我国部分省份（地区）汉族人群HLA-I类基因多态性地区差异分析

目的探讨我国部分省份（地区）汉族人群HLA-I类经典基因座位HLA-A、HLA-B、HLA-Cw位点的群体遗传学特点及其基因频率分布的地区差异。方法选取1014例无关汉族拟行造血干细胞移植治疗患者及其健康家系供者的血液样本,提取基因组DNA后,采用序列特异性引物聚合酶链式反应（PCR-SSP）分型技术进行HLA-A、HLA-B、HLA-Cw位点基因分型,分析不同地区汉族人群及不同种族间的基因频率分布特征。基于文献报道的我国不同地区汉族人群及不同种族的HLA-I类基因频率资料,计算种群间遗传距离（D）,比较不同地区汉族人群及不同种族间遗传距离差异。结果Hard-Weinberg吻合度检验表明,本研究抽样群体适于进行遗传学统计分析。HLA-A位点共检测出14种基因型,最常见的是A^＊02（0.330）、A^＊11（0.240）、A^＊24（0.155）、A^＊33（0.075）;HLA-B位点共检测出27种基因型,最常见的是B^＊13（0.134）、B^＊15（0.143）、B^＊40（0.133）、B^＊46（0.102）;HLA-Cw位点共检测出13种基因型,最常见的是Cw^＊01（0.157）、Cw^＊03（0.247）、Cw^＊07（0.181）、Cw^＊08（0.106）。群体汉族与其他人种间HLA-A、HLA-B基因频率差异均有统计学意义（P〈0.05）;除兰州汉族人群仅同南方汉族、湖南、山东、江苏、台湾汉族人群间HLA-A、HLA-B基因频率差异有统计学意义（P〈0.05）外,其余各地区汉族人群间HLA-A、HLA-B基因频率差异均有统计学意义（P〈0.05）。各地区汉族人群间平均遗传距离D=0.164,辽宁和北方汉族人群间遗传距离（D=0.064）最小,江苏与湖南汉族人群间遗传距离（D=0.299）最大;不同地区汉族人群间遗传距离普遍小于种族间遗传距离。结论我国不同地区汉族人群HLA-I类基因频率分布存在显著差异,但其差异要明显小于世界不同人种间的分布差异。我国汉族人群所特有的HLA-I类基因频率分布格局资料对区域性疾?     

贵州地区汉族人群GDF5基因单核苷酸多态性与成人终身高的关系

目的 探讨生长分化因子5(GDF5)基因rs143383、rs143384、rs6060369和rs224331位点单核苷酸多态性(SNPs)与贵州地区汉族人群成人终身高的相关性.方法 对贵州地区1 069例汉族健康体检者进行体格检查及问卷调查,收集抗凝血标本并提取DNA.用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)方法检测GDF5基因的SNPs,并分析其与身高的相关性.结果 成年女性中,GDF5基因rs143383、rs143384、rs6060369和rs224331基因型分布可分别解释身高变异的1.4％、0.9％、1.1％和1.0％(P＜0.05);在GDF5基因rs143383和rs143384位点,携带GG基因型的个体平均身高均为最高,分别比AG和AA基因型个体高1.7 cm (P＜0.01)、2.3 cm (P＜0.05)和1.6 cm (P＜0.05)、2.1 cm(P＜0.01);在GDF5基因rs6060369位点,携带CC基因型的个体平均身高分别比CT和TT基因型个体高1.7 cm (P＜0.05)和2.2 cm (P＜0.01).但是在成年男性中未发现GDF5基因上述SNPs位点与身高的相关性.结论 GDF5基因单核苷酸多态性与贵州地区成年汉族女性身高有关,GDF5基因可能是影响中国汉族成人女性身高个体差异的基因.     

辽宁汉族人群HLA-DRB1基因多态性分布

目的调查HLA-DRB1基因位点遗传多态性在辽宁汉族人群中的分布。方法应用聚合酶链反应．序列特异性引物方法和反向聚合酶链反应．序列特异性寡核苷酸探针杂交的方法对13265名辽宁汉族人进行中低分辨率HLA-DRB1基因分型。结果共检出HLA-DRB1位点的13种等位基因，其中以HLA-DRB1＊15频率最高（17．49％），其次为HLA-DRB1＊09、＊12和HLA-DRB1＊07，基因频率分别为13．40％、11．87％和11．8l％。HLA-DRB1＊03（18）和HLA-DRB1＊14（8）等位基因未检出。对观察值和期望值进行X^2检验，符合Hardy-Weinberg平衡（X^2=73．34，af=78，P〉0．5）。该人群与南北方汉族人群、日本人、白人和黑人分别进行X^2值检验差异有统计学意义，X^2值分别为112．053、8．514、692．141、70．558和121．755。结论辽宁汉族人群HLA-DRB1基因分布有自身特点。     

β2—肾上腺素能受体基因单核苷酸多态性及在汉族人群中的分布

目的 研究中国人β2－肾上腺素能受体（beta2-adrenoceptor,β2－AR）基因单核苷酸多态性（single nucleotide Polymorphism.SNP),并观察这些SNPs在汉族人群中的多态性分布。方法 应用荧光标记自动测序法测定来自安徽大别山地区80名非亲缘关系人群β2－AR基因序列,确定单核酸多态位点及基因型。结果 在3．8kb长度范围内共发现8个SNPs,其中5个位于编码区,平均274bp出现一个SNP,3个位于调控区,平均721bp出现一个SNP,与国外报告相比－468－G,－367T－C,4．－47C－T,－20T－C,＋79C→G,＋100G→A, 491C→T, 1098T→C未在研究人群中检测到,各SNPs等位基因频率在人群中的分布符合Hardy-Weinberg平衡,结论 β2－AR基因SNPs呈不均匀分布,且具有很大的种族差异,其等位基因频率在人群中分布符合Hardy=-Weinberg 平衡。     

我国河南汉族正常人群凝血因子VII基因MspⅠ多态性观察

目的 研究我国汉族正常人群凝血因子Vll基因MspI多态性的分布特点.方法 利用聚合酶链反应-限制性内切酶片段长度多态性(PCR-RFLP)技术,分析560名河南汉族正常人群凝血因子VII(FVII)基因R353Q突变的分布情况.结果 我国河南汉族正常人群FVII基因R353Q的RR,RQ,QQ,基因型频率分别是0.864,0.132,0.004;R,Q等位基因频率分别是0.930,0.070;与国外其他种族相比,基因型及等位基因频率与日本人差异无统计学意义(χ2=2.475,P＞0.05χ2=0.000,P＞0.05);RQ及QQ基因型明显低于意大利人,差异具有统计学意义(χ2=38.536,P＜0.01;χ2=16.311,P＜0.01);Q等位基因明显低于意大利人,差异具有统计学意义(χ2=50.228,P＜0.01).结论 我国河南汉族正常人群FVII基因R353Q突变的基因型分布不同于国外其它种族,具有种族或地域的差异.     

TIM-4基因多态性与湖北地区汉族人群支气管哮喘易感性的研究

目的 探讨T细胞免疫球蛋白域及黏蛋白域蛋白-4(T cells immunoglobulindomain andmucindomain protein-4,TIM-4)基因外显子2区Lys65Lys(G/A)、外显子9区Val1365Met(G/A)的单核昔酸多态性(SNP)与湖北地区汉族人群支气管哮喘易感性的关系.方法 采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)的方法对湖北地区185例哮喘患者和162例健康者TIM-4基因外显子2区Lys65Lys(G/A)、外显子9区Vai365Met(G/A)的多态性进行分析,计算基因型和等位基因频率.结果 (1)湖北地区汉族人群健康者TIM-4基因外显子2区Lys65Lys(G/A)位G/G、G/A、A/A基因型频率分别为0.840、0.160、0,而哮喘人群其频率分别为0.859、0.141、0,其基因型和等位基因型频率与对照组相比差异均无统计学意义(P=0.603,P=0.618);(2)本试验未检测到TIM-4外显子9区Va1365Met(G/A)的多态性.结论 湖北地区汉族人群TIM-4基因外显子2区Lys65Lys(G/A)存在单核苷酸多态性变异,但该位点的变异与湖北地区汉族人群支气管哮喘易感性无关;TIM-4基因外显子9区Va1365Met(G/A)在湖北地区汉族人群中未发现单核苷酸多态性.     

中国汉族人群DC-SIGN和DC-SIGNR基因遗传多态性

目的了解中国汉族人群DC-SIGN和DC-SIGNR基因颈区重复序列的遗传多态性分布，获得相应位点的汉族人群的遗传学数据。方法应用PCR技术、琼脂糖凝胶电泳结合测序对DC-SIGN和DC-SIGNR基因的颈区重复序列分型，计算DC-SIGNR的多态信息含量。结果DC-SIGN多态性低，颈区绝大多数为等位基因7重复，该等位基因频率为0．9808，但亦检出少量的等位基因4、5、6、8等变异，而美国白人只含有等位基因6、8变异；DC-SIGNR存在高度多态性，多态信息含量为0．5312，存在4、5、6．7、8、9等位基因，检出16种基因型。6／5、7／4、7／5、7／6、7／7、9／5、9．／7、9／9基因型和5、6、7、9等位基因频率在中国汉族人群和美国白人中的分布构成差异有统计学意义（P〈0．01），与美国白人比较，中国汉族人群似乎存在更多的插入突变。结论中国汉人的DC-SIGN和DC-SIGNR基因型分布和基因频率与美国白人相比其差异有统计学意义，并有其独特的群体遗传学特征。     

鄂西北地区汉族人群CD40基因单核苷酸多态性分析

目的研究CD40-E1SNP和E4SNP单核苷酸多态性在鄂西北部地区汉族人群中的分布,并探讨CD40基因单核苷酸多态性与血浆可溶性CD40水平的关系。方法 318例汉族人,其中男性187例,女性131例;平均年龄31.2岁。应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)及测序的方法,CD40-E1SNP和E4SNP并计算其基因型频率及等位基因频率,酶联免疫吸附分析检测血浆可溶性CD40浓度,并与文献报道不同种族人群比较。结果鄂西北地区汉族人群CD40-E1SNP基因型频率:CC型29.2%,CT型54.1%,TT型16.7%,C、T等位基因频率分别为56.3%、43.7%,这种多态性分布在男女间差异无统计学意义(P>0.05),与英国、波兰比较,发现不同种族间CD40-E1SNP基因型分布及等位基因频率差异均存在统计学意义(P<0.01);CD40-E1SNP各基因表型之间可溶性CD40含量分别为:CC(57.3±6.6)pg/mL,CT(34.2±4.5)pg/mL,TT(28.8±4.2)pg/mL,差异存在统计学意义(P<0.01)。在实验中未检测到CD40-E4SNP单核苷酸多态性。结论鄂西北地区汉族人群中存在CD40-E1SNP单核苷酸多态性,其基因型在不同种族间存在较大的差异,并且可能影响CD40的表达,而不存在CD40-E4SNP单核苷酸多态性。     

广东汉族人群HLA-Cw基因多态性分析

检测HLA Cw在广东汉族人群中的基因频率 ,与其他人群进行比较 ,分析该人群HLA Cw等位基因多态性及其特点。骨髓移植供者 15 8例 ,抗凝血提取DNA ,半量全自动PCR RSSO分型检测Cw。结果显示 ,广东汉族人群HLA Cw基因频率分布由高至低依次为 :Cw 0 3(0 2 5 80 ) >Cw 0 7(0 1887) >Cw 0 1(0 1732 ) >Cw 0 8(0 10 70 ) >Cw 14 (0 0 6 5 4 ) >Cw 0 4(0 0 5 87) >Cw 15 (0 0 4 5 3) >Cw 12 (0 0 387) >Cw 0 6 (0 0 32 2 ) >Cw 0 5 (0 0 12 7) >Cw 16 (0 0 0 32 )。Hardy Weinberg平衡检验 χ2 =6 0 35 ,υ =5 4 ,P >0 1。表明广东汉族群体Cw 0 3、 0 7、 0 1、 0 8出现频率较高 ,该人群Cw等位基因处于遗传平衡状态 ,具有较为丰富的多态性及特点。     

β_2-肾上腺素能受体基因单核苷酸多态性及在汉族人群中的分布

目的　研究中国人β2 -肾上腺素能受体 (beta2 - adrenoceptor,β2 - AR)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP) ,并观察这些 SNPs在汉族人群中的多态性分布。方法　应用荧光标记自动测序法测定来自安徽大别山地区 80名非亲缘关系人群β2 - AR基因序列 ,确定单核苷酸多态位点及基因型。结果　在 3.8kb长度范围内共发现 8个 SNPs,其中 5个位于编码区 ,平均 2 74bp出现一个SNP;3个位于调控区 ,平均 72 1bp出现一个 SNP,与国外报道相比 ,- 46 8C→ G,- 36 7T→ C,- 47C→ T,- 2 0 T→ C, 79C→ G, 10 0 G→ A, 491C→ T, 10 98T→ C未在本研究人群中检测到。各 SNPs等位基因频率在人群中的分布符合 Hardy- Weinberg平衡。结论　β2 - AR基因 SNPs呈不均匀分布 ,且具有很大的种族差异 ;其等位基因频率在人群中分布符合 Hardy- Weinberg平衡     

上海人群中TAP、LMP和HLA-DM基因多态性研究

调查上海人群中抗原处理相关基因TAP、LMP和HLA-DM的分布情况,并探索这些基因与自身免疫病类风湿关节炎(RA)、IgA肾炎(IgAN)和多发性硬化症(MS)的可能关联。应用PCR-SSO或PCR-RFLP技术对80名无血缘关系的上海地区正常人及156名RA患者、60名IgAN患者和21名MS患者作了TAP1、TAP2、LMP2、HLA-DMA和HLA-DMB基因分型。并作了两位点连锁不平衡分析。在该群体中,(1)共观察到4个TAP1、6个TAP2、2个LMP2、4个HLA-DMA和4个HLA-DMB等位基因;(2)在TAP1B-TAP2A、TAP1B-LMP2H和TAP2D-DMA*0101存在连锁不平衡(Pc<0.05);(3)本人群中IgAN和MS的遗传易感性与抗原处理相关基因无关,而RA患者中DMB*0101基因频率降低(P<0.01),TAP1C和DMB*0104等位基因频率显著升高(P<0.01)。比较分析表明,上海人群中抗原处理相关基因多态性与国外其他人种中的报道相似,本人群中IgAN和MS与抗原处理相关基因不关联,而TAP1C和DMB*0104等位基因可能是RA的遗传易感基因。     

中国北方汉族HLA基因C位点遗传多态性研究

目的：研究北方汉族人群HLA(人类白细胞抗原)基因c位点的遗传特征。方法：采用序列特异性引物扩增(Polymerase Chain Reaction-Sequence-Specific Primers PCR-SSP)方法对205个样本进行HLA-C及-A、-B基因特异性分析。结果：检出C位点特异性14个，其中Cw*01、*07基因表现频率最高，分别为30．73％和27．80％；血清学方法检测不出的HLA-Cw*12、*14、*15表现频率分别为13．17％、4．88％、8．78％。统计显示显著性连锁不平衡的HLA-B-C单倍型24个，HLAs-A-C单倍型5个。结论：作为中国北方人HLA遗传多态性群体调查，提供了一套比较完整准确的基因频率和连锁不平衡参数，为人类学及疾病相关性等研究提供了较为完整的正常参考数据。     

中国汉族人群DNA修复基因XRCC1多态性

-RFLP)对汉族人群XRCC1基因多态性进行检测.     

Polymorphism of HLA class I genes in Meizhou Han population of Guangdong, China

Human leukocyte antigen (HLA) is an invaluable marker for anthropological studies because of its extreme polymorphism. Most of the studies carried out in Chinese populations are about HLA class II genes, but few about class I genes. In the present study, we investigated HLA class I polymorphism using polymerase chain reaction-sequencing-based typing (PCR-SBT) method in 104 unrelated Han individuals in Meizhou of Guangdong, southern China. Twenty-three HLA-A, 43 HLA-B and 27 HLA-C alleles were identified and allele frequencies and two-locus (C/B) and three-locus (A/C/B) haplotypes were statistically analysed. The most frequent HLA-A allele is A*110101 with a frequency of 30.3%, followed by A*24020101 (22.2%) and A*2420 (11.6%). Among the 43 detected HLA-B alleles, B*5801 (17.0%), B*400101 (15.5%) and B*4601 (10.0%) were frequently observed. Among the 27 detected C alleles, the most predominant one is Cw*07020101 (25.8%), followed by Cw*0717 (14.7%). The most frequent HLA-C/B two-locus haplotype is Cw*07020101/B*400101 (10.1%). The most common HLA-A/C/B three-locus haplotype in Meizhou Han is A*110101/Cw*07020101/B*400101 (3.4%). Phylogenetic tree based on HLA class I allele frequencies genetically suggested that Meizhou Han has an affinity to southern Asian populations. The result may also reflect an admixture of Han and ethnic minorities of southern China.     

Distribution of killer cell immunoglobulin-like receptor genes in the Chinese Han population

Killer cell immunoglobulin-like receptors (KIRs) on natural killer cells recognize groups of HLA class I alleles. Seventeen KIR genes have been identified at present, and two kinds of KIR haplotypes (group A and B) have been described based on their gene contents. Immunogenetic analysis of different ethnic populations shows significant differences in terms of the distribution of group A and B haplotypes. Here, genomic DNA from 104 healthy unrelated Chinese Han individuals was typed for the presence or absence of KIR genes. All 17 KIR genes were observed in the population, and framework genes 3DL3, 3DP1, 2DL4, and 3DL2 were present in all individuals. Twenty-six different genotypes were found, four of which could not be assigned to haplotypes according to the model of Hsu et al. (J Immunol 2002: 169: 5118). Group A haplotypes outnumbered group B haplotypes in frequency by approximately 3:1, with individuals having two group A haplotypes accounting for 58.7%. Analysis indicated that some pairs of KIR genes showed remarkable linkage disequilibrium. Our data demonstrated that the Chinese Han population is distinct in KIR gene frequencies and putative KIR haplotypes in comparison to some other populations.     

中国汉族城市成年人身体肥胖指数值的纬度性分布

目的 探讨中国城市成年人身体肥胖指数（BAI）值随纬度的变化规律。 方法 采用随机抽样方法,2009年～2013年测量城市汉族10 451例（男性5048例,女性5403例）（共31个调查地区）的身高、臀围值,计算身体肥胖指数值。 结果 31个男性族群BAI均值在23.64～27.49之间,可分为3个等级：第1等级为BAI≥26.00,第2等级BAI在25.00～25.99之间,第3等级BAI＜25.00;31个女性族群BAI均值在27.56～30.80之间,女性BAI也可分为3个等级：第1等级为BAI≥30.00,第2等级BAI在29.00～29.99之间,第3等级BAI＜29.00。 结论 汉族31个城市族群臀围与纬度、身高与纬度、臀围与身高均呈正相关,BAI与臀围、BAI与纬度也均呈正相关,但BAI与身高不相关。     

The polymorphism of heat shock protein 70 genes in Chinese Han population in Fujian province

Heat shock protein 70 (HSP70) genes are themost important and conserve gene members intheheat shock protein family,and locate in an areaadjacent tothe TNFgenesinthe classⅢregionofmajor histocompatibilitycomplex(MHC) .Its geneproductsHSP70proteins are encoded by 3 differ-ent genes ,HSP70-1,HSP70-2andHSP70-hom.Previous studies showed that three kinds ofpolymorphisms existin3loci of thesethree genes ,i .e .+190 G/CBsrBⅠrestrictionsite onHSP70-1, +1267 A/GPstⅠrestriction site onHSP…     

汉族人群血小板同种抗原HPA-3、HPA-9w多态性分布

目的研究我国不同汉族人群血小板同地区种抗原HPA-3、HPA-9w多态性。方法采用聚合酶链反应-序列特异性引物(polymerase chain reaction-sequence specific primers,PCR-SSP)技术对1000名来自不同省份汉族无关献血者进行HPA-3、HPA-9w抗原基因分型。结果在调查的1000名汉族人群中HPA-3a、HPA-3b基因频率分别为0.5935和0.4065,HPA-9全为a/a纯合子。经χ2检测,符合Hardy-Weinberg平衡。不同地区汉族人群之间比较,广东省与陕西、黑龙江、浙江、云南、江苏5省的HPA-3多态性分布差异有统计学意义,其余省份之间多态性分布差异无统计学意义。中国汉族人群与越南人、澳大利亚人HPA-3的多态性分布差异有统计学意义。结论在随机输血中供受者HPA-3抗原不配合比例达0.3661,这为研究同种免疫血小板减少症、开展血小板同型输注提供了理论基础。     

温州永嘉汉族人群3个Y-STR基因座的遗传多态性研究

目的研究3个Y染色体STR基因座及其单倍型在温州永嘉人群中的遗传多态性分布,获得相应的群体遗传学数据。方法用复合扩增的方法扩增DYS435、DYS436和DYS4373个基因座,利用聚丙烯酰胺凝胶电泳及银染显带技术进行分型,检测140名无关男性个体单倍型分布。结果3个基因座在该群体中分别检出3、3、4个等位基因,GD值分别是0.5100,0.1490,0.4056,观察到11种单倍型,其单倍型的变异度为0.7042。结论Y-STR基因座复合扩增体系和建立的Y染色体STR数据库,在法医学鉴定中有帮助意义。