miR-10b与肿瘤侵袭转移关系的研究进展

微小RNA(miRNA)是一类进化上高度保守的、内源性的非编码小分子单链RNA,它通过与靶基因相互作用来降解靶mRNA或抑制靶基因的翻译,从而进行转录后的表达调控[1].Lee等[2]和Reinhart等[3]分别在线虫中发现了能调控胚胎后期发育的小分子RNA lin-4和具有转录后调节功能的小分子RNA let-7.     

转录因子Sp1与AP-2的研究进展

正转录因子是能与位于转录起始位点上游50~5 000bp的顺式作用元件、沉默子或增强子结合并参与调节靶基因转录效率的一组蛋白,并能将来自细胞表面的信息传递至核内基因。转录因子通常有几个功能域,可分为DNA结合域、转录调控域及自身活性调控域,DNA结合域可与特定的DNA序列(一般长8~20bp)相互作用,使转录因子与靶基因中特定转录因子结合位点结合起来,进而转录调控域就可发挥其激活或抑制     

AML1基因转染对M-CSF受体基因的转录调节作用

目的 观察AML1B基因及其异构体AML1A对靶基因启动子转录活性的影响，探讨造血干细胞定向分化和白血病发生的机制方法构建AML1A和AML1B的表达质粒，与含有靶基因巨噬细胞集落刺激因子受体（M-CSF-R）启动子的荧光素酶报告质粒共转染非洲绿猴肾CV-1细胞，测定荧光素酶活性，分析AML1A及AML1B对靶基因转录活性的影响。结果AML1B对M-CSF-R具有明显的转录激活作用，这种作用具有明显的序列特异性和剂量依赖性；AML1A无转录激活作用，而且拮抗AML1B，使M-CSF-R的表达水平明显下降。结论AML1转录本结构的完整性对M-CSF-R的转录激活是必需的、AML1A可以干扰AML1B的转录激活作用。     

miRNA与乳腺癌的关系及其研究进展

miRNA是真核生物中一类长度约为22个核苷酸的参与基因转录后水平调控的非编码小分子单链RNA,能通过与靶miRNA特异性的碱基配对引起靶miRNA的降解或抑制其翻译,从而对基因进行转录后的表达调控。目前,人类已发现326个miRNA基因,计算机预测可能会超过1000个,     

胚胎干细胞核心转录因子靶基因集蛋白互作网络特征分析

背景:外源性核心转录因子导入终末分化细胞能产生具有与胚胎干细胞特性相似的诱导多潜能干细胞,其复杂机制目前尚未完全阐明。目的:分析核心转录因子靶基因集蛋白互作网络特征,获得其影响"干性"特征的调控机制。方法:去除BioGRID数据库中的冗余数据,获得非冗余蛋白互作数据库。perl程序搜索靶基因集组成的蛋白互作对,广度优先算法搜索非冗余蛋白互作数据库,获得靶基因集组成的最大连续蛋白互作网络,同时进行1000次随机抽样网络分析。通过Cytoscape软件对网络进行可视化分析。复杂无标度网络Barabasi-Albert模型分析网络特征。结果与结论:核心转录因子靶基因集形成更多的蛋白互作对,最大连续蛋白网络与随机蛋白网络相比具有明显的统计学差异,且核心转录因子靶基因集形成更大的互作网络。网络具有复杂网络无标度特性。该研究通过蛋白互作网络分析证明:靶基因集通过紧密相互作用,形成网络模块方式协调调控胚胎干细胞分子特性。     

胚胎干细胞核心转录因子靶基因集蛋白互作网络特征分析

背景：外源性核心转录因子导入终末分化细胞能产生具有与胚胎干细胞特性相似的诱导多潜能干细胞,其复杂机制目前尚未完全阐明。目的：分析核心转录因子靶基因集蛋白互作网络特征,获得其影响＂干性＂特征的调控机制。方法：去除BioGRID数据库中的冗余数据,获得非冗余蛋白互作数据库。perl程序搜索靶基因集组成的蛋白互作对,广度优先算法搜索非冗余蛋白互作数据库,获得靶基因集组成的最大连续蛋白互作网络,同时进行1000次随机抽样网络分析。通过Cytoscape软件对网络进行可视化分析。复杂无标度网络Barabasi-Albert模型分析网络特征。结果与结论：核心转录因子靶基因集形成更多的蛋白互作对,最大连续蛋白网络与随机蛋白网络相比具有明显的统计学差异,且核心转录因子靶基因集形成更大的互作网络。网络具有复杂网络无标度特性。该研究通过蛋白互作网络分析证明：靶基因集通过紧密相互作用,形成网络模块方式协调调控胚胎干细胞分子特性。     

microRNA-361-5p在人类恶性肿瘤中的研究进展

研究表明,microRNA(miRNA)在恶性肿瘤的发生、发展中起重要作用.miRNA通过各种机制参与细胞基因转录调控,其中与下游靶基因mRNA的特异性结合并使其降解为经典的调控机制.近年来,miR-361-5p在恶性肿瘤中的表达失调得到了验证,通过调节与肿瘤生长、转移、上皮-间质转化(EMT)等方面相关的靶基因,进一...     

缺氧诱导因子-1与缺氧缺血性肾损伤

缺氧诱导因子-1(hypoxia inducible factor-1,HIF-1)是细胞在缺氧条件下产生的具有转录活性的核蛋白,能与靶基因结合,通过转录和转录后调控使机体对缺氧、缺血产生适应性反应。近年来,HIF-1在肾脏缺氧缺血性损伤中的作用也逐渐受到人们的关注。本文就HIF-1的生物学特点,对靶基因的调节及在缺氧缺血性肾损伤中的作用作一综述。     

瘦素和细胞外信号调节激酶2在胃癌及癌前病变中的表达及意义

瘦素是肥胖基因编码的产物,是机体调节能量的重要物质,通过激活特定的信号传导通路,调控靶基因的转录.近来研究发现瘦素与肿瘤的发生密切相关,可抑制肿瘤细胞凋亡、促进其增殖、增加其对基底膜的侵袭能力等.     

microRNA与人脑胶质瘤的研究进展

microRNAs(miRNAs)是一类长度为19~25个核苷酸的非编码小分子RNA,它主要通过与靶基因mRNA3'UTR完全或不完全配对,导致靶标mRNA降解或转录后翻译抑制,参与细胞凋亡、增殖及分化等生理过程.miRNAs可通过调控其靶基因参与的信号通路,调节胶质瘤的形成和发展,发挥癌基因或抑癌基因的作用,与人脑胶...     

微小RNA与乳腺癌的发病风险、诊断和治疗的关系

微小RNA(microRNA或miRNA)是真核生物中一类长度约18～25个核苷酸(nucleotide,nt) 的内源性非编码单链小RNA,具有高度保守性、时序性和组织特异性.miRNA的发现,揭示了真核细胞中一种新的基因表达调控模式;它主要通过与靶基因mRNA 3′端非翻译区碱基互补配对的方式并根据互补程度的不同,抑制靶基因的翻译或导致其降解,实现对基因的转录后表达调控.     

染色质重塑复合物与基因表达调控的研究进展

染色质重塑复合物能够通过与转录因子等多种蛋白质结合实现染色质重塑,在组织特异性表达、细胞核内信号传导、细胞分化、增殖等方面起重要作用.本文对近年来关于染色质重塑复合物家族构成、调控机制、主要方式、启动子区的特异性靶定以及以基因的转录激活或抑制作用等进行综述,以利于对基因调控、细胞因子应答、肿瘤发生、发育和分化等过程中表...     

调节因子X5及其复合物的研究进展

调节因子X5(regulatory factor X5,RFX5)是在人体广泛表达的DNA结合蛋白,它通过结合RFXB和RFXAP形成RFX复合物,主要功能是转录调控主要组织相容性复合体MHCⅡ类基因。研究发现,RFX5还具有转录调控非MHC类靶基因的功能,尤其是与肿瘤相关的研究提示,RFX5可能在免疫系统和肿瘤进程中发挥重要的跨界分子作用。该文综述了RFX5及其组成RFX复合物的生物学特性,以及在裸淋巴细胞综合征、动脉粥样硬化和肿瘤等疾病中RFX5转录调控靶基因的研究进展。     

microRNA-22在特发性肺动脉高压发病机制中的作用

目的 研究血浆microRNA-22 (miR-22)在特发性肺动脉高压(IPAH)诊断中的价值及发病机制中的作用.方法 应用real-time PCR方法检测IPAH患者及匹配健康人血浆miR-22表达水平,结合生物信息学方法分析miR-22靶基因MYCBP,并采用eGFP报告基因对靶基因进行实验验证.结果 IPAH患者血浆miR-22表达水平明显降低(P＜0.01),ROC曲线下面积(AUC)为0.744;生物信息学分析及eGFP报告基因验证,MYCBP是miR-22的靶基因之一.结论 血浆miR-22在IPAH患者表达明显下调,可作为IPAH诊断分子标志物,miR-22通过靶基因MYCBP激活c-Myc信号通路,促进细胞增殖相关基因转录,是导致IPAH患者肺动脉中膜平滑肌增殖及肺血管重构的可能机制之一.     

微小RNA对血细胞分化及功能调控的研究进展

微小RNA(miRNA或miR)是近几年发现的一类长度约22个核苷酸的内源性非编码RNA,通过与靶mRNA互补结合,在转录后水平调节靶基因的表达,是细胞内基因表达的调控机制之一.迄今为止,已在哺乳动物细胞中鉴定出800多种miRNA.     

维生素D受体多态性与肠道CYP3A4表达:维生素D受体基因突变在人群中分布有差异吗?

背景:研究表明,维生素D受体可以诱导肠道中CYP3A4的转录表达,维生素D受体基因的突变将涉及到它自身所翻译的蛋白改变,而其相应的下游靶基因的转录表达或功能亦可能会发生改变.目的:确定HT-29肠细胞中维生素D受体Fokl突变在对其下游靶基因CYP3A4转录的影响.方法:取肝胆管结石患者术中切除的肝脏组织,构建重组真核表达载体pcDNA3.1(-)B-myc/his h维生素D受体(野生型和Fok1突变型),利用瞬时转染技术和双荧光素酶报告基因分析系统在体外HT-29细胞中检测转染不同载体后的细胞在给予不同浓度(1,10,100 nmol/L)的药物1,25(OH)2VD3(维生素D受体的天然配体)处理后,CYP3A4的转录表达情况.结果与结论:将野生型和突变型维生素D受体质粒共转染于HT-29细胞中,在1,25(OH)2VD3孵育24 h后,3个浓度代表CYP3A4mRNA转录水平的荧光素酶活性数值分别与溶煤对照组和空载体对照组相比差异具有显著性意义(P<0.05),且转染Fok1突变型的细胞荧光素酶活性数值稍大于转染野生型的细胞荧光素酶活性数值,但两者间差异无显著性意义(P>0.05).维生素D受体Fok Ⅰ突变体对其下游靶基因的转录表达与维生素D受体野生型没有差异.提示在肠细胞中,维生素D通过维生素D受体诱导CYP3A4转录表达,但是维生素D受体Fokl突变体对CYP3A4的转录与野生型相比差异无显著性意义.     

miRNA-148a在膀胱癌组织中的表达及生物信息学分析

目的 探索miRNA-148a在膀胱癌发生发展中的作用。方法 收集35例膀胱癌组织和16例非癌组织,采用荧光定量PCR方法检测miRNA-148a的相对表达量,并分析其与临床特征的相关性; 采用生物信息学分析,预测miRNA-148a的靶基因和转录因子,构建TF-miRNA-148a-靶基因调控网络图,并对其靶基因进行GO富集和KEGG Pathway分析。结果 miRNA-148a在膀胱癌中的相对表达量(0.0008±0.0002)明显低于非癌组织(0.0021±0.0005)(t=2.46,P＜0.05),其相对表达量在不同性别、年龄、病理分级、临床分期、淋巴结转移组的差异无统计学意义(P＞0.05)。3个软件都预测到的miRNA-148a靶基因268个; 预测到miRNA-148a的转录因子60个,结合评分＞80的结合位点657个; 对268个靶基因进行GO富集分析,发现其靶基因主要涉及神经细胞分化、发育、增殖、mRNA合成,蛋白连接等众多的生物学过程(P＜0.001,相对于背景具有统计意义); KEGG Pathway分析发现268个靶基因参与p53,恶性肿瘤、前列腺癌、PI3K-AKT等信号通路(P＜0.05,相对于背景具有统计意义); 根据构建的TF-miRNA-148a-靶基因调控网络图,挖掘出可能调控miRNA-148a的转录因子有SP1,ESR1,AP1,MYC,BRCA1等; 可能受miRNA-148a调控的基因有IGF1,P27^kip1,NCOA1,PTEN,SERPINE1等。结论 miRNA-148a在膀胱癌中表达下调,可能参与膀胱癌的发生发展,生物信息学分析为后续研究提供一定的思路。     

组蛋白去乙酰化酶抑制剂治疗肿瘤的机制和临床应用研究进展

基因有序的转录调控是机体细胞维持正常功能的前提 ,如果基因转录调控功能紊乱 ,细胞可能发生癌变。核心组蛋白的乙酰化和去乙酰化与基因调控密切相关 ,而负责组蛋白乙酰化和去乙酰化的是一对功能相互拮抗的蛋白酶———组蛋白乙酰化转移酶 (ＨＡＴ)和组蛋白去乙酰化酶 (ＨＤＡＣ) ,它们各自形成的基因转录调控复合物 ,分别称为辅助激活因子(ＣｏＡ)和辅助抑制因子 (ＣｏＲ)。ＨＡＴ乙酰化组蛋白氨基末端、舒展核小体结构、激活基因转录 ,而ＨＤＡＣ的功能相反 ,抑制基因转录。特定基因的表达状态取决于被转录因子定位于靶基因启动子上的Ｈ…     

转录因子KLF14在动脉粥样硬化与2型糖尿病和肿瘤进展中的作用

KLF14作为转录因子中的一员,能与靶基因序列进行特异性的结合,调控靶基因的转录,参与人体生理和病理过程。目前研究发现KLF14在脂肪组织中发挥重要的作用,参与动脉粥样硬化和2型糖尿病疾病的进展,除此之外,作为肿瘤抑制因子参与肿瘤的发生发展。     

微小RNA-92与恶性肿瘤关系的研究进展

正微小RNA(miRNAs)是一类内源性的高度保守的非编码蛋白质的单链小分子RNA。它们通过与靶基因结合,在转录后水平导致靶mRNA的翻译抑制或降解,调节靶基因的表达~([1])。微小RNA-92(miR-92)是近年来发现的一种新型miRNA,含有