紫杉醇耐药细胞与敏感细胞分泌蛋白差异凝胶电泳分析

背景与目的 紫杉醇是用于肺癌临床一线治疗的作用于微管蛋白的化疗药物,而耐药是影响其疗效的关键因素.本研究应用蛋白组学技术整体比较紫杉醇耐药细胞与敏感细胞分泌蛋白表达谱,以期发现肺癌紫杉醇耐药相关分泌蛋白标志物,为临床选择有针对性的化疗药物提供依据.方法 收集A549亲代及耐药细胞培养液中的蛋白,应用差异凝胶电泳(DIGE)进行分离,Decyder 6.5软件分析后获得的差异蛋白点通过基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)进行鉴定.结果 应用DIGE进行分离后,成功获得了蛋白质组分辨率高、重复性好的双向凝胶电泳图谱,Decyder 6.5软件分析获得差异>2倍以上的蛋白质点共有76个,经质谱鉴定了19种蛋白,鉴定的蛋白涉及代谢酶类、细胞外基质降解酶类、粘附分子、细胞因子和信号转导相关蛋白质.结论 本研究首次应用双向电泳技术整体展示了紫杉醇耐药细胞株及敏感细胞株的分泌蛋白表达谱,并分析、鉴定、筛选出与紫杉醇耐药相关的差异分泌蛋白.该研究为非小细胞肺癌血清耐药标志物的筛选提供了新的方法和候选分子.     

MALDI蛋白指纹图谱筛选NSCLC患者化疗耐药相关血清标志物

目的通过检测吉西他滨联合顺铂方案化疗敏感及耐药的晚期非小细胞肺癌患者治疗前血清蛋白质谱的差异,寻找可能的化疗耐药血清预测因子。方法收集非小细胞肺癌（non-small cell lung cancer,NSCLC）Ⅳ期患者治疗前血清,予以吉西他滨联合顺铂化疗,每2疗程后评估疗效。基质辅助激光解析电离化飞行时间质谱（matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight-mass spectrometry,MALDI-TOF-MS）检测血清蛋白,生物信息学分析找出差异蛋白峰,对筛选的差异蛋白峰进一步用遗传算法结合支持向量机模型的方法筛选最佳模型。结果收集25例晚期NSCLC患者,14例部分缓解（partial response,PR）进入化疗敏感组,2例疾病稳定（stable disease,SD）和9例出现疾病进展（progression disease,PD）进入化疗耐药组。化疗敏感组与耐药组出现10个明显差异蛋白质峰（P〈0.05）。其中筛选得到4 978 Da、2 999 Da、4 996 Da、2 627 Da、4 188 Da、1 458 Da及1 984 Da 7个蛋白峰组成的最佳模型。结论 MALDI-TOF-MS技术检测得到血清差异蛋白模型可用于预测吉西他滨联合铂类二药化疗疗效。但需进一步扩大样本量以完善及验证疗效预测模型。     

代谢重编程在化疗耐药乳腺癌中的作用机制

摘 要：［目的］ 探讨葡萄糖代谢在耐药乳腺癌组织中的改变及其在乳腺癌细胞化疗耐药中的作用机制。［方法］ 取10只裸鼠，分别采用人乳腺癌细胞株MCF7和紫杉醇耐药细胞株MCF7-Taxol右侧腋下接种建立乳腺癌裸鼠移植瘤模型和紫杉醇耐药乳腺癌模型各5 只。给药4 周后处死，免疫组织化学染色法、Western blot法用于检测癌组织和耐药癌组织糖酵解关键酶的表达。采用乳酸测定试剂盒和丙酮酸测定试剂盒分别检测两组癌组织中乳酸和丙酮酸的含量。在耐药细胞MCF7-Taxol中用siRNA敲低HK2、PFKFB3、PKM2表达，Western blot和实时荧光定量PCR(qRT-PCR)方法检测HK2、PFKFB3、PKM2的敲低效率，CCK8法检测MCF7-Taxol耐药性改变。［结果］ 紫杉醇耐药乳腺癌组织中糖酵解关键酶HK2、PFKM、PKM2表达明显高于紫杉醇敏感乳腺癌癌组织（P值均<0.0001）。相对于癌组织，耐药癌组织中的乳酸产量和丙酮酸产量相对提高增高约28%（P=0.0005）和 50%(P=0.001）。与siNC组（1.00±0.02）相比，敲低组细胞中的HK2 mRNA（0.56±0.03）、PFKFB3 mRNA（0.37±0.01）、PKM2 mRNA（0.42±0.01）相对表达水平明显降低，蛋白水平也明显降低（P值均<0.05）。CCK8结果显示糖酵解酶敲低后MCF7-Taxol紫杉醇耐药性不同程度的减低（P值均<0.05）。［结论］ 糖酵解关键酶的高表达介导了化疗耐药乳腺癌的代谢重编程。抑制糖酵解关键酶HK2、PFKM、PKM2表达逆转了乳腺癌的紫杉醇耐药性，有望成为治疗化疗耐药乳腺癌的有效措施。     

应用iTRAQ多重化学标记串联质谱技术筛选晚期卵巢浆液性腺癌组织中卡铂耐药相关蛋白

目的 利用同位素标记相对和绝对定量(iTRAQ) 技术筛选晚期卵巢癌组织中卡铂耐药相关差异表达蛋白,为临床个体化治疗奠定实验基础。方法 收集Ⅲ期低分化卵巢浆液性腺癌标本并通过ATP-TCA药敏试验检测卡铂敏感度。取卡铂敏感和耐药标本各15例, iTRAQ试剂标记,被标记的肽段进行高效液相色谱（HPLC）分离及质谱检测（MS）。结果 共鉴定出iTRAQ标记定量信息有755个显著差异表达的蛋白。卡铂耐药组与卡铂敏感组相比,上调1.2倍以上的蛋白429个;下调0.83倍以下的蛋白326个。上调蛋白中有osteopontin（OPN）、clusterin（CLU）、5'-nucleotidase（CD73）和tissue inhititor of metalloproteinases 1（TIMP1）等18个蛋白与肿瘤恶性行为及化疗耐药相关。结论 应用iTRAQ技术能筛选出多种与晚期卵巢癌卡铂耐药相关的差异表达蛋白,该技术对于肿瘤组织蛋白质组学的研究有很好的应用前景。     

紫杉醇抗胆管癌细胞差异表达蛋白的分离、质谱鉴定及生物信息学分析

目的：筛选紫杉醇诱导胆管癌细胞凋亡的相关蛋白并鉴定差异表达的蛋白点以寻找抗胆管癌药物作用的新靶点,筛选胆管癌新的肿瘤标志物,为胆管癌的早期诊断、疗效观察提供基础理论依据。方法：应用比较蛋白质组学技术对紫杉醇诱导凋亡的胆管癌QBC939细胞进行蛋白分离和蛋白表达谱差异分析,筛选并鉴定其相关蛋白并测定其胶内酶解后的肽指纹图谱。结果：本研究发现对照组和实验组蛋白点匹配率分别为（90．1±0．14）％和（87．1±0．22）％（P〈0．05）,匹配后在干预组中共发现68个差异表达蛋白点,其中47个表达下调和21个上调;共获得28张PMF,初步质谱鉴定发现11个与凋亡相关的差异表达蛋白,其中6种蛋白表达上调,5种蛋白表达下调。结论：应用蛋白质组学技术分析所获得的68个差异蛋白质点可能在QBC939细胞发生凋亡过程中发挥重要作用;被鉴定出的11个与细胞凋亡相关的差异蛋白点提示紫杉醇是通过多个重要蛋白,发挥其诱导细胞凋亡的抗癌作用机制的。     

活性乳清蛋白对乳腺癌荷瘤小鼠化疗期间营养状态的影响

摘 要：［目的］ 探究活性乳清蛋白对化疗期间荷瘤小鼠的营养状态、免疫调节和疗效的影响。［方法］ 建立三阴乳腺癌小鼠皮下移植瘤模型,根据干预措施不同随机分为4组,分别为空白对照组（Control组）、紫杉醇化疗组（Control+紫杉醇组）、添加酪蛋白的紫杉醇化疗组（酪蛋白+紫杉醇组）、添加活性乳清蛋白的紫杉醇化疗组（活性乳清蛋白+紫杉醇组）。观察和测量小鼠体重、肿瘤体积、肿瘤重量的变化情况,比较各组小鼠的生存期,检测各组小鼠血液及肿瘤组织中谷胱甘肽（glutathione,GSH）含量。［结果］ 活性乳清蛋白+紫杉醇组瘤鼠体重下降速度明显缓于酪蛋白+紫杉醇组和Control+紫杉醇组,试验进行第31d 活性乳清蛋白+紫杉醇组瘤鼠体重［（20.52±1.10）g］,显著高于酪蛋白+紫杉醇组［（19.03±1.76）g］和Control+紫杉醇组［（18.71±0.86）g］,差异具有统计学意义。活性乳清蛋白+紫杉醇组瘤鼠肿瘤体积变化与其他各组差异不具有统计学意义。活性乳清蛋白+紫杉醇组生存期较Control+紫杉醇组与酪蛋白+紫杉醇组生存期明显延长。活性乳清蛋白+紫杉醇组肿瘤组织中GSH含量［（34.5±18.0）μmol/L］低于酪蛋白+紫杉醇组［（55.3±23.8）μmol/L］和Control+紫杉醇组［（54.9±11.7）μmol/L］。而血液中,活性乳清蛋白+紫杉醇组血液的GSH含量［（19.1±0.7）μmol/L］高于酪蛋白+紫杉醇组［（13.0±8.8）μmol/L］和Control+紫杉醇组［（15.2±9.7）μmol/L］。但无论是肿瘤组织中还是血液中,各处理组间GSH含量差异均无统计学意义（P＞0.05）。［结论］活性乳清蛋白联合化疗减缓小鼠体重下降,改善营养状态,抑制肿瘤增长,延长荷瘤小鼠生存期,改善预后。     

胶质瘤SP细胞耐药靶分子ABCG2的实验研究

背景与目的：ABCG2是ATP转运蛋白（ATP binding cassette，ABC）家族中G2成员，具有编码乳腺癌耐药蛋白（breast cancer resistance protein，BCRP）功能，在肿瘤研究中又可作为SP细胞标志蛋白来筛选肿瘤干细胞，本研究旨在逆转其耐药作用。方法：尼卡地平（NCDP）、尼莫司汀（AGNU）分别和联合作用于人脑多形性胶质母细胞瘤（GBM）体外细胞系和裸小鼠脑移植瘤。体外实验：用MTr比色法检测药物作用后GBM细胞存活率，流式细胞仪检测细胞凋亡率；体内实验：观察荷瘤裸小鼠的生存期及移植瘤病理。结果：体外实验中，AC-NU＋NCDP组对肿瘤抑制和促进凋亡作用都显著高于ACNU组（P〈0．01）。体内实验中，ACNU＋NCDP组的生存期比ACNU组明显延长（P〈O．01）。结论：随着胶质瘤恶性程度增高而表达率增加的ABCG2耐药基因功能因被NCDP抑制后增强了ACNU对胶质瘤细胞的杀伤、促进凋亡和延长荷瘤鼠生存期的作用。     

MK-2206联合顺铂对乳腺癌4 T1／DDP移植瘤耐药性的影响

目的：探讨蛋白激酶B（protein kinase B,Akt）抑制剂MK-2206联合顺铂对三阴性乳腺癌4T1顺铂耐药（4T1／cisplatin,4T1／DDP）移植瘤耐药性的影响。方法采用顺铂（cisplatin,DDP）低剂量诱导及体内外交叉致瘤相结合的方法建立三阴性乳腺癌4T1／DDP耐药小鼠移植瘤模型,给予DDP腹腔注射（0．3 g／L,1次／d）单独或联合MK-2206灌胃（12 g／L,1次／周）治疗。给药28 d后处死小鼠,小动物成像检测观察肿瘤生长情况;Western blot法检测肿瘤组织中磷酸化Akt（phosphorate-Akt,p-Akt）和总Akt（total-Akt,t-Akt）蛋白水平变化;免疫组织化学法分析耐药相关蛋白P-糖蛋白（P-glycoprotein,P-gp）、乳腺癌耐药蛋白（breast cancer resistance protein,BCRP）、基质金属蛋白酶7（matrix metalloproteinase 7,MMP7）表达差异。结果建立的三阴性乳腺癌耐药小鼠模型达中等耐药程度。建立非耐药小鼠与耐药小鼠肿瘤组织生长速度未见明显区别（P＞0．05）。分别给予这两种模型小鼠相同剂量（0．3 g／L）的DDP治疗后,耐药小鼠对DDP的敏感性低于非耐药小鼠（P＜0．01）。将MK-2206（12 g／L）与DDP （0．3 g／L）联合应用后小鼠肿瘤较单独应用DDP缩小,且可降低P-gp、BCRP、MMP7蛋白的表达（均P＜0．05）,并降低Akt蛋白磷酸化水平（P＜0．01）。结论 MK-2206联合顺铂能够逆转4T1／DDP移植瘤耐药性,且与抑制Akt蛋白磷酸化相关。     

前列腺癌诊断/预后和耐药分子标志物的筛选及其临床意义

目的：基于已发表的芯片数据通过生物信息学方法筛选差异表达基因,以发现前列腺癌诊断/预后和耐药相关分子标志物。方法：筛选GEO数据库中已发表的前列腺癌mRNA芯片数据GSE6956和前列腺癌细胞多烯紫杉醇耐药mRNA芯片数据GSE33455进行差异表达分析;通过生物学功能注释、基因通路富集分析、蛋白质相互作用网络（protein-protein interaction,PPI）分析等生物信息学方法发现和识别与差异表达基因相关的生物学功能和信号通路;比对TCGA数据库,验证差异表达基因在前列腺癌组织及癌旁组织中的表达,并通过Kaplan-Meier分析差异表达基因对前列腺癌患者生存率的影响;用qPCR方法验证差异表达基因在前列腺癌细胞株PC3及多烯紫杉醇耐药细胞PC3-DTX中的表达情况。结果：共筛选出227个在前列腺癌和前列腺癌多烯紫杉醇耐药细胞芯片数据中共同差异表达基因。差异表达基因主要富集到了癌症相关通路（Lysosome、Sphingolipid、FoxO、Acute myeloid leukemia）,并主要参与细胞黏附、自噬和胞内蛋白转运等生物学过程。构建PPI网络选取18个连接度最高的基因作为Hub基因。Hub基因和共同差异表达基因中,上调基因CITED2、LRP12和RPL17-C18orf32与前列腺癌患者的不良预后显著相关。qPCR验证显示CITED2在多烯紫杉醇耐药细胞PC3-DTX中高表达。结论：通过生物信息学方法筛选出在前列腺癌组织和耐药细胞中共同差异表达,且与前列腺癌患者的不良预后密切相关的基因,为前列腺癌诊断/预后和耐药分子标志物的研究提供了新的思路。     

FANCF在三阴性乳腺癌细胞紫杉醇耐药中的作用及其机制

目的： 建立三阴性乳腺癌紫杉醇耐药细胞株并考察FA/BRCA通路相关基因FANCF在该细胞株紫衫醇耐药中的作 用。 方法： 以药物浓度递增法诱导三阴性乳腺癌细胞MDA-MB-231成为紫杉醇耐药细胞株,采用CCK8法检测细胞的耐药指 数,流式细胞术检测细胞的生长周期,qRT-PCR检测FA/BRCA通路相关基因FANCF的表达;Western blotting 法验证相关蛋白的 表达。对MDA-MB-231敏感细胞和紫杉醇耐药细胞中FANCF的表达进行敲减,并在mRNA和蛋白水平进行敲减效果验证,以 CCK8法检测紫杉醇对该两种细胞的IC 50 。 结果： MDA-MB-231细胞紫杉醇诱导3个月后的耐药指数为9.9,该细胞的G0/G1期 细胞增多且S期细胞减少,细胞中FANCF mRNA和蛋白表达水平显著升高。FANCF敲低后无论MDA-MB-231还是MDA-MB- 231/PTX细胞的凋亡增加,对紫杉醇敏感性显著升高(P<0.05或P<0.01)。 结论： FANCF基因在乳腺癌紫杉醇耐药中具有重要作 用,可能是乳腺癌治疗的一个潜在靶点。     

Mus81基因沉默对MDA-MB-231乳腺癌细胞增殖、凋亡及裸鼠成瘤能力的影响北大核心

目的:分析甲磺酸盐及紫外线敏感性81号基因(Mus81)在乳腺癌组织中的表达水平,观察Mus81基因敲减对三阴性乳腺癌细胞MDA-MB-231增殖、凋亡和裸鼠移植瘤形成能力的影响。方法:从TCGA数据库下载乳腺癌样本基因表达数据,应用perl及R软件整理数据筛选出每个样本Mus81基因表达量。通过慢病毒介导的小干扰RNA(short interfering RNA,siRNA)技术构建Mus81基因敲减的MDA-MB-231乳腺癌细胞系(即Mus81敲减组)和阴性对照组MDA-MB-231乳腺癌细胞系,以实时定量PCR法检测Mus81基因的敲减效率,再以MTT检测实验、克隆形成实验、细胞流式检测及实时定量PCR法检测两组MDA-MB-231细胞的生长、增殖、细胞周期分布、凋亡水平及Mus81下游基因表达水平。最后,向BALB/c裸鼠右侧腋下注射Mus81基因敲减组和阴性对照组MDA-MB-231乳腺癌细胞,观察Mus81基因沉默对MDA-MB-231细胞在裸鼠中成瘤能力的影响。结果:Mus81基因在乳腺癌组织中的平均表达量明显高于癌旁组织(P<0.05)。Mus81基因敲减组MDA-MB-231细胞中Mus81基因的表达水平明显低于阴性对照组(P<0.05),Mus81基因的敲减效率达70.7%。较之阴性对照组,Mus81基因敲减组MDA-MB-231细胞的生长速度明显减缓(P<0.05);形成的细胞克隆数也明显下降(P<0.05);细胞凋亡水平、G2/M期细胞比例则明显升高(P<0.05)。STC2等Mus81下游基因的表达水平在两组MDA-MB-231细胞间也有明显差异(P<0.05)。裸鼠成瘤实验显示,Mus81基因敲减组形成的裸鼠瘤体体积和重量均明显低于阴性对照组(P<0.05)。结论:Mus81基因在乳腺癌组织中的表达明显升高,且可能通过调控STC2等下游基因的表达促进三阴性乳腺癌细胞的生长增殖及裸鼠体内成瘤能力并抑制其凋亡,提示其可能是一个潜在的乳腺癌治疗靶点。     

lncRNA SNHG14在甲状腺乳头状癌组织中的表达及对其癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响

目的:观察长链非编码RNA（long non-coding RNA,lncRNA）核内小RNA宿主基因14（small nucleolar RNA host gene 14,SNHG14）在甲状腺乳头状癌（papillary thyroid carcinoma,PTC）组织中的表达情况及对PTC细胞增殖、侵袭和迁移的影响。方法:选取2019年10月至2020年01月期间于我院甲状腺外科行手术切除的37例患者的PTC组织及配对癌旁组织,采用实时荧光定量逆转录聚合酶链反应（quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR）检测SNHG14在PTC组织和癌旁组织中的表达,并分析其与临床病理特征的相关性,同时检测SNHG14在PTC细胞TPC-1及人正常甲状腺滤泡上皮细胞Nthy-ori3-1中的表达。采用si-RNA技术下调PTC细胞TPC-1中SNHG14的表达,通过细胞计数试剂盒-8(cell counting kit-8,CCK-8)、细胞划痕实验和Transwell实验研究SNHG14在TPC-1细胞中的生物学功能。结果:SNHG14在PTC组织中的表达高于癌旁组织（P＜0.05）,并与淋巴结转移、病灶数有关（P均<0.05）,而与年龄、性别、肿瘤大小、TNM分期无关（P均>0.05）,同时,SNHG14在TPC-1细胞中的表达高于Nthy-ori3-1细胞（P＜0.05）。下调SNHG14后,相较于空白对照组、阴性对照组,si-SNHG14组细胞的增殖、迁移和侵袭能力均降低（P均<0.05）。结论:SNHG14可能参与PTC的发生发展,有望成为PTC患者新的诊断标记物及治疗靶点。     

MAP2K6-FP和紫杉醇对上皮性卵巢癌裸鼠移植瘤的抑制作用

目的:研究靶向融合肽MAP2K6-FP（mitogen-activated protein kinase kinase 6-fusion protein)、紫杉醇单独和两者联合对上皮性卵巢癌裸鼠移植瘤的抑制作用。方法:建立卵巢癌HO8910细胞的裸鼠皮下移植瘤模型,分为空白对照组（予生理盐水 5 ml/kg腹腔注射治疗）、MAP2K6-FP组（予0.25 mg/kg MAP2K6-FP腹腔注射治疗）、紫杉醇组（予15 mg/kg 紫杉醇腹腔注射治疗）、联合用药组（予0.25 mg/kg MAP2K6-FP+15 mg/kg 紫杉醇腹腔注射治疗）,比较4组裸鼠的移植瘤生长速度、体积、裸鼠体质量;TUNEL法、免疫组织化学法和蛋白印迹法分别检测移植瘤中细胞凋亡情况、血管内皮生长因子（vascular endothelial growth factor,VEGF）、增殖细胞核抗原（proliferating cell nuclear antigen,PCNA）的表达以及Bcl-2、Beclin 1蛋白的表达。结果:联合用药组裸鼠移植瘤体积（90 mm3）,小于MAP2K6-FP组（324 mm3）、紫杉醇组（215 mm3）和空白对照组（804 mm3）（P<0.05）。联合用药组肿瘤细胞的凋亡指数（apoptosis index,AI）(28.88±2.03)%,高于MAP2K6-FP组(14.36±0.56)%、紫杉醇组(15.78±0.87)%以及空白对照组(4.78±0.87)%（P<0.05）。联合用药组VEGF蛋白表达水平(0.14±0.06),低于MAP2K6-FP组(0.32±0.10)、紫杉醇组(0.29±0.08)及空白对照组(0.78±0.14）（P<0.01);联合用药组PCNA表达水平(18.4%),低于MAP2K6-FP组(32.3%)、紫杉醇组(29.8%)及空白对照组(81.4%）（P<0.05）。联合用药组Beclin 1/Bcl-2比例较单一用药组高(P<0.05)。结论:MAP2K6-FP联合紫杉醇能够显著抑制卵巢癌裸鼠移植瘤的生长,其机制可能与促进细胞凋亡有关。     

lncRNA 178030.2通过TRPS1对三阴性乳腺癌细胞紫杉醇耐药的影响与机制研究

目的:探讨lncRNA 178030.2通过TRPS1对三阴性乳腺癌细胞紫杉醇耐药的影响与机制。方法:采用逐步增加剂量间歇作用的方法诱导三阴性乳腺癌紫杉醇耐药细胞系并命名为MDA-MB-231/R。采用定量PCR和Western blot检测耐药细胞和亲本细胞中lncRNA 178030.2和TRPS1的表达;应用Lipofectamine 2000将lncRNA 178030.2高表达质粒pcmv-178030.2和对照质粒pcmv转染至MDA-MB-231细胞,分别为高表达组和对照组,定量PCR检测lncRNA 178030.2水平的变化,分别用定量PCR和Western blot检测TRPS1 mRNA及蛋白水平的变化;RIP实验检测lncRNA 178030.2是否与TRPS1相结合;MTT法检测MDA-MB-231细胞对紫杉醇的敏感性及细胞增殖。应用Lipofectamine 2000将lncRNA 178030.2小干扰RNA si178030.2和对照siNC转染至MDA-MB-231/R细胞,分别为干扰组和对照组,定量PCR检测lncRNA 178030.2水平的变化,分别用定量PCR和Western blot检测TRPS1 mRNA及蛋白水平的变化;MTT法检测MDA-MB-231/R细胞对紫杉醇的敏感性及细胞增殖。应用Lipofectamine 2000将TRPS1过表达质粒pcmv-TRPS1和对照质粒pcmv转染至MDA-MB-231细胞,分别为高表达组和对照组,分别用定量PCR和Western blot检测两组细胞中TRPS1 mRNA及蛋白水平的表达情况,然后再分别应用Lipofectamine 2000将lncRNA 178030.2高表达质粒pcmv-178030.2转染入两组细胞,MTT法检测MDA-MB-231细胞对紫杉醇的敏感性及细胞增殖。结果:成功构建在3 μg/ml紫杉醇中稳定生长的三阴性乳腺癌耐药细胞系MDA-MB-231/R。定量PCR结果显示:lncRNA 178030.2在紫杉醇耐药细胞系MDA-MB-231/R中的表达明显高于在其亲本细胞MDA-MB-231中的表达;定量PCR和Western blot显示:TRPS1 mRNA和蛋白在紫杉醇耐药细胞系MDA-MB-231/R中的表达明显低于在其亲本细胞系MDA-MB-231中的表达;与对照组相比,高表达lncRNA 178030.2组的MDA-MB-231细胞中TRPS1表达下降,细胞对紫杉醇的敏感性降低,细胞增殖增强,且lncRNA 178030.2确实可以与TRPS1相结合;与对照组相比,低表达lncRNA 178030.2组的MDA-MB-231/R细胞中TRPS1表达升高,细胞对紫杉醇的敏感性升高,细胞增殖减弱;在MDA-MB-231细胞中过表达TRPS1后再过表达lncRNA 178030.2,其促进紫杉醇耐药、促进细胞增殖的作用也明显减弱。结论:lncRNA 178030.2促进三阴性乳腺癌细胞MDA-MB-231的紫杉醇耐药,促进细胞增殖,其发生机制可能与下调TRPS1的表达有关。     

采用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱技术筛选乳腺癌新辅助化疗敏感蛋白谱

目的应用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱（SELDI-TOF MS）技术检测乳腺癌新辅助化疗前后癌组织内蛋白质谱的变化,筛选乳腺癌新辅助化疗敏感性相关蛋白质。方法 60份样本来自2009年3月至2010年8月山东省千佛山医院乳腺外科收治的30例乳腺癌患者CEF新辅助化疗前后的乳腺癌组织。化疗前,行粗针穿刺获得乳腺癌组织;化疗后,在乳腺癌根治术中取样。应用SELDI-TOF MS技术检测乳腺癌组织的蛋白质谱,所得数据采用Biomarker wizard 3.0.2软件分析,得到差异蛋白谱,再采用SPSS17.0软件对数据进行Shapiro-Wilk正态性检验和配对设计t检验。根据差异蛋白质的质荷比,在SWISS-PROT数据库中检索与差异蛋白质相匹配的存在于乳腺组织或乳腺癌组织中的蛋白质。结果通过比较患者新辅助化疗前后的蛋白峰值,筛选出8个蛋白峰有差异的蛋白质,其质荷比（m/z）分别为5825.9、8949.5、11053.5、11652.0、17898.9、22250.6、26055.5、38546.6,化疗后这8个蛋白峰均高于化疗前（11.0±5.0比8.2±4.9、10.7±4.5比6.3±3.4、22.3±9.9比15.3±9.9、28.0±10.2比21.4±9.3、9.5±4.6比5.4±3.4、1.1±1.0比0.6±0.5、2.0±0.7比1.5±0.7及2.7±2.2比1.5±1.2,P值均〈0.05）。结论应用SELDI-TOF MS技术可以筛选出与乳腺癌新辅助化疗敏感性相关的蛋白质谱。     

ASCL2在乳腺癌组织中的表达及其对患者预后的影响

目的:检测乳腺癌组织中转录因子ASCL2蛋白的表达情况，分析ASCL2蛋白表达与乳腺癌患者临床病理参数之间的关系，及其对乳腺癌患者预后的影响。方法:免疫组织化学SP法检测114例乳腺癌组织及其癌旁乳腺组织中ASCL2蛋白表达情况，分析ASCL2蛋白表达与乳腺癌患者临床病理参数的关系，分析癌组织中ASCL2蛋白表达与乳腺癌患者预后的关系。采用受试者工作特征曲线（ROC）法分析监测ASCL2蛋白表达对乳腺癌预后判断的灵敏度和特异度。结果:ASCL2蛋白在乳腺癌组织和癌旁乳腺组织中的阳性表达率分别为84.21%（96/114）和0.88%（1/114），差异有统计学意义（P＜0.05）。乳腺癌组织中，ASCL2蛋白异常表达与患者的肿瘤直径、Ki67增殖指数和淋巴结转移有关（P均<0.05），而与患者年龄、肿瘤分级、分子亚型和临床分期无关（P均>0.05）。ASCL2蛋白表达阳性患者的术后5年总生存率显著低于ASCL2蛋白表达阴性患者（P=0.000）。ROC分析结果显示，监测ASLCL2蛋白表达水平对患者生存预测有一定价值，曲线下面积（AUC）为0.925。结论:ASCL2在乳腺癌组织中高表达，且与肿瘤恶性进展和患者不良预后密切相关，ASCL2可作为乳腺癌预后预测和治疗的潜在靶点。     

基于生物信息学和转录组测序分析结直肠癌5-FU耐药关键靶点北大核心

目的:筛选结直肠癌5-氟尿嘧啶(5-FU)耐药靶基因,并探究该基因对结直肠癌耐药细胞的作用及其作用机制。方法:通过GEO数据库分析GSE28702芯片筛选结直肠癌患者5-FU耐药与5-FU敏感的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs);利用GO与KEGG数据库对DEGs进行通路富集分析;通过STRING数据库构建蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,利用Cytoscpae的cytohubba工具筛选枢纽基因。构建5-FU耐药细胞株HCT8/5-FU,利用高通量转录组测序鉴定;采用受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC)对诊断价值进行评价并基于TCGA数据库COAD数据集分析关键基因表达及预后;构建TF基因过表达载体转染到HCT8/5-FU细胞系,MTT法检测细胞活力;流式细胞术测定细胞凋亡与细胞周期;qRT-PCR与Western Blot检测基因mRNA和蛋白水平。结果:共筛选出239个DEGs;DEGs主要富集在细胞外囊泡、内吞囊泡腔、药物代谢等通路;PPI得到20个枢纽基因;转录组学显示转铁蛋白(transferrin,TF)在耐药株中显著下调(P<0.05)与生物信息学分析得到的DEGs中TF基因改变趋势相同;与正常结直肠组织相比,癌组织中TF低表达(P<0.05);TF高表达患者总体生存期更长(P<0.05);上调TF表达增强了耐药细胞的5-FU敏感性(P<0.05);上调TF表达增加了5-FU诱导的细胞凋亡与G_(0)/G_(1)期的阻滞(P<0.05);上调TF表达抑制了耐药细胞ABCC1的表达(P<0.05)。结论:基于生物信息学和转录组测序筛选出结直肠癌5-FU耐药靶基因TF,TF基因可能通过调控ABCC1表达降低结直肠癌5-FU的耐药性。     

血清蛋白质谱诊断模型在乳腺癌辅助诊断中的价值

目的 建立乳腺癌的血清蛋白质谱诊断模型,评价其在乳腺癌辅助诊断中的价值.方法 应用表面增强激光解析电离飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测113例乳腺癌患者、103例乳腺良性肿瘤患者及92例健康女性的血清蛋白质谱,采用Biomarker Pattern(BPS)软件分析蛋白质谱,建立分类树模型,然后对模型进行盲筛验证.结果 比较乳腺癌患者与健康女性的血清蛋白质谱,筛选出12个差异蛋白质峰.经验证,所建立的分类树模型Ⅰ诊断乳腺癌的灵敏度为91.9%,特异度为81.2%.比较乳腺良性肿瘤患者与健康女性的血清蛋白质谱,筛选出11个差异蛋白质峰.经验证,所建立的分类树模型Ⅱ诊断乳腺良性肿瘤的灵敏度为87.9%,特异度为81.2%.比较乳腺癌与乳腺良性肿瘤患者的血清蛋白质谱,筛选出2个差异蛋白质峰.经验证,所建立的分类树模型Ⅲ诊断乳腺癌的灵敏度为81.8%,特异度为78.3%.应用这些差异蛋白及分类树模型,分别对93例CA15-3阴性乳腺癌患者与36例乳腺良性疾病患者的血清、20例CA15-3阳性乳腺癌患者与36例乳腺良性疾病患者的血清进行盲筛,诊断乳腺癌的敏感度和特异度分别为80.6%和91.7%、75.0%和91.7%,明显高于传统的乳腺癌标志物CA15-3,而CA15-3阴性与CA15-3阳性乳腺癌未见明显的差异蛋白质峰.结论 应用SELDI-TOF-MS技术可筛选出乳腺癌、乳腺良性肿瘤和健康女性血清蛋白质谱存在的差异蛋白质峰,据此建立的诊断模型可用于乳腺癌的辅助诊断.     

CTEN通过TGF-β1促进非小细胞肺癌细胞紫杉醇耐药的作用及机制研究

目的:探讨CTEN通过TGF-β1促进非小细胞肺癌（NSCLC）细胞紫杉醇耐药的作用和分子机制。方法:采用逐步增加剂量间歇作用的方法诱导非小细胞肺癌紫杉醇耐药细胞系并命名为A549/R,采用定量PCR和Western blotting检测耐药细胞和亲本细胞中CTEN和TGF-β1 mRNA及蛋白的表达,应用Lipofectamine 2000分别将CTEN高表达质粒pcmv-CTEN及其对照质粒pcmv转染至非小细胞肺癌A549细胞,分别为高表达组和对照组,分别用定量PCR和Western blotting检测CTEN和TGF-β1 mRNA及蛋白水平的变化;MTT法检测A549细胞对紫杉醇的敏感性及细胞增殖。应用Lipofectamine 2000分别将CTEN干扰质粒siCTEN及其对照siNC转染至紫杉醇耐药细胞系A549/R细胞,分别为干扰组和对照组,分别用定量PCR和Western blotting检测CTEN和TGF-β1 mRNA及蛋白水平的变化;MTT法检测A549/R细胞对紫杉醇的敏感性及细胞增殖。应用Lipofectamine 2000分别将TGF-β1干扰质粒siTGF-β1及其对照质粒siNC转染至非小细胞肺癌A549细胞,分别为干扰组和对照组,分别检测两组细胞中TGF-β1 mRNA及蛋白水平的表达情况,然后再分别用Lipofectamine 2000将CTEN高表达质粒pcmv-CTEN转染入两组细胞,MTT法检测A549细胞对紫杉醇的敏感性及细胞增殖。结果:成功构建在5 μg/mL紫杉醇中稳定生长的非小细胞肺癌耐药细胞系A549/R。定量PCR和Western blotting显示,CTEN和TGF-β1 mRNA及蛋白在紫杉醇耐药细胞系A549/R中的表达明显高于在其亲本细胞系A549中的表达;与对照组相比,高表达CTEN组的A549细胞中TGF-β1表达上升,细胞对紫杉醇的敏感性降低,细胞增殖增强;与对照组相比,低表达CTEN组的A549/R细胞中TGF-β1表达降低,细胞对紫杉醇的敏感性升高,细胞增殖减弱;在A549细胞中低表达TGF-β1后再过表达CTEN,其促进紫杉醇耐药及细胞增殖的作用也明显减弱。结论:CTEN具有促进非小细胞肺癌A549的紫杉醇耐药,促进细胞增殖的作用,其发生机制可能与上调TGF-β1的表达有关。     

毛萼乙素通过Wnt/β-catenin通路抑制结直肠癌细胞增殖的机制探讨

目的:探讨毛萼乙素（Eriocalyxin B,EriB）通过Wnt/β-catenin通路抑制结直肠癌（colorectal cancer,CRC）细胞增殖的机制。方法:CCK-8、软琼脂克隆形成实验检测EriB对结直肠癌细胞增殖活力的影响,流式细胞术检测EriB对结直肠癌细胞周期和凋亡的影响,无血清悬浮培养实验检测EriB对结直肠癌细胞干性的影响,Western blot 检测周期、凋亡以及分子机制相关蛋白的表达变化,裸鼠皮下瘤实验体内检测EriB对结肠癌细胞生长增殖的影响,免疫组织化学染色检测小鼠皮下瘤组织Ki67的表达,SynergyFinder用于分析EriB对5-FU抗结直肠癌的协同作用。结果:与对照组相比,EriB处理显著抑制了结直肠癌细胞的存活（P＜0.05或P＜0.001）,抑制干细胞球体数量（P＜0.001）。流式细胞术检测结果表明,与对照组相比,EriB处理组S期和G2期细胞百分比增加（P＜0.001）,细胞凋亡增加（P＜0.001）。Western blot结果显示,EriB处理细胞后,干性相关分子CD44、Sox2、Klf4表达下调,细胞周期相关蛋白CyclinA、Cdk2表达下调,凋亡相关蛋白Cl-PARP、Cl-caspase-3表达上调,Wnt/β-catenin通路相关蛋白β-catenin、TCF4、CyclinD1、c-myc表达下调。EriB与5-FU联合应用,经SynergyFinder分析,ZIP synergy得分大于＋10,有协同作用。裸鼠异种移植瘤模型结果表明,与对照组相比,EriB处理显著抑制肿瘤生长,并减小裸鼠皮下异种移植瘤的体积（P＜0.05）。免疫组织化学分析显示,EriB处理组显著降低了肿瘤组织中Ki67的表达。结论:EriB可能通过抑制Wnt/β-catenin信号通路抑制结直肠癌细胞增殖。