基于文献的生物医学知识发现研究综述

介绍基于文献的知识发现(Literature Based Discovery,LBD)概念及实现方法,从数据获取、概念抽取、关系挖掘、结果评估4个方面阐述LBD相关研究情况及关键问题,分析LBD在生物医学领域的应用情况及LBD研究存在的问题,提出建议和展望。     

基于MEDLINE的非相关文献知识发现

介绍了非相关文献知识发现法的概念及应用情况,以及人机交互系统ARROWSMITH的作用和操作过程;以图示的方式详尽地描述了在MEDLINE数据库中应用ARROWSMITH系统进行非相关文献的知识发现.认为非相关文献知识发现方法为情报研究和情报检索开辟了更广阔的研究领域,为情报学指明了新的研究方向,赋予情报学更加强大的生命力.     

基于非相关文献的知识发现研究进展

对基于非相关文献的知识发现方法研究进展进行总结,探讨Arrowsmith的演进及排序控制指标,并从词频统计、语义控制、词频统计与语义控制相结合、互信息方法、共词聚类法、主题聚类法等角度对该研究领域的代表性研究成果进行概述,指出Swanson方法存在的不足及其在未来科学发展中具有广阔的前景。     

中医文本信息抽取系统

近年来,文本信息抽取成为中医文献知识挖掘的一种新兴手段。构建了基于本体的中医文本信息抽取系统,它能从中医文献中提取领域概念及语义关系,并支持用户完成文本语义关系的检阅、分析和标注等工作。该系统能辅助中医专家从中医文献中挖掘知识,并进一步完善中医领域本体系统。     

面向中医文献的诊疗知识自动抽取及应用研究

目的：为实现自动化提取中医文献中蕴含的丰富的中医诊疗知识,利用信息抽取技术实现诊疗知识的自动获取并对其进行应用。方法：首先构建中医诊疗基础知识库,然后基于该知识库标注文献样本集,并用样本集进行模型训练,再利用模型抽取诊疗知识并挖掘其诊疗规律,最后以乳腺癌为例进行实证研究。结果：选用UIE信息抽取模型进行抽取,其F1值为0.896 9,对抽取得到的诊疗知识进行数据挖掘,发现用药以行气活血、疏肝健脾为基本治则,药物以补虚药、清热药为主。结论：本方法可高效地完成从中医文献中自动抽取诊疗知识,对中医临床研究有实用价值。     

面向知识发现的生物医学文献信息检索与可视化设计

探讨生物医学文献信息检索过程与可视化设计对用户知识发现的影响与作用,从输入输出、搜索过程、信息定位几方面介绍文献信息检索过程交互流模型,分析文献信息可视化设计的方法,包括颜色与字体、统计图表、分类列表与标签、层次结构与网络图等方面。     

文本挖掘在中医药文献分析中的应用

文本挖掘能从海量的中医药文献中发现知识以促进中医临床研究和中药研发。本文总结现有研究指出文本分类和信息抽取是中医药文献知识发现的关键技术,指出中医药文本分类、非关联知识发现和中医药文献信息抽取为三个主要研究方向,并论述了三个研究领域中需解决的关键问题和研究方向,最后展望文本挖掘在中医药学科的应用前景,指出非关联文献知识将成为中西医结合研究的热点。     

联系强弱对生物医学文献知识发现的影响

分析间接关联的联系强弱在生物医学文献知识发现过程中的不同表现,明确关联性强弱对文献知识发现的影响与作用,表明通过强关联发现潜在关联的准确率显著高于由弱关联所获得的准确率,强关联性可作为提升文献知识发现应用效果的重要因素。     

非相关文献知识发现研究进展

美国芝加哥大学情报学教授Don.R.Swanson创立的情报学知识发现方法及人机交互系统Arrowsmith,是揭示非相关文献及学科间隐藏联系的强有力的工具。文章介绍了Swanson的情报学思想的内涵及其开放式和闭合式的知识发现过程,概述了目前我国在理论和实践两方面的研究状况,指出Swanson方法在医学领域尤其是中医药领域实践中所面临的问题。在未来的科学发展中,Swanson知识发现方法将具有广阔的推广前景。     

文章发表时间对生物医学文献知识发现的影响

通过分析时间因素在间接关联挖掘中的作用,探讨文章发表时间对生物医学文献知识发现的影响。利用来自PubMed的数据集进行测试分析,发现在知识发现过程中近期文献比早期文献获得新关联的效果好,表明时间因素对生物医学文献知识发现具有一定作用,即在间接关联的挖掘过程中考虑时间因素,可以提升生物医学文献知识发现工作的效率。     

学科背景知识在医学文本特征抽取中的应用

分析目前科技文献文本特征抽取方法研究现状,将基于背景知识的TF-IDF方法应用到医学文本特征抽取中,在4个医学领域中进行试验对比,结果表明该方法在抽取词汇数量较少时可以显著提高抽取效果,在对文本集合中通用词的过滤及重要特征词的识别方面明显优于使用通用IDF的TF-IDF方法。     

基于非相关文献的3阶知识发现——闭合式方法探讨

探讨基于非相关文献的3阶知识发现闭合式方法的基本原理,设计基于关联关系共现的闭合式方法。通过实例验证开放式发现方法所挖掘出的潜在关联链条,说明基于非相关文献的3阶知识发现闭合式方法可以实际问题为导向,为研究活动提供服务。     

中医药文献检索和知识发现系统

国际标准化组织（ISO）于近期编制完成了一部专门面向中医药领域的文献—元数据技术规范草案,它将在中医药文献资源的保护和利用中发挥基础性作用。为促进该规范的推广应用,开发了一套中医药文献检索与知识发现系统,它基于万维网实现了文献管理、文献检索及知识发现等功能,用于演示该规范及相关的信息资源在中医药文献处理方面的应用方法和应用效果。     

基于Swanson非相关文献知识发现的超常规检索法在查新中的应用

针对查新中常规主题概念检索结果与实际不相符的情况,通过检索实例,介绍了一种基于Swanson非相关文献知识发现的超常规检索法在查新咨询中的应用.     

基于规则库的电子病历信息抽取研究

电子病历包含病人丰富的诊疗信息,价值相当高。如何快速抽取出电子病历中用户感兴趣的数据,为临床决策、科研提供数据支持是当前电子病历数据利用的重要课题。介绍一种电子病历信息抽取工具,定义规则并建立规则库,构建疾病实体关系,实现电子病历信息抽取。     

电子病历信息抽取可视化分析

以国内外电子病历信息抽取相关文献为研究样本,基于CiteSpace构建关键词共现图谱、时间线聚类图以及共被引网络图,可视化揭示电子病历信息抽取发展趋势、研究热点及重点领域,为相关研究提供参考.     

基于开放评测的临床信息抽取分析

介绍国内外典型临床信息处理开放评测案例,分析评测语料、评测任务以及信息抽取方法,探讨面向临床需求的信息抽取发展方向,为基于中文临床文本的进一步分析与挖掘提供参考借鉴。     

数据库中知识发现在中医药信息咨询中的应用探索

从本校图书馆参考咨询工作现状、本校读者数据库资源的应用情况出发,分析新形式下的参考咨询服务模式,丰富的数据库资源不能充分利用的原因;根据中医药文献数字化现状,提出数据库中知识发现在中医药信息咨询中的应用设想;以用户需求的具体实例,探讨如何利用数据挖掘技术建立用户需求模型和信息咨询模型,探索数据库中知识发现在中医药信息咨询中的应用.     

运用非相关文献知识发现方法挖掘疾病的潜在相关基因

基于非相关文献的知识发现有开放式挖掘和闭合式验证两个过程.先应用开放式的非相关文献知识发现方法寻找与先天性全身多毛症(CGH)相关的潜在候选基因,再应用闭合式方法进行验证和初筛,最后使用Gene、OMIM及PubMed数据库对初筛后保留的基因进一步分析研究,发现CGH可能与位于常染色体17q的潜在MAP2K6基因相关.实践证明,应用非相关文献知识发现方法可用于挖掘疾病的潜在基因.     

基于本体的军事活动事件知识建模研究

目的：适应军事领域知识信息化建设的需求,构建军事活动事件、军事人员、武器装备、战法等知识模型。方法：利用本体建模工具Protégé构建军事活动事件本体模型,梳理概念、属性及其关系,并给出该模型构建案例及其有效性验证。结果：提出了一种具有一般性的军事事件本体模型结构,建立了事件与事件要素之间的语义联系,并复用已建立的领域本体应用于事件本体的构建,形成统一的事件知识表示单元。结论：通过本体建模结构化表示军事活动信息,可完善及扩展军事本体模型。