2016-2019年深圳口岸入境人群感染甲型流感的流行病学特征分析

目的 分析深圳各口岸近4年入境人群感染甲型流感的流行病学特征,为口岸监测和防控甲型流感疫情提供科学依据。方法 收集2016年1月至2019年12月来自深圳各口岸发热入境人员的鼻咽拭子标本,利用实时荧光定量PCR进行甲型流感病毒检测及分型,通过Excel 2003、SPSS 20.0对不同型别的流感阳性病例的流行情况进行分析。结果 共收集104 115例发热入境人员鼻咽拭子标本,从中检出甲型流感病毒14 026例,检出率为13.5%,其中男女比例为1.75:1,甲型流感病毒检出率在51~60岁、60岁以上人群中检出率最高,分别为18.5%、18.9%。2016-2019年共出现3次甲型流感高峰,分别为2016年2-3月,以甲型H1N1为主;2017年7月,H3亚型病例激增,成为主要流行株;2018年12月,以H1N1亚型为主。结论 2016-2018年期间深圳口岸入境人员感染甲型流感病例中同时有H1N1亚型、甲型H3亚型的流行,呈现为相互交替的流行特征。发病以51岁以上人群为主,不同性别、不同年龄层流感病毒亚型检出率有差异。     

2019—2020年山东省H3N2流感病毒抗原性及血凝素基因特征分析

目的 了解2019—2020年流感监测年度山东省分离的H3N2亚型流感病毒抗原性及血凝素(hemagglutinin,HA)基因遗传进化规律与氨基酸变异情况。方法 用免疫雪貂后的抗血清进行红细胞凝集抑制试验,对2019年4月至2020年3月山东省分离的40株H3N2亚型流感毒株进行抗原性分析,并对其中19株待检病毒的HA基因进行序列测定及分析。结果 抗原性分析结果显示检测的H3N2亚型流感病毒中仅仅35%(14/40)与疫苗株A/Kansas/14/2017抗原性类似。系统进化树显示,19株H3N2亚型流感病毒分离株血凝素基因在进化树上全部属于3C.2a分支,与处于3C.3a分支的疫苗株A/Kansas/14/2017亲缘关系较远;与疫苗株相比,所有待检毒株A抗原决定簇有3个位点,B抗原决定簇有2个位点发生改变;受体结合位点均发生T135K位和S137F位变异;19株分离株全部发生133位糖基化位点缺失。结论 抗原性分析及HA基因序列分析结果显示,WHO推荐的 2019—2020 年疫苗株保护效果有可能不理想。应继续密切关注 H3N2 亚型流感病毒的流行与基因变异情况,为流感病毒疫苗株推荐及防控提供科学依据。     

2017-2018年陕西省H7N9禽流感病毒流行特征及基因进化分析

目的 整理和分析2017-2018年陕西省H7N9禽流感病毒流行分布和基因特性,为防控决策提供实证依据。方法 采集陕西省外环境样本、H7N9病例及关联样本,用荧光定量PCR检测H7N9亚型流感病毒,H7N9 阳性标本的病毒分离和基因测序分析由国家流感中心完成。结果 2017年5月至2018年3月,陕西省142个监测点外环境外环境H7N9核酸阳性率仅4.91‰。同时,本省共报告7例H7N9病例和2起禽间疫情。病毒序列分析发现:部分H7N9病毒中HA蛋白裂解位点插入“KRTA”氨基酸基序,具有对禽类高致病性的分子特征。血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因进化树分析结果显示陕西省H7N9禽流感病毒与长三角来源的H7N9序列高度同源。结论 陕西H7N9病毒流行株具有遗传多样性,同时存在低致病性和高致病性两个变种。今后应继续做好禽流感病原学监测和遗传变异分析,为防控工作提供依据。     

马鞍山市2016-2017年流感病原学监测结果分析北大核心CSCD

目的分析2016-2017马鞍山市流感病毒病原学监测结果,为流感防制提供科学依据。方法收集、分析马鞍山市2016-2017年流感样病例(influenza-like illness,ILI)监测数据,同时采集部分ILI咽拭子标本,采用RT-PCR法检测流感病毒核酸,对病原学检测数据进行统计分析。结果 2016年共检测ILI咽拭子标本2 772份,流感病毒核酸检测阳性383例,总阳性率为13.82%。其中新甲型H1N1亚型59例(占15.40%),H3N2亚型111例(占28.98%),B-Yamagata亚型11例(占2.87%),B-Victoria亚型202例(占52.74%);2017年共检测ILI咽拭子标本2 170份,流感病毒核酸检测阳性614例,总阳性率为28.29%,其中新甲型H1N1亚型38例(占52.74%),H3N2亚型309例(占50.33%),B-Yamagata亚型178例(占28.99%),B-Victoria亚型89例(占14.50%)。不同月份阳性检出率比较差异有统计学意义(年X_(2016)~2=450.876,X_(2017)~2=240.002,P均<0.05)。核酸检测阳性率性别差异无统计学意义(X_(2016)~2=0.171,X_(2017)~2=0.174,P均>0.05)。不同年龄组间阳性率比较差异有统计学(X_(2016)~2=160.030,X_(2017)~2=132.901,P均<0.05)。2016、2017年MDCK细胞培养法分离流感病毒221株和98株,分离率分别为57.70%和15.96%;2016、2017年鸡胚培养法分离流感病毒26株和8株,分离率分别为6.79%和1.30%。两种方法比较有统计学差异(X^2=74.815,P<0.05)。结论 2016年马鞍山市流感呈现冬春季两个发病高峰,主要流行株为B-Victoria型;2017年出现夏、冬、春季3个发病高峰,主要流行株为H3N2型。流行株发病高峰的变化可为当地流感防控提供参考,流感监测应进一步加强。     

马鞍山市2016-2017年流感病原学监测结果分析北大核心CSCD

目的分析2016-2017马鞍山市流感病毒病原学监测结果,为流感防制提供科学依据。方法收集、分析马鞍山市2016-2017年流感样病例(influenza-like illness,ILI)监测数据,同时采集部分ILI咽拭子标本,采用RT-PCR法检测流感病毒核酸,对病原学检测数据进行统计分析。结果 2016年共检测ILI咽拭子标本2 772份,流感病毒核酸检测阳性383例,总阳性率为13.82%。其中新甲型H1N1亚型59例(占15.40%),H3N2亚型111例(占28.98%),B-Yamagata亚型11例(占2.87%),B-Victoria亚型202例(占52.74%);2017年共检测ILI咽拭子标本2 170份,流感病毒核酸检测阳性614例,总阳性率为28.29%,其中新甲型H1N1亚型38例(占52.74%),H3N2亚型309例(占50.33%),B-Yamagata亚型178例(占28.99%),B-Victoria亚型89例(占14.50%)。不同月份阳性检出率比较差异有统计学意义(年X_(2016)~2=450.876,X_(2017)~2=240.002,P均<0.05)。核酸检测阳性率性别差异无统计学意义(X_(2016)~2=0.171,X_(2017)~2=0.174,P均>0.05)。不同年龄组间阳性率比较差异有统计学(X_(2016)~2=160.030,X_(2017)~2=132.901,P均<0.05)。2016、2017年MDCK细胞培养法分离流感病毒221株和98株,分离率分别为57.70%和15.96%;2016、2017年鸡胚培养法分离流感病毒26株和8株,分离率分别为6.79%和1.30%。两种方法比较有统计学差异(X^2=74.815,P<0.05)。结论 2016年马鞍山市流感呈现冬春季两个发病高峰,主要流行株为B-Victoria型;2017年出现夏、冬、春季3个发病高峰,主要流行株为H3N2型。流行株发病高峰的变化可为当地流感防控提供参考,流感监测应进一步加强。     

2017—2018年广州市H3N2流感病毒流行及血凝素基因分子特征分析

目的 对广州市H3N2流感病毒进行基因变异和进化分析,为H3N2流感科学防控提供科学依据。方法 对广州市2017年1月-2018年9月流感监测标本进行H3N2病毒检测和分离,并对HA基因进行测序,通过生物信息学软件分析病毒变异和进化特点。结果 所监测的8 535份标本中,检出H3N2流感阳性标本386份,阳性率为4.52%。对其中16株分离株HA基因测序结果显示,与同年度疫苗推荐株A/Hong Kong/4801/2014相比,2017年广州H3N2病毒A 区抗原位点变异频率较高,多发生于140位、144位和150位,其中有7株病毒发生新抗原漂移,变异毒株占比43.75%。受体结合位点变异主要发生在前壁,位于T131K位和T135K(N)位。糖基化位点变异同样多发生于A区抗原位点和受体结合位点前壁。2017年广州H3N2流感病毒均位于3C.2a分支,但分支内又进一步进化形成3个不同的小流行分支,包括3C.2a1分支,以及与2016年北京、2017年美国分离株亲缘相近的另外两个小分支。结论 2017年广州H3N2流感病毒HA蛋白重要氨基酸位点的变异表现遗传多态性,特别是在抗原性上可能发生了较大变异。在基因进化上表现为多样性和复杂性,呈现多分支进化特点。因此有必要密切监测流行毒株的进化趋势,以期及时对疫苗株的匹配性进行有效评估。     

2010～2011年马鞍山市流感疫情监测分析

目的了解马鞍山市流感流行动态,探索流行规律,为流感的防制提供科学依据。方法收集监测医院流感样病例(ILI)数据,采集部分ILI咽拭子标本,采用实时荧光定量RT-PCR技术检测流感病毒核酸。结果马鞍山市2010～2011年共报告ILI 13 151例,占门诊就诊人数的4.79%。采咽拭子3 185份,核酸检测阳性486份,阳性率15.26%,其中A型H1N1亚型47份、A型H3N2亚型119份、B型320份。结论 2010～2011年马鞍山市流感呈现冬春季及夏秋季两个发病高峰,流感病毒以B型为主;流感的监测应进一步加强。     

2013-2018年我国流感流行特征分析北大核心CSCD

目的了解我国近5年流感性感冒(简称流感)流行的季节性、病毒亚型、发病率和病死率等流行病学特征。方法通过中国疾病控制中心信息系统和中国流感监测信息系统收集2013年1月-2018年3月我国流感发病数和死亡数及每周上报流感样病例(ILI)监测实验室检测数据,采用Excel 2010进行统计学分析。结果 2013-2017年全国共检测流感样病例鼻咽拭子标本1 143 123份,检出流感病毒阳性154 699份(阳性率13.53%),以甲型流感病毒(H1N1、H3N2)和乙型流感病毒为主;2018年截止4月1日共检测阳性标本102 166份,流感病毒阳性31 154份(占30.49%),主要流行毒株为甲型H1N1、乙型流感病毒和甲型H3N2。每年的流感发病高峰主要集中在上年的12月至次年的4月,但2015、2017年的7月和8月发病率均较高(>10%)。结论 2013-2017年我国流感发病呈明显季节性,以冬、春季节发病率较高,2015年和2017年夏季出现流感发病高峰期。2017年12月-2018年2月流感发病数达到近5年的最高峰,甲型H1N1和乙型流感病毒为主要流行株。     

山东省2017—2018年B型流感病毒药物敏感性检测及神经氨酸酶基因特征分析

目的 检测山东省2017-2018流感监测年度B型流感病毒对神经氨酸酶抑制剂的药物敏感性,分析其神经氨酸酶(NA)基因特征。方法 选取山东省2017—2018年分离的18株B型流感病毒(Yamagata系16株,Victoria系2株),通过生物学耐药实验检测病毒对奥司他韦和扎那米韦的药物敏感性。提取病毒核酸后一步法RT-PCR扩增NA基因片段,双向测定核苷酸序列,对基因序列和氨基酸序列特征比对分析。结果 在检测的18株B型流感病毒中,有1株Yamagata系病毒对奥司他韦和扎那米韦2种药物的敏感性均降低,此株病毒的NA基因发生H274Y位点突变。其余15株Yamagata系病毒和2株Victoria系病毒均为奥司他韦及扎那米韦的敏感株。结论 随机选取的18株B型流感病毒中大多数病毒对神经氨酸酶抑制剂敏感,临床上可继续使用此类药物对流感患者进行治疗。应加强耐药性监测,警惕耐药株的出现。     

2009～2010年乌鲁木齐市流行性感冒病原学监测分析

目的了解流行性感冒病毒（流感）的流行情况,探讨流感流行规律,为制订流感控制措施提供依据。方法对乌鲁木齐市监测门诊及疫情点的疑似流感样病例采集咽拭子标本,用核酸检测和接种狗肾传代细胞（MDCK）培养进行流感病毒分离及进行血凝试验,并对阳性者进行血凝抑制试验进行分型鉴定。结果 2009年10月-2010年3月监测流感样标本与咽拭子标本共1 218份,分离出流感病毒181株,分离率3.72%,分别为甲型H1N1亚型8株、H3N2亚型32株、新甲型H1N1 104株、B型37株。结论 2009年10月-2010年1月是以新甲型H1N1亚型流感病毒流行为主,2010年2月以B型流感流行为主。     

2019-2020年海南省A(H1N1)pdm09 流感病毒基因特性分析

目的 分析海南省A(H1N1) pdm09亚型流感病毒的抗原性和基因特性,了解病毒的变异情况,为海南省A(H1N1)pdm09亚型流感病毒的防控提供依据.方法 选取14株2019-2020年海南省流感监测网络实验室分离到的A(H1N1)pdm09亚型流感病毒进行基因序列测定,测序结果用MEGA 10.1.8和DNAST...     

福建省人感染H5N6禽流感病毒与外环境禽流感病毒相关性分析

目的 分析福建省外环境H5亚型禽流感病毒分布情况及与人感染H5N6禽流感的关系,为人感染禽流感的科学防治提供依据。方法 收集2013-2017年福建省外环境常规监测标本信息,进行统计分析。从数据库下载相关禽流感病毒基因序列,进行基因同源性比对和系统进化分析。结果 外环境监测结果统计分析显示:2013-2017年共采集样本4 903份,H5亚型阳性率为4.24%,且不同的网络实验室(χ²=101.033)、监测场所(χ²=45.526)、标本类型(χ²=31.751)和季节(χ²=48.174)阳性率均存在统计学差异(P<0.05)。福建省首例人感染H5N6禽流感(A/Fujian-Sanyuan/21099/2017)病毒全基因序列与6株福建省外环境H5N6病毒的同源性在85.1%~98.5%,与病家院中采集的1株加强监测外环境标本的HA和NA基因同源性分别为100.0%和99.9%。系统进化分析显示:福建省人感染H5N6病毒HA基因与加强监测的外环境H5N6病毒的进化距离最近,与其余6株距离较远,处在不同的进化分枝中,其基因源于H5N8病毒;而NA基因则与7株外环境H5N6病毒的进化距离较近,源于H5N6病毒。结论 福建省冬春季外环境中禽流感活动较为活跃,应加强活禽交易市场的卫生管理工作。福建省发现的首例人感染H5N6禽流感与外环境禽流感病毒的重配可能存在一定的相关性。     

2009～2010年北京地区甲型流感监测分析

目的了解北京地区2009～2010年甲型流感的流行情况,为预防和控制北京地区甲型流感的流行提供依据。方法以解放军总医院作为哨点医院,用Real-ti me RT-PCR从流感样病例咽拭子中检测甲型流感病毒,监测甲型流感病毒在该地区的流行情况。结果 2 134份标本中甲型流感病毒阳性575份,阳性率为26.94%,其中甲型H1N1占46.26%,季节性H3N2型占40.70%,H1N1型占3.30%,未分型占9.74%。甲型流感病毒感染者年龄分布峰值在20～30岁之间,感染时间分布的2个峰值在第37周和47周,分别以H3N2型和甲型H1N1流感病毒为主。结论 2009～2010年北京地区流行的甲型流感病毒以甲型H1N1为主,其次是H3N2,甲型H1N1取代了季节性H3N2流感病毒在冬季的流行。应加强对甲型流感病毒的监测,密切关注甲型H1N1流感病毒的抗原变化有重要意义。     

2014年长沙市禽类场所环境H9N2亚型禽流感病毒分子流行特征分析

目的 了解2014年长沙市禽类场所环境中H9N2亚型禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)血凝素(Hemag-glutinin,HA)、神经氨酸酶(Neuraminidase,NA)和非结构蛋白(ron-structural,NS)基因的分子进化特征,为人感染H9N2亚型AIV防控提供实验室科学证据支持.方法 对2014年长沙市禽类场所中采集的501份环境标本(禽类饮水263份,污水221份,其他标本17份)利用real-time PCR方法进行A型、H5、H7和H9亚型流感病毒核酸检测,然后对单独H9阳性标本利用HA和NA基因通用引物进行RT-PCR扩增和核苷酸测序,病毒HA、NA及NS基因测序结果在线BLAST分析,利用Bioedit和Mega5软件进行氨基酸比对和进化树构建.结果 从501份环境标本中检出A型AIV核酸阳性标本350份,H9亚型核酸阳性标本191份,占总标本数量的38.12％,H5亚型核酸阳性标本177份(35.33％),H7亚型核酸阳性11份(2.20％),H5和H9亚型混合核酸阳性标本68份(13.57％).部分单独H9亚型核酸阳性标本经RT-PCR和核苷酸测序鉴定出阳性H9N2亚型病毒核酸标本23份,分子进化分析表明2014年长沙市禽类场所环境中的绝大部分H9N2亚型AIVHA、NA、NS基因来源于A/Chicken/Shanghai/F/98 (F98)类似株病毒,属于新的S基因型,HA蛋白受体结合位点(Receptorbinding site,RBS)第235位(对应H3流感第226位)氨基酸为Leu (L),表现为特异性结合人流感病毒受体特征,病毒HA、NA及NS蛋白关键分子位点表现为低致病性的分子特征.结论 2014年长沙市禽类场所环境中H9亚型AIV核酸阳性率最高,H9N2亚型AIV的HA、NA和NS基因表现为低致病性的分子特征,但具有容易感染人类的特征,需要迸一步加强监测.     

From the Cover: Crystal structures of two subtype N10 neuraminidase-like proteins from bat influenza A viruses reveal a diverged putative active site

Recently, we reported a unique influenza A virus subtype H17N10 from little yellow-shouldered bats. Its neuraminidase (NA) gene encodes a protein that appears to be highly divergent from all known influenza NAs and was assigned as a new subtype N10. To provide structural and functional insights on the bat H17N10 virus, X-ray structures were determined for N10 NA proteins from influenza A viruses A/little yellow-shouldered bat/Guatemala/164/2009 (GU09-164) in two crystal forms at 1.95 Å and 2.5 Å resolution and A/little yellow-shouldered bat/Guatemala/060/2010 (GU10-060) at 2.0 Å. The overall N10 structures are similar to each other and to other known influenza NA structures, with a single highly conserved calcium binding site in each monomer. However, the region corresponding to the highly conserved active site of influenza A N1-N9 NA subtypes and influenza B NA differs substantially. In particular, most of the amino acid residues required for NA activity are substituted, and the putative active site is much wider because of displacement of the 150-loop and 430-loop. These structural features and the fact that the recombinant N10 protein exhibits no, or extremely low, NA activity suggest that it may have a different function than the NA proteins of other influenza viruses. Accordingly, we propose that the N10 protein be termed an NA-like protein until its function is elucidated.     

2016—2020年深圳市盐田区流行性感冒流行特征分析

目的 分析深圳市盐田区流行性感冒的流行病学特征,预测其流行趋势,为流感防控提供科学依据.方法 收集2016—2020年盐田区流感样病例(ILI)监测数据、辖区内流感暴发疫情数据和病原学检测结果并进行分析.结果 2016—2020年深圳市盐田区哨点医院共报告ILI 1563例,其中男性898例,女性665例;年龄以0～1...