高血压相关基因和蛋白质数据库的初构

目的:构建高血压相关基因和蛋白质数据库,以促进高血压医学生物信息学的研究.方法:以GenBank、LocusLink、GDB、GenCard、Proteome等数据库作为信息数据来源;根据高血压相关信息的内容将数据库设计为基因、蛋白质和功能3部分;编写软件从上述信息资源中获取数据,分类整理,存入数据库,利用软件的管理和查询功能对于本地数据进行管理和检索.结果:经过OMIM、文献和相关数据库的检索,目前确定了431个高血压的相关基因,379个蛋白质;建立高血压相关基因和蛋白质数据库,并对其内容进行初步分析.最终实现了网上发布和查询.结论:通过整合现有相关信息,建立一个种类繁多、内容齐全与高血压相关的二级数据库,为高血压和心血管的研究提供一个新的便捷的生物信息查询的工具.     

Reaxys与SciFinder数据库对比分析

Reaxys和SciFinder数据库是化学化工及其相关领域常用的两大重要数据库,对两个数据库从基本情况、检索方法、独特检索功能与应用等方面进行比较分析,指出两者均具有强大的检索和服务功能,指导相关研究人员更好地利用两大数据库的资源。     

心力衰竭相关基因和蛋白质数据库的初构

目的:构建心力衰竭相关基因和蛋白质的数据库,为心血管疾病分子生物学研究提供信息服务.方法:以美国国立生物技术信息中心、欧洲分子生物信息学实验室、美国国立图书馆等知名生物信息组织提供的数据库集群作为信息数据来源;根据心力衰竭的特点设计数据库的结构;编写软件从上述信息资源中自动获取数据,进行分类整理,存入数据库,利用软件的管理和查询功能对于本地数据进行管理和检索.结果:经过对现有基因和蛋白质数据库的检索,目前确定了407条与心衰相关的基因,4 046条相关核酸序列和蛋白质序列;建立心力衰竭相关基因和蛋白质数据库,并对其内容进行初步分析.实现了网上发布和查询.结论:通过整合现有相关信息,建立了一个与心衰相关基因和蛋白质的二级数据库,为心力衰竭的分子生物学研究提供一个新工具.     

壮肾固精方治疗IgA肾病的网络药理学机制

[目的]基于网络药理学预测壮肾固精方治疗IgA肾病的作用机制,为后续相关实验研究提供理论基础.[方法]通过TCMSP数据库和TCMID数据库获得壮肾固精方的有效化学成分和作用靶点,通过OMIM数据库、GeneCards数据库及PharmGkb数据库获得IgA肾病的相关基因,取交集后得到壮肾固精方和IgA肾病的核心基因....     

基于CMap数据库分析骨质疏松症相关基因及潜在治疗药物

目的 基于CMap数据库筛选骨质疏松症（OP）相关基因及潜在治疗药物,为OP的治疗提供新思路。方法 检索GEO数据库中关于OP的相关芯片,采用R语言分析差异基因;检索疾病基因公共数据库,获得已知OP的相关致病基因,通过映射获得OP的致病关键靶点,构建作用靶点的蛋白质-蛋白质相互作用关系（PPI）网络,利用DAVID数据库对关键基因进行GO分析和KEGG通路分析,采用关联性图谱（CMap）数据库筛选出负相关的小分子化合物。结果 检索GEO数据库筛选出GSE56116的芯片,利用R语言分析筛选出69个上调基因和106个下调基因;通过检索GAD、TTD、OMIM、DrugBank、PharmGKB和DisGeNET数据库,得到691个与OP发病相关的已知靶点,通过映射获得OP致病的14个关键基因;DAVID数据库富集分析结果显示,OP关键靶点主要与免疫反应、对过氧化氢的反应、抗原处理和呈递等生物学过程相关。借助CMap数据库结果显示,地高辛、橙皮苷等小分子化合物具有较高的负相关。结论 借助生物信息学和CMap数据库挖掘,地高辛和橙皮苷等小分子化合物可能为OP的候选治疗药物。同时,本研究方法为发现疾病的候选治疗药物开辟了新途径和思路。     

参芪地黄汤治疗糖尿病肾病的网络药理学机制

目的 通过采用网络药理学方法,探讨参芪地黄汤治疗糖尿病肾病(DN)的作用机制.方法 利用TCMSP数据库平台查找参芪地黄汤的有效化学成分及与化学成分相关的潜在靶点,并在UniProt数据库中对靶点的名称标准化.再利用Gene Cards数据库、OMIM数据库筛选出与DN相关的疾病靶点,并通过Cytoscape 3.7....     

基于关联规则和复杂系统熵聚类的活血化瘀法治疗膝骨关节炎的用药规律研究

目的 基于中医传承辅助平台V2.5软件,探讨活血化瘀法治疗膝骨关节炎的组方用药规律.方法检索中国期刊全文数据库(CNKI)、万方数据库(Wanfang)、维普数据库(VIP),收集活血化瘀法治疗膝骨关节炎的相关文献,录入中医传承辅助平台建立数据库,采用关联规则、复杂系统熵聚类等方法进行相关数据挖掘.结果共筛选出155个...     

监测人禽流感疫情及其发展趋势数据库的建立

构建可查询人禽流感疫情、分析人禽流感最新研究进展和趋势的数据库,以利于传染科医生、疾控防疫人员及相关决策者及时、准确的掌握人禽流感疫情相关信息及该领域的最新研究动态和趋势。利用成熟Microsoft Net2.0与AJAX技术,通过互联网和专业医学数据库收集禽流感相关的新闻和文献资料,将相关资料编辑成科学"规范的数据清单格式"后录入数据库。并进一步对相关文献进行数据挖掘,探讨该领域的研究热点和趋势。     

《贵阳医学院学报》加入期刊数据库启事

《贵阳医学院学报》已入编中文科技期刊数据库、中国期刊全文数据库、万文数据-数字化期刊群、中国核心期刊（遴选）数据库、解放军医学图书馆等数据库，刊登在本刊的论文著作权使用费与本刊稿酬一次性给付，不再另行发放。作者如不同意将文章入编相关数据库，投稿时敬请说明。     

SpringerLink及医学期刊资源

介绍SpringerLink的概况及基本使用方法，并对其收录的医学期刊进行分析。SpringerLink期刊数据库是各种数据库性能指标较好的全数据库，从数据库所覆盖的学科范围、容量、检索系统、用户界面等多方面来看，都不失为获取医学相关资源的有效途径之一。     

建立中草药计算机网络药理学网上数据库的构想

在前期研究的基础上,通过文献挖掘,提出建立中草药网络药理学网上数据库的构想.所建立的中草药网络药理学网上数据库将免费提供相关的药用植物、天然产物分子、药物靶标、临床标志物及相关疾病种类,运用Discovery Studio、AutoDock、Pajek、Cytoscape等软件对数据进行处理,综合分析后上传至网上数据库,以供同道参考.中草药网络药理学网上数据库可为揭示中药和复方的科学内涵及深入阐释其作用机理提供可靠的技术平台,并为同类网上数据库的构建提供思路与方法.     

GLS在乳腺癌中表达及免疫逃逸预测

目的 利用生物信息学,探讨谷氨酰胺酶（glutaminase,GLS）在乳腺癌中的表达及免疫逃逸中的作用。方法 运用TCGA、TIMER2.0数据库,生信预测GLS在乳腺浸润性癌中的表达情况;利用STRING数据库、LinkedOmics数据库预测在乳腺癌中GLS蛋白表达及蛋白互作作用;利用TIMER2.0数据库,分析GLS对乳腺癌免疫浸润的影响,探讨GLS对免疫检查点分子表达的影响。结果 GLS mRNA在乳腺浸润性癌中表达下调,与谷氨酰胺代谢相关蛋白表达相关;GLS与免疫细胞浸润相关,且与PD1、PD-L1、CTLA-4等免疫检查点分子表达相关。结论 GLS在乳腺浸润性癌中表达下调,且与肿瘤免疫细胞浸润及免疫检查点分子表达相关。     

加强医院图书馆循证医学馆藏文献建设

为满足临床信息用户循证医学证据检索需求,医院图书馆应该加强循证医学馆藏文献建设,包括引进循证医学研究证据数据库、加强相关专业图书和现刊采访力度以及建立相关网络资源导航数据库等途径.     

基于网络药理学的苇茎汤治疗非小细胞肺癌的作用机制研究

目的:使用网络药理学技术探索苇茎汤治疗非小细胞肺癌的潜在作用机制.方法:结合CNKI数据库、PubMed数据库相关文献与TCMSP数据库筛选出苇茎汤的活性成分,然后通过TCMSP数据库、Swiss Target Prediction数据库获取活性成分的潜在靶点,运用Cytoscape构建"中药?活性成分?靶点"网络图....     

循征医学在临床实践中的应用（三）循证医学证据的来源及分类检索

筛选证据来源和检索最好的证据是临床医生在临床决策中实践循证医学的重要步骤之一,同时也是进行循证医学研究的不可缺少的步骤。目前可提供临床医生使用的数据库较多,检索途径和方法也多种多样,但只有针对临床需要进行检索策略的设计,并针对现有条件,才能确定什么是当前最相关的数据库和基本相关的数据库。为了更有效地获取证据,对证据的检索可分类、分步骤进行,并应先检索对临床工作最有指导价值的最相关的数据库,不能满足需要时再检索基本相关的数据库。以下分类列出对循证医学临床实践有帮助的信息资源以及检索中应注意的问题。1用于临…     

冬虫夏草的化学成分与药理作用分析研究

通过检索中国学术期刊全文数据库医药卫生专辑相关文献577篇,中文科技期刊全文数据库相关文献292篇,重点分析研究冬虫夏草的化学成分、药理作用及其防治系统性红斑狼疮、系统性硬皮病的报道,为冬虫夏草在临床上更广泛的应用提供思路。     

循证医学在临床实践中的应用(三)循证医学证据的来源及分类检索

筛选证据来源和检索最好的证据是临床医生在临床决策中实践循证医学的重要步骤之一,同时也是进行循证医学研究的不可缺少的步骤.目前可提供临床医生使用的数据库较多,检索途径和方法也多种多样,但只有针对临床需要进行检索策略的设计,并针对现有条件,才能确定什么是当前最相关的数据库和基本相关的数据库.为了更有效地获取证据,对证据的检索可分类、分步骤进行,并应先检索对临床工作最有指导价值的最相关的数据库,不能满足需要时再检索基本相关的数据库.以下分类列出对循证医学临床实践有帮助的信息资源以及检索中应注意的问题.     

循证护理对手足口病合并脑炎患儿干预效果的Meta分析

目的 系统评价循证护理对小儿手足口病合并脑炎患儿干预效果和安全性.方法 检索文献数据库获取相关文献资料,中文数据库包括中国知网数据库(CNKI)、维普数据库(VIP)、万方数据库、中文生物医学文献数据库(CBM)等;外文数据库包括PubMed、EMBASE、NCBI、Medline、Web of Science、Coc...     

从信息分析角度聚焦辅助性T细胞研究现状

利用文献计量学和统计分析等信息分析方法,分析SCIE数据库、NIH RePORTER项目数据库、DII专利数据库、Clinicaltrials数据库和Thomson Pharma药物数据库收录的Th细胞相关信息,了解该领域研究现状。指出我国应加大Th细胞研究领域的科研投入,加快基础研究向临床应用的转化,在重视科研产出量的同时更要着重提高科研质量。     

联机检索策略

用户的情报需求必须通过填写规范化的提问单来表达。查找课题的清楚表达是提高检索效率的关键。1选择数据库1．1明确数据库所收录的内容范围所选数据库的内容，必须与检索课题同属一个专业范围。在选择数据库时既不要偏选，也不能重复。对检全相关文献要求较高，应把相关的数据库或包含有相关内容的数据库都选为检索对象。对检索课题的专指性要求比较高，应选择与检索课题完全一致的数据库。1．2应注意数据库的标引方式一般每个库却有主要素引和辅助索引，即主要检索途径和辅助检索途径。主要检索途径大多是主题检索与分类检索，抗助检索途…