网上免费医学生物学数据库指南的建立

目的:建立一个网上免费的医学、生物学数据库的查询指南(directory of biomedical databases,DBD),方便研究者查询相关数据库.改变目前医学、生物学数据库查询不便的现状,推动医学、生物学的发展.方法:以PubMed和Google作为主要检索工具,制定检索策略,根据收录的标准筛选找到的数据库,入选项管理平台采用Microsoft SQL-Server 2000,利用Macromedia Dreamwaver MX设计DBD的Web发布页面,ASP(active server pages)技术处理用户提交的关键词和评分值.结果:目前收集到医学、生物学数据库66类1258个,中英文版同时发布(http://cmbi.bjmu.edu.cn/DBList/index.htm,http://cmbi.bjmu.edu.cn/DBList/index_en.htm),用户可以通过分类、关键词和入选项名称字顺查询相关数据库,并建立基于内容的数据库评分系统和数据库点击记录.使页面简洁易用.结论:DBD为建立网上核心医学、生物学数据库的评价体系奠定了基础,DBD将有助于数据库在未来医学、生物学研究中发挥强大的作用.     

医学信息数据库的建立与数据挖掘

0　引言　计算机和信息技术在医学领域中的应用,形成了现代医学中一个新的边缘学科医学信息学或医药信息学(medicalinformatics),进而成为生物医学工程学的重要支柱.医学信息涵盖了医学活动中产生的文字、图像、声音以及电磁波、光波、压力、温度等多媒体物理数据,这些数据在计算机和数据库技术的支持下,已成为医学技术领域实施科学管理和科学研究的重要资源.数据仓库(datawarehouse,DW)与数据挖掘(datamining,DM)技术的出现[1],为医务管理人员、科研工作者分析、利用这些数据资源进行科学管理、决策和开展大规模、高水平医学研究提供了有…     

如何建立组织胚胎学信息网

随着Internet的发展与普及,远程教育逐步发展起来。网络教学已经走进我们的教室,由此高等院校的各学科都希望建立一个关于本学科内容的教学、科研网站。这样,不但能够对学生进行远程辅导,而且方便与同行之间的交流与合作。及时了解专业发展动态,紧跟时代发展。本文结合我的个人体会,淡淡如何免费建立功能较为齐全的组织胚胎学教学、科研网站。     

我校医学机能实验学科体系的建立和发展

医学机能实验学是通过实验研究正常和异常生命活动过程中机体机能变化的规律和特点,培养基本实验技能和综合分析问题能力的综合实验学科。1998年7月大连医科大学组建了医学机能学实验室,建立了医学机能实验学科体系,独立开课,独立考核,编写了医学机能实验学教学大纲和教材,至2005年7月共计完成949 479人时数。     

医学寄生虫网络资料数据库的建立

为了建立可用关键词进行资料搜索的医学寄生虫学数据库，本研究应用ASP程序及SQL语言，在网页与数据库文件之间建立了桥梁，利用数据库文件实现了网页搜索功能和资料查询。通过对医学寄生虫资料数据库建立方法的介绍，探讨了一种基于数据库的网络搜索的方法。     

综合性睡眠医学中心建立和管理的体会

睡眠医学是一门新兴的发展迅速的综合性医学科学,己成为21世纪医学领域研究的重要课题之一。它除对睡眠进行基础研究外,主要对各种睡眠疾病的发生、发展、防治及其与临床各科的相互关系进行探讨和研究。     

生物信息学与医学：Ⅱ基因量化互动是医学划时代发展的主流

生物信息学是生命科学大系中的新生学科,它的科学价值和意义超越该学科的本身。生物信息学的出现代表了西方生物医学界从单因素分析为主的思维模式向整体观、全面地阐明生命活动的分子水平物质基础,破译基因与环境各类条件的互动并量化其作用的深度与广度。总之,这是生命科学哲学思想划时代伟大变革的开端。毫无疑问,生物信息学是当代医学向顶级发展的核心和原动力。     

糖尿病患者口腔健康状况数据库的建立

目的根据糖尿病患者的特点,设计并建立适合收集、保存、分析患者口腔健康情况信息的数据库。方法应用SQLServer2000搭建数据库平台,应用ASP作为数据库管理系统的开发工具。建立用户管理、患者信息管理、自定义信息查询、信息综合分析及辅助诊断、病例回访、患者口腔健康教育、操作系统维护等功能模块。结果通过本系统可方便进行庞杂的数据录入工作,利于口腔健康状况的分析和诊断,便于临床研究,同时利用生成的图片对患者进行口腔卫生指导。结论本系统数据录入简单方便,数据分析快捷实用,专业性较强,可以辅助口腔健康临床研究。     

校园网站建设及资源共享

目的随着社会的发展,新时期高等院校越来越注重计算机网络化的进程。本文对校园网络在高校应用中的构架方式,资源的合理配置及利用进行了分析,提出了校园网络应用的方向和实际应用中存在问题的解决方案。     

建立医学信息网拓展服务新空间

建立医学信息网是医院2004年信息化建设主要项目之一,图书馆在医院、信息科领导的关心支持下,大胆设想,提出设计方案,经全科同志密切配合,并与南京擎天科技有限公司共同开发,顺利完成了医学信息网的建设工程,开通使用3个月来网站访问量已达32000多人次.医学信息网的建立,体现了医院图书馆服务由传统传媒方式向数字化网络传媒方式转化的必然趋势,拓展了信息服务空间,对于医院信息化、管理现代化和医院教学、医疗、科研水平的提高[1]发挥重要作用.     

医学微生物学题库的建立及应用

介绍医学微生物学题库的建立及应用；通过试卷分析，检测题库质量，探讨题库建设中应注意的问题。     

基于GEO数据库研究结肠癌的生物标志物

目的:通过生物信息学筛选出结肠癌中的关键基因,为结肠癌分子生物研究及早期诊断相关生物标志物筛选提供理论依据。方法:从GEO数据库中选择编号为GSE10950、GSE74602和GSE110224的基因芯片,利用R语言下载评估芯片质量,对样本进行规范化处理并筛选出差异基因(DEG),通过TCGA下载结肠癌的表达数据,验证DEG的准确性,通过DAVID在线网站对DEG进行GO分析和KEGG富集分析,通过STRING在线网站得到DEG的蛋白互作网络,利用Cytoscape软件筛选出枢纽基因(hub基因),Oncomine数据库从基因层面验证hub基因的表达,cBioPortal数据库分析hub基因在结肠癌中的突变情况,最后通过UALCAN及TCGA数据库评估hub基因在结肠癌诊断方面的价值。结果:通过GEO数据库共筛选出结肠癌132个DEG,经TCGA数据库验证后最终得到131个DEG,其中表达下调DEG 78个,表达上调DEG 53个,通过STRING、Cytoscape筛选出10个hub基因,选取排名靠前的DTL等4个hub基因进一步分析,最终证明了DTL、CCNA2、BUB1、KIF23基因在结肠癌中的高表达并可能作为早期诊断结肠癌的标志物。结论:通过生物信息学分析研究筛选出结肠癌的关键基因,并证明蛋白编码基因DTL、CCNA2、BUB1、KIF23有可能作为早期诊断结肠癌的生物标志物。     

建立网上医学生物学实验室的构想

我室在教学改革过程中充分利用网络资源,制作了多媒体课件进行教学,激发了学生的学习热情和主动性,活跃了课堂气氛,取得了较好的教学效果本文在此基础上结合学院的实际情况,对建立网上医学生物学实验室的过程及其作用进行构想,以期为学生更好地掌握医学生物学知识提供有益的帮助