基于网络药理学探讨丹参治疗骨质疏松症的作用机制

目的:采用网络药理学方法分析中药丹参防治骨质疏松症(osteoporosis,OP)的药效物质基础及其分子作用机制。方法:通过TCMSP数据库筛选出丹参的活性成分及其作用靶点;检索OMIM、GeneCards和DisGeNET数据库获得OP的相关靶基因;绘制韦恩图获得丹参-OP共有靶点。通过Cytoscape软件构建疾病-药物-有效成分-靶点相互作用网络;利用Bioconductor工具对共有靶点进行GO功能注释和KEGG通路富集分析。结果:共获得OP相关基因2 026个,丹参抗OP潜在有效成分21个,包括丹参素、丹参酮ⅡA、隐丹参酮、木樨草素等,这些有效成分共作用于474个靶点,其中有53个与OP相关,其潜在调控信号通路139条,包括AGE-RAGE、PI3K-Akt、JAK-STAT等与各种骨细胞增殖、分化密切相关的信号通路。结论:丹参抗OP具有多成分、多靶点、多途径的作用特点,网络药理学为丹参抗OP作用机制的阐明提供了科学依据,并为中药的防病治病机制研究提供参考思路。     

益骨汤治疗肾虚兼气血不足型骨质疏松症临床观察

目的观察益骨汤对肾虚兼气血不足型骨质疏松症的临床疗效。方法将126例骨质疏松症患者随机分为两组。治疗组服用益骨汤;对照组服用维生素D加钙片。结果与治疗前相比,两组治疗后各项指标均得到改善,且具有显著性差异(P0.05);与对照组相比,治疗组的各项指标均具有显著性差异(P0.05);中医症候的总有效率两组无显著性差异(P0.05),但治疗组的显效率47.6%显著高于对照组的30.2%,数据具有统计学意义(P0.05)。结论中药益骨汤对肾虚兼气血不足型骨质疏松症具有显著的治疗作用,且优于单纯的钙制剂治疗。     

基于网络药理学的续断抗骨质疏松分子作用机制研究

目的：基于网络药理学探讨续断治疗骨质疏松症（osteoporosis,OP）的作用机制。方法：通过中药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP）,以药代动力学特征为标准获取续断的活性成分,并预测相关活性成分的作用靶点;与GeneCards和DisGeNET数据库获取的骨质疏松疾病靶点映射,筛选续断治疗OP的潜在靶点。利用STRING数据库和Cytoscape软件构建中药?活性成分?疾病?靶标调控网络和潜在靶点间的蛋白互作网络。同时通过Enrichr在线工具进行潜在靶点的GO分析以及KEGG通路富集分析。最后通过AutoDock Vina软件将续断活性成分与重要的靶蛋白进行分子对接验证。结果：共获得续断活性化合物8个,根据靶点预测技术预测出相关靶点53个,与疾病靶点映射得续断?OP疾病交集靶点14个。富集分析显示续断可通过多条主流信号通路及细胞代谢过程调控OP的发生发展。分子对接实验证实续断的活性成分和靶标之间具有良好的结合能力。结论：续断除了通过直接作用骨代谢相关途径,还参与调控上下游多条信号通路,从而干预OP的进展。     

基于网络药理学探讨龟鹿二仙胶治疗骨质疏松症的作用机制

目的:通过网络药理学的方法研究龟鹿二仙胶治疗骨质疏松症的相关作用机制。方法:基于TCMSP数据库、ETCM数据库、化学专业数据库、DrugBank数据库获取龟鹿二仙胶的潜在活性成分及相关靶点,从OMIM、Genecards数据库获取骨质疏松症的已知治疗靶点,运用STRING数据库建立活性成分-疾病靶点的蛋白相互作用网络(PPI),利用Cytoscape3.8.0软件对该网络进行拓扑参数分析得到关键活性成分及其靶点。并在R4.0.2中利用Bioconductor数据包对关键靶点进行GO生物学功能分析和KEGG通路分析,得到龟鹿二仙胶治疗骨质疏松症的有效成分和作用靶点。结果:龟鹿二仙胶共有87个活性成分和2 305个靶点,骨质疏松症共有4141个已知治疗靶点,二者共同作用靶点共71个,获得PPI核心基因69个,GO生物学过程分析得出95个条目,KEGG通路分析得出115条通路。结论:龟鹿二仙胶可能通过抑制炎症因子、调节成骨及破骨细胞分化、改善微循环、促进破骨细胞凋亡等途径起到抗骨质疏松的作用,涉及的通路包括TNF信号通路、IL-17信号通路、NF-kB信号通路、HIF-1信号通路、MAPK...     

菟丝子—黄芪治疗骨质疏松症的网络药理学机制研究

【目的】运用网络药理学方法探讨菟丝子-黄芪治疗骨质疏松症的作用机制。【方法】首先采用中药系统药理学分析平台(TCMSP)和GeneCards数据库,分别筛选菟丝子、黄芪的中药活性成分,中药靶标及骨质疏松症的疾病靶标,将中药靶标一一映射到疾病靶标,得到中药-疾病靶标并构建中药-成分-疾病-靶标调控网络。其次通过构建中药-疾病靶标的蛋白互作网络和条形图,筛选核心靶标。最后将中药-疾病靶标进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,得出中药-疾病靶标涉及的功能和信号通路。【结果】筛选得到菟丝子-黄芪治疗骨质疏松症的21个有效成分和127个中药-疾病靶标,中药-疾病靶标涉及的GO功能主要包括转录激活活性、转录因子活性、辅因子结合、核受体活性、类固醇激素受体活性、RNA聚合酶Ⅱ转录因子结合、泛素样蛋白连接酶结合、类固醇结合等。中药-疾病靶标涉及的KEGG通路主要包括前列腺癌信号通路、糖尿病并发症的晚期糖基化终末产物-晚期糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)信号通路、动脉粥样硬化信号通路、结直肠癌信号通路、乙肝信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、小细胞肺癌信号通路、内分泌失调信号通路、细胞凋亡信号通路、乳腺癌信号通路等。【结论】运用网络药理学研究方法可预测出菟丝子-黄芪治疗骨质疏松症的主要活性成分、功能活动和信号通路。     

基于网络药理学和分子对接探讨香加皮防治牙周炎的作用机制

目的 运用网络药理学方法及分子对接技术探究香加皮治疗牙周炎的有效成分和作用靶点及其作用机制。方法 采用中药系统药理学数据库（TCMSP）、中医药百科全书（ETCM）和中药分子机制的生物信息学分析工具（BATMAN-TCM）检索筛选香加皮有效作用成分及靶点,并通过Swiss Target Prediction数据库检索预测成分的作用靶点。应用人类基因信息数据库（GeneCards）和DisGeNET数据库获取牙周炎相关靶点,将药物与疾病靶点进行韦恩分析获得共同靶点。利用Cytoscape 3.8.2软件构建“成分-靶点”网络,基因相互作用数据库（STRING）构建蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络,并进行关键基因筛选以及MCODE聚类分析,利用DAVID数据库进行基因本体（gene ontology, GO）和京都基因与基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG）富集分析,通过Cytoscape 3.8.2软件构建香加皮“药物-成分-靶点-通路”网络,利用分子对接技术验证药物成分与靶点蛋白对接情况。结果 筛选得到香加皮有效...     

从“骨肉不相亲”理论探讨益骨汤治疗骨质疏松症

[目的]探讨益骨汤治疗骨质疏松症与“骨肉不相亲”理论之间的关系。[方法]通过临床跟师、临证记录及参阅文献，对“骨肉不相亲”相关理论进行归纳总结，并结合益骨汤防治骨质疏松症的基础与临床研究，探讨益骨汤与“骨肉不相亲”理论之间的联系。[结果]姚新苗教授认为，骨质疏松症的发病机制为“亏瘀致痿”，据此提出“补肾活血法”，并创制“益骨汤”治疗骨质疏松症。“骨肉不相亲”理论则揭示“骨痿”的发病机制为“土胜水”，由此进一步提出“骨痿者生于大热”，并据此提出“治痿独取阳明”治疗痿证。“亏瘀致痿”理论是“骨肉不相亲”理论的继承创新，“补肾活血法”是“治痿独取阳明”理论的传承发展。在该指导思想下创制的骨质疏松症经验方益骨汤，经过基础和临床研究证实，能够补肾壮骨、健脾活血，从多方面改善骨质疏松症。[结论]益骨汤从“骨肉不相亲”理论治疗骨质疏松症，理论可行，证据充实，为该病的预防和治疗提供了一定的思路。     

基于网络药理学探讨王不留行治疗前列腺肿瘤的机制研究

目的 探索王不留行治疗前列腺肿瘤的可能作用机制.方法 通过中药系统药理学技术平台(TC-MSP)数据库得出王不留行的活性成分,利用GeneCards数据库以及DRAR-CPI服务器筛选王不留行的活性成分及治疗前列腺肿瘤的潜在作用靶点,进而采用Cytoscape 3.7.1软件构建王不留行的化合物-靶点网络图.通过STR...     

基于系统生物学探讨强骨饮防治原发Ⅰ型骨质疏松症的靶标和作用机制

目的 探讨强骨饮的物质基础及其靶标，阐明强骨饮防治原发Ⅰ型骨质疏松症的多靶点特点和作用机制。 方法 首先，通过中医药综合数据库(TCMID)、PubChem等数据库确定强骨饮中已知化合物，并用STITCH数据库进行分析。然后，通过中医药分子机制生物信息学分析工具(BATMAN-TCM)预测相关靶标。最后，对靶标进行Gene Ontology(GO)、信号通路和蛋白相互作用网络的富集分析。 结果 本研究总共纳入强骨饮12味中药相关的435种化合物，2 487个靶标；靶标富集结果显示核酸结合转录因子活性，信号传导活性，氧化还原酶活性等138个GO术语被显著富集(均P<0.05)；Wnt信号通路，破骨细胞分化等211个信号通路被显著富集(均P<0.05)。 结论 将强骨饮中的君臣佐使中药转换为与靶标相互作用的化合物形式，发现强骨饮-化合物-靶标，形成了一个非常复杂的三级网络系统，这种网络关系系统有利于阐明强骨饮的物质基础及强骨饮的配伍机制。靶标功能分析，提示强骨饮靶标和通路不仅直接参与骨重建细胞的分化，成骨、破骨代谢平衡，还通过全身其他系统，如循环系统神经系统等来影响和干预骨微环境。强骨饮治疗原发Ⅰ型骨质疏松症具有多靶点的特点，君臣佐使配伍合理，其作用机制符合目前骨质疏松症疾病的病理机制，其针对骨质疏松症的病因病机，从全身多系统进行干预，协调机体的代谢平衡，具有治病求本的特点。      

基于虚拟筛选技术的清感冬饮防治新型冠状病毒感染的潜在活性成分与作用机制研究

[目的]通过网络药理学及分子对接等虚拟筛选技术探究清感冬饮（QGDD）防治新型冠状病毒肺炎（COVID-19）的潜在活性成分及作用机制,为清感冬饮的临床应用提供科学依据。[方法]基于清感冬饮已鉴定的化学成分,以GeneCards和DrugBank数据库检索靶标信息,通过Origin、STRING和Cytoscape构建“药材-制剂-成分-靶点”“蛋白-蛋白相互作用”“药材-归经”等网络,采用DAVID进行功能富集分析。采用BIOVIA Discovery Studio2020进行潜在活性成分和关键靶点的分子对接。[结果]清感冬饮的11味中药中有9味归肺经,筛选获得的45个潜在活性成分与COVID-19的共有靶点66个,GO功能富集分析得到324个生物过程条目、24个细胞组分条目、45个分子功能条目,KEGG富集分析得到123条信号通路,与免疫调节、抗病毒感染和炎症损伤修复相关。分子对接显示组方中多个化合物与主要靶点受体TNF-α、AKT1、VEGFA和ACE2具有中等强度以上的潜在相互作用,提示组方通过多组分配伍,协同发挥防治COVID-19的功效,金银花和红茶中的山柰酚-3-O-芸香...     

补肾化瘀方治疗宫腔粘连的潜在靶点及机制研究

目的 以网络药理学为主要研究思路,探讨补肾化瘀方治疗宫腔粘连的潜在靶点与可能机制,以期为后续进一步临床及实验验证提供可靠的理论依据。方法 借助TCMSP、TCMID、PubChem、TCMSP、Swiss Target Prediction数据库对补肾化瘀方的活性成分、作用靶点进行筛选,借助Disgenet、Genecards、OMIM数据库获得宫腔粘连疾病靶点,将两者导入Cytoscape 3.8.2软件筛选交集靶点并构建“药物–成分–靶点–疾病”网络图,获得补肾化瘀方治疗宫腔粘连的核心成分,并通过STRING数据库构建的蛋白质相互作用（protein-protein interaction,PPI）网络图推测核心基因。最后通过R语言对交集靶点进行基因本体论（gene ontology,GO）与京都基因与基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG）富集分析,推测可能作用机制。结果 共获得补肾化瘀方治疗宫腔粘连的活性成分116个,起治疗作用的核心基因可能为CXCL8、KDR、LCK、ITGAL。GO富集至上皮细胞增殖、修复等生物学过程。KEGG富集分析共涉及169条信号通路,以涉及炎症、免疫激活的相关通路为主。结论 补肾化瘀方治疗宫腔粘连具有多靶点和多通路的复杂过程,基于网络药理学推测补肾化瘀方主要通过调控免疫–炎症反应、细胞增殖、转化等途径治疗宫腔粘连。     

宽胸理肺汤联合三子养亲汤治疗慢性阻塞性肺疾病急性加重期疗效观察

[摘要]目的：评价宽胸理肺汤联合三子养亲汤治疗慢性阻塞性肺疾病（COPD）急性加重期痰浊壅肺证的临床疗效、安全性及其对肺功能、血常规的影响。方法：将符合诊断标准的患者随机分为:对照组30例,以西医常规方法治疗;宽胸理肺汤组30例,在对照组基础上加服宽胸理肺汤;宽胸理肺联合三子养亲汤组30例,在宽胸理肺汤组基础上加服三子养亲汤。7d为1疗程,观察3组临床疗效及治疗前后中医证侯积分、肺功能、血常规改善情况。结果：（1）宽胸理肺汤联合三子养亲汤组总有效率93.3%,高于宽胸理肺汤组（80%）和对照组（66.7%）。两汤联合组与对照组比较有统计学差异（P=0.01）。两汤联合组数值上优于宽胸理肺汤组,宽胸理肺汤组优于对照组,但均无统计学意义（P=0.129,0.243）。（2）中医证侯积分两汤联合组改善最佳,与其余两组比较有统计学差异（P=0.018,0.000）,宽胸理肺汤组改善亦优于对照组（P=0.027）。（3）两汤联合组能有效改善患者FEV1%预计值、FEV1/FVC%、白细胞计数及中性粒细胞比例,明显优于对照组（P=0.003,0.000,0.001,0.003）。宽胸理肺汤组亦优于对照组（P=0.032,0.037, 0.037,0.034）,两汤联合组与宽胸理肺汤组比较有所改善,但无统计学意义（P=0.357,0.063,0.211,0.396）。结论：在西药基础上合用宽胸理肺汤与三子养亲汤,能有效降低白细胞计数和中性粒细胞比率,改善肺功能,从而改善慢性阻塞性肺疾病急性加重期痰浊壅肺证患者的临床症状体征,且未发现明显毒副作用。     

加减右归饮治疗膝关节骨性关节炎机理研究

膝关节骨性关节炎是一种常见于中老年的退行性病变,加减右归饮具有补肾壮阳,填精补髓作用,能增强细胞活力,能改善由阳虚引起的代谢功能低下的作用,能抑制关节软骨细胞凋亡,因而有效地改善骨性关节炎病理表现。     

基于网络药理学的半夏泻心汤治疗胃癌作用机制研究

目的 采用网络药理学的方法研究半夏泻心汤治疗胃癌的作用机制.方法 通过TCMSP平台查询半夏泻心汤化学成分及对应靶点,采用DisGeNet、OMIM、TTD等疾病数据库查询胃癌相关靶点.取两者交集为共同靶点,采用STRING构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络,并进行KEGG通路富集分析.结果 查询到半夏泻心汤化学成分19...     

基于网络药理学和分子对接分析参附汤治疗房颤的作用机制

  目的  基于网络药理学和分子对接技术,探索参附汤治疗房颤的作用机制。  方法  2020年3—4月通过TCMSP数据库筛选参附汤的活性成分以及相关靶点,并在Uniprot数据库中对相关靶点进行注释并得到基因名;在OMIM和Pharmgkb等数据库,获取房颤相关的靶点;由R软件对房颤及其与参附汤有效成分靶点取交集,获得关键治疗靶点;利用String数据库构建PPI网络,并将结果导入Cytoscape软件中构建“活性成分-作用靶点-疾病”网络和进行拓扑分析,获得核心靶点;随后在DAVID数据库对关键靶点进行GO功能注释及KEGG富集分析,最后通过AutoDock Vina软件对关键成分和核心靶点进行分子对接。  结果  获得参附汤靶点101个,房颤靶点3 219个,交集后获得65个共有靶点,拓扑分析发现NFKBIA、RELA、IL1B、JUN、STAT1、MAPK8是参附汤治疗房颤的核心靶点;GO提示主要靶点涉及电压门控钙通道活性、钙离子传输以及活性氧代谢等生物学过程;KEGG提示主要靶点通过cGMP-PKG、cAMP、钙通道以及PI3K-Akt等信号通路参与治疗房颤;分子对接结果显示核心靶点蛋白与对应参附汤活性成分具有较好的结合稳定性。  结论  参附汤治疗房颤具有“多成分-多靶点-多通路”的作用特点,可能与NFKBIA、RELA、IL1B、JUN、STAT1、MAPK8靶点相关,其具体机制尚需分子生物实验印证。      

基于网络药理学探讨三拗汤治疗咳嗽变异型哮喘的作用机制

目的 根据网络药理学方法对三拗汤治疗咳嗽变异型哮喘的作用机制进行探讨.方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)对三拗汤中有效成分进行筛选及靶点预测,检索GeneCards、OMIM数据库筛选CVA疾病靶点,借助网络拓扑分析插件CytoNCA筛选三拗汤治疗CVA核心靶点,使用Cytoscape 3.7.1建...