应用cDNA微阵列芯片筛选胃癌相关基因

目的：应用cDNA微阵列芯片技术筛选人胃腺癌和相对应正常胃黏膜间的差异表达基因。方法：将8192条人类基因PCR产物按微阵列排列点样于化学涂层的载玻片上，即制成cDNA微阵列芯片；抽提胃腺癌和相对应正常胃黏膜组织的RNA并纯化mRNA；将等量的胃腺癌和相对应正常胃黏膜组织的mRNA分别逆转录合成荧光分子标记的cDNA做探针．混合后杂交上述cDNA微阵列芯片；经严格洗片后扫描芯片荧光信号图象，计算机分析后比较2种组织中差异表达的基因。结果：在8192条基因中．共有327条基因在胃腺癌和相对应正常胃黏膜组织间差异表达，其中179条基因下调．148条基因上调。结论：胃腺癌发生过程中有多基因的参与；cDNA微阵列芯片技术是筛选人胃腺癌相关基因的有效方法。     

胃腺癌差异表达基因的cDNA微阵列研究

目的:应用cDNA基因芯片研究筛选人胃腺癌相关差异表达基因, 探讨胃癌发生、发展的分子机制。方法: 运用含18 000个基因克隆的cDNA膜基因芯片,对6 对胃腺癌及正常胃组织标本分别进行杂交检测并对比分析。结果: 6 对人胃腺癌与相对应的胃正常组织相比较,筛选出在3~6 对标本中有2 倍以上改变的基因克隆共有103条(1 条在所有标本中均差异明显),其中胃癌组织表达上调基因56条, 胃癌组织表达下调基因47 条。结论: 人胃腺癌癌变是一个多基因参与的过程, 基因芯片技术是一种快速有效的筛选人胃腺癌差异表达基因的方法。     

胃腺癌差异表达基因的cDNA微阵列研究

目的：应用cDNA基因芯片研究筛选人胃腺癌相关差异表达基因，探讨胃癌发生、发展的分子机制。方法：运用含18000个基因克隆的cDNA膜基因芯片，对6对胃腺癌及正常胃组织标本分别进行杂交检测并对比分析。结果：6对人胃腺癌与相对应的胃正常组织相比较，筛选出在3～6对标本中有2倍以上改变的基因克隆共有103条(1条在所有标本中均差异明显)，其中胃癌组织表达上调基因56条，胃癌组织表达下调基因47条。结论:人胃腺癌癌变是一个多基因参与的过程，基因芯片技术是一种快速有效的筛选人胃腺癌差异表达基因的方法。     

基因芯片在胰腺癌相关基因筛选中的初步研究

目的探讨基因表达谱芯片技术在筛查胰腺癌相关基因群表达中的作用。方法按微矩阵排列的4096种全长基因PCR产物制成Biostar H-40s型微矩阵表达谱芯片;采用一步法抽提胰腺癌及正常胰腺组织总RNA,用Oligotex mRNA离心柱分离纯化两种组织的mRNA;经逆转录合成荧光分子(Cy3/Cy5)掺入的cDNA一链制备表达谱探针,芯片杂交和洗片后,用荧光扫描仪扫描芯片荧光信号图像,分析胰腺癌及正常胰腺组织中差异表达的基因。结果在4096种基因中,胰腺癌组织与正常胰腺组织间有949条(23.2%)存在差异表达的基因,其中我们确定了9条上调和8条下调的癌基因和抑癌基因可能与胰腺癌的发病机制存在相关性。结论基因表达谱芯片技术可以筛选出胰腺癌表达异常的相关基因群,对其进一步研究有助于认识胰腺癌的发病机制。     

基因表达谱芯片在人直肠腺癌相关基因筛选中的应用研究

[目的]用基因表达谱芯片研究直肠腺癌和正常直肠黏膜基因表达差异，筛选直肠腺癌相关基因。[方法]分别抽提直肠腺癌和正常直肠黏膜的总RNA；通过逆转录方法将Cy3和Cy5两种荧光分别标记到两组cDNA上，制成探针；利用这种cDNA探针与含有4096条人类基因PCR产物的表达谱芯片进行杂交。扫描芯片荧光信号图像。计算机分析后比较两种组织中差异表达的基因。[结果]通过基因芯片筛选，在4096条基因中，直肠腺癌和正常直肠黏膜差异表达显著的基因共有121条(2．95％)，其中上调的85条（2．075％)，下调的36条（0．879％)，上调和下调的基因中各有2条为新基因。[结论]直肠腺癌基因差异表达谱的分析可为直肠癌的诊断、治疗和预防提供新的思路和线索。     

胃癌患者原癌基因和抑癌基因的表达谱研究

目的 :用基因表达谱芯片对人正常胃和胃癌组织原癌和抑癌基因表达的差异进行研究比较。方法 :利用胃和胃癌组织的mRNA通过逆转录方法 ,将Cy3和Cy5 2种荧光分别标记到 2组cDNA上制成探针 ,然后和表达谱芯片进行杂交后扫描 ,通过计算机分析判定 2种基因是否在上述组织中存在差异表达。结果 :在 195条原癌及抑癌基因中 ,存在差异表达的共 13条 ,表达上调的 6条 (0 0 71% ) ,表达下调的 7条 (0 0 83% )。结论 :认为应用这种方法识别出的 2种基因对胃癌的诊断和治疗具有重要的潜在价值     

胚胎肺和正常肺组织基因表达谱差异

背景与目的:利用基因芯片技术研究胚胎肺和正常肺组织基因表达谱差异,筛选出人肺在发育过程中基因的变化.材料与方法:分别抽取胚胎肺组织和正常肺组织的总RNA并纯化mRNA,用逆转录的方法,将各mRNA的两种荧光cy5和cy3标记的cDNA链做探针,并与含有1 152条人类全长基因芯片上进行杂交.以ScanArray4000荧光扫描仪扫描芯片上两种荧光信号,用计算机处理和分析.结果:胚胎肺和正常肺组织比较差异2倍以上基因共有317条,其中193条表达增加,124条表达降低.结论:胚胎肺和正常肺组织之间存在有基因差异,初步证明人肺组织在发育过程中受环境影响.     

康莱特抗小鼠肺腺癌相关基因表达谱研究

目的:寻找康莱特抗肺腺癌的表达差异基因。方法:复制T739小鼠肺腺癌模型,制备mRNA探针,应用cDNA表达谱芯片,分析差异表达的基因。结果:康莱特与对照组瘤组织的3张芯片得到的差异表达基因交叉3条,其中2条表达增高,1条表达降低。多数差异表达基因与代谢、免疫相关。结论:运用基因芯片工具和生物信息学方法,能够得到康莱特抗肺腺癌相关的差异表达基因。     

mRNA差异显示法筛选和克隆胃癌相关基因

目的 :筛选和克隆胃印戒细胞癌与正常胃黏膜细胞差异表达基因片段。方法 :采用mRNA差异显示法 (mRNAdifferentialdisplayPCR ,DD PCR) ,对比胃印戒细胞癌组织与正常胃黏膜组织mRNA的表达差异 ,克隆胃印戒细胞癌差异片段 ,经过RNA的斑点杂交、测序以及序列分析和同源性比较。结果 :胃印戒细胞癌与正常胃黏膜中存在明显的基因表达差异 ,发现与胃癌相关的差异表达条带 16条 ,其中 7条为缺失表达条带 ,9条为过度表达条带。对其中 4条差异表达条带进行克隆、测序 ,经序列分析及同源性比较和RNA的斑点杂交 ,表明确认其中 1条为GenBank/BLAST中尚未收录的片段。结论 :胃印戒细胞癌的mRNA差异显示证明 ,该EST序列可能在胃癌的发生发展中具有一定作用     

基因芯片在肾癌相关基因研究中的应用

目的：通过研究人肾癌组织和癌旁正常组织中差异表达的基因，寻找肾癌相关基因以用于诊断和治疗。方法：以包含8000个cDNA基因表达谱芯片研究1组肾癌组织样本的基因表达谱。按一步法抽提肾癌和对照组癌旁正常组织的总RNA并纯化mRNA；将等量的对照组织和肾癌组织mRNA分别逆转录合成荧光分子掺入的cDNA-链做探针，混合后杂交上述基因芯片。经严格洗片后用ScanArray3000扫描仪扫描芯片荧光信号图像，计算分析后比较2种组织中差异表达的基因。结果：共筛选出差异表达基因95条，其中未知基因44条。结论：基因芯片在筛选肾癌相关基因的改变具有快速、高通量、灵敏的特点，肾癌在细胞代谢、信号转录、蛋白合成的相关基因方面有异常表达。     

应用基因表达谱芯片研究人胃癌细胞周期和细胞凋亡相关基因

目的：筛选胃癌发生过程中与正常组织差异表达的细胞周期和细胞凋亡相关基因并作初步功能分析.方法：应用Trizol一步法抽提胃癌及正常组织总RNA,分离纯化mRNA并逆转录合成荧光分子（Cy3/Cy5）标记cDNA探针,与含有8 464种cDNA基因的表达谱芯片杂交,分析胃癌与正常组织间差异表达的基因,对所获得的基因进行分子生物信息学分析.结果：胃癌与正常组织间差异表达的细胞周期和细胞凋亡基因有17条,占芯片基因总数的0.2%.其中与细胞周期相关的基因11条,与细胞凋亡相关的基因6条.在胃癌组织中表达量增加的10条,表达量下降的7条.生物信息学分析显示,该17条差异表达的细胞周期和细胞凋亡相关基因,与胃癌组织细胞的生长和凋亡有关.结论：胃癌的发生、发展过程中存在多基因表达调控的改变,细胞周期和细胞凋亡基因与胃癌组织细胞的生长和凋亡有相关性,对于该相关基因群的进一步研究有助于阐释胃癌的发病机制.     

胃癌及癌前病变差异表达基因的初步研究

目的:寻找胃癌、癌前病变中差异表达的基因,以确定胃癌发生前胃粘膜的分子变化方法:应用荧光mRNA差异显示技术分析胃癌(3例)、癌前病变(3例)和正常胃粘膜(3例),鉴别并分离差异表达的基因片段,进行PCR再扩增将扩增的cDNA片段克隆后测序,测序结果提交GenBank,经BLASTN软件检索以进行同源性分析.差异条带经Northern印迹验证.结果:发现2个差异表达的cDNA片段,1个在正常组织和癌前病变中高表达的cDNA片段在GenBank数据库中未找到同源序列,获得GenBank登陆号CB833297,并由UNIGENE基因库收录,为新基因片段.另1个在正常胃粘膜组织中高表达的cDNA片段,在GenBank数据库中与RP11-315A19克隆高度同源,但其功能目前尚不清楚.结论:本研究发现的2个在胃癌、癌前病变及正常胃粘膜组织中差异表达的基因,它们可能参与了胃癌的发病过程.     

cDNA微阵列对22例弥漫型胃癌基因的检测

目的从转录组水平识别弥漫型胃癌与正常胃黏膜间的基因表达差异,探讨胃癌分子发生发展机制。方法收集22例弥漫型胃癌患者的新鲜冻存胃癌组织及同例相应正常胃黏膜。杂交芯片采用含14592个点的cDNA表达谱芯片。差异表达基因的筛选标准为该基因在50％以上样本中的肿瘤与正常组织荧光强度比（ratio比值）〉2或〈0．5。采用系统聚类法进行基因表达的相似性分析,标本组间比较采用方差分析。应用实时定量RT—PCR方法对芯片结果进行验证。结果胃癌组织与正常胃黏膜间的差异表达基因共357个,其中表达上调者153个,下调者204个。上调基因功能主要与细胞骨架运动、基质重建、细胞增殖及信号传导等相关;下调基因功能则主要与细胞免疫防御、毒理代谢、功能分化、核一浆转运及凋亡抑制等相关。TNM分期的Ⅰ＋Ⅱ期组与Ⅲ＋Ⅳ期组间,有7个基因的表达差异有统计学意义（P〈0．05）。RT—PCR验证结果与芯片表达结果一致。结论运用cDNA芯片进行弥漫型胃癌基因表达谱分析,有助于从分子水平全方位阐明弥漫型胃癌的发病机制及生物学特性,也有助于进一步发现新的分子诊断指标和基因治疗靶标。     

基因表达谱芯片筛选甲状腺癌失分化相关基因的初步研究

目的应用基因芯片技术筛查甲状腺癌失分化相关基因,为进一步研究其发病机制提供新的思路和线索。方法分别用Cy5和Cy3两种不同的荧光染料通过逆转录反应将失分化甲状腺癌组和对照组分化型甲状腺癌组织的mRNA分别标记成探针,并与载有一组靶基因的基因表达谱芯片进行杂交。通过扫描荧光强度,计算机软件分析,寻找两组差异表达基因。结果分化型甲状腺癌与失分化甲状腺癌组织之间存在一系列差异表达基因,共有373条差异表达基因,其中表达增加的有209条(2.0倍以上),表达降低的有164条(0.5倍以下)。结论基因芯片为筛选甲状腺癌失分化相关基因提供了有效的方法。     

应用荧光差异显示法对胃癌及癌前病变相关基因的研究

背景与目的：一般认为胃癌是由癌前病变(慢性萎缩性胃炎、肠化生和不典型增生)逐步发展形成的。mRNA差异显示法是筛选肿瘤发生、发展中差异表达基因的有用方法。在胃癌、癌前病变中寻找差异表达的基因将有助于确定胃癌发生前的胃粘膜组织的分子变化。方法：应用荧光mRNA差异显示技术分析胃癌(2例)、癌前病变(2例)和正常胃粘膜(2例)组织,鉴别并分离差异表达的基因片段,进行PCR再扩增。将扩增cDNA片段克隆后进行测序,测序结果提交GenBank,经BLAST软件检索以进行同源性分析。RT-PCR检测血影蛋白基因在胃癌(7例)、癌前病变(7例)和正常胃粘膜(7例)的表达。结果：发现4个差异表达的cDNA片段,其中3个cDNA片段在胃癌中高表达,1个cDNA片段在正常组织和癌前病变组织中高表达。1个在胃癌组织中高表达的cDNA片段与血影蛋白基因(SPTANl)同源,RT-PCR检测也发现血影蛋白基因在胃癌组织中高表达。另外3个与GenBank中已知的基因序列同源,但其功能目前尚不清楚。结论：所发现的4个差异表达的基因有3个在胃癌组织中高表达,其中SPTAN1基因在胃癌组织的表达比正常胃粘膜及胃异型增生组织表达明显高。     

基因表达谱芯片胃癌差异表达基因的筛选

目的:利用基因表达谱芯片研究胃癌组织中差异表达的基因,从多基因角度研究胃癌发生的分子机制.方法:抽提6例胃癌组织和相应的癌旁组织的总RNA,反转录成cDNA同时进行标记.将标记的cDNA与基因表达谱芯片杂交,经过芯片的扫描和数据处理,分析出胃癌组织和癌旁组织之间差异表达的基因.结果:通过对胃癌组织和癌旁组织的基因表达谱的比较分析,发现在胃癌组织中表达差异＞2倍的基因共有696个,其中表达上调的基因318个,表达下调的基因378个.差异表达的基因主要参与信号转导、免疫反应和细胞运动等生物学过程.结论:胃癌组织与癌旁组织的表达谱存在较大差异,利用基因表达谱芯片可筛选出胃癌差异表达的基因,从而有利于在临床上对肿瘤的诊断和治疗.     

对比分析黑斑息肉综合征合并大肠癌组织肿瘤基因

Objective:The aim of the study was to screen the differentially expressed genes of Peutz-Jeghers syndrome (PJS) and colorectal carcinoma (CRC).Methods:This study used cDNA microarray to comparatively analyze the gene expression profiles of 4 cases of PJS combined with colorectal adenocarcinoma vs.normal mucosae.The cDNA microarray contained 8064 human genes,and then using RT-PCR to test three genes of all.Results:The experimental data showed that fourteen genes were differentially expressed,which were up-re...