副溶血弧菌tlh基因的克隆及序列分析

目的　构建副溶血弧菌不耐热性溶血毒素 (thermolabilehemolysin ,TLH)tlh基因重组质粒。方法　根据已知GenBank中的tlh基因序列 ,设计合成一对引物 ,用PCR方法从副溶血弧菌基因组DNA中扩增编码TLH的基因片段 ,克隆至pET32a+ 质粒 ,转化大肠杆菌DH5感受态细胞 ,经酶切及PCR鉴定 ,而后进行测序。结果　tlh基因体外扩增产物大小约1 30 0bp ,重组质粒经酶切及PCR鉴定表明获得正确重组子 ,测序结果与已知序列基本吻合。 结论　在国内首次克隆了副溶血弧菌tlh基因 ,为研究TLH的功能和探讨TLH作为作为特异性诊断靶抗原的研究奠定了基础     

建立双重荧光定量PCR方法检测蜱传疏螺旋体

目的 建立双重荧光定量PCR方法,同时检测Borrelia burgdorferi和Borrelia miyamotoi。方法 分别利用recA基因、glpQ基因合成引物探针,并优化反应条件。在单重实验的基础上建立双重荧光定量PCR方法,对该方法灵敏度和特异度进行检测,并探索其他因素对反应结果的影响。使用模拟样本和实际样本评价新方法的检测效用。结果 双重荧光定量PCR方法具有良好的灵敏度和特异度,与单重实验方法比较,检测Ct值无明显差异(P>0.05),病原浓度与检测Ct值具有良好的线性相关关系。两种病原浓度差异和其他病原的存在对检测结果无明显影响。使用该方法检测模拟蜱样本和实际蜱样本具有良好的实用性。结论 本实验建立的多重荧光定量PCR方法能快速便捷的检测两种疏螺旋体,为蜱样本病原鉴定提供了有价值的检测工具。     

副溶血弧菌的分子生物学研究进展

副溶血弧菌（Vibrio Parahaemozyticus,Vp）,革兰氏阴性嗜盐杆菌,是一种引起食源性疾病的重要病原。可导致患者出现腹泻、肠痉挛、恶心、呕吐、发烧等典型胃肠炎反应。国家食源性疾病监测网数据显示。我国微生物性食物中毒的病原分布发生了显著变化,特别是沿海省份。副溶血性弧菌引起的食物中毒,在发生规模及人群暴露规模呈明显上升趋势,已经高居微生物性食物中毒首位。因此,对副溶血弧菌的研究,特别是分子生物学方面的研究。     

小鼠动物毒性试验、神奈川溶血试验以及tdh试验对副溶血性弧菌致病性检测有效性的研究

目的比较小鼠动物腹腔注射、灌胃、神奈川溶血实验以及荧光tdh基因PCR反应对副溶血性弧菌致病性检测的有效性。方法采用四种方法,对分离自腹泻者、水产品及自然水体中的菌株测定阳性率,以精确卡方统计比较结果。结果tdh反应可区分腹泻者来源菌株阳性率为90.0%,水产品来源阳性率为9.62%,自然水体来源阳性率为7.32%, P<0.001。结论荧光tdh 基因PCR反应可有效应用于致病性菌株检测。     

幽门螺杆菌TaqMan MGB探针双重荧光定量PCR检测方法的建立北大核心CSCD

目的建立用于幽门螺杆菌快速定量检测和分型的TaqMan MGB探针双重荧光定量PCR方法。方法采用Primer Premier 5软件分析设计引物和探针,采用双重荧光定量PCR扩增幽门螺杆菌CagA和VacA基因片段,建立循环数与拷贝数关系的标准曲线。检测临床标本中所含幽门螺杆菌的循环数,用该方法对临床胃黏膜标本进行检测并与标准曲线对比,计算所含幽门螺杆菌的拷贝数。结果建立的TaqMan MGB双重荧光定量PCR方法检测幽门螺杆菌质粒的线性范围是10~2~10~8拷贝/μl,CagA和VacA基因标准曲线的相关系数分别是0.977 8和0.990 4。29份临床胃黏膜标本的CagA和VacA基因循环数Ct值分别在29~35和30~35之间,幽门螺杆菌拷贝数分别在1.0×10^(1.39)~1.0×10^(3.87)和1.0×10^(3.06)~1.0×10^(3.91)之间,且临床标本中的幽门螺杆菌均为I型。结论建立的TaqMan MGB双重荧光定量PCR法具有敏感、精确、快速的特点,可用于幽门螺杆菌的快速定量检测与分型鉴定。     

TaqMan MGB探针实时荧光定量PCR快速检测布鲁氏菌

目的利用新一代TaqMan MGB探针技术,建立特异敏感的实时荧光定量PCR方法,用于布鲁氏菌的快速检测。方法针对布鲁氏菌基因组中16SrRNA序列设计特异性引物和探针,建立一套基于TaqMan MGB探针技术的实时荧光定量PCR方法,验证方法的特异性、敏感性和稳定性,对2008-2010年期间采集的773份动物样本中的布鲁氏菌进行检测,并与普通PCR方法进行比较分析。结果建立的TaqMan MGB探针实时荧光定量PCR方法对布鲁氏菌的检测具有高度的特异性,对小肠结肠耶尔森菌、假结核耶尔森菌、肠炎沙门氏菌、大肠埃希菌、铜绿假单胞菌、空肠弯曲菌、泰泽氏菌均无交叉反应。生成的标准曲线的相关系数为0.999,斜率为-3.301,TaqMan MGB探针实时荧光定量PCR效率为100.872%。TaqMan MGB探针实时荧光定量PCR能够准确地从布鲁氏菌阳性样本中检测到布鲁氏菌DNA,最低能够检测到的布鲁氏菌数量为9.3拷贝,比常规PCR方法的灵敏度高100倍。对773份动物样本进行检测,结果TaqMan MGB探针实时荧光定量PCR能检出53份布鲁氏菌阳性样本,而常规PCR只检出37份阳性。结果显示,TaqMan MGB探针实时荧光定量PCR方法比常规PCR方法更敏感,能够直接从动物样本中检出布鲁氏菌DNA,检测时间仅为2h。结论本研究首次建立了直接用于检测动物样本中布鲁氏菌的TaqMan MGB探针实时荧光定量PCR方法,该技术适用于传染性病原体的快速检测与鉴定。     

TaqMan?MGB探针实时荧光定量PCR用于中华按蚊kdr基因突变检测的研究

目的 目的 建立一种用于中华按蚊杀虫剂抗性相关kdr基因突变检测的实时荧光定量PCR方法。方法 方法 根据中华按蚊kdr基因序列及其L1014位点常见的突变类型设计一对引物和三条TaqMan?MGB探针, 对TaqMan?MGB探针实时荧光定量PCR反应体系和条件进行了优化, 选择经测序鉴定后的6种中华按蚊kdr基因常见类型对该方法进行验证, 并用该方法对50个实验室和113个现场中华按蚊样本进行检测。结果 结果 实时荧光定量PCR方法能对中华按蚊kdr基因6种不同的基因型进行检测, 单管法可判断kdr基因L1014是否发生突变, 双管法可对具体突变类型进一步鉴别。经检测, 50个实验室样本均为野生型纯合体, 而113个现场样本中, 仅12个样本为野生型纯合体, 其余101个样本均发生了L1014F或L1014C 突变, 突变频率为87.61%。结论 结论 TaqMan?MGB探针实时荧光定量PCR可用于中华按蚊kdr基因L1014位点突变的检测。     

TaqMan探针实时荧光定量PCR快速检测土拉弗朗西斯菌

目的 建立TaqMan探针实时荧光定量PCR方法(FQ-PCR),快速检测土拉弗朗西斯菌。方法 针对土拉弗朗西斯菌的外膜蛋白fopA基因,利用Primer 5.0设计引物及TaqMan探针,人工合成fopA基因保守片段,克隆到载体作为阳性标准品,进行荧光定量检测,制作定量标准曲线,并以合成fopA基因为模板,PF、PR 为引物,研究其灵敏度、特异性和准确性。结果 构建了含fopA基因的重组质粒,以不同浓度的重组质粒制作标准曲线,在103~107拷贝数之间有较好的线性关系。灵敏度试验表明,该方法可检测到30.6个拷贝数的重组质粒,比普通PCR灵敏度高;特异性试验表明,能选择性检测土拉弗朗西斯菌,而与其他病原菌无交叉反应,与普通菌落PCR结果一致;重复性试验表明,拷贝数为3.06×106样品5次平行试验,标准差为0.201,变异系数为0.88%。结论 本研究建立了TaqMan探针FQ-PCR快速检测技术,具有灵敏度高、特异性强、重复性好等特点,可用于快速、实时、定量检测土拉弗朗西斯菌,为快速检测生物战剂级微生物建立了一种人工合成特异基因TaqMan探针实时荧光定量PCR新方法。     

宁波地区海产品及环境中副溶血弧菌主要毒力及耐药性分析

目的了解浙江省宁波地区海产品和环境中副溶血弧菌主要毒力和耐药性。方法采用生化反应、抗菌药物敏感性试验及PCR方法对分离的宁波地方副溶血弧菌进行毒力及耐药性测定。结果 90株分离株中,耐热直接溶血素基因（tdh）阳性率为2.2%,与神奈川溶血表型（KP,Kanagawa phenomenon）一致,但在tdh＋和KP阳性的分离株中未检测到Ⅲ型分泌系统2（T3SS2）;trh与ureC基因携带率分别为20.0%和12.2%,而在11株trh＋-ureC＋菌株中未显示尿素酶表型阳性,2株尿素酶阳性的菌株未携trh或ureC基因;Ⅵ型分泌系统的携带率为17.8%。所有的分离株对氟喹诺酮类、氯霉素类、四环素类药物敏感;72%以上分离株对青霉素类、磺胺类及氨基糖苷类中链霉素和卡那霉素耐药;分离株中至少耐2种药物,最多耐10种药物,超过82%的分离株对6种以上药物耐药。耐药基因tetB的检出率为0,bla TEM、sul2和strB的携带率分别为91.7%、16.7%和43.3%。结论宁波地区相当比例的菌株携带毒力,并呈现不同程度耐药。     

猪巨细胞病毒TaqMan荧光定量PCR检测的建立

目的 建立一种特异、灵敏、快速检测猪巨细胞病毒的TaqMan荧光定量PCR方法。方法 根据GenBank已登录的猪巨细胞病毒(Porcine Cytomegalovirus,PCMV)DNA序列设计合成特异性引物对和TaqMan荧光探针,经优化反应条件,建立了猪巨细胞病毒的TaqMan荧光定量PCR检测方法(fluorescent quantitative real-time PCR, FQ-PCR),进行了FQ-PCR检测方法的敏感性、特异性和重复性试验;对疑似PCMV 感染临床样品进行了应用检测,并与常规PCR方法进行了比对;对FQ-PCR检测结果为PCMV 阳性猪的不同内脏器官进行病毒含量比较检测。结果 成功建立了PCMV 的FQ-PCR方法,标准曲线的循环阈值(Ct值)与模板浓度有良好的线性关系,相关系数为0.998;检测灵敏度可达1 拷贝/μL,是常规PCR的100倍;特异性高,对pGEM-T/PCMV重组质粒扩增呈现阳性反应曲线,而对6个对照病原的扩增曲线均呈现阴性反应;对不同浓度的pGEM-T/PCMV重组质粒分别重复扩增6次,重复结果良好;对15份临床疑似PCMV感染的组织病料进行应用检测表明,其中有9份样品为阳性,与常规PCR方法检测的阳性符合率为100%。猪的内脏器管中PCMV含量最高为扁桃体,最低的为小肠。结论 成功建立了PCMV FQ-PCR方法,可用于临床上PCMV感染猪的确诊和隐性感染猪的早期检测,对PCMV的快速诊断、综合防控及净化等具有重要意义。     

副溶血弧菌tlh基因的克隆、表达及功能的研究

目的　构建融合表达载体pET32a+-tlh ,获得具有生物活性功能的蛋白。方法　用PCR法扩增tlh全序列 ,克隆入 pET32a +高效表达载体进行诱导表达 ,亲和层析纯化目的蛋白 ,采用逐步透析的复性方法 ,并对复性产物进行功能检测。结果与结论　成功构建了融合表达载体pET32a +-tlh ,在大肠杆菌DE3 中表达产物以包涵体形式存在 ,复性后的蛋白在卵磷脂存在下具有溶血活性。     

Detection of tdh and trh genes in Vibrio parahaemolyticus isolated from Corbicula moltkiana prime in West Sumatera, Indonesia

The occurrence of Vibrio parahaemolyticus in raw Corbicula moltkiana Prime from Lake Singkarak and Pasar Raya Padang market and in cooked samples in West Sumatera, Indonesia, was studied. Thirteen raw and seven cooked bivalve samples were positive using CHROMAgar Vibrio medium. All 47 V parahaemolyticus isolates were positive for toxR gene but negative for trh. However, 36% (17/47) of V parahaemolyticus strains were positive for tdh gene. Antibiotic profiling showed that 76% and 38% of isolates from raw and cooked bivalves respectively were resistant to ampicillin. Using RAPD-PCR analysis, most of the strains were clustered according to their source of isolation but some of the strains from raw and cooked samples were clustered together. These results indicate that pathogenic V parahaemolyticus isolates are present in Corbicula moltkiana Prime in West Sumatera, Indonesia, suggesting that V parahaemolyticus may also be present in seafood in other regions of Indonesia.     

检测贝氏柯克斯体的实时荧光定量PCR

目的采用新型TaqMan-MGB探针建立检测贝氏柯克斯体的实时荧光定量PCR(real-timequantitativePCR)方法。方法根据贝氏柯克斯体特异的23SrRNA插入基因序列设计引物和探针,以克隆的23SrRNA插入基因片段作DNA模板,在荧光定量PCR检测仪(ABI7900型)上建立实时荧光定量检测方法。结果建立的定量标准曲线的循环阈值(Ct)与模板拷贝数呈良好的线性关系(r=0.997);与套式PCR相比较,荧光定量PCR检测敏感性是其100倍。用荧光定量PCR检测其它相关立克次体,检出结果均为0。用荧光定量PCR检测贝氏柯克斯体感染的小鼠脾脏标本,脾脏中贝氏柯克斯体的感染量与感染过程具有相关性。结论本研究建立的检测贝氏柯克斯体的实时荧光定量PCR具有很高的特异性和敏感性,特别适合样本中微量贝氏柯克斯体DNA的检测,其定量检测可用于动物实验中的贝氏柯克斯体感染程度的分析。     

实时荧光定量PCR检测恙虫病东方体

目的建立检测恙虫病东方体的实时荧光定量PCR(quantitative real-ti me PCR)方法。方法根据恙虫病东方体56kD外膜蛋白基因序列设计引物和探针,以克隆的56kD基因片段作DNA模板,建立实时荧光定量PCR检测方法。结果建立的荧光定量PCR标准曲线的循环阈值(Ct)与模板拷贝数呈良好的线性关系(r=0.999)。荧光定量PCR检测恙虫病东方体的灵敏度约为套式PCR的100倍,并且具有良好的重复性。用该定量PCR检测其它相关立克次体和病原菌DNA样本,检出结果均为0。用该定量PCR检测恙虫病东方体实验感染小鼠的血、脾脏、肺脏、肝脏标本,结果脾脏中东方体出现最早和检出量最多,肝脏和肺脏次之。血中的恙虫病东方体量较低。结论本研究建立的荧光定量PCR方法具有很高的特异性和敏感性,可用于东方体感染早期血样本的快速检测作恙虫病感染早期诊断,并且可以定量分析评价恙虫病东方体感染的程度。     

实时荧光定量PCR对兔戊型肝炎病毒(HEV)的检测及评估

目的 兔戊型肝炎病毒(HEV)是近年来新发现的,根据其分子生物学特征可能成为HEV的新基因型。为提高对兔HEV的检出率,本研究设计了针对兔HEV RNA的特异性引物和TaqMan探针并对其进行考评。方法 1)从GenBank中下载14条兔HEV全长序列,分别在其ORF1、ORF3片段的保守区域设计一条TaqMan探针和一对上、下游特异性引物,其中ORF1片段的探针及引物为C组,ORF3片段的为B组;A组的探针及引物为Jothikumar N等所报道的通用引物;2)制备相应的质粒标准品来构建定量标准曲线,并利用上述3套引物、探针对49份兔粪便及44份兔血液样品进行检测,将B、C组检测结果与A组的检测结果进行比较。结果 新建立了两套兔HEV定量PCR的TaqMan探针及引物(B、C组),其标准曲线的斜率分别为-3.455和-3.469;使用上述3套引物及探针(A、B、C组)对49份粪便标本进行荧光定量PCR检测,其HEV RNA阳性率分别为67.35%(33/49)、67.35%(33/49)、57.14%(28/49),平均HEV RNA(log copies/g)拷贝数为6.18、5.90、6.11;44份血液标本的HEV RNA阳性检出率分别为65.90%(29/44 )、56.82%(25/44)、50.00%(22/44),平均HEV RNA(log copies/mL)拷贝数为3.62、3.43、3.03;结果显示以上3组探针及引物均可用于粪便和血液标本的定量检测。结论 兔HEV虽然有其独特的基因结构,但使用HEV通用引物检测不影响检出率。     

宁波副溶血性弧菌临床株毒力基因与多位点序列分型研究

目的 了解宁波地区副溶血性弧菌临床分离株毒力基因分布以及分子分型特征。方法 收集来源于食物中毒和散发腹泻患者副溶血弧菌菌株,利用聚合酶链式反应(polymerase chain reaction,PCR)检测耐热直接溶血素基因(tdh)和耐热直接溶血素相关溶血素基因(trh),利用多位点序列分型(multi-locus sequence typing, MLST)进行分子分型。结果 2006—2012年共分离临床株248株,选择48株进行毒力基因和MLST分型研究。42株tdh+,为93.75%;11株trh+,为22.92%。48株菌株可分为9个ST型和一个未分型,ST3有32株,占66.67%; ST265有5株,占10.42%;ST120有3株,占6.25%。ST3克隆群中tdh+/trh-菌株有25株,占78.16%。与全国其他地区比较,在宁波临床株中发现ST262。结论 tdh+型是宁波地区副溶血性弧菌优势菌株。有9种ST型,以ST3克隆为主,其次为ST265和ST120。ST3克隆中以tdh+/trh-型为主。另发现1个独特的ST262菌株。     

血管紧张素转移酶mRNA在胃癌中的表达

目的 定量分析血管紧张素转移酶(ACE)mRNA在胃癌组织和癌旁组织的表达及其临床意义.方法 采用实时荧光定量PCR检测34例胃癌组织及对应癌旁组织ACE mRNA表达水平,分析其与分化程度、临床分期和转移状态等临床病理特征的相关性.结果 ACE mRNA在胃癌组织中的表达显著高于癌旁组织(P=0.003).胃癌组织ACE mRNA表达与分化程度、临床分期和转移状态等临床病理特征无相关性(P＞0.05).结论 ACE mRNA在胃癌组织中呈明显高表达,提示其与胃癌的发病密切相关.     

纳米磁分离法结合实时荧光定量PCR检测恶性疟原虫的研究

目的 目的 建立恶性疟原虫纳米磁分离实时荧光定量PCR检测方法, 快速准确地检测恶性疟原虫, 为输入性恶性疟 防控提供技术支持。方法 方法 根据恶性疟原虫基因组18S rRNA保守区序列, 设计并合成引物和探针; 构建质粒标准品, 拟 合标准曲线, 采用纳米磁分离法提取核酸, 建立恶性疟原虫纳米磁分离实时荧光定量PCR检测法, 并进行该方法的灵敏 度和特异性评价。结果 结果 与常规法 （镜检法和快检法） 相比, 该方法检测恶性疟原虫更加灵敏, 并具有良好的特异性, 在 （2.5×101 ~ 2.9×108 ）copies/ml拷贝数范围内循环阈值 （Ct值） 与质粒标准品拷贝数的对数值之间存在良好的线性关系 （R2 = 0.999）; 应用该方法从非洲维和部队13名归国人员中检出1例低水平恶性疟原虫感染者, 而常规法 （镜检法和快检 法） 未检出。结论 结论 该方法能够快速准确地检测恶性疟原虫, 在口岸低密度恶性疟原虫感染者的检测中具有很大的应用 价值。