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1.
胃癌组织5q微卫星不稳定性与APC/MCC基因杂合性缺失的研究 总被引:2,自引:1,他引:1
目的探讨5q微卫星不稳定性(MSI)与APC/MCC基因杂合缺失(LOH)的关系。方法应用PCR-SSLP及PCR-RFLP技术分析52例手术切除胃癌组织中MSI及APC/MMC基因LOH。结果5qMSI检出率为34.0%(16/47),APC/MCC基因LOH率为31.4%(11/35)。早期胃癌5qMSI阳性率为66.7%(2/3),APC/MCCLOH率为50%(1/2);进展期分别为31.8(14/44),30.3%(10/33)。两组间无显著差别(P>0.05)。MSI及杂合缺失与肿瘤大小、浸润深度、淋巴结转移及临床分期无关。粘液(印戒)细胞癌APC/MCCLOH率(55.6%)显著高于高、中分化管状腺癌(P<0.05)。胃、肠两型胃癌5qMSI及APC/MCCLOH差异无显著性及5qMSI与APC/MCCLOH无相关性(P>0.05)。结论染色体5qMSI有APC/MCC基因LOH在两型胃癌的早期发生及发展中起一定作用。染色体5q可能是胃癌的易感部位。 相似文献
2.
伤寒杆菌耐喹诺酮类机制分子生物学基础研究 总被引:11,自引:0,他引:11
目的 研究伤寒杆菌DNA旋转酶A亚单位基因(gyrA)变异与其耐喹诺酮类的关系。方法 应用聚合酶链反应(PCR)检测、限制性片段长度多态性(RFLP)、单链构象多态性分析(SSCP)及序列测定,对伤寒杆菌S275(临床分离敏感菌株)及其自发耐药突变株RG1,DNA gyrA喹诺酮类耐药决定区进行了研究。结果 伤寒杆菌S275 gyrA第128~426位碱基与大肠杆菌KL-16高度同源,仅7.49% 相似文献
3.
幽门螺杆菌清除前后胃粘膜C-myc蛋白和表皮生长因子受体的变化 总被引:3,自引:3,他引:0
目的 了解幽门螺杆菌( Hp) 感染对胃粘膜Cmyc 基因蛋白和表皮生长因子受体(EGFR) 表达的影响.方法 应用流式细胞术和免疫荧光染色技术,对Hp 清除前后胃粘膜Cmyc 基因蛋白和EGFR 进行定量测定,用免疫组化法研究增殖细胞核抗原(PCNA) 在组织中的表达.结果 Hp 阳性患者胃粘膜细胞Cmyc 蛋白和EGFR 的阳性细胞百分率和平均荧光强度显著高于 Hp 阴性患者,经治疗Hp转阴者上述指标显著下降,而Hp 仍为阳性者上述指标则无明显变化. 胃粘膜PCNA 标记指数与Cmyc 蛋白和EGFR 呈一致性改变.结论 Hp 感染导致的Cmyc 蛋白和EGFR 的过度表达,可能对细胞增殖和癌变具有促进作用. 相似文献
4.
胃Hp感染与癌前病变癌基因和抑癌基因表达的关系 总被引:7,自引:8,他引:7
目的研究Hp感染与胃癌及癌前病变中cmyc,p21,p53增殖细胞核抗原(PCNA)表达的相互关系,以探讨Hp可能的致癌机制.方法经内镜和病理诊断明确的病变者共120例,包括慢性浅表性胃炎(CSG)、肠上皮化生、不典型增生、胃癌各30例.以ABC免疫组化法检测上述标本中cmyc,p21,p53,PCNA的表达,以改良Giemsa法检测Hp.各组比较用χ2检验.结果肠型胃癌Hp阳性率为833%(20/24),弥漫型6例中Hp阳性1例.非贲门部胃癌阳性率为739%(17/23),贲门癌7例中阳性3例.胃癌Hp阳性率(667%)与CSG(333%)比较差异非常显著(P<001).各组Hp阳性的cmyc,p21,p53,PCNA与其Hp阴性者作相应比较均有显著或非常显著性差异(P<005~001).结论Hp感染与肠型胃癌的关系更密切,更容易发生于非贲门部.Hp感染可增加细胞的增殖活性,并通过使抑癌基因失活及癌基因激活而引起胃癌 相似文献
5.
PCR法诊断幽门螺杆菌感染的评价 总被引:1,自引:2,他引:1
目的系统评估聚合酶链反应扩增尿素酶A基因(PCR法)对幽门螺杆菌(Hp)感染的诊断价值.方法采用金标准及PCR法检测69例患者(慢性胃炎52例、消化性溃疡12例、胃癌5例)胃粘膜内Hp.结果金标准诊断有Hp感染34例,PCR法诊断35例Hp阳性;金标准诊断35例无Hp感染,PCR法诊断34例Hp阴性.故PCR法敏感度为100%,特异度为971%,粗一致性为985%,调整一致性为986%,误诊率(假阳性率)为29%,漏诊率(假阴性率)为0,正确诊断指数(r)为10,阳性预测值(+PV)为971%,阴性预测值(PV)为100%,阳性似然比(LR+)为35,阴性似然比(LR)为0.结论PCR法对胃粘膜Hp感染的诊断价值高于细菌培养、组织病理学,尿素酶试验各单项方法. 相似文献
6.
PCR法检测胃粘膜中的幽门螺杆菌 总被引:3,自引:1,他引:3
目的建立检测幽门螺杆菌(Hp)的更为敏感的聚合酶链反应(PCR),并探讨它在Hp感染的诊断及根除效果判定中的应用.方法以一对合成的与Hp16SrRNA基因互补的寡核苷酸为引物(CP1/CP2),建立了从胃粘膜中检测Hp的PCR反应,并与常规检测方法进行比较.结果PCR方法检测Hp标准菌株及50株临床分离菌株均产生500bp片段,检出的最小DNA量为01pg,相当于100个细菌细胞;所有13株其它细菌及无Hp感染的人胃粘膜则无扩增产物出现.用该方法检测96名初诊患者Hp感染情况及21名药物治疗后患者Hp根除情况,并与胃粘膜活组织尿素酶试验、细菌培养及银染色方法比较,证实PCR方法可以检出常规方法不能检出的少量Hp.结论PCR是检测Hp的最为敏感的方法,有助于Hp感染的诊断和Hp根除的精确判断 相似文献
7.
原发肝癌N-ras基因点突变研究 总被引:1,自引:0,他引:1
目的研究Nras基因第12位密码子突变与原发性肝癌(HCC)发生发展的关系.方法采用聚合酶链延伸反应限制性片段长度多态性分析法(PCR-RFLP)对30例HCC手术切除标本Nras第12密码子点突变进行检测.结果在30例HCC中,发现Nras第12密码子点突变5例,突变率为167%.点突变与肿瘤大小、分化程度、有无转移及HBV感染无显著相关(P<005).结论N-ras基因第12位密码子突变参与了部分HCC的发生与发展. 相似文献
8.
目的研究EGF受体(EGFR)在大肠癌中表达的意义,并探讨其对细胞增殖的影响.方法用免疫组化LSAB法检测86例大肠癌组织EGFR,PCNA的表达.结果在86例被检组织中,EGFR阳性表达44例(512%),低分化癌(800%,40/50)、淋巴结转移癌(688%,22/32)较高分化(389%,14/36)、淋巴结未受累大肠癌(407%,22/54)有更高的EGFR表达(P<005).DukesA,B,C期大肠癌的EGFR表达率分别为320%,483%,688%,C期与A期比较差异显著;EGFR阳性大肠癌较阴性癌有更高的PCNA标记(两者PCNAⅠ,Ⅱ,Ⅲ,Ⅳ级的例数分别为4,8,17,15;14,16,7,5;P<005).结论EGFR过表达与大肠癌恶性程度、转移趋势密切相关,并可促使癌细胞过度增生. 相似文献
9.
幽门螺杆菌cagA基因株与胃癌p53,bcl—2表达的研究 总被引:3,自引:0,他引:3
目的 通过研究幽门螺杆菌(Hp)及细胞毒蛋白相关基因A 株〔cagA(+ )株〕感染与胃癌组织p53、bcl2 表达的相互关系,以探讨Hp 的可能致癌机制。 方法 聚合酶链反应(PCR)检测92 例胃癌和24 例浅表胃炎组织石蜡标本Hp 和cagA(+ )株感染。用免疫组化方法检测全部标本的p53、bcl2 表达。 结果 (1)Hp 感染在胃癌和浅表胃炎病例间差异无显著性(794% 及667% ,P> 005),而cagA(+ )株感染前者高于后者(932% 及500% ,P< 001);(2)p53、bcl2 的表达在Hp(+ )与Hp(- )组之间差异无显著性,而cagA(+ )株感染组均显著高于cagA(- )株组(P<001)。 结论 胃癌的发生可能与不同Hp 菌株感染有关。产生细胞毒素的Hp 菌株〔cagA(+ )株〕与胃癌关系更密切,它可能是导致p53 基因突变和bcl2基因过度表达的原因之一。 相似文献
10.
UCP基因A→G(-3826)变异与中国人2型糖尿病脂代谢、体脂含量及分布的关系 总被引:4,自引:0,他引:4
目的观察解偶联蛋白(UCP)基因A→G(-3826)变异与2型糖尿病脂代谢,体脂含量及分布的关系。方法238例中国人(其中糖耐量正常者132例,2型糖尿病106例)及64例白种人用PCRRFLP检测UCP基因A→G(-3826)变异。体脂分布参数用核磁共振测定。结果中国人与白种人UCP基因A→G(-3826)变异的基因型及等位基因频率分布存在显著差异。(P值分别为2.03×10-6及6.8×10-7)。“G”等位基因与2型糖尿病男性腹内脂肪(VA)增加(P=0.026)、2型糖尿病女性腹部皮下脂肪(SA)减少(P=0.014)、股部皮下脂肪(FA)减少(P=0.042)及TC增高(P=0.002)有关。Logistic回归分析发现:UCP基因在2型糖尿病男性中与VA(P=0.0130)及TG(P=0.0052)有关,在2型糖尿病女性中与FA(P=0.0096)有关。结论UCP基因中“G”等位基因与2型糖尿病者腹内脂肪的绝对(表现于男性)或相对(表现于女性)的增加有关。UCP基因或与UCP基因A→G(-3826)变异处于连锁不平衡的邻近基因的突变可能参与人类体脂分布的调节。 相似文献
11.
我们对52例胃粘膜活检标本和18株 Hp 临床分离株进行 Hp 特异的16S rRNA 基因和鞭毛素 A 基因 PCR 扩增和 PCR-RFLP 及 PCR-RFLP-SSCP 分析,以检测 Hp 鞭毛素 A 基因的变异性,进而研究其与 Hp 致病性的关系。结果对43例 Hp( )的 flaA 基因 PCR-RFLP(HindⅢ)大约可分7个型(变异检出率为16.3%),而PCR-RFLP-SSCP 可分37个型(变异检出率为86.0%),两者有非常显著性差异。本研究表明,flaA 基因变异性极大,PCR-RFLP-SSCP 是检测其变异的有效方法。 相似文献
12.
胃癌癌旁组织中幽门螺杆菌感染及基因改变 总被引:5,自引:3,他引:5
应用PCR、PCR/RFLP对胃癌及癌旁组织中Hp感染进行了检测,并应用PCR/RFLP、PCR/SSCP、PCR-DNA测序探讨了Hp感染与ras基因、p53基因变化的关系。研究结果发现:24例胃癌组织Hp阳性12例(12/24,50%),24例癌旁组织Hp阳性11例(11/24,48.5%),两者无显著差异,胃癌组基因改变者17例(17/24,70.83%),其中Hp阳性12例(12/17,70.59%),7例无基因改变者未发现Hp感染。癌旁组基因改变者1例,其中Hp为阴性。24对胃癌p53Exon4的杂合缺失率为47.37%(9/19)。p53Exon5、6、7、8突变在癌组织中有11例(11/24;45.8%),癌旁组仅一例,发生H-ras12位点突变者7例(7/24,29.17%),癌旁组则无突变。胃癌基因改变与Hp+相关性比较发现,Hp感染与基因改变关系密切(P<0.01)。各种基因改变中以p53改变似与Hp感染关系更紧密(r=0.5P<0.05)。结果表明,ras基因及p53基因的协同作用在胃癌的致病机理中显示出重要作用。在癌变过程中,可能Hp的感染是基因改变进而促进组织恶变的促动因素之一。 相似文献
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用PCR—SSCP技术检测并鉴定胃粘膜和唾液中的幽门螺杆菌 总被引:12,自引:0,他引:12
运用聚合酶链反应(PCR)分别检测来自48例患者的胃粘膜和唾液标本中的幽门螺杆菌(Hp)的种系特异性抗原基因,并进一步运用单链构象多态性分析技术(SSCP)鉴定存在于人群之中和同一个体不同部位的Hp菌株。结果表明:在胃粘膜Hp阳性的36例患者中,唾液标本的检出率为72.2%(26/36)。在胃粘膜Hp阴性的12例患者中,有2例患者的唾液Hp呈阳性(16.7%)。进一步的SSCP分型证实:人群中感染的Hp菌株可根据其种系特异性抗原基因区分为6种基本带型。而从26对同时呈阳性的胃粘膜和唾液PCR产物经SSCP分型,其中25例患者呈现相同或相似带型,有1例呈明显差异。上述结果表明同一个体的不同部位存在同种菌株的可能性大,但并不排除混合性感染的可能。 相似文献
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目的 应用PCRSSCP技术快速检测耐INH,RFP,SM结核分支杆菌分离株KatG、rpoB、rpsL基因突变,评价其在检测结核分支杆菌耐药性方面的价值。方法 32株耐INH、RFP、SM结核分支杆菌临床分离株及25株结核分支杆菌敏感分离株用PCRSSCP方法分别检测,rpoB、KatG、rpsL基因突变。结果 32株耐多药结核分支杆菌分离株中,rpoB、KatG、rpsL PCR扩增产物PCR-SSCP分别有28株(87.5%)rpoB基因,19株(59.3%)KatG基因和23株(71.9%)rpsL基因电泳条带与结核分支杆菌标准株H37Rv电泳条带相比有明显差异,而25株结核分支杆菌敏感株的PCR-SSCP条带与结核分支杆菌H37Rv相似,特异性为100%。结论 PCR-SSCP方法敏感、特异,可快速检测结核分支杆菌rpoB、KatG、rpsL耐药基因突变,有利于耐多药结核分支杆菌耐药性的快速检测。 相似文献
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目的 分析幽门螺杆菌(Hp)对左氧氟沙星耐药性及左氧氟沙星耐药菌株与敏感菌株间gyrA基因的DNA序列差异,探索gyrA基因突变在Hp左氧氟沙星耐药产生过程中的作用.方法 浙江省金华市人民医院消化科2007年7月至2008年12月进行胃镜检查的慢性胃炎、消化性溃疡的患者,将胃镜活检黏膜标本接种于Hp选择性培养基,37℃微需氧环境培养3~5 d,分离Hp菌株,采用氧化酶试验、过氧化氢酶试验、尿素酶试验和UreA基因PCR扩增鉴定菌种.左氧氟沙星药敏试验采用E-test法,筛选出耐药菌株和敏感菌株.提取Hp菌株基因组DNA,PCR扩增gyrA基因并进行测序并分析.结果 38例临床分离Hp菌株通过左氧氟沙星E-test药敏试验,其中12例最低抑菌浓度(MIC)>1.0μg/ml,耐药菌株占31.58%,敏感菌株占68.42%.gyrA基因测序结果显示,261、271和272位点在10例耐药菌株存在突变;C261A突变2例,C261G突变1例,G271A突变2例,A272G突变2例,C261A与G271T、A272G突变2例,G271A与A272G突变1例,而在26株敏感菌株未发现突变.结论浙江金华地区分离Hp的临床菌株左氧氟沙星耐药率较高,其耐药与gyrA基因261、271和272位点有关. 相似文献
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应用16S-23S rRNA基因区间对败血症常见菌的鉴定 总被引:6,自引:0,他引:6
目的:建立检测不同菌种细菌的16S-23S rNA基因区间的特异图谱。方法:应用聚合酶链反应(PCR),限制性内切酶片段长度多态性分析(RFLP),分子克隆及测序技术,对临床常见的代表20个属26个种的标准菌株及相应的临床分离菌株共61株进行PCR扩增,同时对临床标本进行培养并与PCR-RFLP比较,探讨其在临床应用中的价值。结果:26株不同的标准菌株行PCR扩增后,分别出现1条带,2条带,3条带及多条带的不同DNA图谱,其敏感性为2.5CFU,与人类基因组DNA,真菌及病毒无交叉反应,其中14种菌经PCR扩增即可区分,另10种经Hinf I或AluI酶切后才能区分,肺炎克雷伯菌与坚韧肠球菌间的差异在第779位碱基上不同,Xma Ⅲ酶能进行区别,临床42例血培养15例阳性,阳性率35.7%;而PCR阳性27例,阳性率达64.3%,其阳性率明显高于血培养(P<0.01),6例脑脊液标本中1例培养为表皮葡萄球菌,其PCR也阳性,2例培养阴性标本,其PCR也阳性,经图谱分析为葡萄球菌,1例培养为新型隐球菌的脑脊液标本PCR检测为阴性,另2例PCR及培养均阴性。结论:建立了PCR加RFLP技术快速检测细菌16S-23S rRNA基因区间的方法,进一步为临床细菌感染的病原诊断提供了新的科学依据。 相似文献
18.
目的了解贵阳地区临床分离的幽门螺杆菌(Hp)的毒力基因ureA、cagA、vacA、iceA的分布特征,探讨不同毒力基因型与上消化道疾病的关系。方法用特异的16SrDNA聚合酶链反应进行临床分离Hp的菌种鉴定,对经过鉴定的152株幽门螺杆菌进行ureA、cagA、vacA、iceA基因及亚型的PCR检测。结果 ureA基因的检出率为100%(152/152),vacA基因的检出率为100%(152/152),vacA基因亚型以s1a-m2型为主,占76.3%(116/152),cagA基因检出率为39.5%(60/152),ieeA1基因检出率36.8%(56/152),iceA2基因检出率为34.2%(52/152),13.2%(20/152)的菌株iceA1和iceA2基因均阳性,不同基因型菌株在慢性胃炎和消化性溃疡中的检出率无统计学意义(P〉0.05)。结论贵阳地区幽门螺杆菌毒力基因vacA以s1a-m2型为主,cagA阴性比例高于cagA阳性,不同基因型菌株与消化性疾病间无明显相关性。 相似文献
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目的建立肝螺杆菌的多重PCR检测方法,对中国动物肝螺杆菌进行检测。方法以毒力基因flaB基因、ureA基因和cdtB基因和cdtC基因作为靶基因,建立检测肝螺杆菌的多重PCR方法。对肝螺杆菌、空肠弯曲菌、幽门螺杆菌、沙门氏菌、志贺氏菌、小肠结肠炎耶尔森菌、大肠埃希氏菌和铜绿假单胞杆菌抽提的DNA进行多重PCR扩增。应用本研究建立的多重PCR检测方法对482只动物(其中:海南30只猴、江苏34只小鼠和北京32只猴、30头猪、66只犬、13只兔、29只豚鼠、69只大鼠、213只小鼠)进行检测,对扩增出的阳性结果进行测序。同时,对所有样本采用选择性培养基进行肝螺杆菌培养以作对照。结果肝螺杆菌能扩增出各自的特异性条带,而其他参考菌株均未扩增出条带,这表明该方法具有较强的特异性。482份样本中检出43份肝螺杆菌阳性样本,阳性率8.92%(43/482),其中:2只犬(3.03%,2/66)、1只兔(7.69%,1/13)、5只大鼠(7.25%,5/69)和35只小鼠(16.43%,35/247)均扩增出肝螺杆菌毒力基因片段。结果显示,肝螺杆菌flaB基因、ureA基因和cdtB基因和cdtC基因序列与GenBank中的肝螺杆菌ATCC51449的相应基因序列核苷酸同源性高达99%。用选择性培养基能培养出肝螺杆菌。结论中国动物中的犬、兔、大鼠和小鼠均能检出肝螺杆菌flaB基因、ureA基因、cdtB基因和cdtC基因。建立的多重PCR检测方法可作为肝螺杆菌大规模检测的新技术,这为在中国开展肝螺杆菌流行病学调查提供了有效科学工具。 相似文献
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新发现的中国人ATP结合盒转运子A1基因M233V 单核苷酸多态性及其家系调查 总被引:2,自引:0,他引:2
目的对112例中国冠心病患者行ATP结合盒转运子A1(ABCA1)基因筛选以发现新的单核苷酸多态性(SNP),并对先证者家系进行调查确定其意义。方法用聚合酶链反应(PCR).单链构象多态性分析(SSCP)-DNA测序及限制性酶切发现ABCA1基因新的SNP,进一步对先证者家系的16位成员进行血脂检查、基因组DNA提取及限制性酶切分析。结果N233V是一个新发现的ABCA1基因SNP,此位点在外显子7,cDNA位置为A1092G,并导致233位氨基酸由甲硫氨酸转变为缬氨酸(N233V)。16位家族成员中发现5例存在N233V SNP位点改变,且均为AG型改变。结论中国人中存在新发现的ABCA1基因N233V SNP,家系调查显示N233V SNP中AA型分布频率最高,AG型次之,AG型SNP的发生具有家族倾向性。 相似文献