医学信息学的研究领域及人才培养

医学信息学(MedicalInformatics,又称医药信息学)是计算机科学、信息科学与医学科学结合,新近形成的前沿多学科交叉的科学,它以信息论、系统论、计算机科学技术为理论基础,几乎全方位地涉及所有的医药卫生领域,已成为现代和未来生物医学发展的基石。目前,医学信息学应用的领域,面临人才短缺的现象,本文论述了在生物医学工程学科中,建立医学信息本科专业方向,通过相关课程体系的设置,培养符合社会需要的医学信息人才。     

从社会物理学、社会生物学，到社会信息学

本文回顾研究社会现象的学科归属的历史演变。起初,它叫社会物理学,借用若干物理一数学方法,却不属于物理学;后来,它叫社会生物学,研究社会的生物学因素和特征,却不是一门生物学;现在,人们看到：社会的本质是文化存在,正在建立一门社会信息学,它在信息科学体系中是与自然信息学相平行的一个分支。     

整个大自然是一个有目的的存在——理解自然信息学和社会信息学的目的论原理

上世纪中叶以来，曾经被物理学革命打入冷宫的目的论的自然观复活了，成为理解自然奥秘的研究纲领。对此．汉斯。约纳斯从三个角度对自然目的性进行了论证：人为事物的目的归根结底是人的目的；主体性存在者的目的则是属于生命体本身的；非人为而又非生命的事物整体可称为前意识的自然界，它也是有目的的，因为它是主体性存在的土壤，其目的通过主体性的存在者表现来。本文试图说明，由于控制论、系统论和信息科学所解释的目的论原理成为自然信息学和社会信息学研究的共同纲领，因此就构成理论信息学的目的论原理：“程序目的论”。     

社会信息科学视野：宏观、中观与微观

研究社会信息系统，可以有宏观、中观和微观三种不同的视角，观测到三个不同的领域。从宏观的角度看，人类是整个地球生态系统的一个组成部分，其本质特征是以符号为载体的社会文化，记录着人类前仆后继的思想探险的历史。中观社会信息的承载者是人类的各种组织，包括靠血缘与感情维系的家庭，靠理性与功利维系的单位，靠法律与规范维系的国家等等，所有的人都同时生活在这些初级群体和社会组织当中，依照各种各样的角色需要进行程序设计。从微观的角度看，社会是个人与个人之间以符号为载体的信息互动的结果，”个人主义”是微观社会信息学的出发点和理论前提。在上述三个领域中分别展开的决策理论是因应自为性、把握复杂性的主要手段。     

关于生命信息学研究的回顾与展望

本文的目的是回顾八年来关于生命信息学研究的基本过程，并就这个新兴边缘交叉学科在今后几年的发展提出若干设想。概略地说，可以把相关的研究分为三个阶段。一是关于生命信息学基本思想和概念的形成（１９９２～１９９５），二是其知识体系基本框架的逐步确认（１９９５～１９９８），三是作为学科特定术语集的初步建立（１９９８～２０００）。今后的几年内，关于生命信息学的研究任务是在深入、细化总论的同时，展开对各论的研究，构成生物分子信息学、细胞信息学、个体信息学、社会信息学四大分支，并逐步填平跨在自然科学和社会科学之间的鸿沟。     

首届全国功能神经影像学和神经信息学研讨会纪要

为交流近年来功能神经影像学和神经信息学的研究成果，进一步加强不同学科间的交叉和融合，中国解剖学会断层影像解剖学专业委员会和全国神经信息学联络组于2003年10月21～23日在济南市山东大学医学院联合召开了首届全国功能神经影像学和神经信息学研讨会。有来自全国25个省、市、自治区的解剖     

响应时代的呼唤,开创关于生命信息学的研究

生命信息学是在生命科学和信息科学的交叉点上生长起来的新兴边缘交叉学科。随着社会生产的主流由物质产品转向信息产品，信息科技日益成为当代高新科技的主导与核心。生物学的重心正在由生命硬件转向生命软件，医学和农学已呈现出明显的“信息化”趋势。基因工程、癌细胞程序性死亡疗法、心理门诊等信息学疗法，迫切地需要理论上的支持与说明。计算机科学的并行分布式处理急需向生命信息处理过程学习。时代呼唤着生命信息学。生命信息学的创立和发展，不仅需要生命科学 、信息科学工作者的参与，而且需要数学、物理、化学、哲学、心理学、以及许多社会文化方面的学者的合作。     

理论信息学:概念、原理与方法(Ⅱ/Ⅵ)

本章说明与论题相关的背景情况。本文选题的必要性直接来自信息时代对理论信息学的呼唤。本章的任务是阐述：信息社会没有自己特有的信息科学知识体系；现有的领域信息学由于研究对象特殊、思想方法局限、又受到物理学范式束缚，不可能揭示各类信息现象中的一般规律：所以，关于理论信息学的研究是科学发展和社会进步的迫切需要。     

展望21世纪 从医药信息学到生命信息学

本文说明信息学与医学相结合的新趋势：从医药信息学到生命信息学。基于五年来的研究与探索，作者提出生命信息学的基本概念，主要原理和知识结构。生命信息学是生命科学与信息科学的边缘交叉学科。当前的医药信息学以传统的生物学为基础，以医疗信息化为目标。生命信息科学的任务是使传统生命科学信息化，全面修订传统的生命观、人体现、健康观、诊疗观及预防观。随着生命信息医学及其疗法的建立与完善，当前的医药信息学将逐步改观。生命信息学的基本原理包括：信息唯物论原理、一般信息学原理、信息决定论原理等。以生命信息运动的层次性为依据，生命信息学的主要分支为：分子信息学（包括遗传信息学），细胞信息学，器官信息学（包括神经系统信息学），个体信息学（包括人体心理学），种群信息学（包括社会心理学、管理科学等）。生命信息学将会成为２１世纪中的新兴带头学科，它不仅给生命科学和医学带来革命性的改变，而且对信息科学、哲学及人文科学也造成重大影响     

从“我思故我在”到“社会思故社会在”——兼谈社会认识论与社会信息科学的逻辑出发点

本文提出和说明一个命题,“社会思故社会在”,认为它是社会认识论与社会信息科学的逻辑出发点。生命世界具有层次结构。站在人类个体的层次上观察,个人通过他的大脑在恩维着;他的每一个细胞都不能思维,即使神经细胞也不能;他所身居其中的社会不能思维,因为社会本身没有类似于人脑的社会脑存在。但是,从理论信息学的角度看,社会、个人、细胞、甚至DNA和生物分子具有“输入-处理-输出”（IPO）的共性,都在“思维”着,其间的区别只是思维的结构和内容不同。如果说工业时代的个体认识论的第一假设是笛卡尔的“我思故我在”,那么信息时代的社会认识论和社会信息科学的第一假设就应当是“社会思故社会在”。     

从理论信息学角度看软件生命周期模型的演变

理论信息学是关于宇宙间一切信息现象的基本法则，与其它一般信息学概念和方法构成了整个信息科学的核心。它在理论和实践中有着普遍的应用.本文主要从理论信息学的角度分析了软件生命周期的演变及其本质。本文指出软件开发人员应该能利用理论信息学这一工具，进一步认清软件的实质，并以它为基础提出更好的软件开发理论与技术．     

生命信息科学的诞生

高度密集的信息，特别是以计算机开发和应用为主的现代模糊信息学包括文献信息学，管理信息学等，都应归属于非生命的信息学科学，而生命信息学则是学术领域的新生儿，它以独创一帜的科学依据，与众不同的崭新的思维方式，在信息科学基础理论研究中将领袖群雄，下文主要谈及生命信息科学诞生与发展有关的几个群为人知的问题。     

医学信息学研究的某些进展

医学信息学是一门新兴的交叉学科，近年来的研究已取得重大进展，本文从医学信息学的沿革及现状，医学信息学研究的范围及内容，医学信息学教育及医学信息学的发展与人才培养等四方面进行论述。     

论生命信息学研究中的方法创新

本文说明方法论上的创新是生命信息学研究的前提，从哲学本体论和方法论上突破，建立一般信息学方法的基础，以及探讨生命信息领域特有的方法论问题，就成了关于生命信息学研究工作的必然结果。     

响应时代的呼吸,开创关于生命信息学的研究

生命信息学是生命科学和信息科学的交叉点上生长起来的新兴边缘交叉学科。随着社会生产的主流由物质产品转向信息产品，信息科技日益成为当代高新科技的主导与核心。生物学的重心正在由生命硬件转向生命软件，医学和农学已呈现出明显的“信息化”趋势。基因工程，癌细胞程序性死亡疗法，心理门诊等信息学疗法，迫切地需要理论上的支持与说明。     

关于我国医学信息技术的发展

本刊编委，浙江大学段会龙教授负责了本专题的策划、组稿和审阅工作，首先我们对段教授为此所付出的辛劳表示衷心的感谢! 过去十年中，计算机在生物医学等领域的广泛应用，形成了大量的各类生物医学数据。如何有效地组织、分析、管理和利用这些数据成为新时期生物医学工程的挑战，并推动了生物医学信息学（Biomedical Informatics）的飞速发展。 生物医学信息学可理解为医学信息学（Medical Informatics）和生物信息学（Bioinformatics）的结合。医学信息学是一个利用计算机和信息技术进行医学信息交换、理解和管理的领域，其最终目的是在合适的时机和场所为医学临床决策提供支持，涵盖了所有与医学数据和知识应用相关的数据结构、算法及系统研究，包括基于生物医学信号处理、医学成像及图像处理等方法提供临床诊疗支持，面向各类医疗仪器和设备的数据采集、传输、管理和应用，以及以患者为中心的各类医疗信息系统等。当前该领域的研究重点是电子健康档案（或称电子病历），通过解决个体综合医疗健康数据的生成、融合、存储、传输、管理和利用，实现医疗卫生健康的高质量和低成本。目前很多国家和地区均已制定了长期的国家计划进行全民电子健康档案的建设。生物信息学伴随基因组学的研究而产生，主要研究分子级别的生物医学信息的储存、检索和利用。进入后基因组时代后，对基因型和表型关系的阐述成为其研究重点，近年来各类研究成果逐渐走入临床应用（如生物芯片等）。生物信息学和医学信息学的边界趋于模糊，互相渗透和结合的趋势明显。广义上，生物医学信息学可定义为与医疗服务、生物医学、公共卫生等领域中信息和知识的集成、管理和利用相关的，理论与实践研究相结合的交叉性学科领域。 生物医学信息学的研究内容非常广泛，覆盖了从生物医学基础理论到医疗卫生应用的各个层次，包括新型的信息获取技术、数据标准化、广域数据交换、信息安全、高性能大规模计算、新设备和硬件技术应用、管理信息系统、电子病历、l临床决策支持、工作流优化、远程医疗、自我看护、公共卫生预警、教育研究和管理、蛋白质组学、基因芯片、生物系统仿真等，很难对其进行清晰而完整的描述。本专题所邀请的该领域的几位专家从不同的侧面对生物医学信息学的一些研究工作进行介绍，以期为广大科研工作者提供一个关于生物医学信息学领域发展的概览。最后，我们要特别感谢俞梦孙院士对本专题的支持，并特为本专题撰写了关于我国医学信息技术发展的评述。     

理论信息学的发展现状

在当今社会,信息技术高速发展,许多传统的学科纷纷接受信息化,衍生出医学信息学等领域信息学.领域信息学的发展,"国家信息化"以及社会转型的提出催生了理论信息学.本文主要介绍了理论信息学的产生过程及其国内外发展现状,并提出理论信息学的发展需要改变以往的物理学科学范式,转向信息学科学范式.     

人工神经网络在基因组信息学中的应用

在信息处理技术的推动下，基因组学研究不断走向深入。伴随着由此带来的信息爆炸，以分析和挖掘基因组数据信息为基本内容的基因组信息学应运而生。随着基因组信息学的研究不断深入，相关计算机技术的发展将发挥日益重要的作用。人工神经网络作为一种并行的计算模型，在特征识别与分类的实现方面表现出优良的特性，非常适合于基因信息学的研究，并在实践中得到了广泛的应用。本对人工神经网络在基因组信息学中的常用模型、运用实例及其发展前景进行综述。     

医学高等教育开设医药信息学课程的必要性

信息技术的迅猛发展 ,引起了社会各个领域的广泛革命 ,信息技术在医学领域中的应用也日新月异 ,并在医疗、教学、科研等方面发挥巨大作用。但是目前在医学院校中 ,医药信息学方面教学内容分散而不完整 ,与现实要求相去甚远。从长远来看对医学人才的培养是不利的。因此在医学院校中开设系统的医药信息学课程是非常必要的。医药信息学课程有利于医学生了解信息技术在医学领域的最新应用 ,掌握获取信息和处理信息的方法 ,学会科研工作中的检索、选题、立题、查新等工作。为今后的医疗、科研、教学等工作打下良好基础。医药信息学是处理与人类健…     

理论信息学视野中的新闻传播过程

理论信息学认为，构成宇宙的基本要素有四种：物质、物质能；信息、信息能。对于人类社会，“信息”就是知识，包含感性知识和理性知识：“信息能”就是智能，主要是符号处理能力。作为大众传播范畴之一的新闻传播，其过程是智能作用下的信息通讯和反馈控制。因此，智能化程度高低在很大程度上决定着新闻传播中实现新闻价值的大小。理论信息学中信息二重性等概念和理论也都适用于于新闻传播现象的认识，比如新闻价值的实现就体现出新闻传播过程中“信息载体”和“纯粹信息”的二重性。本文作者认为，用理论信息学的基本概念、原理和方法采考察新闻传播过程，对新闻传播学理论的完善和大众传媒事业的发展，可以起到很重要的促进作用。