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1.
目的 分析安徽省阜阳市2020-2021年新报告HIV感染者主要亚型毒株的分子流行特征及传播网络情况,为当地制订有效的干预措施提供依据。方法 2020年1月至2021年12月共收集阜阳市新报告感染HIV-1血液样本589份,扩增pol基因和测序,运用美国斯坦福大学耐药数据库进行耐药突变分析,构建系统进化树,提取传播网络并分析其特征,对研究对象进入网络的相关因素进行分析。结果 成功扩增获得589名HIV感染者的pol区基因序列,主要的亚型为CRF07_BC(34.8%),B(30.4%)和CRF01_AE(22.4%),新报告感染者总体耐药率为8.6%。三个主要亚型分别以0.5%作为基因距离阈值构建了分子传播网络,入网率分别为B(41.3%)、CRF07_BC(34.6%)和CRF01_AE(20.5%)。对进入网络的影响因素进行分析,多因素Logistic回归结果显示,年龄>50岁(与<30岁相比,a OR=2.419,95%CI:1.189~4.921)、CRF07_BC(与CRF01_AE相比,a OR=1.875,95%CI:1.085~3.242)、B亚型(与CRF...  相似文献   

2.
目的 分析2019-2021年重庆市MSM新发现472例HIV-1感染者分子网络特征,为精准干预相关人群中HIV-1传播提供实验室依据。方法 收集重庆市疾病预防控制中心性病门诊2019-2021年新报告的MSM感染者血浆样本,扩增pol区基因并测序,构建该人群HIV-1传播分子网络,采用χ2检验进行成簇相关因素分析。结果从580例感染者中,共获得pol区基因序列472条。472例感染者分别属于9种基因亚型,主要亚型为CRF07_BC(344,72.88%)和CRF01_AE(96,20.34%),其他亚型包括CRF55_01B(18,3.81%)、B(4,0.85%)、CRF08_BC(6,1.27%)等。在基因距离0.8%时,共产生32个分子簇,入网率27.33%(129/472),以CRF07_BC入网最高,占82.95%(107/129)。结论MSM中新报告HIV-1感染者病毒基因呈现多样性,并存在传播活跃者。应对传播活跃者实施精准干预,以降低该人群的新发感染率。  相似文献   

3.
目的 研究2016-2021年广东省MSM、性病门诊男性就诊者(STD)、吸毒者(DUS)、暗娼(FSW)四类哨点监测人群HIV-1亚型分布及变化情况,探讨哨点监测同时开展分子流行病学监测的可行性。方法 运用巢式PCR扩增HIV-1 pol区基因片段,鉴定基因亚型,并比较不同年份的HIV-1亚型变化。结果 共计纳入分析814人。HIV-1主要流行亚型为CRF07_BC(43.2%,352/814)、CRF01_AE(27.5%,224/814)和CRF55_01B(14.9%,121/814),其他亚型占14.4%(117/814),其中CRF01_AE总体呈下降趋势,从2016年的33.9%下降到2021年的16.7%(χ2趋势=4.579,P=0.032);CRF07_BC和CRF55_01B在2016至2021年的趋势变化差异无统计学意义,但其构成比出现增加;存在一定比例CRF01_AE和CRF07_BC的新型重组毒株。结论 2016-2021年广东省四类哨点监测人群HIV-1亚型分布以CRF07_BC、CRF01_AE和CRF55_01B为主,亚型复杂多样。CRF01_AE亚型...  相似文献   

4.
目的 分析广西崇左市龙州县HIV/AIDS患者中HIV-1分子传播网络特征,并探讨网络形成的相关影响因素。方法 对2003-2021年龙州县报告的HIV/AIDS患者采集血样,通过DNA提取、pol区扩增、测序及序列整理,使用HIV-TRACE筛选最佳基因距离及构建分子传播网络。对分类资料进行χ2检验,使用Logistic回归模型分析入网和高连接度个体的影响因素。结果 共收集到545份研究样本,成功获得361例HIV/AIDS患者的HIV-1 pol区序列。HIV亚型以CRF01_AE(88.09%)为主,其次为CRF07_BC(5.26%)和CRF08_BC(3.88%)。多因素结果显示,无性病史(OR=3.238,95%CI:1.134~10.642)、已婚/同居(OR=1.953,95%CI:1.03~3.758)的患者更容易入网;年龄≥50岁(OR=2.656,95%CI:1.394~5.109)的患者更容易成为该网络的高连接度个体,而高中/中专及以上(OR=0.251,95%CI:0.057~0.784)更不容易成为高连接度个体。结论 2003-2021...  相似文献   

5.
目的 分析甘肃省部分地区新报告HIV/AIDS患者分子传播网络特征,为精准干预相关人群中HIV-1传播提供实验室依据。方法 反转录和巢式PCR扩增样本pol区基因并测序,采用MEGA 7.0软件构建系统进化树分析亚型,通过美国斯坦福大学HIV耐药数据库在线软件工具分析耐药突变位点,Hyphy和Cytoscape 3.9.1软件生成分子网络,Logistic回归模型对入网率的影响因素进行分析。结果 收集甘肃省部分地区2020-2021年新报告病例血浆样本331份,成功获得pol区基因序列303条,共发现11种亚型和流行重组型,主要为CRF07_BC(58.1%)、CRF01_AE(21.1%)、B(6.9%)和CRF55_01B (5.3%)。治疗前耐药率为4.0%,NNRTI类耐药率最高为3.3%,主要耐药位点是K103 N/S (1.7%)。分子网络最适基因距离为1.2%,在此基因距离时共形成33个分子簇,91条序列入网,入网率为30.0%。对进入网络的影响因素进行分析,多因素Logistic回归结果显示,CRF07_BC(与CRF01_AE相比)、河西地区(与陇东南地区相比)更容易...  相似文献   

6.
目的 了解上海市浦东新区近年来中老年人群中未经抗病毒治疗的新确诊感染者HIV-1分子流行特征及耐药情况,为艾滋病防治策略制定提供科学依据。方法 对2018-2021年期间浦东新区确诊实验室HIV-1抗体首次确诊阳性的50岁及以上患者开展面对面访谈,并同步收集血浆标本,采用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)扩增HIV-pol基因,进行基因亚型及耐药位点分析。结果 获216份HIV-pol区基因全序列片段,HIV-1基因亚型主要有CRF07_BC(46.30%)、CRF01_AE(31.02%)、CRF08_BC(6.48%)、CRF55_01B(1.39%)、B(4.63%)、C(5.09%)、URFs(4.17%);感染途径主要为同性性传播(41.20%,89/216)、异性性传播(57.87%,125/216),其中流行株CRF01_AE的同性和异性性传播占比均为49.25%(33/67)、CRF07_BC同性和异性性传播分别占比45.00%(45/100)、54.00%(54/100),不同性传播途径的病毒亚型分布差异有统计学意义(χ2=18.022,P=0...  相似文献   

7.
目的调查重庆市医疗机构中艾滋病病毒(HIV)1型(HIV-1)感染者/艾滋病(AIDS)病人中的HIV-1基因亚型、群体动力学及耐药性。方法收集2013年12月至2016年4月重庆多家医疗机构HIV-1感染者/AIDS病人血浆,通过提取核糖核酸(RNA)、反转录、巢式聚合酶链式反应(PCR),系统发育学和群体遗传学的方法,扩增及分析HIV基因组pol区序列,并检测耐药相关突变。结果共收集657份HIV-1感染者/AIDS病人静脉血样本,扩增及测序得到256份有效的pol基因片段,HIV基因亚型分析显示,重庆医疗机构中流行的HIV-1毒株以CRF07_BC(43.8%,112份)、CRF01_AE(34.8%,89份)为主要基因型;随后依次为CRF08_BC(8.2%,21份)、B(3.5%,9份)、CRF55_01B(2.7%,7份)、CRF68_01B(0.4%,1份)和CRF86_BC(0.4%,1份)。检出耐药基因突变者94例(占36.7%),无耐药基因突变者162例(占63.3%)。不同基因亚型间,pol基因蛋白酶区和反转录酶区的基因突变位点差异无统计学意义(P0.05)。对优势群体CRF07_BC、CRF01_AE和CRF08_BC的群体遗传学分析,证实重庆市医疗机构中的HIV-1部分基因型群体正在经历扩张。结论重庆市医疗机构中HIV-1病毒基因突变和重组普遍存在。HIV-1CRF07_BC、CRF01_AE和CRF08_BC基因亚型正在经历缓慢扩张的过程。需持续研究和监控重庆地区HIV-1在感染者中的遗传分化及耐药进展。  相似文献   

8.
目的分析黑龙江省HIV-1感染者的毒株亚型构成、分子簇形成和耐药株流行情况。方法对2018年1-6月期间新诊断的、尚未进行抗病毒治疗的黑龙江省HIV-1感染者,采集血样、提取病毒RNA,采用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)/巢式PCR方法扩增HIV-1 pol基因,测序后进行生物信息学分析。结果获得157例HIV-1样本的pol基因序列,检测出7种毒株亚型,以CRF01_AE占比最高,为61.8%(97例),其次为CRF07_BC,占20.4%(32例);21条基因序列形成了10个可能具有传播关系的分子簇,成簇率13.4%;总体耐药率10.2%(16/157),其中NNRTI、NRTI、PI的耐药率分别为5.1%(8/157)、1.3%(2/157)和3.8%(6/157)。结论黑龙江省HIV-1的毒株亚型以CRF01_AE亚型4簇和5簇为主,独特重组毒株URF_01B及A1亚型成簇传播。对治疗前耐药问题应给予密切关注。  相似文献   

9.
目的 了解河北省抗病毒治疗前人群HIV-1耐药毒株流行与分子传播网络情况。方法 用in-house的方法扩增HIV-1 pol区基因序列,并利用TN93模型计算pol序列基因距离,构建HIV-1分子网络图。结果 研究发现17名HIV-1感染者出现耐药突变,耐药突变率为6.16%(17/276),其中,NNRTI类耐药率为4.35%(12/276),PI类耐药率为1.09%(3/276), NRTI类耐药率为0.36%(1/276),NNRTI类和PI类双重耐药率为0.36%(1/276);多因素Logistic回归分析显示年龄和亚型是HIV-1产生耐药的影响因素,虽然HIV-1耐药突变在CRF07_BC(2.44%)亚型中的分布明显低于CRF01_AE(8.03%)和B(3.70%)亚型,然而CRF07_BC序列构建的分子传播网络最多,传播速度最快。结论 河北省治疗前HIV-1耐药突变处于较高水平, 应制定措施实时监测未治疗人群中HIV-1耐药毒株流行情况。  相似文献   

10.
目的了解献血人群中艾滋病病毒(HIV)感染者的病毒亚型分布及流行毒株特征,为无偿献血者的招募、健康征询提供科学数据。方法对来自全国13个省市献血人群中的HIV阳性样本进行分子流行病学调查。对pol区基因进行扩增和测序。基于系统进化分析技术构建贝叶斯(BI)和最大似然(ML)系统树,确定毒株亚型,并针对亚型地理分布进行统计分析。结果来自全国13个省市的115例HIV阳性献血者标本中,成功扩增并获得pol区基因序列89例,发现HIV-1基因亚型9种,其中,亚型CRF01_AE和CRF07_BC所占比例最高,分别占46.1%(41/89)和37.1%(33/89);亚型CRF08_BC、B分别占2.2%(2/89)、5.6%(5/89);其他亚型CRF65_CPX、CRF55_01B、CRF59_01B、CRF68_01B、CRF62_BC各占1.1%(1/89)。系统进化进一步分析显示,所占比例最高的是CRF01_AE中的Cluster 4和Cluster 5亚簇以及CRF07_BC中的msm亚簇,所占比例分别达到23.6%(21/89)、21.3%(19/89)和33.7%(30/89),这3个均是全国男男性行为者(MSM)传播途径中的主要流行亚簇。结论全国献血途径检测出的HIV-1基因型呈现复杂的多样性特征,尤其在MSM传播HIV感染者中占绝对优势毒株的CRF01_AE(C4和C5簇)和CRF07_BC-msm簇也是本次在献血人群中发现的主要流行毒株。  相似文献   

11.
目的了解四川省艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)流行毒株的亚型、人群和地域分布。方法通过抽样调查的方法,采集2014年7-9月新报告的、未经抗病毒治疗的HIV-1感染者的血样400份,采用巢式聚合酶链反应(Nested PCR)扩增HIV-1 pol和gag基因区,对获得的核酸序列进行系统进化分析。比较不同亚型毒株感染者首次随访的CD4^+T淋巴细胞(简称CD4细胞)水平。结果四川省HIV-1流行毒株的亚型有:CRF07_BC(58.22%)、CRF01_AE(29.50%)、CRF08_BC(4.96%)、CRF85_BC(3.39%)、B(2.09%)、C(0.78%)、CRF02_AG(0.52%),以及CRF07_BC/CRF01_AE重组型(0.52%)。毒株分布显示出明显的地域特征。CRF01_AE感染者的基线CD4细胞水平更低。结论以C亚型为骨架的BC重组亚型,在四川省表现出明显的流行优势。提示应结合流行毒株有针对性地提供艾滋病防治工作建议。  相似文献   

12.
目的了解上海市浦东新区近年来男男性行为人群(MSM)中,未经抗病毒治疗的艾滋病病毒1型(HIV-1)抗体阳性者,其HIV-1亚型分布和原发性耐药特征,监测该地区MSM HIV-1毒株的最新流行情况,为当前该区制定艾滋病防治策略提供科学依据。方法选取2011年至2014年4月份期间确认的MSM HIV-1感染者血浆标本70份,应用巢式反转录聚合酶链反应(RT-PCR)扩增pol基因,并对扩增产物进行测序,用Mega 6.0软件将测序结果与各亚型国际参考株比对,根据系统进化树分析确定基因亚型及其特征以及耐药情况。结果获62份pol区基因全序列片段,得到CRF01-AE、CRF07_BC、01B(CRF01_AE与B重组亚型)和B四种亚型。分布显示:CRF01-AE占58.06%(36/62),CRF07_BC占30.65%(19/62),01B占6.45%(4/62),B占4.84%(3/62)。离散率显示:CRF01-AE亚型的平均离散率为(2.1±0.2)%(n=36),CRF07-BC亚型的平均离散率也为(2.1±0.2)%(n=19),B亚型的平均离散率为(5.7±0.6)%(n=3),01B重组亚型的平均离散率为(6.3±.0.6)%(n=4)。耐药特征:62例中有7例分别产生了对核苷类反转录酶抑制剂(NRTIs)、非核苷类反转录酶抑制剂(NNRTIs)及蛋白酶类抑制剂(PIs)的耐药突变,其中2例产生了低度耐药,4例具有潜在的耐药特点。结论上海市浦东新区2011年至2014年4月间,MSM新确证HIV-1感染者中,基因亚型呈多元化趋势,以CRF01-AE和CRF07-BC为主,并已形成了浦东新区范围内的局部流行趋势,新的01B重组毒株已在浦东新区开始出现;HIV-1原发耐药株的传播尚处于低度流行水平,密切监视其流行趋势已显十分必要。  相似文献   

13.
14.
目的 了解广州市艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)流行株的亚型及分布情况.方法 从2004-2005年采集的92份HIV-1抗体阳性者抗凝全血中,提取前病毒DNA,经套式聚合酶链反应(Nested-PCR)扩增gag和env区基因并测定序列,与国际标准参考序列比较确定亚型.结果 经系统进化树分析,92份样本中34份为CRF01AE,40份为CRF07BC,7份为CRF08BC,3份为欧美B,6份为泰国B(B'),2份为C.结论 广州市HIV-1流行株以CRF01AE和CRF07BC为主,也存在CRF08BC、B、B'及C亚型.  相似文献   

15.
目的 了解浦东新区不同基因亚型的HIV感染者肠道菌群的差异及其与血脂指标之间的关系。方法 收集HIV感染者(HIV+组)和年龄、BMI相匹配的HIV阴性人群(HIV-组)的粪便样本,进行16SrDNA测序,并对HIV+组进行基因亚型测定,同时测定外周血血脂水平并进行生物信息学分析,采用Spearman秩相关分析肠道菌群-血脂指标相关性。结果 纳入HIV+组和HIV-组各47例,均为男性,其中HIV感染者基因亚型包括CRF01_AE组(25例)和CRF07_BC组(22例)。CRF01_AE组的血脂指标HDL-C异常情况高于CRF07_BC组(P<0.05)。HIV+组和HIV-组的β多样性差异有统计学意义(R2=0.034 6,P<0.05)。在CRF07_BC组中观察到来自厚壁菌门的5种肠道细菌富集(LDA均>2.0),包括gauvreauii瘤胃球菌属、Dorea属、颤杆菌克属、CAG_56菌属、乳球菌属(P均<0.05)。HIV感染者的HDL-C水平和Dorea菌呈正相关(r=0.302,P=0.039)。结论 不同基因亚型的HIV感...  相似文献   

16.
目的 分析贵阳市2021年5月至2022年5月未接受ART的HIV/AIDS患者的病毒基因亚型分布和耐药情况。方法 采集2021年5月至2022年5月贵阳市新确诊的HIV/AIDS患者全血标本279份,进行HIV-1基因型耐药检测。将提取后的核酸经过反转录后,以巢式PCR扩增HIV-1 Pol区基因并进行Sanger测序,使用斯坦福大学HIVdb Program耐药数据库等工具对序列信息进行分析。结果 PIs区和RT区扩增成功266例,可检测出亚型的样本为265例,其中6名患者IN区未扩增。共检出9种亚型,以B/C重组亚型和CRF01_AE亚型为主,分别为109例和80例,其余CRF07_BC亚型21例,CRF08_BC亚型19例,B亚型13例,A亚型12例,CRF55_01B亚型5例,C亚型4例,B+CRF01_AE亚型2例。不同病毒亚型耐药率不同(χ2=19.15,P=0.01)。ART前患者总体耐药率为9.40%,PIs耐药率为0.75%,NRTIs耐药率为2.63%,NNRTIs耐药率为7.52%,INSTIs耐药率为0.38%。结论 贵阳市HIV/AIDS患者ART前耐药问题...  相似文献   

17.
目的了解河北省不同途径感染人群艾滋病病毒Ⅰ型(HIV-1)亚型分布特点。方法从感染者的血浆样品中提取病毒RNA,反转录后采用套式聚合酶链反应(Nested PCR)扩增HIV-1 gag和env基因的部分片段,对PCR产物直接进行核苷酸序列测定,所获序列与各亚型国际参考株序列比对,进行系统进化树分析,确定基因型。结果对154份HIV-1感染者的样品进行扩增,得到了146份样品的HIV-1基因片段。发现6种HIV-1亚型和重组型,其中B’亚型61例(41.8%),CRF01_AE 59例(40.4%),CRF07_BC 16例(11.0%),CRF08_BC 6例(4.1%),C亚型和B01重组株各2例(1.4%)。血液途径传播为B’亚型,男男性行为传播以CRF01_AE和B’亚型为主。结论河北省不同途径感染人群HIV-1亚型分布具有明显的人群特征。血液途径传播者为单一B’亚型,性传播人群中亚型分布较广。  相似文献   

18.
目的了解浦东新区艾滋病病毒1型(HIV-1)感染者的病毒亚型分布特征,为该区制定针对性的艾滋病防治策略和措施提供科学依据。方法采用分层抽样的方法选取浦东新区242例HIV-1感染者的血浆标本,应用反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增,将PCR产物测序分析,确定基因亚型,并结合现场流行病学调查资料进行分析。结果获得186份pol区基因片段,HIV-1亚型分布显示,CRF01_AE比例最大,为52.69%,其次为CRF07_BC,31.72%,B,5.91%。CRF08_BC未在同性性传播者中发现,在异性性传播者中占5.36%。CRF01_AE与B亚型重组体在25岁以下年龄组和外地户籍感染者中相对较高,分别为12.20%和6.25%。在同性性传播者中发现2例CRF01_AE和CRF07_BC的重组体。结论浦东新区HIV感染者HIV-1型流行株呈现多样化的特点,且分布与年龄、户籍、文化程度以及传播途径相关。  相似文献   

19.
深圳地区男男同性恋人群中HIV-1分子流行病学研究   总被引:7,自引:0,他引:7  
目的 了解深圳地区男男同性恋人群中艾滋病病毒-Ⅰ型(HIV-1)毒株的分子流行情况,帮助分析HIV-1在该人群中传播的危险因素.方法 收集深圳市2006年男男同性恋人群中HIV-1确认为阳性的样本18例,应用套式聚合酶链式反应(Nested-PCR)技术,对该样本膜蛋白基因(env基因)和核心蛋白基因(gag基因)进行扩增,并对各基因区核苷酸序列进行测定和分析.结果 18份样本中共存在CRF01_AE、CRF07_BC、CRF08_BC 3种重组毒株及B 一种亚型,分别占55.56%(10/18)、16.67%(3/18)、5.56%(1/18)和22.22%(4/18);在env基因区与对应的流行代表株01_AE.TH.90.CM240、07_BC.CN.97.97CN001、08_BC.CN.97.97CNGX_9F、B. US. 86. JRFL的基因离散率分别为(8.778±1.296)%、(7.650±0.212)%、11.300%和(13.300±0.819)%;CRF01_AE、CRF07_BC重组株和B亚型组内离散率分别为(10.192±4.179)%、(2.000±0.000)%和(14.367±8.812)%;在gag基因区与对应的流行代表株01_AE.TH.90.CM240、07_BC.CN.97.97CN001、08_BC.CN.97.97CNGX_9F、B. FR. 83. HXB2的基因离散率分别为(5.070±1.132)%、(2.167±0.551)%、4.800%和(7.350±1.926)%;CRF01_AE、CRF07_BC重组株和B亚型组内离散率分别为(4.504±1.692)%、(0.700±0.346)%和(10.167±4.352)%.结论 深圳地区男男同性恋人群HIV-1流行株以CRF01-AE重组亚型为主,其次是B亚型,也存在CRF07_BC和CRF08_BC重组亚型.  相似文献   

20.
目的了解河北省石家庄市2015年新确诊1型艾滋病病毒(HIV-1)流行毒株的亚型分布和原发性耐药情况。方法 2015年石家庄市新报告HIV-1感染者433例,共收集到感染者血浆样本335份,经反转录巢式荧光定量聚合酶链反应(RT-PCR)方法扩增,最终获得311份样本的HIV-1 pol基因片段并测序。对获得的核酸序列用Neighbor.Joining Tree方法构建进化树,以Boot strap值〉70%来判定HIV-1的基因亚型。同时将序列提交至美国斯坦福大学HIV耐药数据库进行耐药基因型分析。结果 311例HIV-1感染者以男性(93.9%)、本市户籍(83.0%)、汉族(96.1%)为主。性接触是最主要的感染途径(98.1%),其中同性性传播占77.5%。311例pol基因序列片段亚型分布显示,CRF01_AE占51.4%(160例),CRF07_BC为28.6%(89例),B亚型为13.2%(41例),未定型CRF01_B为4.2%(13例),CRF08_BC为1.3%(4例),CRF55_01B为0.6%(2例),CRF59_01B为0.3%(1例),CRF65_cpx为0.3%(1例)和CRF01_AE/B为4.2%(13例)。CRF01_AE、CRF07_BC和B是主要的亚型。HIV-1基因亚型分布在性别之间(χ~2=14.039,P=0.005)、不同的职业类型之间(χ~2=21.716,P=0.041)以及不同的传播途径之间(χ~2=20.971,P=0.028)有统计学差异。311例中,14例感染者具有耐药位点,原发耐药率为4.5%,其中蛋白酶抑制剂和核苷类反转录酶抑制剂耐药相关突变率均为1.6%(各5例),非核苷类反转录酶抑制剂耐药相关突变率为1.3%(4例)。结论石家庄市新报告的HIV-1感染者中,传播途径以同性性接触为主,病毒基因亚型以CRF01_AE为主,但具有多样化特点。原发耐药率为4.5%,处于低水平状态。  相似文献   

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