基于网络药理学和实验验证探讨益气和血方治疗肝硬化的作用机制

目的：基于网络药理学和实验验证探讨益气和血方治疗肝硬化的作用机制。方法：首先从TCMSP及BATMAN-TCM数据库搜索益气和血方各中药的有效成分及其作用靶点,应用GeneCard、PharmGkb、OMIM、DrugBank、TTD数据库获得疾病靶基因。将药物潜在作用靶基因与疾病靶基因取交集,并绘制韦恩图,应用Cytoscape软件构建“活性成分-核心靶点”网络,利用R软件对交集基因进行KEGG通路分析。动物实验观察益气和血方对CCl4诱导的肝硬化模型大鼠组织病理学的影响,测定肝组织JAK2、STAT3 mRNA表达水平,对益气和血方治疗肝硬化的作用机制进行初步探讨。结果：通过数据库共筛选得到益气和血方治疗肝硬化的活性成分43个及靶点648个,KEGG通路分析显示益气和血方主要影响PI3K/Akt、MAPK、IL-17、JAK/STAT等信号通路。动物实验研究表明与模型组相比,益气和血方治疗组大鼠肝组织炎症与纤维化程度明显改善;益气和血方治疗组JAK2、STAT3 mRNA的表达明显下调,差异具有统计学意义（P<0.05）。结论：益气和血方能够通过多成分、多靶点、多条通路达到治...     

基于网络药理学和分子对接技术探讨益气活血方治疗糖尿病肾病的作用机制

探讨运用网络药理学与分子对接技术,分析自拟益气活血方治疗糖尿病肾病（DN）的有效成分、潜在靶点和作用机制。方法 通过多个公共数据库获得益气活血方中活性成分的潜在靶点及DN的疾病靶点,并获得交集靶点,对交集靶点进行GO和KEGG分析,蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）分析与网络构建;利用Autodock vina软件对重要成分及关键靶点进行分子对接。结果 网络药理学分析获得有效活性成分78个、成分靶点223个、疾病靶点1002个、交集靶点81个、关键靶点15个。富集的 KEGG 通路有胰岛素抵抗、 PI3K-Akt 信号通路等。分子对接结果显示山柰酚、木樨草酸等成分对大部分靶点具有亲和力。结论 益气活血方可能通过调节炎症与细胞自噬、促进ECM蛋白的降解、调节外周组织对胰岛素的敏感性及胰腺β细胞的增殖和凋亡等作用机制达到治疗DN的作用     

基于网络药理学和分子对接探讨膈下逐瘀汤治疗胃癌作用机制

目的 基于网络药理学和分子对接探讨膈下逐瘀汤治疗胃癌的作用机制。方法 利用TCMSP、化学专业数据库筛选膈下逐瘀汤所有药物的有效活性成分及相关靶点,采用GeneCards、OMIM数据库筛选胃癌的作用靶点,将其与药物的有效活性成分及相关靶点取交集,筛选疾病-药物的共同靶点。将筛选出的共同靶点在STRING数据库中构建蛋白相互作用网络,利用Cytoscape3.9.1软件绘制药物活性成分-靶点网络,运用R4.2.1软件对潜在作用靶点进行GO和KEGG富集分析,运用AutoDockTools-1.5.7软件将膈下逐瘀汤治疗胃癌的关键活性成分与核心靶点进行分子对接。结果 获得药物活性成分173个(槲皮素、山柰酚、木犀草素、β-谷甾醇、黄芩素、柚皮素、柱头甾醇、异鼠李素等),胃癌作用靶点1 463个,药物-疾病共同靶点139个(TP53、AKT1、ESR1、VEGFA、MYC、CTNNB1、TNF等)。根据GO、KEGG富集分析显示这些靶点主要富集在细胞凋亡、PI3K-Akt、TNF、IL-17、AGE-RAGE等信号通路上。分子对接结果显示膈下逐瘀汤的关键活性成分均能与胃癌的核心靶点产生稳定...     

基于网络药理学和分子对接探讨解毒通利方治疗肝纤维化的作用机制

目的 采用网络药理学和分子对接的方法探讨解毒通利方治疗肝纤维化(HF)的可能作用机制。方法 借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、本草组鉴(HERB)获得解毒通利方所有有效活性成分,通过TCMSP数据库将这些有效活性成分进行成分靶点预测,并与GeneCards数据库、PharmGkb数据库、TTD数据库、OMIM数据库和DrugBank数据库中HF疾病基因相关靶点使用R语言软件取交集,从而获得解毒通利方治疗HF的靶点;通过STRING绘制交集靶点的蛋白互作(PPI)网络,筛选核心蛋白;利用Cytoscape 3.8.0软件构建“中药—关键化合物—核心靶点”网络;运用R语言软件进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,预测核心靶点的作用机制。最后,应用分子对接技术,将关键有效活性成分和PPI中核心蛋白进行分子对接。结果 共筛选解毒通利方药物活性化合物172种,作用靶点4 068个,构建PPI网络,运用“CytoNCA”插件筛选出IL6、AKT1、STAT1、RELA、MYC、FOS、STAT3、MAPK1、CCND1等19个核心蛋白...     

基于网络药理学和分子对接探讨培元补肾安胎方治疗复发性流产的作用机制

目的:培元补肾安胎方临床治疗复发性流产取得了良好的疗效,但由于其成分复杂,其治疗复发性流产的机制尚未阐明.本项研究应用网络药理学研究培元补肾安胎方治疗复发性流产的有效化合物、作用靶点、信号通路等,从而揭示其治疗复发性流产的作用机制.方法:应用TCMSP、TCM获取培元补肾安胎方的主要化合物和药物作用靶点,并检索Gene...     

基于网络药理学和分子对接技术探讨冠心Ⅲ号方治疗冠心病潜在分子机制

目的 基于网络药理学和分子对接技术探讨冠心Ⅲ号方治疗冠心病潜在分子机制.方法 通过查询TCMSP数据库获取冠心Ⅲ号方的活性成分及作用靶点,通过TTD数据库、OMIM数据库、GeneCards数据库、DrugBank数据库、PharmGkb数据库获取治疗冠心病的作用靶点,使用Venn Diagram取药物和疾病共有交集靶...     

基于网络药理学和分子对接研究颐脑解郁方治疗抑郁症的作用机制

目的：采用网络药理学和分子对接的方法探讨颐脑解郁方治疗抑郁症的作用机制。方法：通过检索TCMSP、Symmap数据库获取颐脑解郁方的活性成分,利用 TCMSP、Uniport和Symmap预测活性成分的靶点,并通过GeneCards、OMIM、pharmgkb、TTD、DrugBank数据库检索抑郁症疾病靶点,将其疾病靶点取交集,进而将颐脑解郁方的活性成分靶点与抑郁症的疾病靶点取交集,利用Cytoscape构建药物成分-靶点网络,并使用STRING数据库构建蛋白相互作用网络(PPI),进行核心基因的GO和KEGG富集分析,并使用Pymol、AutoDock Tools软件制作分子对接。结果：共获取颐脑解郁方组方中6味植物药的活性成分72个,对应1363个目标靶点;通过CytoNCA筛选出9个关键靶点;GO富集分析得到生物学过程2624条、分子功能243条以及细胞组分116条,主要与炎症反应、以及氧化应激过程相关;KEGG富集分析得出194条显著富集的通路,主要为 IL-17 信号通路、肿瘤坏死因子信号通路等,其功能主要涉及免疫系统调控、信号传导、内分泌系统、细胞生长与凋亡等。结论：颐脑解郁方可通过多个化合物作用于多个分子靶点发挥其对抑郁症的治疗作用,其分子机制主要涉及抑制炎症反应,减弱氧化应激等方面。     

基于网络药理学和分子对接探讨宣肺润燥解毒方治疗新冠肺炎的作用机制

目的 运用网络药理学和分子对接技术,探究宣肺润燥解毒方治疗新冠肺炎的分子机制。方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、TCMID数据库筛选宣肺润燥解毒方活性成分,利用有关数据库筛选新冠肺炎相关靶点。以Cytoscape软件构建“药物-化合物-靶点”网络,并用分子对接验证有效成分与靶点亲和力。结果 筛选出宣肺润燥解毒方有效成分3019个,潜在靶点525个。分子对接结果显示活性成分槲皮素、木犀草素、汉黄芩素与关键靶点ATK1、TNF、TP53具有良好亲和力。结论 本研究初步明确宣肺润燥解毒方通过多成分-多靶点-多通路治疗新冠肺炎的作用机制,为深入研究宣肺润燥解毒方治疗新冠肺炎的作用机制提供了前期参考。     

基于网络药理学探讨益肾种子方治疗弱精子症的作用机制

目的 采用网络药理学的方法,探讨益肾种子方治弱精子症物质基础及作用机制.方法 应用中药系统药理学分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)筛选益肾种子方中的活性成分和作用靶点,并...     

基于网络药理学探讨清肠化湿方治疗溃疡性结肠炎的作用机制

目的:运用网络药理学方法探讨清肠化湿方治疗溃疡性结肠炎(ulcerative colitis,UC)的作用靶点与信号通路,从而解释其治疗湿热型UC的分子作用机制.方法:应用中药系统药理学技术平台(TCMSP)筛选清肠化湿方的潜在活性成分(OB≥30％,DL≥0.18)及作用靶点.利用Cytoscape软件,通过TCMS...     

基于网络药理学和分子对接技术研究八珍益智方治疗阿尔茨海默病的潜在作用机制

目的 利用网络药理学方法及分子对接技术,研究八珍益智方治疗阿尔茨海默病（Alzheimer's disease,AD）的潜在药效物质基础和作用机制,为其临床应用提供理论依据。方法 通过TCMSP、BATMAN-TCM、TCMID、中国知网（CNKI）和Pubmed数据库检索八珍益智方8味组方药材化学成分和作用靶点;通过GeneCards、OMIM数据库查询AD的相关靶点;利用R语言3.6.3得到药物和疾病的交集靶点;借助String数据库和Cytoscape 3.7.2软件构建PPI网络,筛选核心靶点;通过DAVID数据库进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析;利用AutoDock tools 1.5.6、AutoDock vina 1.1.2进行分子对接。结果 八珍益智方共收集到200个化学成分和226个靶点,Cytoscape 3.7.2软件筛选出包括AKT1、MAPK3、IL-6、VEGFA、CASP3等37个核心靶点,槲皮素、山柰酚、柚皮苷、豆甾醇、7-甲氧基-2-甲基异黄酮等15个核心化合物。GO富集分析得到1 331个条目（P<0.05）,KEGG通路富集得到相关通路65条（P<0.05）。分子对接结果显示15个核心化合物和AKT1、MAPK3、IL-6、VEGFA、CASP3具有较好的亲和力。结论 八珍益智方治疗AD的通路主要涉及癌症的途径、MAPK信号通路、前列腺癌、神经活性配体-受体相互作用、钙信号通路等,研究结果为八珍益智方治疗AD作用机制的进一步阐明提供了指引。      

基于网络药理学及分子对接探讨痛泻要方治疗结直肠癌的作用机制

目的:预测痛泻要方治疗结直肠癌(colorectal cancer,CRC)的作用机制.方法:通过TCMSP数据库筛选痛泻要方的活性化合物和靶点,MalaCards数据库以Colorectal cancer为关键词检索提取CRC作用靶点,二者经映射去重后合并交集靶点.在DAVID 6.8数据库中对交集靶点进行GO功...     

基于网络药理学的健脾消积方治疗肝癌的作用机制研究

目的:运用网络药理学的方法探讨健脾消积方治疗肝癌的作用机制.方法:利用TCMSP数据库搜集健脾消积方的成分和靶点,OncoDB.HCC数据库和Livercome数据库收集肝癌的靶点,将共有靶点导入String数据库做蛋白质相互作用(PPI)网络分析,采用Cytoscape制作"化合物—靶点"网络图和"成分—关键靶点—通...     

行为疗法在改善女性下尿路症状患者的应用

目的：研究行为疗法在改善女性患者下尿路症状的治疗效果。方法采用病例随机对照研究试验,选取以下尿路症状（以储尿期症状为主）就诊的女性患者60例,随机分为对照组和观察组,每组30例,对照组常规口服药物和常规护理,观察组在对照组的基础上实施行为疗法,于干预前及干预后1个月及3个月评价患者主诉及24 h排尿日记,对下尿路症状发生率、日间排尿间隔时间、24 h平均排尿次数、单次排尿量及夜尿次数进行比较。结果观察组干预后1个月及3个月患者的下尿路症状发生率均低于对照组,而两组服药控制症状后1～3个月,24 h排尿次数、单次排尿量、夜尿次数各个方面评分观察组均优于对照组,差异均有统计学意义（均P＜0.05）。结论应用行为疗法改善女性患者下尿路症状有良好效果。     

痛风汤作用机制的网络药理学和分子对接探讨

目的 基于网络药理学和分子对接方法,探究痛风汤治疗痛风的可能作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中国中药整合数据库(TCMID)、Similarity Ensemble Approach数据库(SEA),检索并收集痛风汤的活性成分及其对应的靶点.通过人类基因组注释数据库(Genecards...     

基于网络药理学和实验探讨丹玄口康治疗口腔黏膜下纤维化作用机制

目的 探讨丹玄口康治疗口腔黏膜下纤维化（oral submucosal fibrosis, OSF）的作用网络和药效机制。方法 基于网络药理学的方法,结合TCMSP、UniProt、GeneCards等数据库联合分析丹玄口康的有效成分和OSF的作用靶点;通过Cytoscape构建有效成分与靶基因的网络,对靶基因进行GO富集分析和信号通路分析;依据网络药理学结果,设置每组10只共5组SD大鼠进行实验论证,包括正常对照组、模型组、丹玄口康低剂量组、丹玄口康中剂量组、丹玄口康高剂量组。除正常对照组外,其余组以槟榔碱对口腔黏膜机械刺激和注射造模。模型组和正常对照组予以生理盐水灌胃,丹玄口康低、中、高剂量组分别以4、8、12 mL/kg浓度的中药灌胃,每天灌胃1次,连续8周。HE观察大鼠口腔黏膜的病理变化,q-PCR检测HIF-1α的含量。结果 丹玄口康的主要活性成分93个,包括丹参酮、芍药苷、黄芩素等;治疗OSF的关键靶基因有48个,包括EGFR、JUN、HIF-1α等,通过参与氧化应激进程和HIF-1信号通路等,发挥治疗OSF的作用。动物实验结果显示：丹玄口康能改善OSF大鼠口腔黏膜上皮萎缩...     

基于网络药理学和分子实验探讨蝙蝠葛碱对鼻咽癌的作用机制

目的:通过网络药理学分析蝙蝠葛碱对鼻咽癌(NPC)的作用靶点及通路,并探讨其作用机制.方法:运用Pubchem、Pharmmapper、GeneCards数据库检索蝙蝠葛碱和NPC的作用靶点后并取得它们的交集靶点;使用Cytoscape软件构建"蝙蝠葛碱—NPC疾病靶点"网络图,并利用David数据库进行GO功能注释及...     

雄激素全阻断对前列腺癌患者下尿路症状的改善作用

目的:探寻雄激素全阻断(maximal androgen blockade,MAB)治疗前列腺癌(prostate cancer,PCa)患者下尿路症状(lower urinary tract symptoms,LUTS)达到最大改善的时间,为其治疗方案的确定提供指导.方法:对并发下尿路症状的45例PCa患者进行雄激素...     

基于网络药理学和分子对接探讨石菖蒲治疗阿尔茨海默病作用机制研究

目的 利用网络药理学联合分子对接探讨石菖蒲治疗阿尔茨海默病(alzheimer's disease,AD)的关键分子机制,以期为AD的治疗提供新的作用药物.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库分析石菖蒲的相关化学成分及作用靶点,检索GeneCards、Pharm Mapper、治疗靶标数据库(T...     

基于网络药理学研究黑豆方主要药物治疗湿疹的作用机制

目的 基于网络药理学方法研究黑豆方主要药物治疗湿疹的作用机制.方法 通过相关网络数据库(中药系统药理学数据库与分析平台、药物靶标数据库、GeneCards、在线人类孟德尔遗传综合数据库)获得药物成分及对应靶点、疾病相关基因,通过软件构建网络关系并进行相关的生物信息学分析,探究黑豆方主要药物(黑豆、马齿苋、地骨皮、黄柏、...