基于网络药理学探讨柴胡-黄芩治疗慢性肾功能衰竭的作用机制

目的：基于网络药理学探讨柴胡-黄芩治疗慢性肾功能衰竭(chronic renal failure, CRF)的作用机制。方法：基于中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)检索柴胡、黄芩的活性成分及其相关靶点。通过在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man, OMIM)和GeneCards数据库检索CRF相关靶点。应用Draw Venn Diagram在线工具将柴胡、黄芩活性成分相关靶点与CRF相关靶点取交集并绘制韦恩图,得到的交集靶点即柴胡-黄芩治疗CRF的潜在靶点,采用Cytoscape3.8.0软件构建“活性成分-潜在靶点”网络图。采用STRING11.0数据库构建潜在靶点蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络,并筛选柴胡-黄芩治疗CRF的核心靶点。将潜在靶点导入Metascape平台进行基因本体(gene onto...     

基于网络药理学研究消瘀泄浊饮治疗慢性肾功能衰竭的作用机制

目的：利用网络药理学方法研究消瘀泄浊饮治疗慢性肾功能衰竭（Chronic Renal Failure,CRF的分子机制。方法：采用TCMSP与化学专业数据库及文献收集消瘀泄浊饮的有效活性成分和作用靶点。在GeneCards、OMIM、DrugBank、TTD数据库中获得CRF相关靶点,对消瘀泄浊饮药物靶点和CRF相关基因取交集。使用Cytoscape 3.7.2软件构建“药物活性成分-CRF-靶点”网络,将交集靶点导入STRING数据库,构建蛋白质相互作用网络（PPI）,借助Metascape在线工具对关键靶点进行GO功能富集分析、KEGG通路富集分析,并用Autodock vina和Chimera-1.14软件对蛋白和活性成分进行分子对接。结果：通过筛选获得消瘀泄浊饮主要活性成分68个,249个靶点基因;CRF相关基因共1 533个;交集靶点101个。消瘀泄浊饮治疗CRF的关键靶点为黄芪、川牛膝、车前草的共同主要成分AKT1,IL-6,以及大黄、黄芪、桃仁、川牛膝、车前草的共同主要成分PTGS2等。KEGG富集分析筛选出包括HIF-1信号通路、PI3K/Akt信号通路、NF-κB信号...     

基于网络药理学和分子对接探讨苏叶黄连枳实治疗慢性肾功能衰竭的作用机制

目的：运用网络药理学和分子对接探讨苏叶黄连枳实治疗慢性肾功能衰竭（Chronic Renal Failure,CRF）的作用机制。方法：检索中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）数据库筛选药物有效成分,利用Swiss Target Prediction预测其潜在靶点。利用Gene Cards、OMIM及Drugbank检索CRF靶点,通过Venny获取药物有效成分作用靶点与疾病基因靶点的交集。利用STRING构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,利用Metascape进行基因本体论（GO）和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,利用Autodock对有效成分与关键靶点行分子对接。结果：苏叶黄连枳实治疗CRF的核心有效成分为槲皮素、木犀草素等,核心靶点为白细胞介素（Interleukin,IL）-6、肿瘤坏死因子（Tumor Necrosis Factor,TNF）、IL-1β等。共得到1 288个GO富集结果,232条KEGG通路,通路涉及糖尿病并发症中的晚期糖基化终末产物-糖基化终末产物受体信号通路、癌症通路等。分子对接结果显示有效成分与关键靶点的结合能均<0。结论...     

基于网络药理学探讨苓桂术甘汤治疗慢性心力衰竭的作用机制

目的：基于网络药理学方法筛选苓桂术甘汤的活性成分及核心靶标,进一步探讨其防治慢性心力衰竭（Chronic Heart Failure,CHF）潜在分子机制。方法：在中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）检索苓桂术甘汤的活性成分,并预测活性成分作用靶点,采用GeneCards数据库筛选CHF的疾病靶点,运用R语言软件筛选药物与疾病的共同靶点,应用Cytoscape3.7.2软件构建药物活性成分-疾病靶点相互作用网络,应用STRING 11.0构建共同靶点蛋白质相互作用网络,并用Cytoscape3.7.2对蛋白质-蛋白质相互作用网络进行拓扑分析,R语言软件对共同靶点进行基因本体论富集分析、京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析,同时应用Cytoscape 3.7.2软件构建KEGG通路与富集蛋白的相互作用关系网络。结果：获得苓桂术甘汤有效生物活性成分95个,与CHF相关的靶点有72个,这些靶点主要涉及对营养水平的反应、对脂多糖的反应、循环系统中的血管过程、对活性氧的反应等生物学过程,并主要富集在糖尿病并发症中的晚期糖基化终末产物-糖基化终末产物受体（AGE-RAGE）、流...     

大黄治疗慢性肾功能衰竭机制的研究进展

近10年来,国内对大黄治疗慢性肾功能衰竭(CRF)进行了广泛的实验和临床研究,其疗效得到肯定。针对CRF发生的各个环节,国内外学者对大黄及其提取物治疗CRF机制的研究取得了较大进展。     

基于网络药理学探讨强心胶囊治疗慢性心力衰竭的作用机制

目的:基于网络药理学分析预测强心胶囊治疗慢性心力衰竭的作用机制.方法:应用中医药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选出强心胶囊所含有效成分和相关靶标蛋白.根据药代动力学ADME参数,以口服生物利用度(OB)≥30％,药物相似性(DL)≥0.18,生物半衰期(HL)≥4.00为条件筛选出活性成分.从数据库Unip...     

大黄治疗慢性肾功能衰竭作用机理探讨

大黄号将军,始见于《神农本草经》。性味苦寒,通利水谷。运用大黄治疗慢性肾功能不全已有30年历史,自1960年南京中医学院首次介绍大黄治疗本病以来,临床及动物实验均证明大黄治疗本病确有效果,但对其确切机理尚无一致结论。本文就目前对大黄治疗慢性肾功能衰竭(CRF)作用机理的认识和研究现状作一综述。 Willian提出了慢性肾功能减退的三大可能机制:(1)尿毒素蓄积;(2)肾脏血流动力学对肾组织减少的适应性改变;(3)钙、磷代谢异常及继发性甲状旁腺机能亢进。这些环节相互影响,打破这一恶性循环有助于对CRF的治疗。     

基于网络药理学探讨平胃散治疗慢性浅表性胃炎的作用机制

目的基于网络药理学方法研究平胃散治疗慢性浅表性胃炎的潜在作用机制。方法使用TCMSP数据库筛选出平胃散的有效成分及作用靶点,通过Gene Cards数据库筛选出慢性浅表性胃炎的疾病靶点。使用Cytoscape软件构建“药物-成分-靶点-疾病”的相互作用网络图和潜在靶点的相互作用关系,筛选出核心靶点,并进行分子对接验证。最后,对潜在靶点进行富集分析。结果挖掘出平胃散中42种活性成分、67个药物靶点,慢性浅表性胃炎630个疾病靶点,得到药物-疾病共同靶点25个,主要富集于43个生物过程和71条信号通路上。结论平胃散中的山柰酚、汉黄芩素、川陈皮素、厚朴酚等活性成分可能通过调节白介素6、丝裂原活化蛋白激酶8、半胱氨酸蛋白酶3等靶点调控TNF、p53等炎症信号通路,发挥抗炎抑菌等治疗作用。     

基于网络药理学及实验验证探讨止嗽散治疗慢性支气管炎的作用机制北大核心CSCD

目的:本研究旨在通过网络药理学结合动物实验探讨止嗽散治疗慢性支气管炎的作用机制。方法:利用网络药理学工具,获得止嗽散治疗慢性支气管炎的有效成分、核心靶点和信号通路。建立慢性支气管炎大鼠模型,进行病理染色、ELISA、免疫组织化学、免疫荧光及Western blot试验验证网络药理学预测的主要靶点和信号通路。结果:网络药理学筛选出止嗽散关键有效成分包括槲皮素、山柰酚、木犀草素、β-谷甾醇、7-甲氧基-2-甲基异黄酮、川陈皮素、芒柄花素;核心靶点涉及TP53、TNF、IL-6、VEGFA、CASP3、IL-1β、JUN、PTGS2;KEGG通路富集分析PI3K-AKT信号通路、HIF-1信号通路等可能在止嗽散治疗慢性支气管炎中起关键作用;分子对接验证各核心靶点与其对应化合物之间均有较强的结合力。动物实验表明,与正常对照组比较,模型对照组大鼠血清、支气管肺泡灌洗液以及肺组织中IL-4、IL-6、TNF-α含量明显升高,肺组织PI3K、p-PI3K、AKT、p-AKT、HIF-1α、VEGFA蛋白表达明显上调(P<0.05或P<0.01);与模型对照组比较,止嗽散9.72 g/kg组、氢溴酸右美沙芬片8.1×10^(-3)g/kg组能明显改善肺组织病理变化,显著降低血清、支气管肺泡灌洗液以及肺组织中IL-4、IL-6、TNF-α含量,明显下调肺组织PI3K、p-PI3K、AKT、p-AKT、HIF-1α、VEGFA蛋白表达(P<0.05或P<0.01)。结论:止嗽散对慢性支气管炎模型大鼠具有较好的治疗作用,这可能与止嗽散中以槲皮素为代表的活性成分通过调控PI3K-AKT、HIF-1信号通路相关蛋白的表达抑制炎症反应有关。     

基于网络药理学的四君子汤治疗慢性萎缩性胃炎作用机制研究

目的:探讨四君子汤治疗慢性萎缩性胃炎的有效活性成分及作用机制。方法:本研究通过TCMSP数据库选取四君子汤中党参、茯苓、白术、甘草含有的491个化合物,筛选其活性成分及潜在靶点;同时,通过GeneCards数据库挖掘慢性萎缩性胃炎疾病靶点;结合化合物及疾病靶点,构建化合物-靶点网络、进行GO富集分析及KEGG通路富集分析。结果:四君子汤中含有123个活性成分,对应慢性萎缩性胃炎78个靶点;GO生物过程相关条目36个;KEGG通路14条,涉及肿瘤信号通路(pathways in cancer)、TNF信号通路、P53信号通路等。结论:四君子汤主要通过调控细胞炎症、增殖、凋亡、代谢来治疗漫性萎缩性胃炎,这为阐明四君子汤治疗慢性萎缩性胃炎的作用机制、开展实验验证提供依据。     

基于网络药理学探讨“黄芪-桂枝”治疗慢性心力衰竭的作用机制

目的：运用网络药理学技术探讨“黄芪-桂枝”治疗慢性心力衰竭（CHF）的作用机制。方法：通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）筛选出“黄芪-桂枝”中潜在活性化合物及其潜在作用靶点,采用Gene Cards、OMIM数据库获得相关疾病靶点,通过String数据库构建关键靶点蛋白相互作用网络,使用Metascape在线工具对共同靶点基因进行GO功能和KEGG通路富集分析。并将相关数据导入Cytoscape 3.6.1软件进行可视化分析,构建“活性成分-CHF-靶点”网络模型和“靶点-GO-KEGG”网络模型。结果：筛选出27个主要活性成分,共涉及207个中药有效成分和175个中药-疾病关键靶点。“黄芪-桂枝”主要通过调控丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1（AKT1）、丝裂原活化蛋白激酶-1（MAPK1）、白细胞介素-6（IL-6）、转录因子Ap-1（JUN）、肿瘤坏死因子（TNF）等蛋白,以及参与癌症途径、乙型肝炎信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)-蛋白激酶B(Akt)信号通路、癌症蛋白多糖通路、人类T淋巴细胞瘤病毒Ⅰ型(HTLV-I)感染通路等发挥治疗CHF的作用。结论：本研究揭示了“黄芪-桂枝”组分中的有效化合物以多靶点、多通路、多途径治疗CHF的作用机制,为临床研究提供了新思路。     

基于网络药理学探讨温胆汤治疗哮喘作用机制

目的 基于网络药理学探讨温胆汤治疗哮喘作用机制.方法 基于TCMSP数据库获取温胆汤中主要药物的化学成分及其对应靶点,基于OMIM、Gene Cards数据库获取哮喘相关靶点,利用Cytoscape3.6.1软件构建中药-靶点网络及应用STRING平台构建蛋白相互作用网络(PPI),应用R语言软件对关键靶点进行GO富集...     

基于网络药理学探讨白果治疗哮喘作用机制

目的 基于网络药理学探讨白果治疗哮喘作用机制.方法 基于TCMSP数据库获取白果化学成分及其对应靶点,基于OMIM、Gene Cards数据库获取哮喘相关靶点,利用Venny2.1绘制白果靶点与哮喘疾病靶点的韦恩图,利用Cytoscape3.6.1软件构建中药-靶点网络及应用STRING平台构建蛋白相互作用网络(PPI...     

基于网络药理学研究六君子汤治疗慢性阻塞性肺疾病的作用机制

目的 运用网络药理学技术建立“药效成分-疾病靶标-信号通路”之间的关系,研究六君子汤治疗慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)的作用靶点及信号通路,明确作用机制.方法 使用中药系统药理学成分分析平台(TCMSP),获得六君子汤的活性成分及作用靶点,并从G...     

基于网络药理学探讨火麻仁治疗便秘的作用机制

目的：基于网络药理学探讨火麻仁治疗便秘的作用机制。方法：采用中药系统药理学数据库和分析平台检索火麻仁的活性成分及相关靶点;利用DisGeNET数据库、在线人类孟德尔遗传数据库、Drugbank数据库筛选便秘相关靶点;利用Draw Venn Digram在线工具将火麻仁活性成分靶点与便秘疾病靶点进行映射,交集靶点即为火麻仁治疗便秘的潜在靶点;应用STRING平台构建潜在靶点蛋白相互作用网络图;利用DAVID数据库对关键靶点进行基因本体(gene ontology, GO)功能富集分析;使用R软件进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)通路富集分析;利用Cytoscape3.6.0软件构建“药物-活性成分-作用靶点”网络图。结果：共获得火麻仁有效成分6个,活性成分相关靶点199个;便秘靶点742个,潜在作用靶点32个;蛋白相互作用网络得到核心靶点蛋白有1型胶原(collagen type 1,Col1a1)、张力蛋白同源基因(phosphatase and tensin homology deleted on...     

基于网络药理学探讨温胆汤治疗高血压病的作用机制

目的 通过网络药理学方法探讨温胆汤治疗高血压的作用机制。方法 通过中药系统药理学分析平台（TCMSP数据库）、TCMID数据库、化学专业数据库、SwissTarget Prediction 数据库和Uniprot数据库获取并筛选温胆汤活性成分及靶点;通过Genecard、OMIM、Drugbank数据库收集高血压疾病的相关基因。将所得到的温胆汤的药物靶点与高血压相关靶点进行映射,取得交集基因后通过Cytoscape 3.6.0 软件构建“成分-靶点”网络,String 数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络。通过BiocManager软件包对温胆汤治疗高血压的交集靶点进行基因本体论（GO）分类富集分析及京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。结果 获得药物-疾病交集基因94个。通过拓扑分析和MCC算法筛选出槲皮素、柚皮素、川皮苷等关键活性成分10个,STAT3、JUN、IL6等关键基因10个。通过GO分类富集分析确定了1837个条目,其中涉及生物过程的有1686条,涉及细胞组成的有61条,涉及分子功能的有90条。通过KEGG 通路富集分析,找到了126条信号通路。结论 温胆汤中的关键成分可能为黄酮类化合物,作用于STAT3、JUN、IL6等靶点,可能通过调控AGE-RAGE、流体剪应力与动脉粥样硬化、TNF等信号通路从而发挥降压作用 。     

基于网络药理学探讨生脉散治疗动脉粥样硬化的作用机制

目的通过网络药理学探讨生脉散治疗动脉粥样硬化的作用机制。方法在中药数据库TCMSP和BATMANTCM筛选生脉散的成分和靶点,并通过OMIM、TTD、CTD、DisGenet数据库检索动脉粥样硬化疾病相关靶点。采用韦恩图得到生脉散和动脉粥样硬化的共同靶点,Cytoscape软件建立生脉散成分-疾病-靶点互作网络,在STRING数据库中进行蛋白相互作用分析,在David数据库里面进行GO和KEGG富集分析。结果筛选出生脉散45个有效成分和418个预测靶点,动脉粥样硬化靶点254个,韦恩图得到生脉散和动脉粥样硬化共同靶点46个,涉及脂质代谢、胰岛素分泌调节、炎症反应等生物学过程,以及过氧化物酶体增殖物激活受体信号通路、胰岛素抵抗、肿瘤坏死因子信号通路等22条信号通路。结论生脉散可能通过改善胰岛素抵抗,调节脂质代谢、抗氧化应激,抑制炎症反应等机制治疗动脉粥样硬化。     

慢性肾功能衰竭的治疗探讨

慢性肾衰竭属中医“关格”、“癃闭”、“虚劳”等病的范畴 ,是多种肾脏疾病的末期阶段。其病机错综复杂。总的来说具有正虚邪实、病位广泛、变证丛生的特点。正虚是指脾肾衰败 ,脏腑功能失调 ,阴阳气血虚损 ;邪实系风热毒邪、湿热、瘀血、溺毒。正虚为本 ,邪实为标。因虚易招致外邪侵袭 ,脏腑功能失调可产生水湿、瘀血等病理产物 ,即所谓“因虚致实”。“血不利则病水” ,水湿、瘀血皆属有形之邪 ,二者可互相影响而呈血水同病。水湿潴留日久可从热化 ,湿热合邪 ,缠绵难愈 ,三焦均可受累 ,湿热客于下焦 ,膀胱气化不利 ,则可酿生溺毒 ,溺毒入…     

基于网络药理学探讨酸枣仁汤的作用机制

目的:采用网络药理学方法探讨酸枣仁汤的作用机制.方法:借助TCMSP平台预测酸枣仁汤中药成分的作用靶点与通路,利用Cytoscape软件分别构建成分-靶点网络、PPI网络,使用DIVID数据库进行GO富集分析和KEGG信号通路富集分析.结果:经筛选获得酸枣仁汤中五味中药酸枣仁、川芎、知母、茯苓、甘草含有的135种活性成分,332个相应靶点;PPI网络包括293个节点;GO条目146个,其中生物过程为94个,分子功能条目34个,细胞组成条目18个;KEGG通路22条.结论:酸枣仁汤不仅可以用于治疗失眠、焦虑等精神系统疾病,还可以用于治疗肿瘤、循环系统等疾病,同时参与5-羟色胺、氮素代谢等生物过程,揭示了酸枣仁汤多成分、多靶点、多通路的药理作用特点.