KIF2C在肝细胞癌中的作用及ceRNA调控网络构建

目的：分析驱动蛋白家族成员2C(KIF2C)在肝细胞癌（HCC）中的表达及意义;探索竞争内源性RNA(ceRNA)网络在HCC发展中的潜在作用。方法：利用肿瘤芯片数据库（Oncomine）、肿瘤基因组图谱（TCGA）和基因表达谱交互分析（GEPIA）数据库分析KIF2C在HCC中的表达,及其与HCC的总生存期（OS）、无病生存期（DFS）及病理分级等临床参数的关系;通过RT-qPCR实验分析KIF2C在HCC组织和配对的癌旁组织中的表达;通过细胞功能实验分析干预KIF2C表达对HCC细胞增殖、侵袭与迁移的影响;利用STRING和GeneMANIA数据库探索与KIF2C互作的蛋白和基因;使用高通量测序,寻找log2|FC|>1条件下的差异基因,并进行GO与KEGG富集分析,探索KIF2C潜在的作用通路;通过共表达分析,筛选互作的RNA后构建ceRNA调控网络。结果：KIF2C在HCC中显著高表达（P<0.001）;KIF2C表达水平影响HCC患者的生存预后及病理分级（P<0.05）;细胞功能实验表明KIF2C过表达促进HCC细胞的增殖、侵袭与迁移（P<0.05）;...     

ceRNA在缺血性脑卒中中的研究进展

脑卒中是全球范围内致残和致死的主要原因,但因其治疗时间窗较短,患者常错过最佳治疗时间导致病情加重及严重的后遗症。竞争性内源RNA (ceRNA)异常表达在缺血性脑卒中的病理过程中发挥着重要作用,其介导细胞凋亡、炎症反应、血管生成、细胞自噬等病理过程。本综述通过总结相关研究来探讨ceRNA在缺血性脑卒中中的作用及分子机制。     

hsa-miR-423-5p激活IL1R1基因在冠心病中的作用机制

目的：通过人群表达水平及转录组测序分析hsa-miR-423-5p靶向目标基因在冠心病（CHD）中的作用机制。方法：选取广西医科大学第一附属医院收治的151例CHD患者（CHD组）,同期选择健康体检者作为健康对照组。通过实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测外周血白细胞中hsa-miR-423-5p表达水平,通过Spearman相关分析对hsa-miR-423-5p与各临床指标的相关关系进行分析。在EA.hy 926细胞中过表达hsa-miR-423-5p后进行hsa-miR-423-5p的亚细胞定位实验及转录组测序。针对测序结果预测hsa-miR-423-5p的潜在靶基因,对其进行RT-qPCR实验验证并分析目标基因与hsa-miR-423-5p表达水平及各临床指标之间的相关关系。结果：CHD组外周血白细胞中hsa-miR-423-5p的表达水平显著低于健康对照组（P<0.05）。hsamiR-423-5p的表达量与总胆固醇（TC）呈负相关关系,与高密度脂蛋白胆固醇（HDL-C）呈正相关关系（P<0.05）。在EA.hy926细胞中过表达hsa-miR-423-5p,亚...     

ceRNA网络在反复种植失败中的研究进展

竞争性内源性RNA(ceRNA)网络是指一类通过与信使RNA(mRNA)竞争性结合微小RNA(miRNA)来调控mRNA水平,由ceRNA-miRNA-mRNA构成的网络系统.ceRNA网络参与了多种疾病的发生发展.反复种植失败(RIF)是女性不孕患者行体外受精(IVF)或胞浆内单精子注射(ICSI)的常见并发症,一直...     

非小细胞肺癌中PTCH1-3’-UTR调控的lncRNAs的ceRNA网络

 目的  研究PTCH1-3’-UTR对lncRNAs表达水平的影响,通过调控网络的分析,提示PTCH1-3’-UTR的功能。方法  通过芯片筛选非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中调控PTCH1-3’-UTR的lncRNAs,并对部分结果进行荧光定量PCR验证。通过GO和KEGG通路分析调控PTCH1-3’-UTR的lncRNAs可能的生物学功能。通过TCGA数据分析调控PTCH1-3’-UTR的lncRNAs与NSCLC患者生存率的直接关系。结果  荧光定量PCR验证了PTCH1-3’-UTR上调表达的lncRNAs (LOC100507547,FAM41C,DOCK4-AS1,AC009305.1,KLF7-IT1,RP11-749H20.1,LINC01511)。GO和KEGG通路分析结果显示,调控PTCH1-3’-UTR的lncRNAs与一系列的生物过程,包括基因转录、信号转导、蛋白质转运、翻译延伸以及钙信号通路、Jak-STAT信号通路、p53信号通路、胰岛素信号通路有关。TCGA数据分析的结果表明,调控PTCH1-3’-UTR的lncRNAs中,NSCLC患者中高表达lncRNA-CDKN2BAS或 FAM66D者预后较差,而高表达lncRNA-LINC00240、LOC400027、ABCC6P2 或FLJ10038者可能预示高存活率。结论   本研究结果提示了PTCH1-3’-UTR的功能,调控PTCH1-3’-UTR的lncRNA可作为NSCLC预后标志物。     

血清miR-497-5p、FGF-2在阿尔茨海默病患者中的表达及相关性分析

目的 探讨miR-497-5p、人成纤维细胞生长因子-2(fibroblast growth factor-2,FGF-2)在阿尔茨海默病(Alzheimer′s disease,AD)患者中的表达水平、诊断价值及两者的相关性。方法 收集50例首诊AD患者和37例正常受试者(对照组)的临床资料,其中将AD患者分为轻度AD组18例、中度AD组18例和重度AD组14例,采用实时荧光定量聚合酶链反应(real-time quantitative polymerase chain reaction,RT-qPCR)检测miR-497-5p的表达水平,酶联免疫吸附试验(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)检测FGF-2水平,采用简易精神状态量表(mini-mental state examination,MMSE)评估AD患者的认知功能,分析miR-497-5p与MMSE、FGF-2水平的相关性。采用受试者工作特征(receiver operator characteristic,ROC)曲线评价miR-497-5p,FGF-2水平对AD的诊断效能。结果 与对照组和轻度AD组比较,中度、重度AD组患者miR-497-5p表达水平明显升高(P<0.01),FGF-2水平明显下降(P<0.01);AD组miR-497-5p与MMSE评分、FGF-2水平呈负相关(r分别为-0.724、-0.748,P<0.01);ROC曲线分析结果显示,miR-497-5p、FGF-2及两者联合指标诊断中度、重度AD及鉴别轻度和中度,轻度和重度AD时,均有较高的曲线下面积、敏感度和特异性,两者联合指标诊断及鉴别效能最优。结论 中重度AD患者血清miR-497-5p上调,FGF-2水平下调,两者联合检测对中重度AD有一定的诊断价值,并提供一定的参考。     

hsa-miR-145-5p在胰腺癌中的表达及生物信息学分析

目的 研究hsa-miR-145-5p在胰腺癌患者及正常人血浆中的表达模式,探究hsa-miR-145-5p作为胰腺癌诊断标记物的可行性。进一步阐明其在胰腺癌的发生发展过程中可能的调控机制。 方法 采用生物信息学方法进行hsa-miR-145-5p的靶基因预测及功能分析,选择miRanda、TargetScan和RNAhybrid三种软件预测hsa-miR-145-5p的靶基因并结合现有数据库筛选有实验数据支持的靶基因,进一步进行GO功能富集分析,KEGG Pathway富集分析和蛋白互作分析,研究靶基因功能。qPCR验证胰腺癌患者及正常对照组血浆中hsa-miR-145-5p表达。 结果 hsa-miR-145-5p序列在各物种间高度保守;预测其靶基因共得到8 679个,且有实验数据支持靶基因有1 408个;有实验数据支持的靶基因GO富集分析主要显著富集于胞内运输、基因表达调控、细胞内信号传导、细胞生长调控、能量代谢等生物学过程和功能上(FDR<0.01)。KEGG Pathway富集分析靶基因显著富集于p53信号通路、ErbB信号通路、MAPK信号通路、慢性骨髓白血病、膀胱癌、胶质瘤、前列腺癌、胰腺癌等(P<0.01),表明hsa-miR-145-5p在胰腺癌中有重要的调控作用。相较于正常组,患病组hsa-miR-145-5p表达下调。 结论 hsa-miR-145-5p调控多个肿瘤发生相关的基因,在胰腺癌发生相关的生物学过程中具有重要的调控功能,为胰腺癌miRNA标记物的研究提供了线索。      

HOXA11-AS/miR-149-3p通路在肺鳞状细胞癌中的作用及机制研究

目的 探究长链非编码RNA HOXA11-AS在肺鳞状细胞癌发生过程中的确切机制。方法 采用定量聚合酶链式反应(RT-qPCR)检测HOXA11-AS、miR-149-3p和SPT16表达变化。并通过MTT法检测细胞活力。双荧光素酶报告基因检测miR-149-3p与HOXA11-AS或SPT16的互作关系。结果 在肺鳞状细胞癌组织和细胞中HOXA11-AS和SPT16的表达升高,而miR-149-3p的表达降低。miR-149-3p是HOXA11-AS的作用靶点,而SPT16是miR-149-3p的作用靶点。HOXA11-AS的敲低抑制了肺鳞状细胞癌细胞的增殖能力,而使用miR-149-3p抑制剂可拮抗HOXA11-AS敲低对肺鳞状细胞癌细胞增殖的抑制作用。此外,上调SPT16可减弱si-HOXA11-AS介导的肺鳞状细胞癌细胞的抗增殖作用。结论HOXA11-AS的敲低可通过调控miR-149-3p/SPT16轴在肺鳞状细胞癌中发挥抑癌作用。     

miR-212-5p相关ceRNA调控网络在巨噬细胞极化中的作用

目的:构建巨噬细胞极化过程中竞争性内源RNA(ceRNA)调控网络,探讨其中关键lncRNA AK134492/miR-212-5p/Serpinb8轴在巨噬细胞极化中的作用.方法:构建巨噬细胞极化过程中ceRNA调控网络,通过体外功能实验筛选出其中关键轴lncRNA AK134492/miR-212-5p/Serpi...     

Hsa-miR-139-3p靶基因预测及生物信息学分析*

目的 对hsa-miR-139-3p的靶基因进行预测及相关生物信息学分析,为hsa-miR-139-3p靶基因的实验验证及其调控机制提供理论基础。方法 采用3种软件预测hsa-miR-139-3p的靶基因并对结果进行功能注释（GO）和信号通路富集分析（KEGG）。结果 hsa-miR-139-3p成熟序列在各物种间高度保守。获得的133个靶基因存在于细胞各个组分,主要有转录调控、基因表达调控和蛋白连接等分子功能,并富集于发育生物学过程,涉及黏着斑信号转导以及基因信息处理等信号通路。结论 hsa-miR-139-3p通过调控靶基因参与人类生命活动和疾病过程的很多方面,尤其生长发育和癌症过程是值得进一步研究的方向。     

长链非编码RNA PTENP1在膀胱癌发生发展中的分子机制

目的 探讨长链非编码RNA PTENP1在膀胱癌发生发展中的分子机制.方法 通过逆转录实时定量PCR(qRT-PCR)分别检测PTENP1,PTEN,miR-17在膀胱癌中的基础表达并关联分析.利用Western blot检测膀胱癌细胞系T24与5637中超表达PTENP1后PTEN的表达变化.通过荧光素酶报告试验验证miR-17对PTENP1及PTEN的靶向作用.最后通过在膀胱癌细胞系T24和5637中共表达miR-17和PTENP1,建立稳定共表达细胞系进行增殖和迁移实验,探索长链非编码RNA PTENP1在膀胱癌发生发展中的分子机制.结果 miR-17在膀胱癌中普遍呈现高表达趋势,PTENP1在膀胱癌中呈现普遍低表达趋势(P<0.05).与此同时miR-17和PTENP1的基础表达为负相关,PTENP1与PTEN的基础表达为正相关.WB实验发现于膀胱癌细胞系T24和5637中过表达PTENP1后可以在翻译水平增加PTEN的表达,荧光素酶报道实验验证了miR-17可同时靶向PTENP1及PTEN,在膀胱癌中miR-17具有促癌功能,同时在膀胱癌细胞中我们发现miR-17可以部分回复PTENP1的抑癌功能.结论 长链非编码RNA PTENP1在膀胱癌中发挥抑癌功能的分子机制可能是PTENP1结合miR-17作为竞争性内源RNA竞争,从而降低miR-17对抑癌基因PTEN的表达抑制.     

microRNA-7-5p及Raf-1在结直肠癌治疗中的研究价值

虽然我国医疗卫生水平在不断提高,但结直肠癌患者发生率和病死率仍然居高不下。西妥昔单抗等靶向药物丰富了晚期转移性结直肠癌患者的治疗手段,然而对于KRAS突变患者治疗效果不佳。探索新的针对包括KRAS突变患者在内的结直肠癌治疗靶点对降低结直肠癌总体病死率意义重大。本文就miR-7-5p、Raf-1研究进展及两者在结直肠癌治疗中的潜在价值做一综述。     

血红素加氧酶1在阿尔茨海默病中的神经保护作用研究进展

氧化应激是阿尔茨海默病(AD)的一个显著病理特征。AD中存在氧化应激,在生物化学和神经病理水平,在受累脑区脂质、核酸和蛋白氧化损伤的标志物存在于退变的神经元之中。鉴于氧化应激对神经病理形成的影响,针对抗氧化损伤成为治疗AD的重要方法。研究表明,受核转录因子Nrf2调节的血红素加氧酶1(HO-1)参与细胞抗氧化损伤,进而成为了AD中神经保护的新靶标。该文将就HO-1在AD中作用和相关机制予以综述。     

阿尔茨海默病患者血清miR-6867-5p表达水平及诊断价值研究

目的 研究miR-6867-5p在阿尔茨海默病（AD）患者血清中的表达水平及其诊断价值,分析其参与AD的可能机制。方法 选取2021年11月-2022年6月就诊于江苏大学附属医院神经内科门诊的52例AD患者作为AD组,另选取同期在医院体检中心进行常规体检的28名健康体检者为对照组,收集两组血清标本及临床基本资料。使用实时荧光定量PCR方法检测AD组在治疗前及盐酸多奈哌齐治疗6个月后的血清miR-6867-5p表达水平,简易智力状态检查（MMSE）、蒙特利尔认知评估（MoCA）量表评价AD患者的认知功能,分析血清miR-6867-5p与量表评分之间的相关性。使用受试者工作特征（ROC）曲线评估miR-6867-5p在AD中的诊断效能。利用在线预测工具预测miR-6867-5p的靶基因,通过R语言分析包对其进行功能及信号通路富集分析。结果 AD组在治疗前血清miR-6867-5p表达水平高于对照组（Z=-4.65）,治疗后血清miR-6867-5p低于治疗前（Z=-5.54）,差异均有统计学意义（P均<0.01）。血清miR-6867-5p的表达水平与MMSE和MoCA评分成负相关（...     

阿尔茨海默病病人血浆中白介素-6及Aβ1-40的检测分析

阿尔茨海默病是慢性进行性中枢神经系统变性病导致的痴呆,主要临床表现是渐进性远近记忆力障碍、分析判断能力衰退、认知障碍、人格改变和行为失常,进而意识模糊,最后多死于肺炎和尿路感染。是导致老年人痴呆最常见的疾病,严重影响老年人的生命质量,这一疾病可以持续20余年,给个人、家庭和社带来沉重的负担和痛苦。随着人类寿命的延长和人口老龄化AD的发病率也将不断增加。目前Alzheimer病(Alzheimer disease,AD)临床诊断尚无明确的特异性生化指标,     

血浆Aβ1-40及血脂与炎性指标在阿尔茨海默病患者中的表达及意义

  目的  探讨血浆β淀粉样蛋白1-40(Aβ1-40)、血脂及炎性指标在老年阿尔茨海默病患者中的表达及临床意义。  方法  选择2017年6月—2019年10月台州市第一人民医院接诊的老年阿尔茨海默病患者93例作为观察组,依据ADAS-Cog表分组:53例轻度(ADAS-Cog评分＜20分),40例中重度(ADAS-Cog评分≥20分)。另选择同期于本院行健康体检的50例正常老年人作为对照组,通过酶联免疫吸附试验检测血浆Aβ1-40、炎性指标[白细胞介素1β(IL-1β)、白细胞介素6(IL-6)、肿瘤坏死因子α(TNF-α)]表达,并经全自动生化分析仪检测血脂[三酰甘油(TG)、高密度脂蛋白(HDL)、胆固醇(TC)、低密度脂蛋白(LDL)]表达。  结果  观察组患者血浆Aβ1-40、IL-1β、IL-6、TNF-α表达均比对照组高[(109.37±8.52)pg/mL vs. (93.48±7.23)pg/mL、(49.53±6.09)pg/mL vs. (30.51±7.46)pg/mL、(170.87±12.71)pg/mL vs. (75.15±8.27)pg/mL、(65.93±5.72)pg/mL vs. (36.70±5.24)pg/mL,均P < 0.05];2组HDL水平对比差异无统计学意义(均P＞0.05);观察组患者血脂TG、TC、LDL水平均比对照组高(均P＜0.05);中重度组患者血浆Aβ1-40、IL-1β、IL-6、TNF-α表达水平均比轻度组高(均P＜0.05);轻度组、中重度组血脂指标TG、HDL、TC、LDL水平对比差异无统计学意义(均P＞0.05)。  结论  血浆Aβ1-40、血脂及炎性因子表达与老年阿尔茨海默病病情严重程度密切相关,可为临床评估老年阿尔茨海默病病情进展提供参考依据。