家族性阿尔茨海默病早老素-1基因突变研究

目的　探讨早老素 - 1(presenilin- 1,PS- 1)基因的突变在家族性痴呆患者发病机理中的作用。方法　应用聚合酶链反应 -单链构象多态性 (polymerase chain reaction- single strand conformationpolymorphism,PCR- SSCP)和 DNA测序技术检测 2例家族性阿尔茨海默病型痴呆 (familial Alzheimer′sdisease,FAD)患者、5 3例散发性阿尔茨海默病型痴呆 (sporadic Alzheimer′s disease,SAD)患者、6 0例血管性痴呆 (vascular dementia,VD)患者及 90名健康老年人 PS- 1基因第 6外显子。结果　DNA测序在 SSCP泳动异常标本中发现 112 3位点和 130 0位点发生错义突变 ,其中 ,FAD患者 2例均在 130 0位点发生突变 ,SAD组 2例在 112 3位点发生突变、2例在 130 0位点突变 ,VD组 1例在 112 3位点发生突变 ;112 3位点发生 C→G突变 (Cys2 3Trp) ,130 0位点发生 A→C突变 (Asp2 0 0 Ala)。结论　FAD及 SAD患者存在 PS-1基因第 6外显子突变 ,上述两个突变位点均位于早老素蛋白的重要功能区 ,此突变可能为病理性突变。     

猪Ia相关恒定链定位基元突变对其定位功能的影响

目的研究猪Ia相关恒定链(Ii)胞质区2个亮氨酸基元(Leu7/Ile8和Met16/Leu17)周围氨基酸对基元内膜系统定位功能的影响。方法通过大引物PCR定点突变法,将2个亮氨酸基元及其周围氨基酸分别突变并导入pEGFP-C1真核表达质粒,获得21个突变Ii重组质粒。经LipofectamineTM2000将突变Ii重组质粒分别转染COS-7细胞,荧光显微镜检测突变Ii在细胞内的定位。结果 Leu 7/Ile 8和Met 16/Leu 17独立调控Ii分子的细胞内化。当保留其中一个亮氨酸基元,突变另一个亮氨酸基元周围氨基酸时,GFP-Ii融合蛋白或定位于内膜系统或分布于整个细胞。结论猪Ii链含有2个亮氨酸定位基元,亮氨酸基元的定位功能需要周围特定位置的氨基酸的支持。     

新等位基因HLA-B*40:96的确认及家系遗传

目的 鉴定一个中国汉族人群中发现的人类白细胞抗原(human leukocyte antigen,HLA)新等位基因,调查该基因的家系遗传情况.方法 应用Luminex DNA杂交流式分型技术进行HLA分型,发现1例HLA-B位点反应格局异常,采用DNA测序分型技术进行新等位基因鉴定并对该基因的先证者进行家系调查.结果 DNA序列确定为一个新HLA-B等位基因序列,与同源性最高的HLA-B* 40:06:01相比,在第2外显子有7个碱基不同,分别是302位G→A、309位G→C、311位A→C、313位C→G、314位T→C、317位G→T、319位G→C,并导致相应密码子编码的氨基酸发生了改变,密码子101位由丝氨酸(Ser)→天冬氨酸(Asn)、104位由天冬氨酸(Asn)→苏氨酸(Thr)、105位由亮氨酸(Leu)→丙氨酸(Ala)、106位由精氨酸(Arg)→亮氨酸(Leu)、107位由甘氨酸(Gly)→精氨酸(Arg).家系分析表明该新基因来自先证者父亲.结论 鉴定了一个HLA-B新等位基因,2009年2月被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-B* 40:96.     

变性高效液相色谱检测 PKD2基因突变

目的　利用变性高效液相色谱分析技术 ( denaturing high- performance liquidchromatography,DHPL C) ,检测 2型常染色体显性遗传性多囊肾病致病基因 ( polycystic kidney diseasegene 2 ,PKD2 )突变。方法　收集临床确诊的汉族常染色体显性遗传性多囊肾病 ( autosomal dominantpolycystic kidney disease,ADPKD) 94个家系 ,提取外周血白细胞 DNA,用聚合酶链反应 ( polymerasechain reaction,PCR)扩增目的基因的全编码区 ,DHPL C对 PCR产物进行突变筛选 ,出现异常峰型的DNA片段进行核苷酸序列测定 ,明确突变位点和类型。结果　以 5 0名健康志愿者为正常对照 ,从 94例患者家系中成功检测出 8种突变 ,包括 2种无义突变、3种移码突变、3种错义突变。无义突变分别位于第 5和13外显子 ( 12 4 9C→ T,2 4 0 7C→ T) ,编码氨基酸分别在 4 17和 80 3位形成终止密码子。移码突变分别位于第2、12和 13外显子 ( 6 36 - 6 37ins T,2 348- 2 35 1del AGAA,2 4 0 1del A)。错义突变分别位于第 1、4和 5外显子 ( 5 6 8G→ A,96 4 C→T,116 8G→A) ,其编码氨基酸发生改变 ( 190 Ala→ Thr,32 2 Arg→Trp,390 Gly→ Ser)。结论　所检测出的 8种突变 ,为 ADPKD患者的基因诊断、产前诊断和囊肿前诊断积累了资料     

肺腺癌中p16基因外显子2的突变分析

为了解肺腺癌ｐ１６基因外显子２的突变情况，应用聚合酶链反应（ＰＣＲ）及ＰＣＲ双链ＤＮＡ循环测序技术分析了２２例肺腺癌中的ｐ１６基因，结果显示：２２例肺腺癌中存在２例纯合缺失，３例点突变。其中病例１密码子５６由ＣＴＧ→ＣＡＧ的突变，编码的氨基酸由亮氨酸变为谷氨酰胺；病例１２密码子１２１由ＴＡＣ→ＴＧＣ的突变，编码的氨基酸由酪氨酸变为半胱氨酸；病例１０密码子８０由ＧＡＧ→ＡＡＧ的突变，编码的氨基酸由谷氨酸变为赖氨酸，同时这例密码子７９存在一个由ＣＧＧ→ＡＧＧ的同义突变。另外还发现１例由单碱基缺失导致的移码突变。ｐ１６基因在２２例肺腺癌中纯合缺失频率为９．１％，基因突变频率为２７．３％。可见，多重肿瘤抑制基因ｐ１６与肺腺癌的发生发展密切相关并在其演进过程中起着一定的作用。     

中国人内源性高甘油三酯血症患者载脂蛋白AⅣ基因变异的研究

目的　探讨载脂蛋白 A (apolipoprotein A ,apo A )基因变异是否与中国人内源性高甘油三酯血症有关联 ,为其分子遗传基础提供依据。方法　应用多聚酶链反应 -限制性片段长度多态性及DNA片段序列分析法 ,对成都地区汉族 171名正常人及 10 6例内源性高甘油三酯血症 (hypertri glyc-eridemia,HTG)患者 apo A 基因多态性进行了研究。检测的 apo A 基因位点有 :密码子 9(A→ G突变 ,同义突变 ) ,密码子 34 7(A→T突变 ,错义突变 )、密码子 36 0 (G→T突变 ,错义突变 )及 Msp (内含子 2 C→T突变 )。结果　与正常对照组比较 ,HTG组密码子 9的 G等位基因频率显著升高 (0 .45 3vs0 .36 6 ,P<0 .0 5 ) ,其它位点等位基因频率未见差异 (P>0 .0 5 )。中国人 apo A 基因密码子 9、密码子 34 7和密码子 36 0等位点相应的 G等位基因、T等位基因和 T等位基因频率与欧洲白种人存在明显种族差异 (0 .36 6 vs 0 .0 32 ,P<0 .0 0 1;0 .0 0 0 vs0 .16 0 ,P<0 .0 0 1;0 .0 0 0 vs0 .0 70 ,P<0 .0 0 1)。与日本人比较 ,上述位点的等位基因频率及 Msp 位点 T等位基因频率均差异无显著性 (P>0 .0 5 )。正常男性 apo A 基因密码子 9位点G/G基因型携带者其血清 apo A 水平显著高于 A/A基因型携带者 (P<0 .0 1) ;而 HTG组 Msp 位点     

HLA新等位基因B*5618的序列分析

目的识别确认中国汉族人群中的HLA新等位基因。方法采用聚合酶链反应-序列特异性寡核苷酸探针(polymerase chain reaction-sequence specific oligonucleotide probes,PCR-SSOP)方法、聚合酶链反应-序列特异性引物(PCR-sequence specific primer,PCR-SSP)方法以及基因测序分型(sequence-based typing,SBT)技术,发现1个与HLA-B*5610等位基因相近的未知等位基因。以基因特异性引物单独扩增B*56基因并对第2、3、4外显子进行双向测序,序列经BLAST验证并分析该基因与B*5610基因的核苷酸序列差异。结果该基因为新的等位基因,其序列已被GenBank接受(编号为EF016753)。新等位基因与最接近的B*5610相比,在第3外显子上有4个核苷酸的不同,即第379位C→G(密码子127CTG→GTG,氨基酸127Leu→Val);第412位A→G(密码子138AAC→GAC,氨基酸138Asn→Asp);第419位T→C、第420位A→C(密码子140TTA→TCC,氨基酸140Leu→Ser)。结论该等位基因为新的HLA-B等位基因,2006年9月已被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-B*5618。     

肝豆状核变性基因表达产物及基因突变的研究

目的 探讨肝豆状核变性（Wilson's disease,WD)的发病机理。方法 将活检获得的WD患者肝标本体外分离,培养肝细胞,应用Western印迹法对WD患者肝细胞WD蛋白进行检测,同时扩增其基因组DNA并直接测序。结果 3例WD患者中有2例出现肝细胞WD蛋白特异条带密度降低。DNA测序发现其中一例患者存在ATP7B778位点CGG→CTG（Arg778Leu)杂合突变及770位点CTC→CTG改变。结论 WD基因在WD患者肝细胞的蛋白表达存在异常。可能与ATP7B基因突变有关。     

一个中国近端指(趾)骨间关节黏连家系NOG基因新突变鉴定

目的 检测一个中国近端指(趾)骨间关节黏连家系的致病基因突变.方法 收集该家系患者和家系成员的临床资料,采集外周血提取基因组DNA.运用聚合酶链式反应和Sanger测序法筛查先证者的NOG和GDF5基因.确定突变位点后,在家系成员中进行共分离分析并在200名正常对照中筛查该突变.结果 该家系患者中存在NOG基因c.502 T＞C错义突变,该突变导致其编码蛋白Noggin第168位氨基酸由苯丙氨酸变为亮氨酸(p.F168L).在家系正常成员和200名正常对照中未检测到相同突变.该突变在dbSNP、ExAC等数据库中未见报道.在GDF5基因上未发现可疑突变.结论 NOG基因c.502 T＞C错义突变是该家系发病的原因.     

一组泛耐药鲍曼不动杆菌中发现拓普异构酶Ⅳ编码基因新的变异型

目的 调查一组泛耐药鲍曼不动杆菌中喹诺酮类耐药相关基因的存在与变化状况.方法 收集南通大学附属医院2011年1月-2011年4月患者标本中分离的泛耐药鲍曼不动杆菌共20株,采用聚合酶链反应(PCR)及序列分析的方法分析喹诺酮类药物作用靶位基因gyrA与parC,以及可移动遗传元件可介导的喹诺酮类耐药基因[ qnrA、qnrB、qnrS、qepA、aac( 6')-Ⅰ b-cr].结果 本组20株鲍曼不动杆菌均检出gyrA基因第83位密码子TCA→TTA有义突变(氨基酸序列Ser→Leu).parC基因第80位密码子TCG→TTG有义突变(氨基酸序列Ser→Leu),并同时存在3个同义突变(第40位密码子CCC→CCT同义突变;第41位密码子GTA→GTT同义突变;第44位密码子CGT→CGC 同义突变),且本组parC基因序列为新的变异型.可移动遗传元件可介导的喹诺酮类耐药基因qnrA、qnrB、qnrS、qepA、aac(6’)-Ⅰ b-cr均没有检出.结论 本组鲍曼不动杆菌耐喹诺酮类药物可认为主要与喹诺酮耐药决定区(QRDR)突变相关,发现parC基因新的变异型国内未见报道.     

中国人Wilson病WD基因12号外显子突变研究

目的研究中国人Wilson病(WD)基因第12外显子突变特征. 方法应用聚合酶链反应-单链构象多态型(PCR-SSCP)银染技术研究70例无亲缘关系的WD患者和30例正常组的WD基因12外显子,对有异常泳动者经DNA自动测序技术证实其突变性质和位置.结果正常组未见异常.患者组发现11例异常(11/70占15.7%),二种错义突变,其中9例为Thr935Met突变(9/70,占12.9 %),2例为Lys952Arg突变(2/70占2.8%).结论第12外显子是中国人WD基因突变热区之一,发现一种未见报道的新型错义突变.     

中国人中发现一例Charcot—Marie—Tooth病连接蛋白32基？…

目的 了解中国人进行性腓骨肌萎缩症（Ｃｈａｒｃｏｔ－Ｍａｒｉｅ－Ｔｏｏｔｈ ｄｉｓｅａｓｅ，ＣＭＴ）连接蛋白３２（ｃｏｎｎｅｘｉｎ３２，Ｃｘ３２）基因外显子２的突变情况。方法 对６例无亲缘关系的，无重复的ＣＭＴ１患者和１０例无亲缘关系的ＣＭＴ２患者进行ＳＳＣＰ分析，对有异常者进行测序，根据突变点序列设计合适的内切酶，对５０名正常对照进行酶切分析。结果 在１例ＣＭＴ１患者发生了Ｇｌｙ２１Ａｓｐ（６２     

parkin基因的一个新的点突变

目的：研究parkin基因外显子2-10点突变与散发性早发帕金森病发病的关系。方法：应用聚合酶链反应（polymerase chain reaction ，PCR）、琼脂糖电泳、单链构象多态性（single strand conformation polymorphism，SSCP）、DNA测序及限制性核酸内切酶酶切方法，检测了60例散发性早发帕金森病患者以及120名正常人外周血白细胞DNA的parkin基因外显子2-10点突变。结果：发现1例患者的parkin基因外显子2存在纯合突变（G237→C），限制性内切酶酶切证实，其它外显子未见突变，120名正常对照也未见突变。结论：parkin基因外显子存在点突变，可能与部分散发性早发帕金森病发病有关。     

早发性帕金森病parkin基因的一个新的点突变

目的：观察不同亚型帕金森病（Parkinson's disease,PD）患者中是否存在parkin基因新的突变以及突变的分布，探讨parkin基因在PD发病机理中的可能作用。方法：70例患者被分为早发性PD和晚发性PD，70名正常体检者为对照组。以基因组DNA为模板，扩增parkin基因的全部12个外显子，然后行单链构象多态性（single-strand conformation polymorphism,SSCP）电泳观察，对泳动异常者进行DNA序列测定，以确定外显子中存在的突变及其分布。结果：70例患者中有4例SSCP泳动异常，测序证实1例早发性PD患者的外显子7存在1个未曾报道过的新的点突变位点Gly284Arg。结论：parkin基因点突变也是我国早发性PD患者的致病原因之一。     

Is the presenilin-1 E318G missense mutation a risk factor for Alzheimer's disease?

Nearly all of the presenilin-1 (PSEN-1) mutations are missense mutations leading to Alzheimer's disease (AD). The role of the mutation E318G (a substitution of glutamic acid to glycine) in the PSEN-1 is controversial. It has been found both in AD patients and in non-demented control individuals. Using the polymerase chain reaction and the restriction fragment length polymorphism method, we screened for E318G mutation in a total of 16 familial (FAD) cases, in 64 sporadic neuropathologically confirmed AD cases and in 270 non-demented controls including 35 neuropathologically confirmed individuals. We detected the E318G mutation in four FAD cases, seven sporadic AD cases and 10 control individuals with highly varying onset-ages. Odds ratios for carrying the mutation were 7.6 and 3 in FAD and sporadic AD cases, respectively. Our results suggest that this mutation could be a risk factor in the Finnish FAD and sporadic AD population. It may be in linkage disequilibrium with a pathogenic change somewhere else in the PSEN-1 gene or in close proximity to the PSEN-1 gene.     

Missense mutation in exon 11 (Codon 378) of the presenilin-1 gene in a French family with early-onset Alzheimer's disease and transmission study by mismatch enhanced allele specific amplification. Mutations in brief no. 141. Online. besancon@rockefeller1.univ.lyon1.fr

Mutations in the presenilin-1 (PS1) gene account for the majority of familial early-onset Alzheimer's disease (EOAD) cases. We screened the coding part of the PS1 gene for the present of mutations in a French family with EOAD, using single strand conformation polymorphism (SSCP) analysis. Patients in the pedigree showed a missense mutation in exon 11 of the PS1 gene involving a transition of G to A, altering glycine to glutamate at codon 378. The cosegregation of the mutation with EOAD in the family was studied by allele specific amplification, enhanced by the introduction of a mismatch at the penultimate position near the 3' primer end. The mutation has not been described before and is located within the third large cytoplasmic loop and may lead to the appearance of a short additional a-helix.     

Wilson's病8号外显子突变研究

目的对中国人ＷＤ基因８号外显子进行突变分析。方法对中国人Ｗｉｌｓｏｎ＇ｓ病（Ｗｉｌｓｏｎ＇ｓｄｉｓｅａｓｅ,ＷＤ）４５例患者以及２０例正常人的ＡＴＰ７Ｂ基因８号外显子进行ＳＳＣＰ分析,对有异常者进行测序,根据突变点序列设计合适的内切酶对所有患者进行酶切分析。结果正常组未见异常。患者组发现ｅｘ－ｏｎ８有泳动异常,序列分析证实Ｇ２２７３Ｔ置换,即Ａｒｇ７７８Ｌｅｕ突变。用限制性内切酶ＭｓｐⅠ对４５例患者以及２０例正常对照进行该位点酶切分析,表明正常组未见异常,患者组有２例突变纯合子,占患者总数４．４％,１１例杂合子,占１２．２％。外显子８的Ａｒｇ７７８Ｌｅｕ突变率占ＷＤ突变基因的１６．６７％。检测了２个突变家系。结论８号外显子突变可能是中国人ＷＤ发病的较重要原因。     

中国冠状动脉粥样硬化性心脏病患者MEF2A基因的新突变研究

目的研究冠状动脉粥样硬化性心脏病（简称冠心病）患者MEF2A基因在中国人群突变情况。方法应用聚合酶链反应．单链构象多态性（polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism，PCR-SSCP）和DNA测序技术检测156例散发性冠心病（coronary artery disease，CAD）患者及93名健康人MEF2A基因第11外显子。结果在SSCP泳动异常标本中进行DNA直接测序后发现1例患者MEF2A基因147130（C→A）错义突变（P431Q）、147191（G→T）同义变异以及147108-147128位点21个碱基缺失而导致了7个氨基酸（424QQQQQQQ430）丧失。另有两例患者仅在147108-147128位点发现上述同样的21个碱基缺失而无错义突变和同义变异的改变。健康对照组未发现此错义与缺失突变，却发现存在同样的同义变异。结论冠心病患者在MEF2A基因第11外显子存在新的突变，此突变可能为病理性突变。