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相似文献
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1.
目的 分析烟酰胺磷酸核糖转移酶(NAMPT)在肝细胞癌(HCC)中的表达,并研究其与肝癌患者病理特征及免疫浸润的关系。方法 利用TIMER数据库获得NAMPT在HCC中的表达数据。通过UALCAN数据库分析NAMPT表达与血清甲胎蛋白(AFP)之间的相关性。从TCGA-LIHC中下载肝癌转录组RNA-Seq数据,提取NAMPT和免疫相关分子mRNA表达量。利用估计算法和单样本基因集富集分析(ssGSEA),评估NAMPT高低表达组间免疫成分、基质成分的数量和免疫细胞浸润丰度及计算免疫相关分子表达有无差异;分析NAMPT表达与免疫细胞浸润的关联性。结果 TIMER数据库显示,NAMPT mRNA在HCC中的表达低于癌旁组织(P<0.05)。UALCAN数据库检测发现,NAMPT表达和血清AFP呈负向低度相关(r=-0.464,P<0.05)。基质细胞占比、免疫细胞占比和肿瘤细胞纯度在NAMPT高低表达组间存在统计学差异(P<0.05)。ssGSEA分析发现,20种免疫细胞在NAMPT高表达组中的浸润程度高于NAMPT低表达组(P<0.05)。免疫相关分子NKG2D...  相似文献   

2.
【目的】探究DNA损伤修复基因FANCI在肝癌中的表达水平,及其与预后、临床分期、免疫浸润的关系。【方法】在本研究中,使用TCGA、GTEx、TIMER2.0及qRT-PCR法、蛋白质印迹法和免疫组织化学法研究FANCI在肝癌中的表达及其与不同临床分期之间的相关性;使用Kaplan-Meier Plotter数据库分析FANCI与肝癌预后的关系;使用TISIDB数据库探索FANCI与肝癌免疫细胞浸润及免疫检查点的关系;使用STRING数据库探索FANCI相结合的蛋白;使用TCGA及GTEx数据库进行GO及KEGG富集分析;通过细胞实验探索了FANCI在肝癌中的作用。【结果】与正常组织相比,肝癌组织FANCI的mRNA和蛋白表达水平上调(P<0.001);高表达FANCI的肝癌患者预后较差(P<0.001);肝癌组织中FANCI的表达与组织活化的CD4+T细胞数目、Th2细胞数目及免疫检查点基因的表达呈正相关,且FANCI高表达组的B细胞及巨噬细胞浸润水平明显较低(P<0.01);GO及KEGG富集分析显示FANCI相关基因富集在氨基酸跨膜转运体活性等多种生物过程中;细...  相似文献   

3.
目的:检测p53 蛋白在人类表皮生长因子受体2 (human epidermal growth factor receptor 2,HER2) 阴性乳腺浸润性导管癌中的表达,探讨其在HER2 阴性乳腺浸润性导管癌中的临床意义。方法:利用免疫组织 化学检测p53 在HER2 阴性的乳腺浸润性导管癌中的蛋白表达,同时免疫组织化学常规检测雌激素受体(estrogen receptor,ER) 和孕激素受体(progesterone receptor,PR) 的蛋白表达。结果:p53 蛋白在乳腺浸润性导管癌III 级中的阳性表达率高于乳腺浸润性导管癌I 级(P<0.05),但其表达与患者的年龄、临床分期、淋巴结转移状况 无明显相关。ER 阳性的乳腺浸润性导管癌的p53 蛋白的表达率低于ER 阴性的表达率(P<0.01),ER 和PR 共同 阳性的乳腺浸润性导管癌的p53 蛋白的阳性表达率明显低于ER 或PR 阴性的表达率(P<0.05)。p53 蛋白阳性患 者的5 年生存率显著低于p53 阴性患者(P<0.01),而且是HER2 阴性乳腺浸润导管癌的一个独立预后因素。结论: p53 蛋白表达与HER2 阴性的乳腺浸润性导管癌预后相关,并且是其独立的预后预测分子标志物。  相似文献   

4.
目的:通过生物信息学分析探讨巨噬细胞清道夫受体1 (MSR1)在泛癌组织中的表达水平、患者生存情况和免疫特性,阐明MSR1作为新的生物标志物对肿瘤的诊断、预后和免疫治疗的价值。方法:采用临床生信之家数据库和Sangerbox数据库分析正常组织和肿瘤组织中MSR1 mRNA表达水平,采用人类蛋白质图谱(HPA)数据库分析MSR1蛋白表达情况,采用单因素生存分析和Kaplan-Meier分析评估MSR1对预后的价值,采用肿瘤免疫单细胞中心(TISCH)数据库的单细胞测序结果分析MSR1在各种细胞类型中的表达情况,采用肿瘤免疫估计资源(TIMER2.0)、肿瘤免疫共基因小鼠(TISMO)、肿瘤免疫功能障碍与排斥(TIDE)和基因集癌症分析(GSCA)数据库分析泛癌组织中MSR1表达水平与免疫细胞浸润、免疫检查点基因表达和免疫治疗反应之间的相关性。结果:与正常组织比较,在17种肿瘤组织中MSR1 mRNA表达水平上调,包括乳腺浸润性癌(BRCA)、结肠腺癌(COAD)、食道癌(ESCA)、多形性胶质母细胞瘤(GBM)、头颈部鳞状细胞癌(HNSC)、肾透明细胞癌(KIRC)、肾性肾乳头状细胞癌(...  相似文献   

5.
目的 旨在通过多数据库的分析来揭示CCL18在33种癌症类型中的表达、预后及其与免疫细胞浸润的相关性。方法 通过GTEx数据库、CCLE数据库、TCGA数据库综合分析CCL18在泛癌中的表达模式。单因素Cox回归用于分析CCL18在泛癌中的生存和预后。通过TIMER2.0数据库分析CCL18与免疫微环境的关系。分析了CCL18与免疫检查点基因表达谱、DNA错配修复基因(MMRs)和甲基转移酶编码基因的关系。Spearman用于分析CCL18表达水平与肿瘤突变负荷(TMB)和微卫星不稳定性(MSI)的关系。结果 在本研究中,发现CCL18在大多数癌症中异常过表达。CCL18与肿瘤患者的年龄、性别、肿瘤分期和免疫亚型等临床参数密切相关。单因素回归分析表明CCL18表达与患者在ACC、DLBC、LAML、UVM、CESC和LGG中的不良预后密切相关。在大多数癌症中,CCL18的表达与28种免疫细胞亚型、免疫相关通路、肿瘤微环境呈正相关。CCL18与主要组织相容性复合体、免疫激活剂、免疫抑制剂、趋化因子和趋化因子受体相关基因共表达。此外,CCL18与许多癌症中的肿瘤新抗原、肿瘤突变负荷、微卫星...  相似文献   

6.
目的 运用生物信息学方法筛选宫颈癌预后相关的分子标志物,为宫颈癌的预后预测提供依据。方法 从GEO、TCGA和GTEx数据库下载宫颈癌转录组表达数据和相应的临床数据。在GSE9750和GSE52903数据集中,通过WGCNA和LASSO两种方法联合筛选宫颈癌枢纽基因,GEPIA数据库进一步筛选与预后相关的枢纽基因。在GEO数据集(GSE9750和GSE52903)和TCGA联合GTEx数据集中比较预后相关的枢纽基因在宫颈癌和正常宫颈组织中的表达情况,并在HPA数据库中验证其蛋白水平的表达。利用ssGSEA分析宫颈癌肿瘤微环境(tumor microenvironment, TME)中免疫细胞浸润情况,探究预后相关的枢纽基因与免疫细胞浸润和免疫检查点基因表达的相关性。结果 WGCNA和LASSO两种方法共筛选出7个宫颈癌枢纽基因,GEPIA数据库进一步筛选得到3个预后相关的枢纽基因MCM2、APOD和RAD54L。在GEO数据集(GSE9750和GSE52903)和TCGA联合GTEx数据集中,与正常宫颈组织比较,MCM2和RAD54L在宫颈癌组织中表达上调,而APOD则表达下调,与HPA数据库中免疫组化结果基本一致。3个预后相关的枢纽基因与免疫细胞和免疫检查点的表达有相关性。结论MCM2、APOD和RAD54L基因可能是与宫颈癌预后相关的分子标志物,与TME中免疫浸润相关。  相似文献   

7.
目的:分析双特异性磷酸酶(DUSPs)基因家族在肝细胞性肝癌(HCC)中的表达差异,及其与临床预后及免疫细胞浸润的相关性。方法:Oncomine、GEPIA、Kaplan-Meier plotter、TCGA、TIMER公共数据库分析DUSPs mRNA的表达差异及其与临床预后及免疫细胞浸润的相关性。本院收集19例配对的HCC术后癌与癌旁组织,通过免疫组化分析DUSPs蛋白的表达差异及其与临床特征的相关性。基因富集分析(GSEA)用于预测DUSPs参与HCC进展的可能机制。结果:公共数据库分析结果显示:与癌旁组织相比,DUSP12 mRNA在HCC癌组织中高表达(P<0.05),并且与总生存率下降(P<0.001)、病理分级增加(P<0.001)、免疫细胞浸润(P<0.001)增加及免疫检查点相关分子表达(P<0.001)升高有关。本院收集的配对HCC术后癌与癌旁组织免疫组化染色结果显示:与癌旁组织相比,DUSP12蛋白在HCC癌组织中高表达(P<0.001),并随病理分级(P<0.05)、临床分期(P<0.05)增加而进一步升高。GSE...  相似文献   

8.
乳腺浸润性导管癌中Survivin表达及其与ER PR的相关性研究   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的:研究Survivin蛋白在乳腺浸润性导管癌中的表达情况及其与ER、PR的相关性,探讨其与乳腺癌发生发展的内在联系。方法:①采用免疫组织化学SP法检测Survivin、ER和PR在乳腺浸润性导管癌中的表达情况。②统计学处理:本结果采用x^2、Fisher精确概率法检验。结果:①Survivin蛋白在乳腺浸润性导管癌和对照组癌旁正常组织中的阳性表达率分别为76.0%(38/50)和0.00%(0/15),两者具有显著性差异;②Survivin蛋白在乳腺浸润性导管癌中的表达与ER、PR和发病年龄无关,与淋巴结转移、临床分期和病理分级密切相关。结论:Survivin蛋白在乳腺癌组织中高表达,在正常组织不表达,且与临床分期、病理分级、淋巴结转移有关,可作为乳腺癌预后判断的指标之一。  相似文献   

9.
 目的 分析正常乳腺组织和浸润性导管癌中乙酰肝素酶(HPA)和GA结合蛋白α(GABPα)的表达及临床意义,探讨其在乳腺癌发生发展中的作用及相关性。方法 免疫组织化学方法检测HPA及GABPα的表达,并分析二者的相关性及与临床病理因素的关系;Western blot检测HPA和GABPα蛋白的表达。结果 免疫组化显示HPA和GABPα在浸润性导管癌中阳性表达率明显高于正常乳腺组织(P<0.05),且HPA和GABPα的表达与乳腺癌组织学分级、TNM分期、及淋巴结有无转移有关(P<0.05)。Western blot检测显示HPA和GABPα蛋白表达在浸润性导管癌中明显高于正常乳腺组织(P<0.05),与免疫组化的结果一致。统计分析两者在乳腺癌中的表达呈正相关(P<0.05)。结论 在乳腺癌组织中,HPA与GABPα的表达均存在异常,提示HPA和GABPα在乳腺癌的发生发展、浸润转移中可能存在重要的协同作用。  相似文献   

10.
目的:探讨三结构域蛋白家族成员21(tripartite motif 21,TRIM21)在胰腺癌中的表达及其与临床病理特征、预后及免疫浸润的关系。方法:应用Oncomine与GEPIA数据库分析TRIM21在胰腺癌中的mRNA表达水平;利用基因富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)预测TRIM21可能参与的信号通路;TIMER数据库分析TRIM21在胰腺癌中的表达水平与免疫细胞浸润丰度的相关性,并通过Kaplan-Meier Plotter数据库进行验证;免疫组织化学染色(immunohistochemistry,IHC)检测TRIM21在87例胰腺癌组织及36例癌旁组织中的蛋白水平,并分析其与临床病理特征、预后的关系。结果:TRIM21在胰腺癌组织中明显高表达,且与患者无复发生存时间负相关(P=0.041);GSEA分析证实TRIM21参与胰腺癌患者免疫相关信号通路;TIMER数据库分析显示胰腺癌中TRIM21表达水平与B细胞(P=7.87e-06)、CD8+T细胞(P=1.18e-04)、巨噬细胞(P=1.43e-02)、中性粒细胞(P=2...  相似文献   

11.
目的:探讨PHD锌指蛋白19(PHF19)在肺腺癌中的表达水平、临床预后、遗传改变、甲基化值、生物学功能和免疫调节作用。方法:基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库肺腺癌的RNA队列数据,通过TIMER数据库、UALCAN数据库分析PHF19在肺腺癌和正常组织之间的表达差异及其表达水平与患者预后之间的关系,cBioPortal数据库、TIMER数据库分析PHF19在肺腺癌中的基因突变情况,UALCAN数据库分析PHF19在肺腺癌中的启动子甲基化水平,LinkedOmics数据库、KEGG数据库进行PHF19共表达基因的富集分析,TIMER数据库探索PHF19在肺腺癌中的表达与免疫浸润水平的相关性。结果:PHF19在肺腺癌组织中的表达上调,其高表达与肺腺癌患者的临床病理分期、淋巴结转移和总生存期缩短显著相关,0.9%的患者出现遗传变异,扩增和错义突变是最常见的突变,TP53突变可导致PHF19高表达,PHF19的启动子甲基化水平在肺腺癌中显著降低,PHF19的功能集中于细胞有丝分裂过程和细胞周期,PHF19表达水平与肿瘤免疫细胞浸润和免疫检查点表达呈显著相关。结论:PHF19可作为肺腺癌预...  相似文献   

12.
Livin在乳腺癌中的表达及其与Caspase-3,Ki67表达的关系   总被引:4,自引:0,他引:4  
目的:探讨Livin在乳腺癌中的表达和临床意义及其与Caspase-3蛋白表达和细胞增殖的相互关系.方法:采用免疫组化S-P法检测Livin在正常乳腺组织、乳腺增生性病变、乳腺非浸润性癌和乳腺浸润性癌组织中Livin蛋白和Caspase-3蛋白表达以及Ki67在乳腺癌组织中的表达.结果:Livin蛋白在正常乳腺组织、乳腺增生性病变、乳腺非浸润性癌和乳腺浸润性癌组织中阳性率为7.1%,29.8%,65.0%,73.1%;Caspase-3蛋白分别为92.9%,71.4%,45.0%,34.6%,两者差异均有统计学意义(P<0.01).Livin表达与临床分期、淋巴结转移和年龄有关(P<0.05),与肿瘤大小和组织学分级无关.Livin蛋白与Caspase-3蛋白在乳腺浸润性癌表达呈负相关(P<0.01).在乳腺非浸润性癌中两者相当,无相关性(P>0.05).Livin蛋白表达阳性的乳腺癌Ki67的标记细胞增殖指数(47.32±22.34)明显高于Livin蛋白表达阴性的乳腺癌细胞Ki67的标记细胞增殖指数(18.01±23.34)( P<0.01).结论:Livin蛋白在乳腺癌中表达上调,可作为判断乳腺癌预后新的分子标记物,成为乳腺癌诱导凋亡治疗的新靶点.Livin不仅参与细胞凋亡的调控,还促进了细胞增殖及肿瘤发生、发展.  相似文献   

13.
目的 通过生物信息学技术分析细胞周期蛋白A2 (CCNA2)在泛癌中的表达和预后价值,并深入探索CCNA2与免疫浸润的关系。方法 从UCSC Xena数据库下载癌症基因组图谱计划数据库中33种肿瘤的数据,分析CCNA2在33种肿瘤中的表达和预后价值。利用TISIDB数据库计算免疫浸润丰度,分析CCNA2与免疫检查点基因的相关性及其与肿瘤突变负荷和微卫星不稳定性的相关性。利用GEPIA数据库获取肿瘤中与CCNA2相关的基因,进行基因本体以及京都基因和基因组数据库富集分析。结果CCNA2在多种肿瘤中普遍高表达,且CCNA2表达与生存率显著相关。同时,CCNA2表达与肿瘤免疫浸润和免疫检查点基因相关。CCNA2表达与不同类型肿瘤的肿瘤突变负荷和微卫星不稳定性明显相关。结论 CCNA2可作为肿瘤不良预后和免疫浸润的生物标志物,为癌症治疗提供了新的思路。  相似文献   

14.
目的 探讨磷酸化信号传导与转录激活因子3(STAT3)和Twist在乳腺浸润性导管癌组织中的表达情况及其临床意义。方法利用免疫组织化学染色的方法检测60例乳腺浸润性导管癌组织及其相应癌旁正常组织中p-STAT3和Twist蛋白表达,分析两者的相关性以及两者的表达率与乳腺浸润性导管癌患者临床病理特征的关系。结果p-STAT3和Twist蛋白在乳腺浸润性导管癌中的阳性率明显高于癌旁正常组织的阳性率。p-STAT3和Twist蛋白在乳腺癌晚期、淋巴结及脉管及组织学分级为Ⅲ-Ⅳ级的患者中阳性率明显增高,但两者在不同年龄及肿瘤大小不同的患者中阳性表达率不变。在乳腺浸润性导管癌组织中,p-STAT3和Twist蛋白的表达呈正相关性。结论p-STAT3与Twist蛋白的表达在乳腺浸润性导管癌中具有明显的相关性,且两者的阳性率在淋巴及脉管转移、分化较差及晚期的患者中明显升高。这些结果表明磷酸化的STAT3蛋白可能通过上调Twist表达促进乳腺浸润性导管癌的侵袭和转移。  相似文献   

15.
目的 分析血红素加氧酶1(HMOX1)在泛癌中的表达及其在肿瘤预后中的作用。方法 采用肿瘤免疫数据库TIMER2.0和GEPIA2工具分析HMOX1在各癌症中的表达,探讨不同癌症中HMOX1表达与癌症相关纤维细胞浸润水平的关系;采用GEPIA2数据库分析不同癌症中HMOX1表达与癌症总生存期和无病生存期的关系;采用STRING和GEPIA2数据库得到HMOX1的相关蛋白互作网络图。结果 HMOX1在癌症中的发病机制与炎症反应、细胞黏附有关,大多数基因编码定位在质膜上,并发挥三磷酸鸟苷结合和蛋白结合的分子功能。HMOX1在多种癌症中高表达,并且与肿瘤患者预后存在相关性;HMOX1的表达与膀胱尿路上皮癌、结肠癌、头颈鳞状细胞癌、脑低级别胶质瘤、胰腺癌、胃癌、睾丸生殖细胞癌等癌症相关成纤维细胞浸润水平呈正相关。结论 HMOX1的表达与多种癌症临床预后、免疫浸润等存在相关性,通过泛癌分析,有助于从临床肿瘤样本角度阐述HMOX1在肿瘤发生中的作用。  相似文献   

16.
吴铮  任志伟  高润石  孙轲  张国君 《医学研究杂志》2024,53(2):143-150, 177
目的 探讨促红细胞生成素生成人肝细胞受体B4(erythropoietin-producing human hepatocellular receptors B4,EphB4)在低级别胶质瘤(lower-grade glioma,LGG)组织中的表达、其上游靶点以及与患者预后及肿瘤免疫浸润的相关性,分析其作为治疗靶点的潜在作用。方法 首先应用癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库胶质瘤数据分析EphB4在胶质瘤与正常脑组织中的表达差异,并用基因表达谱交互分析(Gene Expression Profiling Interactive Analysis,GEPIA)数据库分析EphB4对不同癌症生存期的影响。用R语言和starBase数据库分析EphB4可能上游调节非编码RNA (non-coding RNA,ncRNA)。用肿瘤免疫评估资源(Tumor Immune Estimation Resource,TIMER)数据库进行EphB4表达与肿瘤免疫细胞浸润、免疫细胞生物学标志物和免疫检查点相关性分析。结果 UBA6-AS1/hsa-miR-346轴是最有潜力影响LGG中EphB4表达的上游ncRNA相关通路。同时,EphB4水平与LGG肿瘤免疫细胞浸润、免疫细胞生物学标志物、免疫检查点表达均呈显著正相关。结论 ncRNA介导的EphB4上调与LGG的不良预后和肿瘤免疫浸润相关。  相似文献   

17.
HIF-1α和MMP-2在乳腺浸润性导管癌中的表达及其相关性   总被引:2,自引:0,他引:2  
目的探讨HIF-1α和MMP-2蛋白在乳腺浸润性导管癌组织中的表达及其相关性。方法应用免疫组织化学法检测52例乳腺癌组织HIF-1α、MMP-2蛋白的表达情况。结果乳腺浸润性导管癌组织中HIF-1α的阳性表达为76.9%(40/52),MMP-2的阳性表达为82.7%(43/52),在乳腺浸润性导管癌组织中HIF-1α、MMP-2蛋白的表达之间存在显著正相关(r=0.448,P<0.01)。结论乳腺浸润性导管癌组织中HIF-1α、MMP-2蛋白高表达,且两者之间的表达强度具有等级相关性。HIF-1α蛋白可通过诱导MMP-2蛋白的表达上调,增加乳腺癌细胞的侵袭力,从而成为其促进乳腺癌浸润、转移的途径之一。  相似文献   

18.
目的探讨PS2蛋白在乳腺浸润性导管癌组织中的表达及与其临床病理因素的关系,评估其作为乳腺浸润性导管癌预后判断和内分泌治疗指标的价值。方法应用免疫组织化学S-P法检测PS2、雌激素受体(ER)、孕激素受体(PR)在57例乳腺浸润性导管癌组织中的表达,分析PS2阳性表达与乳腺癌常用的临床病理因素的关系。结果 PS2阳性表达率为42.10%(24/57),PS2阳性表达与ER、PR相关,但并不完全一致,与患者年龄、月经状况、肿瘤大小、组织学分级、腋窝淋巴结状况无关。结论 PS2阳性表达可能是乳腺浸润性导管癌内分泌治疗的合理指标,但只能是作为对ER、PR不足的补充,并不能取代ER、PR,也不能作为预测乳腺浸润性导管癌患者预后的一个独立指标。  相似文献   

19.
目的研究蛋白激酶CI(PRKCI)在胰腺癌组织中的表达,阐明其对胰腺癌的诊断及预后的作用,并进一步分析PRKCI与肿瘤微环境中免疫细胞浸润的相关性。方法利用Oncomine、GEPIA、HPA和CCLE数据库分别分析PRKCI在胰腺癌组织和细胞系中的表达,利用GEPIA分析PRKCI的表达与胰腺癌患者预后的关系,利用String数据库分析与PRKCI相互作用的蛋白,利用TIMER研究PRKCI的表达与肿瘤纯度和免疫细胞浸润的相关性。结果胰腺癌组织中PRKCI mRNA和蛋白的表达水平均高于癌旁正常胰腺组织,且PRKCI在胰腺癌细胞系中呈高表达。PRKCI高表达的胰腺癌患者的总生存期和无病生存期明显低于低表达患者(P<0.01),且与胰腺癌患者的分期显著相关。与PRKCI相互作用的蛋白有CDC42、NUMB、SQSTM1等,主要参与炎症反应、蛋白质磷酸化等过程。胰腺癌中PRKCI的表达与CD4+T细胞数目、PD-L1基因和CTLA-4基因的表达呈负相关性。结论 PRKCI在胰腺癌中呈高表达,PRKCI mRNA的表达水平与患者的预后和免疫细胞浸润显著相关,其可...  相似文献   

20.
目的:探讨凋亡蛋白抑制因子Livin在乳腺浸润性导管癌组织中的表达及临床意义.方法:应用免疫组织化学SP法检测70例乳腺浸润性导管癌、20例乳腺增生和10例乳腺癌旁组织(距癌组织≥4cm,组织学结构正常)标本中Livin的表达情况,并探讨Livin表达与乳腺癌各临床病理学参数间的关系.结果:Livin在乳腺癌旁正常组织...  相似文献   

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