性率、诊断敏感度显著高于传统检测方法(81.55%vs 42.72%,P<0.001);(92.68%vs 51.21%,P<0.001),但是两者一致性较差(Kappa=0.179<0.4)。在各个亚组mNGS检出阳性率的比较中，合并肺基础疾病组检出阳性率更高(93.02%vs 73.33%,P<0.05)。结论 mNGS检测可提高2型糖尿病合并肺部感染患者病原体的检出率，尤其是在真菌、病毒、特殊病原体方面。     

基于宏基因组的二代测序技术在重症肺炎患者病原体快速检测中的应用价值探讨

目的探讨基于宏基因组的二代测序技术(mNGS)在重症肺炎患者病原学检测中的应用价值。方法纳入2018-07~2019-05收治的重症肺炎患者26例,比较mNGS与传统检测方法对病原菌的诊断效能,同时评价抗生素暴露对检出率的影响。结果mNGS检出病原菌的阳性率为92.3%,高于传统培养方法的42.3%,差异有统计学意义(P<0.05)。在使用抗生素的前提下,mNGS的阳性率(91.3%)显著高于传统方法(43.5%),差异有统计学意义(P<0.05)。结论mNGS对病原菌鉴定具有较高的灵敏度,而且使用抗生素对mNGS检测结果影响小,对感染患者的诊治及疗效有着重要的临床应用价值。     

宏基因组二代测序对肾脏重症监护病房免疫功能低下患者感染的诊断价值

目的：回顾性分析宏基因组二代测序(mNGS)对肾脏重症监护病房(ICU)免疫功能低下患者感染的诊断价值,评估临床应用前景。方法：选取2018年8月至2022年4月国家肾脏疾病临床医学研究中心ICU收治疑诊感染的慢性肾脏病(CKD)免疫功能低下患者,分为常规微生物学检测(CMT)确诊感染组、临床诊断感染组和排除感染组,对比mNGS与CMT的诊断效能。结果：本研究共纳入303例患者,累计使用2(1, 3)种免疫抑制剂,中位治疗时间7(2, 50)月,中位CD4⁺T细胞计数149.50(81.25, 262.25)个/μL,在院死亡率20.46%。CMT确诊感染组中38.79%的mNGS与CMT结果完全一致,27.88%部分一致,33.33%不一致。临床诊断感染组中57.69%通过mNGS发现感染病原体。mNGS报阳时间更早,检测病原体种类更多(P<0.05),混合感染检出率高(P<0.001),可鉴定出常规培养难以发现的病原体。mNGS对感染病原体检测灵敏度和准确度强于CMT(P=0.014),特异度、阳性及阴性预测值无明显差异。结论：mNGS能增加免疫功...     

肺泡灌洗液宏基因二代测序技术对下呼吸道感染病原体检测的优势

目的探讨肺泡灌洗液宏基因二代测序技术(mNGS)对下呼吸道感染病原体检测的优势及指导治疗作用。方法回顾性分析2018年5月至2019年5月在浙江大学医学院附属邵逸夫医院就诊的下呼吸道感染患者56例,所有患者均行支气管镜肺泡灌洗夜mNGS检测与传统培养(包括痰培养及灌洗液培养)检查,比较灌洗液mNGS与传统培养检测的阳性率、检测病原体的分布、病原体检测的一致性;在传统培养阴性患者中,比较灌洗液mNGS阳性患者与灌洗液mNGS阴性患者的治疗效果;并利用多因素logistic回归法分析灌洗液mNGS对病原体检出率的影响因素。结果灌洗液m NGS检测的阳性率高于传统培养(69.6%对25.0%),差异有统计学意义(P0.05)。在传统培养无法检测到病原体的患者中,根据灌洗液mNGS阳性结果调整抗病原微生物药物后治疗效果明显好于经验性抗感染治疗(88.0%对40.0%),差异有统计学意义(P0.05)。多因素logistic回归法分析灌洗液mNGS对病原体检测的影响因素中,未发现有影响因素存在。结论采用灌洗液mNGS检测可以提高下呼吸道感染患者病原体的检出率,特别是对病毒、真菌及特殊病原体。在传统培养无法检测到病原体的患者中,灌洗液mNGS可以作为一种有效的检测方法,从而指导抗病原微生物药物的应用,提升治疗效果。未发现灌洗液mNGS对病原体检出率的影响因素。灌洗液mNGS在下呼吸道感染的诊断及治疗中有很高的临床应用价值。     

血浆甲基化SEPT9基因在原发性肝癌患者中的表达及其临床意义

目的研究血浆甲基化SEPT9基因(mSEPT9)在原发性肝癌患者中的表达及临床意义。方法选取2016年5月至2018年10月在西安就诊393例患者资料, 其中原发性肝癌组75例、肝硬化组50例、健康对照组268例。应用聚合酶链式反应荧光探针法检测3组外周血浆mSEPT9表达阳性率, 并分析其与肝癌临床特征的相关性, 同时与电化学发光法检测的甲胎蛋白阳性率进行比较。采用χ2检验或连续性校正的χ2检验进行统计学分析。结果实际有效样本数为367例。肝癌组64例, 肝硬化组42例, 健康对照组261例, 其中获得肝癌病理组织者34例。血浆mSEPT9阳性率在肝癌组明显高于肝硬化与健康对照组[分别为76.6%(49/64)、35.7%(15/42)、3.8%(10/261)], 差异均有统计学意义(χ2 = 176.017, P <0.001)。肝癌患者血浆mSEPT9检测灵敏度(76.6%)明显优于甲胎蛋白(54.7%), 差异具有统计学意义(χ2 = 6.788, P < 0.01)。血浆mSEPT9联合甲胎蛋白检测较其单一检测灵敏度及特异度均明显提高(分别为89.7%、特异度9...     

支气管肺泡灌洗液送检mNGS对影像学不典型疑似肺结核的诊断及鉴别诊断的临床应用价值

目的探究支气管肺泡灌洗液(BALF)送检宏基因组二代测序(mNGS)对影像学不典型疑似肺结核的诊断及鉴别诊断的临床应用价值。方法本研究为横断面研究。采用单纯随机抽样方法, 收集2020年5月至12月在南京市第二医院行气管镜检查, 影像学不典型且痰结核菌涂片阴性的疑似肺结核患者合计86例的临床资料, 统计分析BALF并行送检mNGS、分枝杆菌培养+鉴定、GeneXpert MTB/RIF分析(Xpert)的结果。结果 86例疑似肺结核患者中, 因数据不完整去除22例, 最终纳入分析64例, 其中诊断活动性肺结核患者44例, 排除肺结核诊断患者20例。在诊断活动性肺结核方面, mNGS的敏感度与Xpert相当(36.36%比34.09%), 高于分枝杆菌培养检测(36.36%比18.18%);并行分枝杆菌培养+Xpert+mNGS的联合诊断可有效提高肺结核病原检测的敏感度(54.55%);同时mNGS还以非靶向方法检测到3例活动性肺结核合并其他病原体的混合感染。对于抗酸杆菌涂片阴性影像学不典型的20例疑似肺结核患者鉴别诊断方面, mNGS检测到13例结核分枝杆菌以外的病原体(13/20, ...     

宏基因二代测序技术对感染性疾病患者的诊断价值及其临床应用

目的利用宏基因二代测序(mNGS)技术,检测其和传统培养法的区别,探讨病原微生物及检出序列数与感染患者病情程度和预后的相关性。方法选取2018年5月至2019年9月在上海市第十人民医院就诊的94例患者样本。分别进行传统培养和mNGS检测,对2种技术的诊断效果、假阳性率、假阴性率进行了分析。然后收集感染组75例患者的血液标本和临床信息,根据mNGS是否检出病原体将患者分为检出组(51例)和未检出组(24例)。测定外周血白细胞、C反应蛋白、降钙素原和中性粒细胞计数,用酶联免疫吸附试验法测定血清中细胞因子的浓度。分析患者病原体检出率与病情严重程度、住院时间等相关性分析。结果纳入的94例样本中,感染组75例(7979%),非感染组16例(1702%),未知组3例(319%)。样本类型中血液占比最多(34/94),其次为肺泡灌洗液(28/94)、组织、痰液、胸水、脓液等。下呼吸道感染所占比例最高(60/94),其次是血流感染、胸水、中枢系统感染、心血管系统感染等。mNGS的敏感度显著高于培养法(χ^2=-223.107,P<005)。mNGS的特异度与培养法差异无统计学意义(χ^2=3.840,P=005)。感染未检出组患者住院时间也明显高于检出组(t=4.724,P<005)。单因素分析发现检出组患者外周血白细胞计数、中性粒细胞计数、C反应蛋白、降钙素原显著高于未检出组(t值分别为-8.848、-4.724、-4.335、-4.335,P值均<005);检出组中肿瘤坏死因子α、白细胞介素2R、白细胞介素8水平均高于未检出组(t值分别为-5.585、-7.258、-4.678,P值均<005)。logistic多因素回归分析去除混杂因素后,显示性别、年龄、白细胞介素2R与病原体检出阳性有关。结论mNGS在结核、真菌、病毒和厌氧菌诊断方面优势更明显,其阳性率高于传统方法3倍以上。感染患者的病原体检出率较高,其检出病原体核酸序列是患者预后不良的高危因素,有显著的临床价值。     

宏基因组的二代测序技术在初治失败社区获得性肺炎患者病原菌检测中的应用价值

目的探讨基于宏基因组的二代测序技术(mNGS)在初治失败社区获得性肺炎(CAP)患者病原菌检测中的应用价值。方法回顾分析2019年5月1日至2020年12月31日安徽医科大学第四附属医院呼吸与危重症医学科收治初治失败CAP患者87例,统计其病原菌分布情况,并比较mNGS与传统检测方法对初治失败CAP病原菌诊断差异。结果 87例初治失败CAP患者中,非重症CAP患者75例,重症CAP患者12例。在75例非重症CAP患者分离到的31种微生物中,细菌感染最常见,其次为结核,再次为真菌、病毒;在12例重症CAP患者分离到的14种微生物中,真菌感染最常见,其次为非典型病原体。mNGS检测出病原菌的阳性率为(85.06%),高于传统检测方法(8.04%)。差异有统计学意义(P0.05)。结论 mNGS对病原菌鉴定具有较高的灵敏度,为初治失败CAP患者提供了快速准确的病原菌检测方法,有助于更早识别病原体和指导用药,提高临床诊治水平。     

支气管肺泡灌洗液宏基因组二代测序在非中性粒细胞减少肺曲霉感染中的诊治价值

目的 探讨支气管肺泡灌洗液(bronchoalveolar lavage fluid, BALF)宏基因组二代测序(metagenomic next-generation sequencing, mNGS)在非中性粒细胞减少肺曲霉感染中的鉴别优势及治疗指导价值。方法 回顾性研究2021年11月至2022年12月的32例非中性粒细胞减少患者的临床资料，其BALF的mNGS均提示真菌，17例为肺曲霉感染，15例为非肺曲霉感染。观察非中性粒细胞减少肺曲霉感染的临床特性，对比mNGS和常规方法的检测阳性率，评估mNGS对治疗的指导价值。结果 与非肺曲霉感染组相比，肺曲霉感染组更多表现为咯血或痰血(23.5%vs 0.0%,P<0.05),更多的患者接受全身皮质类固醇激素治疗(76.5%vs 40.0%,P<0.05)。两组BALF的mNGS检测阳性率均明显高于传统病原学方法(P<0.05)。肺曲霉感染组BALF的mNGS检测阳性率明显高于培养及GM试验(P均<0.001),可鉴定出94.1%共病原，其中共细菌、真菌和病毒的混合感染最多见(23.5%)。88.2%的肺曲霉...     

肺泡灌洗液联合mNGS在免疫抑制合并肺部感染病原学的应用

目的 了解肺泡灌洗液联合宏基因组下一代测序技术(mNGS)在免疫抑制合并肺部感染中病原学诊断的应用价值。方法 回顾分析2020年1月-2022年5月确诊为肺部感染的免疫抑制患者71例及非免疫抑制患者167例的临床资料，同时收集患者痰培养/痰涂片、肺泡灌洗液联合mNGS病原学的检出结果，针对肺泡灌洗液联合mNGS在免疫抑制合并肺部感染患者中的诊断及治疗指导效能进行分析，并绘制ROC曲线。结果 免疫抑制组中肺泡灌洗液联合mNGS检出病原体阳性率高于常规痰培养，差异有统计学意义(P<0.05); CRP、PCT、住院费用、住院天数等指标免疫抑制组均高于非免疫抑制组，淋巴细胞绝对计数低于非免疫抑制组(P<0.001)。将免疫抑制组分为4个亚组，其中肾移植组住院天数及住院费用均高于外在激素类免疫抑制组(P<0.05);而淋巴细胞绝对计数及中位年龄均低于外在激素类免疫抑制组(P<0.05);免疫抑制组各亚组间肺泡灌洗液联合mNGS、痰培养与预后之间关系无统计学差异(P>0.05)。肺泡灌洗液联合mNGS阳性患者的预后优于阴性的患者，差异有统计学意义(P<0.00...     

宏基因组二代测序技术对髋/膝关节结核的诊断价值

目的:评价宏基因组二代测序(metagenomic next generation sequencing, mNGS)技术对髋/膝关节结核的诊断价值。方法:采用回顾性研究方法，收集2019年6月至2021年6月河北省胸科医院收治的34例髋/膝关节感染患者资料，按照病原菌种类分为关节结核组(16例)和非结核感染性疾病组(18例),分别对所有患者感染病灶组织样本进行常规细菌学培养和分枝杆菌培养(MGIT 960培养)、结核分枝杆菌(MTB)-DNA扩增检测及mNGS检测。以临床诊断为参照标准，比较分枝杆菌培养、MTB-DNA扩增和mNGS检测对髋/膝关节结核的诊断效能。结果:mNGS对非结核感染性疾病组中病原体的检出率为100.0%(18/18);对髋/膝关节结核的阳性检出率为93.8%(15/16),明显高于MTB-DNA扩增检测[50.0%(8/16)]和MGIT 960培养[25.0%(4/16)],差异均有统计学意义(χ²=7.575,P=0.015;χ²=15.676,P=0.000)。以临床诊断为参照标准，mNGS诊断髋/膝关节结核的...     

外周血宏基因组二代测序在肺炎中的应用价值

目的 评估外周血宏基因组二代测序(mNGS)技术在肺炎患者中微生物检测方面的应用价值。方法 使用回顾性分析的方法，收集常州市第二人民医院收治的28例使用外周血mNGS技术进行病原学检测的肺炎患者，并与常规微生物学检测(CMT)方法进行比较。结果 在这28例患者中，重症肺炎有19例，非重症肺炎有9例。mNGS对微生物的检出率(78.6%,22/28)与CMT(64.3%,18/28)相比差异无统计学意义(P=0.338)。mNGS对病毒的检出率高于CMT(P=0.004),但是在检出细菌(P=0.625)和真菌(P=0.118)方面无明显优势。进一步在重症肺炎患者的亚组分析中得到了同样的结果。经过综合评估，7例患者通过mNGS确诊病原体，分别为耶氏肺孢子菌(PJ)2例，PJ合并巨细胞病毒(CMV)2例，鹦鹉热衣原体2例和腺病毒1例。结论 尽管血mNGS对病原微生物的检出率并不优于CMT,但是当病毒、PJ或鹦鹉热衣原体感染时，可以考虑使用血mNGS进行病原学诊断。     

外周血宏基因组二代测序对肺孢子菌肺炎的诊断价值

目的:研究探讨外周血宏基因组二代测序技术(mNGS)在免疫抑制剂治疗的肾脏疾病患者合并肺孢子菌肺炎(PCP)的诊断价值。方法:选取肾脏疾病接受免疫抑制治疗后合并弥漫性肺部感染、临床拟诊为PCP的患者37例作为观察组,另选取25例临床确诊为其他病原导致肺部感染的患者作为对照。使用mNGS检测患者外周血中的病原种类和序列,评价mNGS对PCP的检测效能,比较mNGS与传统临床诊断PCP方法(真菌G联合乳酸脱氢酶检测)的效能差异。结果:观察组患者送检外周血样本37份,其中35份mNGS检出耶氏肺孢子菌(PJ)序列,敏感度94.59%,特异度100%;31例患者为混合型感染,27例检出病毒序列(19例为巨细胞病毒),8例合并细菌感染。对照组25份血标本PJ序列均为阴性。真菌G联合乳酸脱氢酶检测的敏感度89.19%,特异度56.0%;mNGS的特异度显著高于真菌G联合乳酸脱氢酶检测。结论:mNGS较传统诊断PCP的方法有明显优势,可同时检出混合感染的病原,对免疫抑制合并肺部感染的诊断有重要意义。     

环介导恒温扩增芯片法在下呼吸道感染病原体检测中的临床应用

目的分析环介导恒温扩增芯片法(LAMP)在下呼吸道感染病原体检测中的应用价值。 方法选择2018年1月至2018年9月空军军医大学第二附属医院收治的1 092例疑似下呼吸道感染患者,分析支气管肺泡灌洗液病原体检测结果,以细菌培养结果为金标准,评价LAMP检测8种常见下呼吸道感染病原体的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、阳性似然比、阴性似然比。 结果LAMP检测8种病原体的灵敏度差异较大,检测金黄色葡萄球菌灵敏度最高(100%),检测大肠埃希菌灵敏度最低(40%),检测8种病原体的特异度均高于94%。LAMP检测8种病原体的阳性预测值低于65%,阴性预测值高于98%,阳性似然比高于13,阴性似然比各病原体间差异较大,金黄色葡萄球菌阴性似然比最低(0.00),大肠埃希菌阴性似然比最高(0.60)。 结论LAMP在下呼吸道感染病原体检测中有较高的准确性,利于下呼吸道感染的早期诊断和精准治疗,具有临床意义。     

呼吸道联检试剂在HIV/AIDS合并呼吸道非典型病原体感染诊断中的应用研究

目的探讨呼吸道联检试剂对HIV/AIDS合并呼吸道感染患者的血清样品非典型病原体的诊断价值。方法采用西班牙Vircell公司生产的呼吸道联检试剂(间接免疫荧光法)对419例HIV/AIDS合并呼吸道感染患者进行9种病原体检测。结果 419例中,非典型病原体总阳性率为26.0%,其中嗜肺军团菌1型阳性率居第一位(17.4%),肺炎支原体阳性率居第二位(9.5%),2种及以上病原体混合感染阳性率为10.3%。结论呼吸道联检试剂对于HIV/AIDS合并呼吸道感染患者的病原学诊断有着重要的临床指导意义。     

北京地区老年肺炎患者血清中呼吸道病原体IgM抗体检测分析

目的探讨北京地区老年人肺炎的病原学流行特点,为临床诊疗提供病原学依据。方法采用间接免疫荧光法检测人血清中8种呼吸道病原体的Ig M抗体,根据不同性别、不同年龄和不同季节的病原体阳性率以及合并感染情况进行统计分析。结果 855例患者中检出病原体343例(40.1%),其中甲型流感病毒检出阳性率最高,其他依次为:嗜肺军团菌、乙型流感病毒、副流感病毒、呼吸道合胞病毒、肺炎支原体、腺病毒和肺炎衣原体;检出病原体阳性343例中感染双重病毒的45例(13.1%),三重及以上11例(3.2%),老年人肺炎病原体混合感染率较高;老年人肺炎患者中男性患者病原体阳性率高于女性(P0.05);不同年龄组呼吸道病原体感染阳性率未见明显差异(P0.05);不同季节病原体的阳性率有差异,春季和冬季的病原体阳性率显著高于夏季和秋季(P0.05)。结论该地区老年人肺炎呼吸道病原体阳性率在性别间和季节性存在差异,在感染年龄上无差异,病原体混合感染率较高,病原体以甲型流感病毒和嗜肺军团菌为主,其他病原体流行有季节性特点。     

2015-2020年烟台市手足口病病原学监测结果分析北大核心CSCD

目的 分析2015-2020年烟台地区手足口病病原体变化规律,为手足口病的防治提供参考依据。方法 收集2015-2020年烟台市手足口病病原学实验室检测数据,分析其流行特征。结果 共检测3654份标本,手足口病病原体检测阳性率为71.87%。2015-2020年烟台市手足口病优势病原体CV-A16和其他肠道病毒交替出现,且EV-A71阳性率呈下降趋势,CV-A16及其他肠道病毒阳性率呈上升趋势(均P<0.05)。共收集到61例重症患者标本,病原学检测阳性率为78.69%,其中EV-A71、CV-A16及其他肠道病毒感染分别占33.33%、24.44%和42.22%。轻症患者病原学检测阳性率为72.36%(2600/3593),感染病原体中以其他肠道病毒占比较高,为47.81%。农村地区患者病原学检测阳性率为74.31%(1082/1456),城镇地区患者为71.11%(1563/2198)。各县(市)区患者手足口病病原学检测阳性率以莱州市较高,为90.67%(243/268);福山区较低,为58.46%(228/390)。≤1岁、>1岁、>3岁、>5岁组患者病原学检测阳性率分别为71.44%(628/879)、72.52%(1029/1419)、72.33%(677/936)和74.05%(311/420)。散发、聚集、暴发病例病原学检测阳性率分别为59.53%(1965/3301)、75.08%(247/329)和89.47%(34/38)。轻、重症病例,不同居住地、不同县(市)区、不同年龄组、不同发病形式的手足口病患者病原学检测阳性率差异均有统计学意义(均P<0.05)。结论 2015-2020年烟台地区手足口病病原体中除EV-A71外的其他肠道病毒感染占比呈逐年升高趋势,尤其是2017年和2020年,烟台市手足口病病原体分布发生了明显变化,因此应加强对其他肠道病毒的监测。     

四种方法联合检测对病原学阴性肺结核的诊断价值

目的:分析结核感染T细胞斑点试验(T-SPOT.TB)、结核抗体(antibody, TB-Ab)、血红细胞沉降率(erythrocyte sedimentation rate, ESR)、超敏C-反应蛋白(high-sensitivity C-reaction protein, hs-CRP)联合检测在病原学阴性肺结核诊断中的价值。方法:收集2020年7月至2022年7月北京市疾病预防控制中心结核病门诊收治的初治且病原学检查阴性的肺结核患者216例(病原学阴性肺结核组),以及同期收治的病原学阳性的初治肺结核患者147例(病原学阳性肺结核组)和其他肺部疾病患者455例(其他肺部疾病组)。均行T-SPOT.TB、TB-Ab、ESR、CRP检测，以临床诊断为标准，分析四种方法单独及联合检测的诊断效能。结果:T-SPOT.TB在病原学阴性肺结核组中检测阳性率为82.4%(178/216),与病原学阳性肺结核组阳性率[87.8%(129/147)]相比较，差异无统计学意义(χ²=1.917,P=0.166),与其他肺部疾病组阳性率28.6%(130/455)相比较差异有统...     

支气管肺泡灌洗液高通量测序技术在成人肺部感染中的应用价值

目的评估支气管肺泡灌洗液(BALF)高通量测序技术在肺部感染病原学诊断中的价值及对患者预后的影响。方法计算机检索PubMed、Embase、Cochrane Library、Web of science、clinical trials.gov.cn、中国知网、万方数据库和中国生物医学文献数据库, 检索时间为自建库时间至2021年12月8日。比较BALF宏基因组测序与传统病原学检测方法对肺部感染检测的阳性率、敏感度及特异度;根据病原学检测结果调整治疗方案, 比较2组患者的抗生素使用强度、住院时长、28/30 d及90 d病死率。采用Review Manager 5.4.1软件对上述指标分别进行meta分析。结果最终纳入35篇文献, 共2 624例患者, 其中高通量测序组2 248例, 传统病原学检测组2 493例。meta分析结果显示, 高通量测序组阳性率为79.8%(1 793/2 248), 高于传统病原学检测组41.7%(1 039/2 493)(OR=6.84, 95%CI:4.84～9.67, Z=10.88, P<0.001);敏感度、特异度及汇总受试者工作特征曲线下面...     

支气管肺泡灌洗液二代测序在检测肺部感染病原体中的应用

目的：探讨支气管肺泡灌洗液(BALF)二代测序(NGS)在肺部感染病原体检测中的应用。方法：回顾性收集412例肺部感染患者的临床病历资料，包括常规呼吸道病原学、NGS及实验室检测结果。结果：412例患者中，有肺部基础病患者222例，无肺部基础疾病患者190例。2组患者NGS检测BALF中前3位病原体均为流感嗜血杆菌、肺炎链球菌和EB病毒。有肺部基础疾病组铜绿假单胞菌检出率高于无肺部基础疾病组(11.3%vs 3.2%,P=0.002),而金黄色葡萄球菌低于无肺部基础疾病组(1.8%vs 6.8%,P=0.01)。NGS的检出率高于常规病原学检测(70.1%vs 38.3%,χ²=9.843,P=0.002)。且NGS还检出18例少见病原体。412例NGS中，68例行宏基因二代测序(mNGS),344例行靶基因二代测序(tNGS)。mNGS在金黄色葡萄球菌(8.8%vs 2.9%,P<0.05)、耶氏肺孢子菌(4.4%vs 0.3%,P=0.015)、群集裂褶菌(2.9%vs 0%,P=0.027)、人类疱疹病毒1型(17.6%vs 5.2%,P<0.0...