白介素-28B基因多态性与HCV感染后转归相关性研究

目的研究白细胞介素28B(IL-28B)基因多态性与HCV感染者转归情况的关系,以期对HCV的治疗和防御提供指导。方法采用基因测序的方法分析230例慢性HCV患者的IL-28B的rs8103142基因多态性,并对患者的HCV-RNA载量进行检测。结果 HCV携带者IL-28B的rs8103142位点的TT基因型和T等位基因的比例高于健康人群(P0.05)。HCV携带者rs8103142位点的CC基因型和C等位基因的比例在低HCV RNA水平患者明显较多(P0.05);rs8103142位点TT基因型和T等位基因的比例在高HCV RNA水平患者明显较多(P0.05)。不同HCV基因型患者的基因型和等位基因分布均有明显差异(P0.05)。接受治疗后为SVR患者的rs8103142位点的CC基因型和C等位基因的比例高于非SVR组患者(P0.05)。维吾尔族患者IL-28B的rs8103142位点的TT基因型和T等位基因的比例高于汉族患者(P0.05)。结论 IL-28B的rs12979860基因多态性与HCV感染者治疗后转归有一定联系,TT基因型可使携带者具有HCV的易感性,CC型基因型可增强携带者对HCV抗性,对临床HCV的预防和治疗有重要意义。     

血清中IL-17 水平及IL-17rs763780 基因多态性与深圳地区Graves 病患者遗传易感性分析

目的:了解Graves病患者血清中IL-17水平及IL-17rs763780基因多态性分布情况,并探讨IL-17rs763780基因多态性与深圳地区Graves病患者之间的遗传基因易感性。方法:收集2016年2月～2018年11月来深圳市大鹏新区妇幼保健院门诊或/和住院部就诊并确诊为Graves病患者152例为Graves组,选取同期来医院体检中心体检的健康人群100名为对照组,采用酶联免疫吸附法(ELISA)检测血清中IL-17水平,同时采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)法对IL-17rs763780基因多态性进行检测,并对检测结果进行统计分析。结果:Graves组患者血清中IL-17水平为(495.47±190.52)pg/ml,明显高于对照组的(164.13±42.95)pg/ml,差异有统计学意义(t=10.627 2,P0.05);男性Graves病患者血清中IL-17水平为(427.26±152.67)pg/ml,低于女性患者的(561.73±201.63)pg/ml,差异有统计学意义(t=2.764 5,P0.05);Graves病组IL-17rs763780 CC基因型及C等位基因频率分别为20.39%和34.87%,明显高于对照组,差异有统计学意义(χ~2=2.810 2～3.275 6,P0.05);男性Graves病患者IL-17rs763780 CC基因型及C等位基因频率分别为16.42%和29.10%,低于女性患者,差异均有统计学意义(χ~2=2.038 4～2.615 3,P0.05);IL-17rs763780 CC基因型患者IL-17水平为(549.24±197.25)pg/ml,略高于TC基因型的(524.29±193.87)pg/ml,差异无统计学意义(t=0.941 4,P0.05),但两者均明显高于TT基因型患者的(371.83±162.96)pg/ml,差异有统计学意义(t=2.502 1～2.871 0,P0.05)。结论:Graves病患者血清中IL-17水平明显增高,IL-17rs763780 CC基因型及C等位基因频率明显高于健康人群,CC和TC基因型患者血清中IL-17水平高于TT基因型。因此,IL-17rs763780 CC基因型及C等位基因可能是导致深圳地区Graves发病的危险遗传基因之一。     

兰州地区IL-15、IL-17A和IL-18基因多态性与复发性流产的相关性研究北大核心CSCD

目的:探讨IL-15、IL-17A和IL-18基因多态性与复发性流产(RSA)的关系。方法:SNaPshot法分析150例RSA患者(RSA组)和150例健康志愿者(对照组)中IL-15基因rs3806798、IL-17A基因rs2275913、IL-18基因rs1946518和rs187238位点多态性分布情况。结果:RSA组和对照组中4个单核苷酸多态性(SNPs)基因型频率和等位基因频率分布在两组间差异无统计学意义(P>0.05);隐性和显性遗传模式下对IL-15基因rs3806798、IL-17A基因rs2275913、IL-18基因rs1946518进行非条件Logistic回归分析,发现两组间差异均无统计学意义(P>0.05)。但IL-18基因的rs187238 SNP位点GG型、CG型、CC型3种基因型构成比在两组间差异有统计学意义(χ2=9.256,P=0.010)。显性、隐性遗传模式Logistic回归分析结果显示G等位型(GC+GG基因型)与RSA患病风险降低相关(χ2=4.303,OR=0.53,95%CI=0.29~0.97,P=0.038),但G等位基因不是RSA的保护性等位基因(χ2=2.275,OR=0.66,95%CI=0.38~1.14,P=0.132)。经连锁不平衡和单体型分析,rs1946518和rs187238存在完全连锁不平衡。TGTG单体型是RSA的保护因素,其OR(95%CI)=0.361(0.158~0.827)。结论:IL-18基因rs187238基因多态性与RSA患病风险相关。     

广东地区慢性丙型肝炎患者IL28B基因多态性与抗病毒疗效的关系

目的 研究广东地区慢性丙型肝炎患者（CHC）白细胞介素28B（IL28B）基因单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism,SNP）的分布特点及其与抗病毒疗效之间的关系,为合理选择经济有效的个体化抗病毒治疗方案提供依据,提高CHC的治疗应答率.方法 对74例CHC患者给予聚乙二醇干扰素（PEG-IFN）联合利巴韦林（RBV）抗病毒治疗,疗程48周或72周,停药后随访24周.通过PCR测序,检测所有患者的IL28B（rs8099917、rs12979860、rs12980275）位点SNP,以快速病毒学应答率（RVR）及持续病毒学应答率（SVR）作为疗效的主要评价指标,比较IL28B不同基因型与抗病毒疗效的关系,评估IL28 BSNP在CHC患者治疗应答中的作用.结果 74例患者中,rs8099917位点基因型为TT、TG、GG各63（85.1％）、11（14.9％）、0（0％）例,rs12979860位点基因型为CC、CT、TT各60（81.1％）、14（18.9％）、0（0％）例,rs12980275位点基因型为AA、AG、GG各57 （77.0％）、17（23.0％）、0（0％）例.对HCV 1型患者,上述三个位点中仅rs12979860 CC型与SVR有关,结果有统计学差异（SVR组vs NonSVR组,88.4％ vs 58.3％,P＜0.05）;对非HCV1型患者,rs8099917、rs12979860、rs12980275三个位点与RVR和SVR无关,结果无统计学差异（P＞0.05）.结论 广东地区CHC患者IL28B基因rs8099917、rs12979860、rs12980275位点分别以TT、CC、AA为主;对于HCV 1型CHC患者,rs12979860位点的基因型可以作为治疗前SVR的一个重要预测因子.     

广西人群中IL-33基因rs10975498C/T、rs16924144C/T多态性的分布特点

目的探讨IL-33基因rs10975498C/T、rs16924144C/T 2位点的多态性在广西人群中的分布特点;分析各基因型及等位基因的分布频率在广西人群中不同性别间的差异。方法采用单碱基延伸法(PCR-SEB)及DNA测序对283例广西地区受试者的IL-33基因rs10975498C/T、rs16924144C/T位点进行多态性分析。用统计学方法分析其分布频率及组间差异。结果rs10975498C/T存在CC、TT、CT 3种基因型,分布频率分别为23.7%、20.8%、55.3%,其各基因型及等位基因频率在广西人群中男女性别之间无显著差异(P0.05),其基因型频率与人类基因组计划公布的欧洲人、非洲黑人、北京汉族人及日本人群之间有显著差异(P0.05),而等位基因频率仅与欧洲人及非洲黑人群间有显著差异(P0.01)。rs16924144C/T存在CC、TT、CT 3种基因型,分布频率分别为22.7%、19.0%、58.3%,其各基因型及基因频率在广西地区人群中男女之间也无统计学意义(P0.05),其基因型与等位基因频率与非洲黑人群相比差异有统计学意义(P0.05)。结论 IL-33基因rs10975498C/T、rs16924144C/T的基因多态性存在着不同程度的种族和地区差异。     

IL-18受体α链基因多态性与重庆汉族人结核病易感性的关系

目的:探讨重庆地区汉族人群白细胞介素18受体α链(IL-18Rα)基因多态性与结核病易感性的关系.方法:采用序列特异性引物多聚酶链反应(PCR-SSP)分析重庆汉族人群中427例结核病患者和469名健康对照的IL-18Rα基因的-69C/T,-638C/T位点多态性,统计分析基因多态性与结核病易感性的关系.结果:IL-18Rα基因启动子-69和-638位点核苷酸均存在C、T二态性,都表现为CC纯合、TT纯合、CT杂合三种基因型;-69C/T位基因型分布频率在结核组与对照组间差异有统计学意义,对照组CC基因型频率(41.6%)明显高于结核组(30.4%)(χ2=13.011,P=0.001),结核组的等位基因T频率(44.8%)明显高于对照组(36.6%)(χ2=11.2,P=0.001);T等位基因在结核组与对照组比较,优势比OR=1.41.-638C/T位基因型和等位基因分布频率分别在结核组与健康对照组间的分布差异均没有统计学意义(P＞0.05).结论:重庆汉族人IL-18Rα基因的-69C/T多态性与结核易感性相关,携带-69T等位基因的人群更易患结核病,而-638位C/T多态性与结核病易感性无明显相关性.     

has-miR-27a和has-miR-124a基因单核苷酸多态性与妊娠期糖尿病的相关性

目的 探讨has-miR-27a基因rs895819位点和has-miR-124a基因rs531564位点单核苷酸多态性(SNP)与妊娠期糖尿病(GDM)发病的相关性.方法 共纳入1 719例孕妇,其中GDM 839例;糖耐量正常和50 g葡萄糖负荷试验阴性者880例,作为对照组.采用TaqMan探针法检测两组孕妇SNP位点基因型,比较两组孕妇各SNP位点等位基因和基因型频率差异,以及不同基因型间临床生化指标的差异.结果 1)rs895819位点CC、CT和TT基因型频率在GDM组分别为3.1％、39.3％和57.6％,对照组分别为7.1％、37.6％和55.3％,CC基因型频率显著低于对照组(P＜0.05);隐性模型(CC vs CT +TT)中两组差异仍具有显著性[P=0.001;OR0.435(0.270,0.702)];GDM组C等位基因频率(22.8％)低于对照组(25.9％)(P＜0.05).2)rs895819 CC基因型孕妇空腹血糖低于CT +TT基因型孕妇(P＜0.05).结论 has-miR-27a基因rs895819位点与GDM相关,C等位基因降低GDM的发病风险.     

Interleukin-18基因启动子区单核苷酸多态性与肝细胞癌遗传易感性关系的研究

目的探讨白细胞介素18(IL-18)基因启动子区-607C/A(rs1946518)和-137G/C(rs187238)单核苷酸多态性(SNP)与肝细胞癌(肝癌)遗传易感性的关系。方法应用序列特异性引物-聚合酶链反应(PCR-SSP)技术,检测228例肝癌患者和300例健康对照者IL-18基因启动子-607C/A(rs1946518)、-137G/C(rs187238)单核苷酸多态性位点基因型,分析肝癌患者和对照组基因型频率和等位基因频率分布。结果肝癌组SNP位点rs187238 G等位基因的频率明显高于对照组(OR=1.1891,95%CI=1.0106-1.5633,P=0.026)。携带rs187238 GG基因型的肝癌患者较多(OR=1.5168,95%CI=1.1490-1.8322,P=0.010)。分层分析发现,rs1946518位点上AA基因型与肝癌发病的关联在饮酒的肝癌患者中更加显著(P=0.024),而且rs187238位点上GC/CC基因型与肝癌发病的关联在出现肝癌复发的患者中更加显著(P=0.005)。结论 IL-18基因启动子区-137G/C(rs187238)GG基因型与肝癌遗传易感性有关联。而rs1946518位点AA基因型和rs187238位点GC/CC基因型分别与肝癌患者饮酒和肝癌复发有关联。     

SLC2A9基因rs2241480位点T/C多态性与深圳地区高尿酸血症之间相关性

目的了解可溶性载体2家族成员9(SLC2A9)基因rs2241480位点T/C多态性分布差异及其与深圳地区高尿酸血症(Hyperuricemia,HUA)之间相关性,为HUA诊断、治疗及预防提供科学依据。方法随机选取2017年2月—2018年7月来医院就诊并确诊为HUA患者172例为高尿酸组,同时选择同期健康人群120名对照组,分别采用SequenomMassArray iPlexGold技术对两组人群的SLC2A9基因rs2241480位点T/C多态性进行检测,并对检测结果进行统计分析。结果高尿酸组和对照组SLC2A9基因rs2241480位点T/C多态性实际基因型分布与Hardy-Weinberg平衡状态下的理论基因型分布差异无统计学意义(χ2=1.1632,P0.05),符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律,具有群体代表性;高尿酸组SLC2A9基因rs2241480位点CC基因型及C等位基因检出率分别为47.09%和65.70%,明显高于对照组的21.67%和36.25%,差异有统计学意义(χ2=3.1938-4.9057,P0.05);高尿酸血症男性患者SLC2A9基因rs2241480位点TT、TC、CC基因型及T、C等位基因检出率分别为15.79%,35.79%,48.42%,33.68%及66.32%,与女性患者之间差异均无统计学意义(χ2=0.5217-1.3524,P0.05)。结论 SLC2A9基因rs2241480位点T/C多态性分布与深圳地区高尿酸血症有一定的相关性,但与性别无关,其CC基因型及C等位基因可能是本区高尿酸血症发病的危险遗传基因之一。     

SP-D基因rs721917位点T/C多态性与深圳地区儿童过敏性鼻炎遗传易感性分析

目的了解肺表面活性蛋白D(surfactant protein D,SP-D)基因rs721917位点T/C多态性分布情况,并探讨其与深圳地区儿童过敏性鼻炎(allergic rhinitis,AR)遗传易感相关性。方法收集2016年3月～2018年8月来医院就诊并确诊为AR患儿165例为实验组,选择同期体检的健康儿童120名为对照组,采用PCR限制性片段长度多态性(PCRRELP)法检测两组SP-D基因rs721917位点T/C多态性,同时采用酶联免疫吸附(ELISA)法检测血清中总IgE水平,并对检验结果进行统计分析。结果实验组和对照组SP-D基因rs721917位点多态性均检出TT,TC和CC 3种基因型,经Hardy-Weiberg检验,均符合Hardy-Weinberg平衡定律(χ~2=0.6218,P0.05),具有样本代表性;实验组患者血清中总IgE(1oge)水平为5.36±0.92,明显高于对照组的2.17±0.34,差异有统计学意义(t=3.9262,P0.05);实验组患者SP-D基因rs721917位点CC基因型及C等位基因频率分别为29.70%和51.82%,明显高于对照组的11.67%和32.08%,差异均有统计学意义(χ~2=2.8703～3.1546,P0.05);不同性别AR患者SP-D基因rs721917位点TT,TC,CC基因型及T,C等位基因频率之间差异均无统计学意义(χ~2=0.3251～1.0624,P0.05);TT,TC及CC基因型AR患者血清中总IgE(1og_e)分别为5.01±0.85,5.27±0.90及5.54±1.02,各基因型AR患者血清中总IgE水平之间差异均无统计学意义(t=0.3802～0.5615,P0.05)。结论 AR患者血清中总IgE水平明显高于健康人群,但SP-D基因rs721917位点不同基因型AR患者间无差异,同时SP-D基因rs721917位点CC基因型及C等位基因可能是深圳地区AR发病的危险遗传易感基因之一。     

ATM基因rs227060位点单核苷酸多态性与肺癌易感性的相关性

目的:探讨共济失调毛细血管扩张症突变基因(ataxia telangiectasia mutated,ATM)rs227060位点单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)与肺癌易感性之间的相关性.方法:采用聚合酶链反应-SNP敏感性分子开关方法,检测225例肺癌患者和128例健康体检者ATM基因rs227060多态位点等位基因以及基因型频率分布特点;并应用非条件Logistic回归法统计分析rs227060单核苷酸多态性与肺癌的相关性.结果:rs227060多态位点共检测出CC,CT,TT三种基因型和C,T两种等位基因,其在肺癌组与对照组的基因型分布频率为:CC基因型17.3％与29.7％、CT基因型61,4％与59.3％、TT基因型21.3％与11％,两组间基因型频率和等位基因频率分布差异均有统计学意义(P＜0.05).在对ATM rs227060基因型的多态性分析过程中发现:吸烟史在肺癌组与对照组相比差异无统计学意义(P＞0.05),而年龄、性别、肿瘤家族史在肺癌组与对照组相比差异均有统计学意义(P＜0.05);且以CC基因型作为对照,携带TT基因型的个体患肺癌的风险是携带CT基因型个体的3.49倍(OR=1.829;95％CI:1.045～3.199).结论:ATM基因rs227060位点单核苷酸多态性与肺癌易感性存在相关性,且携带TT基因型可增加肺癌的发病风险.     

SLC基因家族单核苷酸多态性与汉族孕产妇重度子痫前期易感性的关系

目的探讨SLC基因家族单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)与汉族孕产妇重度子痫前期易感性的相关性。方法选取2011年3月至2013年3月确诊的合并重度子痫前期孕产妇125例和健康孕产妇140例为研究对象,利用Mass ARRAY-IPLEX技术和基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱平台(MALDI-TOF-MS)对SLC9A3、SLC4A1和SLCO4C1基因的4个SNPs位点进行基因分型。结果基因分型成功率为98.11%。与对照组相比,重度子痫前期组rs2074107的等位基因分布(χ~2=0.992,P=0.319)和基因型分布(χ~2=0.886,P=0.648)均无显著性差异。与对照组相比,重度子痫前期组rs2857078、rs4957061和rs10066650的等位基因分布(χ~2=7.720,P=0.005;χ~2=19.755,P=0.000;χ~2=15.078,P=0.000)和基因型分布(χ~2=6.608,P=0.037;χ~2=20.116,P=0.000;χ~2=12.026,P=0.002)均具有显著性差异,但进行Bonferroni校正后rs2857078位点的2组间基因型分布无显著性差异(Pc=0.074),而rs4957061和rs10066650的2组间基因型分布均具有显著性差异(Pc=0.000,Pc=0.008)。与CC基因型相比,rs4957061的TT基因型显著增加重度子痫前期发生的危险性(P=0.001),OR值(95%可信区间)为3.080(1.615~5.875)。如表3与TT基因型相比,rs10066650的GT和GG基因型均增加重度子痫前期发生的危险性(P=0.033,P=0.003),OR值分别为1.938(1.050~3.577)和5.814(1.628~20.758)。结论 SLC9A3和SLCO4C1基因的单核苷酸多态性可能与重度子痫前期易感性有关。     

TLR5rs5744168基因多态性与广西壮、汉族人系统性红斑狼疮的相关性研究

目的:探讨TLR5rs5744168基因单核苷酸多态性与广西壮、汉族系统性红斑狼疮易感性的相关性以及种族间差异,初步阐明其在壮、汉族SLE发生发展中的作用.方法:采用聚合酶链反应PCR技术和直接测序的方法对33例壮族、44例汉族系统性红斑狼疮患者和72名壮、汉族健康对照者的TLR5rs5744168C/T基因多态性进行分析,比较组间基因型和等位基因频率的差异,并与主要临床指标进行相关性分析.结果:(1)广西地区壮、汉族SLE的TLR5 rs5744168的TT基因型均缺失;CC基因型频率在各组中均在90.0％～100.0％之间.(2)广西壮族SLE患者TLR5基因rs5744168 CC、CT基因型频率分别是0.939、0.061,汉族SLE患者相应基因型频率分别是0.977、0.023,与相应民族正常对照组间以及壮、汉族SLE间差异均无统计学意义(分别x2 =2.001 x2=2.235和x2 =0.723;均P＞0.05);壮族SLE患者的TLR5rs5744168 C、T等位基因频率分别是0.970、0.030,汉族SLE相应的C、T等位基因频率分别是0.989、0.011,与相应民族正常对照组间以及壮、汉族SLE间差异均无统计学意义(分别x2=1.970、x2 =2.166和x2=0.708;均P＞0.05).(3)TLR5rs5744168 CC、CT基因型及C、T等位基因与广西壮汉族SLE患者ds-DNA、ANA、肾损害临床表现和实验室检查均无相关性(均P＞0.05).结论:TLR5rs5744168基因多态性与广西壮、汉族SLE的易感性以及ds-DNA、ANA、肾损害临床实验室主要指标均无明显相关性,壮、汉族间亦不存在明显民族差异性.     

类风湿关节炎患者血清中IL-17 表达及IL-17F 基因位点rs763780 多态性分析

目的:了解类风湿关节炎(RA)患者血清中IL-17、类风湿因子(RF)及C反应蛋白(CRP)的表达,并探讨IL-17F基因位点rs763780多态性与RA发病易感相关性。方法:收集2016年1月～2018年10月来深圳市福田区风湿病专科医院就诊的RA患者176例为研究组,并选取同期来院体检的健康人群110名为对照组,分别检测血清中IL-17、RF及CRP含量,并采用聚合酶链反应(PCR-RFLP)技术对IL-17F基因位点rs763780多态性进行分析。结果:RA组血清中IL-17、RF及CRP含量分别为(36.73±11.06)pg/ml,(58.05±14.92)U/ml和(32.15±13.96)mg/L,明显高于对照组的(14.52±6.35)pg/ml,(10.24±5.32)U/ml和(6.81±3.25)mg/L,差异均有统计学意义(t=3.035 7～5.320 6,P0.05);RA组CC基因型和C等位基因检出率分别为19.32%和41.48%,明显高于对照组的6.36%和26.82%,差异有统计学意义(χ~2=3.916 5～5.054 7,P0.05);RA组IL-17F基因位点rs763780 CC基因型中的IL-17水平为(42.96±13.64)pg/ml,明显高于其他基因型,差异有统计学意义(P0.05),而三种基因型血清中RF和CRP水平之间差异均无统计学意义(P0.05)。结论:RA患者血清中IL-17,RF及CRP水平明显高于健康人群,同时RA患者IL-17F基因位点rs763780 CC基因型及C等位基因检测率明显高于健康人群,可能是导致本地区RA发病的危险遗传易感基因之一。     

VEGF基因单核苷酸多态性与中国北方汉族人SLE易感性的相关性研究

目的:研究血管内皮生长因子(VEGF)基因单核苷酸多态性(SNP)与中国北方汉族人系统性红斑狼疮(SLE)易感性的相关性。方法:应用Sequenom飞行时间质谱技术检测44例SLE患者和100例正常对照者外周血VEGF基因的SNPs,选择6个VEGF基因的SNP位点:rs2010963、rs3024994、rs3025000、rs3025010、rs3025035和rs833070进行基因分型,用SPSS 11.5软件对数据资料进行统计分析。结果:SLE患者VEGF多态性位点rs2010963、rs3024994、rs3025000、rs3025010、rs3025035的基因型频率及等位基因频率与正常对照组比较差异无统计学意义(P0.05);VEGFrs833070 A等位基因频率明显高于对照组(31.2%vs20%,χ2=4.547,P=0.033,OR=1.818,95%CI 1.045-3.162)。rs833070 G等位基因在SLE组中关节炎与无关节炎组中频率有显著差异(56%vs80.4%,χ2=5.613,P=0.018,OR=0.336,95%CI 0.134-0.843),rs833070 GG基因型频率明显低于无关节炎组(GGvsAG+AA:28%vs65.2%,χ2=6.684,P=0.010,OR=0.207,95%CI 0.061-0.705),而VEGF rs833070位点基因型、等位基因型的频率与患者血清中ds-DNA抗体、抗Sm抗体、狼疮性肾炎、间质性肺疾病的发生无相关性(P0.05)。结论:VEGF基因SNP点rs833070与北方汉族人SLE发病易感性相关,rs833070位点A等位基因可能增加了SLE患病的易感性,而rs833070 GG基因型及G等位基因型可能是SLE合伴关节炎的保护性基因。     

基于扩增阻碍突变系统实时荧光PCR的IL28B基因SNP位点联合检测方法的建立

目的 建立基于扩增阻碍突变系统和实时荧光定量PCR相结合的IL28B基因多SNP位点联合检测方法,为进一步研究丙型肝炎患者抗病毒治疗效果提供技术平台.方法 分别构建包含IL28B基因的rs12979860和rs8099917两个SNP位点的野生型和突变型质粒标准品;采用ARMS技术,结合Taqman探针技术,建立能够同时检测上述两个SNP位点的实时荧光ARMS-PCR方法.然后采用本方法检测60例丙型肝炎住院患者血清标本并以基因测序结果为金标准进行方法学评价.结果 实时荧光ARMS-PCR能够有效的鉴别rs 12979860位点的CC、CT、TT基因型和rs8099917位点的TT、TG和GG基因型,通过和测序结果进行比对,二者符合率为100％ （P ＜0.05）.结论 本研究建立的双重实时荧光ARMS-PCR能够快速可靠的对IL28B的rs12979860和rs8099917位点进行基因型多态性的联合检测,为慢性丙型肝炎患者实现个体化治疗奠定基础.     

PD-1基因多态性与肺结核易感性的关系

目的探讨PD-1基因多态性与肺结核发病风险以及临床特征的相关性。方法采用PCRRFLP分析方法,检测262例肺结核患者和255例健康志愿者基因组DNA中PD-1基因SNP位点rs2227981和rs2227982基因型和等位基因频率的分布情况,分析PD-1基因多态性与肺结核易感性的关系;并收集了肺结核患者的临床资料,考察PD-1基因多态性与肺结核临床特征的相关性。结果对照组rs2227981和rs2227982基因型和等位基因频率的分布符合Hardy-Weinberg遗传平衡定律;rs2227981位点T等位基因(OR=2.721,95%CI:2.003~3.697,0.001)、rs2227982位点C等位基因(OR=1.614,95%CI:1.262~2.064,0.001)均与肺结核易感性相关;与rs2227981 CC基因型相比,携带PD-1 rs2227981 CT或TT基因型者具有更高的肺结核发病风险(OR=2.937,95%CI:2.018~4.274,0.001),且患者病灶范围较大(=0.009),痰菌阳性率较高(0.001);与rs2227982 TT基因型相比,携带rs2227982 TC或CC基因型者具有更高的肺结核发病风险(OR=1.706,95%CI:1.187~2.452,=0.004),且患者结核空洞的发生率较高(=0.021)。结论 PD-1基因rs2227981和rs2227982位点SNP多态性与肺结核易感性及临床特征相关。     

HLA-DQ遗传多态性与乙肝病毒感染结局相关

目的 探讨中国汉族人群人类白细胞抗原(HLA)-DQ基因单核苷酸多态性(rs9275572和rs9275319)与乙肝病毒感染结局的关系.方法 用TaqMan探针对纳入的921例样本进行HLA-DQrs9275572和rs9275319位点多态性的检测,921例血样本包括310例HBV相关慢性肝病者(CLD)、295例乙肝感染后自发清除者(SC)和316例健康对照者(HC).结果 1)Rs9275572 AG基因型有利于乙肝感染后病毒自发清除(OR 1.82,95％ CI 1.26～2.62;显性基因模型:OR 1.84,95％ CI 1.30～2.61).2)SNPrs9275319位点与乙肝易感性及感染后病毒的自发清除关系密切,携带rs9275319 C等位基因是一个保护因素(CLD vs HC:等位基因模型OR 0.49,95％ CI0.33 ～0.73,显性模型OR0.47,95％ CI0.31～0.72;CLD vs SC:等位基因模型OR 1.61,95％ CI 1.06～2.43,显性模型OR 1.57,95％口1.01 ～2.48).3)单体型T-G/T-A与乙肝易感性及感染后病毒自发清除相关.结论 HLA-DQ基因多态性与乙肝易感性及感染后病毒的自发清除密切相关.     

新疆维吾尔族群体色氨酸羟化酶1基因T3804A位点多态性与抑郁症的关联

目的探讨新疆维吾尔族群体色氨酸羟化酶1(TPH1)基因T3804A(rs623580)位点多态性与抑郁症的关系。方法采用聚合酶链式反应产物直接测序的方法检测104例抑郁症患者(研究组)和90例正常体检者(对照组)TPH1基因rs623580位点的基因型。应用SPSS10.0分析基因多态性与抑郁症相关性。结果研究组与对照组TPH1基因rs623580位点的基因型频率差异(χ2=6.560,P=0.038)和等位基因频率差异(χ2=5.517,P=0.019)具有统计学意义。研究组与对照组按性别分亚组,女性研究组与对照组基因型频率差异(χ2=8.026,P=0.018)和等位基因频率差异(χ2=7.154,P=0.007)具有统计学意义。男性研究组与对照组基因型频率差异和等位基因频率差异不具有统计学意义。结论新疆维吾尔族群体色氨酸羟化酶1基因T3804A位点与抑郁症的发病可能具有关联性,A等位基因可能是抑郁症的易感基因。