慢性苯中毒发病风险与XRCC1基因多态性关联的病例对照研究

采集病例组慢性苯中毒(CBP)患者102名、对照组204名人员静脉血,应用PCR探针法和引物延伸SNa Pshot法检测XRCC1 rs25487、rs25489、rs1799782 SNP位点基因型,分析基因多态位点和CBP易感性的关联,以比值比(odds ratio,OR)及其95%可信限(95%confidence interval,95%CI)表示关联强度。结果显示,XRCC1rs25487CT基因型(ORadj=5.146,95%CI=2.441~10.852,χ2=21.098,P0.05)或TT基因型(ORadj=13.985,95%CI=6.440~30.371,χ2=56.316,P0.05)、rs1799782 AA基因型(ORadj=2.012,95%CI=0.926~4.372,χ2=5.100,P0.05)可使CBP发生风险增高,未发现XRCC1 rs25489位点与CBP发生的关联。提示XRCC1 rs25487 CT或TT基因型、rs1799782 AA基因型多态可能作为CPB发病危险性增加的生物学标志之一。     

汉族人群XRCC1基因多态性与神经胶质瘤易感性的相关性研究

目的探讨X线交错互补修复基因1(XRCC1)基因多态性与神经胶质瘤易感性的相关性。方法对368名汉族脑胶质瘤患者和346名健康对照者进行基因分型,XRCC1 Arg194Trp(rs1799782)、Arg280His(rs25489)、Arg399Gln(rs25487)三种多态性进行直接测序。结果胶质瘤组Arg280His A等位基因频率显著低于健康对照组中频率(9.65%vs 16.04%,OR=0.60(0.46~0.80),P0.001);GA与AA基因型频率两组间差异有统计学意义(16.58%vs 22.83%;1.36%vs 4.63%)。Arg399Gln A等位基因频率胶质瘤组显著高于健康对照组(38.72%vs 30.06%,OR=1.29(1.11~1.49),P=0.001);GA或AA基因型的频率两组差异有统计学意义(45.38%vs 38.15%;16.03%vs 10.98%)。rs1799782(Arg194Trp)等位基因或基因型频率未发现不同。结论中国汉族人群XRCC1基因Arg280His(rs25489)和Arg399Gln(rs25487)多态性可能会影响胶质瘤的易感性。     

细胞色素P450 CYP1A1基因多态与鼻咽癌易感性的关联分析

目的 利用以核心家系为基础的关联研究探讨细胞色素P450酶系(cytochrome P450,CYP450)CYP1A1基因m1和m2多态性并分析其与鼻咽癌易感性的关联.方法 收集457个广东鼻咽癌核心家系(每个核心家系由患者和父母或同胞构成)共2134名成员作为研究对象,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法对CYPlAl基因单核苷酸多态性(SNP)位点m1和m2(其参考编号分别为rs4646903和rs1048943)进行基因分型.挑选PCR产物测序验证.运用家系为基础的相关性检验(family-based association test,FBAT)软件分析这两个多态位点的基因型及其单体型与鼻咽癌易感性的关联.结果 FBAT软件分析结果 显示,位点m1和m2的微效等位基因频率(MAF)分别为0.442(C)和0.339(G).其中无论是否根据EB病毒壳抗原抗体(VCA-IgA)分层,m1位点与鼻咽癌的易感性之间关联均无统计学意义[未分层:X2=2.399,P=0.301;分层后:低滴度组(VCA-IgA<1:80),MAF=0.457(C),X2=1.221,P=0.543;高滴度组(VCA-IgA≥1:80),MAF=0.427(C),X2=2.832,P=0.243];对m2位点来说,末根据VCA-IgA分层时,该位点与鼻咽癌的易感性之间关联无统计学意义(X2=2.694,P=0.260).分层后,在低滴度组,累加和显性模式下,位点m2等位基因G显示了从亲代到子代传递减少[MAF=0.347(G);Z<,累加>=-2.120,P<,累加>=0.034;Z显性=-2.303,P显性=0.021],全局统计也提示了传递的改变(X2=5.394,P=0.067);由这两个位点构建的单体型TG(0.057)可能降低鼻咽癌的发病风险(Z=-2.002,P=0.045),全局统计也提示CYP1A1基因单体型可能与鼻咽癌易感性有关系(X2=7.067,P=0.070).结论 以家系为基础的相关性研究发现CYP1A1基因多态位点m1与鼻咽癌的易感性之间关联无统计学意义,位点m2基因多态性可能与鼻咽癌的发病风险降低有关系.     

19q13相邻基因多态性与慢性苯中毒发病风险关联的病例对照研究

目的探讨共同位于19q13基因ERCC1,ERCC2,XRCC1,PPP1R13L,CD3EAP的单核苷酸多态性(SNP)与慢性苯中毒(CBP)发病风险的关联,找寻慢性苯中毒易感人群的生物标志,并为CBP的早期防治提供科学理论依据。方法 CBP确诊患者100例,按照1∶2匹配同样接触苯的健康对照200例,采集血样2 ml,提取DNA,采用SNa Pshot检测XRCC1 rs25489,PPP1R13L rs1005165及rs1970764;Taq Man Real time PCR探针法检测ERCC1rs11615,ERCC2 rs13181、rs1799793、rs238406,XRCC1 rs25487、rs1799782及CD3EAP rs967591多态基因型。结果ERCC1 rs11615,XRCC1 rs1799782,XRCC1 rs25487多态性与慢性苯中毒发病风险相关,ERCC1 rs11615 TT和XRCC1rs25487 TT基因型均可使CBP发生风险增高(ORa=3.236,95%CI 1.353~7.740,χ~2=6.875,P=0.009;ORa=2.093,95%CI 0.966~4.533,χ~2=5.642,P=0.018),XRCC1 rs1799782 AA和AG基因型均可使CBP发生风险降低(ORa=0.074,95%CI 0.034~0.160,χ~2=45.128,P=0.000;ORa=0.357,95%CI 0.195~0.653,χ~2=12.168,P=0.000)。尚未发现其他基因多态与CBP发病风险的关联。结论在相同苯作业环境下,携带ERCC1 rs11615 TT、XRCC1 rs25487 TT基因型的个体发生慢性苯中毒的风险增高,上述基因多态可能成为预测慢性苯中毒的生物学标志。     

趋化因子CXCL10单核苷酸多态性与慢性乙型肝炎遗传易感性的关系

目的 探讨IFN γ诱导蛋白10(CXCL10)单核苷酸多态性(SNP)位点rs4257674和rs4256246的多态性和中国人群慢性乙型肝炎(CHB)遗传易感性的关系.方法 采用多通道Snapshot分型技术检测501例CHB患者(CHB组)和301例自限性乙型肝炎者(对照组)CXCL10基因rs4257674和rs4256246的多态性,计算和分析基因型、等位基因频率和单体型频率.结果 CXCL10 rs4257674位点多态性在CHB组和对照组组中的等位基因频率(OR=2.347,95％CI:1.478～3.729,x2=13.763,P＜0.01)和基因型分布(x2=12.910,P＜0.01),差异有统计学意义;rs4256246位点多态性在CHB组和对照组中的基因型分布(x2=1.795,P＞0.05)、等位基因频率(OR=1.107,95％ CI:0.897～1.366,x2=0.899,P＞0.05)差异无统计学意义.rs4257674和rs4256246两位点构成的单体型C/T在CHB组和对照组频率分布差异有统计学意义(OR=2.139,95％CI:1.340～ 3.413,x2=10.597,P＜0.01);单体型C/C、T/C频率分布在两组之间差异无统计学意义(x2C/C=0.262,x2T/C=1.342,P＞0.05);单体型T/T频率＜0.03.结论 CXCL10基因多态性位点rs42.57674可能与中国人群CHB发病相关.     

TSC1、TSC2基因多态性和儿童孤独症的家系研究

目的 探讨结节性硬化症(tuberous sclerosis complex,TSC)相关基因TSC1、TSC2基因多态性与儿童孤独症之间的关联。 方法 利用SNaPshot基因分型技术,在97例孤独症核心家系中,对TSC1、TSC2基因上的8个标签SNP,即rs3761840、rs2809244、rs1050700、rs739441、rs2074968、rs2074969、rs2072314、rs8063461进行分型;通过FBAT软件及Haploview软件进行基于家系的单倍型分析。 结果 1)基于家系的关联分析发现8个SNPs等位基因中有2个SNPs的等位基因倾向于过传递(rs1050700 A:Z=2.708,P=0.006769;rs2074968 G:Z=3.244,P=0.001180),并且经过FDR校正后,2个SNPs仍显示出与孤独症之间存在显著关联性(校正P值分别为0.027,0.014)。2)rs3761840-rs2809244基因型的单体型A-C显示出显著的传递不平衡,双亲较少传递给子女(Z=-2.297,P=0.021629)。rs2074968-rs2072314基因型的2种单体型即 G-C及C-C均显示出显著的传递不平衡,单体型G-C能从双亲过传递给子女(Z=2.596,P=0.009444),单体型C-C则相反(Z=-3.657,P=0.000256)。 结论 TSC1、TSC2基因可能与儿童孤独症的发生存在关联。     

XRCC1基因rs915927位点多态性与食管癌易感性的研究

目的 探讨x射线交叉互补修复基因1(X-ray repair cross complementing group one,XRCC1)位点多态性与食管癌易感性的关系.方法 采用病例对照研究的方法,收集食管癌病例143例,对照165例进行食管癌相关因素问卷调查并采用聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)进行基因分型,分析XRCC1基因rs915927多态与食管癌的关系.结果 XRCC1基因rs915927位点基因型A/A、A/G+ G/G,在病例组的比例分别为92.31％、7.69％,在对照组的比例为83.64％、16.36％,两组间差异有统计学意义(x2=5.33,P=0.021).等位基因A、G在病例组和对照组的分布分别为95.45％、4.55％和91.21％、8.79％,差异有统计学意义(x2=4.34,P=0.037).携带有XRCC1基因rs915927突变杂合子(AG)和突变纯合子(GG)的个体发生食管癌的危险性比携带野生纯合子(AA)个体低(OR=0.43,95％CI:0.21 ～0.90).结论 XRCC1基因rs915927多态可能与长治地区食管癌的发生有关.     

哺乳动物雷帕霉素靶蛋白复合物1调节相关蛋白基因多态性与肝细胞癌遗传易感性的关联研究

目的探讨广西地区人群哺乳动物雷帕霉素靶蛋白复合物1调节相关蛋白基因(Regulatory Associated Protein Of m TOR,complex 1,RPTOR)潜在功能性单核苷酸多态性位点(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)与肝细胞癌(Hepatocellular Carcinoma,HCC)遗传易感性的关系。方法采用以医院为基础的病例对照研究方法,以1 048例HCC患者和1 052例年龄、性别匹配的非肿瘤对照为研究对象,对候选的RPTOR基因潜在功能性SNPs(rs3751934CA、rs1062935 TC、rs3751932 TC及rs12602885 GA),应用Taqman-MGB荧光定量PCR方法进行基因分型。结果未发现RPTOR基因单个SNP位点与HCC遗传易感性之间存在显著性统计学关联;进一步按年龄、性别、民族、吸烟史、饮酒史和乙型肝炎病毒感染等因素进行分层分析,结果发现,在乙型肝炎病毒感染者中,RPTOR rs1062935多态性位点与HCC遗传易感性之间存在显著性统计学关联(OR=1.48,95%CI=1.01~2.18),而且该SNP位点与乙型肝炎病毒感染存在交互作用(Pinteraction=0.048)。结论本研究结果提示RPTOR基因rs1062935位点可能与HBV相关HCC的遗传易感性有关。     

5-羟色胺受体1B基因多态性及其与振动性白指关联分析

目的 检测手传振动作业工人5-羟色胺受体1B基因(HTR1B)多态性位点,分析HTR1B基因多态性与振动性白指(VWF)的关联性.方法 对HTR1B再测序筛查多态性位点,其与VWF的关联性采用Logistic回归分析,采用Haploview软件进行其遗传特征和连锁不平衡(LD)分析.结果 筛查到7个已知单核苷酸多态性(SNP)位点,各位点基因型频率均符合Hardy-Weinberg平衡(P＞0.05).rs17273700、rs11568817与rs130058之间、rs6296与rs6298之间均呈强LD,rs17273700与rs11568817为完全LD.校正年龄、工龄、吸烟和饮酒等混杂因素前,rs17273700突变杂合型AG(P=0.034)、rs11568817位点突变杂合型AC(P =0.034)、rs6298位点突变杂合型AG(P=0.030)与突变纯合型GG(P=0.023)和rs6296位点突变杂合型GC(P =0.022)与突变纯合型CC(P =0.012)等突变基因型相对其各自的野生纯合型,均呈现可能增加VWF易感性的趋势(P＜0.05);校正混杂因素后,上述突变基因型与VWF易感性之间的关联无统计学意义(P＞0.05).结论 首次完整测序汉族手传振动作业人群HTR1B基因多态性位点并初步分析了其人群遗传特征,HTR1B对VWF易感性的影响值得进一步研究.     

GCK基因多态性与汉族人群血糖水平的关系研究

目的探讨GCK基因单核苷酸多态性(SNP)位点rs2268576、rs2908297、rs2971676、rs4607517与汉族人群空腹血糖(FG)水平的关系。方法应用Taq Man探针技术在ABI V7平台上对293名健康体检者GCK基因的4个SNP位点进行基因分型,并进行关联分析。结果 SNP位点rs4607517基因型与FG水平存在线性相关性(P=0.002)。rs4607517位点AA组患者平均FG值(5.16 mmol/L±0.49 mmol/L)高于AG组(4.9 mmol/L±0.49 mmol/L)和GG组(4.81 mmol/L±0.41 mmol/L),差异具有统计学意义(P=0.025,P=0.002)。结论 GCK基因内SNP位点rs4607517与中国汉族人群FG水平的遗传易感性相关联。